Impact de la FCO sur la mortalité des bovins

Réunion d'information et d'échanges sur la restitution des résultats de la recherche opérationnelle FCO en France

18 mars 2010, Afssa

JB Perrin, P Hendrikx, C Ducrot, D Calavas

Contexte

• Mortalité bien décrite chez les ovins, divergences à propos de l’espèce bovine

• Études quantitatives rares (Institut de l’élevage)

• Limites des approches classiques – Identification des foyers (clinique peu spécifique , qualité

des tests diagnostiques, réticence liée aux conséquences socio-économiques)

– Identification des mortalités dues à la FCO

• Utilisation d’une approche alternative pour évaluer l’impact de la FCO sur la mortalité bovine

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Données et méthodes

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• Adaptation d’une méthode employée par l’Inserm pour estimer les surmortalités dues à la canicule

• Basée sur un historique de données : BDNI

• Modélisation par département de l’évolution temporelle des effectifs de mortalité (sem-1. âge-1) à partir d’une période de référence (2001-2006) 

• Prédiction des effectifs de mortalité attendus en 2007

• Comparaison des effectifs de mortalité attendus (E) aux effectifs de mortalité réellement observés (O)

Excès relatif : (O-E)/E Ratio de mortalité : O/E

Modèle de prédiction

5

10

2

10

2,,

2

1

2

1

)/2cos()/2sin(

)/2cos()/2sin()log(

i iisiisi

sii

sss

PstXPtsXX

PtsPtst

)(~ Poissonm )(mV

Intercept + tendance

Fonctions sinusoïdales : saisonnalité

Effet de l’âge Interactions saison/ âge

t : semaine i : catégorie d’âge Xi : variable âge (1 ou 0)

P = 52 (période) α,β,γ,η : paramètres du modèle

Ajustement du modèle (exemple de la Meuse)

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Résultats (1) : Excès de mortalité par département

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Ratios de mortalité mensuels, par département en 2007

8

9

Excès relatifs de mortalité et nombre de foyers

déclarés par département, 2007

Nb de foyers déclarés

Ratios de mortalité

1500

1000

500

200

50

10

1

10

Excès relatifs de mortalité et nombre de foyers

déclarés par département, 2008

Nb de foyers déclarés

Ratios de mortalité

1500

1000

500

200

50

10

1

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Résultats (2) : Excès de mortalité à l’échelle nationale

Nombre de mortalités observées et attendues chez les bovins français, par semestre (2007-2008)

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2007 2008Total

Semester 1 Semester 2 Semester 1 Semester 2Mortalités observées (O)

588 314 636 925 688 289 656 660 2 570 188

Mortalités attendues (E)

615 036 584 060 609 838 579 725 2 388 659

Excès de mortalité (O-E)

-26 722 52 865 78 451 76 935 + 181 529

Excès relatif (O-E)/E

- 4.3% +9.0% +12.9% +13.3% +7.6%

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Résultats (3) : Excès de mortalité dans la Meuse

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Prédictions établies par le modèle dans la Meuse

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Déclaration de foyers FCO et excès de mortalité chez les veaux de moins de 7 jours (Meuse)

Risques de mortalité observés, attendus et risques de mortalité attribuables à la FCO 8

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Calculés respectivement à partir des mortalités observées, attendues, et en excès

Veaux <7 j : 1,20%

Vaches 5-10a :1,20%Vaches >10a : 1,27%

Bovins de 2m à 2 a :0.27 - 0.32%

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Discussion

Discussion

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• Validité des prédictionsajustement du modèle, premier semestre 2007

• Veaux de moins de 7 jours : − sur-déclarations des mortalités ? contexte épizootique, compensations financières etc.− conséquence infection au cours de la gestation?

• Attribution des mortalités− Autres causes de surmortalité? Qualité des fourrages,

élévation des quotas, limitations de mouvement− Cohérence surmortalités / épizootie de FCO ?

Cohérence spatiale, cohérence temporelleDécalage pics de mortalité et déclaration de foyersEffets à long terme?

Conclusion

• 50 000 surmortalités (+10%) au second semestre 2007

150 000 surmortalités (+13%) en 2008

• Risque de mortalité augmenté chez les veaux (R=1,2%) et chez les bovins âgés (R=1,27%), stable chez les jeunes bovins

• Mortalités directement ou indirectement attribuables à la FCO

• Complémentarité des approches – Intérêt pour l’évaluation de l’impact d’une épizootie, rapide et peu

onéreuse, sans nécessité de tests diagnostics– Limite : attributabilité des excès de mortalité

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Merci de votre attention

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• Étude faite dans le cadre de l’Observatoire de la Mortalité des animaux de rente (OMAR)

• Thèse FCPR, en codirection AFSSA (D. Calavas) et INRA (C. Ducrot) + encadrement P. Hendrikx (AFSSA)

• Remerciements

Jean-Luc Vinard, Eric Morignat (AFSSA-Lyon)

André Gauffier, Pascal Deriu (DGAl)