Zotero 101 : découverte d'un logiciel de gestion de références bibliographiques
Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0
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©Club photo et Maxime Storn
Mendeley : gestion de références bibliographiques et collaboration entre chercheurs
Alain Marois – Bibliothèque de l'Ecole Centrale de [email protected] / www.twitter.com/amarois
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Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
Plan
● Les logiciels de gestion de références
bibliographiques● Installation de Mendeley● Gérer sa bibliothèque de références● Citer en utilisant ses références● Partager, collaborer, gérer son identité numérique
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Trop de références bibliographiques
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sur une idée originale de Valentin Vivier
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Gérer sa bibliographie
● S'organiser● Capitaliser● Privilégier le fond sur la forme● Partager des références, collaborer● Découvrir de nouveaux travaux ?
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Des outils dédiés
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Besoins classiques...et émergents
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sur une idée originale de Martin Fenner
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Mendeley 1/2
● Logiciel à installer + service en ligne (http://www.mendeley.com)● Windows + Mac + Linux● Modèle de Last.fm (partage de musique)● Version beta, gratuit, mais... ●...business model en évolution, mais...●... « what is free now will remain free »● Société basée à Londres
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Mendeley 2/2
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Installation de Mendeley
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Téléchargement : option 1
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Par défaut, téléchargement suite à l'initialisation d'un compte
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Téléchargement : option 2
Il est aussi possible d'installer l'outil sans créer de compte à priori
Mendeley est disponible sur de nombreuses plateformes
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Installation : les plugins Word et OpenOffice
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Compatibilité word 2003 - 2007
Compatibilité OpenOffice
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Vue d'ensemble de l'interface « Desktop »
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Collections, collections partagées, corbeille
Filtres (auteurs, journaux, tag, mots clés auteur
Liste des références
Détails, tag et annotations, références citées
Moteur de rechercheBarre d'outils
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Créer sa bibliothèque de références
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Ajouter des références : via Mendeley Desktop
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Différentes stratégies :● Ajout d'un document ou d'un répertoire de documents● « Watch a folder », pour l'import automatique de PDF● Ajout de références au format EndNote, BibTeX, RIS, etc.
Ajout par « glisser-déposer » de fichiers PDF...
...et Mendeley extraira les descriptions du document PDF automatiquement
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Ajouter des références : utiliser l'import web
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Un simple lien placé dans la barre d'adresse permet d'importer directement des résultats de recherche à partir des sites compatibles
Choisir les références dans la fenêtre dédiée, annoter, ajouter des tag
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Compatible avec Firefox, Chrome, Safari, Internet Explorer...
Import web : installation et compatibilité
Les principales sources d'information scientifique
http://www.mendeley.com/import
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Synchronisation de sa bibliothèque de références
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Synchronisez votre bibliothèque Mendeley Dekstop avec votre compte en ligne
Gestion et édition en ligne de vos références
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Si vous disposez d'un lot de fichiers PDF
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Indiquez le dossier à importer contenant les PDF
L'importation se déroule automatiquement et les références correspondant aux documents PDF apparaissent
Mendeley va chercher les informations décrivant les documents dans les bases de données d'information scientifique
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Si vous venez de EndNote
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Exporter en Xml, ou .txt avec le style RefMan(RIS)
Sélectionner les références à exporter
2 Dans Mendeley, choisir le format d'import RIS ou EndNote Xml suivant le format d'export EndNote
De la même manière, Mendeley peut importer des listes de références aux formats BibTeX, Zotero.sqlite, OVID,...
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Gérer sa bibliothèque de références
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Des fonctions de gestion simples et utiles
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Affichez le PDF attaché à la référence pour lecture
Les références peuvent être marquées comme « à lire », « lues », « favorites »
Créez vos propres collections
Filtrez vos listes de références de façon aisée
Triez rapidement vos listes en cliquant sur les en-têtes de colonne
Collection créées par défaut : ●Toutes les références●Ajouts récents●Mes favoris●Références à vérifier●Mes publications●Publications non classées
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Recherche incrémentielle et suggestion de recherche
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Mise à jour de la liste de résultat au cour de la frappe
Recherche dans les références et les PDF de toutes les collections
Mise en contexte et surlignage des termes recherchés
Suggestion de termes au court de la frappe
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Utilisation avancée du moteur de recherche
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champs:terme à recherche
Exemples : ● author:harnad● keyword:Bacteria● publication:nature● tag:tools● title:« open access »
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PDF : lecteur intégré + et recherche de mots-clés
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Surlignage du terme recherché dans le PDF
Outils d'exploitation avancée : notes, surlignage manuel, lecture plein écran, etc.
Ouverture des PDF dans des onglet dédiés
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PDF : surlignez et annotez vos documents
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Annotation (avec auteur et date) Notes générales
Passage surligné manuellement
Listes des annotations avec leurs liens pour une navigation aisée
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Classez et renommez automatiquement vos fichiers
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L'outil de gestion des fichiers et ses options
Classement et nommage paramétrables
Tools > Option > File Organizer
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PDF : surlignez, annotez, ajoutez des notes
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Fichiers organisés automatiquement en arborescence
PDF (et autres fichiers) joints renommés
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Prenez soin de vos métadonnées : homogénéisation des noms de journaux, auteurs, tag, etc.
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Passage surligné manuellement
Les entrées d'index peuvent être glissée-déposée les unes sur les autres pour homogénéiser leurs valeurs
Mendeley modifie automatiquement les références en conséquence
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Citer en utilisant ses références
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Citer dans Word et OpenOffice 1/2
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Placer son curseur à l'emplacement de l'appel de citation dans votre texte
Cliquer sur « Insert Citation dans la barre d'outil Mendeley de Word
Dans Mendeley, choisir la référence à citer
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Citer dans Word et OpenOffice 2/2
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L'appel de citation est intégré au format choisi à l'emplacement du curseur
Cliquer sur « Send Citation to Word »
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Éditer une bibliographie dans Word ou OpenOffice
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Finaliser son texte avec tous les appels de citation
Positionner son curseur à l'endroit où doit figurer la bibliographie
Cliquer sur « insert Bibliography »
Choisir un style bibliographique
La bibliographie est générée automatiquement
Vous pouvez changer le style : le document se met à jour
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Produire une simple liste de références formatées
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Sélectionnez des références
Déplacez les dans votre document (« drag & drop »)
La liste est au format sélectionné
Cela fonctionne aussi par copier-coller
![Page 35: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/35.jpg)
Un vaste choix de styles bibliographiques
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Ooo : « Choose Citation Style » Word : « Other citations from Mendeley »
Recherchez et sélectionnez un style
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Utiliser LaTeX / BibTeX : options de synchronisation de la bibliothèque de références
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Tools > Options > BibTeXPrise en compte de caractères spéciaux
Mise à jour automatique du fichier .bib
Un ou plusieurs fichiers. On peut imaginer le mettre sur un dossier partagé...Clés BibTeX éditables si besoin
référence par référence
![Page 37: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/37.jpg)
Partager, collaborer, s'intégrer à une communauté en gérant son identité numérique
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![Page 38: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/38.jpg)
Rendre une collection publique
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Les critères de publication des collections sont paramétrables pour chacune d'entre elles indépendamment des autres
Rendez vos collections publiques via « Edit Settings »
D'autres usagers pourront s'abonner à vos collections publiques. Vos modifications seront répercutées dans les Mendeley Desktop des autres membres abonnées. Les membres abonnées à une collection sont visibles, ainsi que l'auteur d'une collection
![Page 39: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/39.jpg)
Créer une collection partagée pour collaborer
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Une collection partagée entre membres n'est visible uniquement que par ses membres. Vous pouvez inviter vos contacts à partager une collection que vous avez créée.Les références sont alors visibles et modifiables par tous les membres partageant la collection.Les fichiers PDF peuvent être mis en commun et annotés collaborativement.
![Page 40: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/40.jpg)
Compléter son profil et sa liste de publications : l'identité numérique du chercheur
Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
CV du chercheur
Liste des publications du chercheur, mise à jour via une collection Mendeley
Contacts du chercheur
Collections publiques du chercheur
Contacter ce chercheur
Statistiques sur ce chercheur
![Page 41: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/41.jpg)
Mendeley : un réseau social pour les chercheurs ?
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“
”
We define social network sites as web-based services that allow individuals to (1) construct a public or semi-public profile within a bounded system, (2) articulate a list of other users with whom they share a connection, and (3) view and traverse their list of connections and those made by others within the system.
Boyd, D.M., et N.B. Ellison. Social network sites: Definition, history, and scholarship. Journal of Computer-Mediated Communication 13, 2007, 210-230. Available from world wide web: <http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html>.
“
”
![Page 42: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/42.jpg)
Paramétrer la confidentialité de son profil
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Plusieurs niveaux de confidentialité
Se tenir informé
![Page 43: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/43.jpg)
Valoriser son travail bibliographique et son expertise
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Inclure un bouton vers son profil dans votre signature de courriel ou sur son blog de chercheur
Créer par simple copier-coller une liste de publication mise à jour automatiquement
![Page 44: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/44.jpg)
Trouver de l'aide
Alain Marois - 27/04/2010 Formation Mendeley
![Page 45: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/45.jpg)
Mendeley : participer, suivre l'évolution
Alain Marois - 27/04/2010 Formation Mendeley
Suivre les mises à jourSuggérez
Votez
Etat
Commentez
![Page 46: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/46.jpg)
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Statistiques et sérendipité
Alain Marois - 27/04/2010 Formation Mendeley
Données globales
Données par disciplines
Articles les plus lus
Auteurs les plus lus
![Page 47: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/47.jpg)
Questions ?
Formation Mendeley Alain Marois - 27/04/2010
Alain Marois04.72.18.64.50
![Page 48: Mendeley : gestion de références bibliographiques 2.0](https://reader034.fdocuments.fr/reader034/viewer/2022050804/54b99f704a795950448b459e/html5/thumbnails/48.jpg)
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Ressources
● Hull, Duncan, Defrosting the Digital Library: A survey of bibliographic tools for the next generation web. [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur
le world wide web :
<http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web>.
●Hull, Duncan, Steve R Pettifer, et Douglas B Kell. Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web. PLoS
Comput Biol 4, Octobre 2008, e1000204+. Disponible sur le world wide web : <http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204>
● Mendeley Teaching Presentation [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web :
<http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation>
● Reiswig, Jennifer. Mendeley. 98, Avril 2010, 193-194. PubMed Central Link. [cité 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web :
<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/>
● Readwriteweb, Curt Hopkins Of. Mendeley Throws Open the Doors to Academic Data. The New York Times Avril 2010. [cité 31 Mai 2010].
Disponible sur le world wide web :
<http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html>
● Henning, Victor, et Jan Reichelt. Mendeley - A Last.fm For Research? Dans eScience, IEEE International Conference on, Vol. 0 of, 327-
328, [Los Alamitos, CA, USA]: IEEE Computer Society, 2008