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Quelques sujets de stage de Master 2 en cours (2015) Evaluation de la fonction de nourricerie du fond de la baie de Saint-Brieuc pour l’ichtyofaune. Structure daccueil : Réserve Naturelle Nationale de la Baie de Saint-Brieuc (Côtes dArmor) -Thématique générale Fonctionnalité des prés salés au regard de l’Ichtyofaune . - Objectifs scientifiques -Caractérisation de la communauté de poissons qui fréquente les prés salés ainsi que des proies potentielles et consommées. - Evaluation de la fonction de nourricerie des marais salés au travers de l’évaluation des critères définissant une « zone de nourricerie ». -Tentative de reconstitution du réseau trophique à partir de l’analyse des isotopes stables des espèces les plus représentatives. Ces objectifs seront réalisés pour les deux espèces les plus abondantes : le Bar et les Gobies. Impacts de l’écrevisse invasive de Louisiane sur la faune native d’amphibiens (grenouille agile, triton palmé, triton marbré). Structure daccueil : UMR 6553 ECOBIO Université de Rennes 1 - Thématique générale Ségrégation de niche entre la faune native d’amphibiens et l’écrevisse invasive de Louisiane dans un contexte de réseau de mares. - Objectifs scientifiques Volet 1 : identifier s’il existe une exclusion spatiale de 3 espèces d’amphibiens par l’écrevisse de Louisiane dans un réseau de mares (impacts à long terme de l’écrevisse). Volet 2 : caractériser et quantifier les impacts à court terme de l’écrevisse de Louisiane sur les amphibiens en termes de succès reproducteur, mobilité et morphologie des larves. Etude de la contribution des chiroptères dans la régulation des ravageurs en verger de pommier. Structure daccueil : Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes - Thématique générale Biodiversité fonctionnelle en arboriculture fruitière -Objectifs scientifiques - Etude de la prédation de la Tordeuse orientale (Grapholitha molesta) et du Carpocapse de la pomme (Cydia pomonella) par les chiroptères en lien avec la dynamique de ces ravageurs. - Déterminer les espèces de chauves-souris impliquées dans la prédation et la fréquentation du milieu. - Définition des caractéristiques paysagères favorisant l’activité globale et l’activité de chasse des chiroptères en paysage agricole. - Etudier la prédation des ravageurs par les chiroptères autour d’une source de lumière.

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Quelques sujets de stage de Master 2 en cours (2015)

Evaluation de la fonction de nourricerie du fond de la baie de Saint-Brieuc pour

l’ichtyofaune.

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: RRéésseerrvvee NNaattuurreellllee NNaattiioonnaallee ddee llaa BBaaiiee ddee SSaaiinntt--BBrriieeuucc ((CCôôtteess dd’’AArrmmoorr))

-Thématique générale

Fonctionnalité des prés salés au regard de l’Ichtyofaune

. - Objectifs scientifiques

-Caractérisation de la communauté de poissons qui fréquente les prés salés ainsi que des

proies potentielles et consommées.

- Evaluation de la fonction de nourricerie des marais salés au travers de l’évaluation des

critères définissant une « zone de nourricerie ».

-Tentative de reconstitution du réseau trophique à partir de l’analyse des isotopes stables des

espèces les plus représentatives.

Ces objectifs seront réalisés pour les deux espèces les plus abondantes : le Bar et les Gobies.

Impacts de l’écrevisse invasive de Louisiane sur la faune native d’amphibiens

(grenouille agile, triton palmé, triton marbré).

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: UUMMRR 66555533 EECCOOBBIIOO UUnniivveerrssiittéé ddee RReennnneess 11

- Thématique générale

Ségrégation de niche entre la faune native d’amphibiens et l’écrevisse invasive de Louisiane

dans un contexte de réseau de mares.

- Objectifs scientifiques

Volet 1 : identifier s’il existe une exclusion spatiale de 3 espèces d’amphibiens par

l’écrevisse de Louisiane dans un réseau de mares (impacts à long terme de l’écrevisse).

Volet 2 : caractériser et quantifier les impacts à court terme de l’écrevisse de Louisiane sur

les amphibiens en termes de succès reproducteur, mobilité et morphologie des larves.

Etude de la contribution des chiroptères dans la régulation des ravageurs en

verger de pommier.

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: CCeennttrree TTeecchhnniiqquuee IInntteerrpprrooffeessssiioonnnneell ddeess FFrruuiittss eett LLéégguummeess

- Thématique générale

Biodiversité fonctionnelle en arboriculture fruitière

-Objectifs scientifiques

- Etude de la prédation de la Tordeuse orientale (Grapholitha molesta) et du Carpocapse de

la pomme (Cydia pomonella) par les chiroptères en lien avec la dynamique de ces ravageurs.

- Déterminer les espèces de chauves-souris impliquées dans la prédation et la fréquentation

du milieu.

- Définition des caractéristiques paysagères favorisant l’activité globale et l’activité de chasse

des chiroptères en paysage agricole.

- Etudier la prédation des ravageurs par les chiroptères autour d’une source de lumière.

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Structuration des assemblages d’Arthropodes des strates foliaires d’un réseau de

haies.

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: EEAA 77331166 BBiiooddiivveerrssiittéé eett ggeessttiioonn ddeess TTeerrrriittooiirreess UUnniivveerrssiittéé ddee RReennnneess 11

- -Thématique

- Facteurs écologiques-clés structurant les groupes fonctionnels -prédateurs et phytophages

arthropodes - du feuillage des haies. Influence ‘micro-/macro-architecture des haies ‘ vs

‘exposition des haies’.

- -Objectifs

- - Quantifier les différences de températures au niveau des strates foliaires pour des haies

soumises à différentes expositions solaires (mesures par capteurs thermiques)

- -Evaluer l’influence relative des amplitudes thermiques observées (exposition des haies), et

des caractéristiques micro-architecturales et macro-architecturales de la strate foliaire

(indices de complexité) sur la structuration des assemblages d’Araignées (diversité, densité,

groupes fonctionnels) et d’Insectes phytophages (diversité, densité, abondance relative).

Stratégie de conservation des bryophytes du territoire d’agrément du CBN du Massif Central : Cas de 9 espèces rares et menacées d’Auvergne.

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: CCoonnsseerrvvaattooiirree BBoottaanniiqquuee NNaattiioonnaall dduu MMaassssiiff CCeennttrraall

- Thématique générale

Conservation in et ex situ des bryophytes rares et menacées d’Auvergne.

- Objectifs scientifiques

- Affiner la connaissance sur la biologie, la répartition et l’écologie des espèces ciblées par le

projet ; en particulier les exigences écologiques à l’échelle de la phytocénose et du micro-

habitat : à partir de la littérature scientifique, ainsi que par des expérimentations in situ.

-Proposer des actions concrètes de mesures de conservation in situ, sous forme de fiches

action à rédiger, et ce pour chacune des 9 espèces, la biologie et les écologies étant très

variables au sein de ce premier « groupe » d’espèces.

-Initier la mise en collection à but conservatoire (conservation ex situ) au CBN des espèces

ciblées, dans un but de réintroduction à court terme.

Dans certains cas, utiliser cette mise en collection :

- pour affiner les connaissances écologiques, par exemple la différence des taux de croissance

et de survie au sein d’une espèce (Pallavicinia lyelli)

- pour définir les meilleures conditions de croissance et de développement ex situ des espèces,

(quel substrat assure les meilleurs taux de croissance/reproduction (Aloina bifrons) ?).

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Densité et évolution démographique des populations de micromammifères par capture-marquage-recapture et analyse photographique de la fréquentation de passages à faune.

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: CCoonnsseeiill DDééppaarrtteemmeennttaall dduu BBaass--RRhhiinn

- Thématique générale

Suivi pluriannuel des passages à faunes dans les agroécosystèmes

- Objectifs scientifiques

-Etudier la répartition spatiale des campagnols des champs dans les parcelles, selon un

gradient du bord de route, vers l’extrémité opposée de la parcelle.

-Estimer l’efficacité relative des passages à faune en fonctions de la densité de population

présente aux abords des passages

Suivi de la colonisation et de la dispersion des amphibiens au sein d’un réseau de

zones humides en forêt.

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: ééqquuiippee IIPPAA--PPEE ((iinnggéénniieerriiee dduu pprroojjeett,, aamméénnaaggeemmeenntt,, ppaayyssaaggeess eett

eennvviirroonnnneemmeenntt)) ddee ll’’UUMMRR CCNNRRSS 77332244 CCIITTEERREESS –– UUnniivveerrssiittéé FFrraannççooiiss RRaabbeellaaiiss ddee TToouurrss..

- Thématique générale

Colonisation et dispersion des amphibiens au sein d’un réseau de zones humides forestières

et connectivité fonctionnelle (approche génétique).

- Objectifs scientifiques

(1) Comprendre les patrons de dispersion et de colonisation des espèces d’amphibiens au sein

d’un réseau de mares forestières restaurées, en fonction des conditions environnementales et

de la structure spatiale du réseau..

(2) Analyser les capacités de déplacements d’espèces cibles au sein du réseau

(3) aborder la diversité génétique intra-spécifique, des populations inféodées au réseau de

mares forestières.

Analyse comparative des méthodes d’échantillonnages et des méthodes

d’identification des Aranéides de forêts tropicales

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: EEAA 77331166 BBiiooddiivveerrssiittéé eett ggeessttiioonn ddeess TTeerrrriittooiirreess UUnniivveerrssiittéé ddee RReennnneess 11

- Thématique générale

Stratégies d’échantillonnages des aranéides et estimateurs de biodiversité en couvert

forestier tropical ; apport de la technologie du ‘barcoding pour la ségrégation des

morpho-espèces.

- Objectifs scientifiques

- Les communautés répondent de la même manière aux paramètres écologiques (période

= jour vs nuit , altitude : bas vs. Inselberg). Les deux méthodes d’échantillonnage

utilisées (fauchage sur transect et battage dans quadrat) ont-elles la même efficacité

sur les deux sites échantillonnés (Guyane 2010 vs. 2013). ?

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- La méthode du fauchage sur transect permet elle de collecter plus d’individus et une

richesse taxonomique plus importante que la méthode du battage dans quadrat ?les

proportions d’uniques et de dupliqués ainsi que l’indice de complétude (Richesse

observée/Richesse estimée) sont-ils similaires entre les deux méthodes ?Les deux

méthodes permettent-elles d’échantillonner les mêmes communautés (familles)

puisqu’elles ne ciblent pas exactement les mêmes strates ?

- L’identification à la morpho-espèce et à l’espèce permettent d’obtenir une précision

sensiblement similaire (Basset et al., 2000). L’identification grâce à la technologie du

barcoding permet-elle de ségréger de manière plus précise les espèces et de mettre en

évidence les espèces cryptiques que les critères morphologiques ne permettent de

distinguer ?

Cartographie et analyse de la structure des populations du Pique prune

(Osmoderma eremita (Scopoli, 1763)) dans la Réserve Biologique Intégrale du

Marquairès (Lozère – 48)

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: OOffffiiccee NNaattiioonnaall ddeess FFoorrêêttss LLaanngguueeddoocc RRoouussssiilllloonn..

- Thématique

Structure, dynamique et conservation des espèces organisées en métapopulations.

-- Objectifs scientifiques

Réaliser une cartographie et une analyse descriptive des populations du Pique prune

sur le site du Marquaires afin :

- de définir les préférences écologiques de l'espèce sur le site (essence, diamètre…)

- de décrire la structure spatiale de la métapopulation

- d'estimer la taille de la métapopulation

- d'évaluer son état de conservation et les risques d'extinction locale dans un espace

forestier en libre évolution

A partir des éléments de biologie et d'écologie connus sur l'espèce et des données déjà

accumulées dans la vallée du Tarnon, entamer une réflexion sur la stratégie de

conservation de l'espèce à l'échelle de ce territoire.

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Quelques résumés de rapports de stages (promotion 2013-2014).

Étude des facteurs environnementaux influençant le choix du site

de reproduction du Crapaud calamite (Bufo calamita) sur la retenue

de la Chèze.

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: BBrreettaaggnnee VViivvaannttee -- RReennnneess

De nombreuses espèces d'amphibiens, dont le Crapaud calamite (Bufo calamita),

sontactuellement mises en danger par la fragmentation et la destruction de leurs habitats. En

effet, cette espèce pionnière dont les populations sporadiques sont éloignées les unes des

autres, estparticulièrement sensible à ces facteurs. Une meilleure connaissance des paramètres

influençant larépartition du crapaud calamite, en période de reproduction, permettrait

d'améliorer les politiques degestions conservatoires. Dans ce contexte, une étude a été réalisée

sur une population de crapauds calamites suivie depuis quatre ans sur la retenue de La Chèze

(Ille-et-Vilaine). Des caractéristiques structurelles et physico-chimiques ont été relevées

pendant la saison de reproduction, sur cinquante tronçons. De plus des relevés paysagers ont

été effectués en périphérie du site d'étude, afin d'identifier les trames potentiellement utilisées

par le crapaud calamite.

Une importante population estimée à 410 individus a été identifiée sur le site. Les résultats ont

montré une préférence du crapaud calamite pour les milieux pionniers et les eaux alcalines.

Par ailleurs, l'analyse des connectivités entre les sites de pontes identifiés a permis d'émettre

l'hypothèse de la présence de deux sous-populations au sein de la retenue de La Chèze. Cette

importante population est cependant menacée par la fermeture du milieu et le manque de

connectivité entre les sous populations identifiées. Des mesures de gestion ont ainsi été

préconisées, afin d'améliorer le statut du crapaud calamite sur la retenue de La Chèze.

Néanmoins une étude de la connectivité à plus grande échelle serait à envisager pour

améliorer les connaissances sur la viabilité des populations.

Mots clés : Amphibiens, Fragmentation, Connectivité, Espèce pionnière, Gestion

conservatoire

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Facteurs de répartition des espèces d’Anisoptères de rivières en

Région Pays de Loire

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: GGRREETTIIAA –– RReennnneess

DDiiaaggnnoossttiicc ééccoollooggiiqquuee ddee RRoosseelliièèrreess eett ddee lleeuurr ppootteennttiiaalliittéé dd’’aaccccuueeiill

ppoouurr ll’’aavviiffaauunnee ppaalluuddiiccoollee :: llee ccaass dduu mmaarraaiiss dduu PPeennddéé ((SSoommmmee))

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: CCoonnsseerrvvaattooiirree ddeess EEssppaacceess NNaattuurreellss ddee PPiiccaarrddiiee

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RReessttaauurraattiioonn ddee llaa ccoonnttiinnuuiittéé ééccoollooggiiqquuee dd’’uunn mmaarraaiiss lliittttoorraall

eennddiigguuéé :: ssuuiivvii dduu ppeeuupplleemmeenntt ppiisscciiccoollee eett eessppèècceess ppaattrriimmoonniiaalleess..

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: OONNCCFFSS

SSttrruuccttuurree eett ccoommppoossiittiioonn ddeess ccoommmmuunnaauuttééss dd’’AArrtthhrrooppooddeess ddee

bbooiisseemmeennttss iissssuuss ddee ddéépprriissee :: ll’’aarrbbrree vvaa--tt--iill pplluuss vviittee qquuee llaa ffoorrêêtt ??

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: EEAA 77331166,, BBiiooddiivveerrssiittéé eett ggeessttiioonn ddeess TTeerrrriittooiirreess,, UUnniivveerrssiittéé ddee

RReennnneess 11

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Evaluation du succès de réhabilitation de Zones Humides dans le

Finistère à partir des communautés d’arthropodes terrestres: état

initial et mise en place méthodologique.

SSttrruuccttuurree dd’’aaccccuueeiill :: UUnniivveerrssiittéé ddee BBrreettaaggnnee oocccciiddeennttaallee,, EEAA 22221199 GGééooaarrcchhiitteeccttuurree

[Résumé]

Cette étude a pour objectif de réaliser l’état initial du critère « Macro-invertébrés du sol » de

trois projets du réseau expérimental de réhabilitation de zones humides du Finistère selon une

méthodologie qui permettra dans les années à venir de suivre l’évolution des parcelles réhabilitées.

Pour cela, les communautés de carabes et d’araignées ont été échantillonnées sur trois parcelles

expérimentales et leurs trois parcelles de références. La méthode utilisée est celle des pièges Barber,

sur chaque parcelle 3 réplicats de 4 pièges ont été positionnés et relevés toutes les deux semaines de

mi-avril à mi-juin. Un total de 9 174 araignées et de 6 488 carabes, représentant respectivement 79 et

80 espèces, ont été récoltés et identifiés lors des 4 sessions de piégeage. L’hypothèse avancée est que

les parcelles de référence, faiblement perturbées, seront dominées par des espèces de grande taille,

spécialistes et brachyptères tandis que les parcelles expérimentales, plus perturbées, seront dominées

par des espèces de petite taille, généralistes et macroptères. Les parcelles sont ainsi décrites en prenant

en compte les paramètres de suivi spécifiques et fonctionnels de ces deux communautés. A partir de

ces paramètres, la comparaison des parcelles expérimentales avec leurs parcelles de référence

associées a été réalisée. L’hypothèse avancée a pu être validée pour deux des sites étudiés, tandis que

sa non vérification pour le troisième site peut s’expliquer par les connaissances sur sa gestion. Parmi

les paramètres suivis, ceux liés aux traits d’histoire de vie apparaissent comme étant les plus

intéressants à suivre lors de l’évaluation future des travaux de réhabilitation. La fiabilité du dispositif

d’échantillonnage et l’efficacité future des travaux de réhabilitation seront ensuite discutés.

Mots clés : Réhabilitation ; Zones humide ; Araignée ; Carabe ; Traits fonctionnels