Virus à ARN + : stratégie de réplication Caractéristiques spécifiques polyprotéine protéase...

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irus à ARN + : stratégie de réplication Caractéristiques spécifiques • polyprotéine • protéase • protéines non-structurales

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Virus à ARN + : stratégie de réplication

Caractéristiques spécifiques• polyprotéine• protéase• protéines non-structurales

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Virus à ARN - : Organisation du génome

3’ 5’

Enveloppeglycoprotéine

Matrice PolymérasePolymérase

Nucléocapside

5’ 3’

MN P G L

Transcription discontinueARNm sous-génomiques

RageRougeoleOreillonsVirus de la stomatide vésiculaire (VSV)EbolaMarburg

+

-

Enzymes structurales P,L

Nucléocapside (N, NC, NP)

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traduction

modificationpost-traductionelle

morphogenèse

réplication: ARN-

traduction

ARN-

2°) transcription discontinue

Virus à ARN - : stratégie de la réplication

3°) traduction

Membrane cellulaire

1°) dissociation de N de ARN

ARNm

4°) réplication : ARN+Modification de la

fonction de laréplicase

5°) traduction (massive) morphogenèse

-

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Virus à ARN - : stratégie de la réplication

Caractéristiques spécifiques• enzymes structurales (polymérases)• transcription discontinue• protéine N

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Rétrovirus : Organisation du génome

Transcription : épissage alternatifRNAm sous-génomiques

Gag-PolVifVprVpu, EnvTatTevRev, NefNef

Virus à ARN -Enzymes structurales

Virus à ARN +Polyprotéine & Protéase

Protéase IntégraseTranscriptase

inverseM C NC

ARNm (+)

HIVMLVRSV

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1°) rétrotranscription

6°) modification post-

traductionnelle

7°) morphogenèse

3°) transcription

ARNmmultiépissés

Maturation de lapolyprotéine

4°) épissage alternatif

Membrane cellulaire

3’5’5’

Membrane nucléaire

2°) intégration

3’5’5’

ADN (-)

ARNmmonoépissés

ARNmnon-épissés

Transcriptaseinverse

Intégrase

ARN polymérase II

Protéase

5°) changement du cadre de

lecture

Env Gag-Pol GagTatRevNef

Rétrovirus : stratégie de la réplication

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Rétrovirus : stratégie de réplication

Caractéristiques spécifiques• enzymes structurales

• Transcriptase inverse• Intégrase• Protéase

• intégration dans le génome de l’hôte• épissage alternatif (3 cadres de lecture)• polyprotéine• changement du cadre de lecture

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Virus ARN +Virus ARN --enzymes structurales - +-réplicase virale + +-helicase + --protéine N - +-modification de lafonction

de la réplicase par N - +-ARNm taile génomique taile sous-génomique

(ou sous-génomique) (ou génome ségmenté)1 ARNm = plusieurs protéines1 ARNm = 1 protéine

- polyprotéine + -- protéase(s) + -

ARN génomique subi 1°) traduction 1°) ARNm2°) ARN- (antigénomique) 2°) ARN+ (antigénomique)

réplicase (P,L)(1-3 sous-unité)protéine N(Nucléocapside)Virus ARN + et -

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-sb

Un 16-20 Uneprotéine

Transcriptase

- + rhabdoviridae virus de la stomatite vésiculaire (VSV),rage,

" Un " + - + filoviridae Ebola, Marburg

" Un " + - + paramyxoviridae rougeole, oreillons, parainf luenza

" 7-8 segments 14 " + ARNmcellulaire

+ orthomyxoviridae grippe

+/- sb 3 segments 13-21 " + " + bunyaviridae Fièvre hémorragique, Hantavirus

" 2 segments“circ”

10-14 " + " + arenaviridae Lassa, Machupo, virus de la Chorioméningitelymphocytaire (LCMV)

db 8-12segments

22-27 " + - - reoviridae rotavirus, maladie fébrile

" 2 segments 7 " + - - birnaviridae "bursal disease of chickens"

Soulignements : hépatites; maladies infantiles

polarité

ARNgénomique

taille(kb)

ARNm Enzymesdans levirion

amorce enveloppe Nom de famille

+sb

Un 7.2-8.4

Ta ille degénome

- Protéine - picornaviridae Entero-: poliomyélite, Cardio-Hepato-: hépatite A, Rhino-

" Un " - " + f laviviridae hépatite C, f ièvres hémorragiques: f ièvrejaune, virus de la dengue, encéphalite deSt.Louis

" Un 10-12 Subgénomique

- - + alphaviridae rubéole , virus de Sindbis (SV),virus de la foret de Semliki (SFV)

" Un " - - + coronaviridae "common cold pneumonia"

" Un " - - caliciviridae hépatite E, gastroentérite

Familles de virus à ARN humains et animaux

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Pandémie de l'influenza 1918-1919Un des évènements les plus mortels dans l'histoire

Millions de mortsPandémie d' influenza (1918-1919) 20-40La mort noire (la peste) (1348-1350) 20-252e guerre mondiale (1937-1945) 16Pandémie du SID A (jusqu'à 1997) 121re guerre mondiale (1914-1918, morts militaires) 9

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La virus de la grippe est un virus à ARN- avec un génome segmenté

Enzymes structurales :Polymérases PA, PB1, PB2

Protéine « N » (=NP)

(Hémagglutinine)

(Neuraminidase)

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L’acide sialique est le récepteur du virus de la grippeTropisme viral au niveau de l’entrée

Liaison 2’-6’ : trachée de l’hommeLiaison 2’-3’ : les oiseauxLiaison 2’-3’ & 2’-6’ : cochonMembrane cellulaire

Tropisme du virus de la grippeSouches humaines : préférence de hémagglutinine : 2’-6’Souches aviaires (H5) : préférence de hémagglutinine : 2’-3’

HA