Introduction à la gestion des données de recherche
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Natalie Clairoux, M. Sc., M.S.I.Bibliothécaire
Ateliers pour chercheurs futés
22 mai 2014
INTRODUCTION À LA GESTION DES DONNÉES DE RECHERCHE
Mention de source
Le contenu de cette présentation est une traduction et une adaptation de documents provenant du New England Collaborative Data Management Curriculum.
Ce cours a été développé par la bibliothèque Lamar Soutter, University of Massachusetts Medical School: http://library.umassmed.edu/necdmc
Natalie Clairoux Introduction à la gestion des données de rechercheÉté 2014
Objectifs d’apprentissage
1. Reconnaître ce que sont des données de recherche et ce que la gestion des données implique
2. Comprendre pourquoi la gestion des données est importante pour votre carrière en recherche
3. Identifier les enjeux liés à la gestion des données de recherche
4. Apprendre les bonnes pratiques et identifier les ressources pertinentes à la gestion des données
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LES TYPES ET LE CYCLE DES DONNÉES DE RECHERCHE
LE PLAN DE GESTION DES DONNÉES ET SES PRINCIPAUX ENJEUX
LA PRÉSERVATION DES DONNÉES
LE SOUTIEN OFFERT PAR LA BIBLIOTHÈQUE
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Définitions : données de recherche
“Research data, unlike other types of information, is collected, observed, or created, for purposes of analysis to produce original research results” (University of Edinburgh).
“The recorded factual material commonly accepted in the research community as necessary to validate research findings” (Extrait de OMB Circular A-110 36.d.2.i).
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Types de données de recherche
1. Observation
2. Expérimentales
3. Simulation
4. Dérivées ou compilation
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Image: Jørgen Stamp, Digitalbevaring.dk
Le cycle des données de recherche
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Création
Traitement
Analyse
Préservation
Partage
Réutilisation
Quelques arguments pour la saine gestion de vos données de recherche
1. Transparence et intégrité
2. Conformité
3. Bénéfices personnels
4. Pour la science en elle-même:
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“Data is the currency of science, even if publications are still the currency of tenure. To be able to exchange data, communicate it, mine it, reuse it, and review it is essential to scientific productivity, collaboration, and to discovery itself” (Gold, 2007).
Et éventuellement… par obligation?
Plusieurs consultations récentes ont porté sur la question des avantages potentiels du partage des données au Canada, et d’autres sont en cours.
Les détenteurs d’une subvention des IRSC doivent conserver les ensembles de données originaux découlant de la recherche financée par les IRSC pendant au moins cinq ans après la fin de la subvention.
Aux États-Unis, les récentes mises à jour des politiques du NIH et la NSF incluent le dépôt d’un plan de gestion des données de recherche.
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Quelques mythes sur le partage des données...
Toutes les données n’ont pas nécessairement à être partagées.
Le partage peut prendre plusieurs formes.
Les organismes subventionnaires reconnaissent que différentes disciplines possèdent des cultures différentes quant au partage de données.
Le partage devrait se faire à un coût et dans un intervalle de temps raisonnables.
Pas un mythe, mais une réalité: le partage augmente le nombre de citations!
Source: Lisa Federer, Data 101 - An Introduction to Research Data Management
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LES TYPES ET LE CYCLE DES DONNÉES DE RECHERCHE
LE PLAN DE GESTION DES DONNÉES ET SES PRINCIPAUX ENJEUX
LA PRÉSERVATION DES DONNÉES
LE SOUTIEN OFFERT PAR LA BIBLIOTHÈQUE
Plan de gestion des données: 7 étapes à considérer
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1. Types de données produites
2. Détails contextuels (métadonnées) nécessaires pour rendre les données utiles aux autres chercheurs
3. Stockage, copie de secours et sécurité
4. Précautions pour la propriété intellectuelle / vie privée
5. Politiques pour la réutilisation
6. Politiques pour l’accès et le partage
7. Plan pour l’archivage et la préservation de l’accès
Image: Jørgen Stamp, Digitalbevaring.dk
Exemple d’un plan de gestion des données
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Source: Example Data Management Plan: Biology (2)
Enjeu 1 de la planification de la gestion des données: la responsabilité
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À considérer: Équipes multidiciplinaires, gestion des cahiers de laboratoire, rotation du personnel de laboratoire...
Bonnes pratiques1. Définir les rôles de chacun et assigner les responsabilités pour la
gestion des données
2. Pour chaque tâche identifiée dans le plan, identifier les compétences requises
3. Associer les compétences au personnel disponible et identifier les brèches
4. Assurer la continuité par le biais de formations
5. Désigner des responsables et surveiller les résultats
Enjeu 2 de la planification de la gestion des données: la gestion des résultats
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À considérer: Pas de règles pour nommer des fichiers… en plusieurs versions… dans des dossiers classés au petit bonheur…stockés sur des médias variés… conservés dans plusieurs endroits… et en plusieurs formats!
Bonnes pratiques1. Créer des règles pour nommer les fichiers
2. Créer une classification pour les dossiers de fichiers
3. Créer une codification pour les versions
4. Choisir des formats de fichiers appropriés pour la préservation et le partage des données
Enjeu 2 de la planification de la gestion des données: la gestion des résultats
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Enjeu 3 de la planification de la gestion des données: les métadonnées
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À considérer: Les gens comprendront-ils vos données? Quelles normes pourriez-vous utiliser pour étiqueter vos données? Comment décrire votre ensemble de données pour qu’il soit repérable?
Bonnes pratiques1. Décrire le contenu des fichiers de données (exemples de normes:
Dublin Core, MIAME, Protocol Data Element Definitions)
2. Définir les paramètres et les unités de mesure
3. Créer un dictionnaire de données
4. Définir les valeurs codées et les données manquantes
5. Un outil en accès libre pour créer des métadonnées: DataUp
Enjeu 3 de la planification de la gestion des données: les métadonnées
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À considérer: À quelle fréquence? En combien de copies? À quell endroit? Combien d’espace sera requis sur le serveur?
Bonnes pratiques1. Trois copies (originale, externe/locale et externe/à distance)
2. Distribution géographique des copies
3. Copiez sur un disque dur externe (Mac Timeline, UNIX rsync)
4. Profitez de l’entreposage sur le nuage (Amazon 3S, Elephant Drive, Jungle Disk, Mozy, Carbonite...)
5. Données encryptées (sujets humains): garder 2 copies des mots de passe et clés de codage
Enjeu 4 de la planification de la gestion des données: la sauvegarde
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Enjeu 5 de la planification de la gestion des données: propriété et rétention
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À considérer: Qui détient la propriété intellectuelle? Combien de temps doit-on conserver les données?
Bonnes pratiques1. S’assurer que la personne qui a produit les données se porte
garante de leur préservation
2. Vérifier les politiques de votre organisme subventionnaire et/ou de l’éditeur de votre article
3. Consulter les politiques de l’UdeM sur la gestion des bases de données et sur la probité intellectuelle; voir le calendrier de conservation des documents
4. Les données servant à soutenir un brevet doivent être conservées indéfiniment
Enjeu 5 de la planification de la gestion des données: propriété et rétention
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LES TYPES ET LE CYCLE DES DONNÉES DE RECHERCHE
LE PLAN DE GESTION DES DONNÉES ET SES PRINCIPAUX ENJEUX
LA PRÉSERVATION DES DONNÉES
LE SOUTIEN OFFERT PAR LA BIBLIOTHÈQUE
Planification à long terme
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Qu’arrivera-t-il aux données lorsque le projet sera terminé?
Comment évaluer la valeur de mes données?
Quelles sont les options pour l’archivage et la préservation de mes données?
Quelles sont mes options pour publier et partager mes données?
Image: Jørgen Stamp, Digitalbevaring.dk
Format de fichier ouvert vs propriétaire
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Un logiciel particulier doit-il être utilisé pour lire et travailler avec le fichier de données? Si oui, le logiciel, sa version et le système d’exploitation requis devraient être mentionnés dans les métadonnées.
Est-ce que plusieurs fichiers composent la structure des fichiers de données? Si oui, le mentionner dans les métadonnées.
Lors de la sélection du format de fichiers, prioriser un format constant pouvant être lu dans le futur et indépendamment de modifications dans l’application.
Fichiers ouverts: standard documenté, non-encrypté, non-compressé, en format ASCII. Sera lisible dans le futur!
Déposer et publier des ensembles de données
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Le Centre d'expertise numérique pour la recherche (CEN-R) peut vous conseiller pour la structuration de vos données.
Databib vous propose plus de 500 dépôts de données de recherche. Le Registry of Research Data Repositories tient lui aussi une liste détaillée, de même que le NIH et l’OAD.
Plusieurs organismes dont DMP Online vous permettent d'élaborer un plan de gestion des données.
Accédez au portail du NCBI pour y déposer vos données.
Nouvelle revue chez Nature Publishing Group: Scientific Data
Impact de votre recherche au-delà des publications
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La création d’un doi ou d’un lien permanent maximise la découverte de vos données et permet de mesurer son impact
Partage de vos données compilé dans certains outils d’altmetrics, tels que ImpactStory (Figshare, Github)
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LES TYPES ET LE CYCLE DES DONNÉES DE RECHERCHE
LE PLAN DE GESTION DES DONNÉES ET SES PRINCIPAUX ENJEUX
LA PRÉSERVATION DES DONNÉES
LE SOUTIEN OFFERT PAR LA BIBLIOTHÈQUE
Infrastructures… à venir?!
« Pour pallier l’absence d’infrastructure au Canada, l’ABRC propose d’élaborer un réseau national de dépôts pour recueillir les données de recherche, en collaboration avec d’autres partenaires. »
« La vision de ce projet consiste à développer des dépôts de données dans les universités du Canada, où les chercheurs pourraient verser leurs données et les lier à des dépôts disciplinaires, de sorte que les données puissent être intégrées et réutilisées d’une nouvelle façon. »
Source: Science.gc.ca
Plus d’info: Sous-comité de l’ABRC sur la gestion des données
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Soutien aux chercheurs à la bibliothèque
Trouver des ensembles de données pour utilisation dans votre recherche
Comment citer les données publiées par quelqu’un d’autre
Vous aider à écrire un plan de gestion des données de recherche
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Image: Jørgen Stamp, Digitalbevaring.dk
Formation pour chercheurs et étudiants
Traduction et adaptation du NEDMC (6 modules) pour intégration dans un cours?
Guide sur la gestion des données de recherche – été 2014
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Image: Jørgen Stamp, Digitalbevaring.dk
Merci! Des questions?
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Maintenant que vous connaissez les bases de la gestion des données de recherche... vous éviterez bien des situations de ce genre!
Source: NYU Health Sciences Library