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A L I M E N T A T I O N

A G R I C U L T U R E

E N V I R O N N E M E N T

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Journées INRA-INRIA Mai 2007

Présentation générale du département MIA

Quelques exemples de réalisations

Eléments de cohérence et complémentarité avec l’INRIA

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-52 chercheurs; 35 ingénieurs; 23 techniciens et administratifs; 21 enseignants chercheurs ; 51 doctorants (au cours des 4 dernières années)

-Discipline principale des chercheurs : Statistique : 66 % Informatique : 23 % Système dynamique et contrôle : 11 %

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Politique scientifique :

Développer de la recherche dans nos disciplines pour faire avancer les sciences de la vie et de l’environnement

Privilégier les grands enjeux exprimés par nos partenaires des autres départements de l’INRA

Et sélectionner ceux pour lesquels nos disciplines peuvent apporter un plus décisif (essentiellement par de la recherche, mais aussi ingénierie et expertise).

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Deux champs thématiques : Bioinformatique, mathématiques et informatique pour les modèles issus du gène à l’individu

Localisation de régions fonctionnelles dans les séquences et prédiction de leur fonction Cartographie génétique Analyse de données d’expression : transcrits et protéines Réseaux de régulation et biologie des systèmes

Modèles et décision pour l’agriculture, l’environnement et l’alimentation

Ecologie et environnement Epidémiologie Gestion d’agro-éco-systèmes Analyse du risque alimentaire Conception et conduite de procédés

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Nos priorités méthodologiques visent à dépasser les clivages entre disciplines

Représentation et exploitation d’informations dynamiques et spatialisées

Algorithmique et complexité calculatoire

Modélisation et analyse statistique des données

Système d’information et ingénierie des connaissances

Modèles pour l’action

Systèmes complexes

Analyse et gestion du risque

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Quelques réalisations

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Quelques réalisations

Une structure de gène est un chemin dans le graphe

Les arrêtes sont pondérées par une « probabilité conditionnelle » (HMM) à paramètres variables

Le meilleur chemin est déterminé par un algorithme linéaire en temps

Eugene: détecteur de gène

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Quelques réalisationsEugene: détecteur de gène

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Quelques réalisations

Meta analyse de QTL

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Quelques réalisations

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Projets et réalisations

Projet Selommes : flux de gènes OGM à l’échelle du paysage

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Projets et réalisationsQuelques réalisations

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Projets et réalisationsQuelques réalisations

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Il y a de grands besoins en mathématiques appliqués et en informatique pour répondre aux enjeux des sciences de la vie et de l’environnement

complémentarité géographique

complémentarité méthodologique

construire des réseaux sur des enjeux méthodologiques

Cohérence et complémentarité avec l’INRIA