Année 2008-2009

Phylogénie des microbes endolithiquesassociés aux basaltes marins

UE 106 DOM - Diversité des organismes marins

40 cm

Connaissances antérieures

1

Stuctures cellulaires observées

dans le basalte

Pillow lavas au niveau de la dorsale Est-Pacifique

5 µm 5 µm

40 cm

Santelli (2008) Nature

40 cm

Exemple d’une communauté microbienne en relation avec le basalte au Mont Baby Bare

Huber (2006) Environmental Microbiology 2

But de l’étude

Source : wikipedia

- Phylogénie des microbes associés à ces roches

-Distribution géographique des clades déterminés

3Source : www.geologie.ens.fr

Résultats et Discussion

4

11 clades monophylétiques solides originaires des sédiments, du basalte et du gabbro 

7 appartiennent aux bactéries

4 appartiennent au Marine Group 1 Crenarcheota

MGI Crenarcheota

ε-proteobacteria

β-proteobacteria

γ-proteobacteria

Division Candidate TM6

δ-proteobacteria

α-proteobacteria

Verrucomicrobia

AcidobacteriaPlanctomycetes

Firmicutes

Actinobacteria

ChloroflexiBacteroidetes

β-proteobacteria

δ-proteobacteria

α-proteobacteria

Verrucomicrobia

AcidobacteriaPlanctomycetes

Firmicutes

Actinobacteria

ChloroflexiBacteroidetes

(4 clades solides)

(2 clades solides)

(2 clades solides)

5

Colonisation de la croûte par clades cosmopolites et spécifiques.Un clade du MG1 endémique du basalte.

Clades différents de ceux trouvés dans les autres habitats marins Un nouveau monde …

Travail des autres équipes

6

Massana, 2000

- Etude basée uniquement sur les Archea

- Répartition mondiale

Huber, 2006

- Domination des Bactéries

- Clades différents de ceux des autres biotopes

7

Santelli, 2008 :

- Bactéries (66% de Proteobacteria) plus abondantes que Archea

-Clades différents de ceux des autres biotopes

- Répartition mondiale

Bibliographie

8

- Santelli C.M., Orcutt B.N., Banning E., Bach W., Moyer C.L., Sogin M.L., Staudigel H. & Edwards K.J. Abundance and diversity of microbial life in ocean crust. Nature 453 : 653-657 (2008)

- Huber J.A., Johnson P., Butterfield D.A. & Baross J.A. Microbial life in ridge flank crustal fluids. Environmental Microbiology 8 : 88-99 (2006)

- Santelli C.M., Edgcomb V.P., Bach W. & Edwards K.J. The diversity and abundance of bacteria inhabiting seafloor lavas positively correlate with rock alteration. Environmental Microbiology 1-13 (2008)

- Massana R., DeLong E.F., Pedros-Alio C. A Few Cosmopolitan Phylotypes Dominate Planktonic Archaeal Assemblages in Widely Different Oceanic Provinces. Applied and Environmental Microbiology. 66 : 1777-1787 (2000)