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BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVALBIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 1

Stage des fondements chirurgicaux

Emmanuelle Paquette Raynard

8 septembre 2017

La recherche médicale sur le web


Objectifs de l’atelier

• Apprendre à faire une recherche structurée dans les bases de données bibliographiques.

• Apprendre à utiliser correctement la syntaxe et à exploiter au maximum le thésaurus à l’intérieur de la base de

données Pubmed

Compétences travaillées :

Objectifs spécifiques:

À la fin de cet atelier, le résident sera en mesure de :

» explorer les ressources de la Bibliothèque de l’Université Laval ;

» établir sa stratégie de recherche (plan de concept) ;

» effectuer des recherches dans la base de données PubMed (MEDLINE) ;

» connaître les avantages d’utiliser un logiciel bibliographique pour créer une base de données de ses références et faciliter le

processus de rédaction.


Explorer par discipline : Médecine

Vous trouverez les ressources propres à votre discipline telles que:

• les bases de données spécialisées pour retrouver des articles en médecine;

• les ensembles de livres électroniques;

• les atlas, dictionnaires et encyclopédies par spécialités.

http://bibl.ulaval.ca/web/medecine

http://bibl.ulaval.ca/web/medecine


Accès à distance aux ressources électroniques

Modalités et conditions d'accès

• Une fois la session activée, vous

pouvez consulter toutes les

ressources électroniques

désirées.

• La session expire à la fermeture

du navigateur Web ou après 60

minutes d'inactivité.


Interroger une base de données

L’interrogation d’une base

de données se fait à l’aide de

deux types de méthodes:

Vocabulaire libre (mots-clés)

Vocabulaire contrôlé

(thésaurus ou sujet)


Vocabulaire libre (mots-clés)


La recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Généralités

Le vocabulaire libre est la méthode de recherche la plus utilisée.

Utilisation de ses propres mots afin de repérer des documents sur le sujet d’intérêt.

Le choix et l’orthographe du mot ont une incidence majeure sur les résultats de recherche.

Les champs à privilégier dans la recherche:• Titre et résumé PubMed -> [Title/Abstract]


Recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Vos termes de recherche

Les termes utilisés par l’auteur

OlysioLes articles qui parlent d’Olysio

directement

Pas nécessairement ceux qui parlent de Simeprevir

ou de Galexos

?

Exemple : Je m'intéresse aux traitements de l’hépatite C chronique chez l’adulte


La recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Astuce: utilisation de variantes orthographiques et de synonymes pour chacun des

concepts afin de maximiser le repérage.

Synonymes :

Child, children, childhood, pediatric, pediatrics, etc.

Handicapped, Disabled Person, Persons with Disabilities, Person withDisability, Physically Challenged, etc.Un handicap précis :Amputees, Mentally Ill, Blind, Visually Impaired Persons, Deaf, HearingImpaired, etc.

Exemple: Je cherche des articles qui portent sur les enfants handicapés.


Identifier les termes de recherche – Perles de

citation

• [PubMed – indexed for MEDLINE] = l’article a été indexé dans Medline. Décortiquez bien la liste des MeSH, le titre

et le résumé afin de repérer les termes qui pourraient être utiles à votre recherche.

• [PubMed – in process] = l’article n’a pas été indexé dans Medline. Décortiquez la liste des mots clés fournis par

l’auteur afin de repérer ceux qui pourraient être utiles à votre recherche.

Lorsque vous avez repéré un article pertinent à votre sujet, utilisez la méthode des « perles

de citation » afin de repérer des articles similaires

Vous pouvez aussi explorer la section « Titles with

your search terms » de la colonne de droite dans la

page des résultats de PubMed pour trouver des

articles pertinents.


Outils – vocabulaire pour Titre & Résumé

• HeTOP - Portail Terminologique de Santé (Santé, CiSMeF)

• Grand dictionnaire terminologique (Général, OQLF)

• TERMIUM Plus (Général, Gouvernement du Canada)

Dictionnaires

• Notes de cours

• Manuels

• Articles scientifiques

• Recherches Cochrane

Autre documentation

Vous

http://www.hetop.eu/hetop/

http://www.granddictionnaire.com/

http://www.btb.termiumplus.gc.ca/tpv2alpha/alpha-fra.html?lang=fra


Exercice – HeTOP

Utilisez le HeTOP - Portail Terminologique de Santé du CISMeF.

Trouvez cinq synonymes anglophones pour la maladie Diabète de type 1.

autoimmune diabetes

brittle diabetes mellitus

insulin dependent diabetes mellitus 1

juvenile onset diabetes

sudden-onset diabetes mellitus


Les symbolesPour gagner du temps et de la précision

Troncature : placée à la fin d’un terme, elle permet de repérer toutes les terminaisons possibles de ce terme.

Educat* permet de repêcher educate, education, educated, educational, etc.

Guillemets: entourent une phrase, une expression ou une série de mots. Ils permettent de repérer une série de mots placée dans le même ordre d’apparition.

"Heart arrest" ou "Cardiac arrest" permet de repêcher ces mots écrits exactement de cette façon dans le texte.

$ * ? | +

*""

Voir le tableau Astuces et syntaxe – Bases de données en sciences de la santé

http://bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/medecine/astuces_synthaxe_bd_sante.pdf


Chercher le vocabulaire libre dans Pubmed


Vocabulaire

contrôlé (thésaurus ou sujet)


Méthode de recherche faite à partir de termes normalisés.

Le langage propre utilisé par une base de données pour décrire le contenu des articles scientifiques qu’elle indexe.

Pour utiliser cette méthode, on doit d’abord valider notre terme dans le dictionnaire de la base de données, appelé « thésaurus ».

• Termes normalisés classés et reliés entre eux, du terme le plus général au terme le plus spécifique

• Une seule appellation possible et une seule orthographe à utiliser pour l’ensemble des variantes orthographiques

Le champ à privilégier dans les bases de données sont:

PubMed (Medline) > MeSH (Medical

Subject Headings)

ex: "diabetes mellitus, type 1"[Mesh]

Embase > Emtree

ex: 'diabetes mellitus'/exp

PsycINFO > Thesaurus

ex: Index Terms: {Diabetes

Mellitus}

CINAHL > Descripteurs

Ex: (MH "Diabetes

Mellitus, Type 1")

Recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus ou sujet)

Généralités


Thésaurus en santé

La plupart des bases de données disciplinaires en santé publient un thésaurus et souvent

celui-ci est intégré au logiciel de la base.

Medline

MeSH (MedicalSubject

Headings)

Embase

Emtree

PsycINFO

Thesaurus

ERIC

Thesaurus (descripteurs)

CINAHL

Descripteurs CINAHL

Cochrane

MeSH (même que Medline)


Recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus ou sujet)

Avantage: supprime l'ambiguïté du langage naturel (synonymes / variantes orthographiques)

Breast neoplasm

Breast cancer

Mammaryneoplasms

Mammarycarcinoma

Permet de regrouper et de repérer tous les documents sur un sujet donné


Recherche MeSH - PubMed


Recherche MeSH


Définition du MeSH

Subdivisions

Transformation du MeSH en concept majeur [MAJR]

Empêcher l’explosion automatique du MeSH


Concepts plus larges

Synonymes et variantes orthographiques rejetés

Suggestions

Concepts spécifiques Recherchés automatiquement dans PubMed. Pour l'empêcher, sélectionnerDo not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy.


Sélectionner les options voulues et cliquer sur Add to search builder. Puis cliquer sur Search PubMed pour lancer la recherche.


Pour raffiner rapidement les résultats de recherche (Langue, âge, date de publication, etc.)

Les filtres sont des termes du vocabulaire contrôlé (MeSH).


Pour combiner des recherches, vous devez utiliser l’historique de recherche qui se trouve dans Advanced.


Exercice – MeSH

Vous vous intéressez à l’aspect génétique du syndrome de

Lynch II. Empêchez l’explosion du concept. Combien de résultats obtenez-vous?

"Lynch Syndrome II/genetics"[Mesh:noexp] =

15

Combien trouvez-vous d’articles dont le sujet majeur est

l’utilisation d’antipsychotiquespour les personnes de 65 ans et

plus atteintes d’alzheimer?

"antipsychotic agents"[Majr] AND "alzheimerDisease"[Majr]

Filters: Aged: 65+ years = 212 résultats

Vous vous intéressez à la formation continue chez les

chirurgiens. Combien de résultats obtenez-vous?

"Surgeons"[Mesh] AND "Education,

Continuing"[Mesh] = 39


Les filtres cliniques | Clinical Queries

Recherche effectuée avec un filtre créé par PubMed. Pour le diagnostic, la thérapeutique, le pronostic et

l’étiologie. Très utile pour les questions cliniques.


Les filtres cliniques | Clinical Queries

Différents types de filtres de recherche.

Recherche seulement en vocabulaire libre. Pas de MeSH.


Les filtres cliniques |

Clinical Queries

Selon la catégorie et la spécificité choisies, une de ces requêtes est ajoutée à

la recherche.

Sensitive/broad : recherche large, trouve les articles pertinents et les

articles connexes. Moins précis, mais plus de résultats.

Specific/narrow : recherche étroite, trouve les articles pertinents

seulement. Plus précis, mais moins de résultats.


Apprendre à faire une recherche structurée à l’aide d’un plan de concept


Élaboration d’une stratégie de recherche

Formuler son sujet de recherche

Identifier les principaux concepts

Trouver le vocabulaire approprié

Formuler des équations de

recherche (opérateurs booléens)

Analyser et évaluer les

résultats de la recherche


1. Formuler son sujet de recherche

PICO

• Patient (population): patients atteints de fibromyalgie

• Intervention : exercices aquatiques

• Comparateur : aucun

• Outcomes : avantages et inconvénients

Cerner et délimiter son sujet en l’exprimant sous la forme d’un énoncé ou d’un

PICO.

Efficacité des exercices aquatiques chez les patients atteints de fibromyalgie.


2. Identifier les principaux concepts

Peu importe la base de données, une recherche efficace requiert un choix pertinent des concepts.

Concept 1

• Exercices aquatiques

Concept 2

• Fibromyalgie

Efficacité des exercices aquatiques chez les patients atteints de fibromyalgie.


3. Trouver le vocabulaire approprié

Exercices aquatiques

• aquatic exercise* [Title/Abstract]

• water exercise* [Title/Abstract]

• pool exercise* [Title/Abstract]

• aquatic therap* [Title/Abstract]

• water therap* [Title/Abstract]

• pool therap* [Title/Abstract]

• swimming [Title/Abstract]

• swimming [MeSH Terms]

Fibromyalgie

• fibromyalgia* [Title/Abstract]

• fibrositi* [Title/Abstract]

• fibromyalgia [MeSH Terms]



Thésaurus

Outils – Notices d’articles pertinentsVocabulaire libre

RésuméTitre

Stratégie de recherche efficace


4. Formuler des équations de recherche en utilisant

les opérateurs booléensPour lier les différents concepts ou les différents champs

AND (ET)

Limite la recherche à

l’intersection des concepts

OR (OU)Unit les différents concepts

NOT(SAUF)

Exclut un ou plusieurs concepts

non souhaités

Précise la recherche, mais

ATTENTION

Exercices

aquatiquesFibromyalgie

ExercicesActivité

physique

AdultesPersonnes

âgées


Formuler des équations de recherche

ET/AND

Concept 1 Équation de recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Équation de recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus)

OU / OR

Concept 2Équation de recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Équation de recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus)

OU / OR

Vocabulaire libreZones de recherche Title Abstract Keywords (de l’auteur)


Zone de recherche Sujet

(Spécifique à une base de données)


Équations de recherche dans PubMedÀ partir de votre plan de concept, vous pouvez formuler plusieurs équations simples de

recherche, puis les combiner à l’aide de l’historique de recherche.

Combinaison des

deux concepts

7. 3 AND 6 =

19 résultats

1. Search (((aquatic[Title/Abstract] OR water[Title/Abstract] OR pool[Title/Abstract]) AND

(exercise*[Title/Abstract] OR therapy[Title/Abstract] OR therapies[Title/Abstract])) OR

swimming[Title/Abstract]) = 23 567 résultats

2. Search swimming[MeSH Terms] = 21 760 résultats

Concept 1Exercices aquatiques

3. 1 OR 2 = 36 151 résultats

5. Search fibromyalgia[MeSH Terms]= 7 367 résultats

Concept 2Fibromyalgie

4. Search (Fibromyalgia*[Title/Abstract] OR fibrositi*[Title/Abstract]) = 9 150 résultats

6. 4 OR 5 = 10 104 résultats


5. Évaluer les résultats de la recherche

Vous obtenez trop de résultats

• Limitation de la recherche par date de publication, par langue, par type de documents, etc.

• Ajout de termes spécifiques en utilisant l’opérateur booléen AND (et).

Vous obtenez trop peu de résultats

• Augmentation de la portée de la recherche en utilisant des termes plus généraux.

• Ajout de mots-clés (synonymes) en utilisant l’opérateur booléen OR (ou).


Créer un compte personnel My NCBI

• Gratuit ;

• permet de sauvegarder vos recherches pendant 6 mois ;

• possibilité de recevoir des alertes par courriel mentionnant

les nouveaux articles publiés sur votre sujet (alertes

quotidiennes, hebdomadaires ou mensuelles).

Principaux avantages :


EndNote – Pour

gérer efficacement

ses références


BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 45

• C’est un logiciel de gestion de références bibliographiques

qui permet de créer des bases de données personnelles de

références.

• Le Comité des normes informatiques de l'Université Laval a

choisi de recommander et de supporter EndNote.EndNote

X8

Bases de données

Catalogues de bibliothèques

EndNote Online

Bibliographie

Citation

Documents

Vous procurer le logiciel• EndNote X8 (ordinateur) > 30$ à la DTI• EndNote Online > Gratuit par Web of science

https://commerceweb.ulaval.ca/shopping/licences/Index.view

https://acces.bibl.ulaval.ca/login?url=http://webofknowledge.com/WOS


Exemples des possibilités d’EndNote

Insertion de citations dans un texte Création automatique d’une liste bibliographique


Créer une bibliothèque personnelle

• Lors de la première utilisation d’EndNote, il faut donner un

nom à la bibliothèque.

• EndNote créera deux fichiers indissociables : .enl et .data

• Attention! Quand on souhaite déplacer sa bibliothèque, il

faut déplacer ces deux fichiers ensemble.


L’interface

Liste des références

Prévisualisation de la référence sélectionnée,

selon le style bibliographique choisi

Gro

up

es

: po

ur

clas

ser

ses

réfé

ren

ces

PDF de la référence sélectionnée

Liste de styles bibliographiques

Mo

des

de

visu

alis

atio

n e

t d

e r

ech

erch

e


Importation directe sélective avec PubMed

Si vous ne voulez exporter que quelques

références précises, sélectionnez-les avant de cliquer sur Send to.


Importation massive avec PubMed

Exporte toutes les références trouvées (dans cet exemple, 97 607

références).

Cliquez sur le fichier créé pour l’ouvrir

dans EndNote.


Obtenir du soutien sur EndNote /Aller plus loin

http://bibl.ulaval.ca/services/logiciel-endnote

http://bibl.ulaval.ca/services/logiciel-endnote


Obtenir de l’aide

Bibliothécaire-conseil

Emmanuelle Paquette Raynard, [email protected]

Questions ?

Service de clavardage

Offert aux heures d'ouverture du service d'aide à la recherche(Techniciennes en documentation)

mailto:[email protected]

http://www.bibl.ulaval.ca/nous-joindre

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