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Dernière mise à jour : 02/04/2019

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Valorisation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM

La tumorothèque et la banque de muscles de l’AP-HM ont pour mission de cryoconserver des échantillons issus de soins pour une utilisation sanitaire, si nécessaire et de recherche après requalification. La tumorothèque et la banque de muscles ont été certifiées ISO 9001 fin mars 2010 jusqu’en août 2013. Le CRB est autorisé à céder des échantillons à visée recherche depuis 2008 (dossier AC 2008-70 renouvelé en 2013 : N° 2013-1786). Sous l’égide du Canceropôle PACA les deux tumorothèques marseillaises (IPC, AP-HM) et celle de Nice (CHU-CAL) se sont regroupées pour être labellisées IBIZA depuis 2009 et créer un catalogue virtuel des échantillons au sein du Canceropôle PACA (www.biobank.paca.com). De plus, les trois tumorothèques participent au réseau européen BBMRI et sont autorisées à exporter des prélèvements dans le cadre de cessions à des équipes en dehors du territoire français. Enfin, depuis février 2014, un site de stockage long terme entièrement automatisé est opérationnel sur le site de la Timone. Ce changement de locaux et d’organisation expliquent le non-renouvellement de la certification en 2014. Une nouvelle demande d’accrédiation est engagée.

Cette activité de biobanking doit être valorisée au travers de différentes actions. Ceci est rapporté dans le présent document pour les années 2007-2018. Tout d’abord, il est nécessaire de communiquer auprès de différentes instances sur l’existence et les missions du CRB. Ceci est rapporté dans le premier paragraphe intitulé « Actions de communications et publications relatives à l’activité de cryoconservation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM ». Par ailleurs, les échantillons utilisés dans le cadre du soin peuvent faire l’objet d’analyses biologiques qui seront secondairement publiées. De même, il est important que les échantillons cédés dans le cadre de la recherche puissent permettre des travaux de recherche dont les résultats seront publiés. En effet, compte tenu de la préciosité des échantillons, il est particulièrement important qu’ils soient utilisés de la façon la plus optimale possible. Dans ce contexte, le paragraphe II du présent document rapporte le listing des publications réalisées à partir des échantillons cédés par le CRB. Par ailleurs, tout échantillon cédé dans le cadre de la recherche nécessite au préalable le dépôt d’une demande de cession argumentée et approuvée secondairement par le Comité Scientifique. Le paragraphe III rapporte le listing des cessions pour la période 2007-2018 dans le cadre de la recherche, ainsi que les publications dont elles ont fait l’objet. Enfin, la participation de la tumorothèque à des réseaux de soins ou à des projets multicentriques est rapportée dans le paragraphe IV.


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I – Actions de communications, rapports d’activité et publications relatives à l’activité de cryoconservation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM 1. Auprès des organismes de tutelles

2007 Présentation de l’activité de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM auprès du conseil exécutif de l’AP-HM – 24 Septembre 2007 – D. Figarella-Branger

2008 Nouvelle présentation de l’activité de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM auprès du conseil exécutif de l’AP-HM en vu de la construction d’un site de stockage long terme – 11 Février 2008 – D. Figarella-Branger

2009 Présentation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM auprès du centre de coordination en cancérologie (3 C) – Février 2009 – D. Figarella-Branger

2010 Présentation des tumorothèques de Marseille (AP-HM, IPC) lors de la visite AERES de l’Université – D. Figarella-Branger

2011 Tumorothèque-organisation en région PACA ONCOPACA (3C) – Dr C. Chabanon Réunion Régionale de Cancérologie Cancéropôle : l’enjeu des tumorothèques La lettre de l’Université de la Méditerranée – Décembre 2011

2013 Action de communication à l’occasion des 10 ans du cancéropôle PACA – 13 Février 2013

2014 Présentation de la tumorothèque et de la banque de muscles au nouveau bureau de la direction de la recherche et de l’innovation de l’AP-HM – 24 Septembre 2014 – D. Figarella-Branger 2. Auprès des patients et des associations de patients

2007 Présentation auprès de l’Association pour la Recherche sur les Tumeurs Cérébrales (ARTC Sud) – 12 Avril 2007 – D. Figarella-Branger

2008 Présentation du nouveau centre de recherche en oncologie et oncopharmacologie (CRO2) et de l’intérêt des ressources biologiques. Plaquettes d’information de l’ARTC Sud « Le lien » 2008 – D. Figarella-Branger


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2009 La tumorothèque de l’Assistance Publique des hôpitaux de Marseille. Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » – Octobre 2009

2010 Lettre d’information POLA n°1 – Mars 2010

2011 Lettre d’information POLA n°2 – Mars 2011

2012 Présentation du Cancéropôle PACA et des tumorothèques PACA, par le biais du film « Du bloc opératoire au laboratoire, chronique d’un échantillon biologique » : http://vimeo.com/44252496. Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°7 – Octobre 2012

2013 Lettre d’information POLA n°3 – 2013 Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°8 – Octobre 2013

2014 Lettre d’information POLA n°4 – Novembre 2014 Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°9 – Octobre 2014

2015 Lettre d’information POLA n°5 – Novembre 2015 3. Site Web, plaquettes d’informations grand public - Site Web du cancéropôle PACA : http://canceropole-paca.com/ - Site Web de l’AP-HM volet recherche - Site Web de l’ARTC-Sud : http://www.artcsud.fr/ lien vers la tumorothèque dans l’onglet

Recherche - Site Web de la Base Clinico-Biologique de Glioblastomes (BCB-G) : http://www.french-

glioblastoma-biobank.com/ - Information sur la tumorothèque dans le dossier patient AP-HM - Plaquettes éditées par le cancéropôle PACA :

« La conservation d’échantillons biologiques provenant d’individus suspects ou atteints de cancer : un effort collectif au service des malades et de la science. » « The virtual PACA tumour bank: a catalogue of biological collections held within the canceropole PACA. » « Le patient, acteur de la recherche en cancérologie. »

- Réalisation du film « Du bloc opératoire au laboratoire, chronique d’un échantillon biologique »

- Rapports d’activités INCa-DGOS - De 2010 à 2014, la tumorothèque de l’AP-HM a fourni à l’INCa un rapport d’activité.


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- En 2014, la DGOS a adressé à l’AP-HM un questionnaire concernant les CRB en vu de l’établissement des subventions MERRI. Une réponse commune a été adressée à la DGOS concernant ce questionnaire (cf infra).

4. Manifestations scientifiques

• Congrès

2006 Tumorothèque et CRB Société française de neuropathologie – Mars 2006 – D. Figarella-Branger

2008 Chabannon C, Figarella-Branger D, Martin PM, Hofman P, Birtwisle-Peyrotte I, Romain S, Achache K, Honstettre A, Daufresne LM, Mery O, Bordonne O, Bonnetaud C, Ducord C, Vaglio P, Jacotot L, D’Arnoux C, Atger V. The Canceropole PACA: Virtual tumor bank.International Cancer Genome Consortium-15-17 Novembre 2008 – Bethesda – USA

2009 Journée intercancéropôle PACA et GSO Les tumorothèques des ressources biologiques indispensables à la recherche. Quels enjeux ? Quelles contraintes ? – Montpellier 12 mai 2009 Format d’échanges des informations entre tumorothèques : une brève histoire – C. Chabannon

2011 Le Club des utilisateurs de l’outil Modul-Bio, le 15 Novembre 2011 (en parallèle du symposium "Les collections biologiques un enjeu structurant dans les Cancéropôles", 15-16 nov. 2011)

2012 Groupe de Travail Tumorothèques - Cancéropôle PACA, le 25 Juin 2012

2015 11èmes journées Cancéropôle GSO, les 5 et 6 novembre 2015. Tables rondes : Bases de données clinicobiologiques : enjeux et perspectives des différentes BCB du GSO, BCB Glioblastomes – Luc BAUCHET, CHU, Montpellier

• Publications

2006

1 Chabannon C, Lassailly F, Romain S, Xerri L, Bonavita MJ, Atger V, Bernard JP, Maraninchi D, Figarella-Branger D, Martin PM. [The consortium of Biological Resource Centres (BRC) and tumour cell and tissue banks in the Marseilles metropolitan area]. Med Sci (Paris) 2006; 22 Spec No 1: 26-31 2 Figarella-Branger D, Colin C, Chinot O, Nanni I, Baeza N, Fina F, Tong S, Eudes N, Quilichini B, Romain S, Metellus P, Fuentes S, Barrie M, Boucard C, Fraslon C, Bonavita MJ, Martin PM, Ouafik L. [AP-HM tumour tissue bank: molecular signature of gliomas]. Med Sci (Paris) 2006; 22 Spec No 1: 54-9


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2009 3 Delplanque D, Birraux G, Bertoye PH, Postaire E, et les participants à la table ronde n°7 de Giens XXIV. Collections d’échantillons biologiques humains à visée scientifique. Pourquoi et comment clarifier la réglementation actuelle ? Thérapie 2009 ; 64 (3) : 215-24

2010 4 Chabannon C, Honstettre A, Daufresne LM, Martin PM, Bonnetaud C, Birtwisle-Peyrottes I, Romain S, Achache K, Mery O, Bordonne O, Ducord C, Jacotot L, Vaglio P, d'Arnoux C, Figarella-Branger D, Hofman P, Borg JP, Atger V. [Publication of biological samples collections catalogues by tumor banks]. Bull Cancer 2010; 97: 181-9 5 Hofman V, Bonnetaud C, Gaziello MC, Ilie M, Lassalle S, Butori C, Lerda N, Selva E, Gavric-Tanga V, Castillo L, Guevara N, Santini J, Pop D, Venissac N, Mouroux J, Chabannon C, Hofman P. [The Nice CHU biobank experience to collect patients' informed consent for research context (2004-2009)]. Ann Pathol 2010; 30: 337-43

2011 6 Lassalle S, Hofman V, Ilie M, Butori C, Bonnetaud C, Gaziello MC, Selva E, Gavric-Tanga V, Guevara N, Castillo L, Santini J, Chabannon C, Hofman P. Setting up a Prospective Thyroid Biobank for Translational Research: Practical Approach of a Single Institution (2004-2009, Pasteur Hospital, Nice, France). Biopreserv Biobank 2011; 9: 9-19 7 Chabannon C, Doran P, Hofman P, Seberg O, Cinotti S, Bledsoe M, Deigner HP, Koschorreck J, Dagher G, Cooreman A, De Blasio P, Riegman P, Hewitt R. Annual Conferences of the European, Middle Eastern and African Society for Biopreservation and Biobanking (ESBB): overview of 2011 and preview of 2012. Biopreserv Biobank 2012; 10: 407-15

2012 8 Hofman V, Gaziello MC, Bonnetaud C, Ilie M, Mauro V, Long E, Selva E, Gavric-Tanga V, Lassalle S, Butori C, Papin-Michaud C, Lerda N, Bordone O, Coelle C, Sabourin JC, Chabannon C, Hofman P. [Setting up indicators in biobanking: why and how?]. Ann Pathol 2012; 32: 91-101 9 Pellegrini I, Chabannon C, Mancini J, Viret F, Vey N, Julian-Reynier C. Contributing to research via biobanks: what it means to cancer patients. Health Expect 2012; 17: 523-33

2013 10 Hofman V, Ilie M, Long E, Washetine K, Chabannon C, Figarella-Branger D, Clement B, Mabile L, Cambon-Thomsen A, Boucher P, Dagher G, Hewitt R, Parodi B, Hofman P. Measuring the contribution of tumor biobanks to research in oncology: surrogate indicators and bibliographic output. Biopreserv Biobank 2013; 11: 235-44 11 Lawlor RT, Sluss PM, Langer R, Sughayer MA, Igbe MA, Siddiqui K, De Blasio P, Duma B, Mendy M, Chabannon C, Ibrahim M. European, Middle Eastern, and African


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Society for Biopreservation and Biobanking (ESBB). 2012 Conference Session on Biobanking in Emerging Countries. Biopreserv Biobank 2013; 11: 176-81

2014 12 Menei P, Figarella-Branger D, Bauchet L, Loiseau H, Denyset M, Roman T, Dehais C, Delattre JY. French research infrastructures to develop and validate glioma biomarkers. Neurosurgery 2014; 75: E195-6

2018 13 Mariette C, Renaud F, Piessen G, Gele P, Copin MC, Leteurtre E, Delaeter C, Dib M, Clisant S, Harter V, Bonnetain F, Duhamel A, Christophe V, Adenis A; Fregat Working Group. The FREGAT biobank: a clinico-biological database dedicated to esophageal and gastric cancers. BMC Cancer. 2018 Feb 6;18(1):139. 14 Rutkowski S, Modena P, Williamson D, Kerl K, Nysom K, Pizer B, Bartels U, Puget S, Doz F, Michalski A, von Hoff K, Chevignard M, Avula S, Murray MJ, Schönberger S, Czech T, Schouten-van Meeteren AYN, Kordes U, Kramm CM, van Vuurden DG, Hulleman E, Janssens GO, Solanki GA, van Veelen MC, Thomale U, Schuhmann MU, Jones C, Giangaspero F, Figarella-Branger D, Pietsch T, Clifford SC, Pfister SM, Van Gool SW. Biological material collection to advance translational research and treatment of children with CNS tumours: position paper from the SIOPE Brain Tumour Group. Lancet Oncol. 2018 Aug;19(8):e419-e428. 15 Canivet C, Gourgou-Bourgade S, Napoléon B, Palazzo L, Flori N, Guibert P, Piessen G, Farges-Bancel D, Seitz JF, Assenat E, Vendrely V, Truant S, Vanbiervliet G, Berthelémy P, Garcia S, Gomez-Brouchet A, Buscail L, Bournet B; BACAP Consortium. A prospective clinical and biological database for pancreatic adenocarcinoma: the BACAP cohort. BMC Cancer. 2018 Oct 16;18(1):986.


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Participation de la tumorothèque de l’AP-HM à des réseaux de soins ou à des projets multicentriques II – Publications réalisées avec les ressources biologiques de l’AP-HM - La (les) section(s) de la publication dans la(les)quelle(s) le CRB est cité est (sont)

précisée(s) en italique, entre parenthèses. Si le CRB n’est pas mentionné, cela est indiqué par un astérisque (*) .

- L’impact factor (IF) pour les années 2008-2015 est donné en gras entre crochets. Pour les années suivantes l’IF correspond à l’année de publication.

1. Banque de muscles A noter que certaines publications sont issues au départ d’analyses réalisées dans le cadre du sanitaire, d’autres sont issues de cessions réalisées dans le cadre de la recheche.

2008 1 Amati-Bonneau P, Valentino ML, Reynier P, Gallardo ME, Bornstein B, Boissiere A, Campos Y, Rivera H, de la Aleja JG, Carroccia R, Iommarini L, Labauge P, Figarella-Branger D, Marcorelles P, Furby A, Beauvais K, Letournel F, Liguori R, La Morgia C, Montagna P, Liguori M, Zanna C, Rugolo M, Cossarizza A, Wissinger B, Verny C, Schwarzenbacher R, Martin MA, Arenas J, Ayuso C, Garesse R, Lenaers G, Bonneau D, Carelli V. OPA1 mutations induce mitochondrial DNA instability and optic atrophy 'plus' phenotypes. Brain 2008; 131: 338-51 (*) [IF : 9.196] 2 Schleinitz N, Cognet C, Guia S, Laugier-Anfossi F, Baratin M, Pouget J, Pelissier JF, Harle JR, Vivier E, Figarella-Branger D. Expression of the CD85j (leukocyte Ig-like receptor 1, Ig-like transcript 2) receptor for class I major histocompatibility complex molecules in idiopathic inflammatory myopathies. Arthritis Rheum 2008; 58: 3216-23 (*) [IF : 7.764]

2009 3 De Paula AM, Franques J, Fernandez C, Monnier N, Lunardi J, Pellissier JF, Figarella-Branger D, Pouget J. A TPM3 mutation causing cap myopathy. Neuromuscul Disord 2009; 19: 685-8 (*) [IF : 2.638] 4 Krahn M, Beroud C, Labelle V, Nguyen K, Bernard R, Bassez G, Figarella-Branger D, Fernandez C, Bouvenot J, Richard I, Ollagnon-Roman E, Bevilacqua JA, Salvo E, Attarian S, Chapon F, Pellissier JF, Pouget J, Hammouda el H, Laforet P, Urtizberea JA, Eymard B, Leturcq F, Levy N. Analysis of the DYSF mutational spectrum in a large cohort of patients. Hum Mutat 2009; 30: E345-75 (*) [IF : 5.34]

2010 5 Claeys KG, Pellissier JF, Garcia-Bragado F, Weis J, Urtizberea A, Poza JJ, Cobo AM, Stoltenburg G, Figarella-Branger D, Willems PJ, Depuydt CE, Kleiner W, Pouget J, Piraud M, Brochier G, Romero NB, Fardeau M, Goebel HH, Bonnemann CG, Voit T, Eymard B,


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Laforet P. Myopathy with hexagonally cross-linked crystalloid inclusions: delineation of a clinico-pathological entity. Neuromuscul Disord 2010; 20: 701-8 (*) [IF : 2.638] 6 Fernandez C, Halbert C, De Paula AM, Lacroze V, Froissart R, Figarella-Branger D, Chabrol B, Pellissier JF. Non-lethal neonatal neuromuscular variant of glycogenosis type IV with novel GBE1 mutations. Muscle Nerve 2010; 41: 269-71 (*) [IF : 2.283]

2011 7 Lehtokari VL, Pelin K, Herczegfalvi A, Karcagi V, Pouget J, Franques J, Pellissier JF, Figarella-Branger D, von der Hagen M, Huebner A, Schoser B, Lochmuller H, Wallgren-Pettersson C. Nemaline myopathy caused by mutations in the nebulin gene may present as a distal myopathy. Neuromuscul Disord 2011; 21: 556-62 (*) [IF : 2.638]

2012 8 De Paula AM, Bartoli M, Courrier S, Pouget J, Levy N, Pellissier JF, Figarella-Branger D, Krahn M, Attarian S. Further heterogeneity in myopathy with tubular aggregates? Muscle Nerve 2012; 46: 984-5 (*) [IF : 2.283]

2013 9 Bohm J, Chevessier F, Maues De Paula A, Koch C, Attarian S, Feger C, Hantai D, Laforet P, Ghorab K, Vallat JM, Fardeau M, Figarella-Branger D, Pouget J, Romero NB, Koch M, Ebel C, Levy N, Krahn M, Eymard B, Bartoli M, Laporte J. Constitutive activation of the calcium sensor STIM1 causes tubular-aggregate myopathy. Am J Hum Genet 2013; 92: 271-8 (*) [IF : 10.931] 10 Ebbo M, Chagnaud C, Figarella-Branger D, Legall S, Harle JR, Schleinitz N. Antisynthethase syndrome presenting as peripheral limb fasciitis. Joint Bone Spine 2013; 80: 528-30 (*) [IF : 2.901] 11 Fernandez C, Bardin N, De Paula AM, Salort-Campana E, Benyamine A, Franques J, Schleinitz N, Weiller PJ, Pouget J, Pellissier JF, Figarella-Branger D. Correlation of clinicoserologic and pathologic classifications of inflammatory myopathies: study of 178 cases and guidelines for diagnosis. Medicine (Baltimore) 2013; 92: 15-24 (*) [IF : 4.256] 12 Malfatti E, Olive M, Taratuto AL, Richard P, Brochier G, Bitoun M, Gueneau L, Laforet P, Stojkovic T, Maisonobe T, Monges S, Lubieniecki F, Vasquez G, Streichenberger N, Lacene E, Saccoliti M, Prudhon B, Alexianu M, Figarella-Branger D, Schessl J, Bonnemann C, Eymard B, Fardeau M, Bonne G, Romero NB. Skeletal muscle biopsy analysis in reducing body myopathy and other FHL1-related disorders. J Neuropathol Exp Neurol 2013; 72: 833-45 (*) [IF : 3.797] 13 Mercier S, Kury S, Shaboodien G, Houniet DT, Khumalo NP, Bou-Hanna C, Bodak N, Cormier-Daire V, David A, Faivre L, Figarella-Branger D, Gherardi RK, Glen E, Hamel A, Laboisse C, Le Caignec C, Lindenbaum P, Magot A, Munnich A, Mussini JM, Pillay K, Rahman T, Redon R, Salort-Campana E, Santibanez-Koref M, Thauvin C, Barbarot S, Keavney B, Bezieau S, Mayosi BM. Mutations in FAM111B cause hereditary fibrosing poikiloderma with tendon contracture, myopathy, and pulmonary fibrosis. Am J Hum Genet 2014; 93: 1100-7 (*) [IF : 10.931]


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2014

14 Sevy A, Cerino M, Gorokhova S, Dionnet E, Mathieu Y, Verschueren A, Franques J, Maues de Paula A, Figarella-Branger D, Lagarde A, Desvignes JP, Béroud C, Attarian S, Levy N, Bartoli M, Krahn M, Campana-Salort E, Pouget J. Improving molecular diagnosis of distal myopathies by targeted next-generation sequencing. J Neurol Neurosurg Psychiatry 2015; 87: 340-42 (*) [IF: 6.807] 2. Tumorothèque

2008 1 Acunzo J, Thirion S, Roche C, Saveanu A, Gunz G, Germanetti AL, Couderc B, Cohen R, Figarella-Branger D, Dufour H, Brue T, Enjalbert A, Barlier A. Somatostatin receptor sst2 decreases cell viability and hormonal hypersecretion and reverses octreotide resistance of human pituitary adenomas. Cancer Res 2008; 68: 10163-70 (*) [IF : 9.329] 2 Fevre-Montange M, Szathmari A, Champier J, Mokhtari K, Chretien F, Coulon A, Figarella-Branger D, Polivka M, Varlet P, Uro-Coste E, Fauchon F, Jouvet A. Pineocytoma and pineal parenchymal tumors of intermediate differentiation presenting cytologic pleomorphism: a multicenter study. Brain Pathol 2008; 18: 354-9 (*) [IF : 4.643] 3 Metellus P, Figarella-Branger D, Guyotat J, Barrie M, Giorgi R, Jouvet A, Chinot O. Supratentorial ependymomas: prognostic factors and outcome analysis in a retrospective series of 46 adult patients. Cancer 2008; 113: 175-85 (Matériel et Méthodes) [IF : 5.068] 4 Metellus P, Nanni I, Dussert C, Trinkhaus M, Fuentes S, Chinot O, Ouafik LH, Fina F, Dufour H, Figarella-Branger D, Grisoli F, Lah TT, Martin PM. [Prognostic implications of biologic markers in intracranial meningiomas: 120 cases]. Neurochirurgie 2008; 54: 750-6 (*)

[IF : 0.406] 5 Trouillas J, Labat-Moleur F, Sturm N, Kujas M, Heymann MF, Figarella-Branger D, Patey M, Mazucca M, Decullier E, Verges B, Chabre O, Calender A. Pituitary tumors and hyperplasia in multiple endocrine neoplasia type 1 syndrome (MEN1): a case-control study in a series of 77 patients versus 2509 non-MEN1 patients. Am J Surg Pathol 2008; 32: 534-43(*)

[IF : 4.592]

2009 6 Aubert S, Wendling F, Regis J, McGonigal A, Figarella-Branger D, Peragut JC, Girard N, Chauvel P, Bartolomei F. Local and remote epileptogenicity in focal cortical dysplasias and neurodevelopmental tumours. Brain 2009; 132: 3072-86 (*) [IF : 9.196] 7 Barlesi F, Nanni-Metellus I, Breen D, Fina F, Astoul P, Martin PM. Non-small cell lung cancer-smokers or non-smokers, does it matter? Lung Cancer 2009; 63: 430-2 (*)

[IF : 3.958] 8 Colin C, Voutsinos-Porche B, Nanni I, Fina F, Metellus P, Intagliata D, Baeza N, Bouvier C, Delfino C, Loundou A, Chinot O, Lah T, Kos J, Martin PM, Ouafik L, Figarella-


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Branger D. High expression of cathepsin B and plasminogen activator inhibitor type-1 are strong predictors of survival in glioblastomas. Acta Neuropathol 2009; 118: 745-54 (Remerciements) [IF : 10.762] 9 Deville JL, Bartoli C, Berenguer C, Fernandez-Sauze S, Kaafarani I, Delfino C, Fina F, Salas S, Muracciole X, Mancini J, Lechevallier E, Martin PM, Figarella-Branger D, Ouafik L, Daniel L. Expression and role of adrenomedullin in renal tumors and value of its mRNA levels as prognostic factor in clear-cell renal carcinoma. Int J Cancer 2009; 125: 2307-15 (*)

[IF : 5.085] 10 Guyotat J, Metellus P, Giorgi R, Barrie M, Jouvet A, Fevre-Montange M, Chinot O, Durand A, Figarella-Branger D. Infratentorial ependymomas: prognostic factors and outcome analysis in a multi-center retrospective series of 106 adult patients. Acta Neurochir (Wien) 2009; 151: 947-60 (*) [IF : 1.766] 11 Metellus P, Coulibaly B, Nanni I, Fina F, Eudes N, Giorgi R, Barrie M, Chinot O, Fuentes S, Dufour H, Ouafik L, Figarella-Branger D. Prognostic impact of O6-methylguanine-DNA methyltransferase silencing in patients with recurrent glioblastoma multiforme who undergo surgery and carmustine wafer implantation: a prospective patient cohort. Cancer 2009; 115: 4783-94 (*) [IF : 5.068] 12 Palm T, Figarella-Branger D, Chapon F, Lacroix C, Gray F, Scaravilli F, Ellison DW, Salmon I, Vikkula M, Godfraind C. Expression profiling of ependymomas unravels localization and tumor grade-specific tumorigenesis. Cancer 2009; 115: 3955-68 (*)

[IF : 5.068] 13 Salas S, Jezequel P, Campion L, Deville JL, Chibon F, Bartoli C, Gentet JC, Charbonnel C, Gouraud W, Voutsinos-Porche B, Brouchet A, Duffaud F, Figarella-Branger D, Bouvier C. Molecular characterization of the response to chemotherapy in conventional osteosarcomas: predictive value of HSD17B10 and IFITM2. Int J Cancer 2009; 125: 851-60 (Remerciements) [IF : 5.085] 14 Tchoghandjian A, Fernandez C, Colin C, El Ayachi I, Voutsinos-Porche B, Fina F, Scavarda D, Piercecchi-Marti MD, Intagliata D, Ouafik L, Fraslon-Vanhulle C, Figarella-Branger D. Pilocytic astrocytoma of the optic pathway: a tumour deriving from radial glia cells with a specific gene signature. Brain 2009; 132: 1523-35 (Matériel et Méthodes, Remerciements) [IF : 9.196]

2010 15 Amoureux MC, Coulibaly B, Chinot O, Loundou A, Metellus P, Rougon G, Figarella-Branger D. Polysialic acid neural cell adhesion molecule (PSA-NCAM) is an adverse prognosis factor in glioblastoma, and regulates olig2 expression in glioma cell lines. BMC Cancer 2010; 10: 91 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.36] 16 Bennani B, Gilles S, Fina F, Nanni I, Ibrahimi SA, Riffi AA, Nejjari C, Benajeh DA, El Abkari M, Martin PM, Ouafik L. Mutation analysis of BRAF exon 15 and KRAS codons 12 and 13 in Moroccan patients with colorectal cancer. Int J Biol Markers 2010; 25: 179-84 (*) [IF : 1.371] 17 Carpentier A, Metellus P, Ursu R, Zohar S, Lafitte F, Barrie M, Meng Y, Richard M, Parizot C, Laigle-Donadey F, Gorochov G, Psimaras D, Sanson M, Tibi A, Chinot O,


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Carpentier AF. Intracerebral administration of CpG oligonucleotide for patients with recurrent glioblastoma: a phase II study. Neuro Oncol 2010; 12: 401-8 (*) [IF : 6.776] 18 Coulibaly B, Nanni I, Quilichini B, Gaudart J, Metellus P, Fina F, Boucard C, Chinot O, Ouafik L, Figarella-Branger D. Epidermal growth factor receptor in glioblastomas: correlation between gene copy number and protein expression. Hum Pathol 2010; 41: 815-23 (Remerciements) [IF : 2.769] 19 Ducray F, de Reynies A, Chinot O, Idbaih A, Figarella-Branger D, Colin C, Karayan-Tapon L, Chneiweiss H, Wager M, Vallette F, Marie Y, Rickman D, Thomas E, Delattre JY, Honnorat J, Sanson M, Berger F. An ANOCEF genomic and transcriptomic microarray study of the response to radiotherapy or to alkylating first-line chemotherapy in glioblastoma patients. Mol Cancer 2010; 9: 234 (*) [IF : 4.257] 20 El Ayachi I, Baeza N, Fernandez C, Colin C, Scavarda D, Pesheva P, Figarella-Branger D. KIAA0510, the 3'-untranslated region of the tenascin-R gene, and tenascin-R are overexpressed in pilocytic astrocytomas. Neuropathol Appl Neurobiol 2010; 36: 399-410 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.927] 21 Lah TT, Nanni I, Trinkaus M, Metellus P, Dussert C, De Ridder L, Rajcevic U, Blejec A, Martin PM. Toward understanding recurrent meningioma: the potential role of lysosomal cysteine proteases and their inhibitors. J Neurosurg 2010; 112: 940-50 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.737] 22 Laigle-Donadey F, Figarella-Branger D, Chinot O, Taillandier L, Cartalat-Carel S, Honnorat J, Kaloshi G, Delattre JY, Sanson M. Up-front temozolomide in elderly patients with glioblastoma. J Neurooncol 2010; 99: 89-94 (*) [IF : 3.070] 23 Metellus P, Guyotat J, Chinot O, Durand A, Barrie M, Giorgi R, Jouvet A, Figarella-Branger D. Adult intracranial WHO grade II ependymomas: long-term outcome and prognostic factor analysis in a series of 114 patients. Neuro Oncol 2010; 12: 976-84 (*)

[IF : 6.776] 24 Metellus P, Coulibaly B, Colin C, de Paula AM, Vasiljevic A, Taieb D, Barlier A, Boisselier B, Mokhtari K, Wang XW, Loundou A, Chapon F, Pineau S, Ouafik L, Chinot O, Figarella-Branger D. Absence of IDH mutation identifies a novel radiologic and molecular subtype of WHO grade II gliomas with dismal prognosis. Acta Neuropathol 2010; 120: 719-29 (Matériel et Méthodes) [IF : 10.762] 25 Raverot G, Wierinckx A, Dantony E, Auger C, Chapas G, Villeneuve L, Brue T, Figarella-Branger D, Roy P, Jouanneau E, Jan M, Lachuer J, Trouillas J. Prognostic factors in prolactin pituitary tumors: clinical, histological, and molecular data from a series of 94 patients with a long postoperative follow-up. J Clin Endocrinol Metab 2010; 95: 1708-16 (*)

[IF : 6.209] 26 Raynaud S, Carbuccia N, Colin C, Adelaide J, Mozziconacci MJ, Metellus P, Chinot O, Birnbaum D, Chaffanet M, Figarella-Branger D. Absence of R140Q mutation of isocitrate dehydrogenase 2 in gliomas and breast cancers. Oncol Lett 2010; 1: 883-4 (Remerciements)

[IF : 1.554]


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27 Roussel-Gervais A, Bilodeau S, Vallette S, Berthelet F, Lacroix A, Figarella-Branger D, Brue T, Drouin J. Cooperation between cyclin E and p27(Kip1) in pituitary tumorigenesis. Mol Endocrinol 2010; 24: 1835-45 (*) [IF : 4.022] 28 Tchoghandjian A, Baeza N, Colin C, Cayre M, Metellus P, Beclin C, Ouafik L, Figarella-Branger D. A2B5 cells from human glioblastoma have cancer stem cell properties. Brain Pathol 2010; 20: 211-21 (*) [IF : 4.643]

2011 29 Acunzo J, Roche C, Defilles C, Thirion S, Quentien MH, Figarella-Branger D, Graillon T, Dufour H, Brue T, Pellegrini I, Enjalbert A, Barlier A. Inactivation of PITX2 transcription factor induced apoptosis of gonadotroph tumoral cells. Endocrinology 2011; 152: 3884-92 (*) [IF : 4.503] 30 Bourdeaut F, Lequin D, Brugieres L, Reynaud S, Dufour C, Doz F, Andre N, Stephan JL, Perel Y, Oberlin O, Orbach D, Bergeron C, Rialland X, Freneaux P, Ranchere D, Figarella-Branger D, Audry G, Puget S, Evans DG, Pinas JC, Capra V, Mosseri V, Coupier I, Gauthier-Villars M, Pierron G, Delattre O. Frequent hSNF5/INI1 germline mutations in patients with rhabdoid tumor. Clin Cancer Res 2011; 17: 31-8 (*) [IF : 8.722] 31 Dahan L, Norguet E, Etienne-Grimaldi MC, Formento JL, Gasmi M, Nanni I, Gaudart J, Garcia S, Ouafik L, Seitz JF, Milano G. Pharmacogenetic profiling and cetuximab outcome in patients with advanced colorectal cancer. BMC Cancer 2011; 11: 496 (Remerciements) [IF : 3.36] 32 Dujardin F, Binh MB, Bouvier C, Gomez-Brouchet A, Larousserie F, Muret A, Louis-Brennetot C, Aurias A, Coindre JM, Guillou L, Pedeutour F, Duval H, Collin C, de Pinieux G. MDM2 and CDK4 immunohistochemistry is a valuable tool in the differential diagnosis of low-grade osteosarcomas and other primary fibro-osseous lesions of the bone. Mod Pathol 2011; 24: 624-37 (*) [IF : 6.187] 33 Figarella-Branger D, Maues de Paula A, Colin C, Bouvier C. Histomolecular classification of adult diffuse gliomas: the diagnostic value of immunohistochemical markers. Rev Neurol (Paris) 2011; 167: 683-90 (*) [IF : 0.663] 34 Mazouni C, Fina F, Romain S, Ouafik L, Bonnier P, Brandone JM, Martin PM. Epstein-Barr virus as a marker of biological aggressiveness in breast cancer. Br J Cancer 2011; 104: 332-7 (*) [IF : 4.836] 35 Metellus P, Nanni-Metellus I, Delfino C, Colin C, Tchogandjian A, Coulibaly B, Fina F, Loundou A, Barrie M, Chinot O, Ouafik L, Figarella-Branger D. Prognostic impact of CD133 mRNA expression in 48 glioblastoma patients treated with concomitant radiochemotherapy: a prospective patient cohort at a single institution. Ann Surg Oncol 2011; 18: 2937-45 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.93] 36 Metellus P, Colin C, Taieb D, Guedj E, Nanni-Metellus I, de Paula AM, Colavolpe C, Fuentes S, Dufour H, Barrie M, Chinot O, Ouafik L, Figarella-Branger D. IDH mutation status impact on in vivo hypoxia biomarkers expression: new insights from a clinical, nuclear imaging and immunohistochemical study in 33 glioma patients. J Neurooncol 2011; 105: 591-600 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.070]


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37 Metellus P, Voutsinos-Porche B, Nanni-Metellus I, Colin C, Fina F, Berenguer C, Dussault N, Boudouresque F, Loundou A, Intagliata D, Chinot O, Martin PM, Figarella-Branger D, Ouafik L. Adrenomedullin expression and regulation in human glioblastoma, cultured human glioblastoma cell lines and pilocytic astrocytoma. Eur J Cancer 2011; 47: 1727-35 (Remerciements) [IF : 5.417]

2012 38 Badiali M, Gleize V, Paris S, Moi L, Elhouadani S, Arcella A, Morace R, Antonelli M, Buttarelli FR, Figarella-Branger D, Kim YH, Ohgaki H, Mokhtari K, Sanson M, Giangaspero F. KIAA1549-BRAF fusions and IDH mutations can coexist in diffuse gliomas of adults. Brain Pathol 2012; 22: 841-7 (Matériel et Méthodes) [IF : 4.643] 39 Bouvier C, Metellus P, de Paula AM, Vasiljevic A, Jouvet A, Guyotat J, Mokhtari K, Varlet P, Dufour H, Figarella-Branger D. Solitary fibrous tumors and hemangiopericytomas of the meninges: overlapping pathological features and common prognostic factors suggest the same spectrum of tumors. Brain Pathol 2012; 22: 511-21 (*) [IF : 4.643] 40 Budry L, Balsalobre A, Gauthier Y, Khetchoumian K, L'Honore A, Vallette S, Brue T, Figarella-Branger D, Meij B, Drouin J. The selector gene Pax7 dictates alternate pituitary cell fates through its pioneer action on chromatin remodeling. Genes Dev 2012; 26: 2299-310 (*)

[IF : 10.798]

41 Colavolpe C, Chinot O, Metellus P, Mancini J, Barrie M, Bequet-Boucard C, Tabouret E, Mundler O, Figarella-Branger D, Guedj E. FDG-PET predicts survival in recurrent high-grade gliomas treated with bevacizumab and irinotecan. Neuro Oncol 2012; 14: 649-57 (*)

[IF : 6.776] 42 Cuny T, Mohamed A, Graillon T, Roche C, Defilles C, Germanetti AL, Couderc B, Figarella-Branger D, Enjalbert A, Barlier A, Saveanu A. Somatostatin receptor sst2 gene transfer in human prolactinomas in vitro: impact on sensitivity to dopamine, somatostatin and dopastatin, in the control of prolactin secretion. Mol Cell Endocrinol 2012; 355: 106-13 (*)

[IF : 4.405] 43 Fevre Montange M, Vasiljevic A, Bergemer Fouquet AM, Bernier M, Champier J, Chretien F, Figarella-Branger D, Kemeny JL, Lechapt-Zalcman E, Michalak S, Miquel C, Mokthari K, Pommepuy I, Quintin Roue I, Rousseau A, Saint-Pierre G, Salon C, Uro-Coste E, Varlet P, Kratzer I, Ghersi-Egea JF, Jouvet A. Histopathologic and ultrastructural features and claudin expression in papillary tumors of the pineal region: a multicenter analysis. Am J Surg Pathol 2012; 36: 916-28 (Matériel et Méthodes) [IF : 4.592] 44 Fevre-Montange M, Vasiljevic A, Frappaz D, Champier J, Szathmari A, Aubriot Lorton MH, Chapon F, Coulon A, Quintin Roue I, Delisle MB, Figarella-Branger D, Laquerriere A, Miquel C, Michiels JF, Peoch M, Polivka M, Fauchon F, Jouvet A. Utility of Ki67 immunostaining in the grading of pineal parenchymal tumours: a multicentre study. Neuropathol Appl Neurobiol 2012; 38: 87-94 (*) [IF : 3.927] 45 Figarella-Branger D, Bouvier C, de Paula AM, Mokhtari K, Colin C, Loundou A, Chinot O, Metellus P. Molecular genetics of adult grade II gliomas: towards a comprehensive


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tumor classification system. J Neurooncol 2012; 110: 205-13 (Matériel et Méthodes, Remerciements) [IF : 3.070] 46 Gonzalez-Aguilar A, Idbaih A, Boisselier B, Habbita N, Rossetto M, Laurenge A, Bruno A, Jouvet A, Polivka M, Adam C, Figarella-Branger D, Miquel C, Vital A, Ghesquieres H, Gressin R, Delwail V, Taillandier L, Chinot O, Soubeyran P, Gyan E, Choquet S, Houillier C, Soussain C, Tanguy ML, Marie Y, Mokhtari K, Hoang-Xuan K. Recurrent mutations of MYD88 and TBL1XR1 in primary central nervous system lymphomas. Clin Cancer Res 2012; 18: 5203-11 (*) [IF : 8.722] 47 Idbaih A, Ducray F, Dehais C, Courdy C, Carpentier C, de Bernard S, Uro-Coste E, Mokhtari K, Jouvet A, Honnorat J, Chinot O, Ramirez C, Beauchesne P, Benouaich-Amiel A, Godard J, Eimer S, Parker F, Lechapt-Zalcman E, Colin P, Loussouarn D, Faillot T, Dam-Hieu P, Elouadhani-Hamdi S, Bauchet L, Langlois O, Le Guerinel C, Fontaine D, Vauleon E, Menei P, Fotso MJ, Desenclos C, Verrelle P, Ghiringhelli F, Noel G, Labrousse F, Carpentier A, Dhermain F, Delattre JY, Figarella-Branger D. SNP array analysis reveals novel genomic abnormalities including copy neutral loss of heterozygosity in anaplastic oligodendrogliomas. PLoS One 2012; 7: e45950 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.234] 48 Lannering B, Rutkowski S, Doz F, Pizer B, Gustafsson G, Navajas A, Massimino M, Reddingius R, Benesch M, Carrie C, Taylor R, Gandola L, Bjork-Eriksson T, Giralt J, Oldenburger F, Pietsch T, Figarella-Branger D, Robson K, Forni M, Clifford SC, Warmuth-Metz M, von Hoff K, Faldum A, Mosseri V, Kortmann R. Hyperfractionated versus conventional radiotherapy followed by chemotherapy in standard-risk medulloblastoma: results from the randomized multicenter HIT-SIOP PNET 4 trial. J Clin Oncol 2012; 30: 3187-93 (*) [IF : 18.428] 49 Metellus P, Figarella-Branger D. Magnetic resonance metabolic imaging of glioma. Sci Transl Med 2012; 4: 116ps1 (*) [IF : 15.843] 50 Padovani L, Colin C, Fernandez C, Maues de Paula A, Mercurio S, Scavarda D, Frassineti F, Adelaide J, Loundou A, Intagliata D, Bouvier C, Lena G, Birnbaum D, Girard N, Figarella-Branger D. Search for distinctive markers in DNT and cortical grade II glioma in children: same clinicopathological and molecular entities? Curr Top Med Chem 2012; 12: 1683-92 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.402] 51 Quillien V, Lavenu A, Karayan-Tapon L, Carpentier C, Labussiere M, Lesimple T, Chinot O, Wager M, Honnorat J, Saikali S, Fina F, Sanson M, Figarella-Branger D. Comparative assessment of 5 methods (methylation-specific polymerase chain reaction, MethyLight, pyrosequencing, methylation-sensitive high-resolution melting, and immunohistochemistry) to analyze O6-methylguanine-DNA-methyltranferase in a series of 100 glioblastoma patients. Cancer 2012; 118: 4201-11 (Remerciements) [IF : 5.068] 52 Tchoghandjian A, Baeza-Kallee N, Beclin C, Metellus P, Colin C, Ducray F, Adelaide J, Rougon G, Figarella-Branger D. Cortical and subventricular zone glioblastoma-derived stem-like cells display different molecular profiles and differential in vitro and in vivo properties. Ann Surg Oncol 2012; 19 Suppl 3: S608-19 (Remerciements) [IF : 3.93] 53 Vasiljevic A, Francois P, Loundou A, Fevre-Montange M, Jouvet A, Roche PH, Figarella-Branger D. Prognostic factors in central neurocytomas: a multicenter study of 71 cases. Am J Surg Pathol 2012; 36: 220-7 (Matériel et Méthodes) [IF : 4.592]


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54 Vasiljevic A, Champier J, Figarella-Branger D, Wierinckx A, Jouvet A, Fevre-Montange M. Molecular characterization of central neurocytomas: potential markers for tumor typing and progression. Neuropathology 2012; 33: 149-61 (Matériel et Méthodes) [IF : 1.651]

2013 55 Berenguer-Daize C, Boudouresque F, Bastide C, Tounsi A, Benyahia Z, Acunzo J, Dussault N, Delfino C, Baeza N, Daniel L, Cayol M, Rossi D, El Battari A, Bertin D, Mabrouk K, Martin PM, Ouafik L. Adrenomedullin blockade suppresses growth of human hormone-independent prostate tumor xenograft in mice. Clin Cancer Res 2013; 19: 6138-50 (Matériel et Méthodes) [IF : 8.722] 56 Bertucci F, Bouvier-Labit C, Finetti P, Adelaide J, Metellus P, Mokhtari K, Decouvelaere AV, Miquel C, Jouvet A, Figarella-Branger D, Pedeutour F, Chaffanet M, Birnbaum D. Comprehensive genome characterization of solitary fibrous tumors using high-resolution array-based comparative genomic hybridization. Genes Chromosomes Cancer 2013; 52: 156-64 (*) [IF : 4.041] 57 Bertucci F, Bouvier-Labit C, Finetti P, Metellus P, Adelaide J, Mokhtari K, Figarella-Branger D, Decouvelaere AV, Miquel C, Coindre JM, Birnbaum D. Gene expression profiling of solitary fibrous tumors. PLoS One 2013; 8: e64497 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.234] 58 Bourdeaut F, Grison C, Maurage CA, Laquerriere A, Vasiljevic A, Delisle MB, Michalak S, Figarella-Branger D, Doz F, Richer W, Pierron G, Miquel C, Delattre O, Couturier J. MYC and MYCN amplification can be reliably assessed by aCGH in medulloblastoma. Cancer Genet 2013; 206: 124-9 (*) [IF : 2.975] 59 Bouvier C, Bertucci F, Metellus P, Finetti P, Maues de Paula A, Forest F, Mokhtari K, Miquel C, Birnbaum D, Vasiljevic A, Jouvet A, Coindre JM, Loundou A, Figarella-Branger D. ALDH1 is an immunohistochemical diagnostic marker for solitary fibrous tumours and haemangiopericytomas of the meninges emerging from gene profiling study. Acta Neuropathol Commun 2013; 1: 10 (Affiliations, Matériel et Méthodes) [IF : /] 60 Chappe C, Padovani L, Scavarda D, Forest F, Nanni-Metellus I, Loundou A, Mercurio S, Fina F, Lena G, Colin C, Figarella-Branger D. Dysembryoplastic neuroepithelial tumors share with pleomorphic xanthoastrocytomas and gangliogliomas BRAF(V600E) mutation and expression. Brain Pathol 2013; 23: 574-83 (Affiliations, Matériel et Méthodes, Remerciements) [IF : 4.643] 61 Colin C, Padovani L, Chappe C, Mercurio S, Scavarda D, Loundou A, Frassineti F, Andre N, Bouvier C, Korshunov A, Lena G, Figarella-Branger D. Outcome analysis of childhood pilocytic astrocytomas: a retrospective study of 148 cases at a single institution. Neuropathol Appl Neurobiol 2013; 39: 693-705 (Affiliations, Matériel et Méthodes, Remerciements) [IF : 3.927] 62 Duntze J, Litre CF, Eap C, Theret E, Debreuve A, Jovenin N, Lechapt-Zalcman E, Metellus P, Colin P, Guillamo JS, Emery E, Menei P, Rousseaux P, Peruzzi P. Implanted carmustine wafers followed by concomitant radiochemotherapy to treat newly diagnosed malignant gliomas: prospective, observational, multicenter study on 92 cases. Ann Surg


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Oncol 2013; 20: 2065-72 (*) [IF : 3.93] 63 Fellah S, Caudal D, De Paula AM, Dory-Lautrec P, Figarella-Branger D, Chinot O, Metellus P, Cozzone PJ, Confort-Gouny S, Ghattas B, Callot V, Girard N. Multimodal MR imaging (diffusion, perfusion, and spectroscopy): is it possible to distinguish oligodendroglial tumor grade and 1p/19q codeletion in the pretherapeutic diagnosis? AJNR Am J Neuroradiol 2013; 34: 1326-33 (*) [IF : 3.589] 64 Figarella-Branger D, Chappe C, Padovani L, Mercurio S, Colin C, Forest F, Bouvier C. [Glial and glioneuronal tumors in adults and children: main genetic alterations and towards a histomolecular classification]. Bull Cancer 2013; 100: 715-26 (*) [IF : 0.604] 65 Jaffrain-Rea ML, Rotondi S, Turchi A, Occhi G, Barlier A, Peverelli E, Rostomyan L, Defilles C, Angelini M, Oliva MA, Ceccato F, Maiorani O, Daly AF, Esposito V, Buttarelli F, Figarella-Branger D, Giangaspero F, Spada A, Scaroni C, Alesse E, Beckers A. Somatostatin analogues increase AIP expression in somatotropinomas, irrespective of Gsp mutations. Endocr Relat Cancer 2013; 20: 753-66 (*) [IF : 4.805] 66 Joubert C, Dagain A, Faivre A, Nguyen AT, Fesselet J, Figarella-Branger D. [Intracranial Rosai-Dorfman disease mimicking multiple meningiomas]. Rev Med Brux 2013; 34: 112-4 (*) [IF: /] 67 Mercurio S, Padovani L, Colin C, Carre M, Tchoghandjian A, Scavarda D, Lambert S, Baeza-Kallee N, Fernandez C, Chappe C, Andre N, Figarella-Branger D. Evidence for new targets and synergistic effect of metronomic celecoxib/fluvastatin combination in pilocytic astrocytoma. Acta Neuropathol Commun 2013; 1: 17 (Matériel et Méthodes, Remerciements) [IF : /] 68 Nouguerede E, Berenguer C, Garcia S, Bennani B, Delfino C, Nanni I, Dahan L, Gasmi M, Seitz JF, Martin PM, Ouafik L. Expression of adrenomedullin in human colorectal tumors and its role in cell growth and invasion in vitro and in xenograft growth in vivo. Cancer Med 2013; 2: 196-207 (Matériel et Méthodes) [IF : 2.5] 69 Raghunathan A, Wani K, Armstrong TS, Vera-Bolanos E, Fouladi M, Gilbertson R, Gajjar A, Goldman S, Lehman NL, Metellus P, Mikkelsen T, Necesito-Reyes MJ, Omuro A, Packer RJ, Partap S, Pollack IF, Prados MD, Robins HI, Soffietti R, Wu J, Miller CR, Gilbert MR, Aldape KD. Histological predictors of outcome in ependymoma are dependent on anatomic site within the central nervous system. Brain Pathol 2013; 23: 584-94 (*) [IF : 4.643] 70 Tabareau-Delalande F, Collin C, Gomez-Brouchet A, Decouvelaere AV, Bouvier C, Larousserie F, Marie B, Delfour C, Aubert S, Rosset P, de Muret A, Pages JC, de Pinieux G. Diagnostic value of investigating GNAS mutations in fibro-osseous lesions: a retrospective study of 91 cases of fibrous dysplasia and 40 other fibro-osseous lesions. Mod Pathol 2013; 26: 911-21 (*) [IF : 6.187] 71 Tabouret E, Metellus P, Tallet-Richard A, Figarella-Branger D, Charaffe-Jauffret E, Viens P, Goncalves A. Surgical resection of brain metastases from breast cancer in the modern era: clinical outcome and prognostic factors. Anticancer Res 2013; 33: 2159-67 (*) [IF : 1.826]


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72 Trouillas J, Roy P, Sturm N, Dantony E, Cortet-Rudelli C, Viennet G, Bonneville JF, Assaker R, Auger C, Brue T, Cornelius A, Dufour H, Jouanneau E, Francois P, Galland F, Mougel F, Chapuis F, Villeneuve L, Maurage CA, Figarella-Branger D, Raverot G, Barlier A, Bernier M, Bonnet F, Borson-Chazot F, Brassier G, Caulet-Maugendre S, Chabre O, Chanson P, Cottier JF, Delemer B, Delgrange E, Di Tommaso L, Eimer S, Gaillard S, Jan M, Girard JJ, Lapras V, Loiseau H, Passagia JG, Patey M, Penfornis A, Poirier JY, Perrin G, Tabarin A. A new prognostic clinicopathological classification of pituitary adenomas: a multicentric case-control study of 410 patients with 8 years post-operative follow-up. Acta Neuropathol 2013; 126: 123-35 (*) [IF : 10.762]

2014

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[IF : 6.776]

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[IF : 6.368]


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106 Figarella-Branger D, Lechapt-Zalcman E, Tabouret E, Jünger S, de Paula AM, Bouvier C, Colin C, Jouvet A, Forest F, Andreiuolo F, Quintin-Roue I, Machet MC, Heitzmann A, Milin S, Sevestre H, Godfraind C, Labrousse F, Metellus P, Scavarda D, Pietsch T. Supratentorial clear cell ependymomas with branching capillaries demonstrate characteristic clinicopathological features and pathological activation of nuclear factor-kappaB signaling. Neuro Oncol. 2016; 18:919-27 (Remerciements) [IF : 6.776] 107 Greillier L, Tounsi A, Berenguer-Daizé C, Dussault N, Delfino C, Benyahia Z, Cayol M, Mabrouk K, Garcia S, Martin PM, Barlesi F, Oufaik L. Functional analysis of the adrenomedullin pathway in malignant pleural mesothelioma. JTHO 2016; 11: 94-107 (Matériels et Méthodes) [IF : 5.282] 108 Guérin M, Thariat J, Ouali M, Bouvier C, Decouvelaere AV, Cassagnau E, Aubert S, Lepreux S, Coindre JM, Valmary-Degano S, Larousserie F, Meilleroux J, Projetti F, Stock N, Galant C, Marie B, Peyrottes I, de Pinieux G, Gomez-Brouchet A. A new subtype of high-grade mandibular osteosarcoma with RASAL1/MDM2 amplification. Hum Pathol. 2016; 50: 70-8 (Matériels et Méthodes) [IF : 5.282] 109 Kamoun A, Idbaih A, Dehais C, Elarouci N, Carpentier C, Letouzé E, Colin C, Mokhtari K, Jouvet A, Uro-Coste E, Martin-Duverneuil N, Sanson M, Delattre JY, Figarella-Branger D, de Reyniès A, Ducray F; POLA network. Integrated multi-omics analysis of oligodendroglial tumours identifies three subgroups of 1p/19q co-deleted gliomas. Nat Commun. 2016; 7: 112-63 (Remerciements) [IF : 11.470] 110 Macagno N, Figarella-Branger D, Mokthari K, Metellus P, Jouvet A, Vasiljevic A, Loundou A, Bouvier C. Differential Diagnosis of Meningeal SFT-HPC and Meningioma: Which Immunohistochemical Markers Should Be Used? Am J Surg Pathol 2016. 40: 270-8 (Matériels et Méthodes) [IF : 4.592] 111 Mascelli S, Nozza P, Jones D. T. W, Colin C, Pistorio A, Milanaccio C, Ravegnani M, Consales A, Witt O, Morana G, Cama A, Capra V, Biassoni R, Pfister S. M, Figarella-Branger D, Garrè M. L, Raso A.TP53 codon 72 polymorphism may predict early tumour progression in paediatric pilocytic astrocytoma. Oncotarget 2016 [Epub ahead of print] (Matériels et Méthodes) [IF : 6.368] 112 Masliah-Planchon J, Machet MC, Fréneaux P, Jourdain A, Mortemousque I, Raïs KA, Ballet S, Jouvet A, Figarella-Branger D, Delattre O, Bourdeaut F. SMARCA4-Mutated Atypical Teratoid/Rhabdoid Tumor with Retained BRG1 Expression. Pediatr Blood Cancer 2016; 63: 568-9 () [IF : 2.386] 113 Taïeb D, Barlier A, Yang C, Pertuit M, Tchoghandjian A, Rochette C, Zattara-Canoni H, Figarella-Branger D, Zhuang Z, Pacak K, Metellus P. Somatic gain-of-function HIF2A mutations in sporadic central nervous system hemangioblastomas. J Neurooncol 2016; 126: 473-81 (Matériels et Méthodes) [IF : 3.070] 114 Bouvier C, Macagno N, Nguyen Q, Loundou A, Jiguet-Jiglaire C, Gentet JC, Jouve JL, Rochwerger A, Mattei JC, Bouvard D, Salas S. Prognostic value of the hippo pathway transcriptional coactivators YAP/TAZ and β1-integrin in conventional osteosarcoma. Oncotarget 2016 [Epub ahead of print] (Non citée) [IF : 5.008]


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123 Mascelli S, Nozza P, Jones DT, Colin C, Pistorio A, Milanaccio C, Ravegnani M, Consales A, Witt O, Morana G, Cama A, Capra V, Biassoni R, Pfister SM, Figarella-Branger D, Garrè ML, Raso A. TP53 codon 72 polymorphism may predict early tumour progression in paediatric pilocytic astrocytoma. Oncotarget. 2016;7(30):47918-47926. (Matériels et Méthodes) [IF : 5.008] 123b N. Roux-Buisson, N. Monnier, E. Sagui, A. Abriat, C. Brosset, D. Bendahan, G. Kozak-Ribbens, S. Gazzola, J.-L. Quesada, C. Foutrier-Morello, J. Rendu, D. Figarella-


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124 Tauziede-Espariat A, Parfait B, Besnard A, Lacombe J, Pallud J, Tazi S, Puget S, Lot G, Terris B, Cohen J, Vidaud M, Figarella-Branger D, Monnien F, Polivka M, Adle-Biassette H, Varlet P. Loss of SMARCE1 expression is a specific diagnostic marker of clear cell meningioma: a comprehensive immunophenotypical and molecular analysis. Brain Pathol.2017- 2018 Jul;28(4):466-474. (Matériels et Méthodes) [IF : 5.256] 125 A. Verger, Ph. Metellus, Q. Sala, C. Colin, E. Bialecki, D. Taieb, O. Chinot, D. Figarella-Branger, E. Gued. IDH mutation is paradoxically associated with higher 18F-FDOPA PET uptake in diffuse grade II and grade III gliomas. Eur J Nucl Med Mol Imaging. 2017 Volume 44, Issue 8, pp 1306–1311. (Ethical approval) [IF : 5.537] 126 Terrier LM, Bauchet L, Rigau V, Amelot A, Zouaoui S, Filipiak I, Caille A, Almairac F, Aubriot-Lorton MH, Bergemer-Fouquet AM, Bord E, Cornu P, Czorny A, Dam Hieu P, Debono B, Delisle MB, Emery E, Farah W, Gauchotte G, Godfraind C, Guyotat J, Irthum B, Janot K, Le Reste PJ, Liguoro D, Loiseau H, Lot G, Lubrano V, Mandonnet E, Menei P, Metellus P, Milin S, Muckenstrum B, Roche PH, Rousseau A, Uro-Coste E, Vital A, Voirin J, Wager M, Zanello M, François P, Velut S, Varlet P, Figarella-Branger D, Pallud J, Zemmoura I; Club de Neuro-Oncologie of the Société Française de Neurochirurgie. Natural course and prognosis of anaplastic gangliogliomas: a multicenter retrospective study of 43 cases from the French Brain Tumor Database Neuro Oncol. 2017;19(5):678-688 (Non citée) [IF : 7.786] 127 Graillon T, Romano D, Defilles C, Lisbonis C, Saveanu A, Figarella-Branger D, Roche PH, Fuentes S, Chinot O, Dufour H, Barlier A. Pasireotide is more effective than octreotide, alone or combined with everolimus on human meningioma in vitro. Oncotarget. 2017 Jul 24;8(33):55361-55373 (Remerciements) [IF : 5.618] 128 Le Guellec S, Macagno N, Velasco V, Lamant L, Lae M, Filleron T, Malissen N, Cassagnau E, Terrier P, Chevreau C, Ranchere-Vince D, Coindre JM. Loss of H3K27 trimethylation is not suitable for distinguishing malignant peripheral nerve sheath tumor from melanoma: a study of 387 cases including mimicking lesions. Mod Pathol. 2017 Jul 28. doi: 10.1038/modpathol.2017.91. [Epub ahead of print] (Remerciements) [IF :5.728] 129 Bielle F, Di Stefano AL, Meyronnet D, Picca A, Villa C, Bernier M, Schmitt Y, Giry M, Rousseau A, Figarella-Branger D, Maurage CA, Uro-Coste E, Lasorella A, Iavarone A, Sanson M, Mokhtari K. Diffuse gliomas with FGFR3-TACC3 fusion have characteristic histopathological and molecular features. Brain Pathol. 2017 Oct 4. (Remerciements) [IF : 5.272]


24

130 Appay R, Macagno N, Padovani L, Korshunov A, Kool M, André N, Scavarda D, Pietsch T, Figarella-Branger D. HGNET-BCOR Tumors of the Cerebellum: Clinicopathologic and Molecular Characterization of 3 Cases. Am J Surg Pathol. 2017 Sep;41(9):1254-1260 (Matériels et méthodes) [IF : 4.057] 131 Debruyne DN, Turchi L, Burel-Vandenbos F, Fareh M, Almairac F, Virolle V, Figarella-Branger D, Baeza-Kallee N, Lagadec P, Kubiniek V, Paquis P, Fontaine D, Junier MP, Chneiweiss H, Virolle T. DOCK4 promotes loss of proliferation in glioblastoma progenitor cells through nuclear beta-catenin accumulation and subsequent miR-302-367 cluster expression. Oncogene. 2017 Sep 18. doi: 10.1038/onc.2017.323 (Non citée) [IF : 7.519]

132 Quillien V, Lavenu A, Ducray F, Meyronet D, Chinot O, Fina F, Sanson M, Carpentier C, Karayan-Tapon L, Rivet P, Entz-Werle N, Legrain M, Zalcman EL, Levallet G, Escande F, Ramirez C, Chiforeanu D, Vauleon E, Figarella-Branger D. Clinical validation of the CE-IVD marked Therascreen MGMT kit in a cohort of glioblastoma patients. Cancer Biomark. 2017 Jul 31 (Pas accessible) [IF : 2.274] 133 Renaud F, Bibeau F, Leteurtre E, Delaeter C, Dib M, Harter V, Adenis A, Piessen G, Mariette C on behalf of the FREGAT working group. FREGAT : French clinico-biological database dedicated to esogastric cancer.Ann Pathol. 2017 Dec;37(6):457-466. (Pas accessible) [IF : 0.615] 134 Peyre M, Gauchotte G, Giry M, Froehlich S, Pallud J, Graillon T, Bielle F, Cazals-Hatem D, Varlet P, Figarella-Branger D, Loiseau H, Kalamarides M. De novo and secondary anaplastic meningiomas: a study of clinical and histomolecular prognostic factors. Neuro Oncology. 2017 ; [Epub ahead of print] (Remerciements) [IF : 7.786] 135 Gomez-Brouchet A, Illac C, Gilhodes J, Bouvier C, Aubert S, Guinebretiere JM, Marie B, Larousserie F, Entz-Werlé N, de Pinieux G, Filleron T, Minard V, Minville V, Mascard E, Gouin F, Jimenez M, Ledeley MC, Piperno-Neumann S, Brugieres L, Rédini F. CD163-positive tumor-associated macrophages and CD8-positive cytotoxic lymphocytes are powerful diagnostic markers for the therapeutic stratification of osteosarcoma patients: An immunohistochemical analysis of the biopsies fromthe French OS2006 phase 3 trial. Oncoimmunology. 2017; 24;6(9) (Pas accessible) [IF : 7.719] 136 Boeva V, Louis-Brennetot C, Peltier A, Durand S, Pierre-Eugène C, Raynal V, Etchevers HC, Thomas S, Lermine A, Daudigeos-Dubus E, Geoerger B, Orth MF, Grünewald TGP, Diaz E, Ducos B, Surdez D, Carcaboso AM, Medvedeva I, Deller T, Combaret V, Lapouble E, Pierron G, Grossetête-Lalami S, Baulande S, Schleiermacher G, Barillot E, Rohrer H, Delattre O, Janoueix-Lerosey I. Heterogeneity of neuroblastoma cell identity defined by transcriptional circuitries. Nat Genet. 2017 Sep;49(9):1408-1413. (Remerciements) [IF : 32.197] 137 Bielle F, Ducray F, Mokhtari K, Dehais C, Adle-Biassette H, Carpentier C, Chanut A, Polivka M, Poggioli S, Rosenberg S, Giry M, Marie Y, Duyckaerts C, Sanson M, Figarella-Branger D, Idbaih A; Pola Network. Tumor cells with neuronal intermediate progenitor features define a subgroup of 1p/19q co-deleted anaplastic gliomas. Brain Pathol. 2017 Sep;27(5):567-579. (Non citée) [IF : 6.624]


25

2018 138 Tsvetkov PO, Tabouret E, Roman AY, Romain S, Bequet C, Ishimbaeva O, Honoré S, Figarella-Branger D, Chinot O, Devred F. Differential scanning calorimetry of plasma in glioblastoma: toward a new prognostic / monitoring tool. Oncotarget. 2018 Jan 25;9(10):9391-9399. (Remerciements) [IF : 5.168] 139 Macagno N, Vogels R, Appay R, Colin C, Mokhtari K; French CNS SFT/HPC Consortium; Dutch CNS SFT/HPC Consortium, Küsters B, Wesseling P, Figarella-Branger D, Flucke U, Bouvier C. Grading of meningeal solitary fibrous tumors/hemangiopericytomas: analysis of the prognostic value of the Marseille Grading System in a cohort of 132 patients. Brain Pathol. 2018 Mar 30. doi: 10.1111/bpa.12613. (Matériels et Méthodes) [IF : 6.187] 140 Appay R, Tabouret E, Macagno N, Touat M, Carpentier C, Colin C, Ducray F, Idbaih A, Mokhtari K, Uro-Coste E, Dehais C, Figarella-Branger D; POLA Network. IDH2 mutations are commonly associated with 1p/19q codeletion in diffuse adult gliomas. Neuro Oncol. 2018 Apr 9;20(5):716-718. (non citée) [IF : 9.384] 141 Rosenberg S, Simeonova I, Bielle F, Verreault M, Bance B, Le Roux I, Daniau M, Nadaradjane A, Gleize V, Paris S, Marie Y, Giry M, Polivka M, Figarella-Branger D, Aubriot-Lorton MH, Villa C, Vasiljevic A, Lechapt-Zalcman E, Kalamarides M, Sharif A, Mokhtari K, Pagnotta SM, Iavarone A, Lasorella A, Huillard E, Sanson M. A recurrent point mutation in PRKCA is a hallmark of chordoid gliomas. Nat Commun. 2018 Jun 18;9(1):2371. (non citée) [IF : 12.353] 142 Peyre M, Gauchotte G, Giry M, Froehlich S, Pallud J, Graillon T, Bielle F, Cazals-Hatem D, Varlet P, Figarella-Branger D, Loiseau H, Kalamarides M. De novo and secondary anaplastic meningiomas: a study of clinical and histomolecular prognostic factors. Neuro Oncol. 2018 Jul 5;20(8):1113-1121. (non disponible) [IF : 9.384] 143 Bruno A, Labreche K, Daniau M, Boisselier B, Gauchotte G, Royer-Perron L, Rahimian A, Lemoine F, de la Grange P, Guégan J, Bielle F, Polivka M, Adam C, Meyronet D, Figarella-Branger D, Villa C, Chrétien F, Eimer S, Davi F, Rousseau A, Houillier C, Soussain C, Mokhtari K, Hoang-Xuan K, Alentorn A. Identification of novel recurrent ETV6-IgH fusions in primary central nervous system lymphoma. Neuro Oncol. 2018 Jul 5;20(8):1092-1100. (non disponible) [IF : 9.384] 144 Rosenberg S, Ducray F, Alentorn A, Dehais C, Elarouci N, Kamoun A, Marie Y, Tanguy ML, De Reynies A, Mokhtari K, Figarella-Branger D, Delattre JY, Idbaih A; POLA Network. Machine Learning for Better Prognostic Stratification and Driver Gene Identification Using Somatic Copy Number Variations in Anaplastic Oligodendroglioma. Oncologist. 2018 Jul 17. pii: theoncologist.2017-0495. (non disponible) [IF : 5.306] 145 Appay R, Tabouret E, Touat M, Carpentier C, Colin C, Ducray F, Idbaih A, Mokhtari K, Uro-Coste E, Dehais C, Figarella-Branger D; POLA network Somatostatin receptor 2A protein expression characterizes anaplastic oligodendrogliomas with favorable outcome. Acta Neuropathol Commun. 2018 Sep 7;6(1):89. (non citée) [IF : 5.414] 146 Appay R, Fina F, Macagno N, Padovani L, Colin C, Barets D, Ordioni J, Scavarda D, Giangaspero F, Badiali M, Korshunov A, M Pfister S, T W Jones D, Figarella-Branger D. Duplications of KIAA1549 and BRAF screening by Droplet Digital PCR from formalin-fixed


26

paraffin-embedded DNA is an accurate alternative for KIAA1549-BRAF fusion detection in pilocytic astrocytomas. Mod Pathol. 2018 Oct;31(10):1490-1501. (Remerciements) [IF : 6.655]

2019 III – Bilan des cessions de matériel pour projets de recherche et publications associées Classées chronologiquement selon les dates de demande de cession. Il peut y avoir plusieurs cessions pour un même projet.

Code CRB Titre du projet et investigateur principal

(Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Nature des

échantillons cédés Nombre total de patients inclus

Publications

2008

068CCL Etude de l'expression de l'adrénomédulline dans les gliomes – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés 11 37

076LIG Analyse par une approche couplée CGH-array / transcriptome de la chimiosensibilité des glioblastomes – F. Ducray (hors AP-HM)


093GLD Etude translationnelle de l'impact des marqueurs de chimiorésistance dans les glioblastomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2)


108RCC Etude de l'expression de l'adrénoméduline et de ses récepteurs dans les carcinomes du rein – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2)


109ACO Dosage de l'adrenomédulline et ses récepteurs (ARN + proteines) dans les cancers colorectaux – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2)


112MET Mise au point de la recherche de méthylation de gènes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

ADN tissulaires 36 11, 87

113MPM Etude de l'expression de l'adrénoméduline, de ses récepteurs et du VEGF dans les mésothéliomes – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés ARN tissulaires

14 10

107

116REG Analyse du REGF dans une série de glioblastomes par différentes techniques (FISH, PCR, IHC) – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


117LCV Etude du microenvironnement tumoral des lésions bénignes et malignes des cordes vocales (RT-PCR) – S. Duflo (AP-HM)

Tissus congelés 84 Pas de publication

118STU Etude rétrospective de l'expression de MGMT dans les glioblastomes traités selon le schéma de STUPP – O. Chinot (AP-HM / CRO2)


120CSC Dosage du CD133 (ARN) dans une série de glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


124TEP

Corrélation entre l'expression de différents marqueurs moléculaires et l'intensité de fixation en TEP-FDG préthérapeutique dans les glioblastomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2)



27




Publications

125ECO

Protocole ECOM: Evaluation comparative des techniques d'analyse de la MGMT comme facteur prédictif de réponse au Témozolomide dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

ADN tissulaires 25 51, 79, 87,121, 132

126TRA Etude transcriptomique des glioblastomes et corrélation à la topographie et au taux de cellules CD133+ – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

ARN tissulaires 8 52

127OLA

Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J-Y. Delattre (hors AP-HM)

Tissus congelés 2 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109

2009

118STU (2ème cession)

Etude rétrospective de l'expression de MGMT dans les glioblastomes traités selon le schéma de STUPP – O. Chinot (AP-HM / CRO2)


124TEP (2ème cession)

Corrélation entre l'expression de différents marqueurs moléculaires et l'intensité de fixation en TEP-FDG préthérapeutique dans les glioblastomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2)


127OLA (2ème à 4ème cessions)


Tissus congelés 3 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109, 117

129CAV

Analyse transcriptomique et par CGH array de glioblastomes répondant ou non au traitement par campto-avastin à la récidive – O. Chinot (AP-HM / CRO2) et F. Ducray (hors AP-HM)


130ISO

Protocole ISOPS III: essai de phase II randomisée multicentrique, détermination du statut MGMT dans une série de glioblastomes – A. Carpentier (hors AP-HM)


131TFS

Projet Inca GENOSTT: de la cellule souche aux remaniements du génome:caractérisation moléculaire et fonctionnelle des tumeurs adipocytaires et fibreuses – C. Bouvier (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés 19 39, 56, 57

135PSA

Dosage de l'expression de la glycoprotéine PSA-NCAM par ELISA dans les glioblastomes (tumeur initiale et récidive) – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


136CSC Interaction physique entre les molécules A2B5 et CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


137PIL Caractérisation moléculaire des astrocytomes pilocytiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés Lames paraffine

47 101

14, 61

138BIR Recherche de mutations des gènes IDH1 et IDH2 dans une série de gliomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

ADN tissulaires 59 24, 36, 45

139EPE Recherche de la fusion des gènes KIAA1549 et BRAF dans les épendymomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


2010

130ISO Protocole ISOPS III: essai de phase II randomisée ADN tissulaires 27 17


28




Publications

(2ème à 4ème cessions)

multicentrique, détermination du statut MGMT dans une série de glioblastomes – A. Carpentier (hors AP-HM)

ARN tissulaires Tissus congelés

5 8

138BIR (2ème cession)

Recherche de mutations des gènes IDH1 et IDH2 dans une série de gliomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

ADN tissulaires 2 24, 36, 45

140MIR Analyse de l'expression de miRNA dans les tumeurs du SNC – F. Boudouresque (CRO2)


141PED Recherche de mutations du gène IDH1 dans des gliomes de l'enfant – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

ADN tissulaires 4 50, 64

142IDH Corrélation TEP IDH dans les gliomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2)

ADN tissulaires Tissus congelés

16 6

36, 49

150PSA Dosage de PSA-NCAM dans le cancer du poumon – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et P. Thomas (hors AP-HM)


2011



Tissus congelés 27 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109

136CSC (2ème cession)

Interaction physique entre les molécules A2B5 et CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


150PSA (2ème cession)

Dosage de PSA-NCAM dans le cancer du poumon – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et P. Thomas (hors AP-HM)


152SDF Implication de l'adrénomédulline et du facteur SDF-1 dans la vascularisation tumorale des glioblastomes – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2)


154PIN Analyse du profil génomique des tumeurs corticales de l'enfant par CGH array – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


158AST Analyse de l'expression de cibles thérapeutiques dans les astrocytomes pilocytiques par RT-PCR quantitative – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


159ORL

Etude de prédiction de la réponse à une chimiothérapie d'induction des carcinomes épidermoïdes des voies aérodigestives supérieures. PHRC national 2006 – B. Lallemant (hors AP-HM)

Tissus congelés 8 Pas publication

160SEI Etude de l'expression du REGF sur des carcinomes mammaires de haut grade HER2 négatif – C. Charpin (AP-HM)

Lames paraffine 44 90

161SMG Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la base de leurs signatures moléculaires – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


2012



Tissus congelés Lames paraffine (TMA)

4 203

47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109


29




Publications

136CSC (3ème cession)

Interaction physique entre les molécules A2B5 et CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


160SEI (2ème cession)

Etude de l'expression du REGF sur des carcinomes mammaires de haut grade HER2 négatif – C. Charpin (AP-HM)


161SMG (2ème cession)

Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la base de leurs signatures moléculaires – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés ADN tissulaire ARN tissulaire

46 41 27

105

162NEO

Etude in situ de l'expression des facteurs de la néoangiogenèse et des molécules protéolytiques dans les glioblastomes, au diagnostic et à la récidive – O. Chinot (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés 69 92, 103, 118

163GAN Recherche de mutation V600E du gène BRAF dans les gangliogliomes pédiatriques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

Lames paraffine 57 60, 120

164LGG

Caractérisation clinico-radiologique, génomique et transcriptomique des gliomes de bas grades triple négatifs de l'adulte – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés 18 45, 49

165CAR

Etude du génome des tumeurs cartilagineuses « conventionnelles » bénignes et malignes. Recherche de nouveaux marqueurs moléculaires diagnostiques et pronostiques – C. Bouvier (AP-HM / CRO2)


168EPE PHRC épendymomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Tissus congelés 28 En cours

170MOS Validation de biomarqueurs du glioblastome – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J. Mosser (hors AP-HM)

ADN tissulaires ARN tissulaires

32 9

79

2013



Tissus congelés 10 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109

161SMG (3ème cession)

Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la base de leurs signatures moléculaires – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)


17 92

105

162NEO (2ème cession)

Etude in situ de l'expression des facteurs de la néoangiogenèse et des molécules protéolytiques dans les glioblastomes, au diagnostic et à la récidive – O. Chinot (AP-HM / CRO2)


171MET

Mise en évidence d'une signature moléculaire différentielle entre des tumeurs primitives pulmonaires et mammaires et la métastase cérébrale associée – P. Metellus (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés Paraffine

115 106

71, 81

172GLR

Projet Gliareg: Etude prospective non randomisée évaluant l’impact de la chirurgie avec mise en place d’implants biodégradable in situ de BCNU (Gliadel®) dans les glioblastomes récidivants de l’adulte (GliaReG) – P. Metellus (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés ADN tissulaires

23 13

62, 86

177LGG

Molecular Profiles in Low Grade Glioma, Identification of Novel Therapeutic Targets and Biomarkers for Response to Treatment (EORTC) – P. Metellus (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés 6 En cours


30




Publications

180PXA Caractérisation clinico-radiologique et biologique des xanthoastrocytomes pléïomorphes – E. Tabouret (AP-HM / CRO2)


181PIT

PHRC Pituigène: Identification de marqueurs d'agressivité tumorale et de malignité des tumeurs hypophysaires par analyse génomique comparative par hybridation sur puces à ADN (CGH) – G. Raverot (hors AP-HM)

Blocs paraffine Projet sollicité,

pas de sortie à ce jour

182REI ETUDE SIOP2001, tumeurs du rein de l'enfant – A. Coulomb (hors AP-HM)

Tissus congelés Blocs paraffine

6

Pas de publication

183PYR

Demande de destockage d’ADN d’astrocytomes pilocytiques et de gangliogliomes pour la recherche du polymorphisme R72P de TP53 par pyroséquençage – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

ADN tissulaires 25 111

184ATA

Protocole ATAG: Chimiothérapie par temozolomide-bevacizumab dans les glioblastomes supratentoriels des sujets de 70 ans et plus présentant un état fonctionnel altéré (IK < 70) – O. Chinot (AP-HM / CRO2)


1 13

Pas de publication

2014



Tissus congelés 8 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109

185GBJ Caractérisation clinique, histologique et moléculaire des glioblastomes de l'adulte jeune – E. Tabouret (AP-HM / CRO2)

Lames paraffine 38 En cours

186OHG Expression de l'intégrine béta1 et de YAP dans les ostéosarcomes de haut grade – C. Bouvier (AP-HM / CRO2)

Lames paraffine (TMA)

60 114

187OCG Expression de p63 dans les tumeurs osseuses riches en cellules géantes – C. Bouvier (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés Lames paraffine Lames paraffine (TMA)

31 52 72

84

188EPE Ependymomes intracraniens de l'adulte: analyse des facteurs pronostiques et caractérisation moléculaire – P. Metellus (AP-HM / CRO2)

Blocs paraffine 78 69, 104

189HGB Recherche d'anomalie génétique sur le gène VHL dans les hémangioblastomes apparemment sporadiques – P. Metellus (AP-HM / CRO2)

Blocs paraffine 37 113

190INS Analyse neuroradiologique des gliomes de grade II et III impliquant l'insula; corrélation aux données histo-moléculaires – P. Metellus (AP-HM / CRO2)


44 58

125 (Compes et al)

192MEN Recherche des transcrits de fusion NAB2-STAT6 dans les méningiomes anaplasiques – C. Bouvier (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés ARN tissulaires

27 16

110

193PAN Bile salt-dependent lipase single polymorphism as predictive risk for pancreatic cancers – E. Mas (CRO2)

ADN tissulaires 49 101


31




Publications

194PED

Caractérisation moléculaire des tumeurs gliales et glioneuronales circonscrites de bas grade de l’enfant et de l’adulte jeune par droplet digital PCR – F. Fina (AP-HM)

Tissus congelés ADN tissulaires Lames paraffine

3 20 20

115, 126

195CIL

Cilengitide (EMD121974) en association à la radiothérapie chez l’enfant et le jeune adulte porteur d’un gliome infiltrant du tronc cérébral nouvellement diagnostiqué : Etude de phase I – P. Leblond (hors AP-HM)


196OST Etude Intergroupe (SFCE/GSF-GETO) OS 2006 Zoledronate-Ostéosarcome – L. Brugière et S. Piperno-Neumann (hors AP-HM)


197MEL Caractérisation moléculaire des mélanomes à croissance rapide – C. Gaudy (AP-HM)

Tissus congelés Plasmas Culots lymphocytaires Sang total

34 20 19 10

En cours

199TUX

Etude randomisée multicentrique intergroupe pour les enfants et adolescents atteints d'un lymphome ou d'une leucémie à cellules B matures de l'enfant et l'adolescent avec évaluation d'une diminution de traitement dans les stades localiséset de l'efficacité du rituximab dans les stades avancés. Essai Inter B-NHL Ritux 2010 – C. Schmitt (hors AP-HM)

Blocs paraffine Tissus congelés

1 En cours

200MET

Protocole métastases cérébrales : étude pilote en vue d’un essai européen soutenu par l’EORTC (étude prospective « Window of Opportunity study ») – P. Metellus (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés Sang LCR

4 4 4

En cours

203HEM

Conséquences psychosociales du dépistage de la maladie de Von Hippel Lindau chez des patients opérés d’un hémangioblastome du SNC (PsychoVHL) – P. Metellus (AP-HM / CRO2)

Lames paraffine 11 En cours

205AST Essai multicentrique randomisé: Anti- récepteurs angiotensin II, steroïdes et radiothérapie dans les glioblastomes – A. Carpentier (hors AP-HM)


206CHO Caractérisation moléculaire en whole exome et RNAseq des gliomes chordoïdes – F. Bielle (hors AP-HM)


2015



Tissus congelés Paraffine

6 7

47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109, 137,140, 144

194PED (2ème cession)


Tissus congelés 4

115, 126

207 OST

Recherche d'amplification des gènes MDM2 et RASAL1dans les ostéosarcomes de bas grade – C. Bouvier (AP-HM / CRO2) et G. de Pinieux (hors AP-HM)



32




Publications

208TAU

Validation d'un marqueur PET-Scan de la protéine Tau pour le suivi de la progression des glioblastomes – A. Tchoghandjian (AP-HM / CRO2) et H. Kovacic (CRO2)


209CGH Etude en CGH array des anomalies chromosomiques dans les gliomes de haut grade – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)

Tissus congelés 4 Pas de publication (Mise au point)

210GBJ

Caractérisation moléculaire des glioblastomes du sujet jeune – A. Rousseau (hors AP-HM), D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et E. Tabouret (AP-HM / CRO2) (Listing 185GBJ)


211MEL Impact pronostique de la présence d'une forme active de b-caténine dans le mélanome. C. Gaudy-Marqueste et N. Macagno (AP-HM / hors AP-HM)


300 En cours

212MEL

Caractérisation moléculaire d'une cohorte de mélanomes métastatiques : étude de l'impact pronostique du statut mutationnel P53. C. Gaudy-Marqueste (AP-HM / CRO2 / hors AP-HM)

ADN tissulaires 127 En cours

213SAR ICGC LMS GSF. S. Salas (AP-HM) Tissus congelés Blocs paraffine

3 3

En cours

214MMP

Expression de MMP2, MMP9, CXCL12-CXCR4 et leurs partenaires chez des patients porteurs d’un glioblastome au diagnostic et au cours du traitement. E. Tabouret et E. Denicolaï (AP-HM / CRO2)


3 3

En cours

214MMP (2ème cession)

Expression de MMP2, MMP9, CXCL12-CXCR4 et leurs partenaires chez des patients porteurs d’un glioblastome au diagnostic et au cours du traitement. E. Tabouret et E. Denicolaï (AP-HM / CRO2)

Blocs paraffine 10 En cours

215SAF Protocole UNICANCER 0105-1305/IFCT1301 SAFIR 02 LUNG. A. Valette (hors AP-HM)


216IAP Recherche de la coexpression des inhibiteurs de l'apoptose et des marqueurs de cellules souches dans les glioblastomes. A. Tchoghandjian (CRO2)

Tissus congelés Lames paraffine (TMA)

2 2

122

217REI

Valeur des biomarqueurs MMP2 et MMP9 pour prédire le bénéfice des anti-angiogéniques dans le cancer du rein. E. Tabouret et E. Denicolai (AP-HM / CRO2)


218ALT

Rôle des altérations épigénétiques induites par la mutation IDH1 R132H dans la réactivation de la télomérase et de la voie ALT dans les gliomes. D. Figarella-Branger et V. Geli (AP-HM / hors AP-HM)

ADN tissulaires 24 En cours

219HYP Caractérisation génétique de l'hyperthermie d'effort (Biopsies musculaires). J. Faure et C. Bosson (hors AP-HM)

Tissus congelés 28 123b

2016


33




Publications

215SAF (2ème à 14ème

cession)

Protocole UNICANCER 0105-1305/IFCT1301 SAFIR 02 LUNG. A. Valette (hors AP-HM)


220MCM Evaluation de la valeur pronostique de MCM6 dans les tumeurs oligodendrogliales anaplasiques avec codélétion 1p19q. G. Gauchotte (hors AP-HM)


706 En cours

221MET

Analyse Génomique comparative de 15 paires de tumeurs du sein et de leur métastase cérébrale. P. Metellus, F. Bertucci, J. Adélaïde (Clairval / hors AP-HM)

Tissus congelés 14 123c

222MEN Exome des méningiomes de Grade 3. M. Peyre (hors AP-HM)


223TAR

A Phase I/II, Open-Label, Multicentre Study to Assess The Safety, Tolerability, Pharmacokinetics and Clinicall Efficacy of AZD4547 in Patients with Replapsed/Refractory glioma positive for an FGFR fusion. M. Sanson et O. Chinot (hors AP-HM / AP-HM)


224MEL Caractérisation immunohistochimique de marqueurs diagnostiques, pronostiques et d’agressivité de mélanomes. N. Macagno (AP-HM / CRO2)


215 128

225STM Recherche de nouvelles cibles thérapeutiques dans les sarcomes des tissus mous. C. Jiguet-Jiglaire (CRO2)


226TEL Implication des protéines télomériques dans le vieillissement physiologique du muscle squelettique. F. Magdinier et A. Maues de Paula (AP-HM)


227OST

Recherche de facteurs immunohistochimiques pronostiques dans les ostéosarcomes conventionnels du protocole OS06 (sarcome 09). C. Bouvier (AP-HM)


173 135

228ATR Etude clinico-biologique sur une série rétrospective d'ATRT traité en France entre 2009 et 2012. F. Bourdeaut et C. Godfraind (hors AP-HM)


229TFS

Etude moléculaire des tumeurs fibreuses solitaires des méninges : recherche des transcrits de fusion NAB2-STAT6 et correlations pronostiques. C. Bouvier et P. Wesseling (AP-HM / hors AP-HM)

Blocs paraffine 102 139

230STA Analyse du statut STAT6 sur méningiomes. N. Macagno (AP-HM / CRO2)


173 110


34




Publications

231MIC

Imagerie des gliomes infiltrants par microscopie Raman cohérente. H. Rigneault (hors AP-HM)


232BRA

BRAVE project. B. Chanez, B. Escudier et L. Derosa (AP-HM / hors AP-HM)


233HEM

Etude des mécanismes génomiques de progression tumorale des hémangiopericytomes/tumeurs fibreuses solitaires méningés. C. Bouvier et M. Kalamarides (AP-HM / hors AP-HM)


234EBG (1ère et 2ème cession)

Analyse de biomarqueurs pronostiques et prédictifs pour la thérapie du glioblastome (EB1). R. Berges (AP-HM / CRO2)


235MAP

MAPPYACTS Molecular Profiling for Pediatric and Young Adult Cancer Treatment Stratification. B. Geoerger (hors AP-HM)


19 En cours

236NFK Caractéristiques moléculaires et histologiques des ependymomes. D. Figarella-Branger etT. Pietsch (AP-HM / hors AP-HM)


237PRO

Evaluation de l’apport pronostique du genomic prostate score dans la prédiction de pathologie défavorable chez des patients ayant une IRM prostatique négative. N. Branger (AP-HM / hors AP-HM)

Blocs paraffine 2 Pas de publication

238ADE Signalisation EGF-dépendante dans la maladie de Cushing. T. Brue, J. Drouin (AP-HM / hors AP-HM)


239CHN Environnement immunitaire du chondrosarcome : nouvelles cibles thérapeutiques. C. Bouvier, A. Dutour (AP-HM / CRO2)


28 En cours

240MIR

Analyse de l'expression des miRNAs dans des échantillons de serum et de muscles de patients atteints de dystroglycanopathie et leur implication en tant que biomarqueurs. S. Attarian, F. Muntini (AP-HM / hors AP-HM)


241BIO Protocole BIOMED. N. André (AP-HM) Tissus congelés 1 En cours


35




Publications

242SCI

Etude des organes lymphoïdes secondaires impliqués dans la réponse immunitaire à long terme des patients atteints de déficit immunitaire combiné sévère (SCID vC ou JAK3) ayant reçu une greffe de moelle osseuse au cours de leur 12 premiers mois de vie. A. Fisher, M. Gérard, V. Barlogis (AP-HM / hors AP-HM)


1 En cours

243CRI Validation de nouvelles cibles thérapeutiques dans le GBM par une approche de pharmacologie fonctionnelle. E. Pasquier (AP-HM / CRO2)


65 En cours

244FGF

Vérification du statut des gènes BRAFV600E et FGFR3 des patients inclus dans la cohorte POLA pour éventuellement proposer leur inclusion dans des essais cliniques. D. Figarella-Branger (AP-HM)


594 129

247EWI

EURO EWING 2012– Essai international, randomisé, contrôlé, portant sur le traitement des sarcomes d'Ewing nouvellement diagnostiqués. C. Bouvier, D. Figarella-Branger (AP-HM / hors AP-HM)


248SEQ

Identification par séquençage ciblé de nouvelles cibles thérapeutiques dans les ostéosarcomes de haut grade non métastatiques au diagnostic. S. Salas, S. Olschwang, E. Lavit (AP-HM)


249MEN Etude de l'expression de SMARCE1 dans les méningiomes. A. Tauziede-Esperat, D. Figarella-Branger (hors AP-HM / AP-HM)


185 124

2017

250FGT Sélection de gènes prédisposant au cancer gastrique – Etude Européenne de génotypage à grande échelle. XB.D’journo (hors AP-HM)

Cryotubes de buffy coat

32

251LDL (MAD 1 à 3)

Evaluation des taux d’expression du récepteur au LDL (LDLR) dans les glioblastomes. M. Khrestchatisky, D. Figarella-Branger (hors AP-HM / AP-HM)


129 En cours


36




Publications

253MAP

Etude ancillaire de MAPPYACTS : analyse des profils d'expression de tumeur de neuroblastomes au diagnostic et à la rechute par RNAseq. E. Lapouble (hors AP-HM)


254BCO

Mise en place d'une technique de screening de duplication du gène BCOR par ddPCR. F.Fina (AP-HM)


1 3patients*5

130

256CIT

Analyse multi-omique de lymphomes primitifs du SNC comprenant Whole Exome Sequencing, RNAseq, miRNome et Méthylomeprogramme dans le cadre du programme « Carte d’Identité des Tumeurs (CIT)». K. HOANG-XUAN, D.Figarella-Branger (hors AP-HM / AP-HM)


257INN

Validation d’anticorps – collaboration INNATE PHARMA et APHM. D. Figarella-Branger, C. Bonnafous (AP-HM / hors AP-HM))

Lames paraffine Lames paraffine (TMA)

166*2

Pas de publication Screening d’expression

248SEQ (MAD 2 et 3)


Tissus congelés 4+2 En cours


Tissus congelés 3

224MEL (MAD3)

Caractérisation immunohistochimique de marqueurs diagnostiques, pronostiques et d’agressivité de mélanomes. N. Macagno (AP-HM)


204*2

243CRI Validation de nouvelles cibles thérapeutiques dans le GBM par une approche de pharmacologie fonctionnelle. E. Pasquier (AP-HM / CRO2)


100


37




Publications

248SEQ (MAD 4)



105*2 En cours

258SST

Evaluation de la valeur diagnostique et pronostique du marqueur immunohistochimique SSTR2 sur la cohorte de gliomes POLA. D. Figarella-Branger (AP-HM)


652 145

227OST

Recherche de facteurs immunohistochimiques pronostiques dans les ostéosarcomes conventionnels du protocole OS06 (sarcome 09). C. Bouvier-Labit (AP-HM)


138 135

224MEL (MAD4)

Caractérisation immunohistochimique de marqueurs diagnostiques, pronostiques et d’agressivité de mélanomes. N. Macagno (AP-HM)


204*4

259MIT

Mise en place d’une technique de quantification d’ADN sur fibre musculaire unique comme outil d’interpretation de quantification des variants de signification inconnue dans les maladies mitochondriales. C. Rouzier (hors AP-HM)

Tissus congelés

5 patients (2 patients *2

lames 3 patients *3

lames)

260PSA Etude de l’expression de PSA-NCAM (Ac735) dans les gliomes de la cohorte POLA. D. Figarella-Branger (AP-HM)


751*2

261MSE

Etude des mécanismes moléculaires de la barrière hémato-encéphalique et de la perméabilité de la barrière tumorale dans des modèles de métastases cérébrales. P. Metellus (hors AP-HM)

Tissus congelés 14

262LGS

Déterminants moléculaires génétiques, environnementaux liés à l’hôte et cliniques, de survie prolongée des patients atteints de glioblastomes - EORTC 1419 Dr. Michael WELLER / O. Chinot (hors AP-HM / AP-HM)

Blocs paraffine 10

2018


38




Publications

262LGS (MAD 2)


Blocs paraffine 7

248SEQ



105*2

252OGD Test de l'anticorps monoclonal anti OAcGD2 (201.0) fourni par OGD2 Pharma

Lames paraffine (TMA) Tissus congelés

101*1 1

En cours

245UKM

Biological mechanisms of disease relapse in childhood medulloblastoma. S. Clifford, D. figarella-Branger, N. andré (AP-HM / hors AP-HM)


4 7

En cours

264MMP

Etude de marqueurs circulants afin de corréles leur expression à la réponse au traitement dans le glioblastome E.Tabouret/C.Jiguet Jiglaire (AP-HM)

Plasma 50 patients

(103 échantillons x2)

138

265MEN ADN tumoral et circulant de méningiomes humains : vers de nouveaux marqueurs pronostiques et thérapeutiques (AP-HM).

Lames paraffine 7patients *5 lames En cours

266USP

Evaluation de l’intérêt diagnostique de la recherche en FISH du réarrangement d’USP6 dans les lésions osseuses riches en cellules géantes et fasciites nodulaires (AP-HM)

Lames paraffine 16 patients*5

lames En cours

268LYM Lymphatics in the brain (hors AP-HM / AP-HM) Lames paraffine 2* 5 lames En cours


39




Publications



264MMP (MAD2)


Tissus congelés Cryocoupes

19 5*19

En cours

220MCM Evaluation de la valeur pronostique de MCM6 dans les tumeurs oligodendrogliales anaplasiques avec codélétion 1p19q. G. Gauchotte (hors AP-HM)


19patients*2lames +

194patients*1lame

En cours

224MEL (MAD 5)

Caractérisation immunohistochimique de marqueurs diagnostiques, pronostiques et d’agressivité de mélanomes. N. Macagno (AP-HM / CRO2)


204*4 En cours

231MIC Imagerie des gliomes infiltrants par microscopie Raman cohérente. H. Rigneault (hors AP-HM)

Cryocoupes 3patients*2 lames

+ 4 patients*3 lames

En cours

194PED (MAD3)


Lames paraffine 4 patients*4 lames 115, 126, 146

264MMP (MAD3)


Tissus congelés Cryocoupes

3 5*3

En cours

264MMP (MAD4)


Plasma 40 patients

(80 échantillons x2)

En cours


40




Publications

270POU

Caractérisation des altérations génomiques, post-génomiques et épigénomiques des métastases cérébrales dans les cancers du poumon. P.Metellus (hors AP-HM)

Cryocoupes Tissus congelés

3patients*5 lames 40

En cours

239CHN Environnement immunitaire du chondrosarcome : nouvelles cibles thérapeutiques. C. Bouvier, A. Dutour (AP-HM / CRO2)


247EWI

EURO EWING 2012– Essai international, randomisé, contrôlé, portant sur le traitement des sarcomes d'Ewing nouvellement diagnostiqués. C. Bouvier, D. Figarella-Branger (AP-HM / hors AP-HM)




272ILC Rôle des ILC dans la survenue de la maladie du greffon contre l’hôte. F. VELY ((AP-HM)

Lames paraffine 8 patients*3 lames



256CIT

Analyse multi-omique de lymphomes primitifs du SNC comprenant Whole Exome Sequencing, RNAseq, miRNome et Méthylomeprogramme dans le cadre du programme « Carte d’Identité des Tumeurs (CIT)». K. HOANG-XUAN, D.Figarella-Branger (hors AP-HM / AP-HM)


269CEL

Caractérisation du facteur CELF2 dans le contrôle des propriétés souches des cellules souches cancéreuses de gliome. T. Virolle, D.Figarella-Branger (AP-HM / hors AP-HM)


???


41




Publications

2019

262LGS


Tissus congelés 10

IV – Participation de la tumorothèque de l’AP-HM à des réseaux de soins ou à des projets multicentriques 1. Cancers rares de l’adulte

• Réseaux nationaux de double lecture des cancers rares de l’adulte

- Sarcomes des tissus mous et des viscères. Réseau RREPS (Réseau de Référence en Pathologie des Sarcomes) (coordinateur national : JM Coindre – Bordeaux), Marseille : centre d’expertise régional, coordinateur : C. Bouvier (AP-HM)

- Mésothéliomes malins de la plèvre et tumeurs rares du péritoine (coordinateur national : Galateau Salle – Marseille), centre d’expertise régional, coordinateur : L. Garbe (AP-HM)

- Réseau de Neuro Oncologie Pathologique RENOP (coordinateur national : D. Figarella-

Branger)

- Réseau national pour les cancers rares de la peau. Réseau CARADERM pathologie (Cancers Rares Dermatologiques), coordinateur national pour la relecture anatomopathologique : B. Cribier - Strasbourg, co-coordinateurs nationaux : M. Battistella - Paris, B. Vergier - Bordeaux, centre d'expertise régional, co-coordinateurs : N. Macagno, MC Rojat-Habib, AP-HM

• Réseaux nationaux de double lecture des tumeurs pédiatriques du SNC

- Groupe d’étude en Neuropathologie Oncologique Pédatrique. Réseau GENOP

(coordinateur national : A. Jouvet – Lyon, centre de référence coordinateur pour la relecture anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille)

• Réseaux cliniques de références

- Sarcomes des tissus mous et des viscères. Réseau NETSARC (Réseau de centres de

référence dans la prise en charge des sarcomes et tumeurs conjonctives) (coordinateur : JY Blay – Lyon)


42

- Sarcomes osseux. Réseau RESOS (Réseau de Référence des Sarcomes Osseux), (coordinateur national : F Gouin – Nantes, et sur le versant de la Pathologie, coordinateur : G de Pinieux – Tours)

- Tumeurs neuroendocrines malignes rares. Réseau RENATEN (coordinateur : P Niccoli – Marseille)

- Tumeurs cérébrales olidodendrogliales de haut grade. Réseau POLA

(coordinateur national : JY. Delattre – Paris, centre de référence coordinateur pour la relecture anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille)

- Cancers ORL rares. Réseau REFCOR (coordinateur : F Janot – Paris)

- Lymphomes primitifs du système nerveux central. Réseau LOC (coordinateur : K Hoang-

Xuan – Paris)

- Tumeurs cérébrales rares de l’adulte. Réseau TUCERA (coordinateur national : H. Loiseau – Bordeaux, centre de référence coordinateur pour la relecture anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille, AP-HM)

- Cancers rares du rein. Réseau CARARE (coordinateur national B. escudier-IGR Villejuif

Marseille : centre d’expertise régional pour la région PACA, coordinateur : L.Daniel (AP-HM)

2. Bases clinicobiologiques

• Projet POLA (depuis 2008) : Base dédiée au suivi prospectif et à la prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques.

• Projets BCB INCa :

- Projet Melbase (depuis 2011) : Suivi d’une cohorte nationale de patients atteints de mélanome stade IV ou stade III inopérable.

- Projet BCB Glioblastomes (depuis 2012) : Inclusion de tous les glioblastomes qui ont eu une cryoconservation d’au moins 3 fragments de 50 mg, des prélèvements sanguins, le consentement dédié, une mèche de cheveux, et un blic de paraffine surnuméraire sous embargo pour la recherche.

- Projet BACAP (depuis 2012) : Base AnatomoClinique de l’Adenocarcinome

Pancréatique

- Base Gliomes Marseille (depuis 2012) : Suivi de tous les cas incidents de gliomes ou de tumeurs glioneuronales de la file active de patients de l’AP-HM (adultes et enfants), dans le cadre du programme Gliomes du SIRIC Marseille.

- Base RENOP/TUCERA (depuis 2013) : Base de données à visée pathologique

permettant l’enregistrement des cas revus en relectures interrégionale et nationale dans le cadre du projet TUCERA.


43

3. Projet carte d’identité des tumeurs Ligue Nationale contre le cancer - Projet ANOCEF Ligue : Etude transcriptomique de la réponse à la radiothérapie ou à la

chimiothérapie de première ligne chez les patients présentant un glioblastome.

- Etude génomique et transcriptionnelle de la réponse au traitement par innotecan et bevacizumab chez les patients présentant un glioblastome en récidive

- Projet Chondrosarcome Ligue.

- STIC ECOM « Evaluation comparative des techniques d’analyse de la MGMT comme

acteur prédictif de réponse au Temozolomide dans les glioblastomes » - coordinateur : V Quillien - Rennes

4. Projets structurants régionaux - SIRIC : Site Intégré de Recherche en Cancérologie et tout spécialement l’axe gliome du

projet SIRIC - DHU : Départements Hospitalo-Univertaires, dont le DHU IMoTheP (Molecular vector-

based imaging for personalized theranostic applications) (Investigateur : E. Guedj) labellisé par A*MIDEX en septembre 2015, le DHU EPINEXT (Epilepsie et désordres de l’excitabilité neuronale) (Investigateur : F. Bartolomei) et le projet Marseille Immunopôle (MI-DHU) (Investigateur : E. Vivier).

5. Projets internationaux - « Prospective Assessment of Predictive / Prognostic Molecular Biomarkers in the SIOP-

LGG 201X Adaptative trial » SIOP-LGG PLGA foundation. Partenaires: Heidelberg, Rome and Marseille

- Marie Curie International Incoming Fellowships (IIF): FP7-PEOPLE-2013-IIF:

« Broadband screening of therapeutic molecules with AMM, on cellular models of glioblastoma». Investigateur: E. Pasquier

- Cohorte EORTC “Brain tumour Funder’s” Glioblastomes longs survivants.

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