Toxicologie environnementale et humaine

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Master 1 Sciences, Technologies, Santé 2021-2022 Toxicologie et écotoxicologie Toxicologie environnementale et humaine M1 TEH

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Master 1 Sciences, Technologies, Santé

2021-2022

Toxicologie et écotoxicologie

Toxicologieenvironnementale

ethumaine

M1 TEH

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SOMMAIRE

Contacts de la formation 02Calendrier 2021-2022 05 Présentation de la formation 07Volumes horaires et évaluations 09Contenu des enseignementsSemestre 1 13Semestre 2 20

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CONTACTS DE LA FORMATION

Responsable pédagogique et Présidente de JuryHélène TRICOIRE-LEIGNEL Tél. : 02 44 68 82 [email protected]

Gestion de la scolarité et des examensOlivier GUITTONTél. : 02 41 73 53 [email protected]

Scolarité - ExamensBâtiment A, Rez-de-chaussée, Bureau A006Horaires d’ouvertureLundi au vendredi9h30 - 12h30 13h30 - 16h30

PAGE 2 l CONTACTS

Assesseure à la PédagogieSandrine [email protected]

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CALENDRIER

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PAGE 5 l CALENDRIER

Planning susceptible de modifications

Premier semestre

Rentrée et début des cours Vendredi 03 septembre 2021

Vacances d’automne Du samedi 23 octobre 2021 au lundi 01 novembre 2021

Fin des cours du 1er semestre Vendredi 17 décembre 2021

Vacances de fin d’année Du samedi 18 décembre 2021 au dimanche 02 janvier 2022

Jury 1er semestre l Session 1 09-11 février (suivant la disponibilité des membres du jury)

Deuxième semestreRentrée et début des cours Lundi 03 janvier 2022

Vacances d’hiver

Samedi 12 février 2022 au dimanche 20 février 2022

Stage Du lundi 04 avril 2022au vendredi 03 juin 2022

Soutenance de stage 16 - 17 juin 2022

Jury 2ème semestre l Session 1 06-08 juillet 2022 (suivant la disponibilité des membres du jury)

Examens 1er et 2ème semestre Session 2

01-03 septembre 2022

Jury 1er et 2ème semestre Session 2

14 septembre 2022 (suivant la disponibilité des membres du jury)

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Présentation de la

formation

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Le master Toxicologie Environnementale & Humaine (TEH) forme des toxi-cologues et écotoxicologues, capables d’appréhender des problématiques liées aux contaminants de l’environnement et leurs effets délétères sur les organismes vivants et/ou la santé humaine. Au cours de leur formation, les étudiants acquièrent une vision pluridisciplinaire des effets des toxiques à différentes échelles (écosystème, organisme, cellule, cible moléculaire).

L’enseignement s’appuie sur la participation d’une trentaine de laboratoires académiques (Universités, INRA, CNRS…) et de structures privées. La for-mation est complétée par des enseignements transversaux (droit, anglais, management de projet, techniques de communication, analyse du risque, analyse spatiale, expérimentation animale).

OBJECTIF

Le master privilégie l’acquisition de compétences complémentaires en toxicologie générale et écotoxicologie. A l’issue, les diplômés pourront gérer des projets impliquant un pronostic (modélisation et définition de biomarqueurs relatifs à une intoxication), un diagnostic (état des lieux d’une contamination unique ou multiple) et/ou une aide à la décision (solutions mises en oeuvre pour parvenir à un assai-nissement/détoxification). En recherche fondamentale, les étudiants évolueront sur des questionne-ments scientifiques portant sur l’interaction entre un toxique et son environnement ou sur la santé humaine.

PUBLIC VISÉ

Peuvent postuler au Master TEH :— Etudiant.e.s titulaires d’une licence dans les domaines des Sciences de la Vie, de la chimie de l’environnement.— Etudiant.e.s issu.e.s d’un cursus en médecine/pharmacie.— Professionnels en formation continue ou par alternance.

PAGE 7 l PRÉSENTATION DE LA FORMATION

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VOLUMES HORAIRESÉVALUATION

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SEMESTRE 1

PAGE 9 l VOLUMES HORAIRES - ÉVALUATION

SEMESTRE 1 30 ECTS

U.E. Matières ECTS

Coef

f. Volumes horaires Contrôle des Connaissances

tot. CM TD TP 1re session 2e session

Durée exam. Assidus D.A.

S1-Ue1-TEH Toxicologie I 3 1.5 30 15 5 10 CC

(100%) CT

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

S1-Ue2 - TEH Ecotoxicologie I 3 1.5 26.6 16 5.3 5.3 CC

(100%) CT

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

S1-Ue3 - TEH

Technique de communication-conduite de projet

2 1 20 6 6 8 CC (100%)

CT (100%)

CT 80% CC 20% 2h00

S1-Ue4-TEH

Management environnemental et normes

3 1.5 29 15 14 - CC (100%) - CT (100%) 2h30

Toxicologie I approfondie 3 1.5 29 15 14 - CC

(100%) CT

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

S1-Ue5-TEH Analyses de données 4 2 27 8 - 19 CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral

(100%) 1h00

S1-Ue6-TEH Anglais 2 1 - - 17.3 CC

(100%) - CT ou oral (100%) 1h00

S1-Ue7-TEH

Projet Personnel Professionnel Étudiant 2 1 20 - 20 - Validation présentiel

S1-Ue8-TEH

Groupe d’Options au choix 8 4

Toxico-logie

Pharmacologie 3 1.5 28 18 7 3 CC (100%)

CC (100%)

CT ou oral (100%) 2h00

Prolifération cellulaire, apoptose, oncogènes I 3 1.5 27 20 7 - CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

Altération génomique et pharmacogénomique 2 1 27 16 11 - CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

Ecotoxicologie

Biologie et génétique des Populations 6 3 54 26 12 16 CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

Géochimie des milieux aquatiques 2 1 20 11 9 CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

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SEMESTRE 2

PAGE 10 l VOLUMES HORAIRES - ÉVALUATION

Choix conseillé selon orientation

SEMESTRE 2 30 ECTS

U.E. Matières

ECT

S

Coef

f. Volumes horaires Contrôle des Connaissances

tot. CM TD TP 1re session 2e session

Durée exam. Assidus D.A.

S2-Ue1-TEH

Toxicologie II 3 1.5 27 18 5 4 CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

S2-Ue2-TEH

Ecotoxicologie II

3 1.5 25 16 5 4 CC (100%)

CC (100%)

CT ou oral (100%) 2h00

S2-Ue3-TEH

Analyse des pesticides et polluants 3 1.5 30 12 10 8

CC (80%)

TP (20%)

- CT (0.6) CC (0.2) TP (0.2)

2h00

S2-Ue4-TEH

Anglais

2 1 14.7 CC (100%) - CT ou oral

(100%) 1h00

S2-Ue5-TEH

STAGE 6 3 209.3 - 3 -

Rapport (0.5) Suivi (0.1) Oral (0.4)

Rapport (0.5) Suivi (0.1) Oral (0.4)

Rapport (0.5)

Suivi (0.1) Oral (0.4)

0h30

S2-Ue7-TEH

Toxicologie des addictions, toxicologie alimentaire

4 2 27 17,6 9,3 - CC (100%)

CC (100%)

CT ou oral (100%) 2h00

S2-Ue6-TEH Options 9 4.5

Prolifération cellulaire, apoptose, oncogènes II 3 1,5 25 22 3 - CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral

(100%) 2h00

Adaptations physiologiques aux contraintes environnementales

3 1.5 26 15 3 8 CC (100%)

CC (100%)

CT ou oral (100%) 2h00

Écologie des communautés 3 1.5 27.2 14.6 2.6 10 CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral (100%) 2h00

Bioindicateurs des milieux aquatiques

3 1.5 27.5 13.5 8 6 CC (100%)

CC (100%)

CT ou oral (100%) 2h00

Système d’information Géographique (SIG) 3 1,5 27 3 - 24 CC

(100%) CC

(100%) CT ou oral (100%) 1h00

Technique d’inventaire, indices qualité environnementale

6 3 54 16 8 30 CC (100%)

CC (100%)

CT ou oral (100%) 1h30

Toxicologie Ecotoxicologie

Adaptations physiologiques aux contraintes environnementales Prolifération cellulaire, apoptose, oncogènes II Bioindicateurs des milieux aquatiques

+ une option écotox Écologie des communautés

SIG

Tech d’inventaire, indices qualité environnementale

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CONTENU DES

ENSEIGNEMENTS

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SEMESTRE 1

Toxicologie 1Toxicology 1

Responsable : Hélène Tricoire-LeignelIntervenants : Mathilde Munier, César Mattei, Camille Savary, Hélène Tricoire-Leignel

Compétences visées― Maîtriser les concepts généraux de toxicologie (exposition, dose, analyse de risque, toxicité générale (aiguë, chronique)) ainsi que les notions de toxicité spécifique (géno-toxicité, reprotoxicité, neurotoxicité, immunotoxicité, cancérogénicité). ― Évaluer la toxicité spécifique par l’altération d’une fonction particulière, identifier les organes-cibles― Connaître les paramètres caractéristiques de la toxicité d’une molécule (dose létale 50, dose sans effet nocif, dose minimale avec effet nocif, effet-dose, effet à seuil, va-leur toxicologique de référence, limite maximale en résidus)― Savoir identifier les xénobiotiques et leur capacité intrinsèque à entrainer un effet nocif sur l’organisme

Contenu de l’enseignement Définition et concepts de toxicologie : exposition externe, dose interne - Captation tissulaire, absorption, distribution - Organes cibles, effet critique - Effets intrinsèques modifiant les réponses aux toxiques - Réponses cellulaires : lésions, mort cellulaire - Altérations du fonctionnement des organes et des systèmes - Analyse de risque.

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Ue 1

Ue 2

Ue OBLIGATOIRES

Écotoxicologie 1Ecotoxicology 1

Responsable : Vincent LeignelIntervenants : Justine Marchand, Aurore Zalouk-Vergnoux, Vincent Leignel

Contenu de l’enseignement et compétences visées― Maîtriser les définitions et les approches différentielles et communes de l’Eco-toxico-logie et de Toxicologie générale. ― Connaître la diversité des polluants, contaminants et toxiques.― Identifier les compartiments cibles d’accumulation des contaminants (air, eau, sol).― Connaître la notion de transfert de contamination et les voies de pénétration (ab-sorption), de métabolisation (biotransformations primaires et secondaires) et l’excré-tion dans les organismes animaux et végétaux. ― Maitriser la bioaccumulation et la biomagnification des contaminants dans les ré-seaux trophiques au sein d’un écosystème― Comprendre les méthodes d’évaluation des impacts de ces contaminants sur le développement et les grands systèmes physiologiques (digestif, respiratoire, circula-toire, reproductif, urinaire...) à partir de biomarqueurs d’effet et d’exposition (seuil, effet-dose...). ― Savoir apprécier les effets des contaminants à diverses échelles d’analyse (individu, population, microcosme, parcelle).

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Ue 3

PAGE 14 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Ue 4

Technique de communication-conduite de projet Communicating techniques-project management

Responsable : Geoffrey Ratouis

Compétences viséesAppréhender les enjeux, les théories et les méthodes de la communication dans le cadre de l’enseignement, dans la perspective de la recherche et pour leur insertion professionnelle.

Contenu de l’enseignement Introduction aux concepts et aux théories de la communication. La communication de groupe. La conduite de réunion. La préparation d’un débat, d’une présentation, d’une conférence. La prise de parole. Entraînement et improvisation. Le verbal et le non-ver-bal. La parole et le corps. L’attitude, la voix, le regard, les gestes. Environnement et communication (problématique, notions, débats). Approche de la communication institutionnelle des organisations (entreprises, collectivités territo-riales, associations). La communication de crise (histoire, concepts, stratégies). Études de cas. Jeux de rôles (pour mettre les étudiants en situation de choisir une stratégie de communication).

Management environnemental et normes Environmental management & Standards

Responsable : Sophie Kints

Compétences viséesIl s’agit de donner aux étudiants la capacité d’assurer la promotion et la mise en oeuvre des systèmes de management, de l’environnement et de la santé au travail.

Contenu de l’enseignement Les systèmes de management de l’environnement : L’architecture des normes ISO (Présentation des référentiels environnementaux et sécurité/santé au travail, ECO AU-DIT, ISO 14.000, OHSAS 18.001, Le Développement Durable : guide de référence SD 21.000). Organisation du Système de Management de l’Environnement. Organisation et présentation d’un Système de Management Intégré. Les incidences et parallèles des Systèmes de Management de l’Environnement, de la Qualité, de la Santé et de la Sécurité au Travail. Les organismes de certification. La gestion de la communication environnementale. Concept et contexte de la communication. Différentes formes de communication. Les différents modes de communication. Les différents supports de la communication. Architecture des normes/ qualité. Installations Classées pour l’En-vironnement. Le cadre des ICPE. L’organisation administrative. Le dossier ICPE. La directive SEVESO II. Applications, plan d’organisation interne (POI). Plan particulier d’intervention (PPI).

Toxicologie approfondieToxicology

Intervenants : César Mattei, Camille Savary, Hélène Tricoire-Leignel

Contenu de l’enseignementCe module vise à comprendre les mécanismes toxiques à l’échelle de différents or-gane.s/système.s et les conséquences pathologiques d’une exposition à un agent

Ue 4

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PAGE 15 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Ue 6

AnglaisApplied english

Responsable : Philippe Torres

Compétences viséesEn fin de Master, on vise le niveau de compétence B2 du Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL) qui est résumé comme suit : « Peut comprendre le contenu essentiel de sujets concrets ou abstraits dans un texte complexe, y com-pris une discussion technique dans sa spécialité. Peut communiquer avec un degré de spontanéité et d’aisance tel qu’une conversation avec un locuteur natif ne comporte de tension ni pour l’un ni pour l’autre. Peut s’exprimer de façon claire et détaillée sur une grande gamme de sujets, émettre un avis sur un sujet d’actualité et exposer les avantages et les inconvénients de différentes possibilités. »

Contenu de l’enseignement Permettre aux étudiants de continuer à travailler les cinq compétences en langue - compréhension écrite et orale, expression écrite et orale, et interaction orale - à travers des supports authentiques (articles, documentaires, documents audio et vidéo d’inter-net, graphiques…) et des activités variées (exercices de compréhension, d’expression

Analyses de données Data analysis

Responsable : Olivier Pays-VolardIntervenant : Olivier Pays-Volard

Compétences visées― Connaître la démarche d’un test d’hypothèses statistiques. Connaître les quelques lois fondamentales (Loi Normale…), Savoir manipuler un jeu de données et extraire des descripteurs clefs d’un jeu de données (moyenne, médiane, variance, écart-type…), Renforcer les acquis sur les bases nécessaires pour réaliser des analyses statistiques appliquées aux sciences environnementales, S’initier à la modélisation statistique.

Contenu de l’enseignement ― Description des tests statistiques classiques (paramétriques, non-paramétriques, analyses multivariées…). ― Initiation à la modélisation statistique. ― Construire un modèle linéaire à effets fixes (Régression linéaire, régression multiple, analyse de variance à un facteur et deux facteurs, analyse de covariance).― Transformation des variables pour respecter les conditions d’application des procé-dures.― Tester les interactions entre variables.― Estimateur d’ajustement de modèle et de robustesse.― Validation du modèle et Examen des résidus

Ue 5

chimique. Un bref rappel anatomique, histologique et physiologique précédera des exemples concrets d’action toxique d’agents chimiques d’origine professionnelle et en-vironnementale. Les méthodes d’investigation propres à chaque organe seront présen-tées dans le cas notamment de neurotoxicité, d’hépatotoxicité, de néphrotoxicité, de pneumotoxicité.

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Ue 7

Projet personnel professionnel de l’étudiantStudent professional project

Intervenants : Virginie Grimault, Philippe Torrès

Contenu de l’enseignement ― Ateliers du SUIO-IP : « Trouve ton stage », « Talents, compétences, soft skills ».― Construire son CV et sa lettre de motivation en français et en anglais. ― Prendre contact téléphoniquement pour obtenir un rendez-vous. ― Simuler un entretien en langue anglophone.

PAGE 16 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

écrite, jeux de rôle, débats, présentations orales…) ; étoffer les connaissances lexicales dans le domaine de l’environnement ; améliorer la prononciation et revoir certains points de langue le cas échéant.

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Ue OPTIONNELLES

Groupe d’options au choix (8 ects)

Pharmacologie (Tronc commun M1 Bio-santé)Pharmacology

Responsable : Hélène Tricoire-LeignelIntervenants : César Mattei, Hélène Tricoire-Leignel, Camille Savary, Samuel Legeay

Compétences visées― Maîtriser les concepts généraux de pharmacologie : les cibles de médicaments, le développement d’un médicament, les différents-types de récepteurs, les cibles théra-peutiques, la signalisation intracellulaire, les agonistes et antagonistes― Comprendre l’activité d’une biomolécule et son interaction avec son récepteur. Être en mesure de caractériser la relation ligand-récepteur : affinité, sélectivité, Ka, Kd, kon, koff, effet maximal, Ki.― Maîtriser les principales techniques et démarches expérimentales permettant de mettre en évidence les relations ligand-récepteur.― Connaître la structure et la pharmacologie des RCPG, canaux ioniques, récep-teurs-enzymes, récepteurs nucléaires.― Introduire les lois de la pharmacodynamie.― Se familiariser avec la pharmacochimie et la pharmacocinétique. ― Acquérir des connaissances de base sur les méthodes d’études précliniques d’un médicament.― Se familiariser avec des exemples physiopathologiques par la description de l’activité d’un médicament.

Contenu de l’enseignement Médicament, interaction ligand-récepteur, marge thérapeutique, concentration efficace 50, efficacité, pharmacocinétique, pharmacodynamie, agonistes, antagonistes, santé publique, AMM, cible thérapeutique, toxicité, criblage, essai et phases cliniques, loi d’action de masse, affinité, tests de liaison (saturation, inhibition, …) distribution, mé-tabolisme, absorption, relation dose-effet, effets indésirables.

TOXICOLOGIE

PAGE 17 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Prolifération cellulaire, apoptose, oncogènes 1Cell proliferation, apoptosis, oncogenes 1

Responsable : Olivier CoqueretIntervenants : Olivier Coqueret, Benjamin Barré

Compétences visées― Maitriser les mécanismes moléculaires qui régulent la prolifération cellulaire.― Identifier les principales altérations de la prolifération cellulaire qui peuvent être à l’origine du phénomène de cancérisation.― Connaitre les principaux oncogènes et les gènes suppresseurs de tumeurs ainsi que leur rôle dans le maintien de l’intégrité du génome.

Ue 8

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Altération génomique et pharmacogénomiqueGenomic alteration & pharmacogenomics

Responsable : Alain MorelIntervenants : Alain Morel, Benjamin Barré

Compétences visées et contenu de l’enseignement― Comprendre l’impact de la structure du génome sur la physiopathologie humaine. ― Appréhender l’ensemble des approches permettant de caractériser les altérations génétiques et de leur expression.― Identifier les avantages et limites de chacune d’entre elles. ― Comprendre l’impact des altérations sur l’expression de gènes et les altérations phénotypique associées. ― Être capable de comprendre et de maitriser les moyens d’altérer ou de corriger les génomes.

ÉCOTOXICOLOGIE

Biologie et génétique des populations Population biology & genetics

Responsable : Olivier Pays-VolardIntervenants : Christophe Lemaire, Olivier Pays-Volard

Compétences visées ― Appréhender les outils permettant de caractériser la structure d’une population c.a.d. des éléments structurants jusqu’au fonctionnement. ― Comprendre les variations d’abondance et les facteurs impliqués dans la régulation des populations et métapopulations. ― Comprendre les forces évolutives dans la variation génétique des populations (dé-rive, mutation, migration, sélection) et leur rôle. ― Résoudre des problèmes simples de génétique des populations et aborder une ques-tion écologique sous l’angle de la génétique des populations..

Contenu de l’enseignement― Structure et fonctionnement démographique d’une population Age des individus dans une population, Tables et Courbes de survie, Lois de croissance, Matrices de Leslie, Stratégie de reproduction (r,k), Fluctuations d’abondance (régu-lières, irrégulières…), Facteurs indépendants et dépendants (compétitions, prédation…) de la densité, Régulation bottom-up et top down, Métapopulations (concept, modèles simples, structures et fonctionnements). ― Génétique des populations et les quatre forces évolutives Dérive génétique (effet des tailles de populations, mécanisme probabiliste). Effet de la consanguinité (autofécondation, effet Walhund), diversité génétique, structure géné-tique des populations.

― Être capable d’expliquer les mécanismes de protection cellulaire tels que l’apoptose et la sénescence.

Contenu de l’enseignement Mécanismes moléculaires régulant la prolifération cellulaire et ses dérégulations.Principaux oncogènes, gènes suppresseurs de tumeurs et mécanismes de protection apoptotique.

PAGE 18 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Page 20: Toxicologie environnementale et humaine

Migration : flux de gènes. Modèles ile-continent, modèle en iles de Wright, modèle en pas japonais. Généralisation aux matrices de migrations. Mutations réversibles et irréversibles (fréquences d’équilibre). Sélection : modes de sélection (additivité, dominance, récessivité, super- et sous-do-minance). Équilibres entre les différentes forces (migration-dérive, sélection-dérive, mutation-sé-lection).

Géochimie des milieux aquatiquesGeochemistry of marine & aquatic environment

Responsables : Édouard Metzger, Aurélia Mouret

> Fonctionnement biogéochimique des milieux aquatiques et marins

Compétences visées ― Comprendre les flux d’éléments nutritifs et contaminants qui contrôlent les écosys-tèmes. ― Appréhender les évolutions géochimiques des habitats benthiques et planctoniques en domaine océanique franc, côtier (plage, estuaire, lagune) et lacustre, en réponse aux variations hydro-météorologiques (par ex. courants marins, vents, vagues, marée) et climatologiques (par ex. saisons, sècheresse).

Contenu de l’enseignement― Présenter les cycles géochimiques des éléments majeurs (N, P, Ca, C, Si...) et traces (Cd, Pb...) dans l’environnement et leurs interactions dans le cycle de la matière or-ganique. ― Analyser les processus géochimiques à l’interface eau/sédiment et continent/océan. Caractériser les habitats aquatiques et la variabilité temporelle et spatiale des para-mètres physico-chimiques qui les définissent.

PAGE 19 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Page 21: Toxicologie environnementale et humaine

Ue 1

Ue 2

SEMESTRE 2

Toxicologie 2Toxicology 2

Responsable : César MatteiIntervenants : César Mattei, Claire Campion

Compétences visées― Savoir analyser des données scientifiques relatives aux toxines, du producteur à la molécule. ― Maîtriser les principales toxines et leurs producteurs et les cibles associées.― Caractériser le rôle d’une toxine animale dans une stratégie de défense/envenima-tion. ― Mettre en perspective l’effet de cette toxine sur son récepteur, les organes affectés et le tableau symptomatologique.― Maîtriser la notion de toxine dans sa globalité [producteur, fonction, structure chimique, cible, effets, DL50]. ― Comparer les effets de toxines ciblant le même récepteur (exemple du canal sodium). ― Savoir caractériser les effets d’une toxine en analysant des données de la littérature.― Être à même d’associer une toxine avec la maladie humaine dont elle est respon-sable, en sachant identifier les modes de contamination, les effets cellulaires et tissu-laires d’une toxine et ses conséquences sur la santé.― Appréhender les usages traditionnels, présents et en développement des toxines, connaître celles qui ont obtenu une autorisation de mise sur le marché et les aires thérapeutiques concernées.

Contenu de l’enseignement Définition d’une toxine, caractéristiques en termes de producteur, structure chimique, mode de transmission, interaction toxine/récepteur, effets sur l’homme. Toxines fon-giques : classification, types de toxines, phytotoxines, mycotoxines (muscarine), syn-drome phalloïdien. Toxines bactériennes : germes impliqués dans des pathologies, inoculum, cibles physiologiques, toxines protéiques (structure, récepteur), maladies humaines (tétanos, coqueluche, diphtérie), traitement. Toxines animales : producteurs venimeux et vénéneux, toxines peptidiques et non-peptidiques, spécificité de l’interac-tion toxine/récepteur, vectorisation des toxines animales en médicament. Toxines vé-gétales : des micro-algues aux plantes toxiques, alcaloïdes végétaux, principaux effets des intoxications, usage thérapeutique des toxines végétales.

Ue OBLIGATOIRES

Écotoxicologie 2Ecotoxicology 2

Responsable : Amélie ChâtelIntervenants : Amélie Châtel, Françoise Montrichard, Jean Secondi

Contenu de l’enseignement ― Méthodes d’évaluation de la génotoxicité. ― Impacts des polluants sur les amphibiens. Pollution lumineuse. ― Signalisation et régulation des espèces réactives de l’oxygène.

PAGE 20 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Page 22: Toxicologie environnementale et humaine

Ue 3

Ue 4

Analyse des micropolluants organiques et minérauxOrganic & inorganic micropollutant analysis

Responsable : Nicolas Zigon

Compétences viséesConnaitre les principales méthodes instrumentales dédiées spécifiquement à l’analyse quantitative et de détection présentes dans les laboratoires d’analyse des secteurs de l’industrie chimique et pharmaceutique ainsi que dans les sciences de l’environnement.

Contenu de l’enseignement Absorption atomique et ICP ; méthodes chromatographiques et électrophorétiques ; Quantification par étalonnages interne/externe ; Spectrométrie de Masse : notions d’isotopie, de résolution..., présentation des types de sources et analyseurs ; principe de la spectrométrie de masse en tandem ; principales réactions de fragmentation ; interprétation de spectres.

AnglaisApplied english

Responsable : Philippe Torres

Compétences viséesEn fin de Master, on vise le niveau de compétence B2 du Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues (CECRL) qui est résumé comme suit : « Peut comprendre le contenu essentiel de sujets concrets ou abstraits dans un texte complexe, y com-pris une discussion technique dans sa spécialité. Peut communiquer avec un degré de spontanéité et d’aisance tel qu’une conversation avec un locuteur natif ne comporte de tension ni pour l’un ni pour l’autre. Peut s’exprimer de façon claire et détaillée sur une grande gamme de sujets, émettre un avis sur un sujet d’actualité et exposer les avantages et les inconvénients de différentes possibilités. »

Contenu de l’enseignement ― Permettre aux étudiants de continuer à travailler les cinq compétences en langue - compréhension écrite et orale, expression écrite et orale, et interaction orale - à travers des supports authentiques (articles, documentaires, documents audio et vidéo d’inter-net, graphiques…) et des activités variées (exercices de compréhension, d’expression écrite, jeux de rôle, débats, présentations orales…). ― Étoffer les connaissances lexicales dans le domaine de l’environnement. ― Améliorer la prononciation et revoir certains points de langue le cas échéant.

PAGE 21 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Toxicologie des addictions, toxicologie alimentaireAddiction & food toxicology

Responsable : César MatteiIntervenants : César Mattei, Hélène Tricoire-Leignel

Compétences visées― Comprendre les mécanismes inhérents au phénomène d’addictions chimiques.― Identifier les différents agents responsables de l’absence d’innocuité des aliments.

Contenu de l’enseignement Addiction à l’alcool, à la nicotine et aux opiacés. Principes généraux de toxicologie alimentaire. Rappel de la physiologie gastro-intesti-nale et mécanismes d’absorption. Grands groupes de toxiques alimentaires. Les addi-tifs alimentaires et les conservateurs : législation, DJA, controverses.

Ue 7

Page 23: Toxicologie environnementale et humaine

StageInternship

Responsable : Hélène Tricoire-Leignel

Contenu de l’enseignement Mener à bien un projet d’insertion pré-professionnelle cohérent avec la formation et les objectifs de l’étudiant. Faire preuve de savoir-être dans la structure d’accueil (compor-tement et motivation, tenue, ponctualité et assiduité, relation avec les usagers, rapports avec la hiérarchie et capacité d’interaction, rapports avec ses collègues, capacité à sollici-ter les informations). Mobiliser les compétences et les savoirs au profit de la mission qui sera confiée (efficacité, méthode et organisation, adaptation du niveau de connaissance à la mission, faculté d’adaptation et compétences mises en œuvre, autonomie, rigueur et fiabilité, progression au cours du stage, qualité des documents produits dans la rédac-tion, le contenu technique et la clarté).

Ue 5

PAGE 22 l CONTENU DES ENSEIGNEMENTS

Page 24: Toxicologie environnementale et humaine

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Adaptations physiologiques aux contraintes environnementales Physiological adaptations regarding environmental constraints

Responsable : Hélène Tricoire-LeignelIntervenants : Vincent Leignel, Hélène Tricoire-Leignel

Compétences visées― Maîtriser les concepts de régulations physiologiques des organismes en conditions extrêmes. ― Connaître les différents niveaux d’identification d’une adaptation d’un organisme dans un milieu extrême donné.

Contenu de l’enseignement Réponses des organismes aux conditions extrêmes : concepts généraux et approches méthodologiques, études de cas :― Températures extrêmes : stratégies et adaptations physiologiques et moléculaires permettant d’éviter ou de tolérer le gel, les températures polaires et désertiques.― Dessiccation : adaptations physiologiques et moléculaires permettant d’éviter ou de tolérer les pertes d’eau corporelle (modifications des téguments, anhydrobiose, cryp-tobiose, régulations physiologiques et comportementales...).― Conditions abyssales et hydrothermales profondes : adaptations moléculaires à l’hy-poxie, à la pression hydrostatique, aux contaminations métalliques, à l’émission de soufre, au gradient de température, à l’absence de lumière.

Prolifération cellulaire, apoptose, oncogènes 2Cell proliferation, apoptosis, oncogenes 2

Responsable : Olivier CoqueretIntervenants : Olivier Coqueret, Benjamin Barré

Compétences visées― Maitriser les mécanismes moléculaires qui régulent la prolifération cellulaire.― Identifier les principales altérations de la prolifération cellulaire qui peuvent être à l’origine du phénomène de cancérisation.― Connaitre les principaux oncogènes et les gènes suppresseurs de tumeurs ainsi que leur rôle dans le maintien de l’intégrité du génome.― Être capable d’expliquer les mécanismes de protection cellulaire tels que l’apoptose et la sénescence.

Contenu de l’enseignement Mécanismes moléculaires régulant la prolifération cellulaire et ses dérégulations.Principaux oncogènes, gènes suppresseurs de tumeurs et mécanismes de protection apoptotique.

Ue OPTIONNELLES

Ue 8

Options au choix (9 ects)

Page 25: Toxicologie environnementale et humaine

Bioindicateurs des milieux aquatiques Bio-indicators for marine & aquatic environments

Responsable : Emmanuelle Geslin

Compétences visées― Développer l’esprit critique des étudiants par rapport aux différents outils utilisés pour évaluer la qualité des environnements aquatiques afin qu’ils puissent être prêts à définir un plan de surveillance d’un milieu.― Savoir manier quelques indices biotiques employés dans le suivi de la qualité du milieu (eaux douces, eaux intermédiaires, eaux marines).

Contenu de l’enseignement ― Présenter les principes des différents moyens de suivi de la qualité des milieux en mettant l’accent sur les avantages et les inconvénients de chacun. ― Présenter globalement les différentes méthodes de bio-indication en milieu aqua-tique (indices biotiques, bio-essais, bio-accumulateurs…).

Écologie des communautésCommunauty ecology

Responsable : Olivier Pays-VolardIntervenants : Aurélie Davranche, Sébastien Maugenest, Alain Pagano, Olivier Pays-Volard

Compétences visées― Appréhender les outils permettant de caractériser la structure d’une communauté qu’elle soit animale ou végétale. ― Savoir identifier la nature des principales relations entre groupes d’organismes (et populations) pluri-spécifiques et comprendre le fonctionnement des communautés.

Contenu de l’enseignement ― Structure et fonctionnement des communautés animales Caractéristiques des communautés (Richesse et diversité spécifique, indice de domi-nance, comparaison de niches…), Compétition interspécifique (Modèles mathématiques d’exclusion réciproque et de coexistence, Ségrégation et partage des ressources, Conséquences évolutives…), Les interactions prédateurs proies (Modèles d’optimal fo-raging et variation du régime alimentaire, Les réponses fonctionnelles, numériques et écologiques, Rôle limitant de la prédation, Conséquences écologiques et évolutives), Les interactions hôte-parasite (Modèles mathématiques et rôle limitant du parasitisme). ― Structure et fonctionnement des communautés végétales Les successions écologiques (Dynamique, Structuration, Zonation écologique, Commu-nauté fermée et ouverte), Théorie de la niche intermédiaire, Fondements de la synsys-tématique et la syntaxinomie, Détermination des communautés végétales, Dynamique des groupements végétaux, Valeurs indicatrices d’Ellenberg, Exemples concrets sur la végétation des prairies humides angevines.

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Technique d’inventaire, indices qualités environnementales Biodiversity survey techniques, environment quality index

Responsable : Jean SecondiIntervenants : Séverine Chauvet, Hervé Daniel, Philippe Frin, Stéphanie Hudin, Jean Secondi, Jessica Vizinet, Intervenants extérieurs

Compétences visées― Connaître les principes généraux des inventaires en écologie et des études de suivi des populations et des peuplements. ― Connaître les différentes approches de caractérisation de l’environnement des zones humides et les principales méthodes normalisées d’inventaire en rivière. ― Connaître les différentes approches de quantification de la qualité des milieux et leurs intérêts respectifs pour être en mesure de sélectionner la combinaison de tech-niques nécessaires à la mise en place d’un programme d’étude ou de suivi.

Contenu de l’enseignement ― Techniques d’inventaire (27h) L’objectif est d’acquérir les principes d’échantillonnage de la biodiversité et les mé-thodes d’estimation. Seront traitées les questions suivantes Quelles sont les différentes approches pour estimer la biodiversité à différentes échelles ? Comment estimer la taille d’une population et sa tendance démographique. Comment appliquer les prin-cipes d’échantillonnage pour les inventaires botaniques dans les zones humides. ― Indices de qualité environnementale (27h) L’objectif est de comprendre comment les principes d’échantillonnage et les méthodes d’inventaire ont été utilisés pour développer des méthodes de caractérisation de la qualité de l’environnement. Seront développées les différentes approches d’évaluation (physiques, physico-chimiques, biotiques) ainsi que les méthodes normalisées sur des groupes spécifiques ainsi que les méthodes multi-critères en cours de développement pour l’évaluation environnementale des milieux aquatiques et des zones humides. Une part importante de cet enseignement sera donnée par des professionnels du domaine concerné.

SIG (Système d’Information Géographique)GISResponsable : Pierre-Cyril Renaud

Compétences visées― Connaitre les différentes sources d’information géographique. ― Être capable de définir les données géographiques et leurs formats nécessaires à la résolution d’une problématique particulière. ― Comprendre les structures, concepts et théories de base des SIG. ― Développer des compétences pour résoudre des problèmes et utiliser un raisonne-ment analytique à l’aide de données géographiques. ― Apprendre à utiliser les outils informatiques et l’analyse spatiale pour modéliser le monde réel. ― Apprendre à penser spatialement.

Contenu de l’enseignement Aspects théoriques de l’utilisation des systèmes d’information géographique et mise en pratique sur des problématiques de contamination environnementale.

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Administration ı Scolarité ı Enseignement (Amphi A à E)Biologie végétale ı Physiologie végétale ı Travaux pratiques biologieTravaux pratiques biologieTravaux pratiques chimieDépartement de Géologie ı Recherche environnement (LETG -LEESA) ı Recherche géologie (LPGN-BIAF)Travaux pratiques physiqueEnseignement ı Travaux pratiques physiqueDépartement de Physique ı Recherche physique (LPHIA)Travaux pratiques biologieDépartement de Biologie ı Recherche neurophysiologie (SIFCIR) ı Travaux pratiques biologie, géologieDépartement Informatique ı Recherche Informatique (LERIA) ı Travaux pratiques géologieDépartement Mathématiques ı Recherche Mathématiques (LAREMA)Chimie enseignement ı Travaux pratiquesDépartement de Chimie ı Recherche Chimie (MOLTECH Anjou)Espace multimédia ı Enseignement (Amphi L001 à L006) ı Salle d’examen rez-de-jardin

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