Download - Qui s’en occupe ?

Transcript
Page 1: Qui s’en occupe ?

Qui s’en occupe ?Qui s’en occupe ?

…pour entraîner des programmes informatiques capables de reconnaître

des régions biologiquement importantes dans des séquences de

protéines non caractérisées(utiliser ce qui est connu pour orienter la recherche sur des protéines inconnues)

…pour identifier des protéines dans des échantillons biologiques

(chercher des marqueurs de maladies, « drug design », etc…)

C’est quoi ?C’est quoi ?Swiss-Prot est une banque de connaissances sur les protéinesprotéines créée en 1986.

Elle compte actuellement plus de 290’000 fiches (1 fiche par protéine) et est disponible sur internet.

Les protéines connues actuellement sont composées de 2 à 34’350 acides aminés.

Les chercheurs en laboratoire (académique et

industriel)

…pour trouver des ressemblances entre les séquences de protéines

(étudier l’évolution des espèces, etc…)

Les bioinformaciens qui créent des programmes de visualisation, d’analyse

et comparaison de séquences, de prédiction, etc…

Une équipe de près de 100 biologistes et informaticiens

au service de la communauté scientifique…Pour nous contacter: [email protected] nous contacter: [email protected]

MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

L’insuline humaine…

Modélisation de la structure

tridimensionnelle

Collaboration UniProt Suisse Grande-Bretagne USA

Ça sert à quoi ?Ça sert à quoi ?

…à aider le chercheur en laboratoire ou le bioinformaticien en mettant à leur disposition une encyclopédie informatiséeencyclopédie informatisée de ce qui est connu sur les protéines

Qui peut l’utiliser ?Qui peut l’utiliser ?

Tous ceux qui ont accès à internet (accès libre) http://www.expasy.org/sprot/

Le contenu de chaque fiche est la synthèse des informations extraites de la littérature scientifique et de l’utilisation d’outils bioinformatiques. Le tout est validé et régulièrement

réactualisé par des biologistes.

Liste de publications scientifiques

Nom de la protéine

Informations taxonomiques

Liens vers des banques de données spécialisées

Mots-clés

Séquence en acides aminés

Informations biologiques

Une protéine peut avoir plusieurs noms… et

parfois des noms rigolos: Zinedine,

Bigbrain, Timeless, Prospero, Ken and

Barbie…

Swiss-Prot contient des protéines provenant

de environ 10’000 espèces, de l’homme à la bactérie

en passant par le mammouth et les plantes.

Swiss-Prot possède des liens vers environ 100

banques de données spécialisées. Plaque tournantePlaque tournante

de l’information biologique

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 2: Qui s’en occupe ?
Page 3: Qui s’en occupe ?

1986-2007

Quelques exemples (extraits) de fiches

(parmi les 290’000 existantes…)

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 4: Qui s’en occupe ?

1986-2007

Encyclopédie informatisée des protéines

http://beta.uniprot.org

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 5: Qui s’en occupe ?

http://www.expasy.org/

[email protected]

Nous sommes à votre service

Pour nous contacter:

[email protected]

Pour consulter Swiss-Prot:

http://beta.uniprot.org/

http://www.expasy.org/

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 6: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Neuropeptide GWaNeuropeptide GWa

Informations taxonomiquesCommon cuttlefish (Seiche)

Séquence

Informations biologiquesRégule les contractions de l’oviducte.

Il s’agit de la plus petite protéine connue

Fiche no P83570

GW

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 7: Qui s’en occupe ?

Neuropeptide Neuropeptide GWaGWa

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 8: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: OcytocineOcytocine

Informations taxonomiques Lapin

…existe aussi dans d’autres espèces

Séquence

Informations biologiquesFavorise les contractions de l’utérus,stimule l’expulsion du lait pendant la tétée,impliquée dans la régulation des rapports sociaux

Stimule les contractions de l’utérus au moment de l’accouchement

Fiche no P69043

CYIQNCPLG

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 9: Qui s’en occupe ?

OcytocinOcytocinee

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 10: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: InsulineInsuline

Informations taxonomiques Homo sapiens (homme)

…existe aussi dans d’autres espèces…

Séquence

Informations biologiques Régule le taux sanguin de sucre, en permetant l’entrée et le stockage du glucose (sucre) dans les cellules

Fiche no P01308

L’insuline est la première protéine à avoir été entièrement séquencée

(Frederick Sanger en 1955, prix Nobel en 1958)

MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 11: Qui s’en occupe ?

InsulinInsulinee

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 12: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Erythropoiétine (EPO)Erythropoiétine (EPO)

Informations taxonomiques Homo sapiens (homme)

…existe aussi dans d’autres espèces…

Séquence

Informations biologiquesHormone impliquée dans la régulation

de la synthèse des globules rouges… …certains l’utilisent pour se doper

Fiche no P01588

MGVHECPAWLWLLLSLLSLP LGLPVLGAPPRLICDSRVLE RYLLEAKEAENITTGCAEHC SLNENITVPDTKVNFYAWKR MEVGQQAVEVWQGLALLSEA VLRGQALLVNSSQPWEPLQL HVDKAVSGLRSLTTLLRALG AQKEAISPPDAASAAPLRTI TADTFRKLFRVYSNFLRGKL KLYTGEACRTGDR

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 13: Qui s’en occupe ?

EPOEPO

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 14: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Sex-determining region Y protein (SRY)Sex-determining region Y protein (SRY)

Informations taxonomiques Homo sapiens (homme)

…existe aussi dans d’autres espèces…

Séquence

Informations biologiquesResponsable de l’initiation

de la différenciation sexuelle ‘mâle’: …sans elle, il n’y aurait que des femmes….

Fiche no Q05066

MQSYASAMLSVFNSDDYSPAVQENIPALRRSSSFLCTESCNSKYQCETGENSKGNVQDRVKRPMNAFIVWSRDQRRKMALENPRMRNSEISKQLGYQWKMLTEAEKWPFFQEAQKLQAMHREKYPNYKYRPRRKAKMLPKNCSLLPADPASVLCSEVQLDNRLYRDDCTKATHSRMEHQLGHLPPINAASSPQQRDRYSHWTKL

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 15: Qui s’en occupe ?

SRYSRY

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 16: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: CytochromeCytochrome

Informations taxonomiques Mammouth

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la production d’énergie

Fiche no P92658

MTHIRKSHPLLKILNKSFIDLPTPSNISTWWNFGSLLGACLITQILTGLFLAMHYTPDTMTAFSSMSHICRDVNYGWIIRQLHSNGASIFFLCLYTHIGRNIYYGSYLYSETWNTGIMLLLITMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLFSAIPYIGTDLVEWIWGGFSVDKATLNRFFALHFILPFTMIALAGVHLTFLHETGSNNPLGLTSDSDKIPFHPYYTIKDFLGLLILILFLLLLALLSPDMLGDPDNYMPADPLNTPLHIKPEWYFLFAYAILRSVPNKLGGVLALLLSILILGIMPLLHTSKHRSMMLRPLSQVLFWTLATDLLMLTWIGSQPVEYPYIIIGQMASILYFSIILAFLPIAGMIENYLIK

…la séquence de cette protéine est connue dans beaucoup d’espèces (~1250). Elle est souvent utilisée pour construire des arbres phylogénétiques (étude de l’évolution des espèces)

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 17: Qui s’en occupe ?

CytochromeCytochrome

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 18: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: RubisCORubisCO

Informations taxonomiques Epinard

…existe aussi dans d’autres espèces de plantes…

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la fabrication de l’oxygène à partir de la lumière (photosynthèse).

…. C’est la protéine la plus abondante sur notre planète

Fiche no P00875

MSPQTETKAS VEFKAGVKDY KLTYYTPEYE TLDTDILAAF RVSPQPGVPP EEAGAAVAAE SSTGTWTTVW TDGLTNLDRY KGRCYHIEPV AGEENQYICY VAYPLDLFEE GSVTNMFTSI VGNVFGFKAL RALRLEDLRI PVAYVKTFQG PPHGIQVERD KLNKYGRPLL GCTIKPKLGL SAKNYGRAVY ECLRGGLDFT KDDENVNSQP FMRWRDRFLF CAEALYKAQA ETGEIKGHYL NATAGTCEDM MKRAVFAREL GVPIVMHDYL TGGFTANTTL SHYCRDNGLL LHIHRAMHAV IDRQKNHGMH FRVLAKALRL SGGDHIHSGT VVGKLEGERD ITLGFVDLLR DDYTEKDRSR GIYFTQSWVS TPGVLPVASG GIHVWHMPAL TEIFGDDSVL QFGGGTLGHP WGNAPGAVAN RVALEACVQA RNEGRDLARE GNTIIREATK WSPELAAACE VWKEIKFEFP AMDTV

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 19: Qui s’en occupe ?

RubisCORubisCO

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 20: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Toxine botulinique (BOTOX)Toxine botulinique (BOTOX)

Informations taxonomiquesClostridium botulinum (Bactérie)

Séquence

Informations biologiquesInhibiteur de la libération

d’un neurotransmetteur (acétylcholine).

Utilisée en cosmétique pour paralyser les muscles de l’expression (lifting).

Fiche no P10845

PFVNKQFNYK DPVNGVDIAY IKIPNVGQMQ PVKAFKIHNK IWVIPERDTF TNPEEGDLNP PPEAKQVPVS YYDSTYLSTD NEKDNYLKGV TKLFERIYST DLGRMLLTSI VRGIPFWGGS TIDTELKVID TNCINVIQPD GSYRSEELNL VIIGPSADII QFECKSFGHE VLNLTRNGYG STQYIRFSPD FTFGFEESLE VDTNPLLGAG KFATDPAVTL AHELIHAGHR LYGIAINPNR VFKVNTNAYY EMSGLEVSFE ELRTFGGHDA KFIDSLQENE FRLYYYNKFK DIASTLNKAK SIVGTTASLQ YMKNVFKEKY LLSEDTSGKF SVDKLKFDKL YKMLTEIYTE DNFVKFFKVL NRKTYLNFDK AVFKINIVPK VNYTIYDGFN LRNTNLAANF NGQNTEINNM NFTKLKNFTG LFEFYKLLCV RGIITSKTKS LDKGYNKALN DLCIKVNNWD LFFSPSEDNF TNDLNKGEEI TSDTNIEAAE ENISLDLIQQ YYLTFNFDNE PENISIENLS SDIIGQLELM PNIERFPNGK KYELDKYTMF HYLRAQEFEH GKSRIALTNS VNEALLNPSR VYTFFSSDYV KKVNKATEAA MFLGWVEQLV YDFTDETSEV STTDKIADIT IIIPYIGPAL NIGNMLYKDD FVGALIFSGA VILLEFIPEI AIPVLGTFAL VSYIANKVLT VQTIDNALSK RNEKWDEVYK YIVTNWLAKV NTQIDLIRKK MKEALENQAE ATKAIINYQY NQYTEEEKNN INFNIDDLSS KLNESINKAM ININKFLNQC SVSYLMNSMI PYGVKRLEDF DASLKDALLK YIYDNRGTLI GQVDRLKDKV NNTLSTDIPF QLSKYVDNQR LLSTFTEYIK NIINTSILNL RYESNHLIDL SRYASKINIG SKVNFDPIDK NQIQLFNLES SKIEVILKNA IVYNSMYENF STSFWIRIPK YFNSISLNNE YTIINCMENN SGWKVSLNYG EIIWTLQDTQ EIKQRVVFKY SQMINISDYI NRWIFVTITN NRLNNSKIYI NGRLIDQKPI SNLGNIHASN NIMFKLDGCR DTHRYIWIKY FNLFDKELNE KEIKDLYDNQ SNSGILKDFW GDYLQYDKPY YMLNLYDPNK YVDVNNVGIR GYMYLKGPRG SVMTTNIYLN SSLYRGTKFI IKKYASGNKD NIVRNNDRVY INVVVKNKEY RLATNASQAG VEKILSALEI PDVGNLSQVV VMKSKNDQGI TNKCKMNLQD NNGNDIGFIG FHQFNNIAKL VASNWYNRQI ERSSRTLGCS WEFIPVDDGW GERPL

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 21: Qui s’en occupe ?

BOTOXBOTOX

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 22: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: VitellogénineVitellogénine

Informations taxonomiques Poulet

…existe aussi dans d’autres espèces d’oiseaux…

Séquence

Informations biologiquesPrincipal constituant du blanc d’oeuf

Fiche no P87498

MRGLISALVL TLVGSQHLNY QPDFGENKVY TYNYESILFS GIPEKGLART GIRIRSEVEI SGIGPKLCLI RIHSIEAAEY NGIWPTSSFS RSLKLTQALT GQLSIPIKFE YSNGHVGNLM APDSVSDDGL NIYRGILNIL ELSLKKMQHS YSIQEAGIGG ICNTTYAIQE NKKANLVDVT KSKDLNSCEE KVQVVTGSAY TQPCQTCQQR NKNSRATATY NYKIKYTHNE AVITQAEVEE VHQFTPFHEI TGGNAIVEAR QKLALIEVQK QVAEVPPKEF QKRGSLQYQF GSELLQLPVH LFKIKDVERQ IEERLQDLVE TTYEQLPSDA PAKALKLMHL LRAANEENYE SVWKQFSSRP AYRRYLLDLL PAAASHRSLR FLRHKMERQE LTNWEIAQTV LVALHSSSPT QEVMEEATLI VKKHCPRSSS VLRKVCLLSY ASLCHKRCSS PYSCSECLQV FHVFAGEALG KSNIEEVLLA LKALGNVGHP ASIKHIKKFL PGYAAGASEL PLKVHETAVM ALKSIGMRDP QMVQAITLEI FLNHKIHPRI RMLAAVVLLE TKPGLPILMI LVDAVLKEPS MQVASFIYSH LRALGRSTAP DLQMMASACR MAVRALSPKF DRSGYQFSKV FRFSMFKEFL MSGLAAKYFV LNNAGSLIPT MAVSQLRTHF LGRVADPIEV GIAAEGLQEM FVRGYSPDKD WETNYDFREI LKKLSDWKAL PRDKPFASGY LKMFGQELLF GRLDKDTLQN VLQVWYGPDE KIPSIRRLIS SLQTGIGRQW TKALLLSEIR CIVPTCVGFP METSFYYSSV TKVAGNVQAQ ITPSPRSDFR LTELLNSNVR LRSKMSLSMA KHMTFVIGIN TNMIQAGLEA HTKVNAHVPV NVVATIQMKE KSIKAEIPPC KEETNLIIVS SKTFAVTRNI EDLAASKMTP VLLPEAVPDI MKMSFDSDSA SGETDNIRDR QSVEDVSSGN SFSFGHPSSG KEPFIQSMCS NASTFGVQVC IEKKSVHAAF IRNVPLYNAI GEHALRMSFK PVYSDVPIEK IQVTIQAGDQ APTKMVRLVT FEDPERQESS RKEVMKRVKK ILDDTDNQAT RNSRSSSSSA SSISESSEST TSTPSSSDSD NRASQGDPQI NLKSRQSKAN EKKFYPFGDS SSSGSSSSSS SSSSSSSDSS SSSRSSSSSD SSSSSSSSSS SSSSKSKSSS RSSKSNRSSS SSNSKDSSSS SSKSNSKGSS SSSSKASGTR QKAKKQSKTT SFPHASAAEG ERSVHEQKQE TQSSSSSSSR ASSNSRSTSS STSSSSESSG VSHRQWKQDR EAETKRVKSQ FNSHSSYDIP NEWETYLPKV YRLRFRSAHT HWHSGHRTSS SSSSSSSESG SSHSNSSSSD SSSRRSHMSD SSSSSSSHRH GEKAAHSSRR SPTSRAASAH HRPGSSLTRE RNFLGDVIPP GITIVAQAVR SDNRNQGYQA TAYVRSDAAK VDVQLVVVQL AETNWKACAD AVILPLKAQA RMRWGKECRD YRIAALATTG QMARKLAVQL KVQWGIIPSW IKKTSTALMR YVPGVALVLG FSEAHQRNPS RELIVRAVAT SPRSIDTVIK VPGVTLYYQG LRVPFTLALG ASSSSYETRD ITAWNFLPEI ASQIAQEDQS TCEVSKGDFK TFDRMSFTCS FNKSCNVVVA QDCTEHPKFI ITTRKVDHQS LSREVHINTS SANITICPAA DSSLLVTCNK ESVLSDSGVS EYEKDNIKIY KNGKTVIVEA PIHGLKNVNF DGEILKVTVA SWMRGKTCGV CGNNDREKHN ELLMPNHKLA HSCSAFVHSW VLLEETCSGG CKLQRRYVKL NRNPTIDGEE STCYSVDPVL KCMKDCTPIE KTSVKVGFHC FPKATAVSLL EWQRSSDKKS ASEDVVESVD ADIDCTCTGD CS

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 23: Qui s’en occupe ?

VitellogéniVitellogéninene

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 24: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: ‘‘Period circadian’Period circadian’

Informations taxonomiquesDrosophila (mouche)

Séquence

Informations biologiques Impliquée dans le rythme sommeil-veille

et le rythme du chant nuptial (qui permet la reconnaissance entre espèces)

Fiche no P07663

MEGGESTEST HNTKVSDSAY SNSCSNSQSQ RSGSSKSRLS GSHSSGSSGY GGKPSTQASS SDMIIKRNKD KSRKKKKNKG AGQGAGQAQT LISASTSLEG RDEEKPRPSG TGCVEQQICR ELQDQQHGED HSEPQAIEQL QQEEEEDQSG SESEADRVEG VAKSEAAQSF PIPSPLSVTI VPPSMGGCGG VGHAAGLDSG LAKFDKTWEA GPGKLESMTG VGAAAAGTGQ RGERVKEDSF CCVISMHDGI VLYTTPSITD VLGYPRDMWL GRSFIDFVHL KDRATFASQI TTGIPIAESR GSVPKDAKST FCVMLRRYRG LKSGGFGVIG RPVSYEPFRL GLTFREAPEE ARPDNYMVSN GTNMLLVICA TPIKSSYKVP DEILSQKSPK FAIRHTATGI ISHVDSAAVS ALGYLPQDLI GRSIMDFYHH EDLSVMKETY ETVMKKGQTA GASFCSKPYR FLIQNGCYVL LETEWTSFVN PWSRKLEFVV GHHRVFQGPK QCNVFEAAPT CKLKISEEAQ SRNTRIKEDI VKRLAETVSR PSDTVKQEVS RRCQALASFM ETLMDEVSRA DLKLELPHEN ELTVSERDSV MLGEISPHHD YYDSKSSTET PPSYNQLNYN ENLLRFFNSK PVTAPAELDP PKTEPPEPRG TCVSGASGPM SPVHEGSGGS GSSGNFTTAS NIHMSSVTNT SIAGTGGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGNGTNSGT GTGTASSSKG GTAAIPPVTL TESLLNKHND EMEKFMLKKH RESRGRTGEK SKKSANDTLK MLEYSGPGHG IKRGGSHSWE GEANKPKQQL TLGTDAIKGA AGSAGGAVGT GGVGSGGAGV AGGGGSGTGV AGTPEGRATT TSGTGTPGGA GGGGGAGAAA AAGASSSVGS STPGPSSYPT CTQNINLWPP FSVGITPPVH STHTAMAQSS FSSAGLFPTF YYIPASLTPT SPTRSPRMHK HPHKGGTDMP TTSQQAAAAA AQAMPLQYMA GVMYPHPSLF YTHPAAAAAT AMMYQPMPFP GMANALQIPE RPLGSQSAYN KSVYTTTPAS MTKKVPGAFH SVTTPAQVQR PSSQSASVKT EPGSSAAVSD PCKKEVPDSS PIPSVMGDYN SDPPCSSSNP ANNKKYTDSN GNSDDMDGSS FSSFYSSFIK TTDGSESPPD TEKDPKHRKL KSMSTSESKI MEHPEEDQTQ HGDG

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 25: Qui s’en occupe ?

Period Period circadiancircadian

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 26: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: CollagèneCollagène

Informations taxonomiquesHomo sapiens (homme et …femme)

…existe aussi dans d’autres espèces

Séquence

Informations biologiques Protéine de soutien de la peau, de l’os,

du cartilage…

Perd de son élasticité avec l’âge… C’est la protéine la plus abondante des vertébrés…

Fiche no P02458

MIRLGAPQSL VLLTLLVAAV LRCQGQDVRQ PGPKGQKGEP GDIKDIVGPK GPPGPQGPAG EQGPRGDRGD KGEKGAPGPR GRDGEPGTLG NPGPPGPPGP PGPPGLGGNF AAQMAGGFDE KAGGAQLGVM QGPMGPMGPR GPPGPAGAPG PQGFQGNPGE PGEPGVSGPM GPRGPPGPPG KPGDDGEAGK PGKAGERGPP GPQGARGFPG TPGLPGVKGH RGYPGLDGAK GEAGAPGVKG ESGSPGENGS PGPMGPRGLP GERGRTGPAG AAGARGNDGQ PGPAGPPGPV GPAGGPGFPG APGAKGEAGP TGARGPEGAQ GPRGEPGTPG SPGPAGASGN PGTDGIPGAK GSAGAPGIAG APGFPGPRGP PDPQGATGPL GPKGQTGKPG IAGFKGEQGP KGEPGPAGPQ GAPGPAGEEG KRGARGEPGG VGPIGPPGER GAPGNRGFPG QDGLAGPKGA PGERGPSGLA GPKGANGDPG RPGEPGLPGA RGLTGRPGDA GPQGKVGPSG APGEDGRPGP PGPQGARGQP GVMGFPGPKG ANGEPGKAGE KGLPGAPGLR GLPGKDGETG AEGPPGPAGP AGERGEQGAP GPSGFQGLPG PPGPPGEGGK PGDQGVPGEA GAPGLVGPRG ERGFPGERGS PGAQGLQGPR GLPGTPGTDG PKGASGPAGP PGAQGPPGLQ GMPGERGAAG IAGPKGDRGD VGEKGPEGAP GKDGGRGLTG PIGPPGPAGA NGEKGEVGPP GPAGSAGARG APGERGETGP PGTSGIAGPP GADGQPGAKG EQGEAGQKGD AGAPGPQGPS GAPGPQGPTG VTGPKGARGA QGPPGATGFP GAAGRVGPPG SNGNPGPPGP PGPSGKDGPK GARGDSGPPG RAGEPGLQGP AGPPGEKGEP GDDGPSGAEG PPGPQGLAGQ RGIVGLPGQR GERGFPGLPG PSGEPGQQGA PGASGDRGPP GPVGPPGLTG PAGEPGREGS PGADGPPGRD GAAGVKGDRG ETGAVGAPGA PGPPGSPGPA GPTGKQGDRG EAGAQGPMGP SGPAGARGIQ GPQGPRGDKG EAGEPGERGL KGHRGFTGLQ GLPGPPGPSG DQGASGPAGP SGPRGPPGPV GPSGKDGANG IPGPIGPPGP RGRSGETGPA GPPGNPGPPG PPGPPGPGID MSAFAGLGPR EKGPDPLQYM RADQAAGGLR QHDAEVDATL KSLNNQIESI RSPEGSRKNP ARTCRDLKLC HPEWKSGDYW IDPNQGCTLD AMKVFCNMET GETCVYPNPA NVPKKNWWSS KSKEKKHIWF GETINGGFHF SYGDDNLAPN TANVQMTFLR LLSTEGSQNI TYHCKNSIAY LDEAAGNLKK ALLIQGSNDV EIRAEGNSRF TYTALKDGCT KHTGKWGKTV IEYRSQKTSR LPIIDIAPMD IGGPEQEFGV DIGPVCFL

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 27: Qui s’en occupe ?

CollagèneCollagène

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 28: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: TitineTitine

Informations taxonomiquesHomo sapiens (homme et …femme)

Séquence

Informations biologiquesProtéine responsable de l’élasticité

des muscles…C’est la plus grande protéine connue

Fiche no Q8WZ42

MTTQAPTFTQ PLQSVVVLEG STATFEAHIS GFPVPEVSWF RDGQVISTST LPGVQISFSD GRAKLTIPAV TKANSGRYSL KATNGSGQAT STAELLVKAE TAPPNFVQRL QSMTVRQGSQ VRLQVRVTGI PTPVVKFYRD GAEIQSSLDF QISQEGDLYS LLIAEAYPED SGTYSVNATN SVGRATSTAE LLVQGEEEVP AKKTKTIVST AQISESRQTR IEKKIEAHFD ARSIATVEMV IDGAAGQQLP HKTPHRIPPK PKSRSPTPPS IAAKAQLARQ QSPSPIRHSP SPVRHVRAPT PSPVRSVSPA ARISTSPIRS VRSPLLMRKT QASTVATGPE VPPPWKQEGY VASSSEAEMR ETTLTTSTQI RTEERWEGRY GVQEQVTISG AAGAAASVSA SASYAAEAVA TGAKEVKQDA DKSAAVATVV AAVDMARVRE PVISAVEQTA QRTTTTAVHI QPAQEQVRKE AEKTAVTKVV VAADKAKEQE LKSRTKEVIT TKQEQMHVTH EQIRKETEKT FVPKVVISAA KAKEQETRIS EEITKKQKQV TQEAIRQETE ITAASMVVVA TAKSTKLETV PGAQEETTTQ QDQMHLSYEK IMKETRKTVV PKVIVATPKV KEQDLVSRGR EGITTKREQV QITQEKMRKE AEKTALSTIA VATAKAKEQE TILRTRETMA TRQEQIQVTH GKVDVGKKAE AVATVVAAVD QARVREPREP GHLEESYAQQ TTLEYGYKER ISAAKVAEPP QRPASEPHVV PKAVKPRVIQ APSETHIKTT DQKGMHISSQ IKKTTDLTTE RLVHVDKRPR TASPHFTVSK ISVPKTEHGY EASIAGSAIA TLQKELSATS SAQKITKSVK APTVKPSETR VRAEPTPLPQ FPFADTPDTY KSEAGVEVKK EVGVSITGTT VREERFEVLH GREAKVTETA RVPAPVEIPV TPPTLVSGLK NVTVIEGESV TLECHISGYP SPTVTWYRED YQIESSIDFQ ITFQSGIARL MIREAFAEDS GRFTCSAVNE AGTVSTSCYL AVQVSEEFEK ETTAVTEKFT TEEKRFVESR DVVMTDTSLT EEQAGPGEPA APYFITKPVV QKLVEGGSVV FGCQVGGNPK PHVYWKKSGV PLTTGYRYKV SYNKQTGECK LVISMTFADD AGEYTIVVRN KHGETSASAS LLEEADYELL MKSQQEMLYQ TQVTAFVQEP KVGETAPGFV YSEYEKEYEK EQALIRKKMA KDTVVVRTYV EDQEFHISSF EERLIKEIEY RIIKTTLEEL LEEDGEEKMA VDISESEAVE SGFDLRIKNY RILEGMGVTF HCKMSGYPLP KIAWYKDGKR IKHGERYQMD FLQDGRASLR IPVVLPEDEG IYTAFASNIK GNAICSGKLY VEPAAPLGAP TYIPTLEPVS RIRSLSPRSV SRSPIRMSPA RMSPARMSPA RMSPARMSPG RRLEETDESQ LERLYKPVFV LKPVSFKCLE GQTARFDLKV VGRPMPETFW FHDGQQIVND YTHKVVIKED GTQSLIIVPA TPSDSGEWTV VAQNRAGRSS ISVILTVEAV EHQVKPMFVE

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 29: Qui s’en occupe ?

TitineTitine

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 30: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: TPIS (Triosephosphate isomérase)TPIS (Triosephosphate isomérase)

Informations taxonomiquesMaïs

Séquence

Informations biologiquesProtéine impliquée dans le métabolisme du sucre

…C’est une protéine essentielle à tous les organismes vivants

Fiche no P12863

MAPSRKFFVGGNWKMNGRKQSLGELIGTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIA VAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEF VDIINAKQ

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 31: Qui s’en occupe ?

TPISTPIS

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 32: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Hormone de croissanceHormone de croissance

Informations taxonomiquesHomo sapiens

Séquence

Informations biologiques…fait grandir les enfants…

…les 7 nains de Blanche-Neige n’en ont certainement pas eu assez….

Fiche no P01241

MATGSRTSLL LAFGLLCLPW LQEGSAFPTI PLSRLFDNAM LRAHRLHQLA FDTYQEFEEAYIPKEQKYSF LQNPQTSLCF SESIPTPSNR EETQQKSNLE LLRISLLLIQ SWLEPVQFLRSVFANSLVYG ASDSNVYDLL KDLEEGIQTL MGRLEDGSPR TGQIFKQTYS KFDTNSHNDDALLKNYGLLY CFRKDMDKVE TFLRIVQCRS VEGSCGF

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 33: Qui s’en occupe ?

Hormone de Hormone de croissance croissance (Somatotropi(Somatotropine)ne)

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 34: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: MetRS MetRS

(Methionyl-tRNA synthetase)(Methionyl-tRNA synthetase)

Informations taxonomiquesGrenouille

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la biosynthèse des autres protéines.

…indispensable à la Vie, présente chez tous les organismes vivants….

Fiche no Q6PF21

MKLFVGEGNP QGVKVLAAAA LWAQHVQIDR LQQEEKIVPF MSQPRLPVLD LENGNYLFLS NAICRYFYLS SGHDMCDLSN QWLEWEAAEL QPALSAALYA HVVQGKKKED VMATISASLK HLDQSLAGKS SPYLIKDALT VVDIVVWGSI YPLIVDASNL PEEMASLKRW FQNVSQLEQC QKAASSLLKD KGSSVFKPFL QKQPAPITPP GKSVCKEQEG EDMPSLSEED IQAAAEAWAK EPWKCIKGNQ QEQKRAGTVT GVAVNMAALL SIMLHPYMPT ISSVIQEQLL MPQESKVLTT DFCCCLQSGH QIGNVSPLFQ KLENDQIESL RKRFGGGQVK TESKVSPSQE APEQQAPKAS GPERVKELMQ ELEKQGNHVR ELKGKKAEKS VIDPEVQKLL ALKKELALAE GKSPDPPTQK GKKKK

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 35: Qui s’en occupe ?

MetRSMetRS

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 36: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Histone H4Histone H4

Informations taxonomiquesBoeuf

Séquence

Informations biologiques…importante pour la structure des chromosomes…

Fiche no P62803

MSGRGKGGKGL GKGGAKRHRK VLRDNIQGIT KPAIRRLARR GGVKRISGLI YEETRGVLKV FLENVIRDAV TYTEHAKRKT VTAMDVVYAL KRQGRTLYGF GG

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 37: Qui s’en occupe ?

Histone Histone H4H4

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 38: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: ATPA (ATP synthase alpha chain)ATPA (ATP synthase alpha chain)

Informations taxonomiquesVer

(petit ver composé d’environ 1000 cellules)

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la production d’énergie dans les mitochondries…

Fiche no Q9XXK1

MLSKRIVTAL NTAVKVQNAG IATTARGMAG ASGSEVSKIL EERILGTETG INLEETGKVL SIGDGIARVY GLKNIQAEEM VEFDSGIKGM AMNLDVDNVG VVVFGNDKVI REGDIVKRTG AIVDVPVGDG LLGRVVDALG NPIDGKGPIA NARRSRVEVK APGIIPRLSV REPMVTGVKA VDSLVPIGRG QRELIIGDRQ TGKTAIAIDT IINQKRFNDA GDDKKKLFCI YVAVGQKRST VAQIVKRLTD AGAMDYTIVV SATASDAAPL QFLAPYSGCA MGEHFRDNGK HALIIFDDLS KQAVAYRQMS LLLRRPPGRE AYPGDVFYLH SRLLERAAKM NNSLGGGSLT ALPVIETQAG DVSAYIPTNV ISITDGQIFL ETELFYKGVR PAINVGLSVS RVGSAAQTKA MKQVAGSMKL ELAQYREVAA FAQFGSDLDA STQQLLNRGV RLTELLKQGQ YVPMGIEEQV GVIYAGVKGY LDKVDPSAIT KFEKEFLAHL RSSQQALLKT IREEGQISPQ TDAQLKDVVV NFLATFKP

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 39: Qui s’en occupe ?

ATPAATPA

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 40: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Hémoglobine (HBB)Hémoglobine (HBB)

Informations taxonomiquesHomo sapiens

Séquence

Informations biologiquesTransporte l’oxygène dans le sang…

Fiche no P68871

MVHLTPEEKSA VTALWGKVNV DEVGGEALGR LLVVYPWTQR FFESFGDLST PDAVMGNPKV KAHGKKVLGA FSDGLAHLDN LKGTFATLSE LHCDKLHVDP ENFRLLGNVL VCVLAHHFGK EFTPPVQAAY QKVVAGVANA LAHKYH

…existe aussi dans d’autres espèces…

Le changement E -> V à cette position

conduit à l’anémie falciforme, à des

globules rouges en forme de faucille

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 41: Qui s’en occupe ?

HémoglobiHémoglobinene

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 42: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: MRP8MRP8

(ATP-binding cassette transporter sub-family C member 11 de son petit nom !)(ATP-binding cassette transporter sub-family C member 11 de son petit nom !)

Informations taxonomiquesHomo sapiens

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la qualité (grasse ou sèche) de la cire d’oreille, entre autres…

Fiche no Q96J66

MTRKRTYWVP NSSGGLVNRG IDIGDDMVSG LIYKTYTLQD GPWSQQERNP EAPGRAAVPP

WGKYDAALRT MIPFRPKPRF PAPQPLDNAG LFSYLTVSWL TPLMIQSLRS RLDENTIPPL SVHDASDKNV QRLHRLWEEE VSRRGIEKAS VLLVMLRFQR TRLIFDALLG ICFCIASVLG PILIIPKILE YSEEQLGNVV HGVGLCFALF LSECVKSLSF SSSWIINQRT AIRFRAAVSS FAFEKLIQFK SVIHITSGEA ISFFTGDVNY LFEGVCYGPL VLITCASLVI CSISSYFIIG YTAFIAILCY LLVFPLAVFM TRMAVKAQHH TSEVSDQRIR VTSEVLTCIK LIKMYTWEKP FAKIIEDLRR KERKLLEKCG LVQSLTSITL FIIPTVATAV WVLIHTSLKL KLTASMAFSM LASLNLLRLS VFFVPIAVKG LTNSKSAVMR FKKFFLQESP VFYVQTLQDP SKALVFEEAT LSWQQTCPGI VNGALELERN GHASEGMTRP RDALGPEEEG NSLGPELHKI NLVVSKGMML GVCGNTGSGK SSLLSAILEE MHLLEGSVGV QGSLAYVPQQ AWIVSGNIRE NILMGGAYDK ARYLQVLHCC SLNRDLELLP FGDMTEIGER GLNLSGGQKQ RISLARAVYS DRQIYLLDDP LSAVDAHVGK HIFEECIKKT LRGKTVVLVT HQLQYLEFCG QIILLENGKI CENGTHSELM QKKGKYAQLI QKMHKEATSD MLQDTAKIAE KPKVESQALA TSLEESLNGN AVPEHQLTQE EEMEEGSLSW RVYHHYIQAA GGYMVSCIIF FFVVLIVFLT IFSFWWLSYW LEQGSGTNSS RESNGTMADL GNIADNPQLS FYQLVYGLNA LLLICVGVCS SGIFTKVTRK ASTALHNKLF NKVFRCPMSF FDTIPIGRLL NCFAGDLEQL DQLLPIFSEQ FLVLSLMVIA VLLIVSVLSP YILLMGAIIM VICFIYYMMF KKAIGVFKRL ENYSRSPLFS HILNSLQGLS SIHVYGKTED FISQFKRLTD AQNNYLLLFL SSTRWMALRL EIMTNLVTLA VALFVAFGIS STPYSFKVMA VNIVLQLASS FQATARIGLE TEAQFTAVER ILQYMKMCVS EAPLHMEGTS CPQGWPQHGE IIFQDYHMKY RDNTPTVLHG INLTIRGHEV VGIVGRTGSG KSSLGMALFR LVEPMAGRIL IDGVDICSIG LEDLRSKLSV IPQDPVLLSG TIRFNLDPFD RHTDQQIWDA LERTFLTKAI SKFPKKLHTD VVENGGNFSV GERQLLCIAR AVLRNSKIIL IDEATASIDM ETDTLIQRTI REAFQGCTVL VIAHRVTTVL NCDHILVMGN GKVVEFDRPE VLRKKPGSLF AALMATATSS LR

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 43: Qui s’en occupe ?

MRP8MRP8

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 44: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: KératineKératine

Informations taxonomiquesHomo sapiens

Séquence

Informations biologiquesConstituant principal des cheveux et des ongles…

Fiche no Q14532

MTSSCCVTNN LQASLKSCPR PASVCSSGVN CRPELCLGYV CQPMACLPSV CLPTTFRPAS CLSKTYLSSS CQAASGISGS MGPGSWYSEG AFNGNEKETM QFLNDRLASY LTRVRQLEQENAELESRIQE ASHSQVLTMT PDYQSHFRTI DQLQQKILCT KAENARMVVN IDNAKLAADD FRAKYEAELA MRQLVEADIN GLRRILDDLT LCKADLEAQV ESLKEELMCL KKNHEEEVGSLRCQLGDRLN IEVDAAPPVD LTRVLEEMRC QYEAMVEANR RDVEEWFNMQ MEELNQQVAT SSEQLQNYQS DIIDLRRTVN TLEIELQAQH SLRDSLENTL TESEARYSSQ LAQMQCMITNVEAQLAEIRA ELERQNQEYQ VLLDVRARLE GEINTYRSLL ESEDCKLPCN PCSTPSCTTC VPSPCVTRTV CVPRTVGMPC SPCPQGRY

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 45: Qui s’en occupe ?

KératinKératinee

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 46: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Anticorps (IgG) Anticorps (IgG)

Informations taxonomiquesSouris

Séquence

Informations biologiquesProtéine du système immunitaire que participe à la défense de l’organisme…Cette protéine est contituée de plusieurs chaînes.

Fiche no P01868

…AKTTPPSVYP LAPGSAAQTN SMVTLGCLVK GYFPEPVTVT WNSGSLSSGV HTFPAVLQSD LYTLSSSVTV PSSPRPSETV TCNVAHPASS TKVDKKIVPR DCGCKPCICT VPEVSSVFIFPPKPKDVLTI TLTPKVTCVV VDISKDDPEV QFSWFVDDVEVHTAQTQPRE EQFNSTFRSV SELPIMHQDW LNGKEFKCRV NSAAFPAPIE KTISKTKGRP KAPQVYTIPP PKEQMAKDKVSLTCMITDFF PEDITVEWQW NGQPAENYKN TQPIMNTNGS YFVYSKLNVQ KSNWEAGNTF TCSVLHEGLH NHHTEKSLSH SPGK

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 47: Qui s’en occupe ?

IgGIgG

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 48: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Protéine ribosomale L5 Protéine ribosomale L5

Informations taxonomiquesBactérie (E.coli)

Séquence

Informations biologiquesProtéine qui fait partie d’un assemblage de protéines appelé ribosome, impliqué dans la fabrication des protéines

Fiche no P62399

MAKLHDYYKDE VVKKLMTEFN YNSVMQVPRV EKITLNMGVG EAIADKKLLD NAAADLAAISGQKPLITKAR KSVAGFKIRQ GYPIGCKVTL RGERMWEFFE RLITIAVPRI RDFRGLSAKSFDGRGNYSMG VREQIIFPEI DYDKVDRVRG LDITITTTAK SDEEGRALLA AFDFPFRK

…existe aussi dans d’autres espèces…

Protéine en cours de

fabrication par un ribosome...

un ribosome...

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 49: Qui s’en occupe ?

Protéine Protéine ribosomale ribosomale L5L5

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 50: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Zinedine Zinedine

Informations taxonomiquesHomo Sapiens

Séquence

Informations biologiquesProtéine-relais pour le passage des signaux dans la cellule…

Fiche no Q9NRL3

MMEERAAAAV AAAASSCRPL GSGAGPGPTG AAPVSAPAPG PGPAGKGGGG GGSPGPTAGP EPLSLPGILH FIQHEWARFE AEKARWEAER AELQAQVAFL QGERKGQENL KTDLVRRIKM LEYALKQERA KYHKLKFGTD LNQGEKKADV SEQVSNGPVE SVTLENSPLV WKEGRQLLRQ YLEEVGYTDT ILDMRSKRVR SLLGRSLELN GAVEPSEGAP RAPPGPAGLS GGESLLVKQI EEQIKRNAAG KDGKERLGGS VLGQIPFLQN CEDEDSDEDD ELDSVQHKKQ RVKLPSKALV PEMEDEDEED DSEDAINEFD FLGSGEDGEG APDPRRCTVD GSPHELESRR VKLQGVLADL RDVDGLPPKV TGPPPGTPQP RPHEDVFIMD TIGGGEVSLG DLADLTVTND NDLSCDLSDS KDAFKKTWNP KFTLRSHYDG IRSLAFHHSQ SALLTASEDG TLKLWNLQKA VTAKKNAALD VEPIHAFRAH RGPVLAVAMG SNSEYCYSGG ADACIHSWKI PDLSMDPYDG YDPSVLSHVL EGHGDAVWGL AFSPTSQRLA SCSADGTVRI WDPSSSSPAC LCTFPTASEH GVPTSVAFTS TEPAHIVASF RSGDTVLYDM EVGSALLTLE SRGSSGPTQI NQVVSHPNQP LTITAHDDRG IRFLDNRTGK PVHSMVAHLD AVTCLAVDPN GAFLMSGSHD CSLRLWSLDN KTCVQEITAH RKKHEEAIHA VACHPSKALI ASAGADALAK VFV

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 51: Qui s’en occupe ?

ZinediZinedinene

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 52: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: CollagèneCollagène

Informations taxonomiquesTyrannosaure

Séquence

Informations biologiquesC’est la plus vieille séquence de protéine connue…Extraite des tissus mous d’un fossile agé de 68 millions d’années retrouvé dans le Montana (USA)…

Fiche no P0C2W2

GATGAPGIAGAPGFPGARGAPGPQGPAGAPGPKXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGVQGPPGPQGPR XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGAAGPPGATGFP GAAGRXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGVVGLPGQR

Les bouts de séquence manquants sont représentés par des X (par homologie avec des séquences de collagène d’autres espèces). Séquence ‘similaire’ à celle du poulet

…existe aussi dans d’autres espèces…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

Page 53: Qui s’en occupe ?

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]

CollagèneCollagène

Page 54: Qui s’en occupe ?

Nom de la protéine: Flavanone 7-O-glucoside 2''-O-beta-L-rhamnosyltransferaseFlavanone 7-O-glucoside 2''-O-beta-L-rhamnosyltransferase

Informations taxonomiquesPamplemousse

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la fabrication d’une molécule, la naringine, responsable de l’amertume de certains fruits, comme les agrumes et en particulier des fruits qui ne sont pas mûrs…

Fiche no Q8GVE3

MDTKHQDKPS ILMLPWLAHG HIAPHLELAK KLSQKNFHIY FCSTPNNLQS FGRNVEKNFSSSIQLIELQL PNTFPELPSQ NQTTKNLPPH LIYTLVGAFE DAKPAFCNIL ETLKPTLVMY DLFQPMAAEA AYQYDIAAIL FLPLSAVACS FLLHNIVNPS LKYPFFESDY QDRESKNINYFLHLTANGTL NKDRFLKAFE LSCKFVFIKT SREIESKYLD YFPSLMGNEI IPVGPLIQEPTFKVDDTKIM DWLSQKEPRS VVYASFGSEY FPSTDEIHDI AIGLLLTEVN FIWAFRLHPDEKMTIEEALP QGFAEEIERN NKGMIVQGWV PQAKILRHGS IGGFLSHCGW GSVVEGMVFGVPIIGVPMAY EQPSNAKVVV DNGMGMVVPR DKINQRLGGE EVARVIKHVV LQEEAKQIRRKANEISESMK KIGDAQMSVV VEKLLQLVKK SE

…existe aussi dans d’autres agrumes…

La banque de données Swiss-ProtLa banque de données Swiss-Prothttp://beta.uniprot.orgSwiss-

[email protected]