EVOLUTION DES INCIDENCES DES PESTES AVIAIRES PENDANT …
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ANDRIAMAMIMALALA Tanjona Rakotoson EVOLUTION DES INCIDENCES DES PESTES AVIAIRES PENDANT UNE ANNEE AU LAC ALAOTRA
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ANDRIAMAMIMALALA Tanjona Rakotoson
EVOLUTION DES INCIDENCES DES PESTES AVIAIRES PENDANT UNE
ANNEE AU LAC ALAOTRA
Thèse de Doctorat en Médecine Vétérinaire
UNIVERSITE D’ANTANANARIVO
FACULTE DE MEDECINE
DEPARTEMENT D’ENSEIGNEMENT
DES SCIENCES ET DE MEDECINE VETERINAIRES
ANNEE : 2013 N 152
EVOLUTION DES INCIDENCES DES PESTES AVIAIRES PENDANT UNE
ANNEE AU LAC ALAOTRA
THESE
Présentée et soutenue publiquement
le 02 Octobre 2013
à Antananarivo
par
Mademoiselle ANDRIAMAMIMALALA Tanjona Rakotoson
Née le 07 Mai 1987 à Andriba Maevatanana
Pour obtenir le grade de
DOCTEUR EN MEDECINE VETERINAIRE
(Diplôme d’Etat)
Directeur de thèse : Professeur RENE DE ROLAND Lily-Arison
MEMBRES DU JURY
Président : Professeur RENE DE ROLAND Lily-Arison
Juges : Professeur RAFATRO Herintsoa
: Professeur RAKOTOZANDRINDRAINY Raphaël
Rapporteur : Docteur RASAMOELINA ANDRIAMANIVO Harentsoaniaina
SOMMAIRE
SOMMAIRE
Pages
INTRODUCTION ........................................................................................................... 1
PARTIE I. SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE ……………………………………..3
I. Elevage de volailles à Madagascar ................................................................ 3
I.1. Aviculture traditionnelle ................................................................................ 3
I.1.1.Habitat .................................................................................................... 4
I.1.2.Alimentation .......................................................................................... 4
I.1.3.Production .............................................................................................. 4
I.1.4.Santé ....................................................................................................... 5
I.2. Aviculture moderne ........................................................................................ 5
I.2.1.Habitat .................................................................................................... 6
I.2.2.Alimentation .......................................................................................... 6
I.2.3.Santé ....................................................................................................... 6
II. Les pestes aviaires .......................................................................................... 7
II.1. L’influenza aviaire ......................................................................................... 7
II.1.1.Définition .............................................................................................. 7
II.1.2.Etiologie et pathogénie ......................................................................... 7
II.1.3.Importance ............................................................................................ 9
II.1.4.Signes cliniques .................................................................................. 11
II.1.5.Épidémiologie ..................................................................................... 11
II.1.6.Situation mondiale actuelle de l’IAHP de sous-type H5N1 ............... 14
II.1.7.L’influenza aviaire à Madagascar ....................................................... 15
II.2. La maladie de Newcastle.............................................................................. 17
II.2.1.Définition ............................................................................................ 17
II.2.2.Etiologie et pathogénie ....................................................................... 18
II.2.3.Importance .......................................................................................... 19
II.2.4.Signes cliniques .................................................................................. 19
II.2.5.Epidémiologie ..................................................................................... 21
II.2.6.La maladie de Newcastle à Madagascar ............................................. 23
PARTIE II. METHODOLOGIE ……………………………………………………..25
I. zone d’etude .................................................................................................. 25
I.1. Localisation et milieu physique.................................................................... 25
I.2. Agriculture ................................................................................................... 25
I.3. Elevage ......................................................................................................... 26
II. Type et population d’etude............................................................................ 29
III. Echantillonnage ............................................................................................ 29
III.1.Choix des animaux ....................................................................................... 29
III.2.Critères d’inclusion ...................................................................................... 29
III.3.Taille de l’échantillon .................................................................................. 29
IV. Collecte de données ...................................................................................... 29
IV.1.Enquête ........................................................................................................ 30
IV.2.Prélèvements biologiques ............................................................................ 31
IV.3.Considération éthique .................................................................................. 31
V. Analyse de laboratoire .................................................................................. 31
V.1. Analyse sérologique de l’influenza aviaire .................................................. 32
V.2. Analyse sérologique de la maladie de Newcastle ........................................ 32
VI. Traitement et analyse de données ................................................................. 32
VI.1.Stockage et traitement des données ............................................................. 33
VI.2.Analyse des données .................................................................................... 33
VI.2.1.Les variables d’intérêt ....................................................................... 33
VI.2.2.Synthèse des données collectées ....................................................... 34
VI.2.3.Evolution des incidences des pestes aviaires .................................... 34
VI.2.4.Facteurs de variation ......................................................................... 36
VI.2.5.Influence de la vaccination contre la maladie de Newcastle ............ 36
PARTIE III. RESULTATS …………………………………………………………..38
I. Données collectées ........................................................................................ 38
I.1. Au niveau des villages.................................................................................. 38
I.2. Au niveau des élevages ................................................................................ 39
I.3. Au niveau de la volaille ................................................................................ 40
II. Evolution des incidences des pestes aviaires ................................................ 41
II.1. Évolution de l’incidence de l’influenza aviaire............................................ 41
II.2. Évolution de l’incidence de la maladie de Newcastle .................................. 43
III. Facteurs de risques des pestes aviaires ........................................................ 45
III.1.Facteurs de risque pour l’influenza aviaire .................................................. 45
III.1.1.Analyse univariée .............................................................................. 45
III.1.2.Analyse multivariée........................................................................... 45
III.2.Facteurs de risque pour la maladie de Newcastle ........................................ 47
III.2.1.Analyse univariée .............................................................................. 47
III.2.2.Analyse multivariée........................................................................... 47
III.3.La vaccination contre la maladie de Newcastle ........................................... 49
III.3.1.Proportion des élevages vaccinant et volailles vaccinées ................. 49
III.3.2.Taux de réponse vaccinale positive ................................................... 50
III.3.3.Relation entre la maladie de Newcastle et la vaccination ................. 50
PARTIE IV DISCUSSION …………………………………………………………...53
PARTIE V RECOMMANDATIONS ET PERSPECTIVES ………………………58
CONCLUSION .............................................................................................................. 60
BIBLIOGRAPHIE ........................................................................................................ 72
ANNEXES
RESUME
LISTE DES TABLEAUX
Pages
Tableau I. Chronologie de la panzootie de l’influenza aviaire ............................... 16
Tableau II. Production de riz dans la région du lac Alaotra selon le type de
culture (année 2007) .............................................................................. 25
Tableau III. Production de cultures vivrières au lac Alaotra (en tonne) ................... 26
Tableau IV. Effectif des animaux par espèce dans la région du lac Alaotra ............. 26
Tableau V. Types des variables d’intérêt et modalités ............................................ 35
Tableau VI. Répartition des élevages visités par commune ...................................... 38
Tableau VII. Répartition de volailles prélevées et analysées par commune............... 38
Tableau VIII. Nombre de volailles prélevées et analysées par période d’exposition .. 39
Tableau IX. Distribution des variables d’élevages .................................................... 40
Tableau X. Distribution de la variable espèce de volaille ....................................... 40
Tableau XI. Résultat de l’analyse univariée pour l’influenza aviaire (p<0,25) ........ 46
Tableau XII. Résultat de l’analyse multivariée pour l’influenza aviaire (p<0,05) ..... 47
Tableau XIII. Résultat de l’analyse univariée pour la maladie de Newcastle
(p<0,25) ................................................................................................. 48
Tableau XIV. Résultat de l’analyse multivariée pour la maladie de Newcastle
(p=0,05) ................................................................................................. 49
Tableau XV. Nombre d’élevages vaccinant et volailles vaccinées............................. 49
Tableau XVI. Proportion de volailles vaccinées ayant des réponses post-vaccinales
positives ................................................................................................ 50
Tableau XVII. Fréquence des variables liées à la vaccination contre la maladie de
Newcastle ............................................................................................... 51
Tableau XVIII.Résultat de l’analyse univarée pour la vaccination (p<0,25) ................. 52
Tableau XIX. Résultat de l’analyse multivariée pour la vaccination (p<0,005) ........... 52
LISTE DES FIGURES
Pages
Figure 1. Structure du cheptel aviaire local .................................................................... 3
Figure 2. Schéma de la structure d’une influenza virus A ............................................. 8
Figure 3. Virus influenza en microscopie électronique .................................................. 8
Figure 4. Répartition et nombre de cas humains par pays (en anglais) ........................ 10
Figure 5. Carte des foyers de maladie (2005-2012) ..................................................... 14
Figure 6. Prévalence de l'influenza aviaire chez le poulet gasy et palmipèdes à
Madagascar. .................................................................................................. 17
Figure 7. Maladie de Newcastle chez le poulet : troubles nerveux, prostration .......... 20
Figure 8. Maladie de Newcastle chez le poulet : Poulet présentant un torticolis ......... 20
Figure 9. Maladie de Newcastle chez la poule : œufs décolorés, déformés et de
petit calibre ................................................................................................... 21
Figure 10. Prévalence individuelle de la maladie de Newcastle dans la population
de poulets ...................................................................................................... 24
Figure 11. Localisation des communes d’étude ............................................................ 28
Figure 12. Relation entre les différentes tables existantes ............................................. 33
Figure 13. Distribution de la densité d’élevage ............................................................. 39
Figure 14. Distribution des âges de volailles (semaine) ................................................ 41
Figure 15. Évolution de l’incidence de l’influenza aviaire durant l’année 2010 ........... 41
Figure 16. Évolution de l’incidence de l’influenza aviaire par commune ..................... 42
Figure 17. Evolution de l’incidence de la maladie de Newcastle durant l’année
2010 .............................................................................................................. 43
Figure 18. Évolution de l’incidence de la maladie de Newcastle par commune ........... 44
LISTE DES ANNEXES
Pages
Annexe 1. Glossaire ....................................................................................................... 85
Annexe 2. Fiche d’enquête ............................................................................................. 87
Annexe 3. Techniques de manipulation adoptée lors du prélevement ........................... 89
Annexe 4. Les différentes étapes de l’analyse pour la maladie de Newcastle ............... 90
Annexe 5. Les différentes étapes de l’analyse pour l’influenza aviaire ......................... 92
Annexe 6. Extrait du tableau d’analyse ......................................................................... 93
Annexe 7. Rappel sur la régression logistique ............................................................... 95
Annexe 8. Résultat de l’analyse multivariée de toutes les variables sélectionnées pour
l’influenza aviaire (p<0,05) .......................................................................... 97
Annexe 9. Résultats de l’analyse multivariée de toutes les variables sélectionnées pour
la maladie de Newcastle ............................................................................... 98
LISTE DES ABREVIATIONS
ACSA : Agent Communautaire de Santé Animale
AFSSA : Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments
CE : Commission Européenne
FOFIFA : FOiben’ny FIkarohana ho Fampandrosoana ny eny Ambanivohitra
(Centre National de Recherche Appliquée au Développement Rural)
CIRAD : Centre de Coopération Internationale de Recherche Agronomique pour
le Développement
CNLGPA : Comité National de Lutte Contre la Grippe Aviaire
DRZV : Département de Recherches Zootechniques et Vétérinaires
ELISA : Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay
FAO : Food and Agriculture Organization
IA : Influenza Aviaire
IAFP : Influenza Aviaire Faiblement Pathogène
IAHP : Influenza Aviaire Hautement Pathogène
IMVAVET : Institut Malgache des VAccins VETérinaires
IPIC : Indice de Pathogénicité par voie Intracrânienne
LSI : Laboratoire Service International
MN : Maladie de Newcastle
OIE : Office Internationale des Epizooties
OMS : Organisation Mondiale de la Santé
OR : Odds Ratio ou rapport des côtes
SEM : Semaine
INTRODUCTION
1
INTRODUCTION
L’influenza aviaire (IA) et la maladie de Newcastle (MN), regroupées sous le
terme « Pestes aviaires », sont des maladies virales hautement contagieuses. Elles
peuvent infecter plusieurs espèces d’oiseaux domestiques et sauvages. L’IA est due à
des virus de la famille des Orthomyxoviridae, du genre Influenza de type A (1). Tandis
que la MN est due à des virus de la famille des Paramyxoviridae du genre Avulavirus.
La gravité de ces maladies (taux de morbidité, pertes par mortalité) ainsi que la rapidité
de leur propagation font de ces deux maladies des fléaux majeurs en élevage avicole
dans le monde entier.
Les souches de virus de l’IA sont classées en deux catégories : les souches
faiblement pathogènes (IAFP) et les souches hautement pathogènes (IAHP). Parmi les
souches hautement pathogènes, le sous-type H5N1 a beaucoup fait parler de lui ces
dernières années en raison de l’apparition des foyers importants chez les oiseaux
domestiques et les oiseaux sauvages au niveau mondial à partir de l’Asie (2). Ce sous-
type est arrivé pour la première fois en Afrique, notamment au Nigeria, en Janvier 2006.
Au moins 11 pays africains ont été touchés par la panzootie en 2008 (600 foyers ont été
signalés). Cette dernière a été favorisée par les mouvements commerciaux
internationaux de volailles domestiques, qui ont été identifiés comme cause principale
de l’apparition de ces foyers (3). La situation est préoccupante en raison du degré de
virulence non seulement chez les volailles mais également chez les oiseaux sauvages
ainsi que la capacité de ces souches à provoquer des cas humains.
Madagascar est encore indemne d’influenza à H5N1, mais le risque d’émergence
n’est pas nul. D’ailleurs des oiseaux migrateurs inféodés au territoire national, et
migrateurs long courrier sont présents dans l’île. L’existence probable d’échanges
illicites de volailles vivantes pouvant entrainer l’émergence et la diffusion rapide en cas
d’introduction. Cependant, une étude transversale réalisée en 1999 (4) a mis en évidence
la circulation du virus de l’IAFP à Madagascar.
Quant à la MN, le premier foyer a été observé et diagnostiqué à Madagascar en
1946 dans le grand port de Toamasina (5). La présence de cette maladie est
2
régulièrement signalée sur tout le territoire, et devient même un évènement habituel
pour les éleveurs.
Ces pestes aviaires sont le sujet de nombreuses études depuis des années. C’est
dans cette même optique que la présente étude a été réalisée dans le cadre du projet de
recherche GRIPAVI dont le maître d’œuvre est le CIRAD en collaboration avec le
FOFIFA à Madagascar. La zone d’investigation était au lac Alaotra, dans le district
d’Ambatondrazaka et d’Amparafaravola.
D’une part, la dynamique annuelle de l’infection par les pestes aviaires n’est pas
connue. D’autre part, l’on ignore si l’agro-écotype et la vaccination contre la MN
influent les incidences. C’est pourquoi, il importe de répondre aux questions : comment
s’évoluent les incidences intra-annuelles des pestes aviaires dans la zone du lac Alaotra
et quels en sont les principaux facteurs de variations? En effet, si l’on connait comment
s’évoluent les incidences et les facteurs de risque, on pourra agir sur ces maladies, d’une
façon précise et efficace dans le temps et dans l’espace.
L’agro-écotype d’une zone ou d’un village est le type de milieu avec les
caractères agricoles et écologique qui définissent le milieu comme milieu sec, rizière
et/ou humide.
Les hypothèses posées au départ aurait dit que les incidences des pestes aviaires
dans cette zone ne seraient pas les mêmes durant toute l’année et qu’elles varieraient
avec l’agro-écotype et/ou avec la densité d’élevage, l’espèce, la mixité de volailles et/ou
avec le porc dans l’élevage, l’âge et la vaccination contre la MN.
L’objectif de cette étude était de suivre l’évolution intra-annuelle des incidences
des pestes aviaires dans cette zone. Les influences de l’agro-écotype et la vaccination
contre la MN ont été surtout évalués.
Ce travail est divisé en cinq parties, la première partie présente la synthèse
bibliographique sur l’élevage de volaille à Madagascar et les pestes aviaires. La
deuxième montre les méthodes adoptées et en troisième les résultats qui seront ensuite
discutés en quatrième partie. Enfin, la cinquième partie offre des perspectives et des
recommandations.
Partie I : SYTHESE BIBLIOGRAPHIQUE
PARTIE I. SYNTHE
I. ELEVAGE DE VOLAILLES
Madagascar est un pays
en première place en termes
La poule indigène malgache
pour sa chair et ses œufs, on la voit évoluer partout (
Figure 1. Structure du cheptel
Source : Recueil statistique des productions animales CIRAD
Selon la conduite d’élevage
savoir l’aviculture traditionnelle et l’aviculture moderne.
I.1. Aviculture
L’élevage traditionnel extensif
basse cours. Il peut être constitué aussi par les autres espèces de volailles domestiq
(élevage mixte) telles que
paysans commencent très tôt à constituer leurs cheptels, dès l’âge de 12
conduite de cet élevage de type traditionnel se transmet de parents
cheptel peut aller d’une dizaine à plusieurs centaines de tê
2,5%
3
SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE
ELEVAGE DE VOLAILLES A MADAGASCAR
Madagascar est un pays favorable à l’agriculture et l’élevage
en termes de cheptel. Elle concerne 67% de la population rurale
malgache dit « gasy », représente 80,2% du cheptel
pour sa chair et ses œufs, on la voit évoluer partout (4).
ucture du cheptel aviaire local
Recueil statistique des productions animales CIRAD
elon la conduite d’élevage, deux types d’avicultures existent
l’aviculture traditionnelle et l’aviculture moderne.
Aviculture traditionnelle
levage traditionnel extensif de poulets de race locale est la plus familière de la
basse cours. Il peut être constitué aussi par les autres espèces de volailles domestiq
(élevage mixte) telles que les canards, les oies et les dindes
paysans commencent très tôt à constituer leurs cheptels, dès l’âge de 12
conduite de cet élevage de type traditionnel se transmet de parents
cheptel peut aller d’une dizaine à plusieurs centaines de têtes.
80,2%
12%
5,3%
élevage. L’aviculture vient
Elle concerne 67% de la population rurale (6).
% du cheptel (7). Appréciée
Recueil statistique des productions animales CIRAD-EMVT, 1989
existent à Madagascar à
est la plus familière de la
basse cours. Il peut être constitué aussi par les autres espèces de volailles domestiques
(6). Par tradition, les
paysans commencent très tôt à constituer leurs cheptels, dès l’âge de 12- 15ans (8). La
conduite de cet élevage de type traditionnel se transmet de parents aux enfants et le
Poulets "gasy"
Dindons
Canards
Oies
4
I.1.1. Habitat
Généralement, les animaux sont sortis le jour sur un parcours clôturé ou non. Les
palmipèdes sortent plutôt dans les rizières et les mares et sont gardés ou non par des
enfants. Une étude menée dans la région périurbaine d’Antananarivo (8) a présenté que
ces animaux sont logés la nuit dans différents types d’habitat : sous l’escalier (26%),
dans la cuisine (35%), dans un local en grillage (21%) ou en briques (18%). Cette liste
n’est pas exhaustive, car il y a des animaux qui logent dans la même chambre que
l’éleveur (8).
I.1.2. Alimentation
Les volailles se nourrissent d'elles-mêmes autour de la propriété familiale (7).
Cette alimentation offerte par la nature est essentiellement composée:
- d'insectes, de vers de terre, de larves
- de verdure, des récoltes de cultures vivrières, des graines
- de sable.
Généralement, les éleveurs donnent un complément alimentaire le matin, à la
sortie des animaux, et/ou le soir. Il s’agit de riz blanc, de paddy, de maïs ou de déchets
de cuisine. Les coqs de combat quant à eux reçoivent, en plus des céréales, une
alimentation spéciale telle que les tomates et les brèdes (7).
Ainsi, l’aviculture traditionnelle valorise les pertes de récoltes de riz et les écarts
de triage des produits vivriers (6).
Les éleveurs donnent à boire à leurs animaux avec des récipients de récupération
comme abreuvoirs (boîte de conserves, demi-bouteille) (7). L’origine de cette eau est
très variable selon la disponibilité ; elle peut être l’eau de robinet, de puits, d’étang ou
eau après usage ménagère.
I.1.3. Production
La productivité de la poule (œufs et poussins) et la survie des poussins sont les
paramètres clés déterminant la productivité de l'aviculture villageoise (9). Ces mêmes
facteurs permettent également l'étude des caractéristiques propres d’un troupeau (7).
Une étude menée sur l’aviculture villageoise à Madagascar (7) a donné une productivité
moyenne de la poule malgache de 33,3 œufs/an/poule, soit 2,76 couvées/an/poule avec
5
12 œufs par couvée. Le taux d'éclosion moyen est de 77,8%. Soixante-quinze pourcent
des œufs produits servent à la production de poussins et les 25% sont disponible pour la
consommation et vente (7).
Cependant, les taux de mortalité sont très considérables car 42,3% des poussins
meurent avant l'âge de séparation de leurs mères et 34,5% des poulets sont morts avant
d'atteindre l'âge adulte. Chez l'adulte, la mortalité est de 31,4% (7). Malgré toutes ces
pertes, grâce à une rusticité et une prolificité conséquente, les populations se
reconstituent rapidement.
I.1.4. Santé
Les causes des taux de mortalité élevés sont surtout liées à des problèmes
sanitaires, dominées par le parasitisme interne (Tetrameres, Syngamus, Ascaridia,
Heterakis, Taenia) chez toutes les classes d’âge dont le taux est de 74%, surtout pendant
la saison sèche (7). Les mortalités peuvent arriver dès la deuxième semaine d'âge (7).
En pathologie infectieuse, au premier rang, la MN entraine à elle seule plus de 68,8% de
mortalité chez les jeunes et 75% chez les adultes (7) (10). Puis le choléra aviaire
(Annexe 1) au deuxième rang. Chaque année, ces deux maladies, souvent confondues
sous l’appellation de « barika » à Antananarivo et « moafo » au lac Alaotra, déciment
l’aviculture traditionnelle (6). Ensuite vient la variole aviaire (Annexe 1) connu sous le
nom de « tetin’akoho ».
Ces facteurs limitent le développement de la filière en milieu rural (6). Cependant,
ces problèmes sanitaires peuvent être réduits par l’amélioration de conduite et du
contrôle sanitaire apportés dans ce système (11).
En élevage traditionnel, on utilise surtout les vaccins produits localement par
l’Institut Malgache des VAccins VETérinaires (IMVAVET). La PESTAVIA®, qui est
un vaccin inactivé, souche mesogène Mukteswar, est le nom du vaccin contre la MN.
I.2. Aviculture moderne
Contrairement à l’aviculture traditionnelle qui est ancienne à Madagascar,
l’aviculture moderne ne date qu’à partir des années 60 (6).
L'intensification de l’aviculture moderne a pris l'essor depuis près d’un demi-
siècle et est devenue une profession pour beaucoup d’éleveurs situés près des grandes
6
agglomérations urbaines (6). Actuellement, les accouveurs ont du mal à couvrir la
demande, par conséquent, les clients doivent commander plusieurs mois à l’avance pour
avoir des poussins.
I.2.1. Habitat
L’aviculture moderne utilise des poulaillers suivant des normes techniques et des
conditions de biosécurité strictes selon les conseils des techniciens d’élevage (6). Les
matériaux utilisés sont couteux.
I.2.2. Alimentation
Trois possibilités existent en matière d’alimentation :
- achat des matières premières (maïs, tourteaux, Complément Minéraux
Vitaminés ou CMV) et formulation par l’éleveur,
- achat d’aliments de fabrication artisanaux en vente un peu partout et dont la
composition en chaque nutriment est très variable,
- achats d’aliments composés de fabrication industrielle ou par les accouveurs
eux-mêmes.
I.2.3. Santé
La maladie de Marek (Annexe 1) a fait beaucoup de ravage dans les élevages de
pondeuses, notamment par une épizootie en 2004-2005 (12). Des cas sont toutefois
enregistrés jusqu’à maintenant. Il y a aussi la maladie de Gumboro, la laryngotrachéite
infectieuse (LTI), l’encéphalomyélite aviaire, la MN et les diverses maladies
parasitaires comme les helminthoses et coccidioses (Annexe 1).
Malgré l’existence de ces maladies, le suivi sanitaire est plus rassurant pour
l’aviculture moderne par rapport à l’aviculture traditionnelle (6). Les accouveurs livrent
des poussins d’un jour déjà vaccinés et avec un protocole de suivi pour les rappels. Ils
fournissent en général les vaccins. Les distributeurs encadreurs appliquent aussi un
protocole de vaccination.
7
II. LES PESTES AVIAIRES
L’IA et la MN sont des maladies virales cosmopolites et hautement contagieuses,
susceptible d’entrainer une forte mortalité chez les oiseaux.
II.1. L’influenza aviaire
II.1.1. Définition
L’IA est une maladie infectieuse, très contagieuse, affectant les oiseaux. Elle est
due à des virus de la famille des Orthomyxoviridae, du genre Influenza de type A. Cette
maladie est répertoriée dans la liste du Code Sanitaire pour les Animaux Terrestre-2011
(13).
II.1.2. Etiologie et pathogénie
II.1.2.1. Morphologie et structure
Les virus influenza sont des orthomyxovirus répartis en trois types A, B, C. Les
virus IA appartiennent au type A qui sont des virus constitués d’un génome segmenté en
huit monobrins d’ARN négatif (14). Ils apparaissent comme des particules de 80 à 120
nanomètres de diamètre.
En microscopie électronique, ils se présentent comme une sphère recouverte de
spicules, correspondant aux deux glycoprotéines dont l'hémagglutinine HA (16 sous-
types) et la neuraminidase NA (9 sous-types), ancrées dans une bicouche lipidique qui
entoure la particule virale. Sous cette enveloppe se trouvent des protéines internes et
matricielles, et au centre, une structure moléculaire hélicoïdale associant l'ARN à des
complexes de nucléoprotéines et de polymérase. Ils sont classés par sous-types, selon
ces deux protéines de surface. Ces dernières peuvent former 144 combinaisons HxNy
possibles. Cependant, seuls les sous-types H5 et H7 ont déjà démontré le potentiel de
devenir hautement pathogène chez la volaille.
8
Figure 2. Schéma de la structure d’une influenza virus A
Source : Brugère-Picoux J 2006
Figure 3. Virus influenza en microscopie électronique
Source : Linda M. 2006
II.1.2.2. Virus faiblement et hautement pathogène
Les virus de l'IA sont divisés en deux catégories en fonction de leur aptitude à
provoquer la maladie (pouvoir pathogène) chez le poulet : l’influenza aviaire faiblement
pathogène (IAFP) et L’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP).
L’hémagglutinine, pour les virus IAHP, est le principal caractère de pathogénicité.
En effet, à ce jour, les virus IAHP appartiennent tous aux sous-types de virus à H5 et
H7. Ces derniers ne sont pas tous hautement pathogènes mais sont susceptibles de le
devenir par mutation (15-17). En effet, les virus pathogènes et non pathogènes se
9
différencient essentiellement par la présence ou non de plusieurs résidus basiques
d’arginine et de lysine au niveau du site de clivage de l’hémagglutinine. L’activation
des hémagglutinines chez les virus hautement ou faiblement pathogènes ne se fait pas
de la même façon, car la sensibilité des sites de clivage est différente :
- les hémagglutinines avec une seule arginine ne peuvent être clivées que par des
protéases cellulaires de type trypsine, présentes seulement sur certaines cellules
respiratoires et digestives de l’hôte. L’infection qui en découle est uniquement
locale et souvent peu pathogène.
- à l’ opposé, les hémagglutinines dont le site de clivage est multi basique sont
activés par des protéases de type furine ubiquitaires chez l’hôte. Cette
caractéristique est à l’origine d’une infection systémique de l’hôte provoquant
une septicémie. Ces virus sont donc dits hautement pathogènes (18).
Ils se différentient aussi par leur indice de pathogénicité intraveineuse (IPIV) chez
le poulet. L’IPIV est inférieur à 1,2, pour les virus IAFP, et supérieur à 1,2 pour les
virus IAHP (19).
La relation entre sous-type et pouvoir pathogène est inexistante au sens strict chez
les oiseaux mais il faut néanmoins accorder une mention particulière aux sous-types H7
ou H5, qui peuvent être à la fois faiblement pathogène et au sein desquels émergent
fréquemment aussi des souches hautement pathogènes. L’IA devant faire alors l’objet
d’une notification à l’OIE, comprend particulièrement ces deux sous-types, (13, 20).
II.1.3. Importance
II.1.3.1. Importance économique
Les conséquences économiques directes et indirectes de l’IAHP sont très lourdes
pour les pays touchés. En effet, outre les pertes liées à la maladie elle-même, s’ajoutent
les restrictions de mouvements d’oiseaux vivants, d’œufs à couver et de viandes de
volailles produits dans la région atteinte ainsi que les coûts des mesures mises en œuvre
pour lutter contre la maladie (21). Plus de 175 millions d’abattage ou de mort de
volailles domestiques ont été recensés en Asie du Sud-Est depuis l’émergence de la
souche H5N1 (22).
10
II.1.3.2. Importance hygiénique
L’IA est une zoonose, c'est-à-dire une maladie qui se transmet des animaux à
l’homme (20). Le contact étroit avec les volailles malades, a été identifié comme facteur
de risque pour l’homme (20). Le virus de l’IAHP de sous-type H5N1, le virus de l'IAFP
et de l'IAHP de sous-type H9N2 et de l'IAFP de type H7N9 ont été à l'origine de foyers
zoonotiques répétés chez l'homme (23). Depuis novembre 2003, 628 cas de « grippe
aviaire » A (H5N1) dont 374 décès ont été déclarés dans 15 pays par l’OMS (24). Ces
foyers n'ont pas révélé de transmission interhumaine. Pourtant, le risque que ces virus
s'adaptent, pour faciliter la transmission interhumaine, représente une plus grande
menace pour la santé publique (23). Il s’agit de la possibilité d’infection mixte chez le
porc par recombinaisons génétiques entre virus aviaires et virus humains. Ce
phénomène pouvant permettre l’émergence de souches adaptées à l’homme (19) et
ayant acquis de nouveaux antigènes de surface empruntés aux souches aviaires vis-à-vis
desquels la population humaine n’est pas immunisée. Ces souches peuvent être à
l’origine de pandémie grippale.
Figure 4. Répartition et nombre de cas humains par pays
Source : OMS, 2013
11
II.1.4. Signes cliniques
Les signes cliniques sont variables et dépendent de la virulence du virus, de
l’espèce hôte et des éventuelles infections intercurrentes (25). La période d’incubation
varie de 3 à 14 jours.
En général, l’infection par des virus de l’IAFP provoque des symptômes moins
graves, tels que plumages ébouriffés, ponte moins fréquente sauf chez la dinde avec une
chute de ponte brutale de 30-80%, des signes respiratoires plus ou moins sévères tels
que larmoiement, écoulement nasal, gonflement des sinus infra-orbitaires, toux,
reniflement, râles, voire suffocation (ou étouffement). Le taux de mortalité est de l’ordre
de 2 à 3 % chez le poulet, jusqu’à plus de 40 % chez les dindonneaux de moins d’un
mois lors de coïnfections bactériennes ou virales et peut aller jusqu’à 20 % chez les
dindes reproductrices (20).
Sous sa forme hautement pathogène, le virus provoque une septicémie. Les
manifestations cliniques suivantes sont observées, en totalité ou en partie : prostration et
apathie extrême, chute soudaine de la ponte avec de nombreux œufs à coquille molle ou
sans coquille, caroncules et crêtes enflées et congestionnées, gonflement du sinus infra-
orbitaire, toux, éternuement et signes nerveux, diarrhée, hémorragie au niveau des
jarrets. Il se peut que l’on constate quelques mortalités de volailles pendant plusieurs
jours suivis d’une propagation rapide avec un taux de mortalité pouvant alors avoisiner
les 100% dans les 48 heures.
II.1.5. Épidémiologie
II.1.5.1. Espèces sensibles
Toutes les espèces aviaires, domestiques (dinde, poulet, pintade, canard, oie,
caille), ou sauvages (en particulier les oiseaux migrateurs de la famille des Anatidés)
sont tous sensibles à des degrés divers, à l’infection. La dinde et le poulet présentent la
plus grande sensibilité clinique alors que le canard est souvent infecté de manière
inapparente (20, 26).
Par ailleurs, des cas d’infection naturelle, par des virus d’origine aviaire, de
plusieurs espèces de mammifères ont été rapportés à savoir porcs, cheval, carnivores
(tigres, léopards, chiens, chats, visons), le rat et la souris, et mammifères marins
(phoque, baleine) ainsi que l’Homme, avec des cas mortels (13, 20).
12
II.1.5.2. Facteurs de risque de l’influenza aviaire
a. Migration des oiseaux aquatiques
La migration des oiseaux aquatiques présente le principal risque de transmission
des virus de l’IAFP (27) sur de longues distances. Elle fournit un réseau complexe parce
que différents courants d’oiseaux migrateurs se chevauchent géographiquement. Il est
généralement proposé que les souches HP ont pour origine des souches FP circulant
dans l’avifaune sauvage, qui après introduction dans la volaille domestique, acquièrent
des caractéristiques génétiques (notamment l’accumulation de plusieurs acides aminés
basiques au niveau du site de clivage de l’HA) leur conférant leur pouvoir pathogène
(28). La souche H5N1 est très différente de toutes les autres souches d’IAHP. En effet,
ce virus est le premier virus IAHP à avoir connu une telle dispersion géographique (29).
Il a été détecté chez plus de 130 espèces d’oiseaux sauvages.
L’infection chez des volailles domestiques se fait par contact avec des zones
fréquentées par les oiseaux sauvages aquatiques soit par l’introduction de ces derniers
dans les zones d’élevage. La transmission du virus peut se produire à partir d’eau
contaminée ainsi que par contact direct entre les oiseaux sauvages et les volailles.
Une bonne biosécurité requiert donc l’installation des barrières physiques entre les
volailles et les oiseaux sauvages et également l’accès à de l’eau propre ou traitée pour
les volailles.
b. Présence d’eau de lac, des étangs
Le virus de la grippe aviaire peut être isolé dans des eaux de lac fréquentées par
des oiseaux aquatiques (30). Les virus de l’influenza survivent généralement bien dans
l’eau et ils peuvent y rester infectieux jusqu’à 4 jours à 22°C et plus de 30 jours à 0°C
(31).
c. Risque lié à l’importation
Comme Madagascar, plusieurs pays, développés ou en voie de développement,
imposent actuellement des embargos sur l’importation de volaille et des produits
dérivés, en provenance de pays infectés par l’IAHP. Les oiseaux vivants représentent de
loin le risque le plus important mais les carcasses entières d’oiseaux infectés, les œufs
de poules infectées, les déchets de volaille contaminés par les matières fécales peuvent
tous être une source d’infection. L’importation de viande fraîche, notamment celle des
13
canards, est le facteur de risque le plus élevé d’introduction du virus de l’IAHP. Il faut
reconnaître que le déplacement illicite d’oiseaux vivants représente également un risque
qui ne sera pas atténué en imposant des embargos sur l’importation légale (32).
d. Flux commerciaux
Les principales voies de passage du virus d’une région à l’autre sont la vente
d’oiseaux infectés sur les marchés, circulation des vendeurs de volailles qui portent des
chaussures et/ou des vêtements contaminés et le transfert de cages et des palettes d’œufs
contaminés sur des marchés ou dans des fermes avicoles (33-36).
e. Risque lié à la circulation de volailles infectées
Certaines espèces de canards peuvent porter les virus de l’influenza sans toutefois
montrer de signe clinique de la maladie. Les jeunes canards ont les taux les plus élevés
d’infection et de diffusion. Les poussins âgés de quelques jours et les œufs à couver ne
sont pas considérés comme présentant des risques élevés, bien que des infections à
l’IAHP ne puissent pas être entièrement exclues. Les pigeons étaient considérés
comme relativement résistants à l’infection par le virus et ils étaient donc un facteur de
risque limité pour la propagation du virus IAHP H5N1. Cependant, des études récentes
ont toutefois montré qu’ils sont susceptibles d’être infectés (37). On ne peut donc pas
exclure que les pigeons puissent être des porteurs mécaniques. Les pigeons voyageurs
de compétition d’un pays à l’autre, associé à la pratique qui consiste à les réunir sur un
même site pour les lâcher, représentent des risques d’introduction spécifiques à ces
oiseaux.
Les sources de virus sont constituées par les oiseaux infectés, qu’ils soient
porteurs sains, malades ou morts et qu’il s’agisse d’oiseaux sauvages (un vaste réservoir
du virus), ou domestiques. Dans les formes graves (septicémie), tous les tissus,
excrétions (fientes, sécrétions respiratoires) et œufs sont virulents. L’excrétion de virus
peut précéder l’apparition des signes cliniques de quelques heures à quelques jours
selon la souche virale en cause et l’espèce d’oiseau infectée (20).
La transmission du virus de l’IA se fait essentiellement de façon directe,
notamment avec les sécrétions respiratoires et les matières fécales des oiseaux infectés,
mais elle peut aussi être indirecte, par l’intermédiaire des aliments, d’eau, des matériels,
des vêtements, d’œufs et des emballages contaminés. Elle s’opère soit par voie aérienne
14
(par inhalation d’aérosols ou de poussières infectées), soit par voie digestive (par
ingestion d’eau ou d’aliment contaminés par des matières fécales infectées) (20).
II.1.6. Situation mondiale actuelle de l’IAHP de sous-type H5N1
La situation de l'influenza aviaire dans le monde attire depuis plusieurs années
l'attention de la communauté internationale. L’Office International des Epizooties (OIE)
assure en ce sens un suivi épidémiologique de cette maladie, à échelle mondiale. L’IA
elle-même figure déjà dans la liste de l’OIE dont les données afférentes sont mises à
jour et disponibles sur son site.
Figure 5. Carte des foyers de maladie (2005-2012)
Source : WAHID OIE 2012
Pour l’année 2010, 11 pays tels que : Bangladesh, Bulgarie, Cambodge, Chine,
Hong Kong, Israël, Myanmar, Népal, Roumanie, Vietnam, Laos ont déclaré la présence
de l'IA à virus H5N1 dans leurs territoires, chez des volailles domestiques ou des
oiseaux sauvages (13).
L’épizootie d’IAHP se poursuit en Egypte et en Indonésie, zones d’endémie, mais
aussi au Bangladesh et au Vietnam; deux cas ont été identifiés sur la faune sauvage en
Bulgarie et à Hong-Kong. Un cas humains suivi de décès a été rapporté en Egypte; deux
cas humains non suivis de décès, ont été notifiés au Vietnam (38).
15
II.1.6.1. Chronologie de la panzootie de l’influenza aviaire
L’IA a été décrite depuis 1878 dans le nord de l’Italie. A cette époque, appelée
« peste aviaire » cette maladie a été confondue avec une forme septicémique aigue de
choléra aviaire (Annexe 1). Mais en 2003 (Tableau I) est considérée comme l’année de
départ de la panzootie actuelle (39).
II.1.7. L’influenza aviaire à Madagascar
Madagascar n’a jamais notifié de foyer d’IAHP (H5N1 ni d’autres souches) (4,
40). Au titre de la prévention et de l’amélioration des capacités de réaction rapide, il a
bénéficié de projets portant sur cette maladie, dans le cadre du système de prévention et
de réponse rapide contre les ravageurs et les maladies transfrontières des animaux et des
plantes (41). Néanmoins l’IAFP est présent sur l’île. Une étude transversale réalisée en
1999 a mis en évidence une séroprévalence instantanée, en influenza A, de 14,9% chez
les poulets et de 2,8% chez les palmipèdes (4).
Les autorités sanitaires malgaches considèrent au sérieux, la menace que
représente le virus H5N1. Un Comité National de Lutte Contre la Grippe Aviaire
(CNLGPA) a été mis en place en 2006. Des exercices de simulation d’épizootie ont été
réalisés de manière à mettre au point et tester un plan de réaction d’urgence. Douze sites
ont été considérés comme zones à risque.
D’autres projets sont terminés et en cours comme GRIPAVI1. En 2008, une étude,
réalisée dans le cadre de ce dernier, dans trois sites aux alentours d’Antananarivo a
révélé une séroprévalence de 2,5% d’IAFP (42) et au Lac Alaotra 25% (43).
1 Un projet financé par le Ministère des affaires étrangères français. Il travail sur l’épidémiologie et l’écologie de l’IA et de la MN dans les pays du Sud
16
Tableau I. Chronologie de la panzootie de l’influenza aviaire
Année Evènements
2003 H5N1 en Asie du Sud-est
Foyers d’IA extrêmement pathogène, chez les volailles au Pays-Bas
2004 Onze cas d'infection de l'IA H5N1 en Japon.
Vingt-sept cas d’infection H5N1 au Viêt-Nam (19 cas) et en Thaïlande
(8 cas).
2005 Foyer d'IA dans un élevage de volailles à Anatolie Turquie.
2006 Premier foyer d'IA sur les oiseaux sauvages dans les Dombes au Niger
Nouveau cas humain de l'IA H5N1 en Chine
2007 Premier foyer d'infection par IA H5N1 chez les dindes au Royaume-Uni
Trois nouveaux cas d'infection humaine par l’IA H5N1 en Chine (1 cas)
et Indonésie (2 cas).
Présence du virus H5N1 en Moselle en France
2008 Arrêté du 18 janvier 2008 fixant des mesures techniques et
administratives relatives à la lutte contre l'IA en France.
2009 La Thaïlande s'auto-déclare indemne de l'IAHP
Foyer à virus H5N1 dans un village de Phongsaly
2010 Collaboration FAO-OIE-OMS
2011 H5N1 en Inde, Indonésie, Cambodge, Nepal, Chine, Corée, Vietnam.
2012 1220 cas d’IA H5 en Nepal (Octobre) 3481 cas en Inde (Octobre)
2013 Chine notifie un évènement exceptionnel d’influenza A (H7N9)
Source : OIE, 2012
17
Figure 6. Prévalence de l'influenza aviaire chez le poulet gasy et palmipèdes à
Madagascar.
Source : Porphyre, 1999
II.2. La maladie de Newcastle
II.2.1. Définition
La MN ou pseudo peste aviaire est une virose aviaire hautement contagieuse,
affectant électivement les oiseaux, notamment les poulets et les dindes. Elle est due à un
paramyxovirus de sérotype 1(APMV-1) (44-45), du genre Avulavirus, appartenant à la
famille des Paramyxoviridae. Il existe neuf sérotypes de paramyxovirus appelés APMV-
1 à APMV-9.
Sous sa forme hautement pathogène, la MN est visée par le Code sanitaire pour
les animaux terrestres 2011 de l’OIE et compte parmi les maladies à déclaration
obligatoire (46). La maladie se manifeste généralement par des signes respiratoires mais
le tableau clinique peut être dominé par un abattement, des manifestations nerveuses ou
des diarrhées (46).
ANTSIRABE I
TSIROANOMANDIDY
AMBATOLAMPY
7
25
12
7 - 25 (n=3)
0 (n=10)
Prévalence individuelle de l ’influenza aviairedans la population de palmipèdesN N
18
II.2.2. Etiologie et pathogénie
II.2.2.1. Morphologie et structure du virus
Les Paramyxoviridae sont des virus enveloppés, pléomorphes de 150 à 200, voire
600 nm de diamètre. L’enveloppe présente deux types de spicules glycoprotéiques, la
glycoprotéine HN (activité hémaglutinante H, et neuraminidasique N) et la
glycoprotéine F qui est responsable de la pénétration cellulaire du virion. Leur matériel
génétique est constitué d’un ARN monocaténaire non segmenté de polarité négative
(47).
II.2.2.2. Pouvoir pathogène
L'une des caractéristiques majeures du virus est la forte variation du pouvoir
pathogène des différentes souches virales, particulièrement chez les poulets. Les
souches virales ont été classées en cinq pathotypes sur la base des signes cliniques
observés chez les poulets infectés, à savoir :
1. Les souches viscérotropes vélogènes hautement pathogènes qui
provoquent fréquemment des lésions intestinales hémorragiques
2. Les souches neurotropes vélogènes qui provoquent une forme se
caractérisant par une mortalité massive, généralement à la suite de signes respiratoires et
nerveux
3. Les souches mésogènes qui provoquent une forme se caractérisant par des
signes respiratoires, des signes nerveux occasionnels mais une faible mortalité
4. les souches lentogènes ou respiratoires qui provoquent une forme se
traduisant par une infection respiratoire mineure ou infra clinique
5. les souches asymptomatiques entériques qui provoquent une forme se
traduisant généralement par une infection intestinale infra clinique.
Le classement par pathotypes produit rarement des catégories bien distinctes et
même les infections provoquées chez des oiseaux indemnes d’organismes pathogènes
spécifiques peuvent donner lieu à des chevauchements considérables. Il peut aussi se
produire une exacerbation des signes cliniques induits par les souches les moins
virulentes en cas d’infection concomitante par d'autres micro-organismes ou en
présence de certaines conditions environnementales (48).
19
L’OIE définit la forme virulente de la MN comme une infection de volailles, de
pigeons voyageurs et oiseaux maintenus en captivité provoquée par un APMV-1
présentant un indice de pathogénicité par voie intracrânienne (IPIC) chez le poussin
(Gallus gallus) d’un jour supérieur à 0,7. Elle présente plus de trois acides aminés
basiques sur le site de clivage de la protéine de fusion, ce qui peut se déterminer par
séquençage du fragment de gêne correspondant. Ces définitions incluent donc les
pathotypes viraux définis comme vélogènes ou mésogènes, tandis que les souches
virales lentogènes comprennent les virus vaccinaux vivants atténués.
II.2.3. Importance
II.2.3.1. Importance économique
La MN est caractérisée par son importance économique considérable. L’éleveur
subit le premier dommage car elle lui représente un danger permanent par les pertes
dues à la mortalité consécutive à une épizootie. Le taux de mortalité peut dépasser 60%
du cheptel (49). Cette perte se manifeste également par la diminution de la production
d’œufs et de chair. Elle est aussi un fléau majeur de l’élevage avicole en raison de cette
gravité médicale (létalité élevée) et de sa forte contagiosité génératrice d’épizootie
meurtrière en territoire vierge.
II.2.3.2. Importance hygiénique
La MN est une zoonose mineure2 . Chez l’homme, elle peut provoquer une
conjonctivite bénigne (50) et spontanément résolutive (46). Des symptômes
asthmatiformes peuvent être observés après contacts avec des aérosols vaccinaux.
II.2.4. Signes cliniques
La période d’incubation (2 à 15 jours) et les symptômes sont variables en fonction
de la virulence du virus, de l’espèce hôte, de l’âge et du statut immunitaire de l’oiseau,
des stress environnementales, ainsi que des infections intercurrentes. Les souches
virales extrêmement pathogènes entraînent une mortalité soudaine en 24 à 48 heures,
parfois sans autre signe clinique excepté un œdème péri oculaire ou facial. Avec les
virus moyennement pathogènes, l’évolution clinique se fait généralement en trois
phases :
2 Zoonose mineure : maladie animale qui peut infecter l’homme et provoquer une maladie.
20
- Des symptômes généraux : inappétence puis prostration
- Des signes digestifs (diarrhée souvent verdâtre) et/ou respiratoires sévères
(halètement, toux, éternuement et râle) suivis de troubles nerveux (tremblement,
paralysie des ailes et des pattes, torticolis, marche en cercle, spasmes et
paralysies) (Figure 7). La chute de ponte peut alors être brutale.
- Une évolution rapide vers la mort, ou bien la guérison (rare) accompagnée de
séquelles nerveuses telles que torticolis, paralysie des membres, opisthotonos
(Figure 8) et d’anomalies de ponte (Figure 9).
Figure 7. Maladie de Newcastle chez le poulet : troubles nerveux, prostration
Source: Cliché D.Balloy. In Picault J-P, Jestin V, 2008
Figure 8. Maladie de Newcastle chez le poulet : Poulet présentant un torticolis
Source: Cliché LDA 22. In Picault J-P, Jestin V, 2008
21
Figure 9. Maladie de Newcastle chez la poule : œufs décolorés, déformés et de
petit calibre
Source: Cliché D.Balloy. In Picault J-P, Jestin V, 2008
II.2.5. Epidémiologie
II.2.5.1. Epidémiologie descriptive
a. Espèces sensibles
Deux cent trente-six espèces aviaires qui appartiennent à 27 ordres parmi les cinq
existants dans la classe des oiseaux sont réceptifs à l’APMV-1 (51). Parmi les volailles
domestiques, les poulets, les pintades et les dindons sont les plus sensibles (19), les
canards et les oies sont les moins sensibles mais ils peuvent être porteurs de souches
virales potentiellement pathogènes pour d’autres espèces. Le pigeon peut être infecté
par les virus variants, et on parle alors de paramyxovirose du pigeon (37). Le portage de
virus peut exister chez les Psittacidae (perroquet) et chez certains autres oiseaux
sauvages qui ont un rôle important dans la dissémination du virus. Les mammifères
sont, dans l’ensemble, insensibles au virus mais certains d’entre eux comme le chat, la
souris ou l’homme sont capable de multiplier transitoirement le virus. La mortalité et la
morbidité varient selon les espèces hôtes et en fonction de la souche virale (52).
b. Mode de transmission du virus
La transmission peut se faire de façon directe c'est-à-dire le contact avec les
sécrétions, notamment respiratoires et les matières fécales des oiseaux infectés. Elle
peut se faire aussi de façon indirecte, par l’intermédiaire des aliments, eau, instruments,
locaux, vêtements contaminés.
22
Transmission verticale3: pour les souches virulentes, elle est à priori peu probable
car la MN provoque une chute de ponte et la multiplication virale dans l’œuf entraîne
généralement (mais pas systématiquement) la mort de l’embryon. En revanche, les
coquilles des œufs des oiseaux contaminés peuvent facilement être souillées par des
fèces infectées. Quel que soit les modalités précises d’infection, des poussins infectés
par des souches virulentes ou non peuvent éclore. Les virus sont excrétés pendant la
période d'incubation et sur une période limitée au cours de la convalescence (jusqu’à 2
mois après guérison). Toutes les parties de la carcasse peuvent être sources de virus.
II.2.5.2. Facteurs de risques de la maladie de Newcastle
Les réservoirs du virus sont constitués essentiellement d’oiseaux malades et ceux
qui sont porteurs (porteurs sains, chroniques ou vaccinés).
a. Risque lié à la commercialisation de volailles
Les élevages indemnes peuvent être infectés non seulement à partir du réservoir
sauvage mais aussi par l’intermédiaire du commerce d’oiseaux infectés (volailles,
oiseaux d’agrément) ou de produits d’origine aviaire (carcasses contaminées, œufs
souillés) (53-54). En élevage villageois, les éleveurs ont tendance à apporter rapidement
au marché ou de vendre à des voisins ou à des collecteurs du village les volailles
(malades ou non), en cas de survenue de maladie. Cette réalité existe aussi à
Madagascar (12).
b. Risque lié au mouvement des gens et des équipements
Les éleveurs, les personnels de santé animale peuvent être responsable de la
dissémination du virus en faisant des mouvements d’un élevage à un autre ou en
utilisant des matériels contaminés. Les équipements d’élevage peuvent être aussi source
de contamination lorsqu’ils sont communs pour deux ou plusieurs élevages.
La contamination des élevages se fait par voie aérienne et explique la très grande
transmission d’un élevage à l’autre de la maladie en période de vents (55).
3 Transmission verticale : transmission du virus de la poule à l’œuf
23
II.2.5.3. Répartition géographique
Décrite pour la première fois en 1926 à Newcastle-upon-Tyne (Royaume-Uni) et à
Java (Indonésie), la MN a été ensuite observée sur tous les continents mais ce sont les
continents africains, américains et asiatiques qui sont les plus touchés.
Selon les pays, leurs pratiques prophylactiques et les périodes, elle évolue sous
une forme enzootique, ou se manifeste par des épizooties meurtrières parfois très
difficilement maîtrisées.
La « paramyxovirose du pigeon » (MN chez les pigeons) est apparue au cours des
années 1980, et très rapidement, prise la forme d’une panzootie. Depuis, elle est restée
enzootique sur tous les continents.
Le cas de Madagascar est identique au cas Africain. La maladie est apparue
en1946, après la deuxième guerre mondiale.
II.2.6. La maladie de Newcastle à Madagascar
La MN ne semble pas être connue avant la seconde guerre mondiale sur
Madagascar mais, à partir de 1950, elle est bien installée et provoque des enzooties
meurtrières. Elle est aujourd'hui, avec le choléra aviaire, le principal souci des
aviculteurs (4) (Figure 10).
Des enquêtes sérologiques, effectuées lors d’un suivi longitudinal pendant 12
mois (du Mai 1999 au Mai 2000), dans la commune d'Ambohimangakely (zone 1), et
dans la sous-préfecture de Moramanga (zone 2), ont révélé des séquelles
immunologiques spécifiques de la MN, en particulier chez les adultes. Il a été remarqué
toutefois qu'il existe une population négative composée surtout de jeunes. Pour cette
étude, pendant la saison sèche, la MN a été responsable de 62,5% (zone 1) à plus de
82% (zone 2) de mortalités chez les poulets. Pendant la saison humide, la MN a été
venue en tête des facteurs les plus meurtriers, en étant la cause des 61,1% (zone 1) et
des 64,1% (zone 2) des mortalités (7).
Toujours dans le cadre de cette étude, les courbes d'évolution du cheptel des deux
zones ont montré l'existence de deux pics. Chaque pic est suivi d'une phase régressive
annonçant la chute des effectifs. Cette période coïncide toujours à des moments
d'explosion de MN (7).
24
Une étude récente a présenté, pour la première fois, une caractérisation
moléculaire des quatre virus de la MN circulant à Madagascar. Par des analyses
phylogénétiques, cette étude a fourni une preuve de l’existence d’un nouveau génotype
XI appelé MG (Malgache group), proche d’un ancien génotype IV. Les résultats de
cette étude ont montré aussi que tous les épitopes neutralisant décrits ont été conservés
entre les souches malgaches et vaccinales (56).
Figure 10. Prévalence individuelle de la maladie de Newcastle dans la population
de poulets
Source : Porphyre 1999
75 - 100 (n=3)
50 - 75 (n=1)
25 - 50 (n=8)
1 - 25 (n=4)
Prévalence individuelle de la maladie de Newcastle dans la population de poulets de brousse N
Partie II : METHODOLOGIE
25
PARTIE II.METHODOLOGIE
I. ZONE D’ETUDE
I.1. Localisation et milieu physique
L’étude s’est déroulée, dans la zone du lac Alaotra, située au moyen-est de
Madagascar, dans la région Alaotra Mangoro. Elle est à 260 km (par voie routière) au
Nord Est d’Antananarivo. L’Alaotra est composée de trois districts : Andilamena au
Nord-Est, Amparafaravola à l’Ouest et Ambatondrazaka à l’Est. La zone du Lac Alaotra
possède un climat de type tropical comportant deux saisons bien marquées : d’avril à
septembre, une saison sèche; d’octobre à mars, une saison chaude et pluvieuse. La
température moyenne est de 21 à 22°C (57). La pluviométrie annuelle est de 1092 mm à
1200 mm à raison de 100 jours de pluie par an (57).
I.2. Agriculture
L’agriculture représente la principale activité de la population de la zone. La
riziculture est la production prédominante (Tableau II), avec une grande surface de terre
cultivable. Elle possède plus de 70.000 ha de rizières (57-58). La région est
communément connue comme le grenier à riz de Madagascar.
Tableau II. Production de riz dans la région du lac Alaotra selon le type de
culture (année 2007)
Riz contre saison
(tonne)
Riz non irrigué
(tonne)
Riz irrigué
(tonne)
3 608 3 032 343 871
Source : DRDR Alaotra Mangoro, 2007
D’autres cultures vivrières sont aussi pratiquées dans la zone selon la spécialité de
chaque district (Tableau III). La diversité de cultures permet ainsi de combler le manque
pendant la période de soudure.
26
Tableau III. Production de cultures vivrières au lac Alaotra (en tonne)
Spéculation
District
Maïs Arachide Manioc Haricot Tomate Oignon Patate
douce
Concombre
Ambatondrazaka 763 996 3671 212 260 638 402 240
Amparafaravola 970 426 15517 602 403 - 510 -
Total 1733 1420 19188 814 663 638 912 240
Source : DRDR Alaotra Mangoro, 2007
I.3. Elevage
La zone du lac Alaotra est à la fois un grand bassin de production agricole et
d’élevage. L’élevage de bovin a subi une diminution du cheptel entre 2003 (58) et 2009
dans les districts d’Ambatondrazaka et d’Amparafaravola. Tandis que les autres espèces
surtout la volaille en ont trouvé une augmentation. En aviculture, 532 850 têtes ont été
dénombrées dans cette zone en 2003 (58). Le tableau IV illustre l’importance de
l’aviculture par rapport aux autres espèces dans la zone pour l’année 2009.
Tableau IV. Effectif des animaux par espèce dans la région du lac Alaotra
District Bovin Porcin Ovin Volaille
Ambatondrazaka 75 474 9 498 17 800 705 290
Amparafaravola 56 382 9 032 6 700 590 457
Total 131 856 18 530 24 500 1 295 747
Source : Service vétérinaire régional, 2010
Les élevages familiaux de poulets « Gasy » et toutes les autres espèces de volaille
de basse-cour sont très répandus. Elle est très connue pour l’élevage d’oies en mode
traditionnel. Elle en approvisionne les marchés de la capitale et ceux de Toamasina
surtout pendant les périodes de fêtes (57). Les animaux sont parqués la nuit et en liberté
le jour. Les élevages sont en contacts fréquents avec l’avifaune sauvage, notamment
dans les communes situées au bord du lac. Soixante-douze espèce d’oiseaux sauvages
sont recensées dans cette zone, dont 50 sont présentes en permanence notamment les
anatidés (59-60).
27
En termes de maladie des volailles, les éleveurs considèrent comme événement
ordinaire l’explosion au moins une fois par an de foyers de pestes aviaires. Ils les
appellent toujours «Moafo» quel que soit l’agent pathogène en question. La MN tient
encore une place importante parmi ces maladies de volailles. Un réseau de surveillance
épidémiologique mis en place dans cette zone a détecté 35 foyers de maladies cliniques
en 12 mois. Vingt six foyers sur les 35 soit 74% étaient confirmés comme due à la MN
(61). Une étude sur la diffusion des pestes aviaires dans les petits élevages familiaux des
hauts plateaux malgaches (43) a montré que la circulation des deux virus était plus
importante au lac Alaotra caractérisé par les rizières, les eaux de surface et les
palmipèdes (62).
C’est cette structure d’agroécosystème constituée de rizière, mixité d’élevage,
(62) contact avec l’avifaune sauvage (63) et flux de commercialisation complexe4 (43)
qui ont amené à choisir la zone du lac Alaotra comme site d’étude.
Trois communes d’étude (Figure 11) ont été choisies selon l’agro-écotype :
D’abord, la commune d’Anororo choisie comme « milieu humide5 », elle se
trouve dans la partie Ouest de la région Alaotra. Puis la commune d’Ampitatsimo
choisie comme « milieu rizière », elle se trouve au Sud de la commune urbaine
d’Ambatondrazaka. C’est le site le plus proche de cette dernière. Enfin, la commune
d’Imerimandroso choisie comme « milieu sec », elle se trouve dans la partie Est de la
région Alaotra.
4 Implique l’interaction d’un grand nombre d’acteurs à savoir les éleveurs, collecteurs de différents niveaux, marchés de volailles vivantes 5 Commune située au bord du lac, plongée dans des eaux libres
28
Figure 11. Localisation des communes d’étude
Source : FTM BD500
Lac RN : Route Nationale
RNC : Route Nationale Communale
Communes d’étude
29
II. TYPE ET POPULATION D’ETUDE
Il s’agit d’un suivi longitudinal. L’unité épidémiologique suivie était les
communes ou les sous-populations de volailles par agro-écotype.
La population cible inclue toutes les volailles du lac Alaotra et la population
d’étude était les volailles dans les communes choisies.
III. ECHANTILLONNAGE
La population d’étude a été subdivisée en trois strates selon l’agro-écotype c’est-
à-dire de la commune, ce qui a donné trois sous-populations.
III.1. Choix des animaux
Il s’agit d’un échantillonnage non aléatoire. Les volailles prélevées ont été
choisies selon l’acceptation des éleveurs et les guides des personnes ressources.
III.2. Critères d’inclusion
Seules les jeunes volailles entre un et trois mois d’âge ont été prélevées, c’est-à-
dire celles nouvellement exposées dans les deux mois avant la période de prélèvement.
Par conséquent, seuls les élevages possédant des volailles entre un et trois mois d’âge
ont fait partie de l’enquête.
III.3. Taille de l’échantillon
La taille de l’échantillon, ou le nombre de tête à prélever, a été obtenue par calcul
sous le logiciel WinEpiscope 2.0 avec les paramètres suivants: prévalence attendue de
7%, avec une précision absolue de 5%. Ce qui a donné 100 têtes de volailles par
commune par période de prélèvement.
Le nombre d’élevages visités n’a pas été fixé à l’avance. Il y a eu autant
d’élevages jusqu’à ce que le nombre d’animaux à prélever ait été atteint.
IV. COLLECTE DE DONNEES
La collecte de données a été réalisée pendant une année (Janvier à Décembre
2010). Les données cibles étaient :
- statuts sérologiques des volailles par rapport à la MN et à l’IA après chaque
période d’exposition
- les facteurs de variation possibles des incidences des pestes aviaires.
30
IV.1. Enquête
La collecte des données cibles a été effectuée par enquête en face à face auprès des
éleveurs en utilisant un questionnaire. Pour ce faire, les étapes suivantes ont été suivies :
- Préparation du questionnaire
Les facteurs de variation possibles ont été relevés par une revue de la littérature. Le
questionnaire a été établi à partir de ces facteurs (Annexe 2).
- Test du questionnaire
La compréhension des questions et la faisabilité pratique de l’enquête ont été
testées.
- Enquête proprement dite
Tous les deux mois, à partir de Février 2010, des enquêtes auprès des éleveurs
possédant des animaux à prélever ont été réalisées.
Le questionnaire d’enquête comprenait les thèmes suivants :
- identification et localisation des élevages
- cheptel de volailles
Cette partie a fourni le nombre de volailles par espèce et par catégorie d’âge dans
l’élevage. Elle a aussi mentionné la présence ou non de porc.
- vaccination
Cette partie a montré si l’éleveur vaccine ou non leurs volailles mais aussi des
informations sur qui vaccine ? Quel est le nom du vaccin? Et à quelle fréquence ?
- données sanitaires
Cette partie a fourni des données sur l’antécédent de clinique dans l’élevage telles
que la date du dernier passage de maladie, les espèces atteintes, les symptômes, le
nombre de volailles avant la maladie, le nombre de malades et le nombre de morts.
- Fiche commémorative des individus prélevés
Cette partie enregistrait les animaux prélevés avec le numéro d’identification,
l’espèce, l’âge et le statut vaccinal.
31
IV.2. Prélèvements biologiques
Une campagne de prélèvements sanguins a été réalisée tous les deux mois pendant
la période d’étude. En tout, six campagnes de prélèvement par commune ont été
réalisées. Une personne ressource, par commune, a été contactée pour faciliter l’accès
aux élevages. Elle peut être le Chef fokontany, l’ACSA6, ou le policier communal.
La ponction veineuse a été réalisée à la veine alaire, à l’aide d’une seringue de
2ml ou seringue à insuline selon la taille de l’animal. Les seringues pleines ont été
identifiées en double (l’un sur le corps et un autre sur le bout du piston), avec le numéro
d’identification de chaque oiseau prélevé (MGS_num) à l’aide d’une encre indélébile
qui ne s’efface pas avec l’humidité. Chaque individu prélevé a été enregistré dans la
fiche commémorative (Annexe 2).
Tous les prélèvements ont été apportés au laboratoire régional de diagnostic
d’Ambatondrazaka après chaque campagne. Puis la séparation7 et la conservation des
sérums (à -20°C) ont été réalisées dans ce laboratoire. Ensuite, les sérums ont été
transportés sous-froid au laboratoire d’immunologie au DRZV pour les analyses
sérologiques.
IV.3. Considération éthique
La mairie de chaque commune d’étude a été prévenue de l’existence du projet, de
ses objectifs et de la campagne de prélèvement tous les deux mois. L’approche au sein
des élévages a été expliqué. L’enquête et les prélèvements ont été réalisés sous
l’acceptation des éleveurs. Pendant les séances de prélèvement, des blouses, des gants
ont été portés par chaque membre de l’équipe, afin d’éviter la propagation inter-élevage,
voire inter-commune des maladies. Plusieurs techniques de manipulation (Annexe 3)
ont été adoptées pour éviter la contamination des matériels de prélèvement, et d’autres
problèmes secondaires pouvant affecter la santé des volailles prélevées.
V. ANALYSE DE LABORATOIRE
Le test ELISA de compétition a été utilisé pour les deux maladies avec un kit
spécifique pour chaque maladie. 6 Eleveurs élus et formés par l’AVSF pour faire des minimums de soins vétérinaires comme la vaccination des animaux dans les villages 7 Pour obtenir le sérum à partir du sang prélevé, il faut le séparer du culot sanguin par centrifugation.
32
V.1. Analyse sérologique de l’influenza aviaire
Le Kit ID Screen R de compétition d’anticorps d’influenza A, fabriqué par
IDVET a été utilisé. Ce Kit de diagnostic est destiné à la mise en évidence d’anticorps
dirigés contre la nucléoprotéine du virus Influenza A. Les cupules sont sensibilisées
avec la nucléoprotéine. Les échantillons à tester et les contrôles sont distribués dans les
cupules. Les anticorps anti-nucléoprotéines s’ils sont présents, forment un complexe
antigène-anticorps qui masque les épitopes de la nucléoprotéine.
Un conjugué anti-nucléoprotéine marqué à la peroxydase est distribué dans les
cupules. Ils se fixent sur les épitopes nucléoprotéines qui restent libres, formant un
complexe antigène-conjugué-peroxydase. Après élimination du conjugué en excès par
lavage, la réaction est révélée par une solution de révélation. En l’absence d’anticorps
dans l’échantillon, il apparait une coloration bleue qui devient jaune après avoir ajouté
de la solution d’arrêt. En présence d’anticorps dans l’échantillon, aucune coloration
n’apparaisse.
V.2. Analyse sérologique de la maladie de Newcastle
Le Kit SVANOVIR fourni par LSI (Laboratoire Service International, Lyon
France) a été utilisé. Ce Kit est utilisable pour la détection spécifique des anticorps anti-
MN chez toutes les espèces. Il est basé sur une technique ELISA de compétition. Les
échantillons (sérums) sont distribuées dans des cupules sensibilisées avec de l’antigène
MN inactivé. Les anticorps anti-MN s’ils sont présents dans l’échantillon, se fixent sur
l’antigène présent sur les cupules et occupent les sites antigéniques. En l’absence
d’anticorps dans l’échantillon, les sites antigéniques restent libres. Le conjugué
(Anticorps monoclonal anti-MN marqué à la peroxydase) se fixera sur les sites
antigéniques restés libres. La coloration se développera par distribution d’un substrat de
la peroxydase. La densité optique (DO) est mesurée à 450 nm par un spectro-
photomètre.
VI. TRAITEMENT ET ANALYSE DE DONNEES
Les données ont été stockées et traitées sous Excel et microsoft Access. Elles ont
été analysées sous le logiciel R 2.15.1.
33
VI.1. Stockage et traitement des données
Les données ont été stockées dans une base de données relationnelle (microsoft
Access) permettant la gestion de l’ensemble de données (Figure 12). Les tables sont
reliées entre elles par des « relations » (Figure 12).
Pour pouvoir entamer l’analyse de données, la base a été nettoyée. Les fautes de
saisie ont été corrigées. Les doublons et les enregistrements non complets (oiseaux qui
n’ont pas de sérum lors de prélèvement, mais enregistrés dans la table prélèvement) ont
été éliminés.
Figure 12. Relation entre les différentes tables existantes
Source : Auteur
VI.2. Analyse des données
VI.2.1. Les variables d’intérêt
La variable étudiée ou dépendante était le statut sérologique des individus vis-à-
vis des pestes aviaires. Les variables explicatives (Tableau V) étaient les facteurs de
risque. Dix variables explicatives ont été choisies à savoir l’agro-écotype (64-65), la
période d’exposition8, la densité d’élevage (66), la mixité de volailles9 (64, 12), la
mixité d’élevage avec le porc (64), l’agent vaccinateur, la fréquence de vaccination
contre la MN (67), l’antécédent de clinique dans l’élevage, l’espèce et l’âge.
8 Période d’exposition : les deux mois avant la campagne de prélèvement 9 Mélange de différentes espèces de volailles dans l’élevage
34
La variable clinique signifie le passage ou non de maladie dans l’élevage surtout
dans les deux mois avant la campagne de prélèvement.
La densité d’élevage, l’âge de volailles et la période d’exposition ont été analysées
sous plusieurs formes. L’âge et la densité ont été analysés sous forme quantitative, et
sous forme de classification par deux puis par quatre catégories. La période d’exposition
a été classée par période de prélèvement puis par saison.
VI.2.2. Synthèse des données collectées
Des statistiques descriptives des variables ont été effectuées pour mieux
appréhender les données obtenues. Elles permettaient de déterminer la distribution des
différentes modalités de chaque variable. Les données ont été présentées selon les trois
niveaux : village, élevage et individu. Elle consistait à décrire les variables selon leurs
types. Les variables qualitatives ont été présentées sous forme de tableau avec
l’effectif de chaque modalité. Pour les variables quantitatives (densité et âge), des
graphiques (boîtes à moustaches), ont été effectués.
VI.2.3. Evolution des incidences des pestes aviaires
A chaque campagne de prélèvement correspondait une incidence bimestrielle des
pestes aviaires. Des graphiques montrant les évolutions globales puis par agro-écotype
de ces incidences ont été réalisées. Ils ont permis de montrer les pics d’incidence ou les
périodes de fortes infections.
35
Tableau V. Types des variables d’intérêt et modalités
Type de variables Variables Modalités Observation
Qualitative
nominale
Agro-
écotype
Milieu sec Caractéristique agro-
écologique des communes
suivies
Milieu rizière
Milieu humide
Période
d’exposition
Jan-Fév 2010 Deux mois précédant la
campagne de prélèvement Mar-Avr 2010
Mai-Juin 2010
Juillet-Aout 2010
Sept-Oct 2010
Nov-Déc 2010
Vaccinateur
Technicien
d’élevage10
Catégorie d’acteurs qui font la
vaccination
ACSA
Informels11
Espèce
Palmipède Différentes espèces de
volailles Gallinacé
Binaires
Mixité
volaille
Non Mélange ou non entre
palmipède et poulet Oui
Mixité porc Non Mélange ou non entre volailles
et porc Oui
Qualitative
ordinale
Fréquence
vaccination
Moins de 3 mois Fréquence de vaccination
contre la MN 3 mois
6 mois
Quantitative
Age Age individu Age en semaine
Densité Cheptel élevage Nombre de volailles dans les
élevages enquêtés
Source : Auteur
10 La modalité technicien d’élevage regroupe les Docteurs vétérinaires et les techniciens d’élevage proprement dite 11 Vaccinateurs informels : ce sont des gens qui ne sont pas légalement autorisés à faire la vaccination alors qu’ils vaccinent dans les villages et appelés par les éleveurs comme « vaccinateur »
36
VI.2.4. Facteurs de variation
Pour étudier l’influence des variables explicatives sur la variable étudiée, le
modèle linéaire généralisé mixte (GLMM) (68) a été utilisé comme modèle statistique.
Ce modèle permettait d’avoir le coefficient associé à chaque modalité des variables.
L’exponentiel du coefficient de chaque variable permettait par la suite d’obtenir l’OR12.
Pour la MN, les volailles vaccinées contre cette maladie ont été éliminées du
tableau d’analyse pour ne pas fausser le résultat avec les réponses vaccinales positives.
VI.2.4.1. Analyse univariée
L’analyse univariée consistait à vérifier l’association de chaque variable
explicative avec la variable dépendante. Pendant cette phase, les variables explicatives
potentiellement associées à la variable dépendante (p<0,25) ont été sélectionnées pour
l’analyse multivariée.
VI.2.4.2. Analyse multivariée
L’analyse multivariée quantifiait l’association entre la variable dépendante et une
variable explicative en prenant en compte d’autres facteurs. Cette étape consistait à
inclure ensemble toutes les variables sélectionnées lors de l’analyse univariée puis de
retirer les non significatives. Le modèle final a été atteint et constitué par un plus petit
nombre possible de variables explicatives liées significativement (p<0,05) à la variable
dépendante. Enfin, l’existence d’interaction entre les variables du modèle final a été
aussi vérifiée.
VI.2.5. Influence de la vaccination contre la maladie de Newcastle
La variable « vaccination individuelle » a été étudiée à part. En effet, les volailles
vaccinées pourront fausser le résultat d’analyse des autres variables par les réponses
vaccinales. Les proportions des élevages et volailles vaccinés ont été calculées. Le taux
de réponse vaccinale positive13 a été évalué. Ce taux est égal au nombre d’oiseaux
vaccinés présentant des résultats sérologiques positifs (réponse vaccinale) sur tous les
12 L’OR ou rapport des cotes c’est le rapport du nombre de sujet présentant l’événement (séropositif à la maladie) divisé par le nombre de sujets ne présentant pas l’événement. Un OR égal à 1 correspond à l’absence d’effet, un OR inférieur à 1correspond à un effet bénéfique et un OR supérieur à 1 correspond à un effet délétère 13 Nombre d’animaux vaccinés présentant des résultats sérologiques positifs vis-à-vis de la MN
37
oiseaux vaccinés. L’influence des variables liées à la vaccination individuelle sur la
réponse vaccinale a été testée. La variable dépendante était la réponse vaccinale positive
ou négative. Les variables explicatives étaient l’agent vaccinateur, la fréquence de
vaccination, l’agro-écotype et l’antécédent de clinique dans l’élevage.
Partie III : RESULTATS
38
PARTIE III. RESULTATS
I. DONNEES COLLECTEES
Six campagnes de prélèvement ont été réalisées avec 131 élevages visités et 1735
volailles prélevées. Pour l’IA, 1510 prélèvements ont été analysés au laboratoire et
utilisés pour l’analyse de données. Pour la MN, 1492 prélèvements ont été analysés au
laboratoire et 1107 ont été utilisés pour l’analyse de données.
I.1. Au niveau des villages
Cinquante deux pourcent des élevages visités ont été tous à Anororo (Tableau VI).
Tableau VI. Répartition des élevages visités par commune
Commune Nombres d’élevages visités %
Anororo 68 52
Ampitatsimo 41 31
Imerimandroso 22 17
Source : Auteur
Le nombre de volailles prélevées par commune a été presque identique. Les
nombres d’échantillons analysés pour l’IA et la MN n’ont pas été les même.
Tableau VII. Répartition de volailles prélevées et analysées par commune
Commune Volailles prélevées (n=1735)
Echantillons IA (n=1510)
Echantillons MN (n=1107)
Anororo 560 482 363
Ampitatsimo 575 508 400
Imerimandroso 600 520 344
Source : Auteur
39
Tableau VIII. Nombre de volailles prélevées et analysées par période
d’exposition
Période d’exposition Volailles prélevées Echantillons IA
(n=1510) Echantillons MN
(n=1107)
Janv-Fev 315 257 223
Mar-Avril 296 252 197
Mai-Juin 273 271 236
Juil-Août 198 177 127
Sept-Oct 377 328 162
Nov-Déc 276 225 162
Source : Auteur
Le nombre de volailles prélevées par période d’exposition n’ont pas été les même.
Le nombre de volailles prélevées entre Juillet et Août a été faible car le prélèvement à
Ampitatsimo n’a pas été effectué lors de cette période.
I.2. Au niveau des élevages
La médiane de la densité d’élevage visité était 24 (ligne en gras) (Figure 13). La
moitié des élevages visités possède moins de 24 têtes de volailles et la moitié possède
plus de 24 têtes avec un maximum de 41 têtes (Figure 13).
Figure 13. Distribution de la densité d’élevage
Source : Auteur
40
Dix est le nombre moyen de volailles prélevées par élevage, avec un maximum de
41 têtes. La variable vaccination d’élevage (Tableau IX) concerne la vaccination de
volaille en général mais pas seulement contre la MN. Soixante quatre pour cent des
élevages enquêtés ont été victime d’au moins une fois de passage de maladie avant la
période de prélèvement (Tableau IX).
Tableau IX. Distribution des variables d’élevages
Variables Modalités Nombre d’élevages (n = 131)
%
Mixité volaille Non 66 50 Oui 65 50
Mixité porc Non 104 79 Oui 27 21
Clinique Non atteints 84 64
Atteints 47 36 Vaccination élevage
Non 63 48 Oui 68 52
Source : Auteur
I.3. Au niveau de la volaille
Vingt-sept pourcent de volailles prélevées ont été mentionnés être vaccinées. Les
volailles prélevées étaient majoritairement des poulets (86%) (Tableau X).
Tableau X. Distribution de la variable espèce de volaille
Variable Modalités Volailles prélevées (n=1735)
Echantillons IA (n=1510)
Echantillons MN (n=1107)
Espèces Poulet 1503 1303 925
palmipède 212 207 182
Source : Auteur
41
Figure 14. Distribution de l’âge de volailles (semaine)
Source : Auteur
La médiane d’âge de volailles est huit semaines (ligne en gras). La moitié de
volailles prélevées ont été âgées moins de huit semaines et la moitié plus de huit avec
un maximum d’âge de 18 semaines (Figure 14).
II. EVOLUTION DES INCIDENCES DES PESTES AVIAIRES
II.1. Évolution de l’incidence de l’influenza aviaire
L’IA sévit la zone du lac Alaotra en toute saison. L’incidence de cette maladie a
présenté moins de variation. Les niveaux ont été presque constants (2-3%) sauf entre le
mois de Juillet et Août (7%) (Figure 15).
Figure 15. Évolution de l’incidence de l’influenza aviaire durant l’année 2010
Source : Auteur
3% 3%
2%
7%
3% 3%
0%
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
Jan-Fev Mar-Avr Mai-Juin Juil-Août Sept-Oct Nov-Déc
Incidence
42
Pour Ampitatsimo, les niveaux se sont évolués de façon constante du mois de
Janvier au mois de Juin (1%) (Figure 16). Le pic a été localisé entre le mois de
Septembre et Octobre (3%). Pour Anororo, les niveaux maximum (6%) ont été localisés
sur deux périodes : entre le mois de Mars et Avril et de Juillet en Août (Figure 16). Pour
Imerimandroso, l’incidence a été généralement élevée par rapport aux deux communes.
Le niveau maximum (7%) se trouve entre Juillet et Août et le niveau minimum entre
Mars et Avril et entre Mai et Juin (1%) (Figure 16).
Figure 16. Évolution de l’incidence de l’influenza aviaire par commune
Source : Auteur
02468
Inci
denc
e (%
)
Mois
Imerimandroso (n=520)
Incidence
0
2
4
6
8
Inci
denc
e (%
)
Mois
Ampitatsimo (n=507)
Incidence
0
2
4
6
8
Inci
denc
e (%
)
Mois
Anororo (n=482)
Incidence
43
II.2. Évolution de l’incidence de la maladie de Newcastle
La MN sévit la zone en toute saison mais l’incidence pendant une année n’a pas
été le même (Figure 17). L’incidence de la MN (entre 9 à 32%) a été généralement
élevée par rapport à celle de l’IA (entre 2 et 7%). Elle a été maximale entre le mois de
Mai et Juin (32%), et minimale entre le mois de Septembre et Octobre (9%).
Figure 17. Evolution de l’incidence de la maladie de Newcastle durant l’année
2010
Source : Auteur
L’évolution de l’incidence de la MN dans les trois communes ont été très
différentes (Figure 18). Celle d’Ampitatsimo a des niveaux généralement élevées par
rapport aux deux autres communes, avec un pic entre le mois de Mai et Juin (50%) et le
niveau minimum entre Mars et Avril (13%). Il n’y a pas eu de prélèvement entre Juillet
et Août pour la commune d’Ampitatsimo. Par contre, les incidences de la MN à
Imerimandroso et à Anororo ont présenté des niveaux plus ou moins identiques mais
avec des variations différentes. Pour Imerimandroso, l’incidence maximale a lieu entre
le mois de Mars et Avril et entre Novembre et Décembre (10%). Pour Anororo, elle se
situe entre les mois de Janvier et Février (18%) (Figure 18).
10%
12%
32%
11%
9%
16%
0%
5%
10%
15%
20%
25%
30%
35%
Jan-Fev Mar-Avr Mai-Juin Juil-Aout Sept-Oct Nov-Déc
Incidence
44
Figure 18. Évolution de l’incidence de la maladie de Newcastle par commune
Source : Auteur
0102030405060
Inci
denc
e (%
)mois
Imerimandroso (n=245)
Incidence
0102030405060
Inci
denc
e (%
)
mois
Ampitatsimo (n=327)
Incidence
0102030405060
Inci
denc
e (%
)
mois
Anororo (n=276)
Incidence
45
III. FACTEURS DE RISQUES DES PESTES AVIAIRES
III.1. Facteurs de risque pour l’influenza aviaire
Parmi les 1510 échantillons analysés, 50 ont donné des résultats positifs vis-à-vis de
l’IA. Plus de 50% des animaux ont été élevés dans des élevages mixtes avec différentes
espèces de volailles. Trente sept pour cent ont été élevés dans des élevages mixtes avec
le porc.
III.1.1. Analyse univariée
Cinq variables explicatives (Tableau XI) ont été sélectionnées lors de l’analyse
univariée. Il s’agit de la densité (p=0,17), l’antécédent de maladie ou clinique (p=0,21),
l’espèce (p=0,004), l’agro-écotype (p=0,07) et l’âge classé en deux catégories (p=0,10).
III.1.2. Analyse multivariée
Deux variables sur les cinq sélectionnées (Annexe 9) ont été retenues pour le
modèle final. Il s’agit de la densité et de l’espèce dont les associations avec l’IA ont été
confirmées (Tableau XII) par l’analyse multivariée.
46
Tableau XI. Résultat de l’analyse univariée pour l’influenza aviaire (p<0,25)
Variables Modalités OR Degré de signification p
Agro-écotype (p=0,07)
Milieu sec 1,00 - Milieu rizière 0,61 0,26 Milieu humide 1,47 0,29
Période d’exposition14 (p=0,27)
Mai-Juin 1,00 - Janv-Fév 1,69 0,36 Mars-Avr 1,52 0,48 Juil-Aout 3,74 0,18 Sept-Oct 1,76 0,30 Nov-Déc 1,64 0,40
Période de quatre mois15 (p=0,77)
Janv-Avr 1,00 - Mai-Aout 1,24 0,57 Sept-Déc 0,10 0,96
Par saison16 (p=0,77)
Nov-Avr 1,00 - Mai-Aout 1,25 0,50 Sept-Oct 1,02 0,94
Densité quantitative (p=0,17)
- 1,01 0,13
Densité 2 classes (p=0,88)
Moins de 24 1,00 - Plus de 24 0,96 0,89
Densité 4 classes (p=0,41)
Moins de 13 1,00 - 13-24 0,64 0,41 24-41 0,52 0,20 Plus de 41 0,96 0,92
Age quantitatif (p= 0,43)
- 0,96 0,45
Age 2 classes (p=0,09)
Moins de 8 sem 1,00 - Plus de 8 sem 0,59 0,10
Age 4 classes (p=0,25)
Moins de 6 sem 1,00 - 6-8 sem 1,52 0,24 8-10 sem 0,66 0,34 Plus de 10 sem 0,70 0,42
Mixité volaille (P=0,65)
Non 1,00 - Oui 1,13 0,66
Mixité porc (P=0,39)
Non 1,00 - Oui 0,74 0,40
Espèce (P=0,004)
Palmipède 1,00 - Gallinacé 7,92 0,05
Clinique (p=0,21)
Non atteint 1,00 - Atteint 1,50 0,21
Source : Auteur
14 Période d’exposition classée par 2 mois 15 Période d’exposition classée par 4 mois 16 Période d’exposition classée par saison
47
Tableau XII. Résultat de l’analyse multivariée pour l’influenza aviaire (p<0,05)
Variables Modalités OR Degré de
signification p
Densité
(p=0,17) - 1,01 0,03
Espèce
(0,004)
Palmipède 1,00 -
Gallinacée 7,46 0,04
Source : Auteur
La densité élevée d’élevage (p=0,03) a été un facteur de risque pour l’IA avec un
OR égal à 1,01. Les gallinacées (p=0,04) ont été plus à risque que les palmipèdes avec
un OR de 7,46.
III.2. Facteurs de risque pour la maladie de Newcastle
Mille cent sept individus ont été retenus pour constituer le tableau d’analyse de
données pour la MN. Douze pour cent des volailles ont présenté des résultats positifs
vis-à-vis de cette maladie. Soixante pour cent des animaux prélevés ont été élevés dans
des élevages mixtes avec différentes espèces de volailles. Quarante pou cent ont été
élevés dans des élevages mixte avec le porc.
III.2.1. Analyse univariée
Cinq variables (Tableau XIII) explicatives ont été sélectionnées lors de l’analyse
univariée pour la MN. Il s’agit de l’agro-écotype (p=0,008), la densité classée en deux
catégories (p=0,22), l’âge classé en deux catégories (p=0,03), l’âge classé en quatre
catégories (p=0,009) et l’antécédent de maladie ou clinique (p=0,18).
III.2.2. Analyse multivariée
Deux variables (Tableau XIV) sur les cinq sélectionnées (Annexe 10) ont
présenté des associations significatives avec la MN. Il s’agit de l’agro-écotype et l’âge
classé en deux catégories (moins de huit semaines et plus de huit semaines).
48
Tableau XIII. Résultat de l’analyse univariée pour la maladie de Newcastle
(p<0,25)
Variables Modalités OR Degré de signification p
Agro-écotype (p=0,008)
Milieu sec 1,00 - Milieu rizière 6,42 0,008 Milieu humide 1,61 0,50
Période d’exposition (p=0,81)
Nov-Déc 1,00 - Janv-Fév 0,92 0,81 Mai-Juin 1,49 0,90 Mars-Avr 1,28 0,72 Juil-Aout 0,54 0,46 Sept-Oct 0,83 0,81
Période de quatre mois (p=0,97)
Janv-Avr 1,00 - Mai-Aout 0,97 0,94 Sept-Déc 0,90 0,82
Par saison (p=0,92)
Nov-Avr 1,00 - Mai-Aout 0,97 0,93 Sept-Oct 0,78 0,69
Densité quantitative (p=0,36)
- 1,008 0,37
Densité 2 classes (p=0,22)
Moins de 24 têtes 1,00 - Plus de 24 têtes 1,76 0,25
Densité 4 classes (p=0,61)
Moins de 13 têtes 1,00 - 13 à 24 têtes 1,12 0,83 24 à 41 têtes 1,59 0,48 Plus de 41 têtes 2,15 0,22
Age quantitatif (p=0,84)
- 1,01 0,84
Age 2 classes (p=0,03)
Moins de 7 sem 1,00 - Plus de 7 sem 0,50 0,03
Age 4 classes (p=0,009)
Moins de 5 sem 1,00 - 6-7 sem 1,20 0,10 8-10 sem 0,50 0,10 Plus de 10 sem 1,20 0,30
Mixité volaille (p=0,25)
Non 1,00 - Oui 1,71 0,27
Mixité porc (p=0,32)
Non 1,00 - Oui 0,63 0,32
Espèce (p=0,58)
Palmipède 1,00 - Gallinacé 1,28 0,58
Clinique (p=0,18)
Non atteint 1,00 - Atteint 0,51 0,21
Source : Auteur
49
Tableau XIV. Résultat de l’analyse multivariée pour la maladie de Newcastle
(p=0,05)
Variables Modalités OR Degrés de
signification p
Agro-écotype (p=0,008)
Milieu sec 1,00 -
Milieu rizière 9,67 0,002
Milieu humide 2,48 0,23
Age 2 classes (p=0,03)
Moins de 8 sem 1,00 -
Plus de 8 sem 0,48 0,02
Source : Auteur
Le milieu rizière (p=0,002) a été un facteur de risque vis-à-vis de la MN avec un
OR égal à 9,67. L’âge de volaille plus de huit semaine a été un facteur protecteur avec
un OR égal à 0,48.
III.3. La vaccination contre la maladie de Newcastle
III.3.1. Proportion des élevages vaccinant et volailles vaccinées
Soixante-trois élevages sur les 131 visités ont vacciné leurs volailles contre la MN,
soit une proportion de 48%. Parmi les 1735 volailles prélevées, 21% ont été vaccinés
contre la MN (Tableau XV).
Tableau XV. Nombre d’élevages vaccinant et volailles vaccinées
Vaccination Élevages visités (n=131)
% Volailles prélevées (n=1735)
%
Oui 63 48 373 21
Non 68 52 1362 79
Source : Auteur
50
III.3.2. Taux de réponse vaccinale positive
Parmi les 1492 échantillons analysés au laboratoire, 287 ont été vaccinés contre la
MN. Cent quarante sept volailles sur 287 ont présenté des résultats positifs à l’analyse
sérologique, ce qui a donné un taux de réponse vaccinale positif de 51% (Tableau XVI).
Tableau XVI. Proportion de volailles vaccinées ayant des réponses post-vaccinales
positives
Statut sérologique n %
Positifs 147 51
Négatifs 140 49
Source : Auteur
III.3.3. Relation entre la maladie de Newcastle et la vaccination
Les volailles vaccinées contre la MN ont été toutes des gallinacées (100%) et la
commune d’Imerimandroso (milieu sec) en possède le nombre le plus élevé (38%). Les
ACSA ont vacciné 61% de volailles. La fréquence de vaccination de six mois est la plus
adoptée (54%) (Tableau XVII). Parmi ces volailles vaccinées, 77% ont été élevées dans
des élevages atteints de maladie avant les campagnes de prélèvement et 51% ont
présenté des résultats positifs à l’analyse sérologique.
L’analyse de données a montré une association significative entre la variable
agent vaccinateur et la réponse vaccinale positive (Tableau XVIII). L’ACSA (p=0,04) a
été un facteur de risque par rapport aux techniciens d’élevage avec un OR égal à 4,71.
De même pour les vaccinateurs informels, ils ont été des facteurs de risque avec un OR
égal à 29,66. L’agro-écotype (p=0,48), la fréquence de vaccination (p=0,27) et
l’antécédent de clinique (p=0,55) n’ont pas présenté des associations significatives avec
la réponse vaccinale positive.
51
Tableau XVII. Fréquence des variables liées à la vaccination contre la maladie de
Newcastle
Variables Modalités Oiseaux vaccinés (n=287)
%
Agro-écotype
Milieu sec 110 38
Milieu rizière 94 33
Milieu humide 83 29
Agents Vaccinateurs
Technicien d’élevage 38 8
ACSA 176 61
Informels 73 25
Fréquence de vaccination
Moins de 3 mois 18 6
3 mois 106 37
6 mois 163 56
Statut sérologique
Positifs 147 51
Négatifs 140 49
Clinique Non atteints 67 23
Atteints 220 77
Source : Auteur
52
Tableau XVIII. Résultat de l’analyse univarée pour la vaccination (p<0,25)
Variables Modalités OR Degré de signification p
Agro-écotype (p=0,48)
Milieu sec 1,00 -
Milieu rizière 0,39 0,48
Milieu humide 1,34 0,81
Fréquence de vaccination (p=0,27)
Moins de 3 mois 1,00 -
3 mois 6,17 0,42
6 mois 1,95 0,76
Clinique (p=0,55)
Non atteint 1,00 -
Atteint 1,80 0,54
Agents Vaccinateurs (p=0,01)
Technicien d’élevage 1,00 -
ACSA 4,71 0,04
Informel 29,66 0,003
Source : Auteur
Tableau XIX. Résultat de l’analyse multivariée pour la vaccination
(p<0,005)
Variables Modalités OR Degré de
signification p
Agents Vaccinateurs (p=0,01)
Technicien d’élevage 1,00 -
ACSA 4,71 0,04
Informel 29,66 0,003
Source : Auteur
Partie IV : DISCUSSION
53
PARTIE IV. DISCUSSION
Cette étude a été la première à faire une évaluation des incidences bimestrielles
des pestes aviaires à Madagascar. Elle a démontré la période d’une forte infection
élevée durant une année.
Normalement un suivi longitudinal concerne des mêmes individus durant toute la
période d’étude, ce qui est difficile chez les volailles à cause des moments de
séroconversion. C’est la raison pour laquelle la commune a été choisie comme unité
épidémiologique.
L’âge des volailles prélevées a été limité entre un à trois mois. En effet, les
animaux âgées moins d’un mois peuvent avoir encore des anticorps maternels (69) et les
animaux plus âgées peuvent avoir été en contact avec le pathogène avant la période
étudiée (70 - 71), ceux qui pourront fausser le résultat d’analyse sérologique.
Les volailles ont été regroupées par élevage lors de l’analyse de données. En effet,
les volailles appartenant à un même élevage ont des probabilités plus élevées d’avoir le
même statut par rapport aux maladies. Ceci entraine un biais dans l’évaluation de la
force de liaison entre l’incidence de la maladie et les facteurs étudiés. Ce biais s’appelle
effet de surdispersion. Le GLMM permet de corriger ce biais (72).
Le résultat de cette étude a montré que les deux maladies sévissent la zone du lac
Alaotra en toute saison.
Pour ce qui est de l’IA, la circulation du virus à Madagascar tel que démontré par
les études antérieures (4, 40) a été confirmé. L’incidence de cette maladie a été
maximale au mois d’août (7%) et minimale au mois de juin (2%).
Ampitatsimo a eu les niveaux d’incidence les plus bas. Anororo a eu un niveau
d’incidence moyennement élevé par rapport à Imerimandroso qui a montré un niveau
maximal de 7% seulement au mois d’août. Ce résultat à Imerimandroso pourrait être
interprété par l’existence d’un marché de volaille très connu dans cette commune, où les
collecteurs régionaux et nationaux s’approvisionnent. En effet, la circulation de volaille
par voie de commercialisation est un facteur de risque connu pour cette maladie (74).
L’agro-écotype a été non significatif (p=0,07) pour l’IA. Il est possible qu’il y ait
été proche de significativité mais une manque de puissance statistique du test en a été la
54
cause. Magalie R a donné des conséquences non négligeables sur le risque de l’IAFP
que peuvent entrainer les eaux de lac ou étangs (milieu humide) (75), mais avec
certaines conditions telles que la date d’introduction de volailles en contact avec l’eau,
la densité de population sensible arrivée au niveau du lac et la température de l’eau. Une
introduction de volaille domestique au moment de l’augmentation de la densité
d’oiseaux sauvage sur l’eau par hectare augmente le risque d’infection (75). Cette
densité de population d’oiseaux sensibles, avec la température de l’eau, joue aussi des
rôles dans la persistance des virus de l’IAFP d’une année sur l’autre (75). Pour le cas
d’Anororo, cette commune est connue comme étant un lieu très humide surtout pendant
les saisons de pluie. Cependant il est possible qu’il soit peu fréquenté par les oiseaux
sauvages, d’où non significativité de l’association entre l’IA et l’agro-écotype. En effet,
même si le milieu est humide, il faut qu’il y ait des oiseaux contaminant pour infecter
les volailles.
Le résultat d’analyse a montré que les gallinacées ont été plus à risque par rapport
aux palmipèdes, vis-à-vis de l’IA, avec un OR de 7,46. Le premier rapport de la
circulation de l’IA à Madagascar, mené par Porphyre en 1999 (4) a donné aussi une
séro-prévalence de 14,9 % chez les poulets et 2,8% chez les canards. Par contre, Gilbert
M et al, à Thaïlande, ont montré que les palmipèdes sont plus à risque vis-à-vis de cette
maladie car ils fréquentent des eaux en contact avec les oiseaux sauvages (73, 65). Le
notre pourrait être expliqué par le nombre très élevé de gallinacées prélevées (86%) par
rapport aux palmipèdes (14%) (Tableau X). Particulièrement à Imerimandroso, il ne
possède presque pas de palmipèdes dans les élevages en raison de son type de milieu
(sec).
Pour la MN, l’évolution bimestrielle a confirmé la circulation beaucoup plus
importante de cette maladie par rapport à l’IA tel que cité par les études antérieures (40-
61). L’incidence a été maximale au mois de juin (32%) (saison sèche) et minimale au
mois d’octobre (6%), suivi par un niveau un peu plus élevé au mois de décembre (16%).
Du point de vue saison, ce résultat sur l’incidence de la MN est différent de ceux
montrés dans d’autres zones de Madagascar. Maminiaina a trouvé une incidence
maximale au mois d’octobre (intersaison) à Ambohimangakely et Moramanga (1999-
2000) en matière de la MN (77). De même, Ramahefasoa a trouvé des incidences
55
maximales en fin septembre et mi-octobre (intersaison) dans le fokontany d’Anjeva gare
(78). Une étude menée par l’AVSF à Vohipeno en 2005 a aussi montré que le mois
d’octobre est le mois de très forte virulence de la MN (79). Malgré ces différences, on
peut dire que les conditions d’explosion de foyer à ces deux périodes (juin et décembre)
d’incidences élevées au lac Alaotra, ont été réunies. En effet, le repeuplement de
volailles à partir des poules rescapées du foyer en décembre a été favorisé par une
grande production de riz en avril. Par ailleurs, les progénitures issues de ces poules
rescapées ont hérité tous des anticorps maternelles, d’où la constance du niveau
d’incidence jusqu’au mois d’avril (80). Mais au-delà de cette période, ils n’ont plus été
protégés par les anticorps maternels (69). Les poussins séronégatifs qui ont constitué les
élevages ont généré une population de poulets naïfs sérologiquement, au point de rendre
le cheptel vulnérable et totalement sensible vis-à-vis d’un nouveau foyer (67) vers le
mois de juin. L’effectif de volaille maximal, la sensibilité de la population, la
circulation importante de volaille par la commercialisation (43), à cause de la fête de
l’indépendance, ont été les facteurs d’explosion du foyer au mois de juin. Après, un
nouveau repeuplement générant des populations réceptives a pu être recommencé et
cela jusqu’au mois de décembre, à partir duquel un nouveau foyer a été possible à cause
des fêtes de noël et du nouvel an. L’importance du flux de commercialisation dans cette
zone ne peut pas être négligée. En effet, les marchés d’oiseaux vivants sont souvent
impliqués dans la circulation de la maladie, en faisant circuler des poulets infectés d’un
village à un autre (70).
Des études dans d’autres pays d’Afrique ont montré des situations similaires. Des
travaux menés au Mali, Nigeria et Zaïre (81-83) ont montré des incidences maximales
pendant la saison sèche.
L’influence de l’agro-écotype a été confirmée pour la MN. Le risque de survenue
de la MN a été augmenté par le type de milieu rizière avec un OR de 9,67. Ce qui a été
déjà rapporté par Roy P. et al (76). Les rizières abritent de nombreuses espèces
d’oiseaux sauvages résidents mais aussi quelques espèces d’oiseaux migrateurs qui
jouent un rôle important de portage et donc de la dissémination du virus. C’est la raison
pour laquelle les niveaux d’incidence à Ampitatsimo (milieu rizière) ont été
généralement élevés par rapport aux deux autres communes. Une étude sur les facteurs
de risque de la MN dans les petits élevages au lac Alaotra (caractérisé par la présence
56
des rizières) et aux alentours d’Antananarivo a révélé des prévalences plus élevées au
lac Alaotra (OR= 2,4 ; p=0,02) (40).
L’influence de l’âge sur la MN a été significative, l’âge de plus de huit semaines a
été un facteur protecteur. Ce qui est étonnant car les volailles plus âgées devraient avoir
été plus longtemps exposées par rapport aux volailles moins âgées.
Plusieurs autres variables auraient dû être encore considérées pour avoir des
explications plus approfondies des résultats obtenus à savoir la densité de volailles au
niveau des sites, la densité des oiseaux sauvages, l’hydrographie à Anororo et à
Ampitasimo. Par exemple, des données sur les caractéristiques (espèce, mode de vie) et
l’importance (effectif) des oiseaux sauvages existants à Anororo et à Ampitatsimo
pourront aider à comprendre le résultat sur l’absence de significativité de l’association
du type de milieu avec l’IA. Aussi bien pour la MN que pour l’IA, des facteurs
anthropiques (86) comme la densité humaine, la proximité, le contact avec l’avifaune
sauvage et avec l’eau auraient dû être connus pour évaluer leur influence sur les pestes
aviaires.
Des résultats sur la proportion d’élevages vaccinant et des volailles vaccinées
contre la MN puis le taux de réponse post-vaccinale positive ont pu être évalués.
Quarante-huit pourcent des élevages visités ont vacciné leurs volailles et 21% des
volailles prélevées ont été vaccinées contre cette maladie. Ces résultats restent faibles
par rapport au nombre de vaccinateurs et à la disponibilité des vaccins dans cette zone.
Les éleveurs n’ont pas été vraiment motivés pour la vaccination des volailles. L’intérêt
des éleveurs pour la vaccination dépend de la taille de leur troupeau, du type d’élevage,
et donc de leur investissement dans l’élevage (12). Ils pensent qu’ils n’ont pas besoin de
vacciner leurs volailles s’ils n’en possèdent qu’une dizaine de têtes. D’ailleurs la
vaccination de cette espèce n’est pas obligatoire et est payante à Madagascar.
En calculant le taux de la réponse vaccinale positive, seuls les 51% des volailles
vaccinées ont donné des résultats positifs vis-à-vis de la MN. Des études dans d’autres
zones de Madagascar (84) ont donné un résultat à peu près similaire (42,4%).
Cependant, ce taux est très bas par rapport au résultat d’une étude (85) sur la qualité du
vaccin Pestavia® au moyen de titrage sur plaque et test clinique avec des taux
d’efficacité successifs de 80% et 100%. D’autres facteurs ont pu alors entrer en jeu.
57
Cette question doit-être répondue : est-ce que toutes les conditions nécessaires pour
l’efficacité du vaccin ont été bien suivies lors de la vaccination des volailles?
Les influences de la fréquence de vaccination et les agents vaccinateurs sur la
production d’anticorps ont été testées. Des associations significatives entre l’agent
vaccinateur et le taux de réponse vaccinale positive ont été obtenues. Les vaccinations
effectuées par l’ACSA et par les vaccinateurs informels ont été plus à risque par rapport
aux techniciens d’élevage (Docteur et techniciens d’élevage proprement dite).
Des études avec des sites plus élargies seront utiles pour avoir des résultats
représentatifs de la zone toute entière.
Partie V : PERSPECTIVES ET RECOMMANDATIONS
58
PARTIE V. PERSPECTIVES ET RECOMMANDATIONS
Les résultats de cette étude contribuent dans l’amélioration de connaissances sur
l’éco-épidémiologie des pestes aviaires en général mais en particulier celle adaptée à
Madagascar. En effet, elle permet de faire des études approfondies sur la relation entre
les facteurs de risque identifiés et les pestes aviaires, par exemple le mécanisme qui fait
que le type de milieu rizière soit un facteur de risque potentiel pour la MN. En effet, les
acteurs ou facteurs qui relient ces deux éléments (variable et maladie) et les mécanismes
qui entrent dans leur association doivent être mis en évidence pour pouvoir agir
efficacement. Elle ouvre aussi des recherches approfondies sur l’influence des
différentes saisons de l’année sur les pestes aviaires.
On connaît la dynamique de l’infection par les pestes aviaires pendant une année
mais il est aussi intéressant de vérifier s’il y a variation des incidences inter- annuelles
c’est-à-dire entre deux années différentes. Au lieu d’une année, le suivi longitudinal
devra être réalisé dans une période de deux années successives. Les éventuels facteurs
survenant au cours de la période devront être enregistrés pour servir des variables
explicatives à part celles utilisées pour cette étude.
Elle permet d’améliorer la surveillance en matière de pestes aviaires notamment
l’IAHP vis-à-vis duquel Madagascar est encore indemne. Elle pourrait être utilisée aussi
dans toute étude contribuant dans l’éradication de la MN, pour revaloriser et développer
l’élevage du « poulet gasy ». Cette filière traditionnelle devra être intégrée dans le
marché formel pour faciliter les actions d’amélioration de son environnement
économique.
Des organisations et contrôles du mode de vaccination doivent être révisés par les
autorités de la santé animale de la zone. Ils doivent veiller à ce que le vaccin utilisé soit
efficace, sécuritaire, approprié aux conditions locales, disponible et abordable. Puis les
sensibilisations des éleveurs, les formations et surveillances des agents vaccinateurs
devront être renforcées. Il est aussi possible que le vaccin utilisé ne protège plus les
volailles de façon totale (56). Un programme national sur la maitrise et le contrôle de
l’utilisation des vaccins devrait être réalisé. En effet, les vaccins doivent être utilisés
avec toutes les conditions nécessaires pour être efficace. Ils pourront apporter des
conséquences contraires à ce qu’on attend de lui si utilisé de façon inappropriée.
59
Cette étude incite aussi une remise en question sur l’efficacité du vaccin contre la
MN. Est-ce que la vaccination protège-elle encore ? Si oui, quelles peuvent-être les
facteurs limitant de son efficacité?
A Madagascar, le secteur avicole est régi par un dispositif de textes réglementaires
mais l’inapplication et l’inobservation de ces textes pour diverses raisons entravent le
développement de l’aviculture traditionnelle, ne serait-ce que pour la carence des
vaccinations. Par exemple, il existe un arrêté fixant des mesures de lutte contre la MN
(n° 1708-98 du 09/03/98), mais son application devra être révisée.
Parfois les éleveurs n’ont pas aussi d’intérêt personnel à la vaccination de leurs
volailles vu la petite taille du troupeau. Si l’on souhaite vacciner ces élevages pour
l’intérêt collectif, il faut envisager une vaccination obligatoire et/ou gratuite. Elle peut
être effectuée à l’occasion de la vaccination d’autres animaux, porc, bovin mais en
respectant les calendriers appropriés.
CONCLUSION
60
CONCLUSION
Cette étude a permis de savoir que les évolutions des incidences des pestes
aviaires dans cette zone pendant une année ne sont pas constantes et varient avec des
variables liées à l’agro-écotype, à l’élevage, et à l’individu.
Le virus de l’IAFP circule dans cette zone. L’évolution de l’incidence de cette
maladie a montré moins de variation par rapport à celle de la MN. Durant toute la saison
de pluie, les incidences restent aux mêmes niveaux (3%), mais elles sont maximales
entre le mois de Juillet et Août (7%) précédée par le niveau minimal entre le mois de
Mai et Juin (2%). Imerimandroso est la commune ayant présenté l’incidence la plus
élevée (7%) et ceci entre le mois de Juillet et Août, puis Anororo (6%) à cette même
période mais à un niveau plus bas. Deux facteurs de risque ont été identifiés pour l’IA à
savoir la densité d’élevage et l’espèce. Les élevages à densité élevée ont montré plus de
risque avec un OR de 1,01. Concernant l’espèce, les gallinacées ont été plus à risque par
rapport aux palmipèdes avec un OR de 7,46.
Pour la MN, l’incidence a été maximale entre le mois de mai et juin (32%) et
minimale entre le mois de septembre et octobre (9%). Ampitatsimo a montré des
niveaux généralement plus élevés, 51% des individus prélevés dans cette commune, au
mois de Juin, ont montré des résultats positifs. La variation des incidences annuelles
avec l’agro-écotype a été confirmée par l’analyse de donnée. Le type de milieu rizière a
été identifié comme un facteur de risque pour la MN avec un OR de 9,67.
La vaccination contre la MN n’a concerné que les 48% des éleveurs enquêtés et
21% des volailles prélevées. Sur les 287 volailles vaccinées, 51% ont présenté des
statuts sérologiques positifs (réponse vaccinale positive). Les résultats d’analyse ont
montré que la vaccination effectuée par les ACSA, les vaccinateurs informels ont été
plus à risque à la diminution de la réponse vaccinale positive par rapport aux techniciens
d’élevage avec les OR successifs 4,71 et 29,66.
Les objectifs de cette étude ont été presque atteints et ces résultats pourront être
utilisés pour la suite de recherche du projet dans la même zone ou dans d’autres. Ils
pourront améliorer la surveillance épidémiologique des pestes aviaires notamment de
l’IA à Madagascar.
BIBLIOGRAPHIE
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Res.41:28.
ANNEXES
ANNEXES
Annexe 1. Glossaire
Inféodé : Oiseau qui ne peut se nourrir qu’aux dépens d’une seule espèce.
Incidence : Nombre de nouveaux cas d’une pathologie observés pendant une
période et pour une population déterminée. Critères les plus importants
pour évaluer la fréquence et la vitesse d’apparition d’une pathologie,
exprimé généralement en pourcentage
Panzootie : C’est la contagion d’une maladie qui couvre à la quasi-totalité d’une
population animale d’un ou de plusieurs continent(s), ou alors
occasionnellement la planète.
Coccidioses : Maladie parasitaire causée par des protozoaires qui se trouvent
principalement dans l’intestin grêle de volaille ou dans le caecum.
Ansériforme : Comprend les oiseaux limicoles et aussi ceux qui ont évolué vers des
types plus spécialisés comme les goélands, mouettes, sternes, pingouins.
Choléra aviaire : Maladie bactérienne contagieuse des espèces aviaires domestiques et
sauvages due à l’infection par Pasteurella multocida.
Variole aviaire : Maladie contagieuse due à un virus de la famille des Poxviridae. Une
maladie d’évolution lente caractérisée par des lésions cutanées au niveau
des parties non emplumées et par d’autres diphtérique au niveau de la
partie supérieur du tube digestif et de l’appareil respiratoire.
Maladie de Marek : Une panzootie de la poule due à un herpesvirus induisant une
prolifération tumorale de cellules lymphoïdes dans un grand d’organes
et de tissus.
Maladie de Gumboro : Une infection virale très contagieuse du jeune poulet
caractérisée par la destruction des organes lymphoïdes et plus
particulièrement de la bourse de Fabricius.
L’encéphalomyélite aviaire : Une maladie virale de la poule, du faisan, de dindon et
du canard. Elle est due à un entérovirus de la famille des
Picornaviridae.
Laryngotrachéite infectieuse : Une maladie respiratoire de la poule due à un
Alphaherpesvirus. Elle est caractérisée par des symptômes et des
lésions trachéales très sévères.
Annexe 2. Fiche d’enquête
Fiche d’enquête
Annexe 3. Techniques de manipulation adoptée lors du prélèvement
- avant d’insérer l’aiguille dans la veine, le piston a été tiré vers l’arrière afin
d’évacuer la seringue et puis le pousser tout vers l’avant pour qu’il ne reste plus
d’air à l’intérieur.
- après la collecte du sang, le site de la ponction veineuse a été recouvert avec
gaze pressé par le doigt jusqu’à l’arrêt du saignement, pendant 30 à 60 secondes
pour éviter la formation d’un hématome.
- les seringues pleines ont été placées de façon verticale avec le bouchon dans un
gobelet mis sous vide et à l’abri de soleil pendant la séance de prélèvement.
- des aiguilles de prélèvement et d’autres déchets vétérinaires ont été débarrassées
dans des récipients hermétiques.
Annexe 4. Les différentes étapes de l’analyse pour la maladie de Newcastle
Étape 1 : Préparation des réactifs
Les réactifs utilisés ont été préparés avant tout :
- tampon de dilution : diluant du sérum, a été dilué à 1/20 dans de l’eau distillée et
a été agité après dilution, puis conservée à 5°C.
- conjugué anti-NDV : le conjugué lyophilisé a été reconstitué avec 11,5ml de
tampon de dilution du conjugué. Il a été préparé immédiatement avant
l’utilisation. Le conjugué reconstitué et non utilisé a été conservé à 5°C (jusqu’à
la date de péremption du Kit).
Étape 2 : Dilution des échantillons
- Pré-dilution des échantillons dans une plaque vierge, à ½ dans le tampon de
dilution des échantillons (60µl de sérum et 60µl de Tampon de dilution).
- Agitation de la microplaque.
- Transfert des échantillons dilués sur plaque sensibilisée, à raison de 100µl par
cupule.
- Distribution du contrôle positif dans les cupules A1 et A2 et le contrôle négatif
dans les cupules B1 et B217.
- Incubation de la plaque pendant 30minutes à température ambiante (18 à 25°C).
- Lavage avec le tampon de dilution (3fois à raison de 300µl par cupule par
lavage).
Étape 3 : Étape conjuguée
- Distribution de 100µl de conjugué dans chaque cupule de la plaque.
- Incubation de la plaque pendant 60minutes à température ambiante (18 à 25°C).
- Lavage avec le tampon de dilution (3fois à raison de 300µl par cupule par
lavage).
Étape 4 : Révélation
- Distribution de 100µl de solution de substrat dans chaque cupule.
17 A1A2, B1B2 : Noms des 4 premiers cupules de la plaque dans lesquelles les contrôles positifs et négatifs ont été placés.
- Agitation de la plaque
- Incubation de la plaque pendant 20minutes à température ambiante et à
l’obscurité.
- Distribution de 50µl de stop solution dans chaque cupule.
- Lecture de la plaque au maximum 15 minutes après l’arrêt de la réaction à
450nm.
Annexe 5. Les différentes étapes de l’analyse pour l’influenza aviaire
Étape 1 : Dilution des échantillons
Pour les échantillons de gallinacée ajout de :
- 90µl du tampon de dilution 2 dans chaque cupule
- 10µl du contrôle positif (cupules A1 et A2) et négatif (cupule B1et B2)
- 10µl de chaque échantillon à tester dans les cupules restantes
Pour les échantillons de palmipède ajout de :
- 90µl du tampon de dilution2 et 10µl du contrôle positif dans les cupules A1 et
A2, et 10µl du contrôle négatif dans les cupules B1 et B2
- 190µl du tampon de dilution 2 et 10µl de chaque échantillon à tester dans les
cupules restantes
- Incubation pendant 1h à 37°C
- Lavage 5fois de chaque cupule avec environ 300µl de solution de lavage. Le
dessèchement des cupules entre les lavages a été évité.
Étape 2 : Étape conjuguée
- Préparation du conjugué 1X18, en diluant le conjugué 10X au 1/10ème en
tampon de dilution 3
- Distribution de 50 µl de conjugué 1X dans chaque cupule
- Incubation pendant 30 minutes à 21°C
- Lavage 3 fois de chaque cupule avec environ 300 µl de solution de lavage. Le
dessèchement des cupules entre les étapes de lavage a été évité.
Étape3 : Révélation
- Distribution de 50 µl de solution de révélation (ou substrat) dans chaque cupule
- Incubation pendant 10mn à 21°C à l’obscurité
- Distribution de 50µl de solution d’arrêt dans chaque cupule pour arrêter la
réaction
18 Conjugué 1X : C’est la solution prêt à utiliser (10X dilué au 1/10 du diluant 3) en tant que conjugué
- Lecture pour mesurer et enregistrer les densités optiques à 450nm.
Annexe 6. Extrait du tableau d’analyse
NUM_AN NUM_EL SES COM PPC DEN MIX AGE ESP NDV 9 1 6 B 1 183 1 5 0 1 13 1 6 B 1 183 1 4 1 0 14 1 6 B 1 183 1 4 1 0 15 1 6 B 1 183 1 4 1 0 16 1 6 B 1 183 1 4 1 0 17 1 6 B 1 183 1 4 1 0 18 1 6 B 1 183 1 4 1 0 19 1 6 B 1 183 1 4 1 0 20 1 6 B 1 183 1 4 1 0 21 1 6 B 1 183 1 4 1 0 22 1 6 B 1 183 1 4 1 0 24 1 6 B 1 183 1 4 1 0 25 1 6 B 1 183 1 4 1 0 26 1 6 B 1 183 1 4 1 0 27 1 6 B 1 183 1 4 1 0 28 1 6 B 1 183 1 12 1 0 29 1 6 B 1 183 1 12 1 0 30 1 6 B 1 183 1 12 1 0 31 1 6 B 1 183 1 12 1 0 44 3 6 B 1 19 0 8 0 1 45 3 6 B 1 19 0 8 0 1 46 3 6 B 1 19 0 8 0 1 47 3 6 B 1 19 0 8 0 0 48 3 6 B 1 19 0 8 0 0 49 3 6 B 1 19 0 8 0 0 50 3 6 B 1 19 0 8 0 1 51 3 6 B 1 19 0 8 0 1 52 3 6 B 1 19 0 8 0 0 53 3 6 B 1 19 0 8 0 1 54 3 6 B 1 19 0 8 0 1 55 3 6 B 1 19 0 8 0 0 56 3 6 B 1 19 0 8 0 1 57 3 6 B 1 19 0 8 0 1 58 3 6 B 1 19 0 8 0 1 59 3 6 B 1 19 0 8 0 1 60 3 6 B 1 19 0 8 0 0 61 3 6 B 1 19 0 8 0 1 Source : Auteur
Pour faciliter le traitement des données, les variables choisies et leurs modalités
ont été codées et c’est avec leurs codages qu’elles ont été présentées dans les tableaux
d’analyse). Pour les variables qualitatives, les valeurs ou les modalités ont été codées
avec 0 (moins à risque) ou 1 (plus de risque), sauf pour la commune qui a été codée par
A, B, C. Par contre, les variables quantitatives n’ont pas été codées, mais laissées
prendre leurs vraies valeurs dans le tableau.
Annexe 7. Rappel sur la régression logistique
Régression linéaire
La régression linéaire est utilisée quand la variable dépendante est continue ou
métrique. En épidémiologie, la variable Y caractérise la maladie (variable dépendante),
et Xi caractérise le facteur de risque (ou facteur pronostique, ou variable indépendante)
de la maladie.
Par modèle linéaire, la relation entre les variables Y et X s’écrit de la manière
suivante :
Y = � + ���
La droite de régression qui en résulte montre une droite croissante. Par ailleurs le
but de l’analyse de régression est d’estimer les paramètres inconnus α et β.
La régression linéaire peut être simple ou multiple selon le nombre de variable
explicative. L’équation d’une régression linéaire multiple s’écrit :
Y = � +β1X1+ β2X2+βKXK
Régression logistique
Contrairement au modèle de régression linéaire, un modèle de régression
logistique est utilisé si la variable dépendante n’est dichotomique, ou encore binaire. Par
contre les variables indépendantes peuvent être qualitatives ou quantitatives (60). La
régression logistique est largement répandue dans de nombreux domaines. En
médecine, elle permet par exemple de trouver les facteurs que caractérisent un groupe
de sujets malades par rapport à des sujets sains.
Sa différence avec la régression linéaire réside principalement dans
l’interprétation des résultats. Dans la régression linéaire, l’effet des paramètres
d’influence sur la variable dépendante peut se déduire directement du coefficient estimé.
Dans la régression logistique par contre, la variable dépendante (avec ses deux
caractéristiques possibles) n’est pas directement modélisée mais est fonction de la
probabilité que l’évènement se produise dans des conditions données. Les effets estimés
du/des paramètres d’influence doivent alors être évalués selon un odds ratio (OR) ou
rapport des côtes, qui mesure la force de l’association entre la maladie M et une variable
d’exposition.
Dans le cas où il n’y a qu’une seule variable X, la fonction logistique s’écrit :
� =e�(�� � )
1 + e�(�� � )
Le modèle logistique s’écrit:
P(M +/X) =e�(�� � )
1 + e�(�� � )
Correspondant à la probabilité de survenue de la maladie quand le facteur est
présent. Ce modèle est appelé fonction logistique car sa transformation logistique en fait
une fonction linéaire
Logit P = α + βiXi
L’intérêt de cette fonction réside dans la simplicité de passage à l’estimation d’un
OR. En effet, si l’exposition est codée en 0/1 (non exposé/ exposé), le modèle permet
d’arriver après simplification à :
0R= e�
Dans le cas où il y a plusieurs variables X, le modèle logistique devient :
P(M +/X�, … … , X�) = e�(�∑ � � �
!" )
1 + e�(�∑ � � � !" )
Où Logit P = α + ∑ βiXi� #�
Pour la présente étude, les modalités de la variable Y correspondent à la
séropositivité ou à la séronégativité de l’individu vis-à-vis des pestes aviaires. Elle est
alors dichotomique. Tandis que les Xi correspondent aux facteurs qui peuvent
influencer ces maladies.
Le modèle linéaire généralisée mixte
Le GLMM est croisé de deux types d’extension du modèle linéaire classique noté LM.
Premièrement, une extension en termes de loi pour donner le modèle linéaire généralisé
et deuxièmement, une extension en termes d’introduction d’effets aléatoires pour
donner le GLLM. Le GLLM, a été choisi afin d’identifier la variabilité inter-groupe et
les modalités du facteur de regroupement (élevage).
Annexe 8. Analyse multivariée de toutes les variables sélectionnées pour
l’influenza aviaire
Variables Modalités OR Degré de
signification p
Densité - 1,01 0,03
Espèce Palmipède 1,00 -
Gallinacée 7,46 0,04
Clinique Non atteint 1,00 -
Atteint 1,56 0,14
Agro-écotype
Milieu sec 1,00 -
Milieu rizière 0,65 0,29
Milieu humide 1,82 0,08
Age deux classes Moins de 8 sem 1,00 -
Plus de 8 sem 0,64 0,15
Source : Auteur
Annexe 9. Analyse multivariée de toutes les variables sélectionnées pour la
maladie de Newcastle
Variables Modalités OR Degrés de
signification p
Agro-écotype
Milieu sec 1,00 -
Milieu rizière 9,67 0,002
Milieu humide 2,48 0,23
Age 2 classes
Moins de 8 sem 1,00 -
Plus de 8 sem 0,48 0,02
Age 4 classes
Moins de 13 sem 1,00 -
13 à 24 sem 1,97 0,10
24 à 41 sem 0,51 0,11
Plus de 41 sem 1,49 0,52
Clinique Non atteint 1,00 -
Atteint 0,39 0,08
Densité 2 classes
Moins de 24 têtes 1,00 -
Plus de 24 têtes 1,12 0,80
Source : Auteur
VELIRANO
« Eto anatrehan’i ZANAHARY, eto anoloan’ireo mpikambana ao amin’ny
Holafitra Nasionalin’ny Dokotera Veterinera Malagasy sy ireo mpampianatra ahy,
mianiana aho fa hitandro lalandava ary hatraiza hatraiza ny haja amam-boninahitry ny
Dokotera Veterinera sy ny asa.
Noho izany dia manome toky ary mianiana aho fa:
-Hanatanteraka ny asako eo ambany fifehezn’ny fitsipika misy ary hanaja hatrany ny
rariny sy ny hitsiny;
-Tsy hivadi-belirano amin’ny lalàn’ny voninahitra, ny fahamendrehana, ny fanajana ny
rariny sy ny fitsipi-pitondran-tena eo am-panatanterahana ny asa maha Dokotera
Veterinera. Hanaja ireo nampianatra ahy, ny fitsipiky ny hai-kanto. Hampiseho ny
sitraka sy fankatelemana amin’izy ireo ka tsy hivaona amin’ny soa nampianarin’izy
ireo ahy;
-Hanaja ny ain’ny biby, hijoro ho toa ny andry hiankinan’ny fiarovana ny
fahasalaman’izy ireo sy ho fanatsarana ny fiainany ary hikatsaka ny fivoaran’ny
fahasalaman’ny olombelona sy ny toe-piainany;
-Hitazona ho ahy samirery ny tsiambaratelon’ny asako;
-Hiasa ho an’ny fiarovana ny tontolo iainana sy hiezaka ho an’ny fisian’ny fiainana
mirindra ho an’ny zavamanan’aina rehetra ary hikatsaka ny fanatanterahana ny
fisian’ny rehetra ilaina eo amin’ny fiaraha-monina tsy misy raoraon’ny olombelona sy
ny biby;
-Hiezaka ahafehy ireo fahalalana vaovao sy hai-tao momba ny fitsaboana biby ary
hampita izany ho an’ny hafa ao anatin’ny fitandroana ny fifanakalozana amin’ny
hairaha mifandray amin’izany mba hitondra fivoarana ho azy;
Na oviana na oviana aho tsy hanaiky hampiasa ny fahalalako sy ny toerana misy
ahy hitondra ho any amin’ny fahalovana sy hitarika fihetsika tsy mendrika. Ho
toavin’ny mpiara-belona amiko anie aho raha mahatanteraka ny velirano nataoko. Ho
rakotry ny henatra sy horabirabian’ireo mpiray asa amiko kosa aho raha mivadika
amin’izany. »
PERMIS D’IMPRIMER
LU ET APPROUVE
Le Président de Thèse
Signé : Professeur RENE DE ROLAND Lily-Arison
VU ET PERMIS D’IMPRIMER
Le Doyen de la Faculté de Médecine d’Antananarivo
Signé : Professeur ANDRIAMANARIVO Mamy Lalatiana
Full Name: ANDRIAMAMIMALALA Tanjona Rakotoson
Title of the thesis: EVOLUTION OF THE IMPACT OF AVIAN PEST FOR ONE
YEAR TO LAKE ALAOTRA
Heading: Epidemiology Number of charts: 18
Number of pages: 60 Number of annexes: 09
Number of tables: 19 Number of bibliographical references: 86
SUMMARY
Longitudinal study the impact of avian pests was conducted at Lake Alaotra for
one year. Sampling campaigns every two months were performed Anororo (wet)
Ampitatsimo (middle rice) and Imerimandroso (dry). In terms of avian influenza, the
maximum incidence is between the months of July and August (7%). Stocking density
(OR = 1.01) and the species gallinacée (OR = 7.46) were significantly associated with
avian influenza. The level of maximum impact of the Newcastle disease was marked
between the months of May and June (32%), and minimum incidence between July and
August (9%). Birds living near rice paddy are more at risk vis-à-vis the Newcastle
disease than those living in dry or wet environments. The vaccination rate is breeding
48%, and poultry is 21%. The rate of vaccine positive respond was 51%. The ACSA
(OR = 4.71), informal vaccinator (OR = 29.66) reduces the production of vaccine
positive respond. This study opens a field of reflection on further research on other risk
factors it may improve disease surveillance including AI to keep the free status of our
island regarding highly pathogenic influenza virus.
KEYWORDS: Avian pest, poultry, type of environment, Incidence, Risk Factors.
Director of thesis: Professor RENE DE ROLAND Lily-Arison
reporter: Doctor RASAMOELINA ANDRIAMANIVO Harentsoaniaina
Author's Address: Lot 30 CD Ambatoroka VB Antananarivo
Nom et prénoms : ANDRIAMAMIMALALA Tanjona Rakotoson
Titre de la these : EVOLUTION DES INCIDENCES DES PESTES AVIAIRES
PENDANT UNE ANNEE AU LAC ALAOTRA
Rubrique : Epidémiologie Nombre de figures : 18
Nombre de pages : 60 Nombre d’annexes : 09
Nombre de tableaux : 19 Nombre de références bibliographiques : 86
RESUME
Un suivi longitudinal sur les incidences des pestes aviaires a été réalisé au lac
Alaotra pendant une année. Des campagnes de prélèvement tous les deux mois ont été
effectués à Anororo (milieu humide), Ampitatsimo (milieu rizière), et Imerimandroso
(milieu sec). En termes d’influenza aviaire, le niveau maximal d’incidence se trouve
entre le mois de Juillet et Août (7%). La densité d’élevage (OR=1,01), l’espèce
gallinacée (OR= 7,46), ont été liées significativement avec l’influenza aviaire. Pour la
maladie de Newcastle, le niveau d’incidence maximale a été marqué entre le mois de
Mai et Juin (32%), et l’incidence minimale entre Juillet et Août (9%). Les oiseaux
habitant à proximité du milieu rizière a été plus à risque vis-à-vis de la maladie de
Newcastle que ceux habitant dans des milieux sec ou humide. La proportion d’élevage
vaccinant contre la Maladie de Newcastle a été de 48%, et celles de volailles vaccinées
de 21%. Cinquante et une pourcent a été le taux de réponse vaccinale positive. Les
ACSA (OR=4,71), les vaccinateurs informels (OR=29,66) diminuent la production de
réponse vaccinale positive. Cette étude ouvre un champ de réflexion sur des recherches
plus approfondies sur d’autres facteurs de risque. Elle pourra améliorer la surveillance
de ces maladies notamment l’influenza aviaire afin de garder l’indemnisation de notre
île vis-à-vis de la souche H5N1 et d’autres souches hautement pathogène.
MOTS CLES : Pestes aviaires, volaille, Type de milieu, Incidence, Facteurs de risque.
Directeur de thèse : Professeur RENE DE ROLAND Lily-Arison
Rapporteur : Docteur RASAMOELINA ADRIAMANIVO Harentsoaniaina
Adresse de l’auteur : Lot VB 30 CD Ambatoroka Antananarivo
