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Biochimie des Protéines

Licence STS Biologie-Biochimie UEO26 L3

Vincent Vedel

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Introduction

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2.1 Structure primaire 2.1.1 Structure primaire linéaire

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2.1 Structure primaire 2.1.1 Structure primaire linéaire

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2.2 Structure secondaire

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2.2 Structure secondaire 2.2.1 L’hélice alpha

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2.2 Structure secondaire 2.2.2 Le feuillet beta

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2.2 Structure secondaire 2.2.3 Hélice vs feuillet

résidu

fréquence dans une hélice α (1=distribution aléatoire)

résidu fréquence dans un feuillet β (1=distribution aléatoire)

E 1,59 V 1,87

A 1,41 I 1,67

L 1,34 Y 1,45

M 1,3 C 1,40

Q 1,27 W 1,35

K 1,23 F 1,33

R 1,21 L 1,22

F 1,16 T 1,17

I 1,09 M 1,14

H 1,05 Q 0,98

W 1,02 S 0,96

D 0,99 R 0,84

V 0,90 H 0,80

T 0,76 A 0,72

N 0,76 K 0,69

Y 0,74 G 0,58

C 0,66 E 0,52

S 0,57 N 0,48

G 0,43 D 0,39

P 0,34 P 0,31

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2.2 Structure secondaire 2.2.4 Autres structures secondaires

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2.2 Structure secondaire 2.2.4 Autres structures secondaires

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2.3 Structure tertiaire 2.3.1 Maintien de la structure

Type d'interaction Changement dans l'énergie libre (en kJ/mol)

lien covalent (carbone-carbone) -350 (très solide!)

interaction hydrophobique -10

interaction ionique (pont de sel) -4

pont hydrogène (entre H et F,O ou N) -3

forces de Van der Waals -1

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2.3 Structure tertiaire 2.3.2 Fibres et globules

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2.3 Structure tertiaire 2.3.3 Domaines

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2.3 Structure tertiaire 2.3.3 Domaines

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2.3 Structure tertiaire 2.3.3 Domaines

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2.3 Structure tertiaire 2.3.4 Les chaperones

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2.3 Structure tertiaire 2.3.5 Quand la structure tertiaire cafouille

Dr Stanley Prusiner Photo (c) 2000 The Nobel Institute.

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2.3 Structure tertiaire 2.3.6 Epissage protéique

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2.3 Structure tertiaire 2.3.6 Epissage protéique

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2.3 Structure tertiaire 2.3.6 Epissage protéique: par le protéasome

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2.4 Structure quaternaire 2.4.1 Hémoglobine

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2.4 Structure quaternaire 2.4.1 Hémoglobine

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2.4 Structure quaternaire 2.4.2 Anémie falciforme