Espèce et spéciation : problématique générale
Sarah Samadi & Anouk Barberousse
Consommation de plantes sauvages en Ethiopie (Balanites aegyptiaca)
La perception intuitive des espèces
Indien Kapayos du Brésil Connaissances des vertusmédicinales des plantes
Biodiversité• Une tâche d’inventaire
• Un objectif de reconstruction des processus qui l’ont produite
Avec Darwin, la perception de la biodiversité, instantanée, s’explique comme le produit d’une histoire continue
La révolution darwinienne
Variation + descendance évolution
Décrire vs. Expliquer
• Etudier les espèces et les mécanismes de spéciation, ce n’est donc pas seulement dérouler le film de l’évolution, c’est surtout comprendre les causes de cette histoire.
• Il s’agit donc de proposer des modèles explicatifs.
Exemple : Pasteur et la réfutation de la génération
spontanée
• Le phénomène à expliquer : e.g. apparition d’asticots sur de la viande
• Le modèle couramment accepté : la génération spontanée
• L’expérimentation apporte la réfutation du modèle
• Ce qui permet de proposer un nouveau modèle
• Les données accumulées depuis confortent le modèle
La Sélection Naturelle : un modèle explicatif général
• Les faits : diversité actuelle et fossile et sa structuration (pattern discret à un instant et pattern continu dans le temps)
• Le modèle existant : chaque espèce résulte d’un événement unique de génération (création)
• Les données expérimentales qui permettent de proposer un modèle : la sélection artificielle (expérimentation peu contrôlée)
• Les données accumulées ont permis de conforter et d’affiner le modèle (par exemple en introduisant des raisonnements probabilistes)
Les modèles particuliers
• Tectonique des plaques = explication générale
• Collision Inde / Asie = un modèle particulier pour expliquer la formation de l’Himalaya– C’est un nouveau modèle (pas une
dérivation triviale du modèle général)– Il est réfutable
Pour conforter le modèle général, on évalue sa capacité à expliquer des ensembles circonscrits de faits grâce à un modèle particulier c’est-à-dire restreint aux paramètres propres au cas étudié
modèle canonique
Sélection Naturelle
Espèces sœurs
Barrière Extrinsèque
Barrière d’Isolement Reproducteur
Espèces sœurs
modèle alternatif
Application à la biologie évolutive Exemples de modèles généraux :
spéciation allopatrique, écologique etc…
• Pattern (phylogénie, données fossiles, structure génétique) = ensemble d’hypothèses descriptives des faits à expliquer
• À partir de ce pattern, proposition d’un modèle particulier qui peut être une combinaison des modèles généraux
Application à la biologie évolutive
Espèces soeursespèce Y
outgroup
espèce Z
espèce X
Allopatrie Sympatrie
Alcithoe
Cancellopollia
Chicoreus
Thèse Magalie Castelin
Thèse Magalie Castelin
Patterns
D'après "Au commencement était l'homme - De Toumaï à Cro-Magnon" Pascal Picq
Mais ces patterns sont eux-mêmes des
hypothèses réfutables
On reconstruit des patterns
On s’appuie sur de tels patterns pour proposer des modèles
explicatifs
D'après "Classification phylogénétique du vivant" G. Lecointre et H. Le Guyader, Editions Belin
Typiquement, les clades sont des
hypothèses sur l’histoire évolutive
Patterns: clades et espècesDe même, les espèces décrites sont des
hypothèses sur la réalité biologique et non
directement cette réalité.
Lucanus cervus.
Les espèces, au même titre que les
organismes, interagissent
individuellement avec leur
environnement biotique et
abiotique
Les clades décrits ne peuvent que témoigner des
processus qui ont agi dans le passé sur les espèces
Conclusion
• Cela montre que les approches « pattern » et
« process » ne doivent pas être opposées.
• Au contraire, la justification de la recherche
de patterns est qu’ils permettent de
comprendre les processus.
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