Paul Payette, Merck Frosst, janvier 2004
Génomique et protéomique
Paul Payette, Merck Frosst, janvier 2004
1980 19
81 1982 19
83 1984 19
85 1986 19
87 1988 19
89 1990 19
91 1992 19
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95
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1997
1998 19
99
2000
PD
B
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spro
t
Gen
bank
0
5,000,000
10,000,000
15,000,000
20,000,000
25,000,000
30,000,000
Nombre
Année
Bases de données Août 2003
Paul Payette, Merck Frosst, janvier 2004
Bases de données - Proteines
0
20,000
40,000
60,000
80,000
100,000
120,000
140,000
Nom
bre PDB
Swissprot
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Bioinformatique, génomique, protéomique… ique, ique, ique!
– BIOINFORMATIQUECollecte, organisation et analyse de grandes quantités de données biologiques, à l’aide de réseaux d’ordinateurs et de bases de données. Les technologies et les outils logiciels des bases de données permettent aux chercheurs de recueillir, de stocker et d’extraire un volume sans cesse croissant de données sur les séquences géniques et protéiniques.
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Définitions…
• GÉNOMIQUEScience qui se propose d’étudier la structure, le fonctionnement et l’évolution des génomes.
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• PROTÉOMIQUELa protéomique est l’étude de toutes les protéines fabriquées par un organisme : son protéome. Les chercheurs en protéomique étudient la structure et la fonction des protéines, de même que leurs interactions.
Définitions …
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Liens intéressants
• Reseau bioinformatique canadien– http://cbrmain.cbr.nrc.ca:8080/cbr/servlet/ListCLAppsServlet?type=2&lang=fra)
• Génome Québec– http://www.genomequebec.com/index.asp
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Génomique
• MICRO-PUCES À ADN (gene chip)– Puces d’ADN; supports miniaturisés qui
portent sur une surface réduite de grandes quantités de « sondes » capables de «happer» dans un milieu biologique des fragments d’ADN homologues (complémentaires).
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Génomique: Résultats micro-puces
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Gel de protéines 2D - Protéomique
Poids moléculaire
Point isoélectrique
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Exemple d’expérience in silico
• Analyse fonctionnelle de l’oestrogène sulfotransférase
(Dossier réalisé par Cédric Dubois et par Nicolas Novalis, École supérieure d’ingénieurs de Luminy, France)
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