MN Adam, CH Orsay B Pangon, Versailles

C Eloy, Troyes

Evaluer les pratiques lors d’endocardites, myocardites, péricardites dans nos laboratoires d’après le référentiel de microbiologie de la Société Française de Microbiologie (REMIC).

Un questionnaires a été adressé aux membres du collège de bactériologie, virologie hygiène au mois de mars 2011 sur les pratiques de diagnostic direct et indirect de microbiologie y compris la biologie moléculaire.

Établissement

Phase préananalytique

Méthodes diagnostiques:

◦ Culture

◦ Biologie moléculaire

◦ Recherche d’antigènes ou d’anticorps

66 laboratoires ont répondu sur les 210 établissements représentant le collège (310 membres).

1 questionnaire non rempli car absence de ces pathologies dans l’établissement

1

5

8

11

15

20

0

5

10

15

20

25

<100 100- 199 200-299 300-399 400-499 > 500

N

b

é

t

a

b

l

i

s

s

e

m

e

n

t

s

Nb de lits

5 7

23

11 10

6

0

5

10

15

20

25

< 10 10 à 19 20 à 29 30 à 39 40 à 49 > 50

N

b

é

t

a

b

l

i

s

s

e

m

e

n

t

s

Nb de lits

15

37

8

1

0

5

10

15

20

25

30

35

40

0 < 10 10 à 19 > 20

N

b

é

t

a

b

l

i

s

s

e

m

e

n

t

Nb de lits

Toujours Jamais Parfois

Endocardites 8 7 50

Péricardites 3 19 41

Myocardites 3 26 34

Renseigne-ment ATB 5 5 55

Appel bio- logiste (endo) 2 4 57

ENDOCARDITES

Automates : - 43 Bac Alert de Biomérieux - 22 Bactec de Becton Dickinson Flacons avec résine ou charbon (absorption des

antibiotiques) : 8 sans / 56 avec Suspicion du diagnostic d’endocardite : - 31 toujours - 2 jamais - 27 parfois

Nbre d’Hémocultures Durée d’incubation si endocardite

3/24H 3/24h Renou-velmt 72H si

neg

3h/24H pdt

3J

10 jours

11-15 jours

21 jours

28-30 jours

12 43 8 12 8 33 6

Repiquage des hémocultures : - oui : 6

- non : 53

Utilisation des tubes Isolator : - oui : 3

- non : 62

CMI CMB PBS Associa-tion AB

Conserva-tion

souche

Toujours 37 0 0 0 57

Jamais 2 62 58 55 1

Parfois 25 2 6 9 6

Intérêt de conservation de la souche et réalisation de la CMI (ex Streptocoque et Pénicilline G et Pénicilline A) : durée de traitement et posologie en fonction de la CMI.

Réalisations de la CMB, de l’association des AB et du PBS non marquées dans le REMIC.

3 Hémocultures prélevées (inhibiteur si possible)

Qualité de flacons permet la croissance de bactérie à croissance difficile (durée recommandé par le fabricant).

Durée d’incubation conseillée de 15 à 30 J (3 semaines).

Prélèvement sur Isolator possible (concentration des bactéries intracellulaires)

Si Hémocultures négative, il est conseillé de reprélever des Hc 3J plus tard

Tube hépariné pour culture cellulaire : C burnetti, Bartonella spp , T. Whipplei

Sérologie : C. burnetti , Bartonella spp , Brucella spp, Chlamydiae spp, Legionella spp, Mycoplasma spp, Aspergillus spp et Candida spp (gras : conférence consensus 2009)

Biologie moléculaire : prélèvement per-opératoire-conférence consensus 2009 PCR valve : C. burnetti , Brucella spp, Whipple Legionella spp, Mycoplasma spp

PERICARDITES

52/65 établissements reçoivent des liquides péricardiques

< 10 liquides : 41

Entre 10 et 50 : 10

NSP : 1

Deux établissements font de la culture cellulaire pour une recherche virale.

Cytologie Quantita-tive

Gram Giemsa Ziehl/ Auramine

Hemoc BK

Toujours 42 49 27 5 16 8

Jamais 6 0 6 37 3 2

Parfois 4 3 19 > 10GB : 9 >50 GB : 5 >100GB :2

10 33 42 (36 sur prescrip-tion)

Cyto-bactériologie conventionnelle des liquides péricardiques

Les pratiques d’ensemencement sont très variables suivant l’établissement .

La recherche mycologique n’est pas faite systématiquement

Les durées d’incubation vont de 48 H à 30 jours essentiellement pour la mycologie avec une moyenne de 5 jours.

SEROLOGIES ENDOCARDITES- PERICARDITES-MYOCARDITES

Endocardites Péricardites Myocardites

Coxiella burnetti 25 7 5

Bartonella spp 21 4 4

Chlamydiae spp 15 6 5

Rickettsies : 11 4 5

Brucella 18 4 2

Legionella spp 7 2 2

Mycoplasma spp 9 7 6

Candida spp 4 1 1

Aspergillus spp 3 1 1

Toxoplasmose 4 4 4

Endocardites Péricardites Myocardites Enterovirus (coxsackie,

Echovirus)

4

12 11 CMV

5

12 11 Myxovirus

3

4 7 Arbovirus

3

1 1 VHC

6

6 4 VIH

4

9 5 Parvovirus B19

2

5 3 EBV

4

8 5 Adenovirus

2

6 4 HSV

3

3 1 Virus de la rougeole

1

3 2

Autres sérologies réalisées :

Whipple, VZV,HBV, Trypanosome, rubéole, toxocarose

Entre 21 (endocardite)-33 (myocardite) réponses NSP

BIOLOGIE MOLECULAIRE

ENDOCARDITES- PERICARDITES- MYOCARDITES

Endocardites Péricardites Myocardites

ARN 16S 1 1 0

Groupe herpès 2 2 1

Mycobactéries 3 1 1

Parvovirus B19 0 4 0

Entérovirus 1 3 3

Grippe-Chlamydiae- fièvre Q-Whipple

1

1

0

Autres PCR réalisées :

légionelle, Adénovirus, ARN 18S fongique

Entre 13 (endocardite)-23 (myocardite) réponses NSP

26 établissements ne font jamais de biologie moléculaire

Pratiques très variées suivant les établissements

Manque de renseignements cliniques

Intérêt d’harmonisation des pratiques

Importance du dialogue entre clinicien-biologiste pour une meilleure prise en charge du patient (protocoles écrits en commun).

Alba Sauviat C. Chaumont, Belmonte O. Réunion, Bensedik Z. Chartres, Blanc V. Antibes, Boucaud Maitre Y Lyon, Breuil J. Ouanich J. Villeneuve St Georges, Cattier C. Amboise, Cattoen C. Valenciennes, Chardon H. Aix, Danjoux M. F. Tarbes, Danquigny A.L. Vienne, Decousser J.W. Béclère Clamart, Delesalle S. Mendes Martins L. Charleville , Deligne D. Remiremont, Demachy M.C. Meaux, Deregnaucourt J. Bellan, Doat V. Bourgoin –Jallieu, Dubourdieu B. Rodez, Elharrif Z. Libourne, Eloy C. Troyes, Evers A. Annonay, Fasquelle D. Thonon, Fevre C. Montbéliard, Fiette H. Melun, Hombrouck-Alet C. Blois, Geffroy F. Quimper, Gravet A. Delarbre J.M. Mulhouse, Goursaud R. Nouméa-IP Nouvelle Calédonie, Grise G. Elbeuf, Guiet P. sens, Jensen C. Avignon, Julienne G. Laurens E. Belfort, Laluque S. Montluçon , Lamarca R. Narbonne, Lambert C. Longjumeau, Lebrun C. Cholet, Lecaillon E. Perpignan, Lemenando Saint Nazaire, Leturdu F. Argenteuil, Lureau P. Niort, Machuca S.Langres, Mandjee A. Drome, Noulard M.N. Arras, Ogier Desserrey A Chalons sur Saône, Palette X. Dourdan, Pangon B. Versailles, Paul J.G. Boulogne sur Mer, Petitboulanger N. Dole, Pocheret H. Aulnay, A.S. Poirier La Roche/Yon, Rey H. St Cloud, Richardin F. Mantes la Jolie, Sanchez R. Périgueux, Stolidi P. Aubagne, Thellier J. P. Château Thierry, Vachée A. Roubaix, Varache C. Le Mans, Vaucel J. Saint Brieuc, Verdier I. Bourg en Bresse, Verhaeghe A. Dunkerque, Villemain M. Aurillac, Vrillon H. Saint Maurice, Wilhem N. Cahors.