LE MICROBIOTE: UN MONDE QUI SE DEVOILE

LE MICROBIOTE:

UN MONDE QUI SE DEVOILE

ET SES DIFFERENTES APPLICATIONS EN PARTICULIER

DANS LE SYNDROME METABOLIQUE

www.cabinet.gardan.ch

Dr med. Jacques Gardan 2016-2017

1

http://www.cabinet.gardan.ch/

«SILLONNER LA MER A L’INSU DU CIEL»

Faire quelque chose qui produise des

effets évidents sans que notre action soit

remarquée, permet d’éviter les

résistances au changement que nous

voulons déclencher.

A partir des «Trente six stratagèmes chinois»


2

Le microbiote

un monde et un organe


3

MICROBIOTE INTESTINAL

Un écosystème:

- 400 m2: 2 cours de tennis

- 100 000 milliards de bactéries, soit 10 fois plus que le nombre de

cellules humaines

- poids total de 2kg, soit le même poids que le cerveau

- 1000 espèces bactériennes (150 à 170 prédominantes par individu)- 95% le pourcentage du microbiote que contient le colon, le reste est

dispersé dans le système digestif

- 2 millions de gènes, soit 100 fois plus que le nombre de gènes humains


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100 000 milliards de bactéries, soit 10 fois plus

que le nombre de cellules humaines

Alors qui sommes nous ?


5


Quelques définitions

* Le microbiote: ensemble de microbes qui vivent dans le corps humains, y compris lesbactéries, les archées, les virus et les eucaryotes

* les archées: organismes unicellulaire, qui ont l’apparence de bactéries, mais qui s’en distinguent au niveau génétique et moléculaire

* les eucaryotes: ensemble des organismes vivants, qui ne sont pas desbactéries ou des archées, y compris les humains, les plantes et les animaux. La première cellule eucaryotes auraient vu le jour, lorsqu’une archée aurait «avalé» une bactérie


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Quelques définitions (suite)

* Le Microbiome désigne les génomes collectifs présents dans un microbiote donné

* Métagénomique: en plus du génome humain, apparaît le métagénome,directement en relation avec des bactéries environnementales, dont plus de 80% restent ignorées

Se déclinent ainsi,

- le métatranscriptome (étude des ARN produits par un microbiome)- Le métaprotéome (l’étude des protéines produites par un microbiome)

- Le métabolomique (réseau métabolique d’une communauté microbienne)


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L’étude du microbiote intestinal a commencé avec le

Human Microbiome Project nord-américain en 2007,

suivi par le Metagenomics of the Human intestinal tract

en Europe en 2008

Quelques articles synthétiques

- Forum Med Suisse 2014; 14 (16-17): 342-344

- P.Lepage: Micalis-UMR1319, INRA, Jouy-en-Josas Feuillet de biologie / N°323-Mars 2015

- Pierre Bourlioux, académie de pharmacie, groupe de travail microbiote

- Denis Roy, université Laval, microbiote intestinal, octobre 2013 etc

- www.invivomagazine.com décembre 2014


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http://www.invivomagazine.com/


Ensemble important de bactériesréparties le long du tractus intestinalet dont la composition globale estvariable selon la localisation, les individus, l'âge, les périodes de la vied’un même individu ...


9



10


Implantation du microbiote intestinal

Notre microbiote est caractérisé par les différentes propriétés d’un organe.Il est héréditaire, il communique à l’intérieur et à l’extérieur des cellules et peut être transplanté. Mais il ne se forme qu’après la naissance. La transmission, dans le sens de la colonisation par le microbiote maternel, ne se fait elle aussi qu’après la naissance. Le mode d’accouchement détermine la composition des bactéries pionnières sur la peau et la muqueuse des nouveau-nés. Après césarienne, ce sont les staphylocoques qui dominent et après accouchement par voie basse, les germes vaginaux et intestinaux, dont surtout les lactobacilles acidophiles. Sous l’effet des influences environnementales, le microbiote adulte, dont la composition est très stable, se développe au cours des deux premières années de vie.


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Le développement du microbiote intestinal peut se voir en 4 phases:

- Phase 1: premières bactéries anaérobies facultatives, streptocoques,

entérobactéries et staphylocoques (après 48H 10 (4) – 10 (6) du contenu

intestinal

- Phase 2: les anaérobies strictes (bifidobactéries) augmentent jusqu’à

10 puissance 9 dans les dix premiers jours de la vie

- Phase 3: depuis le début de la diversification alimentaire, la flore

anaérobie augmente et se diversifie

- Phase 4: dès la deuxième année environ, le microbiote se rapproche de

celui de l’adulte


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Le mode d’alimentation de l’enfant va affecter la

colonisation.

Ainsi les enfants nourris au lait maternel présentent

un microbiote enrichi en bactéries du genre

Bifidobacterium, tandis que le microbiote des

enfants nourris au lait infantile est plus diversifié et

contient des niveaux plus faibles de

Bifidobacterium.


13


14


A l’âge adulte, le nombre moyen d’espèces bactériennes est estimé à plus

de 500 par individu.

Une caractéristique majeur, la résilience du microbiote. Cependant, celle-

ci semble avoir un seuil et dépend des expositions environnementales

(antibiotiques)

Enfin, chez la personne âgée, le microbiote va subir des modifications

structurales caractérisées par une diminution des bactéries des genres

Bifidobacterium et Bacteroides, au profit des entérobactéries et des

Clostridia.

En conditions saines, les anaérobies strictes, ne survivent pas plus de

quelques minutes en présence d’oxygène


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Le développement de méthodes

indépendantes de la culture basées,

entre autres, sur l’analyse du gène codant

l’ARN de la sous-unité 16S du ribosome

(16SrRNA gene) a rapidement permis

d’élargir nos connaissances sur la diversité

du microbiote digestif.


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Ecologie du microbiote intestinal

- Bactéries symbiotiques

fonctions bénéfiques pour la santé de l’hôte

- Bactéries commensales

résidantes, sans effet sur l’hôte

- Bactéries opportunistes

résident de façon permanente, en fonction de

l’environnement peuvent s’avérer pathogènes


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Bactéries endogènes ou autochtones

Toujours présentes dans le tractus intestinal

Se développent et se maintiennent

comme membres d’une population

bactérienne particulière à l’individu.


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Bactéries exogènes ou allochtone

Peu susceptibles de devenir des populations normalesLa majorité des pathogènes sont acquis accidentellement.Les souches probiotiques sont désignées sous le nom d’allochtone


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On distingue ainsi diverses classifications, d’où

une certaine confusion selon:

- un phylum (un embranchement)

- une classe

- un ordre

- une famille

- un genre

- une espèce


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Par exemple:

Bifidobacterium (Genre)

lactis (Espèce)

Bb-12 (Souche)


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22


On distingue ainsi 3 très grands phylum:

Firmicutes

Bacteroidetes

Actinobacteria

On distingue aussi plusieurs autres phylum, plus

secondaires, en particulier les protéobactéries

le phylum Verrucomicrobia


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Le phylum Firmicutes est constitué de :

Bactéries gram +, en particulier le Ruminococcus, les lactobacilles et les entérocoques, streptocoques et clostridium, etc.

On distingue aussi les Faecalibacterium, dont le Faecalibacterium prausnitzii, dont on verra plus tard le rôle dans la modulation de l’inflammation


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Le phylum Actinobacteria, gram + aussi, est constitué en autre, par les

bifidobactérium


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Le phylum Bacteroidetes, gram – , renferme en particulier les

bacteroides et le Prevotella


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Les deux autres phylum secondaires:

- Proteobacteria, gram -, renferme les

Enterobactéries, en particulier E.Coli

- Verrucomicrobia, avec en particulier

Akkermansia muciniphila, dont on verra le rôle

en pathologie


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A côté de ces phylum, on distingue, depuis le

projet MetaHIT, 3 clusters de microbiotes

appelés entérotypes, qui sont stables et

indépendants de l’ethnie, de l’alimentation, du

sexe et de l’âge.

- entérotype 1: Bacteroides

- entérotype 2: Prevotella

- entérotype 3: Ruminococcus


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Selon les entérotypes


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Selon les phylum


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FONCTIONS DU MICROBIOTE

Le microbiote "normal" possède deux fonctions de

défense essentielles pour l'organisme :

il participe à la maturation du système immunitaire

au début de la vie

il possède un effet barrière vis à vis de pathogènes

extérieurs.


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Sur le plan du système immunitaire intestinal,

- développe une tolérance induite par voie orale et empêche le développement d’une réponse immunitaire contre les protéines alimentaires et le microbiote

intestinal présent en permanence dans le tube digestif

- développe des réponses immunitaires protectrices contre les agents pathogènesenvahissants par la synthèse d’Ac IgA. Ces anticorps peuvent bloquer la translocation bactérienne, neutraliser les toxines et inhiber la multiplication virale

Les fonctions immunitaires ne se développent pour l’essentiel que sous l’influence du microbiote, les follicules lymphatiques sous l’épithélium intestinal ne se formant qu’en présence du microbiote intraluminal.


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Effet barrière exercé par la flore résidente vis-à-vis des bactéries exogènes

- par élimination totale de la souche exogène

(effet drastique)

- par maintien de la souche exogène en

sous-dominance (effet permissif)


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En résumé:

Interactions entre notre microbiote et le bol alimentaire

‐ fermentation de la partie non digérée

‐ détoxication de composés nocifs

- régulation de l’appétit et stockage des graisses

Interactions entre notre microbiote et nos cellules

‐ stimulation du système immunitaire

‐ développement des tissus

- stimulation des défenses passives

- interaction avec le SNC

Interactions entre notre microbiote et les microbes

- pathogènes : effet de « barrière » protecteur

- des composants et/ou bactéries de nos aliments

- peuvent participer à ces « effets ‐ santé » : les pré ‐ et probiotiques


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FONCTIONS METABOLIQUES

Propriétés biochimiques de la flore intestinale

Dégradation des sels biliaires: Déconjugaison , déshydrogénation, déshydroxylation

Dégradation de la bilirubine: Déconjugaison, réduction

Dégradation du cholestérol: Réduction en coprostanol, diminution du LDL cholestérol sanguin

Fermentation: Production d’hydrogène et de méthane

Production AG courte chaîne: Production d’acides acétique, propionique, butyrique, isobutyrique et isovalérique

Dégradation des mucines: Dégradation

Production d’enzymes: β-glucuronidase, uréase

D’après Fuller et Perdigon, 2003


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PRODUCTION D’ACIDES GRAS

A COURTE CHAINE

ACETATE

- important pour le cœur, les muscles et le cerveau

- Bacteroides, Bifidobacterium, Eubacterium,Lactobacillus, Clostridium, Ruminicoccus,Propionibacterium, Vellonella…

Macfarlane et Gibson, 1997; Bernalier-Donadille et Doré, 2008


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A COURTE CHAINE

PROPIONATE

- Utilisé principalement par le foie

- Bacteroides, Propionibacterium,

Veillonella


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A COURTE CHAINE

BUTYRATE

- Source principale d’énergie pour les

colonocytes

- Clostridium, Eubacterium, Butyrivibrio,

peptostreptococcus, Faecalibacterium,

Roseburia, Anaerostipes


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FACTEURS INFLUENÇANT LA FLORE


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L’ALIMENTATION

Vous êtes ce que vous mangez

Communauté dominée par:

* Bacteroides – protéines animales et gras saturés

* Ruminococcus – consommation d’alcool et

gras polyinsaturé

* Prevotella – régime à base de glucides

Linking Long-Term Dietary Patterns with Gut Microbial Enterotypes Gary D.Wu et al. Science 334, 105 (2011);

Doi: 10.1126/science. 1208344


42

L’ALIMENTATION

En résumé:

Une consommation élevée de protéines et de graisses

animales est liée à l’entérotype «Bacteroides», tandis qu’un

régime riche e glucides est associé à l’entérotype dominé par

le genre Prevotella.

Une intervention nutritionnelle sur 10 jours affecte la

composition en espèces du microbiote intestinal, mais pas la

distribution en entérotypes. La stabilité dans le temps de

l’appartenance à un entérotype chez l’homme en fonction

de la nutrition ou de l’état clinique n’a pas encore été

évaluée à l’heure actuelle


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L’ALIMENTATION

Les régimes pauvres en FODMAPS (Fermentable Oligo-, Di - and Monosaccharides, And Polyols)

La réduction des aliments fermentescibles contribue à réduire les ballonnements secondaires aux productions de gaz et peut-être même les diarrhées et les douleurs abdominales, par une modification non spécifique du microbiote.

Capital Santé 10 Printemps 2015


44

LE TABAGISME

En effet, on note une augmentation des Firmicutes et Actinobacteria, et une diminution des Proteobacteria et Bacteroïdetes dans le groupe qui a arrêté de fumer, alors que la flore reste stable dans les groupes contrôles.

Parallèlement, la prise de poids était en moyenne de 2,2 kg(en neuf semaines) chez les sujets qui avaient arrêté de fumer.

Rev Med Suisse 2015 ; 11 : 1304-6


45

EUBIOSE ET DYSBIOSE

Il est connu qu’une grande diversité

bactérienne est l’expression d’un

microbiote sain («eubiose»).

Une dysbiose, avec une diversité plus faibles et prédominance de certaines

bactéries, se voit par contre dans de

très nombreuses maladies.


46

Rappel sur la physiologie de

la barrière intestinale et sur la

notion de l’hyperperméabilité

du grêle


47

RMS 7 11 2011 1696


48

EUBIOSE ET DYSBIOSE

Cellules épithéliales (Entérocytes)

Les entérocytes assurent une fonction de barrière mécanique vis-à-vis du contenu de l’intestin. Cette barrière est obtenue grâce aux liaisons serrées unissant étroitement les entérocytes.


49

EUBIOSE ET DYSBIOSE


Les entérocytes procèdent à la réabsorption

des micronutriments grâce aux multiples

enzymes et transporteurs fichés dans leur

« bordure en brosse ». Celle-ci est constituée par

les microvillosités, qui multiplient encore par

trente la surface muqueuse de l’intestin grêle


50

EUBIOSE ET DYSBIOSE


Les cellules épithéliales possèdent donc une double fonction antinomique: limiter les entrées des grosses molécules indésirables, tout en absorbant les petites molécules indispensables.


51

EUBIOSE ET DYSBIOSE


Cette dualité délicate implique un parfait état de santé de ces cellules. Les deux fonctions principales des entérocytes sont souvent perturbées simultanément en cas de « leaky gutsyndrome »


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EUBIOSE ET DYSBIOSE

Les cellules de Paneth

Les cellules de Paneth se différencient (à partir de

cellules souches intestinales) en migrant vers le fond

des cryptes de Lieberkühn, où elles s’accumulent.

Ces cellules de Paneth sont facilement

reconnaissables à leur grande taille et à la

présence de granules bourrés de peptides, prêts à

être largués dans la lumière des cryptes intestinales.


54

EUBIOSE ET DYSBIOSE

Les cellules de Paneth

Les cellules de Paneth orchestrent la composition

de la population microbienne dans les cryptes de

Lieberkühn. Mais elles influencent aussi le

microenvironnement de la crypte.

Il est donc logique d’incriminer un

dysfonctionnement des cellules de Paneth dans la

genèse des maladies inflammatoire intestinales.


55

EUBIOSE ET DYSBIOSE

Les cellules M

Au niveau des plaques de Peyer, les microvillosités

soigneusement accolées les unes aux autres font

place à des digitations plus courtes et bien plus

désordonnées.

En forme de doigts de gants, cela explique le nom

donné aux cellules: M pour microfolds, soit

digitations en anglais.


56

EUBIOSE ET DYSBIOSE

Les cellules M

Leur rôle consistent essentiellement à

échantillonner les antigènes et les micro-

organismes présents dans la lumière

intestinale.

Les jonctions serrées unissent également

les cellules M aux entérocytes avoisinants.


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EUBIOSE ET DYSBIOSE

Les cellules dendritiques

Les cellules dendritiques sont tapies dans les poches intra épithéliales des cellules M et dans la lamina propria.Elles commencent par ouvrir les jonctions serrées unissant les entérocytes et les cellules M. Puis elles envoient des prolongements en forme de dendrites, comme des périscopes, pour échantillonner directement les antigènes dans la lumière intestinale.


58

EUBIOSE ET DYSBIOSE


Les cellules dendritiques fabriquent toute la gamme des protéines constituant la jonction serrée.Elles peuvent donc rétablir des jonctions serrées avec les cellules épithéliales adjacentes, qu’il s’agisse des cellules M ou des entérocytes présents dans la plaque de Peyer.


59

EUBIOSE ET DYSBIOSE


Les cellules dendritiques partagent

donc avec les cellules M la capacité

de constituer une porte d’entrée aux

micro-organismes.


60


61


62


63

EUBIOSE ET DYSBIOSE

Transport contrôlé de substances à travers la

muqueuse intestinale

Le bloc de la muqueuse n’est donc pas une

barrière infranchissable, mais bien plus un filtre

hautement sélectif qui garantit un transport

physiologique contrôlé de particules à travers la

muqueuse intestinale intacte.


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EUBIOSE ET DYSBIOSE

Transport contrôlé de substances à travers la muqueuse intestinale

L’absorption de molécules dans la muqueuse peut emprunter deux voies:

1 Persorption: des particules peuvent pénétrer enpetites quantités dans la paroi intestinale à traversdes « lacunes » de l’épithélium

2 Transport par les cellules M: entre les entérocytes de la muqueuse intestinale, se trouvent des cellules qui ne portent guère sur leur surface des microvillosités, maisdes microplis.


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HYPERPERMEABILITE DU GRELE

Muqueuse du grêle


66


Causes de l’hyperperméabilité du grêle

- perte des jonctions serrées par anomalie des protéines

- micro ischémie intestinale

- déficit en glutamine

- dénutrition

- anomalie des glycocalix

- le déséquilibre de la flore


67

DYSFONCTIONS DU

MICROBIOTE INTESTINAL,

DANS QUELLES AFFECTIONS ?


68

MICI

On entend par MICI la maladie de Crohn (MC),

rectocolite hémorragique (RCH) et toutes les

colites microscopiques

C’est une entité large qui concerne toutes les

maladies inflammatoires cryptogénétiques de

l’intestin en relation avec un mécanisme auto-

immun.


69

LES MICI

Maladie de Crohn MC

Signes digestifs

Diarrhées plus ou moins sanglantes et douleurs abdominales

Signes généraux

Syndrome inflammatoire

Signes extradigestifs

arthrites périphériques


70

LES MICI

Recto-colite hémorragique RCH

Signes digestifsEmissions glairo-sanglantes, ténesmes, épreintes

Signes générauxSyndrome inflammatoire

Signes extradigestifCholangite sclérosante


71

LES MICI

MC localisation

29% : iléale19% : colique50% : iléocolique

Le reste tractus gastro-intestinale supérieur isolé


72

LES MICI

RCH localisation

- limité au rectum

- en dessous de l’angle gauche

- en dessus de l’angle gauche


73

LES MICI


74

LES MICI

MC: marqueurs immunologiques

ASCA: anticorps anti-saccharomyces

cerevisae


75

LES MICI

RCH: marqueurs immunologiques

ANCA: Anticorps anti-cytoplasme

des polynucléaires


76

LES MICI

Autres Anticorps dans le MCInterprétations délicates

- Ac anti-pancréas exocrine

- Ac anti-antigènes microbiens

- Ac anti-glycans

marqueur pronostic: CRP supérieur à 45mg/L


77

LES MICI

Les autres MICI

- Colite indéterminée dissociation

histologique et immunologique

- Colite microscopique sérologie

négative: causes médicamenteuses

fréquentesDr med. Jacques Gardan 2016-2017

78

LES MICI

Le dosage de la

Calprotectine sur les selles

>50 microg/g


79

LES MICI

Les autres étiologies à discuter

- syndrome du colon irritable

- colites infectieuses (salmonelle,yersinia, etc.)

- colites ischémiques, etc.


80

LES MICI

La maladie de Crohn

La maladie de Crohn est une inflammation chronique qui atteint toutes les structures de la paroi intestinale.

Elle est associée à HLA-DR1.

Les facteurs aggravant sont l’abus de nicotine, une période d’allaitement courte et une consommation élevée d’hydrates de carbone raffinés


81

LES MICI

La maladie de Crohn

Au niveau de la physiopathologie, sous l’influence de facteurs bactériens, on note une hyperproduction de d’IL-12 déséquilibrant le système en faveur de Th1


82

LES MICI

La maladie de Crohn

Cette activité Th1 augmentée conduit à une sécrétion accrue de cytokines inflammatoires.La maladie de Crohn correspond en fait à une réponse immunitaire excessive à des antigènes exogènes au niveau de l’intestin (facteurs infectieux bactériens)


83

LES MICI

La maladie de Crohn

En fait, un grand nombre de germes sont « supposés » impliqués dans l’étiologie de la maladie de Crohn.Ceci amène à s’interroger à nouveau sur le rôle de la flore intestinale.


84

LES MICI

Aucun agent bactérien spécifiquement responsable du développement

de ces maladies n’a été décrit.

L’hypothèse d’une dysbiose plus généralisée de l’écosystème semble la

plus probable et les déséquilibres observés au cours des MICI touchent les

groupes majeurs ave une forte diminution des bactéries du phylum

Firmicutes, en particulier le faecalibacterium prausnitzii (bacille Gram

positif, anaérobie strict du groupe Clostridiun leptum, bactérie commensale

productrice de butyrate, isolée du microbiote humain (5%) associée à une

augmentation importante des bactéries du phylum Proteobacteria.

De plus, à cette dysbiose, une certaine souche de E.Coli a été rapporté

comme colonisant la muqueuse de l’iléon terminal d’environ 30 % des

patients atteints de MC. Cette souche aboutit à la sécrétion de cytokines

pro-inflammatoires (IL-12 et IL-6)


85

LES MICI

Au-delà de cette dysbiose de composition, une forte diminution de la diversité microbienne a été observée au cours de MICI

Dans le cadre des MICI, une moindre diversité a été rapporté en ce qui concerne les espèces bactériennes présentes (phylogénétique) mais également le nombre de gènes bactériens de l’écosystème (métagénome)

Jeudi 24 mars 2011 - N° 8930 – Quotimed


86

LES MICI

Une équipe de Chicago a constaté également que les

lipides du lait favorisent la croissance bactérienne d’une

bactérie d’une espèce rare la Bilophila wadswothia

corrélée à des taux élevés de MICI et appendicite.

Cette bactérie se multiplie en présence de souffre que

la bile produit en réponse à une alimentation peu

digeste et riche.

Cette interaction bactério-biliaire altère la barrière

muqueuse et facilite l’infiltration immunitaire

Quotimed - n° 9145 - mercredi 20 juin 2012


87

LES MICI

Dysbiose et inflammation

Le microbiote est soumis à un système de reconnaissance spécifique «sensing bactérien» constitué de récepteurs présents à la surface de l’épithélium (TLR : toll-like receptors)et dans les cellules épithéliales (NOD-like receptors : nucleotide oligomerisation binding domains). Chaque TLR et NOD reconnaît spécifiquement un motif bactérien (commensal ou pathogène) tels que les lipopolysaccharides, peptidoglycanes, flagellines et ADN bactérien. Ce système est un élément essentiel de l’immunité innée. Les MICI se caractérisent par une perte de tolérance immune des bactéries commensales. Cette perte de tolérance peut être aussi induite par le terrain génétique de l’hôte, puisque certains gènes de susceptibilité de la MC (NOD2/CARD15) jouent un rôle dans la reconnaissance bactérienne. Ceci s’exprime via l’activation du NFkB.


88

LES MICI

Protéines NOD et cellules de Paneth

NOD-2 (surtout exprimé dans les cellules de Paneth) est altéré chez les sujets atteints de la maladie de Crohn.La protéine NOD-2 est une protéine cytoplasmique capable d’identifier le peptidoglycan (PGN) trouvé dans les parois cellulaires des bactéries Gram positives


89

LES MICI

Plus simplement,


90

LES MICI


Une fois stimulés par le motif antigénique bactérien, la protéine NOD-2 active la voie du facteur de transcription NFkB


91

LES MICI


La maladie de Crohn résulte donc d’un

dysfonctionnement du système immunitaire inné,

avec retentissement sur l’immunité acquise

entraînant une inflammation anormale face aux

bactéries commensales, caractéristiques de

l’affection

Rev Med suisse 2011 ; 7 : 1696-700


92

LES MICI

Un modèle descriptif

Forum médical Suisse 2012;12(38):724


93

Par extension, toutes les maladies auto-

immunes procèdent d’une participation à

une dysbiose intestinale, même s’il n’existe

pas de corrélation précise encore avec

des entérotypes prédictifs.


94

LES MICI

Une association avec une dysbiose intestinale fongique

Une équipe de l’Assistance publique-Hôpitaux de Paris a révélé un déséquilibre de la flore intestinale fongique associée aux maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), dans des travaux publiés dans Gut.Cette équipe a observé des différences dans la composition du microbiote fongique. La part des Saccharomyces cerevisiae était notamment basse, alors que celle des Candida albicans était plus importante que chez les sujets sains. Dans la maladie de Crohn, la diversité fongique semblait être favorisée au détriment de la flore bactérienne.Dans un communiqué, l’équipe explique «qu’il serait concevable d’envisager de diminuer la charge des champignons pro-inflammatoires»

Gut. 2016 Feb 3


95

LE SII

Corrélation avec le FODMAP,

sans spécificité, autre que les

bactéries de la fermentation


96

LES PATHOLOGIES

NEUROPSYCHIATRIQUES

C’est l’axe de plus en plus étudié entre intestin

et cerveau: le «Gut-Brain Axis»

La communication est bidirectionnelle par des

molécules neuro-actives (par exemple les

peptides microbiens agissant sur les récepteurs

des benzodiazépines), le nerf vague et des

composantes spécifiques ou non du système

immunitaire.


97

LES PATHOLOGIES NEUROPSYCHIATRIQUES

L’humeur:

Le cerveau est lui-même influencé par de très nombreux facteurs, dont le régime alimentaire.Ainsi, une méta-analyse récente a mis en évidence une relation inverse entre régime alimentaire équilibré et dépression. Une autre méta-analyse a montré que plus l’observance à un régime de type méditerranéen était grande, moins la dépression était fréquente. L’impact du régime alimentaire sur l’humeur serait médié par le microbiote intestinal comme cela a été suggéré par des études montrant qu’une antibiothérapie, avec les modifications qu’elle induit au niveau du microbiote, pouvait avoir un impact sur l’humeur, en particulier de personnes prédisposées en raison d’antécédents dépressifs.

S.Dash et coll. The Gut Microbiome and Diet in Psychiatry: Focus on Depression. Curr Opin Psychiatry. 2015; 28(1): 1-6


98

Le parkinson


99

LES PATHOLOGIES

NEUROPSYCHIATRIQUES

Dans les maladies neurodégénératives comme le parkinson vu

précédemment, la maladie d’Alzheimer et même la SEP, le rôle du

microbiote est évoqué. Ce dernier interagit avec le système nerveux, à la

fois autonome et central, par différentes voies, incluant le système

entérique, mais aussi le nerf vague. Des modifications coliques en rapport

avec l’alpha-synucléinopathie sont précoces dans la maladie de Parkinson

et pourraient contribuer, avec le microbiote, à la réponse immunitaire

anormale observée au niveau du tube digestif chez ces patients.

Pour la SEP, le rôle du microbiote serait lié à des modifications des sous-

populations lymphocytaires périphériques, dites régulatrices.

Professeur Patrick Vermersch, CHRI Lille (revue des microbiotes mars 2015)


100

Tribune médicale n°39 25 09 2015


101

L’autisme


102

LE DIABETE ET LE POIDS

Plusieurs pistes:

- un appauvrissement des bactéries productrices de

butyrate (Pr Dusko Ehrlich INRA MétaHIT), serait un

marqueur prédictif du diabète de type 2.

Dans ce cas, la barrière intestinale est affaiblie, ce qui

entraîne une translocation des bactéries intestinales vers

le sang et produit une réaction inflammatoire de

l’organisme. On retrouve dans les bactéries productrices

de butyrate des bactéroides et certaines du genre

Faecalibacterium, entre autre.


103


Lors d’études sur les souris, l’équipe du Pr. Burcelin unité INSERM1048 (Quotimed n°9122 3 mai 2012), des souris maigres diabétiques étaient composées de bactéries majoritairement de type bactéroides à la différence des souris maigres non diabétiques, où le type Fermicutesétait prédominant.En rajoutant des fibres alimentaires au régime riche en graisses, on a observé que les souris traitées avec ces fibres devenaient proches des souris maigres et non diabétiques.

Quotimed - n° 9122 - jeudi 3 mai 2012


104


AKKERMANSIA MUCINIPHILA, La bactérie marqueur du syndrome métabolique

Une abondance de Akkermansia muciniphila et à une bonne diversité du microbiote sont associées un meilleur métabolisme des glucides chez les personnes obèses. L’abondance en Akkermansia Muciniphila était un prédicteur indépendant de l’efficacité de l’intervention diététique.

Cette bactérie appartient à un groupe minoritaire, celui des Verrucomicrobia. Elle dégrade la mucine et se niche dans le mucus des parois intestinales. Son abondance peut varier d’un facteur mille d’un patient à l’autre, sans que l’on ne sache vraiment pourquoi.

Quant à son lien avec l’amélioration du métabolisme du glucose et de la répartition des graisses, il est également trop tôt pour se prononcer. «Ce qui est sur, c’est que cette bactérie n’agit pas toute seule, précise le Pr Clément, elle interagit avec tout un écosystème qu’il va falloir étudier»

Quotimed 23 06 2015


105

OBESITE

Des protéines secrétées par le microbiote intestinal responsables de la sensation de satiété

Escherichia coli sécrète des protéines particulières à satiété. L’étude, menée par l’équipe du Pr Sergueï Fetissov, de l’unité mixte de recherche INSERM/Université de Rouen, a d’abord mis en évidence qu’une infusion de nutriments à une population d’E. coli commensale provoquait sa croissance, qui atteignait un plateau au bout de 20 minutes. Cet intervalle de 20 mn semble coïncider avec le temps nécessaire à une personne pour ressentir la sensation de satiété après un repas. Un effet coupe-faim via l’intestin et le cerveau

Quotimed 25 11 2015


106

MALADIE CARDIO-METABOLIQUE

Concernant la maladie cardio vasculaire, le rôle causal

de la translocation

d’un métabolite produit par les bactéries intestinales, le

triméthylamine-N-oxide (TMAO), dans l’athérosclérose

en modèle murin a été démontré et une corrélation

entre le taux sanguin de TMAO et le risque

cardiovasculaire a été établie chez l’homme. Notre

groupe a montré une corrélation entre l’ADN bactérien

sanguin appartenant au phylum des protéobactéries et

le risque cardiovasculaire.

La revue des microbiotes Pr Jacques Amar, Pr Rémy Burcelin, Michaël Courtney


107

LES ALLERGIES

Des travaux récents confirment le rôle essentiel de la flore bactérienne de l’intestin, le développement, la maturation et la régulation du système immunitaire dans son ensemble: chez les individus présentant des manifestations allergiques, la flore intestinale présentait de nombreuses différences de composition par rapport à celle des individus sains non allergiques. La flore d’enfants avec dermatite atopique contient plus de bactéries de type Clostridium, bactéroïdes et entérobactéries par rapport aux sujets sains contenant davantage de bifidobactéries et de lactobacilles. Par ailleurs, on sait que l’allaitement maternel apporte au nouveau-né une protection certaine vis-à-vis des manifestations allergiques à venir. Or, le lait maternel contient davantage de bifidobactéries dont l’apport chez le nouveau-né protégerait de l’allergie.

Saarinen U.M., Kajoassri M. – Breastfeeding as prophylaxis against atopic disease: prospective follow- up studyuntil 17 years old. Lancet, 1995, 346, 1065-9 Rapporté par le Pr. Coudron Mars 2015


108

Et bien d’autres pathologies

sont à l’étude dans leur

relation avec la dysfonction

du métabolisme du microbiote


109

QU’EST CE QUI MODULE

LE MICROBIOTE ?


110

MODULATIONS PATHOGENES

DU MICROBIOTE

A travers les xénobiotiques:

en particulier, médicaments antibiotiques,

pesticides polluants.

Beaucoup d’études, mais peu de spécificité

Enfin le stress, dont l’action s’exprime à travers

une aggravation de l’hyperperméabilité du

grêle


111

L’ALIMENTATION

Aliments et Entérotypes

- Prévotella

Glucides

Fruits et Légumes

- Bateroides

Protéines

Graisses animales

- Ruminococcus

Alcool

Huile végétale


112

PAR DES INTERVENTIONS A TRAVERS LES AGENTS MODULATEURS DE LA FLORE


113

Qu’est-ce qu’un probiotique ?

Probiotique : préparation microbienne vivante utilisée comme additif ou complément alimentaire, qui a une action bénéfique sur

l’hôte en améliorant la digestion intestinale

Probiotiques = bactéries lactiques = qui synthétisent de l’acide

lactique

Les probiotiques séjournent de 2 à 20 jours dans le tube digestif

La durée dépend de l’environnement de la bactérie (acidité,

présences de nutriments, possibilité d’adhésion et de colonisation


114


115

Qu’est ce qu’un prébiotique ?

Prébiotique : aliment ou ingrédient favorisant le développement de la « bonne » flore intestinale(flore de fermentation)

Critères pour être un prébiotique :

Ne pas être digéré ni absorbé avant d'atteindre le côlon

Être un substrat sélectif d'une ou de plusieurs bactéries commensales (de préférence un faible nombre)

Modifier la composition de la flore colique dans un sens favorable à un meilleur état de santé

Augmenter la croissance et/ou l'activité souches probiotiques

Atténuer la virulence de souches pathogènes

Cibles principales des prébiotiques:

Lactobacilles

Bifidobactéries


116

Les principaux prébiotiques

Inuline

+ Fibre, n>10 – poly glucose-fructose

+ Sources alimentaires : poireaux, asperges, ail, artichaut, oignon

Fructo-oligosaccharides (FOS)

+ 2<n<10 – Glu- Poly fructose

+ Sources alimentaires : chicorée

+ Équilibre flores de putréfaction/fermentation régime riche en prot. animales

trans-Galacto-oligosaccharides (TOS)

+ 2<n<6 – Glu- Poly galactose

+ Sources alimentaires : pomme de terre

Gluco-oligosacch., xylo-oligosacch. (XOS), Isomalto-oligosacch. (IOS)

Oligomères de glucose, xylose, isomaltose

Efficacité prébiotiques mal connue et faible a priori

Sucres-alcool

+ Maltitol, lactitol


117

MODES D’ACTION DES PROBIOTIQUES


118


119


120

Quelques exemples

d’interventions sur le microbiote


121

PROBIOTIQUES ET ANTIBIOTHERAPIES

Diverses souches:

- Lactobacillus acidophillus

- Enterococcus SF 68

- Saccharomyces boulardii, etc.

ont été étudiés en prévention et en curatif.

Article de synthèse effectué par une équipe des hôpitaux du Valais suisse, rapporté par Rev Med Suisse 2012; 8: 1907-10


122

PROBIOTIQUES ET IMMUNOTHERAPIES

DES CANCERS

Le microbiote conditionne le succès de l’immunothérapie des cancers

La flore intestinale joue un rôle dans l’efficacité de l’immunothérapie des

cancers, selon deux exemples publiés dans «Science».

Une équipe française à l’institut Gustave Roussy met en évidence le rôle de

premier plan de la bactérie Bacteroidales pour l’ipilimumab, un anti CTLA-4

utilisé dans le mélanome.

Une équipe de Chicago le fait avec Bifidobacterium pour les anti-PD1 et

PDL1, de plus en plus largement utilisés.

Sciencexpress. 2015 Nov 5


123

PROBIOTIQUES

ET POLYPES PRECANCEREUX

Régression de polypes précancéreux par un lactobacille modifié

Les Américains ont réussi à faire régresser des polypes précancéreux chez la souris, en rééquilibrant la réponse inflammatoire au moyen de l’administration orale d’une souche de Lactobacillus acidophilus probiotique, rendue déficiente en acide lipothéichoïqe

Quotimed n° 9141 - mercredi 13 juin 2012


124

PROBIOTIQUES ET MICI

E.Coli Nissle 1917 a montré une efficacité, autant en prévention des récidives qu’en intervention dans les MICI, comparable à l’acide 5-aminosalicylique.

Tribune médicale N°23 6 juin 2014


125

AUTRES EXEMPLES

Saccharomyces Boulardii

Dans une petite étude universitaire randomisée publiée dans le Journal of

Aids, (janvier 2015), une supplémentation par Saccharomyces Boulardii a

permis de prévenir la translocation bactérienne qui fragilise les patients

infectés par le VIH.

Saccharomyces cerevisiae

Une thérapie par la levure Saccharomyces cerevisiae a montré une effet

calmant sur les douleurs abdominales de patients souffrant de SII, selon les

résultats d’une étude française publiée dans Digestive and Liver Disease

(2001Déc 2)


126

Lactobacillus acidophilus et C. albicans


127


128

LES ACTI-BIOTIQUES


129

LES ACTI-BIOTIQUES

Les Acti-Biotiques sont obtenus par culture d’une souche spécifique de Lactobacillus: la souche LB

La souche LB est une souche naturelle possédant la caractéristique unique de conserver ses propriétés bénéfiques après thermostabilisation, notamment sa capacité d’adhésion aux muqueuses digestives


130

LES ACTI-BIOTIQUES

Propriétés des Acti-Biotiques

Effet cellulaire sur la muqueuse

Effet sur la flore: bifidogène et compétition avec

les gènes pathogènes

Effet sur l’immunité: immunomodulation


131

ET LA TRANSPLANTATION FECALE


132

TRANSPLANTATION

DU MICROBIOTE FECAL

La transplantation de microbiote fécal suscite un intérêt grandissant et a fait l’objet de plusieurs études montrant des résultats encourageants mais qui restent néanmoins limités. Les infections à Clostridium difficile sont parmi les pathologies les plus étudiées, mais aussi d’autres pathologies représentent des cibles potentielles, comme les MICI, les maladies métaboliques, l’obésité, les désordres neuropsychiatriques, etc. L’Agence nationale française de sécurité du médicament et des produits de santé (ANSM) vient de définir le cadre technique et règlementaire des prochains essais cliniques de transplantation de microbiote fécal (disponible sur son site)

Revmed 14 mai 2014


133


134

TRANSPLATATION FECALE

Une méta-analyse décrit les effets secondaires

S’agissant des 226 patients traités pour une MICI, l’effet

secondaire le plus courant était un épisode fébrile (14 cas).

Les auteurs notent six aggravation de la maladie

inflammatoire et 28 effets secondaires gastro-intestinaux tels

que flatulences, vomissements, douleurs abdominales.

Un bilan globalement positif malgré de sérieuses réserves.

Journal of Hospital Infection. 2015 Dec 16


135

PROPOSITIONS DE STRATEGIES

CONCRETES D’INTERVENTION

EN L’ETAT ACTUEL DE NOS

CONNAISSANCES…


136

«TUER LE SERPENT AVEC SON

PROPRE VENIN»

C’est s’approprier l’arme de l’adversaire (la dysbiose) pour lutter

contre lui, en développant un milieu compétiteur.

La défense se transforme en attaque.

A partir des 36 stratagèmes chinois


137

Correction de la dysbiose


138


Muqueuse du grêle


139


Causes de l’hyperperméabilité du grêle

- perte des jonctions serrées par anomalie des protéines

- micro ischémie intestinale

- déficit en glutamine

- dénutrition

- anomalie du glycocalix

- le déséquilibre de la flore


140


Trois conséquences de

l’hyperperméabilité du grêle

- perte de digestion

- perte de l’assimilation

- passage anormal de peptides:

problème immunitaire


141


142


143


144

PRE ET PROBIOTIQUES


145


La Glutamine

A l’état digestif normal, la glutamine est le substrat énergétique qui nourrit la muqueuse intestinale.

La glutamine contrôle et régule la stimulation du développement entérocytaire.

L’action se situe au niveau du facteur de croissance spécifique des cellules épithéliales (EGF ou Epidermal Growth Factor).


146


La Glutamine

En outre, la glutamine favorise le renouvellement normal des entérocytes par l’intermédiaire de IGF-I (InsulinGrowthFactor I)


147


La Glutamine

En cas de stress digestif, la glutamine intervient dans la réponse inflammatoire de l’intestin, en modulant la production de radicaux libres.


148


La Glutamine

Cette modulation concerne

notamment le monoxyde d’azote

(NO) qui est un puissant médiateur

de la réponse inflammatoire


149

NUTRITHERAPIE ET HYPERPERMEABILITE DU GRELE

L’arginine, précurseur de l’oxyde nitrique

- croissance du mucus intestinal

- synthèse du collagène


150


La vitamine A

- micronutriment clé pour combattre l’infection

- les patients souffrant d’une inflammation intestinale

présentent des taux sériques plus faibles en rétinol

- prudence avec les taux: 10.000 UI


151


L’acide folique

- participe au bon fonctionnement de la

muqueuse intestinale

- adjuvant au métabolisme d’enzymes

jéjunales


152


Les antioxydants

On discute le rôle:

- du Sélénium pour la membrane des entérocytes

- de la quercétine: flavonoïde stabilisantdes monocytes de la muqueuse intestinale


153


Le Zinc

- nutriment capital de la muqueuse intestinale

- cofacteur de certaines d’enzymes

- un déficit en Zn isolé peut alterner la croissance, la digestion et l’absorption du grêle du rat, même si pas de déficit protéique associé

- à 15mg


154

Les Acides gras, en particulier,

Omégas 3


155


156

Les Oméga 3

- améliorent le transport actif de la muqueuse intestinale

- renforcent l’intégrité de la jonction des membranes cellulaires

- précurseurs des prostaglandines anti-inflammatoires

- synergies avec les pro biotiques


157

Réponse pathologique

kinase

cytoplasme

noyau

récepteurdu signal

inflammatoire

signalinflammatoire

excessif

NF-kB

IKB

NF-kB

IKBIKK

kinase

PP

phosphorylation

IKBPP

NF-kB activé

ADN

NF-kBARNmARNm

transcriptionCOX 2

PGE2

Inflammation

L’inflammation : mécanismes cellulaires


158

LE CURCUMA


159

LES OLIGOELEMENTS


160


161

LES ANTIOXYDANTS DE L’IMMUNITE

Le Manganèse

Antioxydant (composant de la SOD)

- Synthèse et sécrétion de l’insuline

- Activation enzymatique de neurotransmetteurs

- Participe à la synthèse des anticorps

- Inhibiteur calcique

- Synthèse des hormones thyroïdiennes


162

LES ANTIOXYDANTS DE L’IMMUNITE

Le Molybdène

- Antioxydant

- Formation de l’acide urique

- Action détoxifiante par dégradation des sulfites toxiquesen sulfates

- Métabolisme et dégradation des acides aminés soufrés

- Rôle anticancéreux (composés nitrosés)


163

PROPOSITION D’UN PROTOCOLE

Formule antioxydante:

CuivreManganèse

Sélénium

Zinc

Magnésium

Molybdène


164

CAS SPECIFIQUE DE

L’INTERACTION FLORE/HÔTE

LE SYNDROME METABOLIQUE


165


Une entité clinique et biologique

- un surpoids: en réalité le tour de taille plus spécifique que le BMI

pour les hommes > 85-102

pour les femme > 80-85

- une hypertension: la limite 130/85

- une glycémie: < 1g

- des triglycérides: < 1,5

- un profil lipidique: en particulier ApoB/ApoA1 < 0,65 et Tg /HDL< 3


166


Suite,

En discussion,

- une inflammation de bas grade, mise en évidence sur le profil d’acides

gras, selon le rapport oméga 6/oméga 3 plus précisément

ARA / EPA

- la CRP US


167

SYNDROME METABOLIQUE

Quatre mécanismes physiopathologiques interdépendants:

- La NASH

- L’insulino résistance

- La dysbiose

- Le stress oxydant


168


169


La résistance à l’insuline

En rapport avec la dysfonction des récepteurs à l’insuline, des anomalies

des réactions de phosphorylation et de déphosphorylation, la présence

des cytokines pro-inflammatoires dans un contexte de stress oxydant.

On discute aussi le rôle des Bisphénols A, de la dette en sommeil, de la

sédentarité, des carences en vitamine D, en Mg, en Zn, en Cr et Se.

Rôle aussi de la dysbiose que nous verrons plus tard.

Mise en évidence sur le test HOMA et Quicki


170


171


La NASH (non alcoolique stéatose hépatique),

qui s’inscrit dans le sillage de l’obésité abdominale, est le pivot du syndrome métabolique.Les mécanismes à l’origine de la composante inflammatoire de cette affection sont complexes et restent encore discutés, mais deux facteurs jouent un rôle majeur:

- l’insulino résistance et,- le stress oxydant

Quotidien du Médecin 23.11.2011 entretien de Bichat. Communication du Pr. Jean-Louis Schlienger, service de médecine interne et de nutrition, hôpital de Hautepierre, Strasbourg


172


Trois schémas démonstratifs

Revue Médicale Suisse 06.06.2012 page 1212


173


174


175


176

Revue médicale suisse 07.09.2011 page 1698


177



178

IMPACT DE LA MICROFLORE

Deux mécanismes biologiques:

- L’endotoxémie métabolique: LPS

- Les cytokines pro-inflammatoires


179

L’endotoxémie métabolique LPS

D’une part, la flore intestinale modifiée des obèses – baisse des

populations de Bacteroidetes et Bifidobacterium en même temps

qu’une augmentation des Firmicutes –contribue à cette inflammation.

D’autre part, le régime riche en lipides participe à l’inflammation de bas

grade, en rendant plus perméable la barrière intestinale, comme en

témoigne la présence dans le sang de lipopolysaccharides (LPS).

Cette présence de LPS dans la circulation générale favorise sa liaison

aux macrophages circulants TLR4:

il s’agit du concept d’endotoxémie métabolique induite par les AG

saturés (P Cani et coll).

D’où la cascade pro-inflammatoire.


180

Les Cytokines pro-inflammatoires

Le tissu adipeux produit des cytokines (IL-1β, TNF-α et IL-6), une accumulation de leucocytes dans celui-ci et d’autres organes, l’activation des macrophages dans le foie et la graisse, l’activation de la signalisation des voies pro-inflammatoires dans de multiples organes. Dans l’obésité, ces phénomènes sont corrélés avec le tissu adipeux abdominal (tour de taille) bien plus qu’avec l’IMC.L’accentuation de dépôts du tissu adipeux périviscéral conduit à la sécrétion d’adipokines qui s’accompagnent du recrutement de lymphocytes et macrophages. Ils colonisent ce tissu adipeux et sécrètent à leur tour des cytokines pro-inflammatoires (IL-1 β, TNF-αet IL-6)


181

Le tout est un cercle vicieux dont les

conséquences sont multiples, mais aussi

cérébrales et expliquent le lien entre troubles

métaboliques et dépression.

L’inflammation de bas grade est à considérer

comme un médiateur neuropsychiatrique.


182

Il a été démontré chez la souris obèse qu’en manipulant la flore intestinale par des ingrédients alimentaires appelés «prébiotique» favorisant la prolifération sélective notamment des Bifidobactérium spp, il était possible d’améliorer la perméabilité intestinale détériorée par la flore intestinale et de réduire le passage dans le sang du LPS responsable de l’endotoxémiemétabolique et par voie de conséquence, de diminuer l’inflammation systémique. Cette amélioration de la perméabilité intestinale est due à l’augmentation de la production endogène d’une hormone impliquée dans la croissance et la prolifération de l’épithélium, le glucagon-like peptide 2 (GLP-2)Quoi qu’il en soit, on est autorisé à considérer comme recevable l’hypothèse que la modulation de la flore intestinale par des prébiotiques peut diminuer l’inflammation et les désordres métaboliques liés à l’obésité et au diabète de type 2.


183


184

Le stress oxydant


185

LE STRESS OXYDATIF

Le radical libre

Oxygène 1O2, anion superoxyde O*2

Peroxyde d’hydrogène H2O*2

radical hydroxyl OH*

Production des radicaux libres

- chaîne respiratoire- réactions physiologiques- les espèces oxygénées

+ réaction de Fenton+ réaction d’Haber Weiss


186

LE STRESS OXYDATIF

REACTION D’HABER-WEISS

H2O2 + O2-° OH° + OH- + O2


187

LE STRESS OXYDATIF

REACTION DE FENTON

H2O2 + Fe2+ OH- + OH° + Fe3+


188

LE STRESS OXYDATIF

Le radical libre

Le stress oxydatif

- la balance pro-oxydants – antioxydants

- conséquences du stress oxydant

+ produits de dénaturation des glucides, lipides,

protéines, ADN et facteurs de transcription

+ génération de nouveaux radicaux libres


189

LE STRESS OXYDATIF

Le radical libre

Le stress oxydatif

- les conséquences au niveau cellulaire:

*détérioration des membranes: rancissement

*détérioration extra membranaire: réticulations

*détérioration des acides nucléiques: A.D.N et A.R.N


190

LE STRESS OXYDATIF

Le stress oxydantselon le Pr Jean-Louis Beaudeux Paris


191


192


193

LE STRESS OXYDATIF

Exemples de modèles de stress oxydant

+ Schéma des étapes de la fonction des RLO, enzymes et antioxydants endogènes intervenant dans leur neutralisation

+ Point d’impact des antioxydants endogènes etdes éléments traces au cours de l’activation du NFKB

Dr. Mette M. Berger - CHUV Lausanne


194


195


196

La nutrition des composants du

syndrome métabolique pourrait

s’organiser concrètement autour de

« l’alimentation en 5 chiffres »


197

L’ALIMENTATION EN 5 CHIFFRES

Indice ORAC antioxydant

Indice PRAL équilibre acide-base

Rapport Na/K équilibre acide-base

Rapport oméga 6/ oméga 3 principe crétois

Indice glycémique pouvoir « sucrant » et mieux,

la charge glycémique


198

INDICE ORAC

La capacité antioxydante d'un aliment se mesure à

travers l'indice ORAC (Oxygen Radical Absorbance

Capacity); mesure obtenue à l'aide d'une méthode

standardisée basée sur le principe de l'inhibition de la

fluorescence par les antioxydants contenus dans les

végétaux et qui s'exprime en mole d'équivalents

Trolox par gramme d'aliment


199

L’ORAC EN PRATIQUE


200

INDICE ORAC

Herbes aromatiques, épices et condiments

Ces denrées sont les plus riches en antioxydants, mais ce sont aussi celles

que l'on mange en plus petites quantités. Il est donc peu probable

qu'elles soient la principale source d'antioxydants de notre alimentation.

Il n'empêche: voilà encore une bonne raison de cuisiner en associant les

assaisonnements.

Clous de girofle (314.450), cannelle (267.540), origan séché (200.130),

persil séché (74.350), curry en poudre (48.500), poivre noir (30.140),

chili en poudre (23.635).


201

INDICE ORAC

Fruits à coque

Les fruits à coque allient qualité des acides gras et potentiel

antioxydant. Ils gagneraient à être mieux intégrés dans notre

alimentation... de préférence en prenant part à une collation

ou en étant inclus dans des préparations culinaires, plutôt qu'en

version salée à l'apéritif!

Noix de pécan (17.940), noix (13.540), noisettes (9.645), pistaches

(7.980), amandes (4.450), cacahuètes (3.166), noix de cajou

(2.000), noix du Brésil (1.420), pignons de pin (720).


202

INDICE ORAC

Baies et petits fruits noirs à rouges

Les petits fruits noirs à rouges bénéficient d'un grand potentiel

antioxydant. Malheureusement, de par leur prix et leur

caractère saisonnier, leur fréquence de consommation est

assez faible. L'alternative des surgelés ou des jus vaut la peine

d'être envisagée.

Airelles (9.460), myrtilles (6.220), cassis (5.348), framboises

(4.930), fraises (3.580), cerises (3.360).


203

INDICE ORAC

Féculents/légumineuses

Surprise: on n'y pense que rarement, mais les légumineuses et les

céréales complètes ont un potentiel antioxydant non négligeable.

Et ce, d'autant plus que ce sont des aliments que l'on recommande

en quantités relativement importante. Même les pommes de terre,

surtout si leur chair est jaune, ont un apport en antioxydants appréciable.

Mention spéciale pour les haricots rouges! Haricots rouges séchés

(14.400), pétales de maïs (2.360), pain complet (1.420), pommes de

terre rouges (1.330), pommes de terre blanches (1.080).


204

INDICE ORAC

Fruits jaune-orange-rouge

La coloration orangée de ces fruits témoigne de leur teneur

élevée en caroténoïdes, antioxydants reconnus. Un seul mot

d'ordre: plus ils sont colorés, mieux c'est! Les manger avec la

peau, si celle-ci est très colorée, optimalise la lutte contre le stress

oxydatif.

Pruneaux (8.580), prunes (6.240), pommes rouges (4.275), pommes

golden (2.670), pêches (1.860), oranges (1.810), pamplemousse

(1.550), abricots (1.340), mangue (1.000), ananas (790).


205

INDICE ORAC

Autres fruits

Les autres fruits ne sont pas en reste en raison de leur teneur

en vitamine C et en autres polyphénols, comme les

épicatéchines dans la pomme. A noter que les fruits secs

seront bien entendu plus concentrés en antioxydants.

Dattes séchées (3.895), figues (3.380), raisins secs (3.040),

avocat (1.930), poires vertes (1.910), raisins noirs (1.260),

raisins verts (1.120), kiwis (920), bananes (880).


206

INDICE ORAC

Légumes

Même s'ils sont un peu moins riches en antioxydants que les

denrées ci-dessus, les légumes en général restent une bonne

source de ces composants. D'autant plus que ce sont des aliments

que l'on recommande de consommer en relativement grandes

quantités.

Ne pas négliger la supériorité des légumes de saison!

Asperges (3.017), épinards (2.640), brocoli (1.590), carottes (1.220),

oignons jaunes (1.030), laitue romaine (989), artichaut (790), céleri

(570), tomates (340).


207

INDICE ORAC

Autres denrées

Vin, thé, café, chocolat... Ces denrées ne sont pas

indispensables à l'équilibre alimentaire, mais pourraient bien

donner un sérieux coup de pouce à notre apport en

antioxydants.

Voilà un élément en faveur de leur consommation, en

quantités raisonnables, cela va de soi! Cacao en poudre

(82.000), vin rouge (1.460), vin blanc (330).


208

L’ORAC dans l’assiette

Actuellement, on conseille de consommer:

Entre 400 et 800 g de fruits et légumes chaque jour

La moitié doit être apportée sous forme de crudités


209


Pour obtenir davantage de diversité:

- Associer différents végétaux dans le même plat:salade de différents fruits, salades composées de plusieurs crudités, potages, jardinières de légumes, ratatouille

- Consommer différentes parties des plantes: racines (navet, carotte…), fruit (courgette, pomme…), feuille (salades, épinards…), graines (haricots frais en grains…), car ils présentent des apports nutritionnels complémentaires


210

INDICE ORAC


Pour obtenir davantage de diversité

Utiliser régulièrement ail, oignon, persil, ciboulette crus qui sont d’excellentes source de micronutriments protecteurs. Ils contribuent à nos apports dans la mesure où on les utilise régulièrement et en quantité suffisante


211

NUTRITION

Idéalement,

une assiette « tricolore »


212

L’INDICE PRAL

Définition :

Mise au point par Dr Thomas Remer, de l’Institut de recherche pour la nutrition des enfants à Dortmund en Allemagne

De l’anglais « Potential Renal Acid Load »

= charge acide rénale potentielle d’un aliment

= Effet acidifiant ou alcalinisant sur l’organisme.

Alimentation Paléolithique, « celle que nos gènes a toujours connu » :- 88 mEq/jour

Alimentation moderne = + 48 mEq / jour

(Évaluation Pr Anthony Sebastian / Université de Médecine de Californie San Francisco)


213

L’INDICE PRAL

Dosage/détermination :

Calcul mathématique fonction des coéficients d’absorption

Unité : milliéquivalent (mEq).

PRAL = (protéine × 0,49 + phosphore × 0,037)

– (potassium × 0,021 + magnésium × 0,026 + calcium × 0,013)

Un aliment est-il acidifiant ou alcalinisant?

Alcalinisant : < -0,1

Neutre : = 0

Acidifiant faible : de 0,1 à 4,1

Acidifiant modéré : de 4,2 à 8,7;

Acidifiant fort : > 8,8

=> Le bon équilibre est situé entre -2 et 2


214

Liste des aliments acides

Aliments Indice PRAL

(par portion)


(par portion)

Bière blonde-blanche / Alcools forts 0,0 / 0,1 Cabillaud / crabe / crevette 9,0 / 10,8 / 8,8

Lait écrémé / entier 0,3 / 2,5 Huîtres / moules / raie 4,0 / 1,5 / 11,8

Soda (Coca, Fanta) 0,6 Maquereau / saumon fumé 11,3 / 11,6

Biscuit sec / fourré 3,4 / 0,0 Sardine / Surimi / thon 10,3 / 9,1 / 11,3

Tarte aux fruits 0,9 Crème vanille / chocolat 0,1 / 0,1

Fromage frais écrémé / entier 2,5 / 3,1 Yaourt entier fruits / nature 0,4 / 0,4

Bleu/Brie/Coulommiers/Mozzarella 8,3 / 9,7 / 8,7 / 6,0 Barre céréales 3,3

Camembert/cheddar/comté/Fêta 13,7 / 15,2 / 25,2 / 10,0 Baguette blanche / complète 2,8 / 1,8

Gruyère/mimolette/Parmesan 21,7 / 22,4 / 35,1 Biscotte / Pain grillé suédois 3,9 / 3,3

Raclette/Roquefort 16,8 / 13,9 Pain au chocolat / croissant 2,5 / 3,8

Amande / cacahuète / noix 2,2 / 7,6 / 6,7 Pâtes / riz blanc / riz complet 3,0 / 2,2 / 2,1

Lentilles 2,6 Semoule 6,3

Matières grasses (huiles / margarine) 0,0 / 0,7 Cassoulet / couscous 1,1 / 1,9

Œuf (Entier / Jaune / blanc) 13,5 / 26,5 / 2,1 Croque Monsieur / Lasagnes 8,2 / 1,0

Agneau / bœuf / dindonneau 9,1 / 7,8 / 10,7 Paëlla / Ravioli / pizza 3,5 / 0,1 / 4,0

Porc / poulet / Saucisse de Frankfort 7,1 / 8,7 / 6,7

Liste des aliments alcalinisantsAliments Indice PRAL

(par portion)


(par portion)

Bière brune / Champagne -0,1 / -1,1 Compote abricot / pomme -3,7 /-1,3

Vin blanc / rouge / rosé -1,1 / -1,7 / -2,4 Abricot sec / raisin sec -26,6 / -13,9

Badoit / Evian / Perrier -1,1 / -0,1 / -0,1 Abricot / ananas / banane -6,3 / -2,9 / -6,0

Saint Yorre / Vichy célestin -6,6 / -4,5 Figue / framboise / kiwi -4,3 / -2,7 / -5,1

Eau du robinet 0,0 Melon / olive / orange -7,3 / -1,8 / -3,8

Jus ananas / carotte / citron -3,2 / -3,9 / -3,7 Pêche / poire / pomme -3,4 / -2,0 / -2,0

Jus de pomme / raisin / orange -2,2 / 2,6 / 3,4 Raisin blanc ou rouge -3,5

Café - 1,4 Choucroute -0,5

Thé nature - 0,3

Lait chocolaté / Lait demi-écrémé -0,6 / -0,1

Glace / sorbet -0,3 / -0,3

Asperge / aubergine / brocoli -2,2 / -3,7 / -2,2

Choux fleur / concombre / épinard -1,8 / -1,7 / -7,5

Laitue / oignon / poivron / tomate -1,8 / -1,4 / -3,0 / -4,3

Sources : Base Afssa/Ciqual 1995

http://www.lanutrition.fr/aliments-index.php

RAPPORT Na/K EQUILIBRE ACIDE – BASE

idéalement entre 0,1 et 0,7 ok si <2


217

LE RAPPORT DU CRÉTOIS

Omégas 6 / Oméga 3


218


219

RAPPORT OMEGA 6/OMEGA 3Dr med. Jacques Gardan 2016-2017

220

LA QUESTION DES OMEGAS 6

Remplacer les acides gras saturés par de l’acide linoléique , une fausse bonne recommandation?

On sait que la consommation des oméga-6, acides gras polyinsaturés,

fait partie des recommandations de prévention secondaire des maladies

coronariennes.

Le principal représentant des oméga-6 est l’acide linoléique, présent

dans les huiles végétales (tournesol, pépins de raisin, maïs, soja, etc.) et surtout dans les huiles de carthame (79 %)

Il semble finalement que remplacer les acides gras saturés par cet

oméga-6 ait des effets néfastes sur la santé: la mortalité globale

augmente, ainsi que les problèmes cardiovasculaires


221

INDICE GYLCEMIQUE

« POUVOIR SUCRANT »


222


223


224


225

CHARGE GLYCÉMIQUE


226

LA CHARGE GLYCEMIQUE

En réalité l’index glycémique n’est pas vraiment

représentatif du pouvoir sucrant (index

insulinique)d’un aliment, car lorsque les glucides

sont consommés avec d’autres classes d’aliments

(lipides, fibres, protides), leur index glycémique

baisse de façon parfois considérable.


227

CHARGE GLYCEMIQUE

Face à ce constat, la notion de charge glycémique (CG) a été élaborée. Celle-ci se définit pour chaque aliment comme la réduction au centième du produit de son index glycémique par la quantité de glucides contenu dans une portion de 100 grammes. On parle dès lors de charge glycémique: - faible lorsqu’elle est inférieure ou égale à 10, - modérée lorsqu’elle est comprise entre 10,1 et 20 - forte quand elle est supérieure à 20.

Par exemple, pour la carotte dont la quantité de glucides pour 100g est de 7, sa charge glycémique varie selon qu’elle est consommée crue ou cuite, la cuisson augmentant significativement son IG. Ainsi, la charge glycémique crue est de 1,12 tandis que la charge glycémique cuite sera de 3,29. La carotte est donc un aliment à consommer sans trop de modération contrairement à ce qui était conseillé jusque là!Il est aujourd’hui convenu qu’un régime alimentaire ne devrait pas dépasser une charge glycémique totale journalière de 120…


228


229

NUTRITION

Ainsi l’alimentation en 5 chiffres, en corrigeant les

facteurs étiologiques de la NASH, du stress oxydant et

de la résistance à l’insuline, répond aux paramètres

nutritionnels favorisant le syndrome métabolique qui se

fonde sur les 7 erreurs principales de l’alimentation

occidentale (la sédentarité étant le facteur non

nutritionnel)


230

NUTRITION

Le microbiote, condition du succès d’un régime

Une étude montre que la consommation de pain à base d’orge permet

d’améliorer le contrôle glycémique, mais seulement chez une partie de la

population de l’étude.

Ceux ayant un rapport des concentrations des bactéries Prevotella copri

par rapport à Baceroides plus élevé et une meilleure réponse au régime

que les autres.

La présence de P.copri est en effet associée à une fermentation accrue

des polysaccharides complexes. Une amélioration de la tolérance au

glucose y serait aussi associée.

Cell Metab.2015; 22 (6): 971-982


231

LA MICRONUTRITION DU



232

LA MICRONUTRITION

DU SYNDROME METABOLIQUE

Les fondamentaux…


233

LES PRO-PRE-ACTI-BIOTIQUES…

Pour participer à la correction

de la dysbiose, cofacteur de

l’inflammation de bas grade …


234



235


236

UN ANTIOXYDANT

Ce serait l’acide alpha-lipoïque

Appelé aussi l’acide thioctique. Présent dans l’alimentation ou synthétisé

à partir de la cystéine, son action principale est antioxydante, mais plus

spécifiquement, sur la glycation (sur les premières phases de cette réaction) qui est le dommage des protéines lié à l’excès de sucre.

A dose moyenne de 600mg/j utilisé depuis de nombreuses années en

Allemagne.

Hagen TM, Liu J, Lykkesfeldt J t al.Feeding acetyl-L- carnitine and lipoic acide to old rats significantly improves metabolic

function while decreasing oxidative stress.

Proc Natl Acad Sci USA 2002; 99: 1870-5


237

LA GLYCATION ET LES CONSEQUENCES OXYDATIVES


238


Les protéines glyquées, appelées aussi produits de

glycation avancée ou AGE (Advenced Glycation

Endproducts), jouent un rôle important dans le

déterminisme des lésions cellulaires et tissulaires du

diabète.

De plus, les produits ainsi formés ne peuvent plus

être détruits, ni libérés de la cellule.


239


La glycation est un phénomène méconnu du vieillissement.


240


Biochimie de la glycation

Le point clé est que si les deux premiers stades se stabilisent à un plateau et sont potentiellement réversibles selon la glycémie, le troisième stade est irréversible, progresse quelque soit le niveau ambiant de glycémie et génère des composés réactifs responsables du vieillissement tissulaire.


241

UN OLIGOELEMENT

Ce serait le Chrome

En effet une insuffisance en Chrome peut entraîner une

insulinémie élevée, car il joue un rôle clé dans l’homéostasie

glucidique, en particulier amélioration de l’insuline sur ses

récepteurs, augmentation du nombre des récepteurs à

l’insuline et enfin optimisation de la sensibilité à l’insuline

Roussel AM, Anderson RA. Chrome et sensibilité à l’insuline. Médecvine et Nutrition 2005. 41 (1): 21-8


242

UN MINERAL

Le Magnésium, en particulier le glycérophosphate

de magnésium, pour son assimilation et sa

tolérance intestinale.

Les actions du Magnésium sont multiples, tant au

niveau de la paroi des vaisseaux qu’au niveau

enzymatique


243

UN ACIDE AMINE

La Taurine, antioxydant majeur par la fonction thiol

- transporteur d’ions, en particulier Mg, en synergie

avec la vitamine B6

- stabilisateur membranaire (structure, perméabilité)

- hypoglycémiant


244

UNE VITAMINE

La vitamine D

Des études récentes montrent qu’une supplémentation

adéquate en vit D, tant sur la durée que sur la quantité,

peut améliorer la sensibilité à l’insuline sur les patients

obèses et aussi sur la satiété

Bibliographie en annexe


245

UN ACIDE GRAS

Les Oméga 3

Plusieurs études montrent une association inverse entre les oméga 3 et la CRP-US, un des principaux paramètres inflammatoires.

Bibliographie en annexe


246

UN ANTIOXYDANT SYTEMIQUE

Le Curcuma

L’alliance de la tradition et de la modernité

par son action sur l’inflammation de bas

grade à travers la modulation du NFkB.


247

UN ANTIOXYDANT SYTEMIQUE

Un peu plus de Curcuma dans le régime méditerranéen?

Intérêt sur la glycémie à jeun, l’intolérance au glucose et la résistance à l’insuline. Etude en double aveugle avec un suivi à 3,6 et 9 mois, de supplémentation en Curcumine 500 mg.

Revue Médicale Suisse 17 avril 2013Chuengsamarn S.Curcumin extract for prevention of type 2 diabetes. Diabetes Care 2012; 35: 2121-7


248

Réponse pathologique

kinase

cytoplasme

noyau

récepteurdu signal

inflammatoire

signalinflammatoire

excessif

NF-kB

IKB

NF-kB

IKBIKK

kinase

PP

phosphorylation

IKBPP

NF-kB activé

ADN

NF-kBARNmARNm

transcriptionCOX 2

PGE2

Inflammation

L’inflammation : mécanismes cellulaires


249

UNE BIOTHERAPIE

Le Romarin, Rosmarinus off.


250

STRATEGIES COMPLEMENTAIRES

On a mis en évidence l’importance des

Polyphénols comme antioxydants, il en existe

de nombreux, de la cannelle, du canneberge,

du raisin pépin, du thé vert, de la myrtille, etc.

Et bien sur, la correction du mode de vie avec

la grande importance de l’activité physique


251

Bibliographie complémentaire du

syndrome métabolique


252


253


254

POUR CONCLURE,

Il existe d’autres microbiotes:

- le microbiote pulmonaire:

- le microbiote sinusienon a découvert (quotimed 18 09 2012 ) qu’un facteur de chronicité sinusien pourrait être causé par la croissance du Coryneacterium tub. lors d’un appauvrissement du microbiote sinusien. On a identifié une espèce bactérienne potentiellement protectrice ( en instillation) le lactobacillus Sakei

- le microbiote vaginalIntérêt des lactobacilles sécréteurs d’acide lactique dextrogyre: Lactobacillus cripsatus, Lactobacillus gasseri et Lactobacillus jensenii…


255


256

Le propre du savoir n’est ni de voir ni de démontrer,

mais d’interpréter

Michel Foucault

www.cabinet.gardan.ch


257

LE MICROBIOTE: UN MONDE QUI SE DEVOILE

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