Virus à Transmission Entérique MICROBIOLOGIE DCEM1 Mercredi 18 Février 2009 Nicolas LEVEQUE...

Virus Transmission Entrique MICROBIOLOGIE DCEM1 Mercredi 18 Fvrier 2009 Nicolas LEVEQUE Laboratoire de Virologie CHU Robert Debr - Reims Mail : [email protected]

Virus Transmission Entrique Entrovirus (poliovirus) Hpatite A Hpatite E Rotavirus Astrovirus Calicivirus Adnovirus

A. Virus entriques non responsables de diarrhes

1. Classification et structure Un genre de la Famille des Picornaviridae Comprend 89 srotypes humains : Poliovirus 1 3 Coxsackievirus A et B Echovirus Enterovirus Les entrovirus

Oberste et al., 2001 o Classification actuelle : 4 espces A, B, C, D Classification en constante volution EV96 et 97 (Smura et al., J Gen Virol, 2007) EV79-88, EV-97 et EV-100-101 (Oberste et al., Virus Res., 2007) Genre Rhinenterovirus 1. Classification et structure

1. Classification et structure La capside Canyon = zone dinteraction virus/rcepteur Pleconaril

1. Classification et structure Le gnome Petits virus nus ARN simple brin Daprs Rueckert, 1996 Trs conserve Trs variable

2. Aspects pidmiologiques Antona et al., EJCMID, 2007 Surveillance de la circulation des entrovirus : Laboratoires participant au RSE au 1er janvier 2005

Distribution par tranches dge des diagnostics positifs dinfection entrovirus, RSE, France, 2000-2004 2. Aspects pidmiologiques Antona et al., EJCMID, 2007 En % du total des prlvements Age :

Saison : Les infections EV voluent toute lanne, y compris en hiver, sur un fond endmique avec un pic de mai octobre 2. Aspects pidmiologiques Antona et al., EJCMID, 2007 Saisonnalit des infections entrovirus, RSE, France, 2000-2004 NB : Semaine 27 ~ Juillet

Srotype : tous les srotypes sont impliqus mais certains sont particulirement pidmiognes et mningotropes exemples : E6, E13, E30 Chomel et al., EJCMID, 2003 2. Aspects pidmiologiques Donnes du CNR de Lyon 1976-2002

2. Aspects pidmiologiques Serotype20002001200220032004 Total E-305254415649639 23.2% E-1342513430445 16.1% CV-B5382351534115 4.2%

Clinique LCR Gorge Sang Selles 2 mois minimum (poliovirus) 1 2 jours 7 14 jours Incubation 1 2 jours 3. Physiopathologie

Les entrovirus en pathologie humaine : Infections frquentes Asymptomatique ou bnigne dans plus de 90% des cas Gravissime chez limmunodprim et le nouveau-n Possibles atteintes cardiaques, hpatiques ou cutano- muqueuses Virus neurotropes 4. Clinique

Polios gris et muelos moelle. Infection de la substance grise de la corne antrieure de la moelle pinire (atteinte des neurones moteurs). Paralysie ascendante en quelques heures (Paralysies Flasques Aigus ou PFA). Mortalit entre 5 et 10 % par paralysie des muscles respiratoires (poumons dacier). Paralysies rsiduelles des degrs variables. 4. Clinique : La Poliomylite antrieure aigu

Avant l're vaccinale 600 000 morts infantiles/an 1988 Plan dradication lanc par lOMS Vaccin Polio Injectable (VPI), Inactiv, dvelopp par Jonas Salk, contenant les 3 srotypes de virus 1+2+3, immunit gnrale (IgG) Vaccin Polio Oral (VPO), attnu, Sabin, 3 srotypes, immunit locale + gnrale 4. Clinique : La Poliomylite antrieure aigu

VPI Innocuit parfaite Immunognicit parfaite Pas de retour possible la neurovirulence Administration parentrale Cher VPO Administration orale et bon march Immunit locale Immunit collective Possibilit de rversion (1 cas sur 10 7 ) Thermolabile

19 4. Clinique : La Poliomylite antrieure aigu 350 000 cas dans 125 pays en 1988 1951 en 2005 dans 4 pays

Les virus des hpatites Hpatite A (HAV) Hpatite B (HBV) Hpatite C (HCV) Hpatite D (HDV, agent delta) Hpatite E (HEV) Hpatite G (HGV)

Virus FamilleAcide nuclique / enveloppe Taux de mortalit % Infection chronique Mode de transmission HAV HBV HCV HDV HEV HGV Picornaviridae Hepadnaviridae Filaviridae Satellite Calicivirus-like Flavivirus ARN / non ADN / oui ARN / oui ARN 0,2-0,4 0,2-1 1-2 2-20 0,2-3 ? non oui non oui (peu svre) fcal-oral parentral parentral fcal-oral parentral Les virus des hpatites

Le VHA 1. Structure Famille des Picornaviridae Genre Hepatovirus Virus nu ARN+ proche des entrovirus 1 seul srotype

strictement humain Virus strictement humain Contamination fcale-orale Contamination fcale-orale : directe (mains) ou indirecte (coquillages, eau). 2. pidmiologie Zone tempre fin automne sporadique ou petites pidmies limites endmicit faible < 15 % des sujets anticorps 20 ans Zone tropicale toute lanne anticorps prsents chez la plupart des enfants endmicit forte 70-100 % des sujets anticorps 20 ans

Incubation variable : 1 mois (4 6 semaines) Une hpatite virale volue en trois phases : Pr-ictrique (4 7 jours) : troubles digestifs, asthnie, rash, arthralgies Ictrique (8 30 jours) : ictre, oligurie, dcoloration des selles Phase de convalescence (plusieurs mois) Il existe des formes cliniques majeures (hpatite fulminante) ou mineures, voire inapparentes (Influence de lge +++) 3. Clinique

Infection aiguInfection chronique VirusHpatite asymptomatique Hpatite aiguHpatite fulminante Hpatite Chronique Cirrhose Carcinom e VHA90%10% Rares 0.2 0.4% 000 VHB90%10% 1% 10%30%40% VHC95%5% 0 85%20%25% 3. Clinique

Srologie Srologie / tests ELISA : IgG + IgM (3 mois) PCR srique 4. Diagnostic de lhpatite A

Prvention de lhpatite A hygine = rgles dhygine (cf transmission fcale-orale, transmission par leau) 5. Prvention Vaccin contre le VHA Vaccin contre le VHA = vaccin inactiv ; 1 injection + rappel 1 an + rappel 10 ans (Havrix) vaccin combin VHA + VHB (Twinrix)

Caliciviridae ARN monocatnaire de polarit positive Virus nu pidmies transmission fcale-orale Asie (Indes), Afrique et Amrique du sud Hpatite aigu en 2 10 semaines Grave chez femme enceinte, 3me trimestre (mortalit 20%) Diagnostic srologique Le VHE

B. Virus entriques responsables de diarrhes

Over a 3 day period, one sick fisherman contaminated 23,000 bushels of oysters sold in about 14 states with a single strain of norovirus

En 2005: 14 outbreaks on 10 ships Some repeated after cleanup By sequence, some linked to common sources Multiple modes of spread Food, person- to-person

La majorit des pisodes de gastro-entrite sont dues des virus Absence de diagnostic tiologique dans la plupart des cas 1910, Ito (Japon) pseudo-cholera infantile 1929, Zahorsky (St Louis, USA) Winter vomiting syndrome Virus Hiver Bactries et parasites t Reflte lamlioration du traitement des eaux Sude : Prvalence ts annes 30 = hivers des annes 80 Virus responsables de diarrhes

Rotavirus Calicivirus Norovirus (virus de Norwalk) et Sapovirus Astrovirus Adnovirus

1. Structure des virus Types 40 et 41

Famille des Reoviridae ARN gnomique bicatnaire en 11 segments Capside icosadrique Pas denveloppe 7 srotypes : A G A, B et C chez lHomme A Monde entier B Chine principalement C rares pidmies 1.1. Les Rotavirus

Observs pour la premire fois en 1975 en microscopie lectronique morphologie en toile Famille des Astroviridae Virus nu ARN monocatnaire + 8 srotypes 1.2. Les Astrovirus

Famille des Caliciviridae Dpressions rgulires la surface de la capside calice Virus nus ARN monocatnaire de polarit positive 2 genres / 2 gnotypes : Norovirus et Sapovirus Norovirus = Virus de Norwalk (pidmie de gastro-entrites survenue en 1972 dans la ville de Norwalk (Ohio) 1977 Virus Sapporo 1.3. Les Calicivirus

Famille des Adenoviridae, genre Mastadenovirus ADN bicatnaire Capside icosadrique Pas denveloppe 51 srotypes humains 6 sous-groupe de A F Adnovirus 40 et 41 1.4. Les Adnovirus

2. Modes de transmission Fcale-orale Infectivit leve (10 100 particules virales) Transmission directe : Rotavirus, adnovirus Transmission indirecte : virus Norwalk. Grande quantit de virus dans les selles (10 10 virus /ml de selles) Virus nus = rsistants en milieu extrieur

3. Epidmiologie Pic dincidence des infections svres entre 6 et 24 mois L'un des premiers motifs de consultation en mdecine et principalement en pdiatrie Morbidit leve / impact conomique important 3 millions de consultations mdicales/an en France 220 000 hospitalisations aux USA chez lenfant de 3 millions de dcs annuels dans les PIVD

3. Epidmiologie

30-50 % des gastro-entrites aigus de lenfant 70 % des gastro-entrites aigus dans 1re anne de vie Touchera tous les enfants avant lge de 5 ans 140 millions de cas/an 18 millions diarrhes svres (90% des gastro-entrites hospitalises) 600 800 000 dcs 3.1. pidmiologie des rotavirus

3.1. les rotavirus Pays dvelopps : principale cause dhospitalisation des nourrissons 1ere cause dinfections nosocomiales pdiatriques (15 %) Dcembre janvier : concomittantes des pidmies de viroses respiratoires (VRS, grippe) engorgement hpitaux

1.5 9% des selles denfants diarrhiques 1 2% des selles denfants asymptomatiques pidmies de gastro-entrites en collectivit Hpitaux, maisons de retraite, crches 75% des enfants sropositifs 10 ans 3.2. les Astrovirus

1re cause GEA dans les pays dvelopps 85% des gastro-entrites tout ge confondu aux Pays-bas Adulte > enfants pidmies de gastro-entrites collectivits maisons de retraite, hpitaux, crches bateaux de croisire, Consommation eau, aliments et coquillages souills 3.3. les calicivirus

Cause endmique de gastro-entrites (5%) dans les collectivits maisons de retraite, hpitaux, crches et orphelinats Tout ge Chez lenfant +++

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