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A L I M E N T A T I O N A G R I C U L T U R E E N V I R O N N E M Les Lundis de la SGQA – H. Larroque - 22/01/2007 Domaine expérimental du Pin-Au-Haras Les expérimentations génétiques laitières Y. Gallard, J. Vandenbrock (Le Pin) J.J. Colleau, D. Boichard, H. Larroque (SGQA)

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Domaine expérimental du Pin-Au-Haras

Les expérimentations génétiques laitières

Y. Gallard, J. Vandenbrock (Le Pin)J.J. Colleau, D. Boichard, H. Larroque (SGQA)

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Détection de QTL dans un croisement Normand x Holstein

Races très différentes sur leur aptitude à produire, la qualité du lait, la morphologie, la mobilisation corporelle…

Dispositif F2• familles de pleines sœurs F2 de taille importante (pour des bovins) en recourant au transfert d’embryons

Le Pin5 - La thématique

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Reproduction et conduite du troupeau

Transfert d’embryons et sexage partiel (40 donneuses collectées 3 fois / an)

Les embryons: 1/3 transférés en frais, 1/3 sexés, 1/3 congelés

220 vêlages de receveuses, 120 premières lactations

Réforme lors de la 2ième ou au début de la 3ième lactation

Le Pin5 - La création des familles

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Le Pin5 - La création des familles

10 70F1 1- 4 F1 par F01995

1 F0 2- 4 F05 NO 12 PHF0

5 PH 13 NO

1993

691F2 10 F2 par F1 1997 - 2003

(3 à 21 pleines soeurs)

Fin des L1 fin 2006

Structure familiale finale

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Le Pin5 – Les mesures phénotypiques

• Quantité et composition du lait

• Microfabrication fromagère (40 l de lait) (A. Delacroix : UBLO - Jouy ) • Plasmine (D. Dupont : SRTL - Poligny)

• Composition en acides gras du lait, taille des globules gras (P. Faverdin, C.Hurtaud, UMR PL - Rennes)

• Métabolisme de la lactation, mobilisation corporelle (P. Faverdin: UMR PL - Rennes)

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Le Pin5 – Les mesures phénotypiques

• Mammites (J.C. Ogier: UBLO - Jouy )

• Reproduction, précocité, cyclicité post partum(P. Monget, J. Saumande: PRC - Nouzilly)

• Aptitude à la traite(P.G. Marnet: UMR PL - Rennes)

• Coloration(J.J. Lauvergne: UMR GDA - Jouy , A.Oulmouden: UMR GMA - Limoges)

• Pointage morphologique (UPRAs Prim’Holstein et Normande)

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Le Pin5 – Les marqueurs

Genome Scan : 169 marqueurs microsatellitesLABOGENA

LGBC

Typage des caséinesLGBC

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Le Pin5 – Les analyses

Une primo détection en 2004 (sur des caractères de production et de morphologie)

• Des phénotypes et des typages partiels

• Un test du logiciel d’analyse (QTLMAP) pour ce type de dispositif

• Des premiers résultats encourageants:Analyse du TB => ségrégation de DGAT1

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Le Pin5 – Les perspectives

• Une analyse complète qui démarre

• Poursuite des recherches sur les QTL

• Affiner la position et les effets de certains QTL

• Caractériser les QTL par une approche de génomique fonctionnelle

➟ Le Pin6: procréation de nouveaux individus F2 des mêmes familles puis production d’une génération « avancée »

➟ participation au projet Agenae: GenoMilkFat (GMF)

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Le Pin5 Le Pin6

La transition

• F2 encore vivantes insuffisantes

• Recréer des F2 hors protocole à partir d’un stock d’embryons congelés

➟ grandes familles de F2 bien caractérisées

• Création d’une génération supplémentaire: Mâle F1 X Femelle F2= « F3 »

• Calendrier:Campagnes 2003 2004 2005 2006 2007

Décongélation d ’embryons F25 familles Production d ’embryons F3

Procréation des F3

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GenoMilkFat: Projet GENANIMAL 2005 Porteur du Projet : Koenraad Duhem (CNIEL) Responsable scientifique : Patrice Martin (INRA-GPL)

Projet: GenoMilkFat

Biologie intégrative de la fonction mammaire et adaptabilité de la matière grasse laitière

Impact des facteurs génétiques et alimentaires sur les caractéristiques de la matière grasse laitière et sur les propriétés

techno-fonctionnelles des constituants du lait

Financement:Partenariat :

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Globule Gras

GénétiqueQTLs &

Polymorphismes

AlimentationFourrages

Supp. lipidique

Micelle de caséines

Génomiquefonctionnelle

Biologie cellulaire

Impact sur la composition du lait et sur les propriétés techno-fonctionnellesde ses constituants

BiochimieTechnologie

* Matière Grasse Laitière* * Acides Gras

MGL*TB, profil AG, …

Cellule épithélialemammaire

Globule Gras

GénétiqueQTLs &

Polymorphismes

AlimentationFourrages

Supp. lipidique

Micelle de caséines

Génomiquefonctionnelle

Biologie cellulaire

Impact sur la composition du lait et sur les propriétés techno-fonctionnellesde ses constituants

BiochimieTechnologie

* Matière Grasse Laitière* * Acides Gras

Globule Gras

GénétiqueQTLs &

Polymorphismes

AlimentationFourrages

Supp. lipidique

Micelle de caséines

Génomiquefonctionnelle

Biologie cellulaire

Impact sur la composition du lait et sur les propriétés techno-fonctionnellesde ses constituants

BiochimieTechnologie

* Matière Grasse Laitière* * Acides Gras

MGL*TB, profil AG, …

Cellule épithélialemammaire

Projet: GenoMilkFat

Le principe:

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Début 2007

Etude de l’effet du génotype sur l’activité du tissu mammaire

DGAT1 (GCGC) faibleDGAT1 (AAAA) fort

Juin 2007 Déc. 2007 Juin 2008 Déc. 2008

Etude de l’effet Génotype X Alimentation sur l’activité du tissu mammaireLe Pin Theix

Caractérisation phénotypique fine du lait

Choix des animaux

Projet: GenoMilkFat

Sur l’ensemble du troupeau en L1: camp 2005-2006-2007

8 paires de pleines soeurs

Génomique fonctionnelle: Analyse du Transcriptome et du Protéome

Le calendrier:

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Le Pin: un domaine en mutation

BORCULO:

un pôle viande

2006-2007 4 abrisréhabilitationautomatisation

2010-2011Réhabilitation hangars 1 et 2

2009Construction unité de contrôle aliment V.A

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ERMITE:

un pôle lait

2008Construction stabulation 80 V.L. (avec C.I.?)

Le Pin: un domaine en mutation

Une salle de traite commune

2 troupeaux:Elevage (UMRPL)Génétique (SGQA)

Des moyens en commun

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Le Pin: un domaine qui communique !

A vos agendas: prochaines Prairiales

Jeudi 14 Juin 2007 sur le site du domaine du Pin-Au-Harashttp://www.prairiales-normandie.com/index.html