LIENS Code de la Propriأ©tأ© Intellectuelle. articles L 122. et principalement Thierry...

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  • AVERTISSEMENT

    Ce document est le fruit d'un long travail approuvé par le jury de soutenance et mis à disposition de l'ensemble de la communauté universitaire élargie. Il est soumis à la propriété intellectuelle de l'auteur. Ceci implique une obligation de citation et de référencement lors de l’utilisation de ce document. D'autre part, toute contrefaçon, plagiat, reproduction illicite encourt une poursuite pénale. Contact : ddoc-theses-contact@univ-lorraine.fr

    LIENS Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 122. 4 Code de la Propriété Intellectuelle. articles L 335.2- L 335.10 http://www.cfcopies.com/V2/leg/leg_droi.php http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm

  • Thèse de doctorat présentée par

    Apolline AUCLERC

    en vue de l’obtention du grade de Docteur de l’Université de Lorraine

    mention Ecotoxicité, Biodiversité, Ecosystèmes

    EFFETS D’AMENDEMENTS CALCO-MAGNESIENS SUR LA

    DIVERSITÉ DES MACROINVERTÉBRÉS DE SOLS FORESTIERS ET

    SUR CERTAINS PROCESSUS FONCTIONNELS ASSOCIÉS.

    Cas du massif vosgien (nord-est, France)

    Soutenue publiquement le 12 juin 2012 devant le jury composé de

    RAPPORTEUR Thierry GAUQUELIN - Professeur, Université de Provence, IMBE, MARSEILLE

    RAPPORTEUR Eric BLANCHART - Directeur de Recherche, IRD, MONTPELLIER

    EXAMINATEUR Mickael HEDDE - Chargé de Recherche, INRA, PESSAC

    EXAMINATEUR Arnaud LEGOUT - Chargé de Recherche, INRA, CHAMPENOUX

    EXAMINATEUR Jean-François PONGE - Professeur émérite, MNHN, BRUNOY

    DIRECTEUR DE THESE François GUEROLD - Professeur, Université de Lorraine, LIEBE, METZ

    CO-ENCADRANTE Johanne NAHMANI - Chargée de Recherche, CNRS, CEFE, MONTPELLIER

    Ecole Doctorale Sciences et Ingénierie Ressources

    Procédés Produits Environnement

    RP2E ED 410

    Université de Lorraine

    Laboratoire des Interactions Ecotoxicologie, Biodiversité,

    Ecosystèmes

    LIEBE CNRS UMR 7146

    ANR RECOVER

  • REMERCIEMENTS

    Et voilà c’est le moment pour moi d’écrire cette partie tant désirée. Heureuse d’être arrivée jusque là, heureuse de pouvoir remercier tous les gens qui m’ont soutenue, qui ont cru en moi et que j’ai eu la chance de connaitre tout au long de cette thèse, Ô période inoubliable de ma vie.

    Tout d’abord mes remerciements les plus forts sont pour mes deux encadrants. Le premier François GUEROLD, qui a accepté d’accueillir une limousine (la vache, la voiture ou la fille) dans son gué rôle de directeur de thèse. Un grand merci pour tout ce que tu m’as inculqué (le savoir, la force que tu as à faire passer des messages difficile à faire passer, la patience, la vulgarisation scientifique…). La deuxième Johanne NAHMANI (alias môman), merci d’avoir accepté toutes mes blagues pourries, de m’avoir fait connaitre tous tes contacts, de m’avoir fait vivre l’expérience exceptionnelle mexicaine et de m’avoir tellement appris, les traits, le sol, la vie quoi… et sur les vers de terre (mais tu n’as pas réussi à me faire passer de l’autre coté de la force…mon cœur restera toujours avec les Collemboles). J’adresse mes remerciements aux membres du jury qui ont accepté d’évaluer mon travail de thèse : Thierry GAUQUELIN, Eric BLANCHART, Mickael HEDDE, Arnaud LEGOUT et Jean-François PONGE. Merci beaucoup Jean-François, c’est grâce à toi que j’arrive ici et que mon chemin semble continuer dans la Recherche et promis je resterais toujours TON étudiante. Merci à Jean-Pierre ROSSI que je n’ai jamais rencontré mais qui m’a tellement appris, aidé et conseillé pendant cette thèse. Merci à Yvan CAPOWIEZ, le maître végétarien de la tomographie et mondial en plus ! J’en profite pour faire la bise à tes deux p’tits bouts de choux et merci Line pour tes plats succulents.

    Je tiens à remercier toutes les personnes qui ont aidé dans le projet avant et pendant la thèse (Jean-François MASFARAUD, Delphine ARAN (vive la CEC et les andosols!), Claudine, Chantal, Anne-Marie, Marie-Andrée, Antoinette, Aurore, Emmanuel L., Philippe R., Laetitia…) pour le tri manuel des bestioles pour lequel il vous a fallu du courage pour affronter les araignées géantes des Vosges. Bravo aux porteurs de plus de 500kg de sol vosgien (JF. M., Christophe PAGNOUT, Philippe W., Yvan, Hugues). Un grand merci à Philippe WAGNER, j’ai aimé tous ces moments passés sur le terrain et dans ton camion (surtout derrière), tu sais rendre les Vosges encore plus belles qu’elles ne le sont. Grâce à toi, j’ai eu l’honneur de faire la connaissance de Jérome et Nadia, de rejouer aux échecs, de goutter à des spécialités régionales (master flambé au kirsch, le baeckeofe MIAM !), et de connaitre des moments inoubliables de réchauffement

  • avec le Picon Bière après des journées de terrain dans la montagne vosgienne dans laquelle je n’ai pas réussi à observer la bête des Vosges, ni le loup… Je tiens également à remercier toutes les personnes participant au projet ANR Recover et principalement Thierry GAUQUELIN, Hussain RIZVI, Charles GERS, Virginie BALDY, Jean-Luc DUPOUEY…, et les financeurs du projet, l’ANR et la ZAM. Merci à Guy GEHIN (ONF Cornimont) pour son marc trop doux et son miel fait par une abeille qui a fait des heureux jusqu’en Limousin et merci à sa femme Ghislaine. Les belles vaches vosgiennes ont également fourni le munster à mon papa, merci à elles ! Merci à tous les agents ONF, Bruno VAXELAIRE, Pascal MOUGEL (ONF Cornimont), Sylvain LEBLOND (ONF moussey), Jean-Luc DEBIAS (ONF forêt de HUMONT). Merci à Philippe ROUSSELLE pour tous ses conseils chimiques et ses sourires, merci à Jean-François POINSAINT pour toutes les minutes de rire et la construction des mésocosmes. Chantal, je n’oublierai jamais les innombrables feuilles triées ensemble dès mon arrivée au labo. Merci à Maryline pour tous ces coups de mains et bisous à Gary, Mireille je te remercie pour ton Endnote si fabuleux. Un très chaleureux remerciement à Etienne IORIO pour m’avoir offert une formation sur les chilopodes et à Alain PASQUET qui m’a fait connaître le monde des araignées tellement fascinant. J’en profite également pour remercier Jorg SPELDA (diplopodes), Emmanuel LAPIED (vers), Henry CALLOT (coléoptères) pour leur aide dans la détermination des individus échantillonnés durant cette thèse. Merci à Charline FREYBURGER (INRA Nancy) pour le scan des colonnes de sol, Marc BUE (INRA Nancy) pour m’avoir initiée à l’enzymo, Etienne DAMBRINE et Bernd ZELLER pour leurs conseils sur l’isotopie, Jean-Pierre BOUDOT pour ses conseils sur l’aluminium dans les sols vosgiens. Un grand merci à François TOUTAIN pour la formation sur les humus et aux techniques de sorcier, Je tiens également à remercier Stephan HATTENSCHWILER pour la relecture du papier de Humont et Sandra BARANTAL qui m’a permise de décrocher un POSTDOC. Une pensée très forte est adressée à Mickael HEDDE pour m’avoir intégrée dans le projet BETSI sur les traits de la faune du sol, et à son bras droit (ou gauche) Benjamin PEY mais c’est un faux problème… Merci à Jérome CORTET pour son soutien et Nico j’ai adoré ta formation sur l’agrégation du sol !

    Un grand merci est adressé à Michael DANGER qui a ramené un air Orséen dans un labo messin et qui amène chaque jour deux rayons de soleil : son sourire et sa femme Florence, avec laquelle j’ai adoré manipuler l’acide et discuter dans son bureau avec la nostalgie d’antan... bisous à Loïc. Sandrine c’était trop cool les dissections !

  • Merci aux trois stagiaires de Master (Jordan GUIZ, Sophie FLORSCH, Pierre HUGUIER) avec lesquels j’ai passé des très bons moments et qui m’ont appris la pédagogie et m’ont ouvert les yeux sur ma volonté de transmettre mes modestes connaissances, et qui m’ont montré comment calculer en 100 leçons. Merci aux étudiants en thèse qui m’ont accueillie chaleureusement avec cette jolie poubelle vache dont je me sers tous les jours en pensant à vous (Eric, Audrey). Hugues, merci pour tes blagues en particulier celles sur les lépreux et ma préférée reste celle avec les tronçonneuses (ta mèèèèreee….). Manu, j’ai réussi à survivre à ton Fahrenheit et Jonathan j’ai aimé nos échanges dans le labo et nos chansons revisitées.

    THANKS to Nano-Emilie et Fanny la blonde, mon duo de choc, la girl team de soutien dans les moments les plus messins. Et trop cool les paris sur la neige, les buffalos et puis aller j’mobalpa… Cools les soirées avec El Papo, Eveline, Faustine (mon ptit), Mael (la touf), Pierrot que j’ai connu trop tard !!! mais vieux motard que jamais et pis je pense que c’est le début d’une longue histoire avec vous. Merci au beau sourire de Gabriel, au chocolat et aux conseils de Cyrielle et Kaïna et à tous les autres stagiaires que j’ai eu l’honneur de connaître… Après ma venue du fond de la Creuse, merci à la ville de Metz pour m’avoir fait découvrir sa richesse historique et tous ses habitants sont tellement… le Lac Symphonie avec ses canards orangés et le golf pour toutes ces balades déstressantes du soir. Maintenant je pourrais placer précisément Metz sur la carte de France et même du Monde… Je souhaite finir ces remerciements sur ma plus grosse pensée qui va à mes proches, Amandine e