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Dveloppement et optimisationde services WebGIS interactifs et communautairespour lanalyse intgrede donnes spatiales environnementales et molculairesLtzS BHM AlexanderEV MARCHAL Cyril11/8/20131Dr. Stphane JOOSTPU Christophe CLARAMUNT111/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL2Dveloper des services WebGIS interactifs et communautairespour chercheurs en cologie molculaire et dcideurs publics: quels enjeux, quelles solutions? ProblmatiquePlanIntroductionSituation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs Analyse des besoins en cologie molculaireDmarche scientifiquevaluation IHM des solutionsMission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOMEInterface de GENOMAPSystme dutilisateurs de GENOMAPVisualisation des donnes environnementales et gntiques dans GEOMEInterface de GEOMEExecution: Synthse entre modles interactionnels universels et cohrence spatiale Avantages des linterfaces intgres de GENOMAP de GEOMEDeux plateformes collaboratives au service de la biodiversitConclusion, LimitesRfrences11/8/20133LtzS BHM, EV MARCHALPlan3IntroductionSituation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOMEExecution: Synthse entre modles interactionnels universels et cohrence spatiale ConclusionRfrences11/8/20134LtzS BHM, EV MARCHALIntroduction4IntroductionLASIG, EPFL, Lausanne, SUI

EN, Lanvoc-Poulmic, FRA

11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL5IntroductionFigure 1 : GC D2 415Figure 2 : Campus de lcole Navalecole Navale et PFE11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL6IntroductionFHMD&IthiqueGEOPOLEPMSStages LeadershipFMMNAV, ASTRO, Voile, BIMCorvette: BIN, BESCITC: SSA, STIC, STM, MTIVA: GM, GE, EM, ASM, SIMPFE46 binmes21 projets ltranger + 2 outre-mer13 pays

Figure 3 : Vue depuis la passerrelle dun BE devant Dunkerque avec une mer 3Figure 4 : Cours dispenses le semestre de VA.IntroductionSituation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs Analyse des besoins en cologie molculaireDmarche scientifiquevaluation IHM des solutionsMission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOMEExecution: Synthse entre modles interactionnels universels et cohrence spatiale Conclusions, LimitesRfrences11/8/20137LtzS BHM, EV MARCHAL1. Situation7

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Dfinition des contextes dutilisations

1. SituationFigure 5 : Schma de extraction et du squenage dADN. [1]Dmarche scientifique11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL91. SituationDveloppement centr utilisateur

Fig. 7 : UCD @ GENOMAPFig. 6 : Workflowvaluation ergonomiqueFig. 8 : GENOMAP Index

Fig. 9 : GEOME Homepage

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GENOMAP USE CASES11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL11

1. SituationGENOMAP USE CASES:Mode PublicFig.10: GENOMAP use case diagram 1GENOMAP USE CASES11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL121. SituationGENOMAP USE CASES:Mode PublicMode Private

Fig. 11: GENOMAP use case diagram 2Plus doptions de personnalisationIntroductionSituation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOMEInterface de GENOMAPSystme dutilisateurs de GENOMAPVisualisation des donnes environnementales et gntiques dans GEOMEInterface de GEOMEExecution: Synthse entre modles interactionnels universels et cohrence spatiale Conclusion, LimitesRfrences11/8/201313LtzS BHM, EV MARCHAL2. Mission13Interface de GENOMAP11/8/201314LtzS BHM, EV MARCHAL2. MissionCarte Openlayers

Accs libre

Affichages des tudes accessibles

Systme dutilisateur: tudes prives

Gnration durl daccs aux tudes prives

Slection de couleur prdfinies

Affichage de trois lgendes et de Landmark sur la carte

Tutorial

14Systme dutilisateurs de GENOMAPInscription libreSlection du statut prive/publicPalettes de couleurs personnalisableMise jour de ltudeRinitialisation du mot de passeAdministrateur11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL152. Mission2. Mission

11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL162. MissionVisualisation des donnes environnementales et gntiques dans GEOME

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Fichier JSON limit 1 degr autour de ltudeChaque fichier contient les valeurs des 12 mois et annuelle

2. MissionVisualisation des donnes environnementales et gntiques dans GEOME11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL182. MissionVisualisation des donnes environnementales et gntiques dans GEOME

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Interface de GEOME2. Mission

IntroductionSituation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOMEExecution: Synthse entre modles interactionnels universels et cohrence spatiale Avantages des linterfaces intgres de GENOMAP et de GEOMEDeux plateformes collaboratives au service de la biodiversitConclusion, LimitesRfrences11/8/201321LtzS BHM, EV MARCHAL3. Execution21Avantages des linterfaces intgres de GENOMAP et de GEOMEL'interface de visualisation de GEOME et de GENOMAPoffre l'exploration des donnes statistiques et binaires gorfrences;offre un fort degr d'interactivit avec les lments reprsents;

Cette interactivit permet notamment : de slectionner des individus ou populations;d'interroger des surfaces de la couche des donnes environnementales;d'appeler des informations drives;d'appliquer des analyses statistiques ou spatiales;

Les concepts principaux qui rgissent linterface sont:Rduire la charge cognitive;Mettre le contrle entre les mains de l'utilisateur. [2]11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL223. RsultatsAvantages des linterfaces intgres de GENOMAP et de GEOMELa dynamique assure la cohrence entre les diffrentes reprsentations;entre la carte et les tableaux de bords;

Le concept de tableau de bord repose sur l'intgration au sein d'une mme interface d'lments de reprsentation graphique complmentaires[2] , tels que :Compteur dindividusPosition (LAT, LON)Valeurs prcises des paramtres environnementaux

L'utilisateur doit pouvoir obtenir directement les lments ncessaires au suivi des valeurs et une prise de dcision claire et rapide.

11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL233. RsultatsIntroductionSituation: formuler les besoins et identifier les utilisateurs Mission : Proposer de nouveaux prototypes de GENOMAP et de GEOMEExecution: Synthse entre modles interactionnels universels et cohrence spatiale Conclusion, LimitesRfrences11/8/201324LtzS BHM, EV MARCHALConclusion, Limites

24Limites11/8/201325LtzS BHM, EV MARCHALConclusion, Limites

GENOMAPBasemap aprs chargement de donnes (Gmaps)RETEX

GEOMEGrandes tudes: optimisation des JSONLecture du nom dindividu dans le JSONAffichage precipitation: limites des valeursInscription doit passer par un administrateur.Lenteur daffichage pour les tudes couvrant une grande surface

25IntrtVisualiser des donnes difficiles se reprsenterFaibles connaissance techniques ncessairesAccessibilit optimaleNe ncessite pas dinstallation de logicielOutils de calculs performant pour GEOME: Sambada (S.Stucki)

11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL26Conclusion, Limites

Prsentation PFE - CF KESSLER 27 06 2013, http://cours.ecole-navale.fr/mod/resource/view.php?id=2522 (30.07.2013, 13h00)[1] http://wwz.ifremer.fr/lareunion/Medias-Ifremer/Medias-Lareunion/CAMP-SOOI/Sequencage-ADN (08.11.2013, 08h21)[2]Pointet, A., Solution de cartographie statistique distribue mapIntera, PPT, juin 2009

11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL27RfrencesRfrences

Merci pour votre attention!-Thank you for having paid attention to our presentation!Questions11/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL2811/8/2013LtzS BHM, EV MARCHAL29

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Futur travauxAmliorer interface: separer fentres (+ sobre)Database information on demandeColor selection and creation in popupsGenerate URL to share in popupEvaluate logs : traductions dans dautres languesTransfert technologique (?): futur OpenLayers 3.0Django & GEOMETlchargement des donnesExtraction dimages annotesVisualisation de graphes tudes de diversit gntique = projet Semestre dune tudiante dici et qui utilisera notre service

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19/09/2013 EV2 Bhm, Marchal