Salmon Elles

7/29/2019 Salmon Elles

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H. Gonsu

FMSB / CHUY

SALMONELLES


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Objectifs

Expliquer la taxonomie ancienne et rcente du genreSalmonella

Spcifier les caractres bactriologiques, biochimiques,pharmacologiques du genre Salmonella

Prsenter quelques donnes pidmiologiques

Expliquer les mcanismes de virulence des principauxpathognes

Prsenter les tableaux cliniques des fivres typhodes et

des autres salmonelloses


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Plan

I- Gnralits :

I-1- Dfinition et intrtI-2- Historique

I-3- Rappels sur les mthodes de diffrentiation infra- spcifique desespces

II- Taxonomie

III- Caractres bactriologiques

IV- Fivres typhodes

V- Salmonelloses non typhodiques

VI- Diagnostic biologique

VII- Traitement curatif et prvention


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Dfinition et intrt

Salmonella :

Genre bactrien de la famille des Enterobacteriaceae, constitu

de bacilles Gram ngatif, le plus souvent mobiles, pathognes

pour lhomme et les animaux

Intrt :

Ce genre regroupe de nombreuses espces pathognes pour

lhomme, agents des fivres typhodes, fivres paratyphodes,

et dautres salmonelloses communes lhomme et lanimal

Ces maladies sont des maladies du pril fcal et peuvent tre

prvenues par lapplication de mesures particulires dhygine

et salubrit

Elles sont responsables dpidmies parfois trs importantes


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Historique

1813 : individualisation de la fivre typhode sur la base des signes cliniques etlsions ulcreuses de lintestin par Petit et Serres

1868 : MEE du rle de leau de boisson dans sa dissmination parPettenkoffer

1880 : Dcouverte de lagent de la fivre typhode par Eberth, dans les coupeshistologiques de ganglions lymphatiques de malades morts de cette maladie

1884 : Culture de la bactrie par Gaffky

1896 : MEE de la diversit antignique des souches de salmonelles par Widal

1918 : Etude spare des Ag somatiques O, flagellaires H, et de surface Vi parWeil, Flix, Mitzemacher

1926 : Inventaire de la diversit antignique de ces bactries, maintenant

regroupes dans le genre Salmonella par White cette date. Kauffmann,puis Le Minor y ont contribu plutard


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Mthodes phnotypiques de diffrentiation

infra- spcifiques

Elles sont essentiellement voues au marquage pidmiologique etpermettent le diagnostic despce des bactries responsablesdinfection. Lon en dnombre plusieurs parmi lesquelles les 2dernires mthodes ci- dessous cites nous intressentparticulirement dans le cadre de cet expos

1- La biotypie : Consiste tudier pour 1 souche donne 1 crible decaractres biochimiques variables au sein de sa propre espce dontle profil dtermine 1 biovar

2- La bactriocynotypie : Limite quelques espces. Elle est basesur lutilisation de bactriocines (produits inhibiteurs voirebactricides, de nature protique ou peptidique (30 70 kDa),synthtiss par des bactries productrices insensibles leurs effetsmais actifs sur dautres souches de la mme espce ou despcesvoisines)

3-Analyses biochimiques particulires : ltude des constituants de la


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infra- spcifiques

4- Srotypie :Mthode de marquage des espces bactriennes base sur la

dtermination dantignes de surface (capsulaires, paritaux ouflagellaires) laide dantisrum spcifiques.

Elle demeure encore la mthode de de choix du marquage infra-

spcifique des salmonelles (mais aussi du mningocoque,pneumocoque, et du bacille pyocyanique)

5- Lysotypie :

Permet de distinguer au sein d1 mme espce bactrienneprdfinie de bactriophages connus, l(es) ventuel(s)phage(s) susceptibles de lyser la souche tudie. Ces virusbactriens ont besoin pour leur attachement de rcepteursspcifiques gntiquement caractriss.

Elle consiste donc tudier la sensibilit ou la rsistance des

souches 1 srie de bactriophages slectionns


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infra- spcifiques

Les phages utiliss peuvent tre ;

Virulents ou lytiques : linfection d1 cellule entrane lamort cellulaire et la production de nouveaux phages qui

rinfectent dautres cellules. Ceci se traduit par laformation de plage ou linhibition de la croissancebactrienne

Temprs : leur ADN intgre le gnome bactrien, serfrant ltat lysogne ; 1 petite portion de cellules htesinduisent naturellement les gnes du phage et la librationdes phages intervient.


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infra- spcifiques

70% des isolats se rpartissent seulement en 3 lysotypes (A,E1, et C1)

Ce qui explique le systme de lysotypie complmentaire dusrotype typhimis au point par Nicolle, et compos de 13bactriophages non adapts Vi, subdivisant le groupe A, leplus frquent, en 10 sous- lysotypes

2me systme :

Publi en 1951 par Flix et Callow

Permet de typerSalmonella srotype paratyphi B

Compos de 12 bactriophages adapts et non adapts etreconnat 48 lysotypes

3me systme :


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Taxonomie

Rgne Bacteria

Embranchement Proteobacteria

Classe Gamma Proteobacteria

Ordre Enterobacteriales

Famille Enterobacteriaceae

Genre Salmonella

Espce 2 espces (actuellement) et plusieurs

sous- espces


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Entrobactries : Principaux genres

Salmonella

Shigella

Escherichia

Edwardsiella

Citrobacter

Klebsiella

Enterobacter

Hafnia

Panoea

Serratia

Proteus

Morganella

Providencia

Yersinia


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Genre Salmonella

Ancienne taxonomie ;

Base sur des tests biochimiques et de srotypie

En sappuyant sur les diffrents facteurs antigniques O (somatiquesparitaux) et H (flagellaires appartenant aux 2 phases possibles, H1et H2), Kauffmann et White ont propos 1 shma srotypique d1extrme richesse

Concept : 1 srotype, 1 espce propos par Kaufmann sur la basede lidentification srologique des antignes somatique O et flagellaireH

Ce type de classification conduisait reconnatre 2463 espces desalmonelles en 1998 et davantage aujourdhui car 26 srovars ontt identifis en 1999

La nomenclature complte des Salmonella se dcline en Genre,es ce trs nombreuses sous- es ce srovar


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Genre Salmonella : taxonomie

Nouvelle taxonomie :

Base sur des mthodes molculaires

Dfinit - 1 genre- 2 espces : S. enterica et S. bongori. Lespcebongori a pour habitat uniquement les animaux.

- 6 sous- espces de lespce enterica : S. enterica, S.salame; S. arizonae ; S. diarizonae; S. houtenae ; S. indica.

La 1re

a pour habitat lhomme et les animaux sangchaud, les 5 autres sont retrouves chez les animaux(vertbrs) sang froid

- Trs nombreux srotypes

Ex. Salmonella enterica, sous espce enterica, srotype typhi,


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Genre Salmonella : taxonomie

Nom complet Appellation du CDC Autre appellation

S. enterica subsp. enterica

ser. typhi

Salmonella ser typhi Salmonella typhi

S. enterica subsp. enterica

ser typhimurium

Salmonella ser typhimurium Salmonella typhimurium

S. enterica subsp. salamea

ser. greenside

Salmonella ser greenside S. II 50:z :e, n,x

Salmonella greenside

S. enterica subsp. arizonae

ser. 18 : Z4 Z23

Salmonella IIIa 18:Z4, Z23 Arizona hinshawii ser.

7a, 7b: 1,2;5

S. Bongori ser brookfield Salmonella ser brookfield S. V 66 :Z41 ;

Salmonella brookfield

S. enterica subsp.

Houtenae ser marina

Salmonella ser salmonella S. IV 48:g, Z51

Salmonella marina

S. enterica subsp. indicaser srinagar

Salmonella ser srinagar S. VI 11: b : e,n,xSalmonella srinagar

C t b t i l i d


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Caractres bactriologiques des

entrobactries

1- Morphologie :

Bacilles Gram - (BG- )

Ne forment pas de spores

Taille :de 2-4 microns x 0,4- 0,6 microns

Mobiles (ciliature piritriche) ou immobiles (Klebsiella,Shiguella et Yersinia pestis)

Quelques fois capsuls (Klebsiella)

C t b t i l i d


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entrobactries

2- Culture :

Poussent facilement sur les milieux usuels en 24H 37Cen arobiose et en anarobiose

Exigences nutritionnelles rduites. La plupart se multiplienten milieu synthtique avec 1 source de C simple comme leglucose

Croissance optimale sur le milieu Mac Conkey (milieucontenant 2 inhibiteurs de la flore Gram+ ; les sels biliaireset le cristal violet). Le caractre recherch dans ce milieutant la fermentation du lactose dont lutilisation est rvlepar lindicateur color du milieu, le rouge neutre


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entrobactries

Dveloppement pour la plupart sous forme de coloniesrondes, lisses (S), bords rguliers, de 2 3 mm dediamtre aprs 18H dincubation. Il existe des diffrences

dans la rapidit de dveloppement des colonies. Ex, cellesde Shiguella sont plus petites que celles de E. coli

Les colonies peuvent apparatre muqueuses avec 1

consistance glatineuse et 1 tendance la confluence etsouvent 1 diamtre double de celui des autresentrobactries >24H

Les colonies aspect rugueux ( R ) se rencontrent le plussouvent chez les cultures de collection la suite de


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Caractres bactriologiques des entrobactries

3- Biochimie :

o Utilisent le D-glucose et les autres sucres par fermentation avec productionde gaz plutt que par oxydation

o Rduisent les nitrates en nitrites (except certaines souches dErwinia et detrs rares mutants)

o Oxydase ngative

o Catalase + (except Shiguella dysenteriae srotype 1)

o Immobiles ou mobiles

o Aro- anarobies facultatifs

o Autres ; grande diversit antignique ( formation dindole, fermentation desglucides tels le lactose,)

C t b t i l i d


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entrobactries

4- Structure antignique :

Contiennent 1 Ag commun et possdent 1 GC% entre 39 et 59%

On distinguera surtout - les Ag O (Ag de paroi toujours prsents)

- les Ag H (Ag flagellaires)

-les Ag K, plus rarement (Ag de capsule oudenveloppe)

Antignes O :

- Sont thermostables (rsistant 2H 1 chauffage 100C)

- Sont 1 fraction protinique qui rend le complexe antignique

- Sont 1 fraction polyosidique qui dtermine la spcificit de lantigne

- Sont trs toxiques (1/20mg suffit pour tuer la souris en 24H) : 1fraction lipidique qui, lie au polyoside, est responsable de la toxicit(endotoxine). Inject lhomme ou lanimal, lantigne O provoque

de la fivre, 1 leucopnie suivi de leucocytose avec lymphopnie etosino hilie


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entrobactries

Antigne H :

De nature protique

Ag thermolabile, dtruit par lalcool 50% et par les enzymes

protolytiques Peuvent permettre lagglutination en prsence d1 immunsrum

spcifique

N.B; Les caractres ci- dessus numrs permettent dexclure de

la famille des Enterobacteriaceae dautres BG ;

Pseudomonas (arobies stricts et ont 1 mtabolisme oxydatif)

Vibrio

Aromonas

C t b t i l i G


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Caractres bactriologiques: Genre

Salmonella

Caractres morphologiques,culturaux et mtaboliquesidentiques celles des autresbactries de la famille des

enterobactries

Bacilles Gram ngatif

Taille ; (0,1 6 x 0,3) microns

Mobiles, except cellesappartenant 1 srovar aviare, et

de rares mutants paralyss

C t b t i l i G


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Salmonella

Culture :

En aro- anarobiose

Se fait avant et aprs prculture sur milieux denrichissement

Les colonies sont bien visibles aprs 18 24H dincubation

En gnral, colonies de 3 4 mm de diamtre; certainescultures donnent des colonies naines (aspect constant chez lessrovars abortusovis, typhisuis, exceptionnellement chez lesmutants

Mur muqueux visible seulement aprs plusieurs jours.Exceptionellement, on peut isoler des souches de Salmonellapoussant sous forme de colonies muqueuses dont lesdimensions et laspect rappellent Klebsiella (cette aptitude seperd aprs quelques mois de conservation)

C t b t i l i G


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Salmonella

La plupart sont prototrophes et produisent du gaz enfermentant le glucose

Les souches auxotrophes appartiennent aux srovars dont

le pouvoir pathogne est restreint 1 hte particulier

Ex. S. typhi, paratyphi A, sendai que lon nisole que chez

lhomme; abortusovis que lon ne trouve que chez les

ovins, gallanarum- pullorum chez les volaillesElles ne peuvent donc pas pousser sur le citrate de

Simmons qui ne contient pas de facteurs de croissance (le

citrate y est la seule source de C)

C t b t i l i G


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Salmonella

Milieux denrichissement ;

Milieux denrichissement au slnite : milieu de Leifson

Milieux au ttrathionate : milieu de Muller- Kauffmann

Milieu Rappaport :

- composition : vert de malachite, MgCl2 et ph acide

- permettent lenrichissement en Salmonella, lexception

de S. typhi et S. paratyphi A,B, et C

C t b t i l i G

Slectivit/ composition Caractres Rsultatseu


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Salmonella

Slectivit/ composition Caractres

recherchs

Rsultats

2 indicateurs prsents dans le

milieu:

Bleu de bromothymol (indicateur

de pH)Fuschine acide (se colore en

prsence daldhyde)

Production dH2S

partir de

thiosulfate

La fermentationou non de 3 types

de glucides ;

saliciline,

saccharose et

lactose

Suspicion de

Salmonella si

colonies bleu- vert

centre noir

Contient 3 inhibiteurs ;

-Sels biliaires

- vert brillant

- forte concentration en citrate de

Na+

Inhibition des G+ ; croissancedifficile des G- autres que

Salmonella et Shigella

Contient du

lactose pouvant

tre ferment

Contient du

thiosulfatepouvant donner

du H2S

Colonies incolores

(lactose -)

centre noir (H2S+)

Contient 2 colorants ; bleu de

mthylne qui inhibe majorit de

flore G+ (suf strptocoque D); Bien

que les entrobactries lactose-s develo ent les

Critre de

diffrentiation:

lactose

Colonies gristres

de 1 2 mm de

diamtre

transparentes ourises ambres:

eu

Hektoen

Glose SS

EMB

XLT4

C t b t i l i G


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Salmonella

Autres milieux disolement utiliss pour Salmonella ;

NBG Rambach

Drigalski

DCLS

XLT4

ONP Glati btagl Alphaglut Malo galact L(+) - sorb Lyse


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Salmonella

ONP

G

(2H)

Glati

nase

(36C)

btagl

ucuro

nidase

Alphaglut

amyl

transfras

e

Malo

nate

galact

urona

te

L(+) -

tartrat

e

sorb

itol

Lyse

par

phage

01

Subs.

Enterica

- - v V - - + + +

Subs.

Salama

e

- + v + + + - + +

Subs.Arizona

e

+ + - - + - - + -

Subs.

Diarizo

nae

+ + + + + + - + +

Subs.

Houten

ae

- + - + - + - + -

Subs.

Indica

v + v + - + - + +

- - - - -


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Ex. Salmonella enterica subs. Enterica :

Caractristiques ;

ONPG-. ADH-, LDC+, ODC+ (typhi ODC-, paratyphi LDC-),

citrate +,H2S+ (typhi citrate -, H2S traces),

urase-, TDA-, indole-, VP-, glatinase-sucres + sauf inositol, saccharose, amygdaline,

Hors API 20 E ; Gaz + (sauf typhi), souvent sensible phage 01

C G


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Salmonella

Identification antigniquepratique :

Etape indispensable de

lidentification des Salmonella

Ractions dagglutination sur

lame avec culture humide,surtout pour la recherche des

Ag flagellaires H (aprs avoir

vrifi que la souche nest pas

auto- agglutinable, avec de

C b i l i G


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Salmonella

Dtermination des Ag somatiques O :

Groupes Agniques O : caractriss par la prsence d1 Agsomatique commun (facteur O majeur)

A lintrieur du groupe, les diffrents srotypes se distinguentsurtout par les Ag flagellaires H

Dans certains cas, lAg somatique est cach par lAg Vi qui estuniquement retrouv chez S. typhietparatyphi Cet quelquesrares souches de Dublin

Seul S. typhi est O inagglutinable par la prsence d1 Ag Vi,mais ses caractristiques biochimiques remarquables (ODC-,citrate -, gaz-) permettent de ldentifier rapidement

Lagglutinabilit par le srum Vi et lagglutination somatique Oaprs chauffage d1 suspension pendant 10min 100C

permettent de confirmer le rsultat La lutination doit tre immdiate

C t b t i l i G


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Salmonella

Dtermination des Ag flagellaires H :

La grande majorit des Ag H existent sous 1 forme biphasiquecd possdant 2 spcificits Agniques diffrentes. Sont

exceptionnellement triphasiques 2 gnes sont alternativement exprims : fliCet fljB

Celles-ci pourront tre MEE par les srums anti- Hcorrespondants

Dans certains cas, l1 des 2 spcificits est prpondrente,lautre ne pouvant tre dtecte quaprs essaimage sur 1glose molle contenant de lantisrum dirig contre la phase quisexprime (mthode de Sven Gard)

LAg H est recherch lorsque lAg O a t dtermin.

Les srum anti- O,45 06,7,8 - O9 (qui reprsentent 90% des

C t b t i l i G


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Salmonella

La caractrisation lysotypique,

gnotypique dans des centresspcialiss permettent 1 bonne

identification

Genre Salmonella : gnralits sur


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Genre Salmonella : gnralits sur

lpidmiologie

Largement rpandus dans la nature, dans le tube digestif desmammifres domestiques ou sauvages, des reptiles, desoiseaux, des insectes

Sont la fois commensales et pathognes, causant 1 largespectre de maladies chez lhomme et lanimal

Certaines salmonelles tel S. typhi et S. paratyphi, sontparticulirement adaptes lhomme, nayant pas dautre

hte naturel connu, et sont responsables dinfections svres

Ces 2 dernires sont responsables des fivres typhodes

Dautres comme S. typhimurium ont de multiples htes naturels.


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Fivres typhodes : pidmiologie

S. typhi et S. paratyphi :

Responsables des fivres typhodes

Lhomme est le seul rservoir

Contamination par ingestion deau et daliments

contamins par les selles humaines (malade ou porteurasymptomatique)

Dans certains cas, sont mis en cause la contamination

daliments contamins responsables de cas groups ou de


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Colonisation de la vsicule biliaire, spcialement lorsquelle

est lithiasique et excrtion intermittente des salmonelles

dans le tube biliaire

Lapplication stricte des mthodes dhygine et de salubrit

par la population diminuent la prvalence des cas de

typhode

2O OOO OOO de cas chaque anne; 600 000 dcs

0,3 cas pour 100 000 habitants dans les pays dvelopps


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Reste endmique en Asie (incidence de 900 cas pour 100

000hbts), en Afrique et en Amrique centrale)

Facteurs favorisant la forte incidence dans ces rgions ;augmentation rapide de la population; urbanisation rapide;

Eau rare ; systmes de sant peu dvelopps

Depuis le dbut des annes 70, les souches de S. typhi

rsistant au chloramphnicol, lampicilline et au

cotrimoxazole par 1 mcanisme plasmidique posent 1

problme de sant publique dans les pays dendmie


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Fivres typhodes : physiopathologie

Lingestion d1 aliment contaminant peutconduire ou non 1 infection

Survenue de signes cliniques dpend de :

- limportance de linoculum

- la virulence de la souche : Facteurs de

virulence cods par des gnes prsents sur lechromosome (S. typhi), ce qui explique la

gravit constante de linfection

- les facteurs tenant lhte


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Fivres typhodes : physiopathologie

Aprs ingestion, colonisation de la muqueuse intestinale.Frquemment suivi d1 bactrimie

1 inoculum lourd (10 exposant5 7) habituellement

ncessaire pour 1 infection chez l immunocomptent

Hypo acidit gastrique (sujet g ou sous anti- H2); 1

diminution de la motilit intestinale (mdicaments, diabte)peuvent contribuer rendre pathognes des inoculum

faibles

Importance du terrain : diabte, personnes ges,

Fi t h d h i th l i


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Fivre typhode : physiopathologie

Aprs avoir gagn lintestin, pntration sans lsion de lamuqueuse par les bactries. Il sy trouve la 2me ligne dedfense reprsente par les IgA, le mucus intestinal et lesdfensines (peptides anti- microbiens permabilisant lesmembranes bactriennes)

Aprs avoir franchit le mucus, les salmonelles interagissentavec les entrocytes (induction d1 activit phagocytaire par lessalmonelles et les cellules M de la plaque de Peyer) quipermettent leur internalisation rapide et le contact avec lescellules immunocomptentes de la sous- muqueuse

(macrophages et lymphocytes)

Les salmonelles peuvent survivre lintrieur des macrophageset mme, induire leur apoptose.

Elles colonisent les macrophages tissulaires (rate, molle


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Fivre typhode : physiopathologie

Aprs traverse de la paroi intestinale, elles gagnent lesganglions msentriques o elles vont se multiplier

1 partie des Salmonella se lysent et librent leur endotoxine .Celle- ci provoque des signes cliniques (fivre,tuphos,bradycardie) et biologique (leucopnie) et 1 irritation desplaques de PEYER qui peuvent entraner des hmorragiesintestinales et des perforations.

A partir des gg msentriques, par le canal thoracique, desSalmonella gagnent le courant sanguin (hmoculture +), etdissminent dans tous les organes (reins, foie, vsicule biliaire.Finalement, lorganisme infect produit desAc contre les Agbactriens (srodiagnostic +), qui contribue la gurison

Fi t h d li i


42/71

Fivres typhodes : clinique

Encore appeles fivres entriques

Incubation silencieuse : quelques jours

60jours (parfois diarrhe fugace dans les 12 48H suivant 1 repas contaminant)

Troubles peu spcifiques : constipation plusfrquente que diarrhe chez ladulte, cphales,

sensation de malaise, dcalage thermique

Fi t h d li i


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Evolution :

Vers 1 tableau clinique svre en quelques jours

Augmentation typique de la temprature de 0,5C /jr pouratteindre 40C le premier septnaire ou fivre leve

demble. Fivre en plateau 39- 40C dans la deuxime

semaine

Classique dissociation pouls temprature dans 50% des

cas


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Angine de Duguet (10% cas), ADP

Macules et/ou papules roses au niveau des paules, duthorax, de labdomen (tches roses lenticulaires dont lamise en culture permet disoler les salmonelles

Tuphos, tat domnibulation, somnolence

Complications digestives (hmorragies, perforations),myocardiques ou crbrales (encphalites)

N.B ; En labsence de traitement, 5% des maladesdeviennent des porteurs asymptomatiques, parfois duranttoute leur vie


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Fivres paratyphodes

o Ressemblent la fivre typhode

o Moins virulentes

o Causes parS. paratyphi A et B (S.

schottmuelleri) et plus rarement S. paratyphi C(S. hirschfeldii)

Salmonelloses non typhodiques :


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Salmonelloses non typhodiques :

pidmiologie Largement rpandues dans le rgne animal (ont pu tre isols

dans pratiquement toutes les espces)

Infections plus souvent lies leau et aux aliments contamins(ufs, volailles, viandes)

La surface des ufs est gnralement contamine par desfcs, des fissures permettant la contamination de luf lui-mme

Des pidmies ayant concern plus de 200 000 personnes sontds au dveloppement de lindustrie agro- alimentaire (laitpasteuris contamin secondairement, crmes glaces,dveloppement du commerce international de fruits et lgumes)

salmonelloses non typhodiques:


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salmonelloses non typhodiques:

physiopathologie

Bactrimies souvent prcoces mais, pas toujours prolonges( lexception de S. typhimurium et parfois S. enteridis quipeuvent donner des infections systmiques)

Se multiplient dans la lamina propria et entranent 1 diarrhe

par production de toxines et par linduction de marqueurs delinflammation modifiant le transport des lectrolytes et desliquides travers la muqueuse

Les facteurs de virulence sont cods par des gnes prsents

la fois sur le chromosome et sur 1 plasmide (Ex. S.typhimurium). Ceci explique que pour 1 mme srovar, 1souche soit plus ou moins pathogne

Facteurs de virulence dus des proprits particulires des

structures de surface (lipopolysaccharides, flagelles, antigneVi ou des facteurs cods ar des nes de virulence


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Salmonelloses non typhodiques : clinique

Plusieurs cas de figure ;- Portage transitoire ou chronique asymptomatique

(persistance de salmonelles dans les urines ou dans les sellesau-del de 1 an aprs infection symptomatique. Il est favorispar la prsence d1 lithiase vsiculaire)

- gastro- entrite

- bactrimie (fait souvent suite gastro- entrite)

Complications possibles ; formes septicmiques et viscrales

(infections endovasculaires; colites; infections uro- gnitales,pneumonies et empymes; infections du SNC; manifestationsosto- articulaires, infections des parties molles, infectionssplniques, )

Ces dernires sobservent surtout chez des terrains particuliers


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Salmonelloses : terrains particuliers

Nourrisson et enfants :Fivre typhode peu frquente chez le trs jeune enfant (maladie de

ladulte et de ladolescent)

Salmonelloses non typhodiques habituelles en pdiatrie

Rle protecteur important de lallaitement maternel (immaturit

immunitaire digestive de lenfant)Infections du NNE par contamination maternelle au moment delaccouchement sont toujours svres. Elles peuvent se compliquerde mningites, et surtout dabcs crbraux

Drpanocytaire :

Il a 1 risque dinfection pneumocoque et salmonelles 20 100 foissuprieur celui de la population gnrale

Lasplnie fonctionnelle joue 1 rle, ainsi que des troublesdopsonisation

Frquence des ostomylites salmonelles favorises par des infarctusosseux, pouvant survenir au cours de bactrimies


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Salmonelloses : terrains particuliers

Immunodprims :Salmonelloses et VIH :

Linfection VIH, facteur de risque majeur de linfection salmonelles

Bactrimies rcurrentes en raison de laptitude de cessalmonelles coloniser de manire durable le tube digestifsouvent ls de ces patients

Lincidence de ces bactrimies a diminu depuis quelques

annes, du fait du recours au cotrimoxazole en prvention,et de lutilisation de zidovudine qui a 1 activitantibactrienne sur les salmonelles

Sujet g :

Di ti bi l i


51/71

Diagnostic biologique

Repose sur ;

la MEE de la Salmonellaresponsable (diagnostic direct) par

hmoculture et/ ou par coproculture,

et/ ou sur la MEE dAc spcifiques

par le srodiagnostic (diagnostic

O i t ti li i


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Orientation clinique

Gastro- entrite fbrile : - en zone dendmie

- au cours d1 pidmie- chez 1 sujet vivant au contact d1 sujet

malade ou 1 porteur chronique

Episodes fbriles rcurrents- chez 1 sujet aux antcdents de lithiase (biliaires ou mme

rnales)

- chez 1 terrain particulier (immuno- dprim, drpanocytaire,

vieillard, nourrissons,)

Septicmie

Symptomatologie vocatrice ; dissociation pouls- temprature ,Tu hos, erforations di estives, abcs rofonds,

Prlvements et transport


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Prlvements et transport

Diffrents sites (ou types) de prlvements en fonction de la clinique

2 princiapux types de prlvement ;

- le sang (hmoculture) : 10 20ml (1 2 ml chez le NRS etlenfant) de sang dans le flacon. A effectuer de prfrenceconcomittement la fivre et avant dbut dATBiothrapie (sinon,fentre de 48 72H observer)

- les selles (coproculture) : dans 1 pot strile muni d1 cuillre oud1 spatule. Ecouvillonnage rectal possible chez lenfant

Autres types de prlvement ;

- Pus (si abcs)

- Urines : 2me

jet dans 1 flacon strile prvu cet effet

Transport:

- Doit seffectuer le plus rapidement possible afin que les selles soientimmdiatement techniques. Si ce nest pas possible, conserver +4C sans dpasser 12H.

- Transport immdiat du flacon dhmoculture au laboratoire

Diagnostic biologique : diagnostic direct


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1- Hmoculture :

Moyen essentiel de faire le diagnostic d1 fivre typhode

Rpter de prfrence les hmocultures comme il ya peude Salmonella dans le courant sanguin

En labsence dATBiothrapie, elles sont positives dans ;

- 90% des cas durant la 1

re

semaine de la maladie (1erseptenaire)

- 75% des cas durant la 2me semaine de la maladie (2meseptnaire)

- 40% des cas durant la troisime semaine de la maladie3me se tnaire

Diagnostic biologiq e diagnostic direct


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Devant toute suspicion de positivit avec le systme manuel ou

avec le systme automatique (dtection de production de CO2rflectomtrie ou fluorescence), procder lexamen du bouillonsuivant :

- Etat frais

- Coloration de Gram

La microscopie permet dorienter le choix du milieu ;

- milieux gloss non slectifs tel glose colombia avec 5% desang incub en arobiose 2 jrs et en anarobiose 5jrs

- milieux slectifs SS, Hekton

Identification par les caractres biochimiques

Lespce en cause est ensuite prcise par ses caractresantigniques


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1- Coproculture:

Il reste souvent ngatif et nest pas le meilleur

moyen de faire le diagnostic de la fivretyphode

Constitue 1 bon moyen de sassurer la fin dutraitement que le sujet nest pas devenu porteur

chronique de Salmonellaet donc, quil ne

constitue pas 1 source de contamination pour


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Principales tapes de lexamen bactriologique desselles :

Macroscopie: Toujours la noter.

Microscopie :

- Etat frais permet de dceler la prsence de leucocytes

et dhmaties (ventuellement de parasites), Salmonellatant 1 germe invasif

- Etalement sur lames + coloration au bleu de mthylne

ou au Giemsa (aprs schage) : permet de dceler la

prsence dhmaties



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Culture :

Se fait sur milieu slectif avant et aprs prculture sur milieuxdenrichissement

Milieux denrichissement :

- au slnite : milieu de Leifson

- au ttrathionate : Mueller- Kauffmann

- Y ajouter 0,5 mL de selles. A repiquer aprs 3 6H maximum dincubation 37C afin dviter la multiplication des bactries commensales mal inhibes au-del de ce dlai

Milieux slectifs pourSalmonella- Shigella ;

- glose Hektoen

- glose Salmonella Shigella (SS)

- milieux chromognes (permettent 1 diffrenciation plus aise des salmonelles(SM ID2, OSCM II,)

N.B ; - Incubation des diffrents milieux 37C

- Il nya pas de milieux denrichissement pourShigella



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Dmarche diagnostique :

1- Aspect des colonies :

Milieu Hektoen (aprs 24H 37C) : colonies lactose, etH2S+ (centre noir) sont suspectes

Glose SS : colonies incolores ou faiblement colores

avec ou sans centre noir sont 1 forte prsomption de

Salmonella

Milieux chromognes : dtection spcifique de l estrase

Di ti bi l i di ti di t


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2- Recherche de lurase(3 5 tubes dure lire en

15min 4H) : -

3- Mini- galerie :Caractre Salmonella Salmonella paratyphi

A

Glucose + +

Lactose - -

Indole - -

Gaz + +

H2S + + (le plus souvent)

Citrate - -

ONPG

LDC

-

+

-

-

Shigella

+

-

-

-

-

-

-

Di ti bi l i di ti di t


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N.B; - mobilit de S. typhifaible (aspect en houpe)- Le LDC fait la diffrence entre S. paratyphi A et les autresSalmonella

- Il existe des souches de Salmonella ayant acquis 1plasmide de mtabolisme du lactose. Ils ne sont isols surtout

que par hmoculture car sont ignors par la coproculture-A ce stade, ou beaucoup plus aprs diagnostic despce par

la galerie API 20E, on peut procder des agglutinations

4- Galerie API 20 E; lyse par les bactriophages spcifiques;

ATBiogramme

Diagnostic diffrentiel : Essentiellement avec ;

- Hafnia alvei

- Citrobacter freundii- +

i di t


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indirect

2- Srodiagnostic de la fivre typhode :

Se fait par le srodiagnostic de WIDAL et FELIX

(suspensions standardises 0 et H)

Permet de dtecter la prsence dans le sang dAc dirigs

contre les constituants des Salmonella

Les Ac anti- O apparaissent vers le 7- 8 jour ( srodg de

Widal ngatif lors de la 1re semaine), atteignant leur

maximum vers le 14mejour, restent en plateau jusqu la

4me semaine puis disparaissent rapidement. Ils

Di ti bi l i


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Diagnostic biologique

Les Ac anti- H apparaissent vers le 10me jour, montent

rapidement pour atteindre 1 maximum de 1/800me 1/

1600me vers le 14mejour, restent en plateau jusqu la

4me semaine et diminuent ensuite

A linverse desAc anti- O, ils ne disparaissent pas

compltement. Ils persistent toute la vie 1 taux de lordrede 1/ 200me

Ce test nest pas le meilleur moyen de faire le diagnostic

biologique de la fivre typhode et linterprtation des

Diagnostic biologique : fivre typhode


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Diagnostic biologique : fivre typhode

Sujet atteint de fivre typhode et ayant reu trs

prcocment des ATB : les Ac anti-O ne peuvent pas

apparatre et les Ac anti-H ne peuvent atteindre qu1 taux

faible. Parfois, ni les Ac anti-O, ni les Ac anti-H

nappairaissent

Des rcidives de fivre typhode peuvent sobserver mme

chez des sujets porteurs de taux levs dAc anti- O et

anti- H (la prsence dAc nassure pas toujours limmunit)

Le sujet vaccin peut avoir 1 persistance des Ac anti TH,

AH et BH. Cette signature srologique ne doit pas dans ce

cas, faire considrer le diagnostic comme positif

Diagnostic biologique des gastro- entrites


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Diagnostic biologique des gastro entrites

Salmonella

Il repose sur lisolement de la Salmonella par

coproculture ; les hmocultures et le

srodiagnostic sont ngatifs, la Salmonelle

restant purement digestive

Chez les terrains particuliers cits plus haut, les

Salmonella mineures sont susceptibles de

franchir la barrire intestinale, provoquer 1

septicmie et donner des hmocultures +

Traitement curatif


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Traitement curatif

ATB utilis doit avoir 1 activit bactricide rapide

ATB doit avoir des concentrations sriques et tissulaires

(intestin, ganglions lymphatiques msentriques, ),

intracellulaires et surtout intramacrophagiques suffisantes

Le chloramphnicol (notion de mylotoxicit), les

aminopnicillines, et le cotrimoxazole sont restslongtemps les traitements de rfrence

Lmergence de souches multirsistantes a conduit

valuer dautres schmas dantibiothrapie

Traitement curatif


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Traitement curatif

Autres ATB utiliss :

- Cphalosporines : C3G sont utiliss avec efficacit (les C1Get C2G ne doivent pas tre utiliss car bien qutant -actives invitro, nont pas montr defficacit suffisante dans le T3 des FT)

- Fluoroquinolones : efficacit remarquable du fait de leurexcellent pntration cellulaire et de leur forte concentrationbiliaire et intestinale

- Lazithromycine: bien quayant 1 activit modeste in vitro, a

1 bonne concentration intracellulaire et sest montr aussiefficace que la ciprofloxacine. Souvent utilise pour les souchesrsistantes aux fluoroquinolones

N.B ; Les gastro- entrites Salmonella gurissent le plus

souvent spontanment ; le T3 se rsume le plus souvent la

Traitement curatif


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Corticodes et T3 adjuvants :

Rhydratation + rgime sans rsidu indispensables

Corticodes rservs aux fivres typhodes dtat de choc ou detroubles de conscience pour 1 dure nexcdant pas 48H(risque de rechutes si ce dlai dpass)

Chirurgie : cas de perforation digestive et abcs

Antibiothrapie prolonge pour les atteintes osseuses

Porteurs chroniques: Difficults dradication de S. typhiquand il existe 1 lithiase vsiculaire ou rnale. 1 T3 paramoxicilline (6g/jr) pendant 6 semaines peut permettrelradication ou ciprofloxacine (1g/jr) ou (norfloxacine (800mg/jr)pendant 4 semaines peut permettre lradication . Lacholcystectomie tant discute en cas dchec

Prophylaxie


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ProphylaxieMesures gnrales ;

Distribution deau contrle bactriologiquement etassainissement de toutes les eaux de boissons

Traitement des eaux uses

Pasteurisation des aliments (ufs, beurre et lait enparticulier)

Eviction scolaire jusqu la gurison clinique Isolement des malades

Enqutes pidmiologiques (pidmies,) et dpistage desporteurs chroniques (3 coprocultures ngatives permettentde conclure larrt du portage)

Traitement des pisodes aiges et des porteurs chroniques

Surveillance pidmiologique nationale (restaurateurs,collectivits,)

Lavage des mains avant le repas

Utilisation de latrines bien construites et rpondant aux

Prophylaxie


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Prophylaxie

Vaccination :

En raison de sa tolrance mdiocre, le vaccin inertecomplet TAB, seul disponible pendant longtemps a t

abandonn malgr son faible cot

2 autres sont actuellement disponibles ;

- vaccin inerte fractionn (Typhim Vi par Aventis-

Pasteur; Typherix par GlaxoSmithKline)- vaccin vivant attnu (vivotif Berna Vaccine)

N.B; Elle est obligatoire pour lexercice de certaines

professions (militaires) et pour des sujets qui voyagent d1


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FIN

Salmon Elles

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