Sélection des souches rhizobiennes efficientes ...· CCIR Cellule corticale infectée par les...

download Sélection des souches rhizobiennes efficientes ...· CCIR Cellule corticale infectée par les rhizobactéries

of 95

  • date post

    16-Sep-2018
  • Category

    Documents

  • view

    213
  • download

    0

Embed Size (px)

Transcript of Sélection des souches rhizobiennes efficientes ...· CCIR Cellule corticale infectée par les...

  • UNIVERSITE KASDI MERBAH-OUARGLA

    Facult des Sciences de la Nature et de la Vie

    Dpartement des Sciences Biologiques

    Mmoire :

    MASTER ACADEMIQUE

    Prsent par :

    RAMDANE Iman

    BOUKARANA Iman Khaoula

    Thme :

    Soutenu publiquement

    Le : 31/05/2016

    Devant le jury :

    M. SLIMANI Nour eddine M.C.B Prsident UKMOuargla

    M. AZIB Salim M.A.A. Promoteur UKMOuargla

    Melle SALHI Nesrine M.C.A Examinateur UKMOuargla

    Anne Universitaire : 2015/2016

    Domaine : Sciences de la Nature et de la Vie

    Filire: Sciences Biologiques

    Spcialit : Biotechnologie vgtale

    Slection des souches rhizobiennes efficientes,

    autochtones de la rgion de Ghardaa, nodulant la

    luzerne (Medicago sativa L.)

  • Ddicaces

    Nous ddions ce travail :

    Nos trs chers parents que nous aimons le plus au monde

    Pour leur encouragement illimit, et pour leurs sacrifices normes.

    Aucun mot ne serait suffisant pour les remercier.

    QuALLAH les protge et les garde.

    A nos surs et frres pour leurs soutiens

    A toutes nos familles

    A nos amis en souvenirs des bons moments passs ensemble

    Merci tous et toutes.

    BOUKARANA imane et

    RAMDANE imane.

  • Remerciements

    Nous voulons exprimer par ces quelques lignes de remerciements notre gratitude envers

    tous ceux en qui par leur prsence, leur soutien, leur disponibilit et leurs conseils, nous avons

    eu courage daccomplir ce projet.

    Nous commenons par remercier M. AZIB Salim qui nous a fait lhonneur dtre notre

    encadreur. Nous le remercions profondment pour son encouragement continu et aussi dtre

    toujours la pour nous aider et nous guider retrouver le bon chemin par sa sagesse et ses

    prcieux conseils.

    Nous adressons nos remerciements galement aux membres de jury pour nous avoir fait

    lhonneur dexaminer et dvaluer notre travail : M. SLIMANI Nour eddine; prsident du jury

    et Mlle. SALHI Nesrinr; examinatrice de ce travail.

    Nous noublions pas dadresser nos vifs remerciements au responsable du laboratoire de

    microbiologie pour son aide ainsi que toutes les quipes du laboratoire de contrle de qualit

    des produits alimentaires(Ouargla).

    Nous tenons remercier toute lquipe de lANRH, Agence national des ressources hydrique.

    Ouargla.

    Nous tenons remercier galement, M. El-haddad djillali, doctorant en cologie des

    systmes vectoriels, facult des sciences, Universit Mhamed bougurra. Boumerdes.

    Un grand merci Mme Boukarana wafa, doctorante en microbiologie. Alger. Et mme

    Dr- babeziz, laboratoire danalyse mdical (Ouargla). Et Mlle. Zoubida, surveillance gnrale

    du paramdical, Ouargla.

    Nous remercions galement, M. BOUMAAKAL (TASS), technicien suprieur de la

    sant, et aussi Dr Dada moussa, chef de laboratoire central, hpital Mohamed boudiaf.

    Ouargla.

    Nous oublier toutes les quipes des laboratoires pdagogiques de luniversit Kasdi

    Merbah, Ouargla.

  • Liste des abrviations

    GA Acides gibbrellique

    AIA Acide-indole-actique

    PG Polygalacturonase

    ADN Acide dsoxyribonuclique

    ADNr Acide Dsoxyribonuclique ribosomique

    ATP Adnosine Triphosphate

    CCIR Cellule corticale infecte par les rhizobactries

    CCS Cellule corticale racinaire saine

    DO Densit optique

    H3O+Cl

    - Acide Chlorhydrique

    LCO Lipochitinooligosaccharides

    INRA Institut national de la recherche agronomique

    N2 azote gazeux

    N2O Oxyde dazote

    NA Nodule actif

    NaCl Chlorure de sodium

    NH3 Ammoniac

    NH4+ Ammonium

    NIA Nodule inactif

    NO2- Nitrite

    NO3- Nitrate

    Nod nodulation

    G Ghardaa

    % Pourcentage

    pH Potentiel hydrique

    PS Partie souterraine

  • PA Partie arienne

    S Sinorhizobium

    Gx Grossissement

    S.R Souche rfrence

    tr/mn Tour par minute

    YMA Yeast Manitol Agar

    YMB Yeast Manitol Broth

    m Micromtre

    oC degr Celsius

    L. Line

    mM millimole

    cm centimtre

    g Gramme

    l Littre

    SNV Science de nature et de la vie

    BNL Bactries nodulant les lgumineuses

    CA-S.F.M Comit de lantibiogramme de la Socit Franaise de la

    Microbiologie

    T Tmoin

    L Microlitre

    FAO Organisation des Nations Unies pour lalimentation et

    lagriculture

    r Coefficient de corrlation

    mm millimtre

  • Liste des tableaux

    Tableau 1. Stades physiologiques de la luzerne. ........................................................................ 9

    Tableau 2. Espces de Sinorhizobium ...................................................................................... 11

    Tableau 3. Les principales diffrences entre les types de nodule indtermin et dtermine. 16

    Tableau 4. Liste des antibiotiques utiliss dans notre tude ..................................................... 26

    Tableau 5. Corrlation entre la nodulation et les diffrents paramtres tudis ....................... 33

    Tableau 6. Croissance des souches sur milieu solide 0mM dNaCl. ..................................... 35

    Tableau 7. Croissance des souches sur milieu solide 40mM dNaCl. ................................... 35

    Tableau 8. Croissance des souches sur milieu solide 80Mm dNaCl. ................................... 36

    Tableau 9. Croissance des souches sur milieu solide 160mM dNaCl. ................................. 37

    Tableau 10. Croissance des souches sur milieu solide 320mM dNaCl. ............................... 38

    Tableau 11. Croissance des souches sur milieu solide 640mM dNaCl. ............................... 39

    Tableau 12. Croissance des souches sur milieu solide 1280mM dNaCl. ............................. 40

    Tableau 13. Croissance des souches sur milieu solide T = 4C ............................................ 42

    Tableau 14. Croissance des souches sur milieu solide T = 28C .......................................... 43

    Tableau 15. Croissance des souches sur milieu solide T = 37C .......................................... 43

    Tableau 16. Croissance des souches sur milieu solide T = 45C .......................................... 44

    Tableau 17. Croissance des souches sur milieu solide pH = 4 .............................................. 45

    Tableau 18. Croissance des souches sur milieu solide au pH= 5 ............................................. 46

    Tableau 19. Croissance des souches sur milieu solide au pH= 6. ............................................ 47

    Tableau 20. Croissance des souches sur milieu solide au pH= 6.8 .......................................... 48

    Tableau 21. Croissance des souches sur milieu solide au pH= 8 ............................................. 49

    Tableau 22. Croissance des souches sur milieu solide au pH= 9 ............................................. 50

    Tableau 23.Slection les souches les plus efficientes par rapport aux paramtres tudies. ... 54

  • Liste des figures

    Figure 1. Cycle de lazote .......................................................................................................... .3

    Figure 2. Fixation symbiotique de lazote atmosphrique ......................................................... 5

    Figure 3. Formation dun nodule induit par rhizobium ............................................................ 15

    Figure 4. Architecture de nodule dtermin et indtermine. .................................................. 16

    Figure 5. Description du dispositif exprimentale. .................................................................. 20

    Figure 6. Effet des souches sur la croissance des parties ariennes. ........................................ 27

    Figure 7. Effet des souches sur la croissance de la partie souterraine. ..................................... 28

    Figure 8. Biomasse sche arienne (g/plante) de la luzerne. .................................................... 29

    Figure 9. Biomasse sche racinaire (g/plante) de la luzerne. ................................................... 30

    Figure 10. Leffet des souches bactriennes sur le nombre des nodules. ................................. 31

    Figure 11. Nombre des nodules actifs en fonction des diffrentes souches examines. .......... 32

    Figure 12. Effet de la salinit sur la croissance des souches 0mM. ....................................... 34

    Figure 13. Effet de la salinit sur la croissance des souches 40Mm. ..................................... 35

    Figure 14. Effet de la salinit sur la croissance des souches 80mM dNaCl. ........................ 36

    Figure 15. Effet de la salinit sur la croissance des souches 160Mm. ................................... 37

    Figure 16. Effet de la salinit sur la croissance des souches 320Mm. ................................... 38

    Figure 17. Effet de la salinit sur la croissance des souches 640mM. ................................... 39

    Figure 18. Effet de la salinit sur la croissance des souches 1280mM. ................................. 40

    Figure 19. Effet de la temprature sur la croissance des souches 4C. ................................. 41

    Figure 20. Effet de la temprature sur la croissance des souches 28C. ............................... 42

    Figure 21. Effet de la temprature sur la croissance des souches 37C. ............................... 43

    Figure 22. Effet de la temprature sur la croissance des souches 45C. ............................... 44

    Figure 23. E