BO N°spécial du 21 mai 1998 BO N°30 du 28 juillet 1994

BO N°22 du 24 juin 1993

52

211.6. Metabolisme intermtklffire, m&abolisme des glu-cides, des lipides et des composks azotés

.r2 11.7. Biosynthése et dégradation des glycoconjugues

g 11.8. Bases molr$culaires de l’évolution

” 11.9. Biochimie analytique

g Ill Biologie e t 66ndtique mdbcuiaires

111.1. Biosynthkse et dégradation des acides nucfeiques

111.2. Biosynthése et dégradation des protéines

111.3. Méthodologies de la biologie moléculaire et sesapplications

111.4. Organisation moléculake de l’information génétique

111.5. ControIe de l’expression de l’information génétique.

111.6. la conservation de l’information génétique.

111.7. La fluidité génétique- .

IV. Biologie cëilulaire_

IV.l. Méthodes d’étude de la cellule

IV.2. Ultrastructure de la cellule animale et végétale

IV.3. Compartimentation cellulaire, dynamique et inté-gration des constituants cellulaires

IV.4. La communjcation inter-cellulaire

IV.5. Le cycle cellulaire et sa régulation

IV.6. La diffërenciation cellulaire

IV.7. Les interactions virus-cellule

V Immunologie

V.l. Réactions de defense de l’organisme

V.2. Les bases cellulaires de l’immunité

V.3. Structure des immunoglobulines solubles et mem-branaires -.r..

V.4. Réaction antigène-anticorps

V.5. Déterminisme genettique de la specificité immuni-taire

5.1. Les génes des immunoglobulines5.2. Les rkcepteurs des cellules T5.3. Le complexe majeur d’histocompatibilite

Vll.5. La reproduction

Vll.6. Pharmacodynamie et toxicologie

Vll.7. Grandes mguiations homéostatiques

Vll.8. Physiopathologie des maladies infectieuses d’ori-gine bacterfenne et virale

VIII. Technobgies et techniques biihimiquas et bio-logiques

V.6. Mecanismes de la rkaction immunitaire VIIl.l. Technologies et techniques biochimiques

V.7. RBgulation et dysfonctionnement du systéme im-munitaire

V.8. Applications cliniques et en recherche fondamentale

VI Microbiibgie g6nbrate et appüqub

VI.l. Méthodes et techniques de la microbiologie

Vl.2. Les micrcorganismes Eucaryotes

Vt.3. Les microorganismes Procaryotes

Vl.4. Croissance et mktabolisme des microorganismes

Vl.5. Le métabolisme des bactéries chimiotrophes

Vl.6. Génétique microbienne

Vl.7. Les différents groupes bactériens

Vl.8. Importance économique des microorganismes etdes cellules Eucaryotes

Vl.9. Principes et méthodes des biotechnologies

VI.16 Microorganismes et pathologie -.

VI.1 1. Interactions microorganismes - organismes su-périeurs

Vl.12. Etude des virus

VII Bilogie humaine

VII.l. Neurobiologie

Vll.2. Milieu intérieur

Vll.3. Endocrinologie

Vll.4. Les fonctions de nutrition4.1. Besoins de l’organisme et leur couverture4.2. Digestion et absorption intestinale4.3. Cœur et circulation4.4. Respiration.4.5. Ponctions rénales

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Vlll.2. Technologies et techniques micmbiologiques

Vlll.3. Technologies et techniques physiologiques

Vlll.4. Technologies et techniques chimiques

PROGRAMME DETAILLE

Chapitre 1 :Chimie générale et analytique

1.1. De l’atome a la molécule

1.1. L’atome

1.1.1. Le noyau- Constitution, stabilité- Réactions nucleaires- Radiictffité : principaux types ; loi de’drkmis-

sance radioactive ; principe des mesures ; uni& ; ap-plications.

1.1.2. Les Blectrons- Quantlfication de l’energie ; nombres quanti-

ques ; orbitales atomiques- Classification périodique des éléments ; confi-

guration électronique des atomes- Pmpri&k des atomes, Energie d’ionisation ; af-

finité électronique ; rayon atomique ; électronégativité

1.2. La liaison chimique

1.2.1 Liaison et édifices covalents- Représentation de Lewis ; liaison de covalence

dative ; formes de résonnance - effet mésomère- Hybridation des orbitales atomiques- Principe de la théorfe des orbitales moléculaires- Théorie VSEPR (règles de Gillespie)

- Propriétés des molécules : longueur de liaison ; ker-gie de liaison ; moment dipolafre ; polarisation ; effetinductif ; isomerfes planes ; stéréoisoméries

1.2.2. interactions faibles- Liaison de Van der Waals ; liaison hydrogène ;

interactions hydmphobes. Applications

1.2.3. Interaction ionique- Reseau crtstallin ; maille ; motif ; énergie Mi-

culaire

1.2.4. Applications : 4.3. Influence de la temperature- Structure Mctronique et mode de liaison des

atomes d’importance biologique (C. H, N, 0, S, P, Na,Ni, Se, V, K. CI, Mg, Mn, Ca, Fe, Zn, CO, Mo).

4.4. Mécanismes r6actionnek Principe de I’&ape lente.Appmximation de l’état stationnaire.

1.2. lhwmodynamique chimique

2.1. Principes de la thermodynamique ; fonctions et va-riables d’etat

4.5. Catalyse : definition et proprir% d’un catalyseur- Exemples de catalyse homogéne et hMrogene

en chimie minerale et en chimie organique. Catalyseenzymatique.

2.2. Potentiel chimique- Definition- Diverses expressions ; etats standards : gaz z

parfaits ; solutions idéales ; solutions réelles (force io-nique, actfvfté, calculs simples de coefficients d’activité)

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- Applicationsz

2.3. Thermodynamique appliquee aux rkactions chimi- zoques

- Chaleur et enthalpies de réactions ; vanations iavec la temperature

- Enthalpie libre ; variation en fonction de I’avan-cernent d’une r6action ; affinite chimique ; enthalpie li-bre standard, variation avec la temperature

- Etats stationnaires. -Équilibre chimique : constante d’équilibre ;

déplacement

vert)Etat stationnaire de non équilibre (Systerne ou-

2.4. Étude du corps pur. Diagramme d’equilibres

1.3. Équilibres en solution aqueuse

3.1. L’eau solvant

3.2. Acides ; bases (Bronsted)

3.3. Composés peu solubles

3.4. Complexes

3.5. Couples redox :- Aspects thermodynamiques : prévision des

réactions, applications de la formule de Nernst- Aspects cinétiques : courbes intensite - potentiel

et applications

1.4. Cinétique chimique

4.1. Vitesse globale d’une rt$action : definition, étudeexpérimentale

4.2. Influence des concentrations. Ordre d’une réac-tion. Constante de vitesse. Etude des réactions d’or-dre simple. R&$ions reversibles. Reactions successi-ves.

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m 1.5. Chimie anaifliqusg2 Méthodes d’analyse qualitative et quantitative :-zz: 5.1. Électmchimie ; potentiométrie ; conductimétrie ;

ampémmetrie ; polarographieNy 5.2. Méthodes spectrales : spectmmétrre d’émssion,c d’absorption (infra-rouge, visible, ultraviolet) ; fluori-g métrie. Résonnance magnétique nucléaire.

Spectrométrie de masse. Diffraction des rayons Xpar les cristaux. (Principes).

Chapitre II :Biochimie structurale et métabolique

11.1. introduction à la biochimie

1 .l Structure et propriétés des principales fonctionsintervenant dans les composés biologiques (fonctionshydroxyle, thiol, carbonyle, carboxyle, amine, amide,phosphoryle).

1.2. Composés aromatiques et hetérocycliques

11.2. Constituants biochimiques élémentaires

Les méthodes d’identification, d’isolement et de dosa-ge font partie intégrante de l’étude de chacun des cons-tituants biochimiques simples.

2.1. Structure et propriété des glucides : aldoses, cé-toses, desoxyoses, structure cyclique, stérkochimie, liai-son osidique

2.2. Principaux oses, oligosides et hétémsides natu-rels : esters phosphoriques et sulfuriques, osamines,acides uroniques, acides sialiques, acide muramiqueet acide ceto-desoxyoctanoique. Nucléoside, nucléoti-des oses.

2.3. Structure et proprietés des lipides : acides gras,glycérides, phospholipides, sphingomyélines, sulfolipi-des.

2.4. Carotenoïdes, isoprénoïdes, terpénoïdes, stérolset leurs dérivés : stéroïdes hormonaux.

2.5. Les prostaglandines et dérivés.

2.6. Les amino-acides : formules, configuration, pro-priétés, ionisation

La liaison peptidique, les peptides naturels d’in-térêt biologique

2.7. Les nucleotides et leur enchaînement dans les aci-des nucléiques

- Analogues des nucléotides- Proprietés physico-chimiques, configurations

11.3. Structure des constituants macromolé-culaires

3.1. Les acides nucléiques- Méthodes appliquées à l’isolement et à I’ktude

de la structure des acides nucléiques- Les différents types de double hélice d’ADN- Topologie des ADN circulaires et des complexes

nucléoprotéiques- Structure de la chromatine et interactions

protéines-acides nucléiques, méthodes d’étude- Bude comparée de la taille et forme de chro-

mosomes d’origines variées (virus, bactéries, eucaryo-tes)

- La structure et conformation des ARN de trans-fert des ARN messagers, des ARN ribosomiques et desARN nucléaires de petite taille

- Les particules ribonucléoprotéiques

3.2. Les pmtéines- Méthodes d’isolement et de purification des pro-

téines, critéres de purete et méthodes de détermina-tion de la masse moléculaire d’une protéine. Détermi-nation de la composition et de la séquence des acidesaminés

- Structure tridimensionnelle des protéines (struc-ture secondaire, tertiaire et quaternaire).Liaisons covalentes et non covalentes impliquées. Tailleet forme des molécules de protéine. Stabilité et chan-gements conforrnationnels

- Modifications chimiques des protéines ; protéi-nes radiomarquées, protéines fluorescentes, pontagesintermoleculaires de chaînes polypeptidiques

- Etude des relations structure-fonction de pro-téines structurales (actine, myosine. collagénes, fibro-nectine), h&opmtéines (hémoglobine, myoglobine), ré-cepteurs membranaires (rrkepteurs d’hormones, deneuromédiateurs, de facteurs de croissance cellulaire).

- Notions sur les méthodes de traitement infor-matique pour l’analyse de la structure, mobilité et évo-lution des molécules de protéines.

3.3. Polysaccharides, pmtéoglycanes et glycoprotéines

3.3.1. Polysaccharides- Amidon, glycogène, cellulose, hemicelluloses.

dextranes. h é t é r o p o l y s a c c h a r i d e s .

3.3.2. Pmteoglycanes et mucopolysaccharides ; les pep-tidoglycanes des enveloppes bactériennes.

3.3.3. Glycoprotéines- Méthodes chimiques, physiques (RMN et spec-

trométne de masse) et enzymatiques de déterminationdes structures

- Structure des copules glucidiques et leurs rô-les dans la conformation, la stabilité et les fonctions dereconnaissance des proteines ,

3.4. Les complexes lipidiques et lipoprotéiques- Les lipoprotéines (HDL, LDL, VLDL)

- Les membranes (bicouche lipidique et protéi-nes intégrées)

- Les micelles lipidiques, les liposomes.

11.4. Les enzymes et la catalyse enzymatique

4.1. Données génerales sur les mécanismes de la ca-talyse enzymatique. La formation des complexesenzyme-substrat et les méthodes d’analyse en dnéti-que rapide.

4.2. La cinétique enzymatique Michaelienne dans le casd’un seul et de deux substrats limitants (exemples sim-ples). Définition et signifkation des paramétres cinéti-ques. Condition et définition de la mesure de l’activitéenzymatique. Données sur l’efficacité de la catalyseenzymatique.

4.3. Les effecteurs de l’activité enzymatique (tempé-rature, pH, cations). Activation et inhibition de I’activi-té enzymatique.

4.4. Les enzymes allostériques. Modeles de fonction-nement, effecteurs allostériques.

4.5. Principes de marquage par affinité du site actif desenzymes.

4.6. Principes de la détermination de la constante d’af-finité et du nombre de sites par dialyse à l’équilibre.

4.7. La spécificité de la catalyse enzymatique. Étudede quelques mécanismes réactionnels : enzymes pro-téolytiques, lysozyme, ribonucléase, lactate deshydro-génase

4.8. Les coenzymes. Interactions avec I’apoenzyme,couplage des réactions par l’intermédiaire de coenzy-mes. Coenzymes d’oxydoréduction, coenzyme A, te-trahydrofolate, thiamine pyrophosphate, biotine, pyri-doxal phosphate, groupements prosthétiques divers.

4.9. La régulation de l’activité enzymatique et le con-trôle génétique de la synthèse des enzymes. Compar-timentation et assemblages multienzymatiques. Effec-teurs de l’activité enzymatique, sous-unnés régulatri-ces, altérations de l’activité et de la spécificité. Cata-bolisme des enzymes. Proenzymes. Inhibiteurs natu-rels. Rôle des enzymes dans l’accomplissement etl’orientation des réactions métaboliques ; données ther-modynamiques

4.10. Principes de la classification des enzymes

4.11. Ribozymes

4.12. Abzymes

4.13. Les enzymes en tant qu’outils. Enzymes immo-bilisés, principes d’immunoenzymologie. Applications

55

industrielles, applications analytiques (au laboratoire eten analyse médicale).

11.5. Bioénergétique

5.1. Oxydoréductions, équilibres et potentiels d’oxydo-réduction ; principaux systemes d’oxydoréduction chezles êtres vivants ; deshydrogénases a coenzymes pyri-diniques et flaviniques, protéines fer-soufre, transpor-teurs quinoniques, cytochromes, catalases, peroxyda-ses, oxygénases. superoxyde-dismutases.

5.2. Chaines respiratoires aérobies et anaérobies ; fer-mentation. Méthode génerale d’etude des chaines bio-logiques de transport d’électrons

5.3. Conversion de l’énergie. Molécules a enthalpie Ii-bre d’hydrolyse élevée : ATP, phosphoénol pyruvate,créatine phosphate, acyl CoA. Phosphorylations oxyda-tives et ATPase. agents découplants, théorie chimio-osmotique

5.4. Photochimie, photosynthése : loi d’Einstein, ren-dement quantique, spectre d’action, pigments récep-teurs. Transferts d’électrons, photophosphorylationschez les pmcaryotes et les eucaryotes. Bioluminescence.

5.5. Réduction de l’azote moléculaire. Productiond’hydrogène chez les êtres vivants,

11.6. Métabolisme intermédiaire, métabolismedes glucides, des lipides et des composésazotés

6.1. Méthodes générales d’étude des voies métaboli-ques : emploi des molécules marquées, obtention et uti-lisation des mutants génétiques.

6.2. Origine métabolique de l’énergie- Décarboxylation, oxydation des acides CY-

cétoniques, complexes multienzymatiques, coenzymesimpliqués

- Cycle des acides tricarboxyliques et cycle duglyoxylate

- Glycolyse. fermentations lactique et éthanolique ;effet Pasteur, régulation de la glycolyse

- Formation du phosphoénolpyruvate à partir dupyruvate

6.3. Métabolisme des glucides- Glucogénèse et néoglucogénèse- Dégradation du glucose par la voie des pento-

ses phosphates- Interconversion des oses- Phosphorolyse et biosynthése du glycogène el

de l’amidon- Métabolisme des mucopolysaccharides

6.4. Metabolisme des lipides- Oxydation des acides gras satures. Biosynthèse desacides gras satures. Complexes multienzymatiques de

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gsynthése chez les animaux, systemes bactériens et vé-gétaux. Désaturation des acides gras. Origine metabo-

- lique des pmstaglandines. Metabolisme du proponiate.s - Biosynthese du mévalonate et de ses dérives= isoprenoïdes et stéroïdesz - Biosynthese des triglycérides, phospholipides

‘ (acides phosphatidiques, phosphatidylcholine, -sérine,01 -ethanolamine, -inositol et dériv&,), sphingolipides0c - Metabolisme des glywlipides et des suffotipides

m 6.5. Metabolisme des composés azotes- Dksamination. décarboxytation, transamination :

structure, role et mécanisme des enzymes catalysantles réactions dépendant du pyrtdoxal-phosphate

- Voies d’entrée de l’azote dans le métabolisme- Biosynthése des osamines et de l’acide sialique- Métabolisme des acides aminés- Rble des acides amines dans ta synthese d’hor-

mones et d’amines pnkentant une activiie physiologique- les acides aminés comme source d’unités car-

bon& dans le métabolisme (sertne, histidine, dans lesréactions de méthylation (méthionine)

- Synthese du Ievulinate et du noyau porphyrini-que : héme et chlorophylles

- Synthèse des nudéotides puriques et pyrimi-diques. Reduction du ribose

- Régulation des différentes voies de biosynthè-se des composés azotes : acides aminés, nucléotides,osamines

- Voies d’élimination de l’azote. Cycle de l’uréeacide urique, creatinine. Production d’acetyl coenzy-me A et de corps cetoniques a partir des acides aminés

- Maladies heréditaires affectant le métabolismedes acides aminés et des glucides chez l’homme

6.6. Rktions de detoxification, glycuronoconjugaison,réactions d’oxydation et de conjugaison

11.7. Biosynthèse et dégradation des glyco-conjugués

7.1. Glycoprotéines a groupement N-glycosidique,biosynthése des complexes oligosidedolichol, glycosyl-transférases et glywsidases spkfiques, maturation desglycoprotéines et translocation dans l’appareil de Gol-gi, les membranes et les lysosomes

7.2. Biosynthése des glycoprotéines a groupement O-glycosidique

7.3. Les glycolipides, biosynthèse

7.4. MBcanismes de regulation de la biosynthése et dela degradation des glywwnjugués. Maladies associéesà des defauts du métabolisme des glywconjugues

11.8. Bases molkulalres de IWolution

8.1. Informations appportees par l’étude comparée desséquences en acides aminés de protéines (exemple ducytochrome C)

8.2. Données fournies par I’etude des homologies deséquence des acides nucleiques (hybridation molécu-laire, comparaison de sequences nucleotidiques).

8.3. Donn&es fourni& par l’analyse de l’organisationde l’information génetique chez les eucaryotes (séquen-ces répétées, gènes complexes en mosaïque, pseudo-gènes, familles multigéniques).

8.4. Mecanismes hypothétiques de la complexificationgénétique au cours de l’évolution : phénomènes decmssing-over inegal, notion de rétrotransposition.

8.5. Notions sur les méthodes mathématiques d’eta-blissement d’arbres phyfogénetiques

11.9. Biochimie analytique

9.1. Théorie et applications des méthodes de centrifu-gation et uttracentrifugation. Applications au fraction-nement subcellulaire et à l’isolement de macmmokcules.

9.2. Solubilité, force ionique, méthodes de précipita-tion. Melanges hydroorganiques. Partition de phase.

9.3. Methodes colortmétriques, spectrophotometrtqueset spectmfluomméttiques. Méthodes de dosage spéci-fique des constituants organiques de la cellule (protéi-nes, acides nucleiques, glywwnjugués). Methodes par-ticulières au dosage des substances ioniques (Na+,K+, Ca2+).

9.4. Méthodes de filtration et ultrafiltration, dialyse.

9.5. Bases théoriques des methodes chromatographi-ques : adsorption, partage, échange d’ion, tamisagemoléculaire, affinite.

9.6. Pratique de la chromatographie en couche minceet sur papier. Chromatographie sur colonne : en pha-se liquide, d haute pression, en phase gazeuse.

9.7. Spectmmétrie de masse.

9.8. Méthodes électmphoretiques et immunoélectmpho-rétiques,

- &ctrophon?se sur papier ou acétate de cellulose- +ctrophokse en gel : agarose. polyacrylamide- Electrophorese capillaire- IsorWtrofocaliition et isotachophorése- &ectmphorése en champs puise- Immunodiffusion, immunoélectrophorese- Transfert sur membrane de nitrocellulose

9.9. Notions sur les mt!thodes de marquage des molé-cules biologiques et applications : applications de I’uti-lisation des isotopes stables et radioactifs, marqueursfluorescents, bioluminescence et chimioluminescence.résonnance magnétique nucléaire.

9.10. Cartographie des pmteines, des acides nucleiques.

57

9.11. Méthodes d’étude des interactions : ligands-récepteurs, pmteines-protéines, proteines-acides nu-cléiques, protéines-glucides, acides nucléiques-acidesnucléiques. Techniques d’hybridation et d’identificationapres transfert sur membrane.

Chapitre III :Biologie et génétique moléculaires

111.1. Biosynthése et dbgradation des acidesnucléiques

111.1.1. La replication de I’ADN

1 .l .l . Méthodes d’étude in viw ef in vitro

1.1.2. Les replicons, procaryotes et eucaryotes ; ca-ractères généraux de la réplication de I’ADN

1.1.3. La machinerie enzymatique de réplication, pro-priétés physico-chimiques, propriétés catalytiques in viveet in vitro des composants de l’appareil de réplication(ADN polymérases, hélicases, protéines à haute affini-té pour I’ADN, ADN primase, ADN topoisomérases, ADNligase)

1.1.4. Action concertée de ces protéines au niveau desfourches de réplication. Complexes multienzymatiques

1.1.5. Mécanismes particuliers de la réplication des bac-tériophages à ADN simple brin, à ARN, des virus on-cogènes à ADN, des rétrovirus, du génôme des orga-nelles. Mécanismes de terminaison de la réplication deschromosomes linéaires

1 .1.6. Régulation de la réplication

lll.l.2. La transcription de I’ADN

1.2.1. Notion de gène

1.2.2. Les ARN polymérases, structure polymériquechez les procaryotes, râle des différentes formes chezles eucaryotes

1.2.3. Mécanisme de la transcription in viw et in vi-tro, promoteurs procaryotes et eucaryotes, séquencesmodulatrices et activatrfces, facteurs de transcriptiongénéraux et spécifiques, terminaison de !a transcrip-tion, stabilité des molecules d’AAN

1.2.4. Génes en mosaïque, maturation des ARN pré-messagers et mécanismes moléculaires de l’épissage

1.2.5. Maturation des transcrits primaires des gènesde I’ARN ribosomique et des tARN

1.2.6. Propriétes de la chromatine transcriptionnelle-ment active

1.2.7. Carte de transcription de quelques génomes sim-ples : SV40 et polyome, ADN mitochondrial des ver-té- 2brés

.c111.1.3. La dégradation des acides nucléiques

2s

1.3.1. Mécanisme d’action des enzymes impliqués dansla degradation de I’ADN et de I’ARN (endo et exonu-

i

clbases spécifiques et non spécifiques)or

0

1.3.2. Applications à la cartographie des acides nucléi- mques

III.2 Biosynthèse et dégradation des protéi-nes

111.2.1. La traduction

2.1 .l. Structure et composition de l’appareil de traduc-tion. Regulation de la synthèse de ses composants.Agents inhibiteurs de la traduction et leurs applications

2.1.2. Le code génétique, méthodes d’etude. Signauxde traduction portés par I’ARN messager. Choix du cadrede lecture.

2.1.3. L’initiation de la synthése des protéines, fac-teurs impliqués, diffërences entre procaryotes et eu-caryotes, quelques exemples de régulation s’exerçantau niveau de l’initiation de la traduction

2.1.4. L’élongation des chaînes polypeptidiques, mé-canismes moléculaires, role des tARN et aminoacyl tARN

2.1.5. La terminaison des chaînes polypeptidiques, fac-teurs de terminaison. Les tARN suppresseurs

111.2.2. Les événements post-traductionnels

2.2.1. Transport et sécrétion des protéines, peptide SI-gnal, mécanismes moléculaires de transfert dans le ré-ticulum endoplasmique

2.2.2. Biosynthèse des glycopmtéines, translocation etmaturation, régulation

2.2.3. Conversion des préprotéines en protéines actives

2.2.4. Phosphorylation et déphosphotylation des pro-téines : rôle dans la rkgulation de l’activité enzymatique

2.2.5. Phénomènes de protkxyse intracellulaire, pro-téases ATP dépendantes. Remodelage cellulaire, le plas-minogène et son activateur

111.3. Nthodologies de la biologie mokulai-re et ses applications

3.1. Principes des manipulations génétiques in vitro

58

3.2. Les outils enzymatiques utilises pour le clonageg genettique

g 3.3. Divers types de vecteurs utilisables, vecteurs d’am-plification, d’expression, vecteurs navette procatyotes-

g eucaryotes .,

” 3.4. Introduction de molecules d’ADN etranger dansc les cellules hôtesz2

3.5. Methodes de sélection

3.6. Réalisations pratiques, clonage de séquences spé-cifiques, constitution de banques et méthodes de cri-blage, fusion d’opérons et de gènes, production de pro-téines, reprogrammation des organismes végétaux etanimaux (animaux et végétaux transgéniques)

3.7. La détermination de la séquence des acides nu-cléiques et celle des protéines à partir des ARN mes-sagers ou de I’ADN

111.4. Organisation moléculaire de I’informa-tion génétique

4.1. Différentes classes de séquences de I’ADN des cel-lules eucaryotes. Methodes d’étude par cinétiques derenaturation et d’hybridation ADN-ARN et ADN-ADN.

4.2. Étude de l’organisation de représentants de cha-cune de ces classes de séquence : ADN satellite. séquen-ces hautement répétées, dispersées, séquences moyen-nement répétées

4.3. Organisation de gènes complexes en mosaique

4.4. Gènes alternatifs et chevauchants

4.5. Familles multigéniques

111.5. Contrôle de l’expression de l’informationgénétique

5.1. Les opérons procaryotes, analyse génétique et or-ganisation moléculaire. Régulation de l’expression gé-nétique par induction-répression, repression cataboli-que, régulation par atténuation, régulation au niveaude la traduction, réponse stringente et relaxée

5.2. Un exemple de fonctions régulatrices intégrées,le contrôle des fonctions lytiques ou lysogéniques (exem-ple du bactériophage X )

5.3. Les differents niveaux de la régufation de I’expres-sion génique chez les Eucaryotes

5.4. Perte du contrble de l’expression de l’informationgenétique : la transformation cellulaire induite par desagents physiques, chimiques et viraux. Phénoménesde translocation chromosomique. Oncogénes et antion-cogènes cellulaires et viraux

111.6. La conservation de l’information géné-tique

6.1. Les différents types de lésion de I’ADN, agentsgénotoxiques et mutagenes

6.2. Mécanismes enzymatiques de la réparation deI’ADN chez les procaryotes et les eucaryotes

6.3. Le systemes SOS de réparation chez les bactéries

6.4. Systemes expérimentaux d’identification des agentsmutagènes (Test de Ames, inductest, chromotest)

6.5. Restriction et modification chez les bactéries. Dif-férentes classes d’enzymes et mécanismes d’action

6.6. Maladies de la réparation de I’ADN

111.7. La fluidité génétique

7.1. La recombinaison génétique généralisée, mécanis-mes moléculaires du n crossing over n. Modèles topo-logiques

7.2. La recombinaison site-spécifique : exemple du mé-canisme d’intégration du phage A.

7.3. La transposition génétique chez les procaryoteset les eucaryotes. Éléments transposables chez les pro-caryotes (IS, transposons, phages) et les éléments mo-biles chez les eucaryotes, organisation moléculaire desdifférentes classes d’éléments génétiques mobiles

7.4. Mécanismes moléculaires de la transposition et con-séquences de la transposition au niveau genétique

7.5. Intégration des rétrovirus dans le génome des cel-lules eucaryotes

7.6. Remaniements liés au contrôle de l’expression gé-nétique ou de la diversité génétique : chez les procaryo-tes (exemples du bactériophage F. des salmonelles),chez les eucaryotes (exemples de la levure, trypano-some, maïs, drosophile, gènes des immunoglobulines)

7.7. Le crossing-over inégal et ses conséquences évo-lutives. La conversion génique

7.8. L’amplification génetioue et l’acquisition de carac-tères de résistance aux drogues. L’amplification géné-tique programmée au cours du développement

Chapitre IV : I

Biologie cellulaire

IV.l. Méthodes d’étude de la cellule

1 .l MQhodes morphologiques - Microscopie optiqueet électronique.

Immunocytochimie et radioautographie 3.5. Mécanismes de I’adhksion cellulaire

1.2. Les méthodes de fractionnement cellulaire IV.4. La communication intercellulaire

1.3. Méthodes de conservation du mat&iel biologique 4.1. Signaux et rkepteurs

1.4. Culture de tissus et de cellules animales et végé-tales ; applications industrielles

4.2. Les mécanismes de transduction ; médiateurs in-tercellulaires

&0c

1.5. Exploration fonctionnelle du métabolisme cellulaire

1.6. Utilisation de traceurs de l’architecture et de I’ac-tivit6 cellulaire

4.3. Les types de @onses m

IV.5 Le cycle cellulaire et sa dgulation

IV.2. UltrastnMure de la cellule animale etvégétale

5.1. Les phases du cycle cellulaire, croissance et divi-sion cellulaire

5.2. La mitose, la méiose2.1. La membrane plasmique

- Architecture, perméabilités, transports actifs etpassifs

5.3. Facteurs de croissance cellulaire

- Les différents modes de relation intermembra- 5.4. Imrnortalisation et. transformation cellulaire, mé-naire, structure des jonctions différenci8es canismes, rôle des oncogènes cellulaires et viraux

2.2. La paroi des cellules végétales 5.5. Renouvellement biologique, vieillissement

2.3. Le cytosol et le cytosquelette- Microtubules, microfilaments et filaments inter-

médiaires. L’appareil cinétique et ses dérivés : cils etflagelles

lV.6. Diffhnciatlon cellulaire et développe-ment

2.4. Les organites cytoplasmiques- Réticulum endoplasmique et appareil de Golgi :

inter-relations- Lysosomes. peroxysomes- Mitochondries- Chloroplastes

6.1. Caractéres généraux de la différenciation cellulai-re, facteurs chimiques de différenciation, tératomes

6.2. Bases moléculaires de la diffërenciation cellulaire.Le maintien de l’état différencié

6.3. Cellules germinales et fëcondation

2.5. Le noyau- Enveloppe nucleaire- Nucléoplasme- Nucléoles- Chromatine interphasique, chromosomes, me-

thodes de la cytogénétique

IV.3. Compartimentation cellulaire, dynami-que et intégration des constituants cellulai-res

3.1. Origine des constituants

3.2. Modalités de reconnaissance, de transport et d’in-tégration des molkcules de la cellule : cytosol, mem-branes, noyaux, lysosomes, peroxysomes. mitochon-dries

3.3. Dynamique des réseaux membtanaires. endocy-tose. phagocytose, pinocytose, exocytose, mecamsmesmoléculaires

3.4. Les composants des matrices extracellulaires

6.4. Les mécanismes cellulaires et moléculaires du dé-veloppement

6.5. Étude de quelques types de cellules différenciées :

(Se reporter au chapitre VII. 1 du programme de Biolo-gie humaine)

lV.7. Les interactions virus-cellule

(Se reporter au chapitre Vl.6. du programme de mi-crobiologie)

Chapitre V : immunologie

V.1. Réactions de défense de l’organisme

1.1. Barr&es anatomiques et physiologiques de luttecontre l’agression

1.2. Immunité anti-infectieuse spécifique et non SP&cifique

60

1.3. Repenses immunitaires non spécifiques : phagocy-g rose, intervention de cellules tueuses

5 1.4. Les réactions inflammatoires2

x 1.5. La réaction antigène-anticorps

” V-2. Les bases cellulaires de l’immunité

i 2.1. Anatomie du système immunitaire

2.2. Les différentes catégories cellulaires impliquéesdans la réponse immunitaire (lymphocytes 6, T et ma-crophages)

2.3. La sélection clonale

V.3. Structure des immunoglobines solubleset membranaires

3.1. Diverses classes d’immunoglobulines solubles etmembranaires, IgM, IgG, IgA, IgD. IgE et leurs sous-classes.

3.2. Structure fine, domaines constants, domaines va-riables. Pmprietés antigéniques des immunoglobulines :allotypie, idiotypie

V.4. La réaction antigène-anticorps

4.1. Antigènes, épitopes, haptènes

4.2. Réaction antigène-anticorps, sites anticorps. Affi-nité et avidité

4.3. Activation du système enzymatique du ccmplément.Mécanismes moléculaires de la lyse cellulaire

VS. Déterminisme génétique de la spécifici-té -immunitaire

5.1. Les gènes des immunoglobulines- Organisation des familles de gènes des chaî-

nes legéres et lourdes d’immunoglobulines- Réarrangements génétiques générateurs de di-

versité- Mécanismes d’expression des gènes des chai-

nes lourdes et Iégéres ; biosynthése des anticorps- Changement d’expression de classe au cours

de la repense immunitaire

5.2. Les recepteurs des cellules T- Structure des recepteurs membranaires- Organisation des genes et réarrangements gé-

netiques- Fonction des recepteurs des cellules T

5.3. Le complexe majeur d’histocompatibilité- Structure des molecules du complexe majeur

d’histocompatibilitéantigènes de classe 1,

antigénes de classe II- Fonctions des molecules du complexe majeur

d’histocompatibilite- Organisation génétique du complexe

V-6. Mécanismes de la réaction immunitaire

6.1. Antigénicité

6.2. Réponse primaire et secondaire

6.3. Mécanismes de présentation des antigènes

6.4. Coopérations cellulaires dans la réponse immunitaire

6.5. Facteurs solubles et régulation : interleukines.lymphoxines, monokines, interférons, lymphotokines,facteurs de croissance et de différenciation

6.6. Prolifération et différenciation leucocytaire

6.7. Les récepteurs cellulaires des immunoglobulines,des interleukines et des facteurs du complément

6.8. Mécanismes cellulaires et moléculaires du rejet degreffe, réaction du greffon contre l’hôte

6.9. Les réactions d’hypersensibilité immédiate et re-tardée

V.7. Régulation et dysfonctionnement dusystème immunitaire

7.1. Régulation de la synthèse des anticorps : la théo-rie du réseau

7.2. Mémoire et tolérance immunitaire

7.3. Maladies du systéme immunitaire- Allergies- Maladies autoimmunes- Déficits immunitaires congenitaux- Syndrome d’immunodeficience acquise- Pmlifëration anarchique des cellules du systè-

me immunitaire : myélomes, lymphomes

V.8. Applications cliniques et en recherchefondamentale

8.1. Les vaccins

8.2. Immunothérapie

8.3. Transplantation d’organes

8.4. Rybridomes et anticorps monoclonaux

8.5. Methodes classiques de sérologie : precipitation,agglutination, neutralisation, immunofluorescence, fii-tion du complément

61

8.6. Oosages radio-immunologiques

8.7. Oosages immuno-enzymatiques

Chapitre VI :microbiologie générale et appliquée

VI.1. Wthodes et techniques de la microbio-logie

1.1. Techniques des cultures pures

1.2. Théorie et pratique de la stérilisation

1.3. Antiseptiques, désinfectants et antibiotiques

1 .4. Les milieux de culture et les milieux sélectifs

1.5. Techniques de dénombrement

1.6. La conservation des souches microbiennes

1.7. Techniques d’identification des microorganismes

V1.2. Les microorganismes eucaryotes

2.1. Structure des cellules eucaryotes : algues, cham-pignons, protozoaires

2.2. Techniques d’isolement et d’identification

2.3. Croissance et développement

2.4. Différenciation des systèmes végétatifs

2.5. Reoroduction sexuée e? asexuée

2.6. Métabolisme et tolérance aux conditions extrêmesde milieu

2.7. Les Mycorhizes

2.8. Notions de systématique

Vl.3. Les microorganismes procaryotes

3.1. Morphologie

3.2. Structure et composition de la cellule. Fonctionsdes structures obligatoires et facultatives. Formes derésistance.

3.3. Étude comparée des Archaéobact&ies, des Eubac-téries et des Eucaryotes.

Vl.4. Croissance et métabolisme des microor-ganismes

4.1. Croissance

- Définition de la croissance :l Expressions mathématiques de la croissance.l Mesure de la croissance.

g

l Cmissance synchrone, diauxie, croissance con- =tinue et discontinue 2

xd- Les conditions de la croissance :

l Sources d’énergie et de carbone.l Sources d’azote (fixation de l’azote)

zac

t Oligoéloments. Sidérophores 0

l Facteurs de croissance.a

l Conditions physico-chimiques : O,, CO2, t”C,pH, pression osmotique, a,, pression, inhibiteurs aecroissance.- Interactions entre populations microbiennes.

4.2. Les diffërents types trophiques : photolithotmphes.photoorganotrophes, chimiolithorophes, chimioorgano-trophes. Autotrophes. auxotrophes, pmtotmphe (cf. pm-gramme de biochimie pour l’étude des voies métaboti-ques générales).

4.3. Transports actifs

4.4. Protéines a exporter

VIS. Le m6tabolisme des bactéries chimio-trophes

5.1. Métabolisme des chimioorganotrophes- Fermentations : lactique, propionique, butyrique, aci-des mixtes, alcoolique, succinique, acétonobutylique.acétique, de Stickland.- Respiration :

l Respiration aérobie : les chaines de transporteursd’électrons, cycle de Krebs, voie du glyoxylate.

l Respiration anaémbie : respirations sur fumarate.sur DMSO. sur N-oxyde de triméthylamine, sur nitra-te, réduction des sulfates et du soufre. Méthanogénèse.

5.2. Métabolisme des chimiolithotrophes- Bactéries oxydant le soufre, le fer et le manganèse- Bactéries de la nitrification- Bactéries chimioliihotrophes facultatives : oxydationde I’hydrogene mol&culaire. de l’oxyde de carbone- Bactéries méthanotmphes et méthylotrophes

5.3. Metabolisme des bactéries phototmphes- Metabolisme des Archaéobactéries- Métabolisme des Eubactéries : cyanobact&ies, Rho-dospirillaceae, Chromatiaceae, Chloroflexaceae

5.4. Fixation du CO2 par les bactéries

5.5. RGgulation du m&abolisme microbien. Divers typesde mkanismes de contrôle (se referer aux program-mes de Biochimie et de Biologie et Génétique Molrku-laire)

62

2Vl.6. Gbnétique microbienne

-.g

(se reporter au programme de génétique)

.g 6.1. Variabilité et mutation chez les microorganismesT (mutagénèse, criblage et sélection, test de Ames)

z - Transfert de matériel génétique chez les bactéries :0 transformation, transfection, transduction, conjugaison,= conversion lysogénique.z - Les principaux groupes de plasmides. Importance

pratique.- Recombinaison- Séquences d’insertion et transposons

6.2. Génétique des champignons (levures et champi-gnons filamenteux) : reproduction sexuée et asexuée,parasexualité, transformation, génie génétique.

Vl.7. Les différents groupes bactériens

7.1. Principes et méthodes de la taxonomie

7.2. Structure phylogénique des Eubactériales- Mendosicutes : Archaéobactéries- Ténéricutes : Mollicutes- Gracilicutes- Firmicutes

VI.& Importance économique des microorga-nismes et des cellules eucaryotes

8.1. Biomasse : substrats, microorganismes (bactéries,levures, champignons filamenteux, basidiomycètes, cya-nobactéries, algues)

8.2. Métabolites primaires : acides aminés, acides or-ganiques, alcools et solvants, bioénergie et biofuel, li-pides, nucléotides, polysaccharides, vitamines et pig-ments alimentaires.

8.3. Métabolites secondaires : alcaloïdes, antibiotiques,produits pharmacologiquement actifs (analgésiques, an-tidiabétiques, anticholestérolémiques, antihypertenseurs,antiinflammatoires, antiiumoraux, immunomodulateurs.inhibiteurs d’enzymes).

8.4. Production de protéines étrangères par les microor-ganismes : interleukine 3, streptokinase, ahtigène deI’hépatite B, hormone de croissance, interfémrr, chymo-sine, etc.

8.5. Aromes

8.6. Insecticides et pesticides, insecticides et némati-cides. Lutte biologique : virus contre virus, virus con-tre bactéries, virus contre champignons. Phénomènesd’antagonisme : bactéries contre batteries. bactériescontre champignons, champignons contre champignons.

8.7. Substances de croissance végétales : gibbérelli-nes, acide abscissique.

8.8. Produits obtenus à partir de cellules animales enculture : production de vaccins, insuline, hormone decroissance, activateurs du plasminogène.

8.9. Produits synthétises par les cellules végétales :shikonine, alcaloïdes.

8.10. Production d’enzymes : amylases. B-galactosidase, cyclodextrine, glycosyl-transférase, glu-cose isomérase, inulase, lipases, pectinases, protéa-ses, enzymes diverses (amino-acylase, asparaginase,aspartase, cellulases, chitinase, cholestérol-oxydase.dextrinase, glycérokinase. hyaluronidase. hydantoina-se. R-lactamases, leucme déshydrogénase, linamara-se. naringinase, nitrnase, oxydases, xylanases. ..).

8.11. Les électrodes à enzymes

8.12. Biitranformations : antibiotiques, acides aminés,vitamines, prostaglandines, stéroïdes.

8.13. Épuration biologique des eaux et biolixiviation.Bactéries et xénobiotiques.

8.14. Les aliments fermentés- notions d’hygiène alimentaire- produits végétaux : ensilage, choucroute, pickles,olives, produis asiatiques ou africains (sauce de soja,miso, sufu, natto...). Pain, café, cacao, manioc.- produits laitiers : laits acidifiés (yaourts, kéfir), fro-mages frais, cottage-cheese, cheddar, fromages à pâ-te molle, fromages à pâte pressée et fromages à pâtepersillée, fromages à pâte cuite. Maturation des froma-ges et role des microorganismes.- produits carnks- boksons alcoolisées : vins, cidre, bière, saké, vinde palme.

Vl.9. Principes et méthodes des biotechno-logies

9.1. Biosécurité

9.2. Maitrise des populations microbiennes : sélectiondes souches, conservation, inoculum.

9.3. Conditions de culture pour les microorganismes.

9.4. Planification expérimentale.

9.5. Bioréacteurs et fermentation.

9.6. Cinétique des « fermentations u industrielles.

9.7. Systèmes immobilisés.

9.8. Génie genetique appliqué à la médecine, à I’agro-nomie, à l’industrie micmbiologique et pharmaceutique.

9.9. Criblages de nouvelles molécules.

9.10. Cellules animales : clonage et expression géné-tique.

12.8. Les virus oncogènes.

12.9. Les rétrovirus.9.11. Cellules végétales : micropropagatiis, embryonssomatiques, végétaux transgéniques. Chapitre VII : biologie humaine

9.12. Applications industrielles.

X10. Microorganismes et pathologie

10.1. Les toxines microbiennes (bactéries, champi-gnons), diphtérie, tétanos. choléra, enterotoxines destaphylocoques, toxines de clostridium, toxines des en-térobactérfes, mycotoxines.

VII.l. Neurobiologie

1 .l . Méthodes d’études. cm

- Exploration fonctionnelle de l’activité nerveuse.- Notions de neurochimie et neuropharmacologie.- Électrophysiologie cellulaire, u patch-clamp n.

10.2. Épidémiologie et maladies infectieuses. 1.2. Les cellules excitables :

10.3 Colonisation microbienne et invasion. Notion de - Les cellules nerveuses. Potentiel de membrane etvirulence, chimiothérapie et antibiothérapie. potentiel d’action

10.4. Les principales bactéries pathogènes des verté-brés et des inverfébnk : staphylocoques, streptocoques,Bacillaceae, mycobactéries, listeriose, entérobactéries,Campylobacter, Iégionellose, turalemie, brucellose,Pseudomonas, Sordetella et Haemophilus, Neisseria,Mycoplasme, Spirochete, Richettsia et Chlamydia.

- Les cellules musculaires- Les cellules sécrétrices- La transmission synaptique.

1.3. Ontogénèse et phylogénèse du systéme nerveux.

10.5. Les Protozoaires pathogènes (amides pathogè-nes, paludisme, toxoplasmose, maladie du sommeil.

1.4. Organisation du système nerveux central.

10.6. Les principales bactéries pathogènes des végé-taux : Pseudomonas, Xanthomonas, Erwinla. Agrobac-térium, Corynebactéries, Mycoplasmes. Streptomyces.

1.5. Fonctions sensorielles, sensibilités cutanées, ladouleur, la vision, l’audition. Récepteurs. transduction,codage du message sensoriel. intégration centrale desperceptions.

VI.ll. Interactions microorganismes.organismes supérieurs

11.1. Types de symbioses.

1.6. Fonctions motrices.

- Les mouvements réflexes automatiques et volontaires- Régulation du tonus musculaire, posture et équili-bration

11.2. Fonctions des symbioses. - Les troubles des fonctions motrices : physiopatho-logie.

11.3. Les microorganismes du tube digestif des verté-brés. 1.7. Système limbique.

Vl.12. Étude des virus 1.8. Fonctions hypothalamiques.

12.1. Méthode d’étude, d’identification et de titrage.

12.2. Structure des virus.

12.3. Classification des virus.

12.4. Les cycles de réplication viraux.

12.5. Généralités sur les interactions virus-cellule.

12.6. Les bactériophages, la lysogénie, restriction-modification, développement abortif.

12.7. Étude de quelques exemples de virus végétauxet animaux.

63

1.9. Organisation structurale et fonctionnelle du systè-me nerveux autonome et du systeme nerveux entérique.

1 .lO. Exemples d’activités intégrées : langage, mémoi-re, apprentissage, vigilence, mflexes conditionnés. Com-portements alimentaire et sexuel et leur régulation.

Vll.2. Milieu intérieur

2.1. Composition des compartiments liquidiens intra-cellulaire et extracellulaire : sang, lymphe, liquide cé-phalomchidien.

2.2. Le plasma et les protéines plasmatiques, paramé-tres physico-chimiques plasmatiques.

64

2.3. Les éléments figures du sang, I’hématopoiése. Lesg groupes sanguins. L’hemostase.

0% Vll.3. Endocrinologie.-

7 3.1. Généralités sur le mode d’action des hormones ;

Fiélaboration, sécrktion, transport et métabolisme des hor-mones. Effets et mécanisme d’action cellulaire. Dévia-0c tions pathologiques et exploration clinique.

m3.2. Anatomie fonctionnelle et ontogénèse des glandesendocrines.

3.3. Thyroïde et hormones iodées.

3.4. Pancréas endocrine et régulation du métabolismedes glucides et des lipides.

3.5. Glandes surrénales et régulation des métabolismeshydrominéral, glucoprotéique et énergétique ; adapta-tion à l’effort physique.

3.6. Parahormone, calcitonine, cholécalciférol et méta-bolisme phosphocalcique.

3.7. Hormones du tractus digestif et du cœur.

3.8. Complexe hypothalamo-hypophysaire, neuro-endocrinologie, rythmes biologiques et sécrétions pul-satiles.

Vll.4. Fonctions de nutrition

4.1. Besoins de l’organisme et leur couverture

- Dépenses énergétiques et leur mesure, dépense ba-sale, variations selon l’état physiologique, déviations pa-thologiques, adaptations à l’effort- Besoins quantitatifs et qualitatifs en protéines, glu-cides, lipides, eau et minéraux- Nutriments indispensables. Vitamines et dérivés,cœnzymes, fonctions métaboliques- Ration alimentaire : principaux types d’aliments,composition, valeur énergétique, équilibre de la ration,principes de diétetique. adaptation aux états physiolo-giques

- Utilisation cellulaire et métabolisme des nutriments.Reserves énergétiques de l’organisme, tissu adipeux.Inter-relations et regulations métaboliques. Notions surles maladies nutritionnelles en particulier diabéte, obé-site, athérosclérose.

4.2. Digestion et absorption intestinale

- Sécrétions digestives- Motricite et transit- Absorption intestinale et transport des nutriments- Regulation nerveuses et hormonales

- Exploration des fonctions hépatiques et gastro-intestinales

4.3. Cœur et circulation

- Co?ur : origine et propagation de l’excitation, cou-plage excitation-contraction, électmcardiographie, cyclecardiaque. ControIe de l’activité du cœur- Vaisseaux : hémodynamique, régulation locale etsystémique de la circulation artérielle, artériolaire, ca-pillaire, veineuse et lymphatique- Adaptation cardio-vasculaire a l’exercice musculai-re, à l’état d’apesanteur, à I’hyperbarie ; aspects pa-thologiques : hémorragie, hypertension, insuffisancecardiaque.

4.4. Resoiration

- Transport des gaz respiratoires par le sang. Rôle del’hémoglobine- Mécanique ventilatoire, ventilation alvéolaire. échan-ges alvéole-capillaire- Régulation de la respiration- Adaptations respiratoires à l’exercice musculaire, àI’hypoxie, à l’altitude et à la plongée sous-marine- Respiration au niveau tissulaire ; effets de I’anoxie.

4.5. Fonctions rénales

- Methodes d’exploration- Filtration glomérulaire. réabsorption et excrétion tu-bulaire des ions, de l’eau, des composés organiques,du plasma, acidification de l’urine- Régulation de la composition et du volume des li-quides extra-cellulaires. Notions sur les aspects patho-logiques.

VII.5 Reproduction

5.1. Différenciation sexuelle et développement, puber-té, maturité, ménopause

5.2. Appareils reproducteurs masculin et féminin, lesfonctions exocrines et endocrines des testicules et desovaires

5.3. Régulation neumendocrinienne de la fonction dereproduction male et femelle ; gestation parturition, lac-tation

5.4. Methodes contraceptives ; lutte contre la stérilité.

Vll.6. Pharmacodynamie et toxicologie

6.1. Antimetabolites. analogues compktitifs. drogues ettoxiques : voies de pénetration. devenir métabolique,action cellulaire

6.2. Intoxications aigües et chroniques, dosesléthalesDL50 et DLlOO, pharmaco-dépendance. dopage

l à haute performance (HPLC)

6.3. Mécanismes de détoxication, excrétion des toxi-nes. venins, toxines végétales et microbiennes

l chromatographie en phase gazeuse

- Électrophorèse

6.4. Intoxications alimentaires et industrielles, kcotoxi-cologie.

1.2. Mthodes physiques et chimiques d’analyse quan- ktitative N

0tVll.7. Grandes rkgulations homéostatiques - Dosage gravimétriques

: < ,. ,7.1. Rôle intégrateur du foie dans l’organisme - Dosages volumétriques :

7.2. Régulation de l’equilibre hydre-minéral

7.3. Régulation du pH

7.4. Régulation de la calcémie

l determination des points d’équivalence par métho-des chimiques et par méthodes physiques : potentio-métrie. conductométrie, ampérométriel applications a la protom&ie, a I’oxydo-réduction àla complexométrie, a la précipitation dissolution.

7.5. Régulation de la glycémie- Dosages par méthodes optiques :

7.6. Thermorégulation

7.7. Adaptation au travail et à l’effort.l ’ polarimétrfel réfractométrie

Vll.8. Physiopathologie des maladies infec-tieuses d’origine bactérienne et virale

Se reporter paragraphe Vl.9. du chapitre de Microbio-logie générale et appliquée.

Chapitre VIII : Technologies et techni-

l spectrophotométrie des milieux troubles (néphélomé-trie, turbidimétrie, opacimetrie)l spectrophotométrie d’absorption moleculaire* spectrophotométrie d’émission atomiquel spectrophotométrie d’absorption atomiquel spectrofluorométrie

ques biochimiques et biologiques - Électrodes spécifiques : électrodes sensibles auxions, électrodes à gaz, électrodes à enzymes

VIII.l. Technologies et techniques biochimi-ques 1.3. Mthodes immunologiques de préparation, d’tden-

tification et de dosageCes technologies et ces techniques seront mises en œu-vre sur des produits biologiques d’origine animale ouvégétale ou microbienne, sur des aliments. des pro-duits pharmaceutiques ou cosmétiques.

- Immuno-précipitation en milieu liquide et en milieugélifié

1.1. Méthodes physiques et chimiques d’extraction, defractionnement, de purification et d’identiication

- Immuno-électrophorèse- Immuno-capture et immuno-affinité- Immuno-fluorescence- Immuno-enzymologie

- Broyages, filtrations, solubilisations fractionnées etrelargages 1.4. Enzymobgie et génie enzymatique

- Minéralisations- Centrifugations et ultra-centrifugations- Distillations

- Étude des parantétres cinéüques d’une rkaction enzy-matique ; influence des facteurs physiques et chimi-ques.

- Extractions solide-liquide et liquide-liquide- Dialyse et électro-dialyse

- Détermination d’activités enzymatiques et dosagesde substrats.- Utilisation d’enzymes immobilisees.

- Chromatographies : 1.5. Mnb bfmentaire

l chromotographie en phase liquide :l à pression ambiante : adsorption, partage, échanged’ions, gel-filtration, affinité

- Étude de fermentattons en laboratoire : suivi de cmis-sance ; production de biomasse ; production de méta-bdites ou d’enzymes.

65

2.E.=s

0m

66

s- Extraction et purification des produits formks.

-.f

1.6. Wthodologies g&ukales du g6nie g6n6tique1c=

- Isolement, purification et caractérisation des acidesnucléiques

N - Utilisation des enzymes agissant sur les acides nu-0c cléiques

m- Techniques bactériologiques appliquées au génie gé-nétique- Marquage et detection non radioactifs.

Vlll.2. Technologies et techniques microbio-logiques

Ces technologies et ces techniques seront appliquéesa l’analyse de produits biologiques d’origine humaine(sang, urine, matières fécales, pus. crachats. liquidecéphalo-rachidien), ê l’analyse et au contrôle des ali-ments, des eaux, des produits pharmaceutiques et cos-mktiques et au contrôle d’hygiéne des surfaces et deslocaux.

2.1. PrBparation et stérilisation des milieux de cultureet du matériel de laboratoire. PmblBmes de sécurité aulaboratoire de microbiologie

2.2. Observation, culture et identification des micro-organismes

- Techniques microscopiques : état frais, colorationsusuelles, colorations spéciales, observations en fondnoir, en contraste de phase et en fluorescence.

- Techniques de culture :

l préparation et étude de milieux sélectifs et non sélectifsl techniques d’ensemencement et d’isolementl cultures de bactéries aérobies et anaérobies ; cultu-res des champignons.

- Principales méthodes d’identification des bactérieset des champignons d’intérêt médical ou industriel :

l caractéres morphologiques, biochimiques et antigé-niquesl techniques classiques, techniques miniaturisées etautomatiséesl sondes non radioactives

2.3. Techniques de quantlfication des bactkies et deslevures

- Méthodes classiques :

* dénombrement en cellule, en milieu liquide, sur mi-lieu solide, par filtration sur membrane, par opacimétriel mesure de biomasse : par pesée, par dosage d’azote

l mesure de I’activitk microbienne : par mesure de laconsommation en substrat. par dosage d’un métabolite.

- Méthodes rapides :

l cytofluorom&-iel ATP-m&riel impédancemétrie.

2.4. Techniques de géndtique microbienne

- Étalement, clonage, sélection, répliques, transferts.transformation, recombinaison, transduction, transfec-tion.

2.5. Maîtrise des populations microbiennes

- Détermination du pouvoir bacténostatique et bacté-ricide, du pouvoir fongistatique et fongicide, du pou-voir sporicide- Recherche et dosage d’un composé antimicrobien :antibiotique, antiseptique, désinfectant, conservateur- Contrôle d’efficacité d’une substance antimtcrobien-ne.

2.6. Génie fermentaire

- Conservation des souches- Amélioration des souches : sélection, génie génétique- Production et contrôle d’une biomasse (cellules pro-caryotes ou eucaryotes)- Conduite et suivi d’une fermentation industrielle- Étude d’une bioconversion- Systèmes immobilisés.

2.7. Virologie

- Cutture de virus in vive : inoculation à l’animal, ino-culation au végétal, ovoculture- Culture de virus in vitro : diffërents types de cultu-res cellulaires, techniques de mise en culture, recon-naissance d’effets cytopathogénes sur des culturesfixées- Recherche et numération de bactériophages.

Vlll.3. Technologies et techniques physiologiques

3.1. Limites et conditions de la mise en œuvre de I’ex-périmentation animale :

- Réglementation française et européenne. Notion ju-ridique d’animal comme être sensible ; pmtection desanimaux domestiques ou sauvages contre les mauvaistraitements.

67

3.2. Mbthodes de substitution 4 l’expérimentation ani-male

3.3. Animaux utilis6s à des fins exp&imentalas (gre-nouille, souris, rat, cobaye, lapin)

- Génétique appliquée aux animaux de laboratoire ; es-péces, races et souches- Anatomie par systémes et anatomie topographique- Physiologie générale- tthologie des espkes et comportement des indivi-dus susceptibles d’être utiWs a des tins expkrimentales- Pathologie spontanée : maladies virales, bactérien-nes, parasitaires, zoonoses

- Statuts sanitaires des animaux.

3.4. Animaleries

- Administration et organisation d’une animalerie- Entretien et logement des animaux- Nourriture et régimes en fonction des buts d atteindre- Transport et réception des animaux, maniement, con-tention- Hygiéne et contrôle sanitaire

3.5. Techniques opératoires

- Techniques d’anesthésie : prrncipaux anesthésiquesutilisés, préparation de l’animal à l’anesthésie- Préparation d’une artère, d’une veine, d’un nerf,a’un organe in vivu ou in vitro- Pose de cathéters et de canules- Pose d’électrodes- Autopsie des animaux.

3.6. Techniques de prélévement et d’administration

- Prélèvement de liquides biologrques. de cellules etd’organes- MBthodes d’administration de susbtances :

l orale, sous-cutanée, intrapéritonéale, intraveineuse,intramusculaire, intracardiaquel perfusions.

3.7. Mdthodes d’enregistrement et de stimulation

- Enregistreurs et capteurs- Stimulateurs- Électrodes de rkception et de stimulation- Cuves d organes isok

3.8. Expkimentations mettant en œuvra les techniqueset les méthodes préciMes sur les espkes animales rB-pertorides

g

.g

-. Préparations microscopiques et observations- Étude de phénoménes physiologiques

‘2

- Explorations fonctionnelles 2

- Essais d’activité, d’efficacité et de toxicité des m& ocdicaments et d’autres substances biologiques et chi- gmiques

3.9. Euthanasie

Vlll.4. Technologies et techniques chimiques

Ces technologies et ces techniques seront mises en œu-vre sur des produits minéraux ou organiques en solu-tion (aqueuse ou non aqueuse) ou solides.

Elles consistent en méthodes d’analyse qualitative etquantitative :

4.1. 6faviméfrio

4.2. Volumétrie :

’ détermination des points d’équivalence par métho-des chimiques et par méthodes physiques : potentio-métrie, conductométrie, ampérométrie, polarographiel applications a la protométrie. à I’oxydo-réduction, àla complexométrie et à la précipitation

4.3. Utilisation d Wctrodes spécifiques sensibles auxions

4.4. Méthodes optiques :

* polarimétriel réfractométriel spectrophotométrie d’absorption moléculairel spectrophotométrie d’émission atomique* spectrophotométrie d’absorption atomique

*