Rapport annuel d'activité, année 2019 Laboratoire National ... · Schistosoma qui a émergé en...

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1 Rapport annuel d'activité, année 2019 Laboratoire National de Référence Parasites transmis par les aliments, hormis Echinococcus sp. Nom du responsable du LNR Isabelle VALLÉE Nom du laboratoire où l'activité du LNR est mise en oeuvre Laboratoire de santé animale Nom de l'unité où l'activité du LNR est mise en oeuvre Unité BIPAR (Biologie moléculaire et Immunologie Parasitaires) Nom du ou des laboratoires ayant collaboré avec le LNR dans le cadre de son mandat sur l'exercice considéré Laboratoire de Sécurité des Aliments - Anses Nom des unités ayant collaboré avec le LNR dans le cadre de son mandat sur l'exercice considéré Unité Bactériologie et Parasitologie des Produits de la Pêche et de l'Aquaculture, site de Boulogne - Anses

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Rapport annuel d'activité, année 2019

Laboratoire National de Référence Parasites transmis par les aliments, hormis Echinococcus sp.

Nom du responsable du LNR Isabelle VALLÉE

Nom du laboratoire où l'activité du LNR est mise en oeuvre Laboratoire de santé animale

Nom de l'unité où l'activité du LNR est mise en oeuvre Unité BIPAR (Biologie moléculaire et Immunologie Parasitaires)

Nom du ou des laboratoires ayant collaboré avec le LNR dans le cadre de son mandat sur l'exercice considéré Laboratoire de Sécurité des Aliments - Anses

Nom des unités ayant collaboré avec le LNR dans le cadre de son mandat sur l'exercice considéré Unité Bactériologie et Parasitologie des Produits de la Pêche et de l'Aquaculture, site de Boulogne - Anses

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Les faits marquants de l'année Le LNR " Parasites transmis par les aliments " couvre un spectre relativement large de parasites à transmission alimentaire : les nématodes, les trématodes, les cestodes et les protistes. Aujourd'hui, la référence du LNR porte essentiellement sur 2 familles de nématodes (Trichinellidae, Anisakidae), 1 trématode (Alaria alata), 1 cestode (Cysticercus) et 3 protistes (Toxoplasma gondii, Giardia duodenalis, Cryptosporidium sp.). L'ensemble de ces parasites sont des agents zoonotiques de classe 2. Parmi ces parasites zoonotiques, le genre Trichinella est classé comme danger sanitaire de catégorie 2. Le LNR est engagé dans des contrats Européens, dont 2 projets de recherche intégratif de l’EJP One Health (acceptés fin 2019) visant l'amélioration du diagnostic et/ou de la traçabilité de la source d'infection pour Trichinella, Toxoplasma, Giardia et Cryptosporidium. Un contrat national ANR vise également l'étude du cycle biologique de l'hybride de Schistosoma qui a émergé en Corse afin de mieux comprendre sa circulation sur l'ile. Pour l'activité Parasites des poissons, l'équipe de parasitologie du CHU de Rennes a recensé 7 cas humains en Mai 2019 de diphyllobothriose à Dibothriocephalus nihonkaiense, probablement suite à la consommation de saumon du Pacifique cru et non congelé. Le laboratoire a analysé plusieurs échantillons de merlu présentant des lésions macroscopiques et une texture altérée. A chaque fois, des spores de Myxosporidies ont été observées. En l'absence de méthode disponible au laboratoire, l'identification n'a pas été poursuivie.

1. Méthodes développées ou révisées

Nombre de méthodes développées ou révisées proposées à l’autorité compétente 0 méthode(s)

Nombre total de méthodes transférées par le LNR à son réseau dans l'année 0 méthode(s)

2. Matériels biologiques ou chimiques, échantillons et souches d'intérêt Information disponible auprès du LNR.

3. Activités d'analyse

3.1 Analyses officielles de première intention

Nombre d'analyses officielles de première intention réalisées dans l'année (de biotypage, sérotypage, caractérisation moléculaire...) 48 analyse(s)

Détail par type d'analyse de première intention Helminthes

Digestions artificielles de muscle et identification morphologique (analyses officielles Trichine): 8 analyses; Protistes

Sérologie de la toxoplasmose par ADHS: 10 analyses; Recherche de Cryptosporidies par coproscopie et IFI: 30

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3.2 Analyses officielles de confirmation

Nombre d'analyses officielles de seconde intention réalisées dans l'année (de biotypage, sérotypage, caractérisation moléculaire...) 33 analyse(s)

Détail par type d'analyse de confirmation Identification morphologique d'helminthes (analyses officielles Trichinella) : 7

Identification morphologiques autres nématodes des viandes: 15

Identification morphologique d'Alaria spp : 11

3.3 Autres analyses

Nombre estimé d'autres analyses (non officielles) réalisées dans l'année en lien avec le mandat de LNR 704 analyse(s)

Détail par type d'autres analyses Parasites des animaux terrestres: Toxoplasma: Analyses sérologiques sur sérum ou fluides musculaires : 996 animaux (ovins, oiseaux rapaces ou domestiques, ragondins); Giardia: 780 analyses dont 78 coproscopies, 305 Immunofluorescence et 397 PCR Parasites des poissons: Cryptocotyle sp.: 1200 poissons prélevés et 150 analysés pour la détection du parasite. Anisakidae : 420 poissons analysés (programme ATTILA) Sept analyses de détection d'Anisakidae par la méthode de la presse/lumière UV pour des professionnels

Six recherches de parasites dans des échantillons de produits de la pêche : observation de Myxosporidies

3.4 Essais interlaboratoires d'aptitude auxquels le LNR a participé dans l'année Détail des essais interlaboratoires d'aptitude (EILA) auxquels le LNR a participé dans l'année, dans le cadre : National; UE (en particulier les EILA organisés par le LRUE); International Au plan Européen, le LNR a participé aux EILAs orgnisés par le LR-UE Parasites (ISS, Rome): - Detection of Trichinella larvae in meat; - Identification of Trichinella larvae at species level by a molecular method; - Detection of Anisakidae L3 larvae in fish fillets (le LNR et le Laboratoire associé ont participé à cet EILA); - Molecular identification of Anisakid nematodes at the species level (Seul le Laboratoire associé a participé); - Qualitative detection of anti- Toxoplasma IgG in goat serum samples.

4. Activités de production et de contrôle de matériaux de référence et de réactifs biologiques

Le LNR produit des réactifs à usage du LNR uniquement Non

Le LNR produit des réactifs à usage du LNR et du réseau Non

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Le LNR produit des matériaux de référence à usage du LNR uniquement Non

Le LNR produit des matériaux de référence à usage du LNR et du réseau Oui

Types de matériaux de référence produits et fournis (MRE, MRI, contrôle positif ou négatif, autre) Le LNR fourni des échantillons de référence (MRE) pour le test de Détection de larves de Trichinella dans la viande selon la réglementation EU 2015/1375. Ces échantillons sont préparés individuellement à façon. Pour l'année 2019, des échantillons ont été préparés pour les LVD agréés et accrédités, ainsi que pour le Centre Collaborateur OIE homologue au Canada, mais aussi pour des Laboratoires étrangers (Luxembourg, Espagne).

Format (sérum, souche, produit chimique, autre) de ces matériaux de référence Les échantillons de référence sont constitués d'une matrice carnée dans laquelle est intégrée un nombre connu de capsules de Trichinella.

Nombre de lots produits dans l'année Sans objet car il n'y a pas de lots.

Nombre d'unités distribuées au plan national Pour l'année 2019, un total de 156 échantillons de référence de viande artificiellement infectée par des capsules de Trichinella a été préparé et fournis au laboratoires agréés du réseau qui en ont fait la demande. De plus, 3 carcasses de souris infectées ont également été envoyés à des laboratoires.

Analyse de l'évolution (augmentation, diminution) des tendances en termes d'activité sur les 5 dernières années La demande d'échantillons de référence pour les tests officiels de recherche de larves de trichine dans la matrice carnée est en augmentation compte-tenu de la mise sous accréditation de cette analyse. Ces échantillons sont nécessaires aux laboratoires agréés pour l'habilitation de nouveaux personnels ou pour les maintiens d'habilitation. De fait, les laboratoires ont tendance à en demander plus systématiquement. Ces échantillons étant périssable (viande ) et ne pouvant pas être congelés, ils sont proposés lors de deux sessions annuelles afin de regrouper leur préparation. Les périodes choisies sont le début d'année (Février), et l'automne (Sept-Oct) soit avant et après la période d'EILA trichine; cet EILA étant organisé au printemps.

Le LNR réalise des contrôles de réactifs commerciaux Non

5. Activités d'appui scientifique et technique

5.1 Demandes d'appui scientifique et technique (AST) des ministères (de l'agriculture, de la santé, etc...) ou d'instances européennes ou internationales qui concernent le domaine de compétence du LNR

Nombre de demandes d'AST reçues dans l'année 0 demande(s)

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Nombre de rapports d'AST rendus dans l'année, issus de demandes de l'année ou de l'année précédente 0 rapport(s)

5.2 Autres expertises

Les membres de l'équipe du LNR peuvent avoir des activités d'expertise (internes: CES, GT ou externe: EFSA...) ou des activités auprès de commissions de normalisation (Afnor...). 2 scientifiques du LNR : membre du groupe de travail en lien avec le groupe IS0 (Organisation internationale de normalisation) ISO/TC 34, Produits alimentaires, sous- comité SC 9, Microbiologie

1 scientifique : sollicitée pour la normalisation de méthodes de détection des Anisakidae dans les produits de la pêche. 1 scientifique est membre du Cost FA1408 "Foodborne Parasites in Europe". 1 scientifique est membre du comité exécutif de la Commission Internationale de la Trichinellose (ICT), nommée Vice-présidente de l'ICT en Août 2019.

5.3 Dossiers de demande d'agrément Nombre de dossiers de demande d'agrément étudiés dans l'année 0 dossier(s)

5.4 Activités d'appui ou de conseil aux autorités ou aux professionnels

Il n'y a pas d'organisation particulière. Le LNR dispose cependant d'une adresse e.mail générique "[email protected]" permettant de centraliser les demandes provenant des clients (principalement laboratoires agréés, laboratoires privés, DDPP). Le LNR apporte son expertise scientifique auprès du BEAD lors de la gestion de suspicion, pour l'évolution de la réglementation ou pour l'évaluation annuelle de la prévalence nationale.

6. Animation du réseau de laboratoires agréés ou reconnus

6.1 Description du réseau

Animation d'un réseau de laboratoires agréés Oui

Nombre de laboratoires agréés dans le réseau 59 laboratoires

Animation d'un réseau de laboratoires reconnus Non

6.2 Essais interlaboratoires d'aptitude

6.2.1 Organisation d'essais interlaboratoires d'aptitude

Nombre d'EILA organisés par le LNR au cours de l’année 1 EILA

Nom de l'EILA

Recherche de larves de Trichinella par digestion artificielle

L'EILA est-il réalisé sous accréditation "17043"?

Non

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Nombre de laboratoires participants

61 laboratoire(s)

Nombre de laboratoires agréés participants

59 laboratoire(s) agréé(s)

Le LNR a-t-il participé à l'EILA?

Non

Nombre de laboratoires participants en cours de demande d'agrément 0 laboratoire(s) en demande d'agrément

Nombre d'autres laboratoires participants

2 laboratoire(s)

Détail des autres laboratoires participants: français/étrangers

Il s'agit de laboratoires français privés réalisant uniquement l'autocontrôle des analyses de recherche de trichine sur des porcs destinés à l'exportation hors UE.

Nombre de laboratoires dont la performance individuelle a été jugée non satisfaisante** par le LNR

60 laboratoire(s)

Nombre de laboratoires agréés dont la performance individuelle a été jugée non satisfaisante** par le LNR

1 laboratoire(s) agréé(s)

Nature des écarts (limiter aux laboratoires agréés) Les écarts relevés concerne un manque de sensibilité ou de spécificité.

Gestion des écarts (limiter aux laboratoires agréés) : actions mises en œuvre pour l'identification des causes et définition des mesures correctives

Les causes de non-conformité ont été identifiés pour 2 laboratoires sur 3 avec notamment le facteur humain (geste technique non réalisé́ rigoureusement et avec précision) et défaut de rinçage de la vaisselle. Les actions correctives mises en œuvre ont donc été la re-sensibilisation du personnel habilité et une amélioration du rinçage de la vaisselle.

Suivi de décisions sur l'agrément Le laboratoire qui a obtenu des résultats non satisfaisant a perdu son agrément pour le diagnostic officiel des trichines dans la matrice carnée.

Evolution du réseau dans le temps

Le réseau est stable depuis 2017 tant au niveau du nombre de laboratoires agréés que de leur performance.

6.2.2 Exploitation de résultats d'essais interlaboratoires d'aptitude organisé par un tiers

Le LNR exploite les résultats d'EILA organisé(s) par un (des) tiers (LRUE, autre...) Non

(**) au sens de la norme 17043

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6.3 Autres actions visant à vérifier l'aptitude des laboratoires

Actions mises en œuvre Sans objet

6.4 Formation, organisation d'ateliers

Nombre de journées d'échange et de restitution rassemblant les laboratoires agréés du réseau, organisées dans l'année

0 journée(s)

Nombre de sessions de formation des personnels des laboratoires agréés aux méthodes utilisées pour les contrôles officiels, organisées dans l'année 2 session(s) de formation

Détail de ces activités, durée moyenne des sessions et nombre de participants par session Le LNR organise chaque année au moins un stage de deux jours de formation théorique et pratique sur le diagnostic officiel des trichinelloses animales. Il s'agit d'un stage spécialisé qui s'adresse aux techniciens des laboratoires d'analyses vétérinaires mais aussi aux responsables qualité chargés de mettre en place l'assurance qualité de l'analyse officielle. Le programme du stage comprend une présentation du parasite Trichinella spp (cycles biologique et épidémiologique, anatomie du parasite), de la trichinellose humaine, de la méthode officielle de détection dans la matrice carnée, de l'assurance qualité qui entoure ce diagnostic avec l'accréditation des laboratoires, les points critiques de la technique, la gestion des résultats non négatifs et la réglementation en vigueur. La formation est élargie à la présentation aux autres parasites susceptibles d'être identifiés au cours d'une analyse trichine. Les stagiaires effectuent au laboratoire la pratique du test officiel par binôme. La capacité maximale d'accueil par stage est de 10 participants.

Autres formations dans le cadre des activités du LNR Des techniciens des laboratoires agréés peuvent venir se former en dehors des stages officiels notamment lors de problèmes rencontrés suite aux EILA. Il s'agit d'une formation pratique, sur une journée et sans contrôle de connaissance. Elle n'a pas de valeur de stage officiel vis-à-vis de l'agrément.

6.5 Organisation d'autres essais interlaboratoires (EIL) Nombre d'EIL de validation (EILV) organisés par le LNR au cours de l’année 0 EILV

Nombre d'EIL de transfert (EILT) organisés par le LNR au cours de l’année 0 EILT

7. Surveillance, alertes

7.1 Surveillance programmée par l'autorité sanitaire, notamment PS/PC et prophylaxie officielle en santé animale

L'autorité sanitaire a mis en œuvre dans l'année une surveillance programmée dans le champ du LNR

Non

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7.2 Autres activités de surveillance

Le LNR est impliqué dans des activités de surveillance autres que celle programmée par l'autorité sanitaire Oui

Cadre de ces activités Autre

Précisions sur "Autre activité": Collecte des données d'abattoirs

Activités dans lesquelles le LNR a été impliqué dans le cadre de Collecte des données d'abattoirs Pilotage ; Appui scientifique et technique (analyses de données, etc...)

7.3 Fiches d'alerte ou de signal Le LNR a émis dans l'année des fiches d'alerte ou de signal dans Salsa (système d'alerte sanitaire de l'Anses) Oui

Nombre de fiches émises dans Salsa dans l'année: 2 fiche(s)

8. Activités de recherche en lien avec l'activité de référence Acronyme Titre Statut

AptaTrich (doctorat) – EJP OH

Development of an aptamer-based test for trichinella detection

Démarrage

ToxoSources – EJP OH

Toxoplasma gondii source quantified Démarrage

Stratégies thérapeutiques et préventives innovantes de lutte contre la cryptosporidiose animale

Paradise – EJP OH PARAsite Detection, ISolation and Evaluation (Cryptosporidium, Giardia)

Démarrage

Development de tests sérologiques pour la détection de la trichinellose porcine

ATTILA Actions pour le développement de Technologies et Techniques de lutte contre l'Infestation par les Larves d'Anisakidés

en cours

Fish&CrySp (Doctorat)

Caractérisation et distribution de Cryptocotyle et Spraguea, parasites potentiellement zoonotiques dans les produits de la pêche et de l'aquaculture

en cours

FreezAni Définition des conditions de congélation domestique pour tuer les larves d'Anisakidae dans les produits de la pêche

en cours

ToxSauQMRA – EJP OH (doctorat)

Study of the tropism and persistence of Toxoplasma gondii: from pork carcass to sausage and dry ham, a quantitative microbiological risk assessment

Démarrage

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9. Relations avec le CNR

Existence d'un CNR dont le mandat recouvre au moins en partie celui du LNR Oui

Intitulé du CNR 1- Laboratoire conventionné avec Santé Publique France pour la surveillance des cas humains de trichinellose

2- CNR Toxoplamose

3- CNR Cryptosporidioses

Organisme porteur du CNR 1-AP/HP, Hôpital Cochin, Service de Parasitologie

2- CHU Reims, Service de Parasitologie

3- CHU Rouen, Service de Parasitologie

Rencontre organisée dans l'année avec le CNR Oui

Collaboration avec le CNR dans le cadre de la surveillance Le LNR et le laboratoire associé travaillent en lien avec ces trois CNR. Des plans de surveillance ont été conduits ensemble par le passé avec le CNR toxoplasmose. Le LNR a participé au comité scientifique du congrès international "Cryptosporidium & Giardia" organisé à Rouen en Juin 2019 par le CNR Cryptosporidioses. En ce qui concerne Trichinella, des échanges réguliers se font dans le cadre de gestions de cas avérés humains de trichinellose ou de suspicions afin d'agir rapidement à la fois pour l'identification de patients et de leur prise en charge mais aussi au niveau vétérinaire avec l'identification de la source de contamination et de l'espèce de trichinella incriminée.

Collaboration avec le CNR dans le cadre de projets de recherche Un contrat de recherche a commencé avec le CNR Toxoplasmose concernant l'étude de la survie et de la viabilité de Toxoplasma dans la matrice carnée et notamment les produits transformés comme les saucissons secs et les jambons. Ce contrat se fait aussi en partenariat avec l'Institut Français du Porc.

Autres collaborations avec le CNR, le cas échéant Sans objet

Transfert de matériel biologique Non

10. Relations avec le LRUE

Détention d'un mandat LRUE qui recouvre au moins en partie celui du LNR Non

Existence d'un LRUE dont le mandat recouvre au moins en partie celui du LNR Oui

Intitulé du LRUE

European Union Reference Laboratory for Parasites – ISS Roma

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Le LNR a participé au Workshop organisé par le LRUE Oui

Le LNR a participé à une formation organisée par le LRUE Non

Raison pour laquelle le LNR n'a pas participé

Le LNR a participé à des formations les années passées en fonction des besoins, mais en 2019 il n'y a pas eu d'agents formés au LR-UE. Une formation est prévue en 2020.

Relations avec le LRUE

Questions posées par le LNR Le LNR entretien de bonnes relations de collaborations scientifiques et de référence avec le LR-UE. Des publications témoignent de ces collaborations et un contrat européen est en cours avec le projet de recherche conjoint Paradise au sein de l’EJP One Health concernant le développement d'outils de détection de Cryptosporidium et Giardia dans l'environnement.

Points particuliers ou d'actualité sur l'année, à signaler Sans objet

11. Détention d'autres mandats de référence au niveau international Autres mandats détenus par le LNR dans le même domaine de compétences Centre Collaborateur OIE

Intitulé(s) officiel(s) Centre Collaborateur OIE pour les "Foodborne Zoonotic Parasites"

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Annexes

Liste des publications et communications 2019 dans le cadre du mandat de LNR Parasites transmis par les Aliments (Maisons-Alfort) et

laboratoire associé (Boulogne-sur-Mer)

Les noms des auteurs appartenant au LNR sont soulignés. Les publications de cette liste sont sous presse ou publiées.

Publications scientifiques nationales et internationales (Revues à comité de lecture)

1. Le Roux D, Djokic V, Morisse S, Chauvin C, Doré V, Lagrée A-C, Voisin D, Villain Y, Grasset-Chevillot A, Boursin F, Chunlei Su, Perrot S, Vallée I, Séche E, Blaga R. 2019. « The feline immune response after vaccination with the Mic1-3 knockout Toxoplasma gondii strain.” Vaccine, doi: 10.1016/j.vaccine.2019.11.076.

2. Sahraoui L, Thomas M, Chevillot A, Mammeri M, Polack B, Vallée I, Follet J, Ain-Baaziz H, Adjou K. 2019. “Molecular

characterization of zoonotic Cryptosporidium spp. and Giardia duodenalis pathogens in Algerian sheep.” Veterinary Parasitology: Regional Studies and Reports, 100280. doi.org/10.1016/j.vprsr.2019.100280.

3. Oleaga A, Rey O, Polack B, Grech-Angelini S, Quilichini Y, Pérez-Sánchez R, Boireau P, Mulero S, Brunet A, Rognon A,

Vallée I, Kincaid-Smith J, Allienne JF, Boissier. 2019. “Epidemiological Surveillance of Schistosomiasis Outbreak in Corsica (France): Are Animal Reservoir Hosts Implicated in Local Transmission? “ PLOS Neglected Tropical Diseases, 13, (6): e0007543. doi.org/10.1371/journal.pntd.0007543.

4. Mammeri M, Cartou L, Chevillot A, Thomas M, Julien C, Vallée I, Polack B, Follet J, Adjou K. 2019. “First Identification

of Cryptosporidium Parvum Zoonotic Subtype IIaA15G2R1 in Diarrheal Lambs in France.” Veterinary Parasitology: Regional Studies and Reports, 18: 100355. doi.org/10.1016/j.vprsr.2019.100355.

5. Mammeri M, Chevillot A, Chenafi I, Thomas M, Julien C, Vallée I, Polack B, Follet J, Adjou K. 2019. “Molecular

Characterization of Cryptosporidium Isolates from Diarrheal Dairy Calves in France.” Veterinary Parasitology: Regional Studies and Reports, 18: 100323. doi.org/10.1016/j.vprsr.2019.100323.

6. Mammeri M, Chevillot A, Thomas M, Julien C, Auclair E, Pollet T, Polack B, Vallée I, Adjou K. 2019. “Cryptosporidium

Parvum-Infected Neonatal Mice Show Gut Microbiota Remodelling Using High-Throughput Sequencing Analysis: Preliminary Results.” Acta Parasitologica, 64 (2):268-275. doi.org/10.2478/s11686-019-00044-w.

7. Gajadhar A, Noeckler K, Boireau P, Rossi P, Scandrett B, Gamble R. 2019. « International commission on Trichinellosis:

Recommendations for quality assurance in digestion testing programs for Trichinella.” Food and Waterborne Parasitology, e00059. doi.org/10.1016/j.fawpar.2019.e00059.

8. Blaga R, Aubert D, Thébault A, Perret C, Geers R, Thomas M, Alliot A, Djokic V, Ortis N, Halos L, Durand B, Mercier A,

Villena I, Boireau P. 2019. « Toxoplasma gondii in beef consumed in France: regional variation in seroprevalence and parasite isolation. » Parasite, 26, 77, doi.org/10.1051/parasite/2019076.

9. Bărburaș D, Gyӧrke A, Blaga R, Bărburaș R, Kalmár Z, Vişan S, Mircean , Blaizot A, Cozma V. 2019 “Toxoplasma Gondii

in Water Buffaloes (Bubalus Bubalis) from Romania: What Is the Importance for Public Health?” Parasitology Research 118,(9): 2695 2703. doi.org/10.1007/s00436-019-06396-6.

10. Certad G., Follet J. Gantois N. Hammouma-Ghelboun O., Guyot K., Benamrouz-Vanneste S., Fréalle E., Seesao Y.,

Delaire B., Creusy C., Even G., Verrez-Bagnis V., Ryan U., Gay M., Aliouat-Denis C.M., Viscogliosi E. 2019. "Prevalence, molecular identification, and risk factors for Cryptosporidium infection in edible marine fish: a survey across sea areas surrounding France". Front. Microbiol. 10:1037. doi: 10.3389/fmicb.2019.01037.

11. Gay M., Lailler R., Bourgau O., Rudloff L., Guillotteau S., Midelet G. 2019. "Niveaux d'infestation par les Anisakidae

chez sept espèces de poisson prélevées au stade de la distribution en France". Bulletin épidémiologique santé animale alimentation. Sous presse.

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Communications nationales

Duflot M., Vanderschooten L., Bourdin G., Gay M. 2019. "Caractérisation et distribution de Cryptocotyle dans les produits de la pêche et de l’aquaculture". Congrès annuel des sociétés françaises de parasitologie et de mycologie médicale, Tours. (Communication affichée) Duflot M., Vanderschooten L., Bourdin-Midelet G., Gay M. 2019. "Caractérisation et distribution de Cryptocotyle, un parasite zoonotique potentiel, dans les produits de la pêche". Journées Ifremer Manche – Mer du Nord, Lille. (Communication orale)

Communications internationales

1. Karadjian G, Heckmann A, Blanchard A, Grasteau A, Boireau P, Neveu C, Martin and Vallée I. 2019. « Transient inactivation of Trichinella spiralis adults unc-63 by RNA interference. » 15th International Conference of Trichinellosis, Cluj-Napoca, Roumanie, 26th -30th August. (Communication orale)

2. Wang Anqi, Heckmann A, Caignard G, Vitour D, Liu M, Bruneau S, Boireau P, Vallée I and Karadjian G. 2019. “The New-Born Larvae stage specific serine protease NBL1 interacts with the host’s cell Vimentin.” 15th International Conference of Trichinellosis, Cluj-Napoca, Roumanie, 26th -30th August. (Communication orale)

3. Xiaoxiang Hu, Xiaolei Liu, Yong Yang, Anqi Wang, Haining Shi, Xuenong Luo, Wanzhong Jia, Xuepeng Cai, Vallée I, Boireau P, Xue Bai, Mingyuan Liu. 2019. “The roles of serine protease-like protein from the new-born larvae stage of Trichinella spiralis in regulating collagen synthesis and differentiation on C2C12 myoblasts in vitro.” 15th International Conference of Trichinellosis, Cluj-Napoca, Roumanie, 26th -30th August. (Communication orale)

4. Caron Y, Bory S, Prum Sang Houn, Lim Sun Bun Hong, Vallée I, Sengdoeun Yi, Sovann Ly, Yera H. 2019. “First description of Trichinella papuae involved in an outbreak in central Kampong Thom province in Cambodia.” 15th International Conference of Trichinellosis, Cluj-Napoca, Roumanie, 26th -30th August. (Communication orale)

5. Barruet R, Devez A, Dupouy-Camet J, Gely F, Karadjian G, Plavsa D, Chydériotis G, Vallée I, Sofronic-Milosavljevic L, Yera H. 2019. “Backyard pigs: a common source for a trichinellosis outbreak reported in France and Serbia in 2017.” 15th International Conference of Trichinellosis, Cluj-Napoca, Roumanie, 26th -30th August. (Communication orale)

6. Adjou K, Mammeri M, Chenafi I, Chevillot A , Thomas M , Polack B , Follet J, Julien C , Vallée I. 2019. “Cryptosporidium Genotypes and Subtypes in Diarrheal Dairy Calves in France.” 27th Conference of the World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology (WAAVP), Madison, WI, USA. 7th -11th July. (Communication orale)

7. Adjou K, Sahraoui L, Mammeri M, Thomas M, Chevillot A, Julien C, Polack B, Vallée I, Follet J, Ain Baaziz H. 2019. “Cryptosporidium and Giardia Species and Genotypes in Sheep in Algeria.” 27th Conference of the World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology (WAAVP), Madison, WI, USA. 7th-11th July. (Communication orale)

8. Vallée I, Boireau P, Karadjian G, Polack B. 2019. “Zoonotic foodborne parsites in wild boar meat: how Trichinella inspection allows identification of other helminths.” Foodborne parasites conference, COST action Euro-FBP, Oeiras, Portugal. 14 February. (Communication affichée)

9. Karadjian G, Bahn P, Johne A, Bassiloud B, Py J-S, Mayer-Scholl A, Vallée I. 2019. “Trichinella species identification by Maldi-Tof. Foodborne parasites conference.” Foodborne parasites conference, COST action Euro-FBP, Oeiras, Portugal. 14 February. (Communication affichée)

10. Gay M., Lailler R., Bourgau O., Rudloff L., Guillotteau S., Midelet G. 2019. "Anisakidae infestation levels in seven fish species at the retail stage in France: results of the 2017 national surveillance plan". 1st Annual Scientific Meeting of the One Health European Joint Programme OHEJP, Dublin (Irlande) (Communication affichée)

Conférences sur invitation

Gay M.. 2019. "Parasites in finfish: What’s the Risk? « Symposia “Emerging Hazards Associated with Seafood”, Annual Meeting of International Association for Food Protection, Louisville, U.S.A.

Autres (thèses, rapports de projets, d’expertise, et documents d’appui scientifique et technique)

Gay M. 2019. "Histoires d’Agents Pathogènes dans le Milieu Aquatique : Des Vibrio et des Anisakidae". Mémoire d’HDR,

Université du Littoral Côte d’Opale, France. (soutenance le 12 décembre 2019)

Vallée I, Zanella G, Goulinet M, Laborieux J, Boireau P. 2019. « Bilan de surveillance de Trichinella spp chez les animaux

de boucherie en 2016. » Bulletin épidémiologique, santé animale et alimentation (5).