Jour 3 : Jour 3 :

La numérisation de La numérisation de données de biodiversitédonnées de biodiversité

Sommaire

L’infrastructure informatique de GBIF

Rôle et importance des nœuds GBIF (Mélianie)

Objectifs quotidien d’un nœud GBIF

Qui suis-je?

Michael Akbaraly (akbaraly@gbif.fr)

Ingénieur Informatique Au GBIF depuis mars 2009

Spécialisé dans les bases de données Intéressé par le datamining et le

développement Web

L’infrastructure L’infrastructure informatique du informatique du GBIFGBIF

Base de donnéesCollection

Observation

DiG

IR /

Bio

CA

Se

/ T

AP

IR/

IPT

occurrence record

taxon concept

indexing DB

raw occurrence record

extraction

occurrence record

taxon concept

portal DB working copy

raw occurrence record

processingharvesting

metadata

logs

Darwin Core

ABCD

UDDInames

copy

occurrence record

taxon concept

portal DB live system

raw occurrence record

swap

Data Portal UI

web services

registration

Provider domain Internet

Internet / public

GBIF / non-public

MapServer

status until summer 2009

Normaliser les données

GBIF : Réseau mondial

Besoin d’un langage commun à toutes les données

Adapter l’information au réseau Wrappers (IPT, Biocase, …) Standards (ABCD, Darwin Core)

Connecter les données

Index : Annuaire des données

Récupère les informations générales

Connexion directe aux données

Diffuser les données

Portail international

Publication des données

Géoréférencement

http://data.gbif.org/

Le Portail GBIFLe Portail GBIF

Quelles informations?Quelles informations?

Données sur la présence d’espèces (spécimens ou observations)

Noms Noms scientifiques & classification Noms vernaculaires

Recherche filtrée

Autre exemple :répartition géographique de Hirundo rustica (hirondelle de cheminée) à différentes périodes de l'année

Quelle utilisation?

Prédire la distribution d’espèces selon divers scénarios de changement climatique, écologique, etc.

Prévoir des sites pour la protection de la biodiversité, etc.

Anticiper les régions nécessitant des actions précises (combattre les espèces invasives, mettre en place des mesures sanitaires, etc)

Le nœud GBIF Le nœud GBIF FranceFrance

Sommaire

Historique

Présentation de l’équipe

Objectifs

Difficultés

Nœud GBIF France

Mis en place en 2006

Situé au Musée d’Histoire Naturelle de Paris

3ème fournisseur en nombre d’occurrences du GBIF

L’équipe du GBIF France

Responsables :

Eric Chenin et Régine Vignes

Communication :

Anne-Sophie Archambeau

Technique et développement informatique :

Delphine Gasc et Michael Akbaraly

Objectifs

Connecter les données

Identifier et contacter les fournisseurs de données du pays

Développer des outils utiles à la communauté GBIF

Portail GBIF FrancePortail GBIF France