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L’enseignement en Biologie structurale int´ egrative Les d´ efis humains de la biologie structurale : former des ´ etudiants ayant une culture biologique de plus en plus vaste construite sur une formation scientifique initiale suffisante en physique, chimie, et math´ ematiques, une maitrise de l’outil informatique et une ouverture vers le domaine de la sant´ e. Les d´ efis ` a relever : le plus souvent pas abordables par une seule universit´ e. ecessit´ e de d´ evelopper collaborations et ´ echanges entre les universit´ es fran¸caises : indispensables pour assurer la formation et le recrutement de futurs chercheurs dans un niveau d’excellence international. Colloque Annuel ITMO BMSV (Paris) eNaFoBiS 24/05/2013 1 / 11

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L’enseignement en Biologie structurale integrative

Les defis humains de la biologie structurale :

former des etudiants ayant une culture biologique de plus en plus vaste construite sur uneformation scientifique initiale suffisante en physique, chimie, et mathematiques, une maitrisede l’outil informatique et une ouverture vers le domaine de la sante.

Les defis a relever : le plus souvent pas abordables par une seule universite.

Necessite de developper collaborations et echanges entre les universites francaises :

indispensables pour assurer la formation et le recrutement de futurs chercheurs dans unniveau d’excellence international.

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Reseau National de Formation en Biologie structurale integrative

• Developper/re-stimuler les collaborations et les echanges entre les universites/equipes derecherches francaises dans le cadre de l’enseignement de la biologie structurale integrative.

• Une reflexion ”qui murit” depuis plusieurs dernieres annees

GTBIO 2012 Montpellier, AFC 2010 Strasbourg, GTBIO 2009 Paris

Les Programmes mobilisateurs

FRISBI : Infrastructure Francaise de Biologie Structurale Integrative.

INSTRUCT : Infrastructure Europeenne de Biologie Structurale Integrative.

• Groupe de travail national, Reunions ”fondatrices”Paris Mai 2011, Fevrier 2012, Octobre 2012, Fevrier 2013, Mai 2013

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Reseau National de Formation en Biologie structurale integrative

Coordinateur

Jean Cavarelli

Bureau

Herve Darbon,Marie-Helene LeDU, Claudine Mayer, Eric Guittet,Bruno RobertBruno Kieffer, Dominique Housset, Stefano Trapani,Andy Thompson

Conseil Administration

Yves Mechulam, Herman van Tilbeurgh, JacquelineCherfils,Arnaud Gruez, Patrice Gouet, Jean-Francois Guichou,Laurent Maveyraud,Catherine, Bougault, Coralie Bompard , Myriam Czjzek,Valerie Lamour, Arnaud Poterszman,Eva Pebay-Peroula, Cathy Royer, Bruno Klaholz, YvesBourneJean-Luc Ferrer, Gordon Leonard, Matthieu Reffregiers

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Relever les defis de l’enseignement de la biologie structurale integrative en France

Structure nationale de formation au niveau post-master (”ecole doctorale”) en Biologie StructuraleIntegrative

• le public cible est principalement les etudiants en doctorat,

• les etudiants de master ne sont pas exclus, mais ne sont pas la cible principale,

• elargissements aux post-doctorants,

• ouvertures eventuelles a des chercheurs plus confirmes, specialistes d’une ”technique donnee”et souhaitant integrer plusieurs techniques.

Appellation :

Reseau National de Formation en Biologie structurale integrative

ReNaFoBiS

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Reseau National de Formation en Biologie structurale integrative

Objectifs :

1 Integrer, coordonner et mutualiser les formations offertes en Biologie Structurale Integrative.Formations existantes ou planifiees et creations eventuelles de nouvelles formations.

2 Proposer/developper/encourager les collaborations nationales et internationales. Chaqueuniversite/centre peut et doit developper sa specificite.

3 Offrir une visibilite et une unite a la communaute nationale.Valoriser un coeur federateur commun

4 Proposer des enseignements labellises, reconnus par les Ecoles Doctorales de chaqueuniversite. Le label donne doit etre valorisant dans la formation du doctorant.

un gage de formation de haut niveau.valorisant un CV et pris en compte dans un recrutement.

5 Integrer les aspects connaissances fondamentales et developpements pratiques. Visionactuelle et developpements futurs.

Vers une Ecole Doctorale Nationale en Biologie Structurale Integrative ?

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Les domaines de competences de la formation doctorale :

• Les methodes de determination de structures 3D a differentes echelles de resolution.Specificite et integration. Developpements methodologiques et technologiques.

• Les methodes de biologie moleculaire en vue d’etudes structurales (sur-expression, productionet purification des macromolecules biologiques).

• Les methodes biophysiques d’etudes d’interaction entre macromolecules.

• Les outils predictifs de base en biologie structurale (relations sequence - structure - fonction -evolution).

Formation doctorale nationale necessite formations initiales locales au niveau master.

• formations initiales pouvant etre heterogenes en fonction des universites ou des domaines decompetences, si necessaire des modules plus « basiques » adaptes au depart a desnon-specialistes d’un domaine donne.

• Sauf exception, il ne s’agit donc pas d’un copier/coller de ce qui se fait localement.

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Organisation de la formation. Programme en mode classique

• 3 modules annuels

• module labelise ReNaFoBiS n’est pas forcement un module cree ”ab-initio”s’adosser a une une initiative, une formation, un workshop, un meeting mis en place localement oudeveloppe specifiquement : Un congres, workshop, .. affiche le partenariat ReNaFoBiS.

Le cadre des modules « normaux » :

50H a 70H d’enseignements, theorique et pratique

20 participants par module

5 tuteurs

Planning 2013-2014

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Planning 2013

Formation pre-existantes avec partenariat ReNaFoBiS

Roscoff, Juin, 10 personnesCristallographie biologique

Strasbourg, 18-21 septembre, 25 personnes. INSTRUCT”Getting the best from your structural data : beyond black boxes”http ://structural-data.sciencesconf.org/

Marseille, Marseille, 25-29 Novembre 2013”HTP protein complex production and characterization”

Les objectifs de ReNaFoBiS

aider la formation et ”sponsoriser” 5 doctorants par formation

Financement : 2000e par atelier + 500e par participant

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Planning 2014

Ecole Nationale de Biologie Structurale Integrative : 2-6 Juin, Ile d’OleronLa biologie structurale integrative : methodes, enjeux et defis.Apports et limites des differentes methodes de biologie structurale par des exemples.50 participants

Panorama des methodesPossibilites et limites de chaque methode. echecs et succesOutils d’integration inter-methodes

GiGreStraformation RMN

”Integrated structural Cell Biology”Les Houches, Juillet.

BioStruct : ”Soleil”” Advanced data collection techniques ”, Novembre

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Les actions en cours

1 Une organisation• un bureau, une instance de « management », des statuts

2 Un organe de communication. Site Webrenafobis.fr. Juillet 2013

3 Des sources de financementscreation/soutien de formationAides aux deplacements, bourses de voyagesOffrir des bourses de doctorat ouvertes a la communaute nationale ?

Soutien de l’ITMO BMSV

4 Un outil de formation ? : Creation d’un ”MOOC” ReNaFoBiS

5 Premiere promotion ReNaFoBiS : rentree 2013

Les interfaces en developpement

• Liens avec les societes savantes (AFC, SFB, SFBBM, SFmu).

• Liens avec les instances nationales

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Site Web : renafobis.fr. Acces public courant Juillet 2013

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