Salmon Elles

download Salmon Elles

of 71

  • date post

    04-Apr-2018
  • Category

    Documents

  • view

    217
  • download

    0

Embed Size (px)

Transcript of Salmon Elles

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    1/71

    H. Gonsu

    FMSB / CHUY

    SALMONELLES

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    2/71

    Objectifs

    Expliquer la taxonomie ancienne et rcente du genreSalmonella

    Spcifier les caractres bactriologiques, biochimiques,pharmacologiques du genre Salmonella

    Prsenter quelques donnes pidmiologiques

    Expliquer les mcanismes de virulence des principauxpathognes

    Prsenter les tableaux cliniques des fivres typhodes et

    des autres salmonelloses

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    3/71

    Plan

    I- Gnralits :

    I-1- Dfinition et intrtI-2- Historique

    I-3- Rappels sur les mthodes de diffrentiation infra- spcifique desespces

    II- Taxonomie

    III- Caractres bactriologiques

    IV- Fivres typhodes

    V- Salmonelloses non typhodiques

    VI- Diagnostic biologique

    VII- Traitement curatif et prvention

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    4/71

    Dfinition et intrt

    Salmonella :

    Genre bactrien de la famille des Enterobacteriaceae, constitu

    de bacilles Gram ngatif, le plus souvent mobiles, pathognes

    pour lhomme et les animaux

    Intrt :

    Ce genre regroupe de nombreuses espces pathognes pour

    lhomme, agents des fivres typhodes, fivres paratyphodes,

    et dautres salmonelloses communes lhomme et lanimal

    Ces maladies sont des maladies du pril fcal et peuvent tre

    prvenues par lapplication de mesures particulires dhygine

    et salubrit

    Elles sont responsables dpidmies parfois trs importantes

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    5/71

    Historique

    1813 : individualisation de la fivre typhode sur la base des signes cliniques etlsions ulcreuses de lintestin par Petit et Serres

    1868 : MEE du rle de leau de boisson dans sa dissmination parPettenkoffer

    1880 : Dcouverte de lagent de la fivre typhode par Eberth, dans les coupeshistologiques de ganglions lymphatiques de malades morts de cette maladie

    1884 : Culture de la bactrie par Gaffky

    1896 : MEE de la diversit antignique des souches de salmonelles par Widal

    1918 : Etude spare des Ag somatiques O, flagellaires H, et de surface Vi parWeil, Flix, Mitzemacher

    1926 : Inventaire de la diversit antignique de ces bactries, maintenant

    regroupes dans le genre Salmonella par White cette date. Kauffmann,puis Le Minor y ont contribu plutard

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    6/71

    Mthodes phnotypiques de diffrentiation

    infra- spcifiques

    Elles sont essentiellement voues au marquage pidmiologique etpermettent le diagnostic despce des bactries responsablesdinfection. Lon en dnombre plusieurs parmi lesquelles les 2dernires mthodes ci- dessous cites nous intressentparticulirement dans le cadre de cet expos

    1- La biotypie : Consiste tudier pour 1 souche donne 1 crible decaractres biochimiques variables au sein de sa propre espce dontle profil dtermine 1 biovar

    2- La bactriocynotypie : Limite quelques espces. Elle est basesur lutilisation de bactriocines (produits inhibiteurs voirebactricides, de nature protique ou peptidique (30 70 kDa),synthtiss par des bactries productrices insensibles leurs effetsmais actifs sur dautres souches de la mme espce ou despcesvoisines)

    3-Analyses biochimiques particulires : ltude des constituants de la

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    7/71

    Mthodes phnotypiques de diffrentiation

    infra- spcifiques

    4- Srotypie :Mthode de marquage des espces bactriennes base sur la

    dtermination dantignes de surface (capsulaires, paritaux ouflagellaires) laide dantisrum spcifiques.

    Elle demeure encore la mthode de de choix du marquage infra-

    spcifique des salmonelles (mais aussi du mningocoque,pneumocoque, et du bacille pyocyanique)

    5- Lysotypie :

    Permet de distinguer au sein d1 mme espce bactrienneprdfinie de bactriophages connus, l(es) ventuel(s)phage(s) susceptibles de lyser la souche tudie. Ces virusbactriens ont besoin pour leur attachement de rcepteursspcifiques gntiquement caractriss.

    Elle consiste donc tudier la sensibilit ou la rsistance des

    souches 1 srie de bactriophages slectionns

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    8/71

    Mthodes phnotypiques de diffrentiation

    infra- spcifiques

    Les phages utiliss peuvent tre ;

    Virulents ou lytiques : linfection d1 cellule entrane lamort cellulaire et la production de nouveaux phages qui

    rinfectent dautres cellules. Ceci se traduit par laformation de plage ou linhibition de la croissancebactrienne

    Temprs : leur ADN intgre le gnome bactrien, serfrant ltat lysogne ; 1 petite portion de cellules htesinduisent naturellement les gnes du phage et la librationdes phages intervient.

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    9/71

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    10/71

    Mthodes phnotypiques de diffrentiation

    infra- spcifiques

    70% des isolats se rpartissent seulement en 3 lysotypes (A,E1, et C1)

    Ce qui explique le systme de lysotypie complmentaire dusrotype typhimis au point par Nicolle, et compos de 13bactriophages non adapts Vi, subdivisant le groupe A, leplus frquent, en 10 sous- lysotypes

    2me systme :

    Publi en 1951 par Flix et Callow

    Permet de typerSalmonella srotype paratyphi B

    Compos de 12 bactriophages adapts et non adapts etreconnat 48 lysotypes

    3me systme :

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    11/71

    Taxonomie

    Rgne Bacteria

    Embranchement Proteobacteria

    Classe Gamma Proteobacteria

    Ordre Enterobacteriales

    Famille Enterobacteriaceae

    Genre Salmonella

    Espce 2 espces (actuellement) et plusieurs

    sous- espces

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    12/71

    Entrobactries : Principaux genres

    Salmonella

    Shigella

    Escherichia

    Edwardsiella

    Citrobacter

    Klebsiella

    Enterobacter

    Hafnia

    Panoea

    Serratia

    Proteus

    Morganella

    Providencia

    Yersinia

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    13/71

    Genre Salmonella

    Ancienne taxonomie ;

    Base sur des tests biochimiques et de srotypie

    En sappuyant sur les diffrents facteurs antigniques O (somatiquesparitaux) et H (flagellaires appartenant aux 2 phases possibles, H1et H2), Kauffmann et White ont propos 1 shma srotypique d1extrme richesse

    Concept : 1 srotype, 1 espce propos par Kaufmann sur la basede lidentification srologique des antignes somatique O et flagellaireH

    Ce type de classification conduisait reconnatre 2463 espces desalmonelles en 1998 et davantage aujourdhui car 26 srovars ontt identifis en 1999

    La nomenclature complte des Salmonella se dcline en Genre,es ce trs nombreuses sous- es ce srovar

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    14/71

    Genre Salmonella : taxonomie

    Nouvelle taxonomie :

    Base sur des mthodes molculaires

    Dfinit - 1 genre- 2 espces : S. enterica et S. bongori. Lespcebongori a pour habitat uniquement les animaux.

    - 6 sous- espces de lespce enterica : S. enterica, S.salame; S. arizonae ; S. diarizonae; S. houtenae ; S. indica.

    La 1re

    a pour habitat lhomme et les animaux sangchaud, les 5 autres sont retrouves chez les animaux(vertbrs) sang froid

    - Trs nombreux srotypes

    Ex. Salmonella enterica, sous espce enterica, srotype typhi,

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    15/71

    Genre Salmonella : taxonomie

    Nom complet Appellation du CDC Autre appellation

    S. enterica subsp. enterica

    ser. typhi

    Salmonella ser typhi Salmonella typhi

    S. enterica subsp. enterica

    ser typhimurium

    Salmonella ser typhimurium Salmonella typhimurium

    S. enterica subsp. salamea

    ser. greenside

    Salmonella ser greenside S. II 50:z :e, n,x

    Salmonella greenside

    S. enterica subsp. arizonae

    ser. 18 : Z4 Z23

    Salmonella IIIa 18:Z4, Z23 Arizona hinshawii ser.

    7a, 7b: 1,2;5

    S. Bongori ser brookfield Salmonella ser brookfield S. V 66 :Z41 ;

    Salmonella brookfield

    S. enterica subsp.

    Houtenae ser marina

    Salmonella ser salmonella S. IV 48:g, Z51

    Salmonella marina

    S. enterica subsp. indicaser srinagar

    Salmonella ser srinagar S. VI 11: b : e,n,xSalmonella srinagar

    C t b t i l i d

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    16/71

    Caractres bactriologiques des

    entrobactries

    1- Morphologie :

    Bacilles Gram - (BG- )

    Ne forment pas de spores

    Taille :de 2-4 microns x 0,4- 0,6 microns

    Mobiles (ciliature piritriche) ou immobiles (Klebsiella,Shiguella et Yersinia pestis)

    Quelques fois capsuls (Klebsiella)

    C t b t i l i d

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    17/71

    Caractres bactriologiques des

    entrobactries

    2- Culture :

    Poussent facilement sur les milieux usuels en 24H 37Cen arobiose et en anarobiose

    Exigences nutritionnelles rduites. La plupart se multiplienten milieu synthtique avec 1 source de C simple comme leglucose

    Croissance optimale sur le milieu Mac Conkey (milieucontenant 2 inhibiteurs de la flore Gram+ ; les sels biliaireset le cristal violet). Le caractre recherch dans ce milieutant la fermentation du lactose dont lutilisation est rvlepar lindicateur color du milieu, le rouge neutre

  • 7/29/2019 Salmon Elles

    18/71

    Caractres bactriologiques des

    entrobactries

    Dveloppement pour la plupart sous forme de coloniesrondes, lisses (S), bords rguliers, de 2 3 mm dediamtre aprs 18H dincubation. Il existe des diffrences

    dans la rapidit de dveloppement des colonies. Ex, cellesde Shiguella sont plus petites que celles de E. coli

    Les colonies peuvent apparatre muqueuses avec 1

    consis