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LABORATOIRE DE BIOLOGIE MEDICALE DU CHRU DE MONTPELLIER
Procédure Manuel de prélèvement
Document n° LBM/TRANSV/ 7/041/v5
Date d’application : 04/10/2018 Page : 1/30
Rédaction :
[Rédacteur] I. Tamby
Vérification :
[Vérificateurs]
Dr AL MICHON
Dr J. DESCOEUR
Mme S. VOILLOT
Approbation :
[Approbateurs] I. Tamby
Date d'approbation: [Date d'approbation]
Destinataires : LBM-RQA (Groupe), LBM-référents risque (Groupe), LBM-CDS (Groupe)
Libellé des modifications ou révisions
- 1994 : Création - 03 sept 12 : Actualisation - 23 sept 14 : Revue sans modification du texte (modification des annexes uniquement) - 24 oct 14 : Modifications des annexes - 20 Fev 15 : Modalités d’ajout d’un examen § 4.3 c - 25 Avril 15 : Actualisation :
conditions de stockage
identitovigilance : n° de séjour lors du prélèvement,
annexes : ordre de prélèvement de tubes, prélèvements pour bactério, HPV, toxico
- mai 2016 : actualisation - avril 2018 : actualisation - sept. 2018 : GDS annexes P16 et 17, Bactério annexes P16, 20 et 26
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1. Objet et domaine d'application
1.1 Objet
Ce manuel a pour but de donner les principales règles pour la réalisation de l'acte de soins qui consiste à :
- prélever un échantillon biologique en vue d’être analysé,
- dans des conditions d’hygiène et de sécurité pour le patient et le personnel,
- sur prescription médicale.
1.2 Domaine d'application
Ce manuel s'applique à la réalisation de tous les prélèvements, en particulier : - sang : artériel, veineux,
- urines,
- selles,
- liquides,
- expectorations,
- peau et phanères,
- muqueuse oro-pharyngée,
- muqueuses génitales,
- pus superficiels et profonds,
- biopsies,
- … Les détails de certains prélèvements spécifiques et moins fréquents sont définis dans le catalogue des actes de biologie.
2. Fondements, références et définitions
2.1 Fondements, références
- Arrêté du 26 novembre 1999 relatif à la bonne exécution des analyses de biologie médicale Guide de bonne exécution des analyses de biologie médicale (GBEA),
- Décret n° 2002-660 du 30 avril 2002 relatif aux conditions de transmission de prélèvements biologiques aux laboratoires d’analyse de biologie médicale,
- Arrêté du 20 juin 2003 fixant la présentation de la fiche de prélèvement de biologie médicale,
- Circulaire n°2006-90 du 2 mars 2006 relative aux droits des personnes hospitalisées,
- Code du travail - Partie réglementaire. Titre II : Prévention des risques biologiques (mise à jour juillet 2008),
- ADR, - Manuel de certification des établissements de santé (HAS) version 2010,
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- Arrêté 2016-08-01 test sur les signaux biologiques,
- Arrêté 2017-05-06 sur volume total de prélèvement.
2.2 Définitions
LBM : Laboratoire de Biologie Médicale.
3. Responsabilités
3.1 Responsabilités relatives à la maîtrise du document
Responsable de la gestion documentaire du LBM du CHRU.
3.2 Responsabilités concernant l'observation de la procédure
Responsable du LBM et Coordination générale des soins du CHRU.
4. Exécution
4.1 Règles générales
a. Personnes autorisées :
- Médecins (obligatoire pour les prélèvements d’Anatomie et Cytologie Pathologiques),
- Etudiants en médecine placés sous la responsabilité des médecins,
- Pharmaciens biologistes : décrets N° 91-834 du 30 Août 1991 modifié fixant les
catégories de personnes habilitées à effectuer certains actes de prélèvement en vue
d’analyse de biologie médicale (JO 13 mars 2006) et N° 2009-774 du 23 juin 2009,
- Internes en biologie médicale,
- Infirmières diplômées d’état : article R 4311.7 décret n° 2004-802 du 29 juillet 2004
relatif aux parties IV et V du Code de la Santé Publique et modifiant certaines parties de
ce code,
- Sages-femmes,
- Manipulateurs en électroradiologie : article R 4351-2 décret n° 2005- 840 du 20 juillet
2005,
- Techniciens de laboratoire: (prélèvement sanguin) article R 1222-21.
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b. Préalables :
- Vérifier la prescription médicale,
- Vérifier le traitement,
- Informer le malade du soin, vérifier si son consentement a été demandé le cas échéant,
- S’informer des dispositions particulières relatives aux examens à effectuer
(Catalogue des actes de biologie – Accès via Intranet / Prise en charge du patient / laboratoires),
- Choisir le matériel adapté au type de prélèvement (tubes, aiguilles, dispositifs de
prélèvement) et au malade,
- Vérifier la date de péremption du matériel,
- Préparer le matériel nécessaire.
4.2 Matériel nécessaire:
a. Transport :
- chariot de soin ou plateau, drap de protection (alèze bleu)
b. Matériel de protection
Application des précautions standards PS avant tout contact avec un spécimen biologique, patient suspect ou pas :
- gants non stériles ou stériles (biopsie, …)
- masque, s'il existe un risque de projection ou pour protéger le prélèvement
(Ex. : expectoration, hémoculture),
- Surblouses.
c. Matériel d’hygiène et d’asepsie :
- solution hydro-alcoolique ou savon antiseptique,
- compresses non stériles avec ATS alcoolique (alcool, chlorexidine alcoolique, …) ou stérile + 4 temps pour les hémocultures, ponction biopsie, …
d. Matériel spécifique
Conservé selon les instructions fournisseurs mises en lignes sur : Qualidoc LBM/ Documents externes / Pré-analytique /Notices fournisseurs
En respectant la date de péremption :
- tubes, flacons, récipients, milieux de transport (spécifiques pour la bactériologie…),
dispositifs à prélèvement.
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e. Matériel d’élimination :
Sacs DASRI et collecteur à aiguilles
4.3 Consignes générales pour tous types de prélèvements
a. Déroulement de l’acte :
- Vérifier la prescription,
- Réaliser une désinfection par friction avec la solution hydro- alcoolique
(cf. Protocole de Lavage simple et antiseptique des mains – Accès via :
Intranet/Qualité Gestion des risques/Qualidoc/Qualidoc Transversal CHU/§ 8 g 1 Règles de bases)
Installer la personne confortablement,
- Vérifier son identité (nom, prénom, nom de jeune fille, sexe, date de naissance),
cohérence entre la prescription, la planche d'étiquettes, la personne
(cf. Procédure de vérification d'identité du patient à toutes les étapes de sa prise en
charge en Secteurs de Soins – Accès via :
Intranet/Qualité Gestion des risques/Qualidoc/Qualidoc Transversal CHU/§ 15 a)
- Enfiler des gants stériles ou non stériles (à usage unique),
- Réaliser l’antisepsie,
- Réaliser le prélèvement (cf. annexe 1),
- Eliminer le matériel de prélèvement dans les collecteurs adaptés au plus près du geste,
les aiguilles ou autre objet piquant ou tranchant dans le collecteur, le reste dans le sac
jaune DASRI,
- Oter les gants après la mise des échantillons dans le sachet de transport et les éliminer
dans le container/sac dédié aux DASRI,
- Réaliser une désinfection par friction avec la solution hydro alcoolique,
- Réaliser l’étiquetage des contenants au chevet du malade.
b. Echantillon :
- Apposer l’étiquette qui doit au minimum mentionner : nom, prénom, nom de jeune fille,
date de naissance ; importance du choix du bon numéro de séjour,
- Préciser la date et l’heure du prélèvement sur l’échantillon particulièrement dans les cas
suivants : dosages de médicaments, tests d’explorations dynamiques.
c. Demande d’examen :
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- Coller les étiquettes mentionnant l’identité du patient : vérifier la concordance avec l'étiquette de l'échantillon,
- Mentionner l’identification de l’unité de soins (UF et téléphone),
- Mentionner l’identité du prescripteur (NOM et PRENOM),
- Mentionner l’identité et la qualité du préleveur,
- Mentionner la date et l’heure du prélèvement,
- Mentionner la nature de l’échantillon,
- Mentionner l’origine anatomique de l’échantillon, en particulier pour les prélèvements
bactériologiques et anatomo-cyto pathologiques.
- Cocher les éléments de prescription et vérifier si les renseignements cliniques sont
précisés (traitement anticoagulant, antibiotique,…),
- Préciser si la demande est urgente,
- Associer les attestations de consultation du prescripteur et de recueil de consentement
ou la copie du consentement du patient pour les examens qui le nécessitent.
En cas de rajout d’examen, transmettre une prescription complémentaire, après avoir si possible téléphoné à l’unité concernée pour confirmer la faisabilité.
d. Conditionnement :
S'assurer que les 2 premiers emballages répondent à la norme UN 3373
- le 1er correspondant au contenant primaire,
- le 2ème correspondant au sachet de transport,
- le 3ème étant le contenant rigide du coursier.
e. Conditions d’acheminement :
- Vérifier l’étanchéité du contenant,
- Mettre les échantillons dans les poches plastiques doubles et y joindre la feuille de
demande adéquate,
- Acheminer l'échantillon dans les conditions requises (cf. Catalogue des actes de
biologie : Intranet / Prise en charge du patient / Catalogue des actes de biologie), par un
personnel habilité ou dédié,
- Ranger le matériel et nettoyer le plan de travail,
- Réaliser la traçabilité de l’acte dans le dossier de soins en absence d'un plan de
prélèvement informatisé.
Remarque : En cas d’Accidents par Exposition au Sang et aux liquides biologiques, se reporter à l'affiche
(disponible sur Intranet / Affiches info pro. / Infos professionnelles).
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5. Supports de travail et annexes
- prescription médicale, - dossier de soins ou plan de prélèvement si prescription connectée.
6. Archivage - Elimination – Préservation
- prescription médicale (Système d’Information Clinique) : 40 ans, - dossier de soins ou plan de prélèvement (Système d’ Information Clinique) : 40 ans
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ANNEXES
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SOMMAIRE
Le surlignage bleu correspond à des modifications du paragraphe correspondant
ORDRE DE PRELEVEMENT DES TUBES
P10
SANG VEINEUX (tubes)
P 11
SANG Surveillance des Héparines
P 12
SANG Suivi Thérapeutique Pharmacologique
P 12
SANG Suivi Thérapeutique Pharmacologique (cas particuliers)
P 13
SANG VEINEUX (flacons d'hémoculture)
P 14 à 16
SANG ARTERIEL (gazométrie artérielle)
P 17
SANG CAPILLAIRE
P 18
URINES
P 19 à 21
SELLES
P 22
LBA
P 22
LIQUIDES
P 23
EXPECTORATIONS, ASPIRATIONS BRONCHIQUES, TRACHEALES, NASO-PHARYNGEES
P 24
IST, ORL
P 24
MUQUEUSE GENITALE
P 25
PRELEVEMENT CERVICO-VAGINAL pour frottis cervico-vaginal et recherche des Papillomavirus humains (HPV)
P 27
PRELEVEMENT CERVICO-VAGINAL pour recherche des Papillomavirus humains (HPV)
P 28
Recherche des papillomavirus humains (HPV) à partir de TISSU FRAIS ET TISSU INCLUS EN PARAFFINE
P 29
PEAU
P 30
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ORDRE DE PRELEVEMENT DES TUBES
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ECHANTILLON SPECIFICITES DE PRELEVEMENT CONTENANTS
SANG VEINEUX
(tubes)
- Poser le garrot afin de favoriser une vasodilatation veineuse,
- Mettre des gants à usage unique,
- Ponctionner la veine avec l’aiguille de façon tangentielle,
- Respecter le volume de remplissage du tube,
- Réaliser le prélèvement en respectant l’ordre des tubes,
- Enfoncer le tube au fond du corps porte tube dès que l’aiguille est en place de façon à percer
le bouchon et maintenir le tube (ponction veineuse sous vide),
- Oter le garrot dès que le sang s’écoule dans le tube (sa pose ne doit pas dépasser 5 minutes)
Attendre l’arrêt de l’écoulement du sang dans le tube pour changer de tube,
- Respecter le niveau indiqué (attention de différencier un trait d'information et un trait de jauge).
Pendant que le 2° tube se remplit, homogénéiser le 1° tube par retournements lents,
- Enlever l’aiguille à la fin du prélèvement en appliquant une compresse sèche sur le point de
ponction,
- Maintenir une pression ferme pendant 1 minute ou plus suivant le cas puis mettre un
pansement sec sur le point de ponction.
Si prélèvement avec microtainer®, utiliser un prolongateur et coller l’étiquette patient dans le sens de la longueur à cheval sur le tube et le prolongateur
Pour l’hématologie, possibilité d’utiliser des tubes de prélèvements pédiatriques avec respect du volume de remplissage minimum pour l’hémostase (niveau de remplissage du tube recommandé : plus de 90 %; minimum acceptable : 80%).
- Héparine Non Fractionnée (HNF) :
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SANG Surveillance des
Héparines
Le prélèvement pour juger de l’efficacité du traitement (TCA) est fait à n’importe quel moment en cas de perfusion IV, de préférence 4 à 6 h après chaque changement posologique. En cas d’administration Sous Cutanée, le prélèvement doit être réalisé à mi-temps entre 2 injections.
- Héparine Bas Poids Moléculaire :
La surveillance ne concerne que des cas particuliers. Les activités anti-Xa doivent être mesurées au pic maximal d’activité, c’est-à-dire 3 à 4 h après l’injection d’HBPM en 2 injections par jour et 4 à 6 h après l’injection par HBPM en mono-injection, pour le fondaparinux 2 à 3h après injection. (GEHT, décembre 2012)
SANG
Suivi Thérapeutique Pharmacolo-
gique
De façon générale réaliser les prélèvements avant l’administration suivante. En cas d’espacement inégal des doses sur la journée, le prélèvement doit être réalisé à la fin de l’intervalle le plus long entre deux doses, avant la dose suivante. En cas de doute contacter le biologiste de l’unité.
- Indications nécessaires à une interprétation complète des résultats :
Poids, taille du patient,
Heure(s) de prise, de prélèvement,
Posologie prescrite : forme galénique, horaires et doses,
Date de début et/ou de modification du traitement (à défaut la durée approximative du traitement actuel),
Nature des molécules recherchées,
Autres médicaments pris par le patient,
Autres pathologies (notamment digestive, hépatique ou rénale),
Raison de la prescription de l'analyse ("recherche d'efficacité ou de toxicité"),
En l'absence de la mention des autres médicaments pris par le patient, aucune étude d'interaction ni recherche d'interférence de dosage ne pourra être effectuée.
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SANG
Suivi Thérapeutique Pharmacolo-
gique (cas particuliers)
- Dosage des antibiotiques aminosides : Le pic doit être réalisé 30 min après la fin de la perfusion IV. La résiduelle (ou vallée) doit être réalisée avant la perfusion suivante.
- Dosage de la teicoplanine : Le pic doit être réalisé 30 min après la fin de la perfusion IV.
- Dosage de la vancomycine : En cas de perfusion continue, le prélèvement peut être réalisé à n’importe quel moment mais à distance du site d’administration.
- Dosage du méthotrexate : Le moment du prélèvement par rapport au début de l’administration doit être mentionné. Exemple : pour un début d’administration le 1er janvier à 13h, le prélèvement réalisé le 2 janvier à 13h correspond à un H24. L’interprétation du résultat n’est possible que si sont disponibles :
- L’indication, - La posologie en g/m² et le temps de perfusion, - Les jours et heure de début de perfusion (H0), - Les jours et heure de prélèvement associé à l’équivalent H (par exemple H24 pour un
prélèvement réalisé 24h après le début de perfusion), - La valeur de créatininémie au moment du prélèvement et avant l’administration de
méthotrexate, - Le pH urinaire au moment du prélèvement, - Les co-médications.
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SANG VEINEUX (flacons
d'hémoculture)
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SANG VEINEUX (flacons d'hémoculture)
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SANG VEINEUX (flacons d'hémoculture)
Particularité du diagnostic des bactériémies liées aux cathéters, avec matériel en place : Ne pas purger le cathéter, et prélever en parallèle au même moment, par ponction veineuse périphérique et sur cathéter, le même volume de sang. Spécificité en pédiatrie : Quantité de sang prélevée selon le poids de l’enfant :
Respect de l'antisepsie selon l’âge de l’enfant : - Moins de 1 mois : Biseptine en 3 temps (Biseptine/séchage/Biseptine) - Sinon 4 temps : Hibiscrub / Rinçage / Eau stérile / Chlorhexidine alcoolique 2%. Acheminement le plus rapidement possible des hémocultures. Mode de prélèvement : Deux techniques ou site :
- soit par ponction veineuse directe (toujours à privilégier)* - soit par prélèvement sur cathéter central après purge * La ponction veineuse directe permet une mise en culture bactériologique plus fiable. Le prélèvement sur cathéter comporte un risque de contamination de l'échantillon par le cathéter ou la ligne s'ils sont colonisés.
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SANG ARTERIEL
(gazométrie artérielle)
Précautions : Signaler toute prise de médicament pouvant fluidifier le sang et entraîner un risque hémorragique avant la réalisation du prélèvement
Examen :
par un médecin ou une infirmière qualifiée sous surveillance du médecin.,
désinfection large soigneuse,
repérer par palpation et fixer l'artère entre 2 doigts,
ponctionner l’artère (radiale au poignet,…) sans prise d'air,
remplir la seringue et l’obturer rapidement avec le bouchon hermétique prévu à cet effet,
presser le piston afin purger à travers le bouchon l’air présent dans la seringue,
mélanger délicatement l’échantillon par retournement
rebrancher l'oxygène s'il avait été arrêté.
Lors de prélèvements sur cathéters artériels, le risque de dilution de l’échantillon est présent :
avec la solution de rinçage,
si héparine liquide dans la seringue.
Après la ponction, effectuer une compression :
manuelle prolongée (3 minutes),
et/ou par pansement à enlever au bout de 10mn.
Les prélèvements sanguins coagulent s’ils ne sont pas correctement homogénéisés pour une meilleure répartition avec l’héparine. (Un prélèvement présentant un caillot donne des résultats non fiables).
NB : Avant tout transport, vérifier que la seringue est bien bouchée
Transport : se référer aux préconisations indiquées dans le catalogue des Actes
Préciser sur la demande si malade sous oxygène ou respirateur
seringue héparinée,
tube capillaire
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SANG CAPILLAIRE
- Prélèvement au talon (nouveau-né ou nourrisson 3 mois):
plante du pied à hauteur du talon, zones les plus externes. Attention : risque d'ostéochondrite nécrosante si la lancette pénètre dans le calcanéum, donc éviter la zone centrale.
- Prélèvement au doigt (enfant, adulte):
risque d'altération de la sensibilité, donc respecter la pulpe des doigts, exclure la
"pince" : pouce/index,
varier le point de ponction si les prélèvements sont fréquents.
Prélever la face interne
Eviter toute zone oedématiée.
- Laver ou faire laver la zone de prélèvement (ou désinfecter en respectant le temps de contact).
- Ponctionner et exercer une pression douce jusqu'à obtention de grosses gouttes de sang.
Soit remplir entièrement le tube par capillarité sans toucher la peau. Boucher les extrémités du tube avec le mastic, Déposer la lancette dans le collecteur (il est interdit de recapuchonner les
aiguilles).
Soit déposer une goutte de sang sur la bandelette.
- Comprimer la zone ponctionnée ou faire un pansement au niveau du talon du nouveau-né.
- Pour les envois de gaz du sang au laboratoire de BIOCHIMIE se référer aux instructions indiquées dans le catalogue des actes
- Pour les gaz du sang en biologie délocalisée : se référer aux instructions communiquées par le laboratoire
lancette ou stylo autopiqueur,
tube(s) capillaire(s) ou bandelettes réactives.
Bouchons plastiques
Limaille de fer
Aimant
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URINES
BIOCHIMIE: urines de 24 h : totalité des urines des 24h après élimination de la 1ère miction du lever
BACTERIOLOGIE :
- ECBU (Examen Cyto-Bactério. des Urines): (préciser le mode de recueil)
Miction (adulte continent): Recueil des 1ères urines du matin ou s'abstenir d'uriner 3 heures avant le prélèvement :
effectuer la toilette génitale: gant de toilette à usage unique, savon, sécher recueillir le 2ème jet d’urines dans un pot à usage unique prévu pour le remplissage du tube
approprié (pot jaune) transvaser secondairement, en utilisant le système de transfert et sans rompre le système
clos, dans un tube boraté et ne retirer le tube qu’après arrêt du remplissage du tube (en cas de petit volume d’urines possibilité de prélever les urines d’un adulte sur un tube pédiatrique de 4 ml). Le bon remplissage du tube boraté est indispensable à la qualité de l’échantillon.
Sonde urinaire : prélèvement réalisé au niveau du site prévu à cet effet ¼ d’heure après le clampage de la tubulure sous le site de prélèvement. Désinfecter le site avec un antiseptique en respectant le temps de contact du produit. Prélever l’urine et transférer dans le tube boraté en respectant les conditions de remplissage. Déclamper la tubulure et s’assurer du bon écoulement des urines.
Poche de recueil (nouveau-né, nourrisson, jeune enfant, adultes incontinents) : effectuer la toilette avec savon, rincer, sécher et antisepsie locale : AMUKINE®, mettre en place une poche à urine stérile à l’aide de gants stérileslaisser en place jusqu'à
la miction mais pas plus de 30 minutes (changer de poche après 30 mn), prélever l’urine et transférer dans un tube boraté pédiatrique
Autres à préciser obligatoirement : sondage aller-retour (autosondage), ponction sus-pubienne, urines prélevées au bloc opératoire (préciser impérativement le type d’urines : pyéliques, urétérales…), bricker, étui pénien.
Tube bouchon jaune
Bien remplir le tube boraté (bouchon vert): - Adulte : 10 ml à remplir avec 9 ml minimum - Pédiatrique : 4 ml à remplir avec 3,5 ml minimum.
Niveau de remplissage
correct indiqué
par un carré
noir
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URINES
- Recherche de Mycobactéries : totalité des urines de la nuit, recueillie après restriction
hydrique sur la nuit. A réaliser 3 jours consécutifs.
- Antigènes solubles urinaires - Cytologie urinaire isolée
- Bandelette urinaire : Recueillir les urines dans un pot stérile, prélever à la seringue une
quantité d'urine en respectant le mode d'emploi (respecter le temps de lecture) VIROLOGIE
Pot stérile
Tube bouchon jaune, pot à bouchon rouge ou tube boraté (cf ci-dessus)
Pot stérile
Pot stérile
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URINES
- Urines pour recherche de bactéries responsables d’infections sexuellement transmissibles
Prélever le 1er jet d’urine pour recherche de : gonocoque Neisseria gonorrhoeae (PCR ou culture) Mycoplasma genitalium et Chlamydia trachomatis (PCR)
Pour la culture, tube boraté (cf ECBU)
Tube spécial pour PCR.
Suivre les instructions au dos du kit de prélèvement (voir ci-contre)
Cobas® PCR Urine Sample Packet (pastette + tube bouchon jaune - consignes de prélèvement au dos)
Remplir entre les 2 traits
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SELLES
Selon les examens demandés : faire uriner avant dans un récipient séparé. prélever un échantillon ou réaliser un écouvillonnage rectal (privilégier le prélèvement de parties muco-purulentes ou sanglantes), acheminement < 12h
BACTERIOLOGIE
a/ Coproculture standard (recherche de Salmonella, Shigella, Campylobacter et Yersinia) b/ Recherche de Clostridium difficile c/ Recherche de bactéries multi-résistantes : réaliser un écouvillonnage anorectal
PARASITOLOGIE Prélever dans un pot à selles : 3 selles de 3 jours à 6 jours d’intervalle s'assurer des heures d'ouverture du département afin que l'échantillon soit traité. Demandes spécifiques : se référer au catalogue des actes de biologie
- VIROLOGIE Prélever dans un pot à selles ou sur écouvillon sec
- BIOCHIMIE - Recherche de Na K Cl sur selles très liquides
Bactériologie : a)et b) pot stérile (bouchon rouge) + spatule à usage unique stérile c)Ecouvillons avec milieu de transport
Parasitologie : Pot à selles Virologie : Pot à selles ou écouvillon sec (bouchon rouge) Biochimie : Tube sec/à hémolyse/jaune
LBA
Prélèvement réalisé par le personnel médical Bactériologie standard Biologie moléculaire (ex : PCR Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae)
Pot stérile
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Procédure Manuel de prélèvement
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LIQUIDES
Ponctions réalisées par le personnel médical :
- Liquide d’ascite et liquide de dialyse péritonéale (attention les contenants ne sont pas interchangeables, ne pas en oublier un):
- Liquide articulaire et liquide péricardique (par ordre de priorité en fonction de la quantité disponible)
- LCR
- Autres ponctions (ex : liquide pleural) ou pus profonds (ex : liquides péritonéaux)
- si demande de PCR : Ex : Liquide articulaire pour recherche de Kingella kingae Ex : Liquides pour PCR ARNr 16S (toutes bactéries)
Tube EDTA et 2 flacons d’hémoculture aéro-anaérobie Tube sec stérile ± 2 flacons d’hémoculture aéro-anaérobie
Tube sec stérile (Bouchon transparent, sans activateur (surtout pas bouchon rouge) Tube sec stérile + milieu de transport type portagerm Rajouter un tube sec ou pot stérile
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EXPECTO-RATIONS
ASPIRATIONS BRONCHIQUES, TRACHEALES,
NASO-PHARYNGEES
L'expectoration du lever est conseillée.
Faire expectorer le patient dans un pot à vis classique après rinçage de la bouche à l'eau courante et éventuellement brossage des dents.
L'expectoration peut être facilitée par une séance de kinésithérapie respiratoire ou un aérosol de liquide physiologique.
Volume minimum : 3ml
Bactériologie standard
Recherche de Mycobactéries
Biologie moléculaire (PCR Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Bordetella
parapertussis/ pertussis) : cas du diagnostic de la coqueluche (Bordetella parapertussis/ pertussis), privilégier l’envoi de sécrétions naso-pharyngées en pot stérile et renseigner obligatoirement le statut vaccinal et la durée de la toux
Pot stérile
IST
ORL
- GORGE:
Bactériologie standard : écouvillonnage (NB préciser si recherche de portage de Gonocoque)
Biologie moléculaire : Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium et gonocoque
- OREILLE : externe : écouvillonnage moyenne : recueil du pus (écoulement ou paracentèse)
écouvillon avec milieu de transport ou écouvillon avec milieu de transport spécifique au charbon pour le gonocoque
Tubes spéciaux pour PCR,
Suivre les instructions au dos du kit de prélèvement (voir muqueuse génitale)
Ecouvillon avec milieu de transport ou pot stérile
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MUQUEUSE GENITALE
- VULVAIRE: écouvillonnage sans pose de spéculum
- VAGINAL ou ENDOCOL: écouvillonnage après pose d’un spéculum ou auto-prélèvement
- URETRAL : écouvillonnage après toilette du méat urinaire
Recherche standard : Bactéries, virus, champignon, Trichomonas
Recherche de gonocoque (culture)
Biologie moléculaire : Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium et gonocoque
(+ ANAL et SECRETIONS CONJONCTIVALES)
Indication : en perpartum avec un statut de portage de STRB non connu (service maternité ou salle d’accouchement). Réalisation 24h/24 : l’échantillon doit être apporté directement par un aide-soignant du service d’obstétrique au laboratoire (résultat en environ 1 heure après arrivée au laboratoire). En période de garde (à partir de 18h et le week-end), prévenir l’interne de
Ecouvillon (avec milieu de
transport pour recherche de bactéries)
Ecouvillon avec milieu de transport spécifique au charbon
Tube spécial pour PCR
Suivre les instructions au dos du kit de (voir ci-contre)
Milieu spécifique COPAN Transystem cf ci-joint
Cobas® PCR Female Swab Sample Packet (écouvillons + tube à bouchon jaune - consignes de prélèvement au dos)
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MUQUEUSE GENITALE
Recherche de Streptococcus agalactiae (Streptocoque du groupe B) en perpartum
Indication : en perpartum avec un statut de portage de STRB non connu (service maternité ou salle d’accouchement). Réalisation 24h/24 : l’échantillon doit être apporté directement par un aide-soignant du service d’obstétrique au laboratoire (résultat en environ 1 heure après arrivée au laboratoire). En période de garde (à partir de 18h et le week-end), prévenir l’interne de bactériologie sur le GSM de garde.
La feuille de demande doit comporter : o analyse « strB par GeneXpert » de prescrite o le numéro de poste dédié aux résultats de cette analyse (24/24) : 31348
Système de prélèvement : Utiliser le dispositif COPAN Transystem : écouvillon double + tube
avec milieu de transport Stuart (Cepheid).
Réalisation du prélèvement :
o Retirer du sachet les 2 écouvillons comportant une marque.
o Les introduire dans le vagin de la patiente. Prélever les sécrétions au niveau de la
muqueuse du tiers inférieur du vagin. Faire pivoter les 2 écouvillons 3 fois pour garantir
un échantillon uniforme sur les 2 écouvillons.
o Placer les 2 écouvillons dans le récipient de transport.
Remarque : il est important d’éviter la présence de sang ou d’autres substances comme du gel ou de la bétadine sur les écouvillons (risque d’inhibition de la PCR et de résultat « invalid »)
Milieu spécifique COPAN Transystem cf ci-joint
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PRELEVEMENT CERVICO-VAGINAL
pour frottis cervico-vaginal
et recherche des
Papillomavirus humains (HPV)
Mode d'emploi
Pot liquide PreservCyt®
Solution
Références Hologic : Flacons :
70098-002 Brosses
Cervex: 70671-001
Le pot liquide PreservCyt® contient 20 ml d’une solution qui permet de préserver les cellules
cervico-vaginales. Sur le même prélèvement, il est possible de faire un frottis cervico-vaginal (frottis
couche mince) et la détection des HPV.
Sur les flacons, l’étiquette
de la patiente doit être
collée horizontalement
SUR l’étiquette existante,
en laissant découverte la
partie nécessaire à
l’emplacement du code
barre du laboratoire.
Envoyer à température ambiante au laboratoire d’anatomie pathologique, accompagné de la feuille de demande en indiquant si un test HPV est souhaité sur le même prélèvement.
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PRELEVEMENT CERVICO-VAGINAL
pour recherche des
Papillomavirus humains (HPV)
Mode d'emploi
du dispositif
DNAPAP
Cervical
Sampler™
(ref QIAGEN 5122-
1220)
Le dispositif DNAPAP Cervical Sampler™ est composé d’un tube contenant 1 ml d’une solution et
une brossette. Ce dispositif est utilisé pour la détection des HPV mais ne permet pas de faire un frottis
cervico-vaginal.
1) Effectuer le prélèvement à l'aide de la brosse à la jonction endo-exocol (3 tours dans le sens
contraire des aiguilles d'une montre)
Si un frottis doit être réalisé, faire celui-ci avant le prélèvement pour la détection d'HPV.
2) Plonger la brosse chargée de cellules dans le milieu de transport (1 ml).
3) Casser le manche (autocassable – petite entaille) et laisser la brosse baigner dans le milieu.
4) Bien refermer le tube pour éviter les écoulements
Envoyer à température
ambiante, accompagné de
la feuille de
renseignements.
Remarque: Après
prélèvement, le tube peut
se garder 2 semaines à
température ambiante.
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Recherche des papillomavirus humains (HPV)
à partir de tissu
frais et tissu inclus en paraffine
Série :
1 fois/mois.
- L’échantillon inclus en paraffine peut être acheminé selon les circuits habituels en moins de 24
heures à température ambiante.
Attention : le fixateur doit être compatible avec l’analyse moléculaire (voir avec le laboratoire
d’anatomopathologie si besoin).
- L’échantillon frais peut être transporté à température ambiante mais doit arriver au
laboratoire dans l’heure suivant la réalisation du prélèvement. Au-delà d’une heure,
congeler l’échantillon (à -80 °C de préférence) et l’acheminer dans de la carboglace.
- Prélèvement :
Si l’échantillon frais est destiné uniquement au laboratoire de biologie des tumeurs
solides en vue de la détection des HPV :
Mettre le prélèvement frais dans un tube type tube Nunc® (2 ml ; bouchon vissé)
(plate-forme Medimat : Tubes polyester – conservation AZOT – Quantité 100 – référence : 002078)
Remplir la feuille de demande de la biologie des tumeurs solides en indiquant : l’heure de prélèvement indication et origine du tissu dans la section Renseignements « Typage
HPV »
Si l’ensemble de l’échantillon est adressé au laboratoire d’anatomopathologie, préciser
sur le bon de demande, le souhait de faire un typage HPV à partir du même
échantillon. Le laboratoire d’anatomopathologie renverra alors secondairement des
copeaux de tissu fixé en paraffine au laboratoire de biologie des tumeurs solides.
Pour tout renseignement, contacter le laboratoire au 04 67 33 58 77.
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PEAU
- PEAU (recherche mycologique) :
avec un scalpel mousse ou d'une curette de Brocq stériles, prélever les squames dans une boite de Pétri ou un pot stérile, notamment en périphérie de la lésion.
Effectuer ensuite un écouvillonnage (écouvillon humidifié) de toute la lésion, en particulier au niveau des plis cutanés.
- ONGLES (recherche mycologique) :
avec des ciseaux et d'un scalpel mousse ou d'une curette de Brocq stériles, prélever, dans une boite de Pétri ou un pot stérile, de fins fragments d'ongle et de matière sous-unguéale jusqu'à la zone de décollement de l'ongle.
- CHEVEUX, CUIR CHEVELU (recherche mycologique) :
au moyen d'une paire de pinces à épiler biseautées, prélever, dans une petite boite de Pétri ou un pot stérile, au moins une quinzaine de cheveux cassés courts et un maximum de squames.
Effectuer ensuite un écouvillonnage (écouvillon humidifié) de la lésion pour une recherche d’agent pathogène
- PEAU ET TISSU MOU (recherche mycologique ou bactériologique).
Pour la bactériologie, le principe est d’éviter de contaminer l’échantillon avec la flore commensale de la peau saine et de privilégier les prélèvements profonds :
Désinfecter des zones proximales de la plaie, débrider les tissus nécrosés, laisser sécher, rincer au sérum physiologique
Ecouvillonnage profond ou aspiration à la seringue en cas d’écoulement ou biopsie
Bien préciser si prélèvement profond ou superficiel et le contexte de prescription
Boîte ou pot stérile
Les contenants sont détaillés dans les fiches de chaque examen sur le catalogue des actes (milieu de transport)
Ecouvillon avec milieux de transport ou pot stérile (biopsie, liquide)