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Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle Mignon E., Moinet B., Moons V. Mignon E., Moinet B., Moons V. 2eme doc en médecine VT 2eme doc en médecine VT Année 2003-2004 Année 2003-2004

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Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle

Mignon E., Moinet B., Moons V.Mignon E., Moinet B., Moons V.

2eme doc en médecine VT2eme doc en médecine VT

Année 2003-2004Année 2003-2004

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DescriptionDescription Robe beige clair à noir. Robe beige clair à noir. Tache blanche sur le ventre plus ou moins Tache blanche sur le ventre plus ou moins étendue. Poils courts. Train avant plus massif étendue. Poils courts. Train avant plus massif que l'arrière. Quatre pattes terminées par des que l'arrière. Quatre pattes terminées par des sabots fendus en corne sombre. Bosse sabots fendus en corne sombre. Bosse musculo adipeuse à l'avant du garrot. Tête fine musculo adipeuse à l'avant du garrot. Tête fine à front large (chez les mâles) surmontée d'une à front large (chez les mâles) surmontée d'une paire de corne en forme de lyre ou de coupe à paire de corne en forme de lyre ou de coupe à base massive, surplombant de petites oreilles base massive, surplombant de petites oreilles à l'horizontale. Fanon et bosse plus à l'horizontale. Fanon et bosse plus développés chez le mâle que la femelle. développés chez le mâle que la femelle. Longue queue à toupet développé qui touche Longue queue à toupet développé qui touche le sol.le sol.

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Race indigène d’Amérique du Sud Race indigène d’Amérique du Sud Taille:1.25mTaille:1.25m Population semi sauvagePopulation semi sauvage

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Introduction

L’importance de la diversité génétique:L’importance de la diversité génétique:

Amélioration des races sélectionnéesAmélioration des races sélectionnées

Facilité d ’adaptation rapide aux Facilité d ’adaptation rapide aux changementschangements

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Mais…. La sélection artificielle:diminue la Mais…. La sélection artificielle:diminue la variation génétique:variation génétique: Sélection pour traits économiques Sélection pour traits économiques

(viande,lait)(viande,lait) Conduit vers une population Conduit vers une population

génétiquement uniforme par sélection génétiquement uniforme par sélection d’individus reproducteurs (IA et transfert d’individus reproducteurs (IA et transfert d’embryon)d’embryon)

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Donc la sélection artificielle:Donc la sélection artificielle: Utilisation intensive d’animaux d’élitesUtilisation intensive d’animaux d’élites Reproduction assistéeReproduction assistée

Diminue la taille de la population Diminue la taille de la population effective des races domestiques effective des races domestiques commercialescommerciales

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Ex:holstein:1000000 et pop effective=1000 Ex:holstein:1000000 et pop effective=1000 malgré la pop malgré la pop

La diversité génétique du bétail est La diversité génétique du bétail est compromise à cause des stratégies de compromise à cause des stratégies de management (il y a diminution pop management (il y a diminution pop effective de la plupart des races effective de la plupart des races domestiques)domestiques)

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Races indigènes(créole)Races indigènes(créole) Diminution de la sélection artificielle et Diminution de la sélection artificielle et

donc, on a de la sélection naturelle:donc, on a de la sélection naturelle:Haute variabilité phénotypiqueHaute variabilité phénotypiqueAugmentation fitness sous condition Augmentation fitness sous condition

naturellenaturelle

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ACC (Argentinean Creole cattle)

Où? Où? Dans des lieux inadéquats pour les Dans des lieux inadéquats pour les races commercialesraces commerciales

Comment?Comment? Distribuée en pop semi isolée Distribuée en pop semi isolée avec un petit nombre d’individu par avec un petit nombre d’individu par troupeau,isolation géographique,…troupeau,isolation géographique,…

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Csq? Csq? Sélection naturelleSélection naturelle Adaptation locale résultant du haut taux de Adaptation locale résultant du haut taux de

diversité phénotypique:diversité phénotypique:Couleurs +++ Couleurs +++ LongévitéLongévitéFertilitéFertilitéRésistance à certaines maladies endémiquesRésistance à certaines maladies endémiques

• Tique à bofilus microplus,vecteur Tique à bofilus microplus,vecteur commun de nombreux pathogènescommun de nombreux pathogènes

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Etude

Évaluation de la structure pop génétique des Évaluation de la structure pop génétique des ACC comparé avec les holsteinsACC comparé avec les holsteins

Utilisation de marqueurs génétiques:Utilisation de marqueurs génétiques: 3 gènes impliqués dans la production de 3 gènes impliqués dans la production de

lait (lait (αs1-caséin, k-caséin, prolactine)αs1-caséin, k-caséin, prolactine) 1 gène impliqué dans la réponse immune 1 gène impliqué dans la réponse immune

de l’organisme contre les pathogènes de l’organisme contre les pathogènes (BOLA-DRB3)(BOLA-DRB3)

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Hypothèse?

Est-ce que le taux de diversité génétique chez Est-ce que le taux de diversité génétique chez ACC est différent de celui existant dans la ACC est différent de celui existant dans la race Holstein?race Holstein?

Quel motif de diversité génétique existeQuel motif de diversité génétique existe-t-il-t-il à à l’intérieur et entre les pop de ACC?l’intérieur et entre les pop de ACC?

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Méthodes et matériels

Échantillons de sang chez 339 animaux provenant de 9 Échantillons de sang chez 339 animaux provenant de 9 pop de ACCpop de ACC Sélection d’individu ne partageant pas des ancêtres Sélection d’individu ne partageant pas des ancêtres

communs jusque 2 générationscommuns jusque 2 générations Animaux venant d’habitats différentsAnimaux venant d’habitats différents

Forêts subtropicales humidesForêts subtropicales humidesSteppesSteppesPrairiesPrairiesForêts tempéréesForêts tempérées

Holsteins d’Argentine: 3 populationsHolsteins d’Argentine: 3 populations

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Extraction d’ADN

Isolé des lymphocytesIsolé des lymphocytes Marqueurs génétiques utilisés:Marqueurs génétiques utilisés:

αs1-caséinαs1-caséin K-caséinK-caséin ProlactineProlactine BOLA-DRB3BOLA-DRB3

=> Amplifiés par électrophorèses sur => Amplifiés par électrophorèses sur gel de polyacrylamide et visualisé gel de polyacrylamide et visualisé sous U.V.sous U.V.

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Mesure de la variabilité génétiqueMesure de la variabilité génétique:: GENEPOPGENEPOP ARLEQUINARLEQUIN

Le taux de variabilité génétique estimé parLe taux de variabilité génétique estimé par A:diversité allèliqueA:diversité allèlique He:hétérozigotes attendusHe:hétérozigotes attendus

Analyse statistique des résulatsAnalyse statistique des résulats

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Résultats

91.9 à 94.7% de la variance totale observée 91.9 à 94.7% de la variance totale observée est expliquée par des différences à est expliquée par des différences à l’intérieur de la pop ACCl’intérieur de la pop ACC

5.3 à 8.1% sont le résultat de différences 5.3 à 8.1% sont le résultat de différences entre population ACCentre population ACC

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Pour BOLA-DRB3 le nombre d’allèle et la Pour BOLA-DRB3 le nombre d’allèle et la fréquence de distribution a l’int pop ACC est fréquence de distribution a l’int pop ACC est différent de celui observé dans élevages différent de celui observé dans élevages domestiquesdomestiques Les différents troupeaux holstein présentent les Les différents troupeaux holstein présentent les

mêmes allèles avec une fréquence similairemêmes allèles avec une fréquence similaire Tandis que pop ACC présente 39 à 74% du Tandis que pop ACC présente 39 à 74% du

nombre total d’allèle caractéristique pour cette nombre total d’allèle caractéristique pour cette race (variation de la diversité allèlique)race (variation de la diversité allèlique)

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Le nombre moyen d ’alléle partagé entre Le nombre moyen d ’alléle partagé entre pop ACC est significativement + petit que pop ACC est significativement + petit que celui partagé dans la pop holsteincelui partagé dans la pop holstein

BOLA-DRB3 des ACC n’a jamais été BOLA-DRB3 des ACC n’a jamais été détecté dans les races Européennes détecté dans les races Européennes hautement sélectionnées( importé hautement sélectionnées( importé d ’Afrique)d ’Afrique)

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Conclusion:

ACC a une maintenance d’un haut taux de ACC a une maintenance d’un haut taux de diversité génétique et de structure de diversité génétique et de structure de populationpopulation

ACC montrent un + haut taux de ACC montrent un + haut taux de différenciation génétique que holsteindifférenciation génétique que holstein

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Discussion:

ACC: haut taux de diversité génétiqueACC: haut taux de diversité génétique Cette diversité génétique peut être Cette diversité génétique peut être

expliquée par 2 processus:expliquée par 2 processus: La La sélection naturellesélection naturelle a favorisé des a favorisé des

allèles particulières ou des combinaisons allèles particulières ou des combinaisons allèliques particulières. De plus des allèliques particulières. De plus des environnements fort différents(forêt-environnements fort différents(forêt-plaine) ont facilité ce processus plaine) ont facilité ce processus

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La structure de pop ACC et le peu de flux La structure de pop ACC et le peu de flux génétique (comparativement à la génétique (comparativement à la holstein) a prévenu l’homogéinisation holstein) a prévenu l’homogéinisation génétique parmi la pop locale ACCgénétique parmi la pop locale ACCChez holstein, cette homogéinisation Chez holstein, cette homogéinisation

est due IA, transfert d’embryon, est due IA, transfert d’embryon, sélection d’animaux d’élite, production sélection d’animaux d’élite, production massive,…massive,…

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Bibliographie:

Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle; G. giovambattista,M.V. Ripoli, the Argentinean Creole cattle; G. giovambattista,M.V. Ripoli, P. Peral-Garcia, J.L. Bouzat; 2001 International Society for P. Peral-Garcia, J.L. Bouzat; 2001 International Society for Animal Genetics,Animals Genitics,Animal Genetics,Animals Genitics,32,32,p210-247.p210-247.

Amélioration génétique des productions animales,tome 1-2,P. Amélioration génétique des productions animales,tome 1-2,P. Leroy, J. Detilleux, F. FarnirLeroy, J. Detilleux, F. Farnir

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