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Université Pierre-

et-Marie-Curie

Formation_Bu_Medecine

(at)scd.upmc.fr

Apprentissage en français

JUBIL, portail des bibliothèques de l’UPMC

2

Trouver des revues en ligne : liste AZ

3

Accès distant pour accéder de l’extérieur

Bases de données

bibliographiques

• Si on cherche des articles sans savoir dans quelle revue on va les trouver :

• ATTENTION : Les catalogues des bibliothèques ne répertorient que des titres de revues, pas des titres d’articles

• Il faut passer par des bases de données bibliographiques : PubMed, Web of Science…

5

PubMed / MedLine :

présentation

- MEDLINE (Medical Literature Analysis and

Retrieval System Online)

- Base de données bibliographiques

(= références d’articles ≠ texte des articles) en

sciences biologiques et biomédicales

- Base gérée et mise à jour par la bibliothèque

nationale de médecine des États-Unis (NLM)

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PubMed / MedLine : contenu

- MedLine = le contenu (base de données)

≠ PubMed = le contenant (accès à MedLine +

autres bases)

- 21 millions de références d’articles, tirés de

5 000 revues, depuis les années 1950

- Une centaine de titres français

- Liste des revues : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/citmatch_help.html#JournalLists

7

PubMed via JUBIL

PubMed est accessible gratuitement sur

Internet mais si on passe par JUBIL pour

s’y connecter :

On garde l’interface classique

+ lien vers texte intégral si nos

bibliothèques sont abonnées

8

PubMed via JUBIL

9

PubMed via JUBIL

Accès distant possible, quand on se connecte

depuis chez soi ou dans son service ! 10

PubMed via JUBIL

Interroger PubMed

• Pour avoir des résultats pertinents, rechercher en anglais

• Les articles sont indexés avec un système de mots-clefs hiérarchisés : le MeSH

• MeSH pour Medical Subject Headings

• Intérêt du MeSH : gère les synonymes (Trisomy 21 = Down Syndrome = Mongolism)

+ permet de chercher sur le sujet seulement des articles : exemple de la revue Cell ou du docteur Cell

+ permet de réaliser des recherches fines, en allant du général au particulier

12

Qu’est-ce que le MeSH ?

- Plus de 25 000 termes, hiérarchisés entre eux,

répartis en 16 grandes catégories

- Mise à jour annuelle

- Traduction française

par l’INSERM

13

Le MeSH est accessible via PubMed

14

Des tutoriels sur le MeSH

15

Exemple d’un terme dans

l’arborescence du MeSH (on part du

général pour arriver au plus précis)

16

Un même terme peut appartenir à

plusieurs arborescences

Une recherche dans l’idéal :

Étape 1 : trouver le mot-clef de départ en français

• On détermine un mot-clef intéressant en

français

• On cherche l’équivalent de ce mot-clef dans le

MeSH français

• Le site du CISMeF propose la traduction

française du vocabulaire MeSH

18

Équivalent du mot-clef dans le MeSH

français : http://pts.chu-rouen.fr

19

Exemple : moelle épinière

20

Place du terme dans l’arborescence

MeSH

21

Étape 2 : choix des qualificatifs

22

AB AD AE AG AA AN AH AI BI BS BL CF CS CI CH CL CO CN CT CY DF DI DU DH DE DT EC ED

Abnormalities Administration and Dosage Adverse Effects Agonists Analogs and Derivatives Analysis Anatomy and Histology Antagonists and Inhibitors Biosynthesis Blood Supply Blood Cerebrospinal Fluid Chemical Synthesis Chemically Induced Chemistry Classification Complications Congenital Contraindications Cytology Deficiency Diagnosis Diagnostic Use Diet Therapy Drug Effects Drug Therapy Economics Education

EM EN EP ES EH ET GE GD HI IM IN IR IS IP LJ MA ME MT MI MO NU OG PS PY PA PK PD PH

Embryology Enzymology Epidemiology Ethics Ethnology Etiology Genetics Growth and Development History Immunology Injuries Innervation Instrumentation Isolation and Purification Legislation and Jurisprudence Manpower Metabolism Methods Microbiology Mortality Nursing Organization and Administration Parasitology Pathogenicity Pathology Pharmacokinetics Pharmacology Physiology

PP PO PC PX RE RA RI RT RH SC SE ST SN SD SU TU TH TO TM TR TD US UL UR UT VE VI

Physiopathology Poisoning Prevention and Control Psychology Radiation Effects Radiography Radionuclide Imaging Radiotherapy Rehabilitation Secondary Secretion Standards Statistics and Numerical Data Supply and Distribution Surgery Therapeutic Use Therapy Toxicity Transmission Transplantation Trends Ultrasonography Ultrastructure Urine Utilization Veterinary Virology

Le MeSH comprend 83 qualificatifs

Chaque mot-clef du MeSH ne peut être associé

qu’avec certains qualificatifs

Les qualificatifs du MeSH

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Pourquoi utiliser le MeSH ?

• Recherche dans PubMed

– Avec « moelle épinière » : 85 articles seulement

– Avec « moelle spinale » : 1 article seulement

– Avec « spinal cord » (directement) :

plus de 145 000 articles

– Avec « spinal cord [MeSH] » : 73 000 articles

– Avec un qualificatif « "Spinal Cord/surgery"[Mesh] » :

2 600 articles

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Combiner les termes recherchés

• Opérateurs booléens (en majuscules)

AND / OR / NOT

• (AND) par défaut (en majuscule !)

• Troncature (transpl*) + guillemets

(« kidney allograft »)

25

Liste de résultats dans PubMed

26

Les limites…

27

Limiter le nombre de résultats (par langue, type de

document, population…)

28

Consulter les articles trouvés

• Sur papier dans les bibliothèques (JUBIL)

• En ligne, sur les postes des bibliothèques

• Et maintenant de chez vous, via l’accès

distant

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Lien direct vers le PDF ?

• Quand on est sur un ordinateur de l’université

• OU connecté en accès distant via JUBIL

• ET SI l’université est abonnée aux revues en

ligne où est paru l’article recherché

• Alors icône pour accès direct au PDF

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Exemple d’article accessible

31

FIN Merci de votre attention