Maîtrise de l’information (Information literacy) dans la recherche en biologie

Par internet, toute information est disponible, facilement accessible, intéressante et utilisable à volonté…

La recherche en biologie – ou le défi de l’accès à l’information (!), de la sélection, et de l’utilisation des sources d’information!

Maîtrise de l’information dans la recherche en biologie

1. Mes activités et BIST pratiqués dans une activité de biologiste• Activités passées de biologiste • Activité actuelle recherchiste/formatrice

2. Ce qui est important qu’on enseigne aux élèves?

3. Opportunités pour enrichir et actualiser les enseignements?

4. Discussion avec les participantsConfrontations des propositions à la réalité des classes.

1. 1 Activités (passées) de biologiste Utilisation de l’information pour mes recherches

Préparation de projet (état de l’art, originalité, compétitivité d’un système par rapport à un autre)

“A phytoremediation approach to remove pesticides (atrazine and lindane) from contaminated environment” (thèse - académique)

“ Evaluation d’extraction d’ADN facilitée pour grand public (animation Eprouvette - vulgarisation)

“ Choix d’un support à cellules CHO pour l’augmentation de la production de Rebiff” (R&D Serono - industrie)

Recherche de protocoles (en fonction du budget et équipements de laboratoire…)

Comparaison des résultats obtenus, critiques

Rédaction (rapport ou publication)

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Séminaire d’expérimentation animale

Recherche de sources pour l’expérimentation animale pour le

respect des 3RProf. Marcel Gyger

étudiants master en sciences de la vieSylvie Vullioud-Marcacci, pour info.bc, le 13 décembre 2007

1.2 Activité (actuelle) de recherchiste/formatrice Utilisation de l’information pour la recherche en Science de la Vie à l’EPFL

Ex Wiki experimentation animale- Recherches documentaires avec et pour les étudiants et chercheurs

- Formations Ba, Ma, (Dr) à la recherche documentaire

- Accueil info à la bibliothèque

- Accueil aux nouveaux étudiants internationaux

2. Ce qu’il me paraît important qu’on enseigne aux élèves

A. La maîtrise de l’information? Le collège vous y prépare?

Information literacy

Bachelors

- Use of library catalog

- How to cite

- Writing a reference

Masters -Use of specialized databases

- Reference management

PHD

- Use of alerts

- Citation and impact factors

-Publication modalities

3. Technology watch and project design choice and viability

Scholar university

1. Engineer applies for a job

2. Engineer develops an innovative project

Industry

1. Student applies for master project

2. Student develops a master project

2. Ce qu’il me paraît important qu’on enseigne aux élèves actuels:

B. Notion de Web caché

Google• Poor search grammar

• “Best results” listed according score or page rank short-lived list of results

- Popularity – based on number of links pointing on 1 page - Importance – traffic, and quality of links- Distance between words and frequency of results

• Mixed information (personal, commercial, institutional, commercial, political Web sites)

Bibliographic databases

• Rich grammar search options (documentary equation)

• Results based on answers from a request of a form reproducibility

• Mostly based on peer-reviewed articles trustful sources

Invisible Web…

Sometimes 80% of

information is invisible in

science and technology…

• No indexation of deep pages

• Access to pages only with

subscription

• No access to some

databases with objects

without URL

Ex Trouver par Google la page Swisscom de l’adresse Vullioud Sylvie

Rechercher d’abord des BDB avec Google!

2. Ce qui me paraît important qu’on enseigne aux élèves

C. Utiliser des ressources (outils) scientifiques sur internet!

TaskScientific documentary tools in general

Open-Access scientific documentary tool

Documentary tools at EPFL

Scientific Subject search

Book catalog

Bibliographic database catalog

Scientific institutional BDB

OA Book catalogBooshelf in Pubmed?

OA BDBPubmed, DOAJ, Free medical journal?

Search engineScirus, Google scholar?

OA institutional BDBInfoscience, IRD?

Library book catalog

NEBIShttp://www.nebis.ch

Library BDB linkshttp://library.epfl.ch/db/

Institutional BDBInfoscience

Scientific Subject search

Littérature vulgarisée payanteAmerican scientific, Pour la Science etc.

Littérature vulgarisée OA- BDB Université de Pau?

- news de nature par RSS?

- news de newscientist par RSS?

http://library.epfl.ch

Stratégie: explorez les sélections de liens de BDB et journaux par les bibliothèques universitaires pour en trouver en OA?

Ex. What are professional information resources for animal experimentation and 3R at EPFL?

Domaines d’application des 3RReplace , Reduce, Refine

Animal testing, animal experimentationLaboratory animals, animal protection

Domains1. Fondamental basic researchEx : gene fonctions

2. Medical searchEx. Serums, vaccines, diagnosis reactiv, drugs, secondary effects

3. Non medical searchEx: biosafety assessment of chemicals, cosmetics, quality assessment

of drugs

1. Encyclopedias of life sciences Encyclopedias of life sciences

2. Open-access monograph catalogNEBIS

(3. E-Books access restricted to EPFL users)E-books link

4. Commercial BDB (access restricted to EPFL users)MedlineBIOSISWOSScopus

5. Publisher sites (access restricted to EPFL users)Science direct

DOMAINS1. Ethics, bioethics, philosophy see UNIL resources! 2. Swiss, European and International rights see institutional websites and UNIL resources! 3. Alternatives technics to animal experimentation see also CHUV resources!4. Animal genetics and transgenic mice see alsor CHUV and UNIL resources!

Ex Wiki experimentation animale

2. Ce qui me paraît important qu’on enseigne aux élèves

D. Recherche de synonymes pour utiliser les moteurs et BDB!

Related words: translation, plural, synonyms, abbreviations

animal protection, animal testing, animal experimentation, animal models, laboratory animal?

3R, three R, three R principles, Reduce, replace, refine / refinement, replacement, reduction

alternative to animal testing, alternative testing methodologies, alternatives to animal experiments, alternative methods, experimental models, non-models animals, animal use in life sciences

animal genetics, transgenic mouse, transgenic mice

GrammarBoolean operators AND OR NOTQuotation marks “…”Bracket ()Truncations * ?

My questionJ’aimerais avoir une vue d’ensemble et de ce qui se fait actuellement dans le domaine de recherche des méthodes alternatives à l’expérimentation animale

An example of documentary equation for NEBIS and BDB use"three R principles" or "reduce replace refine" or "animal alternative testing methodologies" or "alternatives to animal experiments" or "in vitro alternative methods" or "non-model animals"

DOMAINES1. Ethique, bioéthique, philosophie2. Législatif, Droit suisse, européen, et international, 3R, protection des animaux3. Expérimentation animale et techniques alternatives4. Génétique animale, souris transgénique, modèle animal

3. Opportunités pour enrichir et actualiser les enseignements en biologie?

- Critique de l’information par les élèves – “remonter l’information”- de la presse à la science

- Des cours à jour par les profs: se mettre au courant des nouvelles techniques et découvertes en biologie

- Découverte du réel processus de recherche par les élèves: controverses scientifiques

- Méthodologie documentaire par les élèves… et profs: acquisition de la notion de couverture de recherche et de sélection de l’information

- Ethique de l’information par les élèves…et les profs: respect des sources et de leur sens!

Toute la synthèse dans le travail de matu?

Ex Code d’honneur, guide des références et citations

1. Introduction à la maîtrise d’information (frontal): recherche, critique, utilisation de l’info

2. Formuler une question pour démarrer une recherche documentaire, exploration des mots-clés (par les élèves, avec aide)

3. Exploration de la recherche de sources d’information scientifiques (par les élèves, avec aide)

4. Mise en commun des mots, outils et références sur un wiki (par les élèves, en commun, avec aide)

5. Synthèse et compréhension des documents (travail personnel)

6. Rédaction, avec un chapitre de méthodologie documentaire (mots-clés et ressources utilisées!), des citations et références (par les élèves, avec aide)

3. Articulation de la construction d’un travail de matu?

Maîtrise de l’information (Information literacy) dans la recherche en biologie

Par internet, toute information est disponible, intéressante et utilisable à volonté…

La recherche en biologie – ou le défi de l’accès à l’information (Web caché), de la sélection (fiabilité des infos), et de l’utilisation (droit d’auteur) des sources d’information!