Documentation Médicale

Comment interroger la base de données Pubmed?

CIRD de Ouagadougou

Objectifs

Consulter la base de donnée Pubmed de façon autonome

Connaître les principes de base de l’utilisation d’un langage documentaire

Réutilisation de ces principes avec d’autres bases de données

Plan de la présentation

Présentation globale de Pubmed Effectuer une recherche par sujet Fonctions avancées de Pubmed

Présentation

Pubmed est une base de donnée bibliographique porté sur les ressources documentaires biomédicales.

Pubmed est un service de l’US National Library of Medicine.

Possibilités de Pubmed

Recherche par sujet Recherche par auteur Recherche par périodique

Pubmed peut aussi permettre d’accéder au texte intégral de l’article.

Visite rapide de l’interface

Hinari

Se connecter à Hinari permet l’accès à de nombreuses ressources en texte intégral

http://who.int/hinari/fr

Effectuer une recherche par sujet

Exemple de recherche : Je recherche des informations sur

la prévention du paludisme par les antibiotiques.

Mots-clefs : prevention; paludisme; antibiotique;

Langues et langages documentaires…

Pubmed est une base de donnée américaine. Il convient de traduire en langue anglaise les termes employés pour notre recherche.

Pour cela, ce site peut être utile : http://terminologiecismef.chu-roue

n.fr/

Première équation de recherche dans Pubmed

Malaria AND Prevention AND Anti-Bacterial Agents

332 résultats de recherche à l’équation.

Utilisation du Thésaurus de Pubmed, le MeSh

Le MeSh permet d’utiliser une liste organisée de termes, qui sont unifiés et organisés hiérarchiquement.

Pour trouver un terme du MeSH, il suffit de sélectionner la base de donnée MeSh et d’y entrer le terme recherché. Exemple de « malaria »

Hierarchisation des termes dans le MeSH

Vers une nouvelle équation de recherche

Paludism => malaria Prevention => Prevention and

control (à ajouter en tant que sous sujet du terme « malaria »)

Anti-Bacterial Agents

Elaborer une nouvelle équation de recherche

Elaborer une nouvelle équation de recherche

Equation de recherche

Lancer la recherche en cliquant sur “Search Pubmed”

"Malaria/prevention and control"[Mesh] AND "Anti-Bacterial Agents"[Mesh]

50 résultats trouvés

Opérateurs [mh] = [mesh] , descripteur meSH [majr] , descripteur meSH qui est thème

principal du document [mh:noexp] , descripteur meSH qui ne

prend pas en compte les spécifiques du descripteur

[majr:noexp] , descripteur meSH thème principal du document , ne prend pas en compte les spécifiques du descripteur

Equation de recherche

On souhaite que Malaria/prevention and control soit thème principal des articles recherchés.

"Malaria/prevention and control"[Majr] AND "Anti-Bacterial Agents"[Mesh]

24 documents trouvés

Lire la notice d’un document La notice apporte plusieurs

informations. Résumé, noms des auteurs, titre de

l’article, périodique de publication Le champs descripteur apporte de

l’information sur le contenu de l’article, et peut permettre de savoir très rapidement sur quoi porte l’article.

Accès aux documents

Sélectionnez l’article qui vous intéresse.

Cliquez sur l’icône qui apparaît en haut à droite de la fenêtre et qui permet d’accéder au document.

Les documents qui ne sont pas accessibles peuvent être consultés par commande via article@inist.

Exemple d’accès au document Dans le cas de cet exemple, le

document est accessible via la base de donnée Science Direct.

Le périodique concerné est consultable par les utilisateurs.

Lien : http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/fulltext/120747099/PDFSTART

Limitations à la recherche

On souhaite que les documents trouvés soient rédigés en français, ou que ceux-ci soient disponible en texte intégral.

Pour ces otions, il faut utiliser l’option « limits » de Pubmed

Equation de recherche

L’équation de recherche reste la même

Documents en français : 7 résultats Disponible en texte intégral : 29

résultats Documents disponible en français

ET en texte intégral : 0 résultat