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Recherche Avancée

Nous allons à présent utiliser l’option de Advanced Search qui vous permet d’utiliser la caractéristique du bâtisseur de Recherche (Search Builder). Pour faire une recherche plus précise, vous pouvez ajouter des termes dans tous les fichiers ou dans les fichiers spécifiques en utilisant les opérateurs Booléens AND, OR, NOT.

Vous pouvez accéder à Advanced Search à partir de la page initiale de PubMed ou la page de Résultats de recherche.

Note: les Instructions du Bâtisseur de Recherche peuvent être affichées.

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Nous avons ajouté le mot clé tuberculosis à la case de Recherche de PubMed, activé l’option Text Word dans le Coonstructeur de Recherch (Search Builder), ajouté drug resistance à la boite de texte et cliqué sur l’option Index. Nous allons cliquer sur AND plus l’option Add to Search Box.

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Aprés avoir cliqué sur AND plus l’option Add to Search Box, le terme drug resistance[Text Word] a été ajouté à la case de Recherche de PubMed en même temps que le terme tuberculosis. Nous allons à présent ajouter un autre terme.

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Nous allons cliquer sur l’option MeSH Terms dans la rubrique Search Builder et insérer le terme developing countries dans la boite de recherche. Nous allons cliquer sur Show Index pour afficher les termes MeSH.

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Les termes MeSH et Sous Titre MeSH de developing country sont affichés au niveau du menu déroulant. Nous allons cliquer sur AND plus l’option Add to Search Box pour ajouter ce terme à la boite de Recherche de PubMed.

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Les résultats de la recherche sur tuberculosis AND drug resistance AND developing countries donnent 110 références.

Note: sur la liste Filtrer vos résultats, 21 sont en Texte Intégral Gratuit et 31 sont dans HINARI.

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Nous sommes retournés à la page Advanced Search. Noter que Search History (Historique de Recherche) a été activée et affiche la recherche récente sous le #1. Dans le Module 4.4, nous allons discuter de l’option Search History et comment combiner des résultats de recherche.

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Exercice 17

Faire l’exercice 17 du cahier d’exercices.

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MY NCBI

Pour vous inscrire , ajouter des filtres et les options MY NCBI, vous devrez accéder directement à PubMed en utilisant l’adresse suivante:

www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed

A partir de l’affichage de PubMed, vous cliquez sur le lien MY NCBI/Sign in (connection à My NCBI) pour vous inscrire.

Note: Si vous essayez de vous inscrire à partir de HINARI/PubMed, HINARI va vous empêcher de revenir en arrière aprés avoir travaillé dans MY NCBI.

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Vous serez dirigés à la page d’inscription de MY NCBI. Pour s’inscrire à MY NCBI, cliquer sur le lien Register for an account (s’inscrire pour un compte). Si vous êtes déjà inscrit, vous pouvez cliquer sur MY NCBI Sign In.

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Vous devez remplir une petite page d’inscription,Sélectionnez un Nom d’utilisateur et un Mot de passe. Assurez-vous de noter ces identifiants pour des utilisations futures.Vous aurez aussi besoin de créer une Question Secrète pour le cas ou vous oubliez votre mot de passe.

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Pour l’image à 5 caractères, les saisir textuellement en incluant les majuscules. Une adresse e-mail est nécessaire pour l’utilisation des options de MY NCBI que nous allons aborder. Si le formulaire est complet, cliquer sur Register.

Rappel: assurez-vous de noter les nom d’utilisateur et mot de passe.

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Vous recevrez un e-mail de confirmation de la part de My NCBI. Allez à votre compte e-mail et ouvrez le message- [email protected] Pour compléter l’inscription, cliquer sur le lien hypertexte ci-dessous ‘visit the following Web sit – visiter le site web suivant’. S’il ne s’agit pas d’un lien hypertexte sur votre navigateur, copier l’adresse url et la coller sur la case de recherche de votre navigateur et cliquer sur le bouton send (envoyer).

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Après avoir saisi l’adresse du site web de My NCBI dans la case de Recherche, vous serez envoyés à cette page qui vérifie votre adresse e-mail. Connectez-vous à My NCBI en cliquant sur Sign In.Note: S’il s’agit de votre ordinateur, vous pouvez cocher les options maintenez-moi connecté à moins que je me déconnecte ou sauvegardez mon nom d’utilisateur.

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Pour accéder à My NCBI, vous aurez besoin de vous Connecter (Sign In) avec votre Nom d’Utilisateur et votre Mot de Passe.

Note: c’est la procédure une fois que vous vous êtes inscrit et que voulez retournez à votre compte My NCBI.

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Voici la page MY NCBI qui inclue beaucoup d’options qui seront abordées – 1er Filtres. Les filtres permettent aux utilisateurs de My NCBI d’identifier des catégories d’articles au sein de résultats de recherche. Ouvrir la section des Filtres en cliquant sur Manage Filters (Gérer les Filtres). Assurez-vous de maintenir les Filtres avec l’option PubMed.

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Dans l’option Browse/Search for PubMed Filters (Naviguer/Chercher les Filtres pour PubMed), nous avons cliqué sur Popular. Les filtres les plus usuels sont cités sur cette page et vous pouvez choisir plus d’une option. Lorsque vous choississez un filtre, la page My NCBI va actualiser et appliquer ce filtre. En cliquant sur la boite, choisir le filtre Free Full Text . Vous pouvez aussi choisir d’autres filtres qui vous intéressent.

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Noter que les filtres que vous avez choisi sont cités sur Votre liste de filtres PubMed et que le filtre le plus récemment ajouté est cité sur la boite verte. Pour ajouter un autre filtre important, cliquer sur la catégorie LinkOut.

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Après avoir accédé à la catégorie LinkOut, saisir HINARI dans la case de recherche et cliquer sur le bouton search.

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Une fois que l’option LinkOut de HINARI apparait, cliquer sur la boite de Filtre et ajoutez ce 2e filtre.

Note: LinkOut est le programme de PubMed qui ajoute les icônes HINARI dans le format Abstract et permet l’accès au texte intégral des documents.

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Tous les 2 filtres que vous avez choisi sont affichés sur Votre liste de filtres PubMed. Vous pouvez supprimer n’importe quel filtre en le cochant sur la colonne Active. Retournez à votre première page MY NCBI en cliquant sur MY NCBI à côté de votre nom d’utilisateur ou en cliquant sur le logo MY NCBI.

Note: ces 2 filtres sont utilisés pour créer les tables HINARI et Free Full Text (texte intégral gratuit) qui apparaissent lorsqu’une recherche HINARI/PubMed est faite. Ils vont apparaitre sur n’importe quelle recherche My NCBI réalisée.

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En utilisant la boite Search NCBI databases (bases de données de recherche NCBI), faites une recherche sur HIV AND pregnancy – en saisissant le terme dans la case de recherche et en cliquant sur le bouton de Recherche.

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Dans PubMed, voici les résultats de la recherche pour HIV AND pregnancy. Cliquez sur l’hyperlien Save search qui est disponible si vous êtes connectés à votre compte MY NCBI.

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My NCBI vous donne l’option de sauvegarder ou d’annuler une recherche donnée.En sauvegardant cette recherche, vous pouvez recevoir des e-mail qui vous donnent la liste des nouvelles références d’articles en texte intégral gratuit ou disponibles dans HINARI sur ce sujet.

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My NCBI a confirmé que cette recherche a été sauvegardée. Vous avez à présent l’option de recevoir des mises à jour par e-mail ou de ne pas recevoir des mises à jour (sur des articles publiés sur ce thème).

Dans ce cas, les options de mise à jour par e-mail choisies sont: ‘Yes (oui), once a week (une fois par semaine)’ par ‘Monday (lundi)’ dans le Format Abstract (d’autres options sont texte ou MEDLINE) et recevoir 50 items (articles). Choisissez les options que vous voulez et cliquez sur le bouton Save (sauvegarder).

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Quand vous retounez à la page My NCBI, vous pouvez voir une liste de recherches sauvegardées dans la boite Saved Searches (recherches sauvegardées) – dans la case ‘HIV AND pregnancy’ et ‘malaria AND bednets’. Vous pouvez reproduire une recherche en cliquant sur le titre de la recherche. Vous pouvez aussi supprimer la recherche en cliquant sur Managed Saved Searches.Note: l’e-mail que vous recevez de MY NCBI va comporter des références d’articles récemment publiées. Pour avoir le texte intégral d’un article, vous aurez besoin de retourner à HINARI et de localiser une parution donnée d’un journal.

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Nous sommes retournés à la page initiale du site web et nous voulons noter les ressources Training (Formation) et Utilisation de HINARI. Nous allons accéder à la sous-page Formation.

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• Add screen capture training page

Cette page contient une série de modules qui détaillent beaucoup de caractéristiques de HINARI que nous avons abordées – mais avec plus de détails.

Note Le Module 7 qui contient des informations sur des ressources additionnelles disponibles dans le site web de HINARI.

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Cette diapositive additionnelle souligne le Brief training (Formation brève), Formation de courte durée sur HINARI et divers Outils de Formation plus des Présentations .Noter aussi le matériel Aptitudes a être auteur – série de modules écrits pour assister les chercheurs dans la publication de leur résultats.

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Exercices 18-22

• Faire les exercices 18-22 du cahier d’exercices.

• Vous avez bouclé le Cours de Courte durée de HINARI!

• Pour des instructions plus poussées, aller à la page de formation de HINARI à

www.who.int/hinari/training/en/

Mise à jour du Juin 2011