MASTER Bio-ingénieur : Chimie et bio-industries (Faculté AGRO) .

MASTER Bio-ingénieur :Chimie et bio-industries (Faculté AGRO)

http://www.uclouvain.be/350645.html

Jours des visites des groupes des promoteurs

(12h45 – 14 h)

ELI/ELIM

Je 14/11 S. Declerck & J. Mahillon

Lu 18/11 P. Gerin & S. Agathos (local A+016)

IMCN (local A+016, tour Boltzmann)

Ve 15/11 Y. Dufrêne, Ch. Dupont & cie

E. Gaigneaux, D. Debecker

ISV/FYMO

Me 13/11 M. Ghislain, M. Boutry & cie

Chimie Biologie

Ingénierie


Ingénierie chimique

Développement de (bio)catalyseurs,conversion-valorisation & récupération de

(bio)molécules importantes pour la chimie,la dépollution l ’eau, le sol ou l’air& la production d’énergie renouvelable

Elaboration et caractérisation de (bio)surfacesà l’échelle du nanomètre,

amélioration et mise en œuvre

Chimie des flaveurs identification, propriétés et améliorations des procédés :

vin, chocolaterie, brasserie


Techniques/Outils :Chromatographie GC & HPLC

Méthodologies sensorielles

Spectroscopies & microscopiesMS, RMN, AFM, XPS, Raman, IR,…

Synthèse de matériaux organiques et inorganiquesCultures cellulairesNanobiotechnologies et nanofabrication

Réacteurs (bio)catalytiques


Applications types:

• Elimination (bio)catalytique des polluants de l’air et de l’eau

• Synthèse de molécules pour parfumerie & pharmacie

• Exploitation des (bio)ressources renouvelables d’énergie et de molécules

• Développement de biomatériaux

• Optimisation de l’utilisation de nouvelles variétés de houblon pour le développement d’arômes exotiques (dry hopping, refermentation ..)

• Développement d’aliments santé enrichis en polyphénols (chocolat, ..)

Ingénierie biologique

Génétique des bactéries opportunistes et pathogènes

Etude des champignons filamenteux, levuriens et mycorhiziens à arbuscules

Mécanismes cellulaires (transport, trafic intracellulaire, réponses aux contraintes) chez la levure et les plantes

Ecologie microbienne, bioconversion microbienne et conception de bioprocédés

Techniques/outils:

• Biologie moléculaire et cellulaire, biochimie, microbiologie, physiologie, • Génie génétique, bioréacteurs, mycothèque

Applications types:

• Détection de pathogènes alimentaires

• Production de protéines pharmacologiques en cultures cellulaires et de bio-effecteurs dans le contrôle des organismes pathogènes

• Biodégradation des toxines/polluants et bio-traitements

• Bioconversion de biomasse et résidus en produits utiles

ISVInstitut

des sciences de la vie

IMCNInstitutde la matière condenséeet des nanosciences

ELIEarth & Life Institute

Instituts des promoteurs « BIRC »


ELIEarth & Life Institute

Groupes et thèmes de recherche des promoteurs

ELIM : Applied Microbiology

BRASserie et industries alimentaires

MICRObiologie

GENIE biologique


INBR : Brasserie et industries alimentaires

S. COLLIN

Chimie des flaveurs

• Identification de composés organoleptiquement actifs par GC-olfactométrie, GC-MS, HPLC/MS/MS et analyse sensorielle (chocolat, vin, bière, miel, olives etc)

• Compréhension des mécanismes chimiques et biochimiques impliqués dans la production et la dégradation des arômes et des polyphénols

• Recherche des relations structure-propriétés olfactives

Croix du Sud – Bâtiment Mendel – Etage 2

INBR : Brasserie et industries alimentaires

S. COLLIN

Chimie des flaveurs (suite)

• Contrôle du vieillissement des denrées et apport d’un effet santé par un enrichissement en polyphénols (flavonoïdes, resvératrol ..)


Chimie brassicole

• Contrôle du vieillissement de la bière

• Qualités aromatiques (thiols polyfonctionnels) et antioxydantes du houblon

• Amélioration des procédés (refermentation en bouteille, dry hopping ..)

GENIE : Génie Biologique

S. AGATHOSP. GERIN

Ingénierie cellulaire et microbiologique

Conception de bioréacteurs et bioprocédés

Bioconversions catalysées par des micro- organismes et des enzymes

• Bioconversion (fermentation) de biomasses, récupération de molécules “bioraffinées” pour la chimie verte et les énergies renouvelables: enzymes, caroténoïdes, éthanol, acides organiques, méthane,…


GENIE : Génie Biologique

S. AGATHOSP. GERIN


• Biodégradation de molécules toxiques pour l’environnement

• Chimie verte et bioraffinage:– Fonctionalisation biocatalysée de biopolymères– Formation d’héterocycles via biocatalyse hétérogène– Production des biomolécules par des algues– Bioconversion de substrats en molécules de base pour la chimie

• Ecologie microbienne moléculaire et bioprospection dans des milieux complexes (sols, eaux, eaux usées, boues d’épuration, digestats)

• Traitement des eaux usées, des boues d’épuration et des résidus organiques grâce à des enzymes, des bactéries et des fungi

• Production de protéines recombinantes par des cellules animales

MICRO : Microbiologie - Mycologie

S. DECLERCK Croix du Sud – Bâtiment de Serres – Et 1

Mycologie

• Etude des champignons mycorhiziens: biodiversité, impact des changements climatiques, rôle dans la protection des plantes contre les stress biotiques & abiotiques, dialogue moléculaire hôte/champignon, applications agro-environnementales

• Identification / systématique / classification (taxonomie, phylogénie par voie classique et moléculaire, biogéographie) des levures, champignons filamenteux et mycorhiziens

• Diversité fongique dans les environnements naturels

et anthropisés

MICRO : Microbiologie - Mycologie

S. DECLERCK Croix du Sud – Bâtiment de Serres – Et 1

Mycologie

• Développement de méthodes de détection in situ des mycètes (dans les environnement naturels, anthropisés, confinés) par des outils moléculaires (ex : pyroséquençage)

• Développement des méthodes de préservation des mycètes (organismes récalcitrants, consortia…)

• Caractérisation physiologiques (étude ciblée des propriétés spécifiques des organismes fongiques – ex. bioeffecteurs dans le contrôle des pathogènes…)

MICRO : Microbiologie - Bactériologie

J. MAHILLON Croix du Sud – Bâtiment Kellner – Et +1

Bactériologie et Génétique bactérienne

• Flexibilité génomique et virulence différentielle au sein du groupe Bacillus cereus: étude des phages, plasmides et gènes de virulence (toxines émétiques et diarrhéiques)

• Détection, caractérisation et typage moléculaire de bactéries opportunistes et pathogènes alimentaires: B. cereus et Listeria monocytogenes

• Biofilms de Staphylococcus epidermidis, B. cereus et Listeria spp.: formation, dynamique, contrôle, et lieu de transferts génétiques

• Archées dans les aliments: détection et caractérisation moléculaire

Approches expérimentalesMicrobiologie alimentaire, biologie moléculaire, génétique bactérienne, génie génétique, écologie microbienne, laboratoire de biosécurité L2+


(12h45 – 14 h)

ELI/ELIM






ISV/FYMO


IMCNInstitutde la matière condenséeet des nanosciences


MOST – MOlecules Solids & reactiviTy

Catalyse et chimie des solides inorganiques

BSMA – Bio & Soft MAtter

Surfaces


MOST : Catalyse & chimie des solides inorganiques

E. GAIGNEAUX, D. DEBECKER

Croix du Sud – Bâtiment de Serres – Etages 0 et 1

Mettre au point/optimiser des catalyseurs, en comprendre leur fonctionnement, pour :

protéger l’environnement:• Détruire les polluants de l’air (aromatiques, dioxines, composés organiques volatils)• Transformer le CO2 en molécules à + haute valeur

servir la chimie fine et la chimie bio-sourcée :• Fabriquer des molécules utiles en parfumerie et

pharmacie• Fabriquer des molécules d’intérêt industriel à partir de biomasse (lactochimie et oléochimie)

développer des sources renouvelables d ’énergie :

• Produire des bio-carburants (par exemple : DME)(à partir de biomasse / molécules bio-sourcées)

Outils utilisés :• Synthèse de matériaux inorganiques nanostructurés =

catalyseurs hétérogènes et• adsorbants cellulaires/enzymatiques

• Caractérisation physico-chimique– spectroscopies: IR, Raman, XPS– microscopies: e-, AFM-STM, etc

• Mesures de performances en réacteurs catalytiques

MOST : Catalyse & chimie des solides inorganiques

E. GAIGNEAUX, D. DEBECKER

Croix du Sud – Bâtiment de Serres – Etages 0 et 1

BSMA : groupe SURFACES

NanomicrobiologieY. DUFRENE Croix du Sud – Bâtiment Botzmann – Etage 0

• Développement de nouveaux outils pour les nanotechnologies: nano-imagerie en temps réel de cellules vivantes, manipulation et reconnaissance de molécules uniques

• Propriétés des cellules microbiennes à l’échelle du nanomètre: mécanismes moléculaires

de l’adhésion cellulaire, applications médicales: interactions pathogène-hôte et pathogène-médicament

Croix du Sud – Bâtiment Botzmann – Etage 0Ch. DUPONT

Protéines et cellules aux interfaces

• Elaboration de surfaces nanostructurées nanolithographies,

couches minces de polymères

• Maîtrise de l’organisation des protéines adsorbées auto-assemblage, supports nanostructurés, imagerie à l’échelle du nanomètre

• Evaluation du comportement cellulaire sur les bio-interfaces élaborées cultures cellulaires, microscopie, activité métabolique des cellules

BSMA : groupe SURFACES

IMCN/MOST :Pr T. Leyssens Cocristallisation comme moyen de purification

(domaine pharmaceutique, en industrie)

Etude théorique/cinétique/mécanistique

en catalyse homogène

Pr M. Devillers Chimie de coordination appliquée à la préparation+ Pr Y. Garcia de matériaux inorganiques et hybrides fonctionnels+ Pr S. Hermans (catalyseurs hétérogènes, conducteurs ioniques, pigments,+ Pr O. Riant matériaux luminescents)

IMCN/BSMA :Pr A. Delcorte Analyse de surface par TOF-SIMS

+ Pr S. Demoustier + Pr A. Jonas + Pr K. Glinel + …

D’autres possibilités …

Tout (co-)titutaire d’un cours obligatoire dans le programme BIRC peut être votre promoteur de mémoire


(12h45 – 14 h)

ELI/ELIM






ISV/FYMO



ISVInstitut

des sciences de la vie

FYMO

Physiologique moléculaire


H. BATOKO, M. BOUTRY, F. CHAUMONT, M. GHISLAIN, P. MORSOMME

Croix du Sud – Carnoy B et C Etage 3

FYMO : Physiologie moléculaire

Comprendre des mécanismes biologiques chez les levures et les plantes : la première étape vers les applications

Thèmes:• Marc Boutry

- Transporteurs de drogues multiples chez les plantes: caractérisation enzymatique et amélioration de la sécrétion de métabolites d’intérêt pharmacologique

- Optimisation de la production de protéines (anticorps, immunotoxines, vaccins) dans des cellules végétales


• François Chaumont– Rôle physiologique des aquaporines chez le

maïs : caractérisation moléculaire et biophysique dans des plantes dérégulées pour l’expression d’aquaporines

– Régulation du trafic subcellulaire : abondance des aquaporines dans les membranes cellulaires

• Henri Batoko– Rôle de la protéine membranaire de plante TSPO dans la

protection contre les stress: conditions d’expression, détoxification des porphyrines libres, dégradation et caractérisation des partenaires et ligands endogènes


• Pierre Morsomme– Etude d’un transporteur de Ca2+ chez la levure pour

comprendre une maladie génétique humaine

– Trafic intracellulaire de protéines/lipides dans la levure

• Michel Ghislain– Régulation de l’expression de transporteurs membranaires

de levure, responsables de la résistance aux anti-fongiques: identification des transactivateurs et étude de la dégradation par le système ubiquitine-protéasome

Approches spécifiques•Expression hétérologue•Purification de protéine, reconstitution membranaire, liposome•Spectrométrie de masse, imagerie cellulaire (microscope confocal et sondes fluorescentes), génomique


(12h45 – 14 h)

ELI/ELIM






ISV/FYMO


Remise de prix pour mémoires AGRO

Bioingénieurs à l’honneur - 12/12/13 (19h30)

LintsARAEBULAIALvCeraDe Vuyst

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Documents

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