NetBioDynEt

la modélisation multiagents

Application à la modélisation de quelques phénomènes immunitaires

Les ressources?

• Le logiciel: un applet Java en ligne ou en local

http://acces.inrp.fr/acces/logiciels/externes/netbiodyn/logiciel-et-ressources

• Les modèleshttp://acces.inrp.fr/acces/ressources/sante/reponse-immunitaire/ressources/biodyn/

• Les pistes d’exploitation pédagogique:http://acces.inrp

.fr/acces/ressources/sante/reponse-immunitaire/enseigner/enseigner-avec-netbiodyn/

• Des didacticiels

QuickTime™ et undécompresseur

sont requis pour visionner cette image.

QuickTime™ et undécompresseur

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Pourquoi modéliser?

1. Utiliser un modèle pour simuler une manipulation non réalisable in vivo

2. Utiliser un modèle pour discuter d’un protocole à mettre en œuvre

3. Utiliser un modèle pour synthétiser des connaissances

4. Construire un modèle

Principe de la modélisation multiagents

Chaque agent• est une entité informatique

représentant une entité biologique • possède des comportements • est capable d'interactions avec

d’autres entités

Créer un système biologique avec plusieurs agents évoluant au cours du temps

1. Simuler une expérience

On sait: Les LT4 sont les pivots des réactions immunitaires acquises. On a mis en évidence la nécessité des LT4 pour la production d'anticorps.

Par quel moyen les LT4 interviennent-ils dans la différenciation des LB en plasmocytes sécréteurs d'anticorps.

Le rôle des LT4

QuickTime™ et undécompresseur

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Utilisation du dispositif de Marbrook

On extrait des lymphocytes B et T de la rate d’une souris préalablement mise en contact avec un antigène Z soluble.

Tester une hypothèseL’activation des LB se fait par contact avec les LT4

Modèle marbrook

Entités et comportements

Lba + iL -------> Lba +LBa

LT4a --------> LT4a + iL

Lba + iL ------->Plasmocyte

2. Simuler pour bâtir un protocole

Comment mettre en évidence une séropositivité?(Test ELISA)

Monter un protocole (avant de le mettre en œuvre)

3. Un modèle pour synthétiser des connaissances

Humeur…

4. Créer son modèle

Définir ses entitésNomImagevisible ou non dans le panel

Donner un comportement à Chacune

Montrer que la phagocytose est plus efficace si des anticorps spécifiques sont présents