ESIEECité Descartes

93162 Noisy-le-Grand

laboratoire A2SIgroupe « modélisation et simulation »

dynamique et combinatoire en ingénierie et sciences du vivant

Tarik Alani -Yskandar Hamam - Krys Markowski

René Natowicz* - François Rocaries & Laurence Moreux

01 45 92 65 99l.moreux@esiee.fr

ESIEECité Descartes

93162 Noisy-le-Grand

laboratoire A2SIgroupe « modélisation et simulation »

dynamique et combinatoire en ingénierie et sciences du vivant

Tarik Alani -Yskandar Hamam - Krys Markowski

René Natowicz* - François Rocaries & Laurence Moreux

01 45 92 65 99l.moreux@esiee.fr

Étude sur l’évolutiondes emplois et des compétencesde la filière des biotechnologies

en Ile-de-France

avec l ’appui de : ADEBIO et ESIEE

Étude sur l’évolutiondes emplois et des compétencesde la filière des biotechnologies

en Ile-de-France

avec l ’appui de : ADEBIO et ESIEE

POLLEN POLLEN ConseilConseil

GroupeGroupe TEMSISTEMSISOFEM

Observatoire de la Formation,de l’Emploi et des Métiers

OFEMObservatoire de la Formation,

de l’Emploi et des Métiers

Quel est le secteur d’activité de votre établissement ?Quel est le secteur d’activité de votre établissement ?

CaractéristiquesCaractéristiques

7%

11%

20%

17%

21%

24%Services techniques

Autres

Médical/Diagnostic

Pharmacie

Chimie

Agro-alimentaire

Quelles sont les fonctions concernées par les biotechnologies ? Quelles sont les fonctions concernées par les biotechnologies ?

EffectifEffectif

65%

21%

29%

7%

5%

11%

2%NSP

Autres fonctions

Entretien Maintenance

Logistique

Marketing-Ventes

Production

R&D

RecrutementsRecrutements

Évolution des effectifs à 3 ans

43 % : augmentation

3 % : diminution

44% des établissements pensent recruter

Évolution des effectifs à 3 ans

43 % : augmentation

3 % : diminution

44% des établissements pensent recruter

3

1

5

1

6

8

7

2

7

18

8

5

5

3

25

41

3

2

Spécifiques à l'activité de l'entreprisePolyvalenceAgroalimentaireImmunologieBio génétiqueBio cellulaireBio moléculaireBiologie de l'environnementMicrobiologieBiologieChimiePharmacie, médecineTraçabilité des produitsMarquage moléculaireTechniques de productionAnalyses médicalesMesures industriellesMécanique

RecrutementsRecrutements

... Compétences spécifiques aux biotechnologies... Compétences spécifiques aux biotechnologies

3

5

90

2

1

20

18

15

Autres

Communication

Internet

Management

Informatique

Anglais

Commercial, vente

Juridique

RecrutementsRecrutements

... Compétences transversales complémentaires... Compétences transversales complémentaires

Besoins en nouvelles compétencesBesoins en nouvelles compétences

bio-statistiques et bio-informatique

chef de projet, conduite de projet

affaires régréglementaires

bilinguisme

bio-statistiques et bio-informatique

chef de projet, conduite de projet

affaires régréglementaires

bilinguisme

Difficultés de recrutementDifficultés de recrutement

Secteur « jeune » applications multiformes

très spécialisé

inadéquation entre compétences requises et formations

==> problème évident pour les prochaines années

chimie (50%)

pharmacie (63%)

médical (46%)

laboratoires R&D externes (68%)

Secteur « jeune » applications multiformes

très spécialisé

inadéquation entre compétences requises et formations

==> problème évident pour les prochaines années

chimie (50%)

pharmacie (63%)

médical (46%)

laboratoires R&D externes (68%)

besoins en nouvelles compétencesbesoins en nouvelles compétences

bio-informatique : développement systèmes complexes de traitement d ’informations en génomique, biologie moléculaire, chimie combinatoire, ...

nano-technologies : capteurs, actionneurs

instrumentation scientifique et médicale (20 à 30 % des emplois « biotech » à venir ?)

bio-informatique : développement systèmes complexes de traitement d ’informations en génomique, biologie moléculaire, chimie combinatoire, ...

nano-technologies : capteurs, actionneurs

instrumentation scientifique et médicale (20 à 30 % des emplois « biotech » à venir ?)

Enjeux de formation(rapport Levine*)

Enjeux de formation(rapport Levine*)

Recommandation pour les sciences biologiques

« afin de produire des scientifiques biologistes qualifiés pour faire de la recherche moderne, nous recommandonsfortement que les cursus scientifiques de biologie comprennent quatre années de mathématiques et / ou d ’informatique »

calculus - programmation - théorie des algorithmesmathématiques discrètes - analyse numérique - …

(*) mathematics & biology : the interface.

Challenges and opportunities. --- 40 universités et instituts

Recommandation pour les sciences biologiques

« afin de produire des scientifiques biologistes qualifiés pour faire de la recherche moderne, nous recommandonsfortement que les cursus scientifiques de biologie comprennent quatre années de mathématiques et / ou d ’informatique »

calculus - programmation - théorie des algorithmesmathématiques discrètes - analyse numérique - …

(*) mathematics & biology : the interface.

Challenges and opportunities. --- 40 universités et instituts

Enjeux de formation(rapport Levine)

Enjeux de formation(rapport Levine)

Recommandation pour les sciences de l ’ingénieur

« les troncs communs des cursus de mathématique et informatique devraient comporter des cours en sciences expérimentales [...]

La raison d’être est de fournir à l ’étudiant une compréhension du vocabulaire et des concepts ainsi que l ’expérience par lesquels les mathématiques et l ’informatique contribuent au développement des autres disciplines. »

Recommandation pour les sciences de l ’ingénieur

« les troncs communs des cursus de mathématique et informatique devraient comporter des cours en sciences expérimentales [...]

La raison d’être est de fournir à l ’étudiant une compréhension du vocabulaire et des concepts ainsi que l ’expérience par lesquels les mathématiques et l ’informatique contribuent au développement des autres disciplines. »

Postes d’accueil INSERMPostes d’accueil INSERM

« Le but de la création de ces postes est rapprocher, de faireinteragir les sciences du vivant d ’une part, et les sciencesde l ’ingénieur d ’autre part. »

Ce que l ’ingénieur peut apporter à l ’Unité :

certes [sa] discipline des sciences de l ’ingénieur -

mais aussi et surtout une manière de voir : il peut y avoir dans votre thématique de recherche des pistes nouvelles qui ne sont pas explorées parce que leur possibilité n ’apparaît pas clairement dans un contexte dominé par la biologie cellulaire et / ou par la biologie moléculaire.

« Le but de la création de ces postes est rapprocher, de faireinteragir les sciences du vivant d ’une part, et les sciencesde l ’ingénieur d ’autre part. »

Ce que l ’ingénieur peut apporter à l ’Unité :

certes [sa] discipline des sciences de l ’ingénieur -

mais aussi et surtout une manière de voir : il peut y avoir dans votre thématique de recherche des pistes nouvelles qui ne sont pas explorées parce que leur possibilité n ’apparaît pas clairement dans un contexte dominé par la biologie cellulaire et / ou par la biologie moléculaire.

Exemple d ’un profil de poste d ’accueil INSERM

Exemple d ’un profil de poste d ’accueil INSERM

Intitulé : régulation des gènes et signalisation cellulaire

Thème particulier : les contrôles de l ’homéostasie calciquedans la cellule de ventricule cardiaque

Compétences souhaitées : imagerie, reconnaissance des formes, traitement du signal, modélisation des systèmesdynamiques, simulations informatiques.

Mots clés : imagerie, modélisation dynamique, cellulescardiaques, biologie cellulaire, physiopathologie.

Intitulé : régulation des gènes et signalisation cellulaire

Thème particulier : les contrôles de l ’homéostasie calciquedans la cellule de ventricule cardiaque

Compétences souhaitées : imagerie, reconnaissance des formes, traitement du signal, modélisation des systèmesdynamiques, simulations informatiques.

Mots clés : imagerie, modélisation dynamique, cellulescardiaques, biologie cellulaire, physiopathologie.

Conférence BioMedSim ’99Conférence BioMedSim ’99

Domaines de la biologie :

bio-mécanique - bio-chimie - évolution (dont exo-)dynamique du cœur - système auditif

dynamique musculaire - électro-physiologie dynamique des populations - écologieimmunologie - pharmaco-dynamique biologie cellulaire - épidémiologie

génétique moléculaire

Domaines de la biologie :

bio-mécanique - bio-chimie - évolution (dont exo-)dynamique du cœur - système auditif

dynamique musculaire - électro-physiologie dynamique des populations - écologieimmunologie - pharmaco-dynamique biologie cellulaire - épidémiologie

génétique moléculaire

Conférence BioMedSim ’99Conférence BioMedSim ’99

Domaines des sciences de l ’ingénieur :

contrôle optimal - équations fonctionnelles -statistiques - processus stochastiques

modélisation des systèmes dynamiquesidentification de paramètres

analyse numérique - simulation informatique optimisation non-linéaire / stochastique

algorithmique - traitement du signal optimisation combinatoire - topologie discrète

Domaines des sciences de l ’ingénieur :

contrôle optimal - équations fonctionnelles -statistiques - processus stochastiques

modélisation des systèmes dynamiquesidentification de paramètres

analyse numérique - simulation informatique optimisation non-linéaire / stochastique

algorithmique - traitement du signal optimisation combinatoire - topologie discrète

Modélisation quantitative en BiologieModélisation quantitative en Biologie

Modèles quantitatifs et simulations informatiques

expériences “ in computero ” capacité de prédiction du modèle capacité d’explication apport pour la définition des

expérimentations confrontation résultats expérimentaux -

expériences simulées mise à jour du modèle

Modèles quantitatifs et simulations informatiques

expériences “ in computero ” capacité de prédiction du modèle capacité d’explication apport pour la définition des

expérimentations confrontation résultats expérimentaux -

expériences simulées mise à jour du modèle

Proposition de formation - capacités attendues des ingénieurs-

Proposition de formation - capacités attendues des ingénieurs-

• comprendre les pbs posés ou rencontrés par les biologistes, biochimistes, pharmaciens ou médecins

• identifier les problèmes (ou parties) pour lesquels un apport significatif de l’informatique (en particulier algorithmique et bases de données) ou de la modélisation et simulation des systèmes dynamiques est envisageable

• formaliser ces problèmes et réaliser ou choisir des applications informatiques vues comme outils d’expérimentation, d’analyse de résultats, d’aide au diagnostic

• imaginer des procédés nouveaux ou des techniques de production améliorant l’efficacité des techniques existantes

• comprendre les pbs posés ou rencontrés par les biologistes, biochimistes, pharmaciens ou médecins

• identifier les problèmes (ou parties) pour lesquels un apport significatif de l’informatique (en particulier algorithmique et bases de données) ou de la modélisation et simulation des systèmes dynamiques est envisageable

• formaliser ces problèmes et réaliser ou choisir des applications informatiques vues comme outils d’expérimentation, d’analyse de résultats, d’aide au diagnostic

• imaginer des procédés nouveaux ou des techniques de production améliorant l’efficacité des techniques existantes

capacité attendues (suite)capacité attendues (suite)

• définir le cahier des charge d’une application d’ingénierie bio-médicale en coopération avec les médecins ou biologistes utilisateurs

• évaluer, choisir, enchaîner les applications informatiques (incluant les choix matériels : capteurs, processeurs, architecture et réseaux)

• développer des applications ou systèmes informatiques spécifiques (incluant les choix des matériels)

• définir le cahier des charge d’une application d’ingénierie bio-médicale en coopération avec les médecins ou biologistes utilisateurs

• évaluer, choisir, enchaîner les applications informatiques (incluant les choix matériels : capteurs, processeurs, architecture et réseaux)

• développer des applications ou systèmes informatiques spécifiques (incluant les choix des matériels)

capacité attendues (suite)capacité attendues (suite)

• former les biologistes et médecins à l’utilisation d’une application ou d’un système informatique

• leur apporter la formation de base et le support nécessaires à la compréhension des caractéristiques propres d’un traitement algorithmique ou d’une recherche dans une base de données

• leur apporter la formation de base nécessaire à l’évaluation de l’adéquation au problème posé d’un traitement informatique

• former les biologistes et médecins à l’utilisation d’une application ou d’un système informatique

• leur apporter la formation de base et le support nécessaires à la compréhension des caractéristiques propres d’un traitement algorithmique ou d’une recherche dans une base de données

• leur apporter la formation de base nécessaire à l’évaluation de l’adéquation au problème posé d’un traitement informatique

capacité attendues (suite)capacité attendues (suite)

• modéliser et simuler les processus dynamiques en biologie expérimentale, pharmacie, médecine

• participer à la formulation de protocoles d’expérimentation

• progresser dans la connaissance de la biologie

• évoluer vers des postes de responsable “produit” ou R&D

• modéliser et simuler les processus dynamiques en biologie expérimentale, pharmacie, médecine

• participer à la formulation de protocoles d’expérimentation

• progresser dans la connaissance de la biologie

• évoluer vers des postes de responsable “produit” ou R&D

Pour plus d ’informations...Pour plus d ’informations...

http://www.esiee.fr/~info/a2si/ens_sdv.html

http://www.esiee.fr/~info/a2si/ens_sdv.html