Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de...

48
Jacques Pécréaux

Transcript of Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de...

Page 1: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Jacques Pécréaux

Page 2: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

(Thomas M. Terry)

Page 3: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 4: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Rappels sur la physique des membranes

Reconnaissance de contours

Résultats

Validation sur les vésicules passives

Résultat membranes actives

Conclusion

Page 5: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 6: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

222 21 1

2 2SH d u u

r

Canham, P. B. (1970). J. Theor. Biol. 26: 61-81, Helfrich, W. (1973). Z. Naturforsch. C 28: 693-703.

x

y

zL= q-1

( , )u r t

Page 7: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

22 4

( ) Bk Tu

q q

q

Helfrich, W. et al. (1984). Il Nuovo Cimento 3D(1): 137-151.

module de rigidité de courbure tension

Page 8: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

222 2 2 20

1 12 ( )

2 2 2SH d u u u

r

Ramaswamy, S. et al. (2000). Physical Review Letters 84(15): 3494-3497.

~~),(),( 42

qq

kTtqutqu

e

e

~~2

Page 9: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

)

~~)(~(~~),(),( 22

22

42

qq

wPwPkT

qq

kTtqutqu

eaa

e

wP

wPwP

a

aa

e

~

~~2

w

wwFP

w

wwFP

aa

aa

2

222

22

)

~~)(~(~~),(),( 22

22

42

qq

wPwPkT

qq

kTtqutqu

eaa

e

wP

wPwP

a

aa

e

~

~~2

w

wwFP

w

wwFP

aa

aa

2

222

22

wP

wPwP

a

aa

e

~

~~2

w

wwFP

w

wwFP

aa

aa

2

222

22

Manneville, J.-B. et al. (2001). Physical Review E 64(2): 021908.

Prost, J. et al. Europhysics Letters 33(4): 321-326.

Page 10: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 11: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Bicouche lipidique (EPC)

Vésicule Géante10-50 m

BR

Rouge passive

Jaune active

H+

Luecke, H. et al. (1999). Science 286: 255-260.

Pompe à protons photoactivable (abs. max = 570 nm)Pompage de H+ (cycle 5ms)

vert pompage

rouge pas de pompage

Page 12: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Rv

2Rp

L

P

DIC

Excès d’aire du aux fluctuations

A

Ap

A

AA p

1

2

3

4

5

2 3 4 5

(%)

active

passive

ln

P

vPvP

R

RRRRL

S

S

2

// 32

PRP

2 1 RP / Rv

Activité Activité Amplification des fluctuations Amplification des fluctuations

ln8kTeff

TT eff 85.1:exp

~1~~

22wPwP

T

T aae

eff

27,1: T

Ttheor

eff

ln8kTeff

ln8kTeff

TT eff 85.1:exp

Manneville, J.-B. et al. (2001). Physical Review E 64(2): 021908.

Pa estimé ~ 4×10-20 J

Page 13: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Mesure de la température effective seulement

Pertubent le système

Page 14: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

10-9 N/m

16 2

20

1.5 10 m

4.10 J.maP

10-8

10-7

10-6

10-5

7

16 2

10 N/m

1.5 10 m

Pa

4×10-20 J.m

3×10-20

2×10-20

1×10-20

0.5×10-20

1.5×1016 m-2

7.5×1016

1.5×1015

7.5×1014

20

7

4.10 J.m

10 N/m

aP

1.5×1014

Page 15: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Mesure d’un spectre de fluctuations jusqu’à grands vecteurs d’onde

Qui s’applique loin de la forme sphérique

Résultats interprétables avec une théorie en membrane plane

Page 16: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 17: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Mitov, M. D. et al. (1992). Advances in Supramolecular Chemistry. Gokel. Greenwich (Connecticut), Jai Press. 2: 93-139.

Permet d’accéder à un spectre de fluctuationAnalyse assez fine Ne s’applique qu’aux objets sphériquesNécessite une théorie en harmoniques sphériques

Page 18: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Döbereiner, H.-G. et al. (1997). Physical Review E 55: 4458-4474.

Wilson, T. et al. (1981). Optik 59(1): 19-23.

Permet la reconnaissance de formes non sphériques, et leur analyse

Limitée aux petits vecteurs d’onde, pas réellement de mesure du spectre

Page 19: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 20: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

LampeXénon

Condenseur à immersion,NA=1.4

Echantillon entre 2 lamelles

Filtre jaune ou Rouge

Objectif à immersion 100x, NA=1.4

Diaphragme

Microscope

Camera digitale

Miroir

Moniteur

Carte d’acquisition

Ordinateur

Pécréaux, J. et al. (2004). European Physical Journal E (accepted).

Page 21: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Carted’acquisition

Acquisition de 2000 à 5000 images à 30 im/s

Rouge Jaune

Reconnaissancede Contours(temps réel)

Acquisition d’images

Retrait desContours non clos

Stockage des contours

Page 22: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 23: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Retrait des contours depérimètres trop éloignés

du périmètre moyen

Projection surles séries de

FourierStockage des coefficients de Fourier au cours du temps

i( ) ( )e nn

n

r c t

Stockage des contours

Mode 0 Mode 1 Mode 2 Mode 3 Mode 4Fluctuations des coefficients de Fourier et

fonctions d’autocorrélation temporelle des modes

Sélectiondes contours

Page 24: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

10-22

10-21

10-20

10-19

2.01.51.00.5x10

6

2( , 0)xu q y

xq

Page 25: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 26: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Passage des séries de Fourier aux transformées de Fourier

22 2( , 0, )2x n n

x

Ru q y t c c

nq

R

Page 27: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

22 4

( ) Bk Tu

q q

q

Helfrich, W. and R.-M. Servuss (1984). Il Nuovo Cimento 3D(1): 137-151.

Pour une membrane plane à 3D

2

2

1 1( , 0)

2B

xx

x

k Tu q y

qq

Pour la coupe d’uneMembrane plane

Page 28: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

2( )2

2

( )1( , 0, ) ( ) e 1

4 ( )m qmB

x m ym

qk Tu q y t q dq

q q

0

8ms 16ms 33ms

1 2 41( ) ( )

4m q qq

q 33ms

7

19

10 N/m

10 J

0.001kg/m.s

6

6

(10 ) 40ms

(3 10 ) 13ms

m

m

avec

On ne peut pas négliger l’effet du temps d’intégration

Page 29: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

2

max

48

25µm2

g

R Rg

206.4 10 J 8 22 10 J.m 33kg.m

Négligeable pour

Henriksen, J. R. et al. (2002). European Physical Journal E 9: 365-374.

Page 30: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 31: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

La mesure d’un spectre de fluctuation jusqu’à de grands modes (n=35) par rapport aux techniques précédentes (n=10-15)

L’utilisation d’une description théorique en membrane plane (et donc en transformée de Fourier)

La prise en compte de l’intégration en temps

Une mesure non intrusive du spectre de fluctuations

Page 32: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 33: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Valider notre méthode de mesure du spectre deValider notre méthode de mesure du spectre defluctuations en retrouvant des valeurs raisonnablesfluctuations en retrouvant des valeurs raisonnablesdes paramètres physiques des vésiculesdes paramètres physiques des vésicules

Développement de l’analyse spécifique

Réalisation d’expériences sur EPC, SOPC, et SOPC:CHOL

Page 34: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

2 3( , 0, ) (m )xu q y t

1(m )xq

7

20

1.7 10 N/m

9.4 10 J

10-21

10-20

10-19

1.21.00.80.60.40.2x10

6

SOPC

Page 35: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

LipideModule de Courbure

Déviation

Standard

Valeurs Publiées du module

de rigidité de courbure

EPC 4.25 0.87

6.6 Méléard, P. et al. (1998). Biochimie 80: 401-413.

11.5 Duwe, H.-P. et al. (1990). Journal de Physique France 51: 945-962.

2.5 Kummrow, M. e al. (1991). Physical Review A 44(12): 8356-8360.

SOPC 12.6 2.6

12.7 Méléard, P. et al. (1998). Bioch. 80: 401-413.

12.7 Döbereiner, H.-G. et al. (2003). PRL 91(4): 048301.

9 Evans, E. et al. (1990). Physical Review Letters 64(17): 2094-2097.

SOPC:CHOL

1:129.6 3.3

24.6 Evans, E. et al. (1990). Physical Review Letters 64(17): 2094-2097.

20(10 J) 20(10 J) 20(10 J)

Page 36: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Notre méthode permet une réelle mesure duNotre méthode permet une réelle mesure duspectre de fluctuations et permet pour la spectre de fluctuations et permet pour la première fois un “fit” du spectre première fois un “fit” du spectre

Bon accord entre nos résultats et les valeurs des modules de rigidité de courbure trouvés par d’autres auteurs

Valeurs de la tension raisonnables

Page 37: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 38: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Mesurer l’effet de l’activité hors équilibre de pompeMesurer l’effet de l’activité hors équilibre de pompeSur les fluctuations de la vésicule ?Sur les fluctuations de la vésicule ?

Théorie : amplification des fluctuations et un nouveau spectre de fluctuations Manneville, J.-B. et al. (2001). PRE 64(2): 021908.Prost, J. et al. (1996). EPL 33(4): 321-326.

• Experience : Préparer un système contrôlé de vésicules actives et effectuer la mesure du spectre de fluctuations

Page 39: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Solution de lipides et de BR en éther

Girard, P., J. Pécréaux, et al. (2004). Biophys. J. (submitted).

+

200 nm

H+

Page 40: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

10-21

10-20

10-19

4 5 6 7 8 9

105

2 3 4 5 6 7 8 9

106

2 3( , 0, ) (m )xu q y t

1(m )xq

SOPC

Fit membrane lipidique7

20

5.8 10 N/m

12.9 10 J

2

4

6

10-21

2

4

6

10-20

2

4

6

10-19

8 9

105

2 3 4 5 6 7 8 9

106

2

2 3( , 0, ) (m )xu q y t

1(m )xq

SOPC/BR=230Fit membrane passive

7

22

4.5 10 N/m

10 Jeff

10-20

2

4

6

10-19

2

4

6

10-18

2

8 9

105

2 3 4 5 6 7 8 9

106

1(m )xq

2 3( , 0, ) (m )xu q y tSOPC/BR=1150

Fit membrane passive8

22

6.2 10 N/m

10 Jeff

Page 41: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.
Page 42: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

10-21

10-20

10-19

10-18

1.41.21.00.80.60.40.20.0x10

6

2 3( , 0, ) (m )xu q y t

1(m )xq

SOPC/BR=230

10-21

10-20

10-19

10-18

1.00.80.60.40.20.0x10

6

2 3( , 0, ) (m )xu q y t

1(m )xq

SOPC/BR=230

10-21

10-20

10-19

10-18

2.01.51.00.50.0x10

6

2 3( , 0, ) (m )xu q y t

1(m )xq

SOPC/BR=2302 3( , 0, ) (m )xu q y t

1(m )xq 10

-22

10-21

10-20

10-19

1.51.00.50.0x10

6

SOPC/BR=230FCCP

Page 43: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

On detecte l’effet de la présence de la protéine passive.

On est capable de détecter l’activité de la protéine à partir d’une modification du spectre

Le modèle théorique est insuffisant pour rendre compte des observations

Différences avec les observations de J-B Manneville

Mener des expériences complémentaires Développements théoriques en vue de comprendre les

mesures sur les membranes activesMesure avec d’autres pompes

Page 44: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Collaboration avec J. Solon

Mise en évidence d’une tension négative

Page 45: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Mesure du spectre de fluctuation à la fois précise et rapide, validée par des mesures sur des membranes passives

Mesure de spectres de membranes hors-équilibre moyennés sur des temps longs

Mesure de phénomènes à dynamique rapideReconstitution de la BR en liposomes géants par une

méthode générale

Gamme de tensions accessibles (10-8-10-6 N/m) Limite en vecteur d’onde q<4×106 m-1

Mesures en diffusion de lumière pour accéder à des vecteurs d’onde plus grands

Page 46: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

La Protéine, reconstitution en petits liposomes et test, marquage FITC

J.-L. RigaudD. LevyP. Girard

Travaux théoriques sous-tendant cette étudeJ. ProstJ.-F. JoannyD. Lacoste (PCT, ESPCI)

Bases sur la reconnaissance et l’analyse de ContoursH.-G. Döbereiner (Golm, Germany)

Expériences de MicropipettesJ.-B. Manneville

Page 47: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Jacques Pécréaux

Page 48: Jacques Pécréaux. (Thomas M. Terry) Rappels sur la physique des membranes Reconnaissance de contours Résultats Validation sur les vésicules passives.

Collaboration avec J. Solon

2 4

4

( )

meff

eff

q

q q

f paramètres