Travail de 2ème Travail de 2ème doctoratdoctorat

Martins RitaMartins RitaMargueritte AurélienMargueritte Aurélien

Mahler ElodieMahler Elodie

Intérêts de l’utilisation Intérêts de l’utilisation des indicateurs de santé des indicateurs de santé pour la sélection pour la sélection génétique des saumonsgénétique des saumons

Plan:Plan:1.1.IntroductionIntroduction2.Index de santé proposés:2.Index de santé proposés:• Evaluation par autopsieEvaluation par autopsie• Activité du lysozyme plasmatiqueActivité du lysozyme plasmatique• Fréquence de l’infection par Fréquence de l’infection par R.Salmoninarum R.Salmoninarum 3.Evaluation des index3.Evaluation des index• Tests de survieTests de survie• Taux de croissance et tailleTaux de croissance et taille4.4.RésultatsRésultats5.Discussion5.Discussion6.Conclusion6.Conclusion

1. 1. Introduction:Introduction:

• Les 3 indicateurs de santéLes 3 indicateurs de santé::

• Activité du lysozyme plasmatique (A.P.L.)Activité du lysozyme plasmatique (A.P.L.)

• Détection de Détection de Renibacterium salmoninarium Renibacterium salmoninarium engendrant la Bacterial Kidney Disease (BDK)engendrant la Bacterial Kidney Disease (BDK)

• L’évaluation de l’index de santé basée sur L’évaluation de l’index de santé basée sur l’autopsie (HAIA)l’autopsie (HAIA)

• Croisements-test:Croisements-test:

• • W: souche sauvageW: souche sauvage

• • D: souche D: souche domestique (YIAL)domestique (YIAL)

FemelleFemelle MâleMâle

WWWW WWWW

DDDD WWWW

WWWW DDDD

DDDD DDDD

4 types de descendants:4 types de descendants:

• WW Homozygote sauvage WW Homozygote sauvage

• DD Homozygote domestiqueDD Homozygote domestique

• WD WD

• DWDW Hybrides

2 buts des croisements2 buts des croisements::

• Estimation de l’héritabilité des index de santé.Estimation de l’héritabilité des index de santé.

• Recherche de la corrélation entre les index de santé et les performances.Recherche de la corrélation entre les index de santé et les performances.

2. Index de santé proposés2. Index de santé proposés 1) Evaluation à l’autopsie1) Evaluation à l’autopsie

• Examens qualitatif de différents organes Examens qualitatif de différents organes

• Chaque organe est noté selon l’échelle suivante: Chaque organe est noté selon l’échelle suivante: - 0 : aucune anormalité- 0 : aucune anormalité - 30 : anormalités modérées - 30 : anormalités modérées - 60 : anormalités sévères- 60 : anormalités sévères

• Test de chi-carré pour évaluer les différences entre scores de Test de chi-carré pour évaluer les différences entre scores de santé selon les familles de poissons.santé selon les familles de poissons.

2) Activité du lysozyme plasmatique2) Activité du lysozyme plasmatique

• • Utilisation de la technique sur « lysoplate »Utilisation de la technique sur « lysoplate » - Dépôt de 6 échantillons de plasma de - Dépôt de 6 échantillons de plasma de

poissonpoisson - Dépôt d’un échantillon d’une solution étalon - Dépôt d’un échantillon d’une solution étalon

contenant du lysozyme de blanc d’œuf contenant du lysozyme de blanc d’œuf

• Diamètre de la zone de lyse autour de chaque Diamètre de la zone de lyse autour de chaque échantillon. échantillon.

• ANOVA 1 ANOVA 1

• Estimation de l’héritabilité de l’activité Estimation de l’héritabilité de l’activité lysozymelysozyme

3) Fréquence de l’infection à R. 3) Fréquence de l’infection à R. salmoninarumsalmoninarum

• Extraction de l’ADN de l’homogénat des reinsExtraction de l’ADN de l’homogénat des reins

• PCR d’un fragment de 501 pb du gène p57 de R. PCR d’un fragment de 501 pb du gène p57 de R. salmoninarumsalmoninarum

• Visualisation de l’ADN amplifié sur gel d’agaroseVisualisation de l’ADN amplifié sur gel d’agarose

• Comparaison à des témoins infectés et sainsComparaison à des témoins infectés et sains

• ANOVA 1 ANOVA 1

• Estimation de l’héritabilité de la fréquence d’infectionEstimation de l’héritabilité de la fréquence d’infection

3. Evaluation des index3. Evaluation des index

Survie des différents croisementsSurvie des différents croisements : :

• à une vibriose « naturelle »à une vibriose « naturelle »

• à un pathogène inoculé ( V. anguillarum)à un pathogène inoculé ( V. anguillarum) Injection intrapéritonéale de 0.1 ml d’une Injection intrapéritonéale de 0.1 ml d’une

solution contenant V. anguillarum solution contenant V. anguillarum comparée à celle d’un placébocomparée à celle d’un placébo

• Evaluation de la résistance à la maladie.Evaluation de la résistance à la maladie.

• AnovaAnova

Performances des poissonsPerformances des poissons

• Taux de croissance : évaluation du Taux de croissance : évaluation du poids à 8 mois d’intervallepoids à 8 mois d’intervalle

• Taille en fonction de l’âge :Taille en fonction de l’âge :

- taille à 420 jours post-fertilisation- taille à 420 jours post-fertilisation

- taille à 615 jours post-fertilisation- taille à 615 jours post-fertilisation

• AnovaAnova

Analyse par régression linéaireAnalyse par régression linéaire

• But = voir l’utilité des indicateurs But = voir l’utilité des indicateurs de santé pour prédire les de santé pour prédire les performances familialesperformances familiales

• Régression pour chaque Régression pour chaque indicateur de santé potentiel par indicateur de santé potentiel par rapport au :rapport au :

- taux de survie - taux de survie

après l’infection naturelle à après l’infection naturelle à VibrioVibrio

après inoculation de après inoculation de V.anguillarumV.anguillarum

- taux de croissance et à la taille - taux de croissance et à la taille des poissonsdes poissons

4.Résultats4.Résultats

• A.L.P (activité du lysozyme A.L.P (activité du lysozyme plasmatique): est la plus élevée chez plasmatique): est la plus élevée chez les WWles WW

H.A.I.(évaluation de l’état de santé): 91,2% H.A.I.(évaluation de l’état de santé): 91,2% des saumons ont un score de “0”des saumons ont un score de “0”

•Taux de survie: •Taux de survie: DD 92,4% ; DW et WD taux intermediaires DD 92,4% ; DW et WD taux intermediaires par rapport aux lignés pures.par rapport aux lignés pures.

•Taux de croissance (taille-âge): •Taux de croissance (taille-âge): á 420j _ WW» WD=DW» DD á 420j _ WW» WD=DW» DD á 620j _ WW = WD » DW á 620j _ WW = WD » DW

•Composante héritable paternelle pour •Composante héritable paternelle pour A.P.L. A.P.L. WW : h2= 0,17+/-0,04 WW : h2= 0,17+/-0,04 DD : h2= -0,12+/-0,33 DD : h2= -0,12+/-0,33

5.Discussion5.Discussion

• Santé du poisson Santé du poisson • Index de santéIndex de santé• Composante paternelle héritable de l’A.P.L.Composante paternelle héritable de l’A.P.L.• L’usage de la technique PCR pour détecter L’usage de la technique PCR pour détecter

Renibacterium salmoninarumRenibacterium salmoninarum

6.Conclusion6.Conclusion

• Association : A.P.L. élevée avec BKD + Association : A.P.L. élevée avec BKD + Sont des bons indicateurs de la santé chez Sont des bons indicateurs de la santé chez le poissonle poisson

• Augmentation du nombre des IS ont Augmentation du nombre des IS ont amélioré la resolution de cet étude...amélioré la resolution de cet étude...

• Pour trouver des correlations genétiques Pour trouver des correlations genétiques entre IS et traits performants on conseille entre IS et traits performants on conseille de tenir compte des traits generalisés: de tenir compte des traits generalisés: croissance et survie.croissance et survie.

BibliographieBibliographie

• « Utility of genetically « Utility of genetically based healt indicators based healt indicators for selection purposes for selection purposes in captive-reared in captive-reared chinook salmon, chinook salmon, Oncorhynchus Oncorhynchus tschawytscha,tschawytscha, Walbaum », Rachel M. Walbaum », Rachel M. Johnson et Johnson et al.Aquaculture al.Aquaculture Research, 2003, 34, Research, 2003, 34, 1029-1036.1029-1036.