République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de...
-
Upload
hilaire-marais -
Category
Documents
-
view
116 -
download
4
Transcript of République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de...
![Page 1: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/1.jpg)
République Algérienne Démocratique et Populaire
Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique
Rencontres sur la Recherche en Informatique R²I 2011
12-14 juin 2011, Tizi-Ouzou, Algérie
CLASSIFICATION DES MICROCALCIFICATIONS: NOUVELLE
APPROCHE POUR L’EXTRACTION DES ATTRIBUTS
GHILAS Hamza(1), GAGAOUA Meriem(2), MOUSSAOUI Abdelouahab(3)
Département informatiqueUniversité Ferhat Abas, Sétif
Sétif, Algé[email protected] (1) , [email protected] (2), [email protected] (3)
Université Ferhat Abas, Sétif 2011
![Page 2: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/2.jpg)
2
Cancer du seinLe cancer du sein est une maladie dangereuse,
sa détection précoce reste le seul moyen de lutte→Des compagnies de dépistage gratuites.
Les radiologues sont censés d’analyser des dizaines de clichés / jours.
→Besoin d’outil d’aide au diagnostic.
Les calcifications: signe radiologique à un stade précoce.
![Page 3: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/3.jpg)
3
Cancer du sein
28.3 %
21.6 %
Les cancers les plus fréquents chez la femme en Algérie (OMS).
![Page 4: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/4.jpg)
4
Les microcalcifications
Les Mcs sont formées par des dépôts calciques fortement radio-opaques.
→ Détection.→ Classification: malignes/bénigne: La
vérification par biopsie est inévitable.Classification automatique: peut réduire le nombre d’interventions chirurgicale inutiles
![Page 5: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/5.jpg)
5
Classification automatique
Classifieur
Base d’apprentissageA1
A2
A3
An Classe prédite
![Page 6: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/6.jpg)
6
Etat de l’art
H.D. Cheng et al. Pattern Recognition. 2003:→ Analyse de la texture: indice de Haralick.→ Transformé en ondelette.→ Statistiques.→ …
Impliquer le radiologue dans la recherche des caractéristiques des microcalcifications
![Page 7: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/7.jpg)
7
Diagnostic des Mcs
![Page 8: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/8.jpg)
8
Attributs de classification
Attributs propres à une
Mc
L’aire Rayon maximale et rayon minimale Rectangularité Circularité interne et circularité externe Contraste de la microcalcification Contraste du contour L’écart type des niveaux de gris Angularité
Attributs d’un foyer de Mcs
Nombre de calcifications Densité des calcifications dans un foyer Nombre de foyers dans le sein L’écart type des tailles des microcalcifications Distance du foyer de Mcs de la peau L’écart type des distances inter-microcalcifications La bilatéralité L’écart type des intensités des microcalcifications
![Page 9: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/9.jpg)
9
Attributs de Mcs
• Rectangularité
Rectangularité = Rmin / Rmax
![Page 10: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/10.jpg)
10
Attributs de Mcs
• Circularité
Circularité interne = aire(Mc) / aire(Cint)
Circularité externe = aire(Cext) / aire(Mc)
![Page 11: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/11.jpg)
11
Attributs de Mcs
• Contraste du contour.
• L’écart type des niveaux de gris.
• Angularité.
Contraste(contour) = Im(contour) / Im(Mc)
![Page 12: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/12.jpg)
12
Attributs d’un foyer de Mcs
• Densité des calcifications dans un foyer
• L’écart type des tailles des microcalcifications.
• L’écart type des intensités des microcalcifications
![Page 13: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/13.jpg)
13
Classification
![Page 14: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/14.jpg)
14
Implémentation
• Weka, une API java complète pour le fouille de données.
• DDSM (Digital Database for Screening Mammography). Base d’image mammographiques très riche. Les cas de patiente sont vérifiés par biopsie.
![Page 15: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/15.jpg)
15
Résultats
Type d’attributs Apprentissage TesteTaux de
classification
Attributs propre à une Mc.
1/3 2/3 42%
2/3 1/3 60,20%
Attributs d’un foyer de Mcs.
1/3 2/3 35,12%
2/3 1/3 49,56%
Tout les attributs1/3 2/3 65,03%
2/3 1/3 82,21%
![Page 16: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/16.jpg)
16
Conclusion
• La liste d’attributs proposée dans cet article est issue d’une étude de recueil d’informations du point de vue médical. Ces attributs peuvent être utilisés comme vecteur d’entrée pour n’import quel type de classifieur (Support Vecteur Machine, K plus proche voisins, Réseau de neurones, Arbres de décision, Système immunitaire artificiels et etc).
![Page 17: République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Rencontres sur la Recherche en Informatique.](https://reader035.fdocuments.fr/reader035/viewer/2022081514/551d9dc9497959293b8e4027/html5/thumbnails/17.jpg)
17
Merci pour votre attention