Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010...

32
Département Ecologie et modèles pour l’halieutique JUIN 2011 Rapport d’activité 2010 Département Ecologie et modèles pour l’halieutique Nantes

Transcript of Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010...

Page 1: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Département Ecologie et modèles pour l’halieutique

JUIN 2011

Rapport d’activité 2010

Département Ecologie et modèles pour l’halieutique Nantes

Page 2: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du Département EMH

Page 3: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

sommaire

Rapport d’activité 2010 du département EMH

[1] INTRODUCTION ..................................................................................................................... 6

1.1 PRÉSENTATION DU DÉPARTEMENT............................................................................................ 6

[2] EFFECTIFS ET MOYENS ...................................................................................................... 6

2.1 PERSONNELS PERMANENTS IFREMER........................................................................................ 6 Evolution des effectifs................................................................................................................... 6 Répartition des disciplines et spécialités (d’après thésaurus Ifremer) ....................................... 8 Formations reçues ........................................................................................................................ 8 Formations données ..................................................................................................................... 9 Nouveaux diplômes des personnels permanents .......................................................................... 9

2.2 PERSONNELS NON PERMANENTS............................................................................................... 9 Doctorant...................................................................................................................................... 9 Stagiaires.................................................................................................................................... 10 Personnels titulaires d'un contrat à durée déterminée dont post-doctorants ............................10 Echanges de chercheurs, ingénieurs ou techniciens avec les laboratoires extérieurs............... 10

2.3 RÉPARTITION DES TEMPS AGENT POUR LA RÉALISATION DES PROGRAMMES ET PROJETS......... 11

2.4 CONTRATS DE RECETTES (FAIRE RÉFÉRENCE AUX LISTES DONNÉES EN ANNEXE) .................... 16 Autres contrats............................................................................................................................ 17 Contrats nationaux ..................................................................................................................... 17 Infrastructures – Equipements dont dispose le Département..................................................... 18 Campagnes à la mer ................................................................................................................... 19 Méthode de travail : démarche/procédure qualité (faire référence aux documents cités en annexe)........................................................................................................................................ 19

[3] RESULTATS OBTENUS EN 2010........................................................................................ 20

3.1 (PJ 0505) SURVEILLANCE DES GRANDS AMÉNAGEMENTS ÉNERGÉTIQUES.............................. 20

3.2 (PJ 0510) HABITATS BENTHIQUES ESTUARIENS ET LITTORAUX............................................... 20

3.3 (PJ 0601) ACTIONS TRANSVERSALES AESYPECHE ............................................................. 20

3.4 (PJ 0603) SIH - RESSOURCES................................................................................................ 21

3.5 (PJ 0606) DURABILITÉ ET DYNAMIQUES DES POPULATIONS ET PEUPLEMENTS EXPLOITES

(POPEX) ....................................................................................................................................... 22

3.6 (PJ 0607) EVALUATION INTÉGRÉE DE LA VIABILITÉ DES SYSTÈMES HALIEUTIQUES ET

AQUACOLES (VISTHA) ................................................................................................................. 24

3.7 (PJ 0805) BIODIVERSITÉ ET FONCTIONNEMENT DES ÉCOSYSTÈMES PROFONDS, IMPACTS ....... 25

3.8 (PJ 1101) CONCEPTUALISATION DE LA DCSM....................................................................... 25 3.9 (PJ 5001) CIEM ...................................................................................................................... 26

[4] ANNEXE 1 : INDICATEURS DE PRODUCTION .............................................. 26

4.1 PRODUCTION SCIENTIFIQUE ET TECHNOLOGIQUE (EXTRAIT ARCHIMER) ................................. 26 Campagnes à la mer organisées par l'unité ou sous la direction d'un de ses membres ............ 26 PPDR/Anchois ............................................................................................................................ 27 Réunion....................................................................................................................................... 28

Page 4: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

sommaire

Rapport d’activité 2008 du département EMH

4.2 PARTICIPATIONS À DES COLLOQUES, SÉMINAIRES ET GROUPES DE TRAVAIL............................ 29 Hors site Ifremer de Nantes........................................................................................................ 29 Sur le site Ifremer de Nantes ...................................................................................................... 31

4.3 EXPERTISE D'ARTICLES SCIENTIFIQUES.................................................................................... 32

4.4 EXPERTISE DE PROJETS........................................................................................................... 32

4.5 JURYS DE THÈSE ET HDR........................................................................................................ 32

4.6 COMMISSIONS DE RECRUTEMENT............................................................................................ 32

4.7 COMMISSIONS D’ÉVALUATION ................................................................................................ 33

4.8 NOMINATIONS ........................................................................................................................ 33

4.9 VISITES / ACCUEILS DE PERSONNELS EXTÉRIEUR À EMH ....................................................... 33

Page 5: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

5

[1] INTRODUCTION

1.1 Présentation du département

Le département EMH conduit des recherches sur les écosystèmes d'intérêt halieutique afin d'aider à la définition des conditions d'une exploitation durable des ressources marines vivantes et des écosystèmes associés. Il développe et diffuse des méthodes mathématiques et statistiques qui concourent à cet objectif. Il contribue à la mission d’expertise de l’institut dans le domaine halieutique. Le 01/03/2011, le département EMH est devenu l’Unité de Recherche EMH, au sein du Département Ressources Biologiques et Environnement (RBE) de la nouvelle structure IFREMER.

[2] EFFECTIFS et MOYENS

2.1 Personnels permanents Ifremer Evolution des effectifs CADRES

Nombre : 17

Date arrivée EMH Fonction principale

BADTS Vincent

BERTRAND Jacques

17.11.2008

01.01.2010

Assurance qualité halieutique statistiques

Ecologie halieutique

BERGERON Jean-Pierre 01.01.2005 Océanologie - biochimie

BRINDAMOUR Anik 01.01.2007 Biologie

DINTHEER Christian 01.01.2005 Halieutique

DORAY MATHIEU 20.09.2010 Halieutique

FOREST André 01.01.2005 Halieutique

HURET Martin 01.12.2006 Océanographie

LAFFARGUE Pascal 15.12.2008 Ecologie halieutique et biologie

LORANCE Pascal 03.07.2006 Ecologie halieutique

MAHEVAS Stéphanie 01.01.2005 Mathématiques – modélisation

MARTIN Jocelyne 01.01.2005 Biologie

MASSE Jacques 01.01.2005 Ecologie halieutique

MESNIL Benoît 01.01.2005 Halieutique – modélisation

PETITGAS Pierre 01.01.2005 Géostatistiques – écologie halieutique

ROCHET Marie-Joëlle 01.01.2005 Ecologie – modélisation

TRENKEL Verena 01.01.2005 Ecologie – biostatistiques - modélisation

Page 6: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

6

Rapport d’activité 2010 du département EMH

TECHNICIENS/ADMINISTRATIFS

Nombre : 7

Date arrivée EMH Fonction principale

BERTHELE Olivier 01.01.2005 Informatique

BOURRIAU Paul 01.01.2005 Biologie

COMTE Anne 01.01.2005 Gestion – administration

DEJOUY Cathy 01.01.2005 Traitements de données

GEFFROY Isabelle 01.01.2005 Gestion – administration

GRELLIER Patrick 01.01.2005 Otolithométrie larvaire

VENEREAU Christine 01.01.2005 Gestion - administration

-6

-4

-2

0

2

4

6

8

10

12

14

16

18

20

2004

2005

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

2014

2015

A

D

C

-2

-1

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015

A

D

TA

En terme d’effectifs, 17 cadres, 4 techniciens et 3 personnels administratifs sont présents début 2010.

Page 7: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

7

Répartition des disciplines et spécialités (d’après thésaurus Ifremer)

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

bioch

imie

taxin

omie

biolog

ie or

ganis

mes

biolog

ie po

pulat

ions

halie

utiqu

e

ecolo

gie

Formations reçues

Nom/Prénom Intitulé formation BADTS Vincent ALLEGRO

Formation à l'audit

BRIND’AMOUR Anik Analyse spatiale

BERTHELE Olivier Formation correspondants informatiques

DEJOUY Cathy PAO

POWER POINT

WORD

DINTHEER Christian Ressources informatiques Ifremer (réseau, WEB, wifi)

Anglais perfectionnement

Management

FAUCONNET Laurence Formation OBSMER

MARTIN Jocelyne Quadrige (21-22 septembre 2010)

MAHEVAS Stéphanie Analyse de sensibilité et surface de réponse

Analyse spatiale

Ecole chercheurs INRA :Analyse de sensibilité et surface de réponse

TRENKEL Verena Management

VENEREAU Christine IMAGO : formation au module "gestion de l'EPRD

Page 8: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

8

Rapport d’activité 2010 du département EMH

Formations données

Formateur Unité d’enseignement Niveau Nb d'heures BADTS Vincent Ifremer Lorient Formation observateurs 4h

FOREST André AGROCAMPUS Rennes Master 1 2h

FOREST André LYCEE DESCARTES Rennes Terminal 2h FOREST André Ifremer Lorient Formation observateurs 4h MAHEVAS Stéphanie Ecole chercheur MEXICO Doctorat 35h MAHEVAS Stéphanie AGROCAMPUS Rennes 7h UBS Vannes 22/10 Cours MASSE Jacques AGROCAMPUS Rennes 7h MASSE Jacques Audierne, Pouldrezic 8/4 5

exposés présentés Collèges

ROCHET Marie AGROCAMPUS Rennes Master 2 3h TRENKEL Verena AGROCAMPUS Rennes Master 2 3h

Nouveaux diplômes des personnels permanents

Nom/Prénom Nouveau diplôme Sujet Date Soutenance

PETITGAS Pierre HDR Organisation géographique des populations de poissons marins Université P. et M . Curie Paris

Sept 2010

2.2 Personnels non permanents Doctorant

Nombre : 1

Nom/Prénom Date de séjour Diplôme préparé

Sujet de thèse Tuteur Soutenance

LEHUTA Sigrid

01.11.2007 au 31.10.2010

Doctorat Evaluation de l'impact d'aires marines protégées sur la dynamique de pêcheries mixtes : développement d'indicateurs et application à la pêcherie pélagique du golfe de Gascogne

Mahévas.S. Novembre 2010

RAVARD David

02.112010 au 01.11.2013

Doctorat Evaluation des changements à long terme dans les peuplements de poissons dans le Golfe de Gascogne : approche par indicateurs de populations et peuplements

Brind’Amour A. Trenkel. V.

GASCHE Loïc

01.12.2010 au 30.11.2013

Doctorat Elaboration d’un diagnostic robuste d’impact d’Aires Marines Protégées dans un contexte d’incertitude et de changement global

Mahévas S. Marchal P.

Page 9: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

9

Stagiaires

Nombre : 6

Nom/Prénom Dates de séjour

Diplôme préparé

Thème du stage Tuteur

COURAUDON-REALE Marine

9.04.2010 au 18.06.2010

Master Densité des œufs d’anchois et sardine dans le Golfe de Gascogne

Petitgas.Pierre

GRIMAUD Lucille 01.03.2010 au 31.08.2010

Master Comparaison de la structure trophique des communautés ichyologiques et benthiques des fonds à Haploops sp. et des fonds à vases molles de la baie de Vilaine

Brind’Amour.Anik

JAOUEN Jasmine 19.04.2010 au 25.06.2010

Master

Distribution spatiale des petits poissons pélagiques en structure de taille à partir de la campagne écosystémique PELGAS dans le Golfe de Gascogne

Massé.Jacques

PARENT Briz 25.04.2010 au 25.06.2010

Master Régime alimentaire de l’anchois, la sardine et le sprat dans le Golfe de Gascogne

Petitgas.Pierre

TARAUD Laure 25.04.2010 au 15.06.2010

Master Analyse de la distribution des larves d’anchois du Golfe de Gascogne

Huret.Martin

SAUZEDE Raphaëlle 03.05.2010 au 13.08.2010

Ingénieur Comparaison de l’évolution temporale des indicateurs de communautés ichtyologiques estimés sur le plateau continental et les zones côtières du golfe de Gascogne

Brind’Amour Anik Trenkel.Verena

Personnels titulaires d'un contrat à durée déterminée dont post-doctorants

Nombre : 6

Nom/Prénom Dates de séjour Nature contrat

DORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009 au 13.10.2010 Surcroît d’activité FAUCONNET Laurence 03.05.2010 au 13.08.2010 Surcroît d’activité GUERINEAU Lise 06.10.2008 au 03.04.2010 Surcroît d’activité KOPP Dorothée 01.07.2009 au 31.12.2010 Surcroît d’activité

Echanges de chercheurs, ingénieurs ou techniciens avec les laboratoires extérieurs

[sans objet]

Page 10: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

10

Rapport d’activité 2010 du département EMH

2.3 Répartition des temps agent pour la réalisation des programmes et projets

En 2010, les personnels de EMH sont intervenus dans les projets dont la liste est fournie dans le tableau ci-dessous.

Code Libellé PJ0005 Préparation des réponses aux appels à projets (ANR, UE, etc.) PJ0306 Liens vers les applications PJ0402 Nature et évolution morphosédimentaire PJ0505 Surveillance des grands aménagements énergétiques PJ0506 Surveillance environnementale en soutien aux autorités publiques (SESAP) PJ0510 Habitats benthiques estuariens et littoraux PJ0601 Actions transversales AESYPECHE PJ0602 SIH - Usages PJ0603 SIH - Ressources PJ0605 Processus individuels et adaptation des organismes marins a l'environnement (PROGRES) PJ0606 Durabilité et dynamiques des populations et peuplements exploites (POPEX) PJ0607 Evaluation intégrée de la viabilité des systèmes halieutiques et aquacoles (VISTHA) PJ0710 Bioconversion des produits marins PJ0805 Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes profonds, impacts PJ1101 Conceptualisation de la DCSM PJ3103 Affrètements PJ4201 Fonctionnement de base des unités PJ5002 Politique scientifique PJ5004 Participation aux projets et réseaux européens PJ5006 Elaboration des stratégies et des accords européens et internationaux PJ5008 Activités de la Délégation Générale à L'outre Mer PJ5100 Management et Coordination générale DRH PJ5101 Formation PJ5102 Gestion des carrières PJ5107 Administration générale PJ5110 Politique de communication – Manifestations PJ5112 Politique de communication - Publics cibles

Page 11: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

11

CADRES

Nom A0005 A0306 A0402 A0505 A0506 A0510 A0601 A0602 A0603 A0605 A0606 A0607 A0710 A0805

BADTS Vincent 7,398 0,97

BERGERON J.Pierre 8,252

BERTRAND Jacques 1,261 5,02

BRIND'AMOUR Anik 0,418 4,827 0,509 3,529

DINTHEER Christian 0,049 1,886 1,413 5,494 0,024 0,067

DORAY Mathieu 1,698 6,397

FOREST André 0,182 1,231 0,091

HURET Martin 1,049 1,843 5,463 0,819

LAFFARGUE Pascal 3,638 2,08 4,093

LORANCE Pascal 1,322 0,461 7,282 0,182

MAHEVAS Stéphanie 0,121 1,886 5,639

MARTIN Jocelyne 1,285 0,346 7,446 0,024

MASSE Jacques 5,918 3,129 0,049

MESNIL Benoît 9,083

PETITGAS Pierre 0,049 1,74 3,499 0,903

ROCHET Marie-Joëlle 0,867 1,431 0,267 5,578

TRENKEL Verena 0,788 0,073 0,224 8,295

Nom A0903 A1101 A3103 A4201 A5001 A5002 A5004 A5006 A5008 BADTS Vincent BERGERON Jean-Pierre BERTRAND Jacques 3,41 0,26 0,53BRIND'AMOUR Anik 0,16 DINTHEER Christian 0,53 0,02 DORAY Mathieu FOREST André 1,96 3,01 1,06 0,02 HURET Martin 0,17 LAFFARGUE Pascal 0,02 LORANCE Pascal 0,62 MAHEVAS Stéphanie 0,19 MARTIN Jocelyne 0,09 MASSE Jacques 0,042 MESNIL Benoît 0,15 PETITGAS Pierre 0,10 1,82 ROCHET Marie-Joëlle 0,01 TRENKEL Verena 0,05 0,19

Page 12: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

12

Rapport d’activité 2010 du département EMH

Nom A5100 A5101 A5102 A5107 A5110 A5112 %etp

BADTS Vincent 0,19 0,05 0,13 0,94 BERGERON Jean-Pierre 0,89 BERTRAND Jacques 1,02 BRIND'AMOUR Anik 1,02 DINTHEER Christian 0,14 1,04 DORAY Mathieu 0,87 FOREST André 0,32 0,59 0,91 HURET Martin 1,01 LAFFARGUE Pascal 1,06 LORANCE Pascal 1,06 MAHEVAS Stéphanie 0,85 MARTIN Jocelyne 0,05 0,05 1,00 MASSE Jacques 0,24 1,01 MESNIL Benoît 1,00 PETITGAS Pierre 0,07 0,93 0,98 ROCHET Marie-Joëlle 0,05 0,89 TRENKEL Verena 0,15 0,12 1,07

TECHNICIENS/ADMINISTRATIFS

Nom A0505 A0510 A0601 A0603 A0606 A4201 A4202 A4305 A4307 A5001 A5101 %etp

BERTHELE Olivier 0,10 0,73 0,49 1,61 1,39 1,36 1,20 0,33 0,78BOURRIAU Paul 0,61 3,43 4,59 0,93COMTE Anne 0,10 9,21 0,24 1,03DEJOUY Cathy 0,97 1,65 0,88 2,55 0,05 0,66GEFFROY Isabelle 7,39 0,10 0,81GRELLIER Patrick 0,73 3,17 4,99 0,96VENEREAU Christine 3,76 3,37 0,73 0,41 0,89

Contribution du département par programme (en mois)

0,00

50,00

100,00

150,00

200,00

250,00

PG00 PG03 PG04 PG05 PG06 PG07 PG08 PG09 PG11 PG31 PG42 PG43 PG50 PG51

Page 13: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

13

Contribution du département aux projets du programme PG06 (en mois)

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Trans SIH U SIH R Progres Popex Vistha Tecos

Contribution du département aux actions des projets Les projets sont constitués d’actions, briques élémentaires de la comptabilité analytique. En 2010 les cadres (CDI+CDD, post-doctorant inclus) sont impliqués dans 71 actions, dont 31 correspondent à une activité de recherche. Les autres incluent des activités de support, coordination, prospective, formation et d’expertise. Le temps des cadres sur les actions strictement de recherche représente 73.3% de leur temps.

0,00

5,00

10,00

15,00

20,00

25,00

30,00

actions

moi

s ca

dres

Page 14: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

14

Rapport d’activité 2010 du département EMH

Seules 7 actions totalisent plus de 6 mois de temps de travail sur l’année et 12 actions plus de 4 mois. Dans l’ordre d’importance, il s’agit des actions suivantes : A060303 SIH Campagnes A060602 Dynamique des populations et communautés halieutiques A060609 ANR AMPHORE A060302 OBSMER DCR A051003 Colmatage A060619 UE DEEPFISHMAN A060313 Etude pilote pêche sentinelle anchois-sardine A060623 UE FACTS A060622 MARIFISH REPRODUCE A060603 Outils et méthodes d'observation A060720 Impact de scénario de gestion spatialisée sur les pêcheries A080503 UE Coralfish

Page 15: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

15

2.4 Contrats de recettes (faire référence aux listes données en annexe) La figure ci-dessous fournit la liste des projets dans lesquels EMH est impliqué Rouge : Ifremer coordinateur ; bleu : Ifremer responsable d’un WP ; vert : Ifremer participant ; jaune : en cours d’élaboration ou soumis.

Page 16: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

16

Rapport d’activité 2010 du département EMH

Contrats européens en cours en 2010 Sigle TITRE DU CONTRAT Durée,

Année début, fin Noms personnes EMH (P,C)

Recette totale (€)

DEEPFISHMAN Management and monitoring of deep-sea fisheries and stocks

2009-2012 Lorance.P 518 006

FACTS Forage fish interactions 2010-2012 Trenkel.V 159 983

BADMINTON Appel d’offre Marifish (DS) Rochet M.J. Pas de recette

REPRODUCE Appel d’offre Marifish (DS) 2009-2011 Petitgas.P. Pas de recette

UNCOVER Understanding the mechanisms of stock recovery

2006-2010 Huret.M. 349 849

CORALFISH Assessment of the interaction between corals, fish and fisheries in the deep waters of Europe

2009-2012 Laffargue.P. 767 250

Lot2 VMS TOOL Analyses conjointes des données Logbooks et VMS

2009-2010 Mahévas S.

Autres contrats

Durée, Année début, fin

Noms personnes EMH (P,C)

Sigle TITRE DU CONTRAT

Recette totale

Pew Institute for Ocean Science 2008-2013 Rochet M.J. SELFISH Selectivity of Fishing 102 000

Contrats nationaux

Sigle TITRE DU CONTRAT Durée, Année début, fin

Noms personnes EMH (P,C)

Recette totale

COLMATAGE Couplages bio-morpho-sédimentaires et dynamique à long terme des habitats et peuplements benthiques et ichtyologiques en Seine aval.

2007-2011 Brind’Amour.A 138 252

ANR-Amphore Les aires marines protégées : outil de conservation de la biodiversité et de gestion durable des ressources halieutiques

2008-2011 Brind’Amour.A 91 472

ANR-Reproduce Compréhension des processus reliant stock et recrutement dans le cadre du programme ERA-Net Marifish

2009-2011 Petitgas.P 131 760

Ifremer-MEEDDM-2010

Action 3-2. Développement de 4 indicateurs écosystémiques caractérisant l’évolution des peuplements démersaux, mise en perspective avec l’évaluation de l’état initial de la DCSMM

2010-2010 Bertrand.J. 2 370 000

Chloretro Devenir de la chlordécone dans les réseaux trophiques des espèces marines consommées aux Antilles

2009-2011 Bertrand.J. 306 200

DPMA-indicateurs TBMF

Marché d’étude portant sur l’intégration d’indicateurs concernant les ressources halieutiques et les activités de pêche dans le tableau de bord des mers françaises

2010-2011 Trenkel V. 34 999

P : partenaire - C : coordinateur

Page 17: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

17

Infrastructures – Equipements dont dispose le Département

Type de matériel (Date d'acquisition)

Matériel d’analyse

Homogénéiseur Polytron Kinématica (1974), Homogénéiseur Polytron (2000), Bain-marie agité Salvis (1979), Bain cryothermostaté Huber (1987), Bain cryothermostaté Huber (1988), Broyeur de Potter Elvehjem,(1988), Spectrophotomètre Spectronic Unicam (2000), Spectrofluorimètre Kontron (1988), Centrifugeuse Jouan (1991), Etuve Memmert (1992), Balance Sartorius (1982), Balance Sartorius BP 121 (1997), PHmètre Hanna (1997), Hotte mobile Captair 4007A (1983)

Optique de laboratoire

Caméra vidéo couleur Sony (1994), Moniteur SONY PVM (10/96), Imprimante thermique/images microscope (1997), Plateau antivibratoire de paillasse (04/95), Loupes binoculaires WILD (11) (1975-1986), Dispositif photo/ binoculaire WILD Photomakroscop (1980),

loupe binoculaire Olympus (2009-2010)

Microscope optique Leitz Dialux 20 (1978), Fibres optiques Intralux (1993), Fibres optiques Schott (2004), Logiciel TNPC otolithométrie (1991), Caméra compacte couleur pour alliance microscope lecture d'otolithes (2004)

Acoustique

Mesures océanographiques

4 bouteilles à renversement (1976), Sonde CTD SEA BIRD SBE 19 (1991), Sonde CTD SEA BIRD SBE 19 (1993), Sonde NKE TPS 100 (2007), Balance Marel M1100 PL25/30.

Ctd Sbe 19Plus (2007)

Planctonologie

Filet à plancton vertical WP2 (1984), Filets à plancton BONGO doubles (2) (1984), Filet à neuston (1992), Filet à plancton épibenthique Zébulon (1991), Laser optical plankton counter (2003), Colonne de densité (2004), filet multiple MPS-midi-Hydrobios (2007). Filet « carré ».

Matériel de prélèvement et campagnes à la mer

Chalut à perche : deux cadres + 8 toiles de chalut

Informatique

Station de travail Sun Blade 150 et SUN Ultra 5 ; Station de travail Sun W2100 ; Ultra 45 (2) ; Dell Precision T7400

Page 18: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

18

Rapport d’activité 2010 du département EMH

Campagnes à la mer

Méthode de travail : démarche/procédure qualité (faire référence aux documents cités en annexe)

[non documenté]

Page 19: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

19

[3] RESULTATS OBTENUS EN 2010

3.1 (PJ 0505) Surveillance des grands aménagements énergétiques A050503 IGA-Flamanville Les températures du premier semestre 2010 sont parmi les plus basses observées sur les 25 dernières années. C’est ainsi que le début des éclosions de larves d’araignée n’a commencé que mi-juillet, avec un pic au mois d’août. La densité maximale de larves (25,5 par 10m3) est bien supérieure à celles des années antérieures si l’on exclue l’année exceptionnelle 1983. Nous avons récolté des larves de homard sur toute la période de prélèvement, soit de début juin à début septembre avec une densité maximale qui se situe parmi les meilleures (0,08 par 10 m3) alors que la précocité des années passées nous faisait généralement manquer le pic d’éclosion.

3.2 (PJ 0510) Habitats benthiques estuariens et littoraux A051003 Colmatage Un couplage spatial a été réalisé entre les communautés de poissons bentho-démersaux et leurs proies macrobenthiques potentielles, à partir de deux bases de données : une base de données « poissons » issue des campagnes annuelles de chalutage (automnes 1995-2002) et une base de données « benthos » issue des campagnes d’échantillonnage réalisées à des saisons différentes et dans des secteurs variables. Une première analyse a permis de sélectionner deux années de données (1996 et 2001) permettant de réaliser un couplage spatial sur l’ensemble de la zone échantillonnée. Dans un premier temps, la variabilité spatio-temporelle a été étudiée pour chacun des compartiments séparément (poissons et endo-benthos). Des classifications hiérarchiques ont permis d’identifier des assemblages de poissons et de benthos avec des espèces caractéristiques de chacun de ces assemblages. Le couplage benthos-poissons a ensuite été effectué à l’aide de l’approche dite de « 3 tableaux » (i. e. fourth-corner and RLQ analysis) dans laquelle les données d'abondance des poissons et du benthos ont été mises en relation à l'aide d'une matrice de voisinage. Cette matrice est obtenue par l’intersection de polygones définissant les intersections spatiales entre des les schémas d'échantillonnage des poissons et du benthos. Les résultats montrent des relations spatiales significatives entre le benthos et les assemblages de poissons pour chacune des deux années, 1996 et 2001, ainsi qu’un gradient intérieur/extérieur estuaire au niveau des communautés. Des relations significatives ont également été mises en évidence entre les poisson et leurs proies potentielles. Ce travail permet d'étudier conjointement des données portant sur des schémas d'échantillonnage différents et elle apporte une contribution à une meilleure définition des habitats de poissons en estuaire de Seine en vue d’un application dans la conservation et la gestion des zones côtières. Elle est actuellement en cours de préparation pour une soumission prochaine à une revue de rang A.

3.3 (PJ 0601) Actions transversales AESYPECHE A060110 Développement de 4 indicateurs DCSMM (terminée en 2010) Les travaux menés dans le cadre la convention Ifremer-Meeddm 2010 visaient à (i) définir les modalités d'application des quatre indicateurs écosystémiques du règlement européen sur la collecte des données halieutiques (Data collection framework DCF) pouvant être calculés à partir des informations collectées lors des campagnes scientifiques (état de conservation des espèces halieutiques, proportion de poissons de grande taille, taille maximale moyenne des poissons et taille de maturité des espèces exploitées), (ii) tester ces modalités avec les données collectées lors de campagnes démersales réalisées dans différents environnements (côtier – estuaires – plateau continental, Manche – Atlantique – Méditerranée), (iii) étendre la couverture de ces indicateurs à l'ensemble des grands groupes d'espèces, poissons, crustacés et mollusques, pour une caractérisation plus complète de la biodiversité des peuplements benthiques et démersaux, (iv) automatiser les procédures de gestion des données

Page 20: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

20

Rapport d’activité 2010 du département EMH

et de calcul des indicateurs, (v) automatiser la mise à disposition de ces indicateurs, afin d'obtenir un premier produit de référence pour la caractérisation de l'état des peuplements halieutiques dans le cadre de la DCSMM. Pour réaliser ces opérations, un logiciel spécifique a été créé (logiciel libre Coser), le logiciel de calcul R-Sufi (créé par EMH) a été adapté et le site web de présentation des indicateurs issus des campagnes halieutiques réorganisé.

Exemple d'écran du logiciel Coser.

Page d'accueil du site web.

Cette tâche venait en soutien à l'activité développée dans le cadre de l'action "A060303 SIH-Campagnes".

3.4 (PJ 0603) SIH - Ressources A060302 OBSMER En 2010 les points positifs sont la refonte du plan d’échantillonnage et des documents contractuels qui définissent les marchés d’observation, dans une perspective de contrats pluri-annuels ; la mise en œuvre à grande échelle d’un outil de suivi du plan d’échantillonnage utilisé par tous les partenaires (WAO) ; et un important effort de saisie, bancarisation et validation des données passées et nouvelles. Ce dernier effort a été compliqué par les retards et dysfonctionnements de l’outil informatique attendu : la base de données du Système d’Information Halieutique et son logiciel de saisie Allegro. L’analyse des données d’observation à la mer a permis de répondre aux obligations réglementaires et de fournir les éléments nécessaires aux évaluations de stocks. Le travail a donné lieu à 1 rapport. A060303 SIH-Campagnes L'action SIH-Campagnes s'inscrit dans une démarche intégrée de la recherche amont à l'application opérationnelle en vue de la production d'indicateurs écologiques (fig. 1). Les actions menées en 2010 ont concerné en particulier trois axes :

• le développement de la base Harmonie-Campagnes,

• l'animation d'un groupe de travail pour le calcul d'indicateurs écosystémiques,

• l'organisation d'outils d'administration de l'information (action A060110).

Concernant la base Harmonie-Campagnes, l'objectif est que l'institut dispose d'un outil permettant d'administrer les fonctions suivantes pour les données relatives aux campagnes halieutiques pilotées par l'institut : transfert en base commune des données initiales, qualification et correction des données, extraction des données, gestion des référentiels (communs au système Harmonie). Ce projet s'étend sur plusieurs années. Début 2010, ces différents modules se trouvant en état d'avancement variable, l'objectif pour l'année était de renforcer la coordination de l'activité des différents partenaires (équipes informatiques, équipe d'exploitation, utilisateurs scientifiques,…), en vue de

Production intégréed’indicateurs

> tableaux de bord

Observationsà la mer

Plansd’observation

Tests d’application opérationnelle

Elaboration conceptuelle

Recherche théorique

BaseCampagnes

Fig. 1. Cadre général de l'action SIH-Campagnes de l'Ifremer.

Page 21: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

21

disposer d'une base pleinement opérationnelle courant 2011. Des progrès très significatifs ont été acquis sur ces différents volets en 2010. Mais du travail reste à faire avant le transfert du système aux utilisateurs. De plus, en vue de la caractérisation des habitats benthiques exploités, des données sur le macrobenthos sont en cours de collecte (campagne EVHOE) et d’organisation (protocole pour la mégafaune, base de données, expertise faunistique avec le MNHN). Le Groupe de travail sur les indicateurs de populations et de peuplements rassemble des scientifiques des différents laboratoires de l'institut impliqués dans les campagnes halieutiques sur les façades Manche – mer du Nord, Atlantique – mer Celtique et Méditerranée. Les actions du groupe en 2010 ont principalement visé à définir les bases et organiser le travail pour répondre aux objectifs de production d'indicateurs écosystémiques requis par le règlement sur la collecte des données halieutiques et la DCSMM. Il s'agissait notamment de redéfinir les entités sur lesquelles établir ces indicateurs (zonage, espèces, etc.), de renforcer le contrôle de ces données à travers une démarche qualité structurée et d'améliorer la gestion des processus pour faciliter l'actualisation annuelle des indices écosystémiques élaborés par le groupe. L'activité du groupe a été fortement soutenue par l'action intitulée "A060110 Développement de 4 indicateurs DCSMM". A060313 Etude pilote pêche sentinelle anchois-sardine (terminée) Cette action est une collaboration avec les professionnels, visant à utiliser les navires de pêches pour effectuer un suivi tout au long de l’année sur deux habitats essentiels de l’anchois et de la sardine dans le golfe de Gascogne. L’action est complémentaire des campagnes annuelles réalisées au printemps et permet de fournir des informations saisonnières sur les migrations, la croissance et l’arrivée du recrutement dans la population. En 2010, un protocole d’échantillonnage a été élaboré, les campagnes réalisées et les données acquises. Leur analyse sera poursuivie en 2011 et pourrait aboutir à une poursuite des actions en collaboration scientifiques/professionnels dans les années qui viennent. Dans l’immédiat, les informations recueillies seront utiles pour la modélisation du cycle de vie de ces deux espèces.

3.5 (PJ 0606) Durabilité et dynamiques des populations et peuplements exploites (POPEX)

A060609 ANR-Amphore (en cours) Les travaux ont porté sur le transfert méthodologique de combinaison d'indicateurs et du développement de tables d'interprétation afin de tester un effet de la mise en place des aires marines protégées (AMP). La méthodologie de combinaison d’indicateurs à été testée, entre autres, sur la Réserve National des Bouches de Bonifacio (RNBB) en Corse. Cette réserve créée en 1999, mais dont certaines zones sont protégée depuis 1982, est gérée par l’Office de l’Environnement de la Corse (OEC) et possède une surface totale de plus de 80000 ha. Elle est divisée géographiquement en cinq zones possédant différents niveaux de protection envers le pêche au harpon. Les données du RNBB se présentent sous la forme d’un suivi spatio-temporel des captures (CPUE en g/pêche/24h/50m de filet trémail) entre 2000 et 2007. L’analyse préliminaire des données suggère une efficacité des zones les plus protégées (>40% de protection) en comparaison aux zones faiblement (0%) protégées. La biomasse, l’abondance et la taille des espèces ciblées par la pêche au harpon sont significativement plus élevées dans les zones fortement protégées en comparaison aux zones faiblement protégées. Cette effet de « protection » semble également profiter aux espèces non ciblées par la pêche. D’après les tableaux d’interprétation issus de la combinaison des indicateurs les processus écologiques pouvant expliquer ces résultats sont la diminution de la mortalité par pêche, la présence de refuge pour les espèces ciblées par la pêche et non ciblée. Ces résultats suggère donc une certaine maturation de l’aire marine protégée (AMP) Corse. Ce type d’analyse a également été testée sur l’AMP de Port-Cros et de deux AMP de l’Afrique de l’Ouest Bamboung et le Banc d’Arguin. Ces travaux sont actuellement en voie de valorisation scientifique sous forme d'article. Une synthèse méthodologique intégrant le choix et la justification des indicateurs, les différentes méthodologies de combinaison (méthode de Condorcet, combinaison deux à deux, …) et l’intégration globale des indicateurs de différents disciplines (biologie, socio-économie, gouvernance) est actuellement en cours. En 2010, deux articles scientifiques ont été soumis et plusieurs présentations orales à des congrès ont eu lieu.

Page 22: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

22

Rapport d’activité 2010 du département EMH

Action 060602 Dynamique de populations et communautés halieutiques L'un des volet de cette action porte sur les effets des activités humaines incluant le réchauffement climatique, la surexploitation, la pollution et la dégradation du milieu marin sur les populations et les communautés exploitées sont étudiés. Des études dans la Méditerranée, en Atlantique et mer du Nord ont été menée ainsi que des comparaisons avec d'autres systèmes (Blanchard et al 2010, Bundy et al. 2010, Rochet et al 2010). Une méthode Bayésienne pour estimer la densité locale des espèces basée sur des expérience d'appâts a été développé et appliquée au cas de données d'une espèce profonde collecte lors de la campagne Vital (Trenkel & Lorance 2010). Le développement d'une approche basée sur le principe de vraisemblance pour déterminer le changement d'état des populations et communautés a été finalisé (Trenkel & Rochet 2010). Cette méthode a été utilisée pour la comparaison des principaux facteurs de l'évolution des communautés marines en Méditerrannée et dans l'Atlantique Nord-Est (Rochet et al 2010). Action A060603 : ObsHal

Des nouveaux indicateurs de l'état des écosystèmes marins ont été développés, notamment pour toute la colonne d'eau à partir de données acoustiques halieutiques (Trenkel & Berger 2010).

Une description complète du protocole d'estimation de la biomasse de stocks de poissons par acoustique utilisé à Ifremer a été fait (Doray et al 2010a,b). Des travaux sur l'apport du ME70 pour la description des bancs de poissons pélagiques proche de la surface ont été effectué et présenté (Doray 2010). De plus, des travaux pour l’utilisation du ME70 afin de caractériser les habitats benthiques ont aussi été menés avec le groupe de travail ‘SMFH-bathy’ . A060619 UE-Deepfishman Deepfishman est un projet du 7ième PCRD coordonné par Ifremer. Il a comme objectif d'améliorer l'évaluation et la gestion des espèces profondes (lingue bleue, dorade rose, grenadier de roche,..).

En 2010, les travaux d'Ifremer dans ce projet ont porté sur :

• l'évaluation des stocks de poissons profonds, notamment en utilisant des données de capture et d'effort de pêche détaillées trait par trait, fournies par la profession ;

• l'évaluation de l'état des écosystèmes ;

• la définition d'indicateurs issus des données de pêche commerciale, des observations à la mer et des campagnes ;

• l'intégration des connaissances des parties-prenantes à l'évaluation des pêcheries.

La réunion à mi-parcours du projet a été tenue à Nantes du 14 au 17 septembre 2010. Le projet à donné lieu à l'accueil d'une chercheure étrangère (Dr Julia Blanchard, Imperial College, London) pendant 3 mois(Novembre 2010, Janvier 2011) à EMH.

Les travaux ont donné lieu à une article publié en 2010, deux autres commencés en 2010 sont ou seront publié en 2011 ainsi que cinq communications dans des conférences. A060608 Selfish Ce projet est financé par une bourse de la foundation Pew. Les travaux de modélisation théorique on permis de prédire les effets d’une pêche sélective ou non sélective sur la biodiversité d’une communauté marine exploitée. Cependant, les premières analyses empiriques suggèrent que l’effet de la sélectivité sera difficile à mettre en évidence parmi l’ensemble des facteurs qui influencent les communautés marines. Un temps fort de l’année 2010 a été la participation en octobre à un atelier du Fisheries Expert Group de l’IUCN sur le thème de l’effet de la sélectivité de la pêche sur les écosystèmes. Le travail a donnée lieu à 1 rapport, 1 note à la conférence annuelle du CIEM, 1 publication.

Actions A060623 FACTS (démarrée en 2010) Facts est un projet du 7ième PCRD avec l'objectif d'étudier le rôle dans l'écosystème des espèces fourrage (petits pélagiques) et l'impact de leur exploitation. Ce projet a commencé en 2010. Les premiers travaux ont porté sur :

Page 23: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

23

• L'analyse de la relation entre la dynamique écologique et économique dans le golfe de Gascogne sur la base d'une modélisation qualitative.

• Une revue bibliographique par rapport aux facteurs qui déterminent l'alternance entre l'anchois et la sardine dans différents écosystèmes et la formulation de différents modèles pour expliquer cela; ce travail est fait en collaboration avec le CSIRO en Tasmanie.

• Un modèle Ecopath the l’ensemble de la chaine trophique du golfe de Gascogne (plancton, pélagique, démersaux, prédateurs supérieurs) a été développé par l’Université de La Rochelle et une expertise a été apporté pour permettre l’aboutissement de ce travail.

A060622 MariFish-Reproduce (démarée en 2010).

Les objectifs du projet sont de développer dans deux régions (Golfe de Gascogne et Mer Egée) des modèles de cycle de vie pour l’anchois et la sardine intégrant la dispersion larvaire et les migrations juvéniles et adultes et de relier les modèles de cycle de vie aux modèles de maillons trophiques inférieurs, en vue de prédire l’impact des forçages climatiques sur le recrutement et la distribution de ces espèces. En 2010, des échantillonnages à la mer ont été effectué pour mieux spécifier la distribution verticale des œufs et des larves d’anchois et sardine. Une revue bibliographique a été effectuée sur les différents processus du développement larvaire indispensable à prendre en compte dans les modèles, permettant d'élaborer un modèle conceptuel de cette phase du cycle de vie sous l'influence des facteurs environnementaux. Un travail similaire a été effectué pour modéliser la ponte. L’IBM larvaire de l’anchois a été mis à jour, avec un module de migration vertical. Une méthode a été développée pour cartographier la distribution d’une espèce par classes de taille de façon à contraindre les mouvements de migration dans la modélisation du cycle de vie.

A060624 MariFish-Badminton (démarrée en 2010) Badminton est un projet européen financé par le réseau MariFish qui vise à développer des indicateurs décrivant les rejets de flottilles européennes, et à déterminer les facteurs qui déterminent les quantités rejetées afin de suggérer des approches intégrées au problème des rejets. En 2010 un important travail de compilation des données a été accompli pour une sélection de pêcheries européennes. Le travail a été décrit dans un rapport de projet.

3.6 (PJ 0607) Evaluation intégrée de la viabilité des systèmes halieutiques et aquacoles (VISTHA)

A060708 UE-Uncover (terminée en 2010)

UNCOVER s'est intéressé à comprendre et identifier conjointement les facteurs environnementaux et les mesures de gestion permettant le rétablissement de différents stocks de poisson du Nord-est Atlantique, dont l'anchois du golfe de Gascogne en ce qui concerne EMH. Le modèle de dérive et survie larvaire de l'anchois (modèle Individu-centré couplé à un modèle hydrodynamique) a été utilisé sur une période de 10 ans en intégrant les dérives sur l'ensemble de la saison de ponte, pour estimer le recrutement annuel. L'indice obtenu s'avère être un bon estimateur du potentiel de recrutement annuel (valeur max possible) mais ne permet pas d'avoir une estimation absolue, par manque de certains facteurs limitant dans le modèle actuel. Inclusion de ces résultats dans papier accepté à IJMS. D'autres indices ont été analysés, indices hydrologiques ou de noyau de dispersion larvaire, afin de mettre en évidence de manière intégrée quels pouvaient être les facteurs limitant pour une année donnée. Présentation faite au workshop WKMOR du CIEM. Une schéma de compréhension de l’effondrement et de la résurgence des populations de poissons marins a été développé et tester à partir d’une revue des histoires d’effondrement de stocks. L’effondrement s’accompagnerait d’une perte de diversité intra-stock et de la capacité à occuper des habitats (mémoire des migrations). La résurgence dépendrait de la reconstitution de ces comportements. Papier présenté au symposium UNCOVER et publié dans ICES Journal of Marine Science.

Page 24: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

24

Rapport d’activité 2010 du département EMH

La thèse de S. Lehuta, cofinancée par UNCOVER s'est achevée fin 2010. Différents scénarii de mesure de gestion du stock d'anchois du golfe (TAC, AMP, ...) ont été testés avec ISIS-Fish, avec forçage par les résultats du modèle IBM de dérive larvaire et prise en compte des incertitudes. Ces scénarii ont été testé sur une période réaliste de 10 ans (2000-2010) afin d'estimer les mesures de gestion les plus efficaces pour un rétablissement du stock (combinaison AMP et réduction de l'effort). Papier en révision pour ICES Journal of Marine Sciences. A060720 Scénario de gestion Suivi du projet de développement d’ISIS-FISH

-amélioration des performances -couplage avec R pour AS -parallelisation des plans de simulation sur CAPARMOR

Communication, collaboration avec les professionnels -présentation au comité local des pêches de la Turballe et comité national des pêches -présentation au RAC sud de l’outil

Développements méthodologiques - intégration de la connaissance et production d’indicateurs d’impacts de scenarios de gestion ; finalisation de la thèse de Sigrid Lehuta en novembre 2010 (manuscrit de thèse et article en finalisation) - méthodes d’estimation des paramètres de la dynamique de pêcherie (papier en révision à l’ICES JMS) - prise en compte des incertitudes dans les diagnostics issus d’ISIS-Fish (participation au réseau MEXICO) - méthodes d’analyse de sensibilité prenant en compte les corrélations entre paramètres (papier soumis à Reliability Engineering and System Safety) - organisation EC AS (chapitre d’un ouvrage en cours de finalisation) - démarrage d’une thèse sur un modèle de la théorie du fossé de l’information (Loic Gasche)

3.7 (PJ 0805) Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes profonds, impacts A080503 UE-Coralfish Les objectifs du projet sont d’établir les liens entre les habitats à coraux froids (habitats CWC), les poissons et les activités de pêche afin d’identifier le rôle de ces habitats et l’importance des pressions.

- Coordination du WorkPackage 2 dédié aux espèces exploitées et à la synthèse des activités de pêche dans les secteurs à coraux

- Élaboration d’une synthèse en collaboration avec l’ensemble des partenaires du projet sur les espèces exploitées. Cette synthèse regroupe les connaissances biologiques sur 63 espèces commerciales (vertébrés et invertébrés) et les informations relatives à leur exploitation pour les 7 régions de l’Atlantique nord concernées par le projet

- Synthèse des données disponibles (logbook, VMS) et méthodes pour caractériser l’importance des secteurs d’habitats CWC pour la pêche et l’empreinte spatiale de cette dernière sur ces habitats.

3.8 (PJ 1101) Conceptualisation de la DCSM A110104 Etat initial DCSMM (démarée en 2010) En 2009 et début 2010, l'activité sur la DCSMM a donné lieu à l'implication de trois chercheurs dans les groupes de travail CIEM/JRC sur la définition du bon état écologique pour les descripteurs 3 (espèces exploitées), 4 (réseau trophique) et 6 (fond marin). Chacun de ces groupes a produit un rapport publié en 2010, le task group 6 a de plus produit une communication à ICES ASC (Nantes, Septembre 2010) maintenant acceptée pour publication. Les rapports sont des travaux de synthèses produits lors de deux réunions internationales avec un travail par correspondance et téléconférence en inter-sessions. L'implication de l'unité pour ces descripteurs et d'autres a donné lieu à une réunion, 4 Octobre 2010, Nantes, avec les organisateurs, AAMP, de l'évaluation initiale Française pour définir les contributions requises en 2011. Nous avons aussi participé à une journée thématique organisée dans le cadre du Comité d’orientation recherche et surveillance (CORS, station Ifremer de Lorient, 14 Décembre 2010) pour contribuer à l'harmonisation des

Page 25: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

25

approches menées à l'Ifremer sur les questions d'environnement côtier et d'halieutique dans le cadre de la DCE et de la DCSMM.

Publications : 3 rapports ICES/JRC sur la définition d’indicateurs pour la DCSMM, 1 publication.

3.9 (PJ 5001) CIEM

Le Conseil International pour l’Exploration de la Mer (CIEM) a tenu sa conférence scientifique annuelle à Nantes du 20 au 24 septembre 2010. L’Ifremer a assuré l’organisation matérielle de cette rencontre avec la Cité des Congrès de Nantes. EMH a été fortement impliqué dans la préparation de cette événement : deux chercheurs ont été membre du Comité local d’organisation, et lors de la réunion elle-même, plusieurs agents ont été mobilisés pour en assurer le bon déroulement. Le budget global de cette événement a été de 326 000 €, prés de 800 scientifiques y ont participé et 600 communications et posters y ont été présentés. La qualité de l’organisation a été saluée tant par les responsables du CIEMque par les participants.

[4] ANNEXE 1 : Indicateurs de production

4.1 Production scientifique et technologique (extrait Archimer) 2010 Rapport 26 Thèse 1 Publication 25 Acte de colloque 10 Ouvrage 1 Expertise / Avis 24 HDR 1 Poster 6 NbTotal documents 94 Moyens techniques et développement technologique Logiciels achevés ou transférés et opérationnels : sigle

Noms

WAO Web applicatif obsmer COSER Corrections sélections pour RFUFI Campagnes à la mer organisées par l'unité ou sous la direction d'un de ses membres Campagnes Océanographiques

Campagne Noms (P,C) Nb Jours Dates

Zone Navire Thème(s) d’études(s)

PELGAS Masse Jacques C 25/4-20/5 Golfe de Gascogne

Thalassa Ecologie des petits pélagiques

Campagnes Delaunay Damien P 4+17+5 Golfe de Chalutiers Id-

Page 26: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

26

Rapport d’activité 2010 du département EMH

sentinelles/DPMA (26/4-17/5 18-23/7, 26-30/9)

Gascogne professionnels

Nurse10 Brind’amour Anik C 3-19 sept Golfe de Gascogne

Gwen Drez Fonctionnement et réseau trophique des peuplements côtiers

P : partenaire C : chef

Relations avec les professionnels, l’administration, les collectivités territoriales, les médias

Nom des partenaires

Thème Noms agents EMH

Nb réunions /opérations

Professionnels CNPMEM Paris

Commission Anchois Sardine. Assemblée annuelle

Delaunay + Massé Forest

2 1

Professionnels La Turballe Professionnels Lorient

PPDR/Anchois

Pêcherie profonde

Delaunay + Massé Lorance + Trenkel

1 3

Bateaux professionnels

Campagnes sentinelles Delaunay 7

UAPF Réunion avec les parties prenantes pêche française Analyse données Profession "Pêcherie profonde"

Lorance 2

Salon de la pêche

Table ronde développement durable et pêche plaisancière Nantes, 6/3

Forest 1

FCD Rencontre scientifique FCD sur les ressources halieutiques et l’aquaculture.

Forest 1

Administration CMF Cluster Maritime Français Forest 1 DGAL Réunion Chlordécone Bertrand 1 DPMA Amélioration Plan Obsmer

Obsmer Réunion dictionnaires des données biologiques DCF. Réunion DPMA/DCF/Obsmer GT Eaux profondes Copil étude DPMA TBMF

Badts Dintheer Dintheer Dintheer Lorance Trenkel

6

Page 27: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

27

GRISAM Comité Directeur Forest MEEDDM Restitution des actions relatives à

relatives à la convention MEEDM/IFREMER 2010 DCSMM Chefs de file

Bertrand Dintheer

2

Ministère santé

Plan Chlordécone Bertrand 4

DCF Comité de pilotage Mise en place DCF 2010-2013 DCF/Corse programme national 2011

Dintheer 3

ONEMA Réunions pour la mise en cohérence des référentiels taxinomiques

Martin 3

COGEPOMI Réunion des correspondants. Forest 1

Coordination plan Chlordécone et administrations associées Martinique et Guadeloupe

Séminaires de bilan du PCNA I et préparation du PCNA II

Bertrand 3

DREAL

Démarrage de l'inventaire ZNIEFF mer en Pays de Loire Pêche et développement durable

Martin Forest

1 1

Collectivités territoriales AGLIA Rochefort/Mer

22è Rencontres Interrégionales Forest,DorayPetitgas

1

CCR Sud Réunion Delaunay 2

Conseil Régionl Pays de Loire

Conseil scientifique régional du patrimoine naturel CSRPN

Martin 1

SMIDAP l’Hotel Région

Restitution travaux 2009 Comité scientifique

Forest Forest

2

Conférence Ifremer 6/5 Forest André 1 Conférence EPICEA Challans 1/10 Forest André 1 Ciné débat/Océan, Nantes 29/04 Forest André 1

Conférences grand public

Festival de Noimoutier, bar des sciences ‘Des femmes et des mers’

Martin Jocelyne

1

Page 28: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

28

Rapport d’activité 2010 du département EMH

4.2 Participations à des colloques, séminaires et groupes de travail Hors site Ifremer de Nantes

Objet, lieu, date Nom ASC CIEM, Nantes, Cité des Congrès, 20-24/09 Badts Vincent International Symposium on 80th Anniversary of the Institute of Oceanography and F Split 20-22/10

Bertrand Jacques

DG Mare Appel à propositions. Rome 3-5/2 Bertrand Jacques Réunion Projet Marifish Chios (EL) 17-21/2 Bertrand Jacques Atelier thématique : mise en place d'un réseau national de suivi des peuplements côtier Dinard 2/3

Brind’amour Anik

PGCCDBS/PGMED Lisbonne 1-5/3 Dintheer Christian meeting DCF Regional Data Bases. Bruxelles 22-24/2 Dintheer Christian WKMERGE Copenhague 18-22/1 Dintheer Christian WGACEGG Palma de Majorque 22-26/11 Doray Mathieu 22è Rencontres Interrégionales de l'AGLIA. Rochefort/Mer 12/10 Doray M. Forest A.,

Petitgas P. XII International Symposium on Oceanography of the Bay of Biscay Brest 3-6/5

Doray Mathieu Laffague Pascal

Réunion de projet Badminton Murcia 16-18 /11 Fauconnet Laurence Réunion de projet Badminton Ijmuiden 17-21 /5 Fauconnet Laurence Réunion génétique et halieutique Lorient, 23/06 Forest André Comité organisation P6, Lorient 24/06 Forest André Conseil CIEM Copenhague 27-28/10 Forest André Colloque Aires Marines Protégées La Rochelle 15-17/11 Forest André GT évaluation stock crevettes de Guyane Cayenne 16-21/12 Forest André ASC CIEM, Nantes, Cité des Congrès, 20-24/09 Forest André Réunions ICES WKMOR et WGPBI Aberdeen (UK) 21-26/3 Huret Martin Réunion Projet FACTS La Rochelle 15/3 Huret Martin WGOOFE groupe travail CIEM Brest 7-9/6 Huret Martin Essais Zooscan et séminaire Boulogne s/Mer 12-14/10 Huret Martin Réunion Reproduce/Marifish Barcelone 16-19/11 Huret Martin Conseil CIEM Copenhague 27-28/10 Huret Martin

ASC CIEM, Nantes, Cité des Congrès, 20-24/09 Huret Martin Scientific meeting Coralfish Milan 30/11-3/12 Laffargue Pascal Réunion Steering Comitee Corafish et Worshop Video Analysis Bruxelles 29-30/9

Laffargue Pascal

Colloque ANR Newon Paris 3-6/2 Laffargue Pascal GT Benchmark WKDEEP Copenhague 16-24/2 Lorance Pascal WGDEEP Biologie et évaluation des ressources des pêcheries profondes Copenhague (DK) 6-14/4

Lorance Pascal

Réunion Long distance RAC (1) GT 2 Regional Fisheries Organizations and North Atlantic VIGO 14-16/4

Lorance Pascal

Atelier Deepfishman WP3 et Deepsea biology Conference Reykayvik 6-20/6

Lorance Pascal

Advice Drafting Group COR (ADGCOR) Copenhague 9-11/5 Lorance Pascal Atelier Deepfishman WP4 WP5 Londres 27-28/5 Lorance Pascal Conférence Making the Most of Fisheries Information Underpinning Policy Galway, Ireland, 23-26/8

Lorance Pascal

Page 29: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

29

Objet, lieu, date Nom Symposium "Improved Fisheries and Science Partnerships as Policy Drivers Ostende 9-11/11

Lorance Pascal

ASC CIEM, Nantes, Cité des Congrès, 20-24/09 Lorance Pascal Réunion MEXICO GDR Avignon 17-19/3 Mahevas Stéphanie Marifish Symposium Barcelone 14-19/11 Mahevas Stéphanie Réunion LOT2 VMS+LOGBOOKS analysis Ijmuiden 25-27/10 Mahevas Stéphanie Mexico BAO Paris 13/9 Mahevas Stéphanie Conférence ECOLOGIE 2010 - Organisation de la session halieutique Montpellier

Mahevas Stéphanie

Réunion Plénière LOT2 VMS+LOGBOOKS analysis Paris 22-24/6 Mahevas Stéphanie Réunion MEXICO GDR Avignon 17-19/3 Mahevas Stéphanie GT de synthèse, Allegro Harmonie sur les référentiels Lorient 21/01 Martin Jocelyne WGACEGG Palma de Majorque 22-26 Nov. Masse Jacques Groupe de travail WGANSA Lisbonne 23-29/6 Masse Jacques Première conférence Algéro-Française Universitaire et de Recherche, Alger 18-21/10.

Masse Jacques

WKFRAME2 (Second Workshop implementing the ICES MSY Framework) Copenhague 10-14/1

Mesnil Benoît

WKFRAME (Workshop implementing the ICES MSY Framework) Copenhague 22-26/3

Mesnil Benoît

ICES WKMOR et WGPBI Aberdeen 21-27/3 Petitgas Pierre CIEM Science Committee Copenhague 04-06//5 Petitgas Pierre ASC CIEM, Nantes, Cité des Congrès, 20-24/09 Petitgas Pierre Joint ICES/Acousmed Workshop WKACUGEO, ICES Working Group WGACEG Palma de Majorque 20-21/11 22-25/11

Petitgas Pierre

WG Ecosystem Effects of fishing Copenhague 6-15/4 Rochet Marie-Joëlle Atelier Sizemic. (Présentation invitée) Barcelone 20-22/6 Rochet Marie- Joëlle Réunion annuelle des Pew Fellows Barcelone 24-29/9 Rochet Marie- Joëlle Workshop on Selective Fishing and Balanced Exploitation in Relation to Fisher Nagoya (JP) 12-19/10

Rochet Marie- Joëlle

Réunion de projet Badminton Murcia 15-18/11 Rochet Marie- Joëlle ASC CIEM, Nantes, Cité des Congrès, 20-24/09 Rochet Marie-Joëlle Réunion de travail dans le cadre du projet Deepfishman Bath 9-15/1 Trenkel Verena Réunion lancement projet européen FACTS Jerez (ES) 18-20/1 Trenkel Verena Réunion du groupe de travail FAST San Diego 24/4-1er/5 Trenkel Verena Réunion Projet FACTS La Rochelle 15/3 Trenkel Verena Réunion du projet FACTS Londres 13-15/4 Trenkel Verena Comité d'orientation du programme P6 Lorient 24/6 . Trenkel Verena Réunion génétique et halieutique Lorient 23/6 Trenkel Verena GT CIEM WGFE (Fish Ecology) Sète 5-10/9 Trenkel Verena Cérémonie de remise 2è Trophées Ifremer Paris 20/10 Trenkel Verena Séminaire génétique en halieutique Sète 15-17/12 Trenkel Verena ASC CIEM, Nantes, Cité des Congrès, 20-24/09 Trenkel Verena

Page 30: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

30

Rapport d’activité 2010 du département EMH

Sur le site Ifremer de Nantes

Objet, lieu, date Nom Projet Chlosed 29/4 Bertrand Jacques GT IP SIH campagnes 10/5 Bertrand Jacques Atelier Chlordécone 13-17/9 Bertrand Jacques SIH GT indicateur 7-9/12 Bertrand Jacques Réunion Amphore 14-15/1 Brind’amour Anik Rencontre projet Agrocampus 6/3 Brind’amour Anik Rencontre GT analyses spatiales 24-28/5 Brind’amour Anik CA de l’AFH 3/6 Brind’amour Anik Rencontre HAPLOOPS 13/7 Brind’amour Anik Réunion Amphore 18-19/10 Brind’amour Anik Groupe de travail CIEM WKANSARNS Workshop on ANchovy SARdine and climate variability in the North Sea and adjacents areas. 6-9/7

Huret Martin Petitgas Pierre

Réunion préparation projet "Beyond MSY" 16-17/9 Laffargue Pascal Réunion de projet DEEPFISHMAN 14-17/9 Lorance Pascal Réunion indicateurs DEEPFISHMAN et MARIFISH 2-3/12 Lorance Pascal ISIS-FISH PPDR 25/1 Mahévas Stéphanie Réunion Anchois-Université 26/3 Masse Jacques GT CIEM Méthodes WKADSAM 27/9 au 1er /10 Mesnil Benoît Atelier application CLOST 12-16/4l Mesnil Benoît Plan d’échantillonnage pour l’observation à la mer 7/9 Rochet Marie-Joëlle GT sur la modélisation qualitative 25/10 – 3/11 Rochet Marie-Joëlle Réunion POPEX TECOS VISTHA 24-25-26/11 Trenkel Verena

Forest André Séminaire des observateurs (Nantes du 15 au 17/12/2010) Badts Vincent

Rochet Marie-Joëlle

Page 31: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

Rapport d’activité 2010 du département EMH

31

4.3 Expertise d'articles scientifiques

Revue Expert Nb articles

Journal of the Marine Biological Association Martin Jocelyne 1 Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Science Trenkel Verena 1 Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Science Petitgas Pierre 1 Fisheries Research Trenkel Verena 1 Progress in Oceanography Trenkel Verena 1 Fisheries Oceanography Petitgas Pierre 2 ICES Journal of Marine Science Trenkel Verena 25 ICES Journal of Marine Science Mathieu Doray 1 ICES Journal of Marine Science Pierre Petitgas 1

4.4 Expertise de projets

Type de projet Lieu Expert Nombre de projets Gestion de pêcheries cadre correspondance Lorance Pascal 1 Campagne à la mer correspondance Lorance Pascal 2 NMFS Atlantic bluefin tuna competitive grants award program

correspondance Rochet Marie-Joëlle 1

CAMEO (comparative Analysis of Marine Ecosystem Organization)

correspondance Rochet Marie-Joëlle 1

Icelandic Research Council correspondance Trenkel Verena 1

4.5 Jurys de thèse et HDR

Sandrine ALIZIE Université Lille Comité de thèse Brind’amour Anik M Jérôme SPITZ La Rochelle Jury de thèse Brind’amour Anik E Benjamin MARTINEZ Université Lille Jury de thèse Brind’amour Anik E Lenaig Hemery. MNHN Comité de thèse Laffargue Pascal M Sigrid LEHUTA Agrocampus Rennes Jury de thèse Mahevas Stéphanie D Emily WALKER. Montpellier IRD Jury de thèse Mahevas Stéphanie R Delphine ROCKLIN. Montpellier Jury de thèse Mahevas Stéphanie E Paul MARCHAL Université Montpellier Jury de thèse Forest André E Sakina AYATA Univ.Paris 6 Jury de thèse Petitgas Pierre E Sigrid LEHUTA. Agrocampus Rennes Jury de thèse Petitgas Pierre D

E : examinateur ; R : rapporteur ; D : directeur de thèse ; M : membre

4.6 Commissions de recrutement

Unité Etablissement Expert Jury concours Directeurs et Chargés de recherches

IRD Marseille Forest André

Recrutement CDI technicien DYNECO VIGIE IFREMER Badts Vincent

Page 32: Département Ecologie et modèles pour l’halieutiqueDORAY Mathieu 12.01.2009 au 09.07.2010 Post-doctorant DURIEUX Eric 02.03.2009 au 31.08.2010 Post-doctorant DELAUNAY Damien 14.04.2009

32

Rapport d’activité 2010 du département EMH

4.7 Commissions d’évaluation Unité Etablissement Expert CSS3 (Commission scientifique spécialisé)

IRD Marseille Forest André

Evaluation AERES de l’UMR-ESE Agrocampus INRA Rennes Forest André

4.8 Nominations

4.9 Visites / Accueils de personnels extérieur à EMH chercheur, stagiaires, etc.

Nom Visiteur (statut) Etablissement et pays d'origine

Thème Durée/ Dates

Correspondants EMH

BLANCHARD Julia (chercheur)

Collège impérial de Londres

Test d'indicateurs pour l'approche écosystémique des pêches et dans le cadre du projet UE DEEPFISHMAN

01/12/2010 au 31/01/2011

Rochet M.Joëlle Trenkel Verena

ANDRE Jessica (chercheur)

Université Tasmanie Modélisation d’une pêcherie à petite échelle avec Isis-Fish

08/11/2010 Mahévas Stéphanie

BENOIT Hugues (Chercheur)

DFO Canada Evaluation du rôle à la prédation par le phoque gris

02/11/2010 Trenkel Verena Rochet Marie-Joëlle

HOSACK Geoffrey (Chercheur)

CSIRO Tasmanie Des modèles trophiques généraux existant adaptés à une gamme de cas d'études particuliers

23/10/2010 au 03/11/2010

Trenkel Verena

CRAIG Mundy (chercheur)

Université Tasmanie Spatial Performances Measures

01/06/2010 Rochet Marie-Joëlle Trenkel Verena

ARCHAMBAULT Benoît (stagiaire)

Agrocampus Rennes Evaluation par le modèle Isis-Fish des measures de protection et de restauration de stock de pêches.

01/03/2010 au 31/08/2010

Mahévas Stéphanie

FERHI Hakim (stagiaire)

Creufop Montpellier L’évaluation du stock de poissons par acoustique avec embarquement sur un navire océangoraphique

01/03/2010 au 02/07/2010

Massé Jacques

HAOUCHINE Mohamed (chercheur)

USTHB Algérie Traitement des données et l’évaluation finale campagne Pelgas10

25/04/2010 au 11/06/2010

Massé Jacques