Répresseur de la transcription-Notion antérieure à celle d’activateur (1961 Jacob et Monod)

-Agissent en se fixant dans ou à proximité du Pr

Activité modulée de 3 façons en réponse chgts intra ou extra cell

Stratégie I

Rep actif + effecteur Rep inactif

S. Adhya Encyclopedia of life sciences 2001 pp 1-7

Résultat: gènes réprimés ??(?)

Exemple

Stratégie II

Rep inactif + effecteur Rep actif(?)

Résultat: gènes réprimés ???

Exemple

Cas I et II: effecteurs = substrats, intermédiaires ou produits finaux de voies métaboliques

Exemple

Stratégie III

Rep actif critique Autorégulation; Résultat: cte

CI/OR1 et OR2

CI/OR1,OR2et OR3

cI

cI

D’aprés Ian B. Dodd et al. Genes Dev. 2001; 15: 3013-3022

CI

-gde affinité pour opérateur

-seqs de fixation très spécifiques: 16-20pb palindromiques

Propriétés des répresseurs

-le + souvent dimère

-DNA binding motif: HTH ou feuillets

HTHCro

Hélice dereconnaissance

3,4nm=1 tour

Contact entre P/aa basiques

GalR2aa*

Seq lacI

C

N

foldMetR

Mécanismes moléculaires de la répression

2 majeursEncombrement stérique: + grande affinité du rep (LacI)

Inhibition post RNA pol fixation

Inhibition de contact

GalRP1

P4 de 29 B.S

Contact avecCTD

Allostérie avec ADN

Altération structure ADN par rep

RNA pol impossible de se fixer

ou empêche isomérisation

1 mécanisme particulier= interférence avec 1 activateur

Exp: CytR

deoC (catabolismedeoxynucléosides)

Cas du répresseur Fur Stress ox

Conclusion générale: Activateur/Répresseur comparaison