ETUDE DU POLYMORPHISME ENZYMATIQUE LE MIL · 2016. 6. 14. · B. LE MATERIEL VEGETAL le mil,...

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D.E.A. D'AMELIORATION DES PLANTES - 1979 ETUDE DU POLYMORPHISME ENZYMATIQUE CHEZ LE MIL (PENN/SETUM AMERICANUM S. SP. AMERICANUMj Rapport de stage N'DRI COULIBALY ORSTOM: Biologie et Amélioration des Plantes utiles

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  • D.E.A. D'AMELIORATION DES PLANTES - 1979

    ETUDE DU POLYMORPHISME ENZYMATIQUE

    CHEZ LE MIL (PENN/SETUM AMERICANUM S. SP. AMERICANUMj

    Rapport de stage

    N'DRI COULIBALY

    ORSTOM:Biologie et Amélioration

    des Plantes utiles

  • RAPPORT DE STAGE

    ETIJDE DU POLYr1>RPHISME ENZyt,\ATIQUE C:~EZ LE r··UL

    (PENN1SETLM N'ER1CAN~ S~ SP A1"ER1CANLW

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  • TABLE DES MATIERES

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    PAGES

    A. 1NTRODUCT ION •••••• 0 • 0 0 ..

    B. LE MATER 1EL VEGETAL. 0"." 0.......... 2

    C. LE SYSTEME ENZYMAT 1QUE ETUD 1E 8

    3. APPORT DU VIOLACEUM ••••••••••••••• o ••••••••••••••••

    1 1.. MtrHODOLOG 1E .

    1. MISE AU POINT BIBLIOGRAPHIQUE ..

    III. RESLILTATS •••••••••••••••••••••••••••••••••••••••••••••

    8

    8

    12

    12

    14

    14

    14

    33

    ~ ~ .

    ...............................2.2. Variabilité inter-échanti 1Ion

    2.1. Variabilité intra-échanti lion

    1. DESCR 1PT ION DES ZYMOGRAMMES ••••••••••••••••••••••••

    2. LES DEUX NIVEAUX DE VARIABILITE ••••••••••••••••••••

    1V. 0 1SCUSSION - CONCLUSION •••••••••••• 0 ••••• 0 •••••••••••• 34

    BIBLIOGRAPHIE

  • A. INTRODUCTION

    Le recours à la mutagénèse, aux formes sauvages apparentées aux

    espèces cultIvées, les nombreuses prospectIons dans les centres d'orl-

    gloe et de dIversifIcatIon des végétaux, répondent au souel de dIsposer

    à tout moment d'un matérIel 9égétal génétl~uement dIversifié; en effet,

    c'est de cette varIabIlIté que dépend le nIveau du progrès réalisé en

    ftn de cycle de sélectIon; aussI, est-II Indispensable d'en évaluer

    l'ampleur, au moIns en début de programme. Généralement, cette dIversité

    est est1mée par la mesure des vartatlons phénotypIques entre tndlvldus,

    dont une part revIent à l'envIronnement; du faIt de l'Interférence des

    facteurs du mIl leu, Il n'exIste pas de relatIon bijective entre le géno-

    type et le phénotype. Une méthode blochlmlque p l'électrophorèse, penmet

    d'aborder le problème de la variabilIté génétIque avec une précIsIon metl-

    leure que les procédés classIques.

    Les méthodes électrophorétlques exploItent la propriété qu'ont les

    partIcules de migrer dIfféremment suIvant leur charge électrique, lorsqu'on

    les place dans un champ3électrlque ; en les appliquant aux protéInes,

    elles permettent de dévoiler aisément, moyennant certaines précautions,

    la diversité des systèmes génIques; en effet, chaque protéIne est ca-

    ractérisée par sa charge électrique quI dépend de son contenu en acIdes

    aminés; ce contenu est révélateur d'un certain fragment d'A.D.N. ;

    réclproquemment, toute modIfication affectant le gène est traduite dans

    la protéine, et s1 el le conduit à une varIation significatIve de la

    charge électrique peut être détectée par l'analyse électrophorètlque

    (on e$Tlme à au moIns 25%, le pourcentage de mutations ponctuel les

    pouvant être ainsi révélées). La conséquence Immédiate est la possIbI-

    lIté de construire des distances génétiques (PERNES, 1975) et non des

    dIstances phénotypiques entre Individus.; de plus, on peut étudIer si-

    multanément la variabilIté au niveau de plusieurs loci (lEWüNTIN, 1974) ;

    un autre avantage est què J'effet d'une substitutIon al léllque sur la

    mobilité électrique de la protéine ne dépend pas de l'environnement

    (LEWONTIN, 1974).

    Dans le cas des enzymes, l'électrophorèse permet de meTtre en

    évidence différentes formes moléculaires ayant la même spécifIcIté en-

    zymatIque ; ces formes ont été désignées par le tenne d"'lsozymes" par

    MARKERT et MOLLER (1959). Nous nous proposons d'étudier la variabIlité

    de celles des estérases des grains de mIl; mals p auparavant, Il nous

    semble Important d'évoquer quelques caractéristiques des échantillons

    et du système enzymatIque analysés_.

  • B. LE MATERIEL VEGETAL

    le mil, Pennisetum conericanum 6.sp americanum~ est une céréale

    cultivée pour les besoIns de l'alimentation humaine dans les parties

    sèches de l'Afrique Tropicale, de l'Inde, et du Pakistan; cette gra-

    mInée, al 1agame, dlploTde (2n D 14) et du type métabolique C4 côtoie'

    dans la même espèce, des sous-espèces sauvages, dont P. mo~~i68imum,

    P. vio~aaeum

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    L' I! Il l'''UAMnCI 1 C~ nI: Mil

  • 1-- -----ESPECES PENNISETUM PURPUREUM SCHUMACH

    SECTION PENNISETUM

    .L __. _IPENNISETUM AMERICANUM (l.) LEEKE

    tétraplolde (2n = 28) ; perenne diploïde (2nannuel 1e

    14 )

    parent sauvagedu mil cultivé

    P. Violaceum Lam.P. Mollissimum Hochst

    SOUS-ESPECES1

    s.sp AMERICANUM

    cultivé

    P. typhoidesP. Nigritarum

    -----r-------·---· --------.---.- -------. 1s. sp MONODII s. sp STE'NOSTIlCIlYUM

    morphologiquementIntermédiaire entres. sp americanum ets. sp monodii

    etc. . .. etc. . .. Sh 1bras

    CLASSiFICATION DES PENNISETUM (BRUNKEN 1977)

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  • Nous avons analysé 38 échantll Ions (fig. 5), af~n de voIr sI la

    varIabIlIté décrIte par les prospecteurs se retrouvait au niveau des

    esté rases car~y' Iques.

    C. LE SYSTEME ENZYMATIQUE ETUDIE

    1. MISE AU POINT BIBLIOGRAPHIQUE

    les estérases forment une famille enzymatIque dont le rôle est

    d'hydrolyser les lIaIson esters. El les ont été étudIées chez plusIeurs

    organismes, animaux et végétaux; aInsI, chez le poIsson d'eau douce

    Catostomus c~~kii~ la varIatIon des estérases du sérum est dOo à la

    ségrégation de deux allèles codomlnants d'un même gène, qui se mani-

    feste é 1ectrophorétl quement par trois phénotypes (RJ:CHARD, K. KOEHN,

    1969) ; cette sItuation se rencontre aussI chez Dro8ophi~a me~anogaster,

    où les Isozymes 6F et 6S sont contrôlés par deux allèles du locus est-6

    (WRIGHT, 1963). Chez le maTs (S.. 1 1964-1965), le comportement

    électrophorétlque de l'estérase pH 7,5, codé par le gène El montre une

    seule bande chez les Individus homozygotes, et l'apparition d'une

    troIsIème bande, chez les hybrIdes, sItuée à mI-dIstance entre les

    bandes pare~tales ; l'enzyme seraIt un dImère (SCHWARTZ, 1960 ; WORD,

    1977 ; SHANNON, 1978). Les travaux effectués dans le laboratoire d'é-

    lectrophorèse de l'O.R.S.T.O.M. par HOUDIARD (1977) et par DUBAYlE

    M.C. (1978), sur le mIl, conduisent aux mêmes conclusIons. Enfin,

    on note une varIation quai Itatlve et quantitative des Isozymes en

    fonctIon des tIssus, et du stade de développement de la plante

  • 2. PREPARATION DU GEL DE POlYACRYLAMIDE A 7,5%

    Nous avons utilisé la méthode de DAVIS, nommée "Dise-électropho-

    rèses", dans 1aq ue Ile 1e ge 1 est mou 1é en forme de cy 11ndres dressés

    verticalement pendant la migration; dans une fiole à vide on met :'

    - une part de la solution 1

    - une part de la solution 2

    - deux parts de persulfate d'ammonium (voir composItion des

    solutions tableau I~ ; après dégazage du mélange. celui-ci est coulé

    dans des tubes de verre de 12 cm de long et d'environ 0,6 cm de diamè-

    tre Intérieur; la ~éllflcatlon qui se fait à 19abrl de l'air (on dé-

    pose une goutte d'eau au-dessus du gel) et à la température ambiante

    dure au moins une heure.

    3. EXTRACTION DES ESTERAS ES

    La graine est écrasée à la main dans, un mortier, avec un pl Ion,

    et [a farine recueIl Ile dans un petit tube dans lequel on ajoute

    200 ~I de tampon d'extraction (voir composition tableau Il). Après

    homogénéisation, la suspension est laissée au repos pendant au moins

    20 mn (les extraits peuvent être conservés plusieurs jours dans la

    chambre froide) ; Il n'est poInt besoin de centrlfuger~

    4. ELECTROPHORESE

    Dans le swrnageant, on ajoute une goutte de bleu de bromophénol

    1%0, qui permet de suivre la migration. 100 ~I d'extraits sont déposés

    sur la colonne de gel, préalablement enfilée dans le bac supérieur de

    l'appareil à électrophorèse APElAB (voir fig. 6) ; le bac comporte un

    gel destiné à recevoir l'extrait témoin obtenu en mélangeant les farines

    de trois lignées dont les uniques bandes, homodlmères, représent6nt

    chacune un allèle (allèle R2 pour llGUI ; R6 pour THIOTANDE ; R4 pour

    Jl04). La migration a 1leu en chambre froIde, et dure environ 2 h 30 mo

    sous un ampérage de 2,5 mA par tube de gel.

    5. REVELATION

    la méthode utIlisée est celle de SHAW et PRASARD 1970 (voir solu-

    tion d'Incubation tableau IV page ~)~

  • Solution 1

    TABLEAU 1 gel de polyavrylamlde 7,5 %

    HCl 1 N : 24 ml

    TRIS: 18,15 mg (Trlshydronymethyl-amlnométhane)

    TEMED : 0,23 ml (Tetra méthyl éthylène-dIamIne)

    H20 Jusqu'à 100 ml

    SolutIon 2 Acrylamlde: 28 g

    BI5 : 0,735 g (Méthylène - bis - acrylamlde)

    H20 jusqu'à 100 ml

    Solution 3 PERSULFATE D'AMMONIUM: 140 mg/l00 ml

    TABLEAU fi Tampon d'extractIon

    TGSM : 0,75 ml

    TRITON X 100 à 1% : 150 MI (élImine les IIprdes membranalres)

    DMSO à 10% : 100 MI (amélIore l'extraction des enzymes par aug-

    mentatIon de la perméabilité cellulaIre)

    TGSM : - Tampon de mIgration Trls-glycrne (tableau 1JI)

    - Saccharose 40% (alourdIt l'extraIt lors de la mlgratron)

    - Mercapto ethanol 20 mM

    TABLEAU III

    -3Tampon de mIgratIon TRIS-GLYCINE 4,95.10 MpH 8,3TRIS: 6 g

    GLYCINE: 28,8 g

    H20 jusqu'à 1 lItre à drtuer 10 fols au moment de l'emploi

    TABLEAU IV

    RévélatIon des estérases :

    FAST BlUERR : 100 mg

    TRIS-HCl 0,05M pH 7,1 : 97 ml

    a, ~ NAPHTYl ACETATE 1% : 3 ml

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    t\G.b: ~C.HEMA 1)E LOAffAREILA ELEC.TRO?HORE5E....

  • l'emploi simultané de ~ et a -naphtyl- acétate permet de dissocier

    les Isomères ~ et a des estérases j l'Incubation dure 15 mn et a lieu

    à l'obscurité et à la température ambiante j la détermination des

    allèles se fait par comparaison avec le tube témoin et en s'aidant

    d'un négatoscope.

    III. RESULTATS

    1. DESCRIPTION DES ZYMMOGRAMMES (fig. J page~~)

    les esté rases migrent de la cathode vers l'anode. Dans la nomen-

    clature des bandes, les chiffres Indiquent l'ordre chronologique de

    découverte des allèles et non celui de la migration j J'emploi d'un

    mélange à parts égales de a et ~ naphtyl acétate comme substrat de la

    réaction de révélation permet de distinguer deux types de bandes sui-

    vant la couleur~

    1.1. lES BANDES MARRONS

    El les révèlent la présence des Isomères a des estérases

    nous en avons dénombré quatre~ toutes communes aux 38 échantll Ions

    étudiés j leur déterminisme génétique n'est pas encore élucidé; deux

    d'entre el les, les bandes m4 et m6, facilement lisIbles car Intensément

    colorées~ sont présentes dans toutes les graines; les deux autres, m3et m5, manifestent une faible activité, parfois difficilement décelable

    une durée d'Incubation prolongée (30 à 45 mn) appliquée à quelques échan-

    tll Ions a révélé la présence simultanée des quatre bandes marrons dans

    toutes les graines j mals les bandes roses tendent à se foncer, ce qui

    ~eut rendre difficIle la distinctIon entre les deux types de ~andès, surtout entre,la m6 et [a R] qui sont juxtaposées; pour cette ralson~ ce traitement

    a été évité. le manque de variabilité qui semble exister au niveau des

    bandes marrons~ nous a amené à les exclure du reste de l'analyse qui ne

    concernera que les roses.

    1.2. lES BANDES ROSES

    Elles sont sIgnificatives de la présence des Isomères ~ et

    migrent plus vite que les précédentes; Il n'y a aucune amblguité de

  • R1R3R1R6R1R5R1R2R4R4R3R3R6R6R5R5R2R2R1Rl

    Rl _R2 _ ._-""1

    R5_1-....jR6_ 10---1

    R3 _-I-~R4_

    '1

    M3 -M4 - I:mJJIIM5 -M6- ••

    RlR2R5R6R3R4

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    Ir

    -R1R4 R2R5 R2R6 R2RJ R2R4 R5R6 R5R3 R5R4 R6R3 R6R4 R3R4

    F\G.l REPRE&ENTATION SCHEMATIQUE DES DIFFERENTSles chiffres indiq'uent l'ordre de découverte des allèles

    ~ Position des allèles

    Z YM OGRAM MES

    ...w

  • lecture à leur niveau, et leur déterminisme génétique est bien connu:

    les variations observées sont dOes à la disjonction d'allèles d'un même

    locus; l'enzyme étant un dimère, le zymogramme correspondant à chaque

    graine comporte, soit une bande (homozygotie), soit trois bandes (hétéro-

    zygotie) ; dans ce dernier cas, la bande hybride, hétérodimère, est

    située à mi-distance entre les homodimères "parentales".

    2. LES DEUX NIVEAUX DE VARIABILITE

    2.1. VARIABILITE INTRA-ECHANTILLON (voir dernière page)

    A l'intérieur de l 'échanti 1 Ion, on note une grande varia-

    bi 1 ité al lél ique d'une graine à l'autre; nous avons dénombré six al lè-

    les dans chaque échanti 1 Ion, sauf cinq d'entre eux qui en présentent

    cinq (voir tableau des fréquences al léliques, fig. 8, page 15 et 16)

    cela entraine la présence d'un grand nombre de zymogrammes différents

    (page 13). Les individus se distinguent aussi par le nombre de bandes

    -une ou trois- qui traduit la variabi 1 ité à l'intérieur d'un locus:

    homozygotie, et hétérozygotie.

    Les fréquences alléliques à l'intérieur d'un échantillon

    sont très inégales: dans chaque champ Sénoufo et Lobi, l'allèle pré-

    dominant est soit R1 soit R2 • Chez les Malinké, la première place re-

    vient à R3 ou R5 ou R6 (voir tableau des fréquences al léliques (fig. 8,

    page 15-16) ; cela se répercute sur la fréquence des zymogrammes : les

    plus fréquents sont les combinaisons des allèles R1

    ou R2 chez les

    Sénoufo et Lobi, alors qu'i 1 s'agit des combinaisons de R3 ou de R6chez les Malinké.

    La multipl icité des allèles se comprend aisément quand on

    sait que le matériel végétal étudié n'est pas une structure à base

    génétique étroite, type 1ignée ou hybride F" mais un amalgame de cul-tivars traditionnels n'ayant fait l'objet d'aucune sélection poussée.

    2.2. VARIABILITE INTER-ECHANTILLON

    El le peut être abordée en considérant deux critères:

    d'une part, la variation qualitative et quantitative des allèles, et

    d'autre part, cel le des génotypes représentés par les zymogrammes.

    -14

  • 2.2.1. VARIATIONS DES FREQUENCES ALLELIQUES

    A part cinq échanti 1Ions qui révèlent la présence de

    cinq allèles, tous les autres en possèdent six i la sélection des se-

    mences effectuée par les Malinké ne semble pas préjudiciable au maintien

    des allèles dans les champs i le critère présence-abseoce d'un allèle

    donné ne peut servir à distinguer les échanti 1Ions, les uns des autres

    par contre, le tableau des fréquences (page 15-16 et le classement page

    17 ainsi que les représentations graphiques page 18 à 23) montrent

    une très grande diversité des fréquences al lél iques i ils permettent, en

    outre, de constater les faits suivants:

    - Les échanti 1Ions peuvent se classer en deux groupes: le

    groupe Sénoufo-Lobi, et le groupe Mal inké i dans le premier ensemble,

    les allèles les plus fréquents sont R1 et R2 i chez les M~I inké, ce rôle

    est dévolu à R3, R5 et R6•

    - Entre mi Is Sénoufo et mi Is Lobi, la distinction est dif-

    fici le si l'on considère uniquement R1 et R2 i par contre, les fréquen-

    ces R3

    , R4, R5 et R6 nous indiquent qu'i 1 s'agit de deux groupes bien

    distincts.

    - Le graphique 14 page 23 montre qu'i 1 existe un gradient de

    la fréquence R6, d'est en ouest (un cl ine) qui se ju~tapose à celui des

    isohyètes (carte 1).

    Afin de mieux discriminer les différents échanti 1Ions, nous

    avons appl iqué la technique de l'analyse des composantes principales

    au tableau des fréquences al lél iques.

    14 bis

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    ~o"'~"'-e..h L~~ .t~}~ ~f\..)~ ~t/c) ~/1- 6;,:/0

    "'O~Q.M~ :L ~J1- ;~, ~lt I\.g,ç~' "1-45" '\.4 li- ;\. ~.{;~G\,~~' ,_0_

    1 ,....

    r \G.q. ", T A~L ë Au b ë CS Ff\ ë q> uë r-l Co ëS ALL ELI cr uë C; E l\\~ou ((Lê t-1'"'tA Gê s.

  • Classement des fréquences al léllques moyennes suivant les

    ethnIes

    ordre décroIssant

    Zymogrammes les plus fréquents suIvant les échantillons

    SENOUFO et LOBt : R1 RI' RZ RZ' R1 RZ (les 3 principaux).

  • 1

    A mallnkéso ~énoufos• lobls

    F \ C., ~ . V A RIAT ION 5 G E0 G R A PHI QUE 5 0 E$ FR Eau EN CES A L LE LI QUE S R1

    I~

    ....C1Q.

  • ;s

    ço

    ...

    \FIG.-\.OVARIATIONS GEOGRAPHIQUES DES FREQUENCES AllEllQUES R2

    A malinl(eso -senoufoS• lobis

    sfI CA ....U).

  • Il

    mils

    6. malinl

  • ,"

    ,,1,

    )

    1

    n-,lls

    A malinl

  • FIc, ,\,~ .. VARIATIONS GE.OGRAPHIQUES DES FREQUENCES AllElIQUES R5

    0. malin/

  • ç \

  • ANALYSE DES COMPOSANTES PRINCIPALES

    a - but et prIncIpe

    La méthode, quI a l'avantage d'être exempte d'hypothèses restrIc-

    tIves, a pour prIncIpe de se ramener à partIr d'une matrIce de grandes

    dImensIons, à un petit nombre de variables Indépendantes entre elles,

    appelées facteurs, quI sont des combinaIsons lInéaIres des varIables

    InitIales; el le aboutIt à la projection du nuage de points de départ,

    dIffIcilement vlsuallsable, dans le plan des facteurs principaux pris

    deux à deux. Mathématiquement, chaque axe factorIel est donné par le

    vecteur propre associé à chaque valeur propre de la matrIce carrée

    symétrique 0 x D' (0 ~ matrice Initiale, D' = transposée de 0) ; la

    recherche des facteurs se fait par diagonal Isatlon de 0 x D'.

    b - SIgnificatIon des axes

    le traltement à l'ordInateur des données nous fournIt le tableau

    des saturations (corrélation des varIables InItiales avec les facteurs)

    et le pourcentage de variance expliquée par chaque axe (tableau 1 et Il

    page "'1 ). Nous n'exploiterons que les troIs premiers axes quI repré-sentent 85% de la varlabl lIté:

    - axe 1 : forte Influence positIve de R2 et assez forte Influence

    négatIve de R6- axe 2 marqué posItivement par Rl et négatIvement par R3

    - axe 3 forte partIcIpatIon posItIve de RS et assez forte

    partIcipatIon négatIve de R3

    c - projectIons dans le plan des axes prIncipaux

    c.l - plan des axes 1 et 2 (graphique 15 page 'V( >.La projectIon dans ce système d'axes ne permet pas de dlstJ:n-

    guer des agrégats bIen nets j des échantll Jons, proches géographIquement,

    se retrouvent éloIgnés sur le graphIque; cela confirme la grande dIversI-

    té des f réq uences ail é 11ques ; en outre, corrme 11 ava 1t été noté p.1 us tôt,

    Il n'apparatt aucune dIscrImInatIon entre mIls Sénoufo et mIls Lob 1 quI

    se caractérisent par de fortes fréquences en R1

    et en R2 ;

  • (..\ }..'-~ 1 A _1 ~ [ 4,1 1

    b 11

    1 ~- 1 11\...x> '-U'" L.~v-.\~"- ~ 4JQ.~4...

    3t:~ l,~, \;- ~~ ... '2;> ~~ ~... 6 1..~~t~~ '\"\,.\)..N .....t ft.r\ ,L>

    ) j~

    '\....o~~QJ\ ~~ ~t-''l;, G;:t ~5 ~~)~ ~~}6 ~oo

    ~~ lA~ ~ ~ P-.~ (J..~ ~~ Rb

    ~ Oj~b o/~lt_ o ... l;-~ - 0 ~4- _ 0) Q.1 _ c,.l6~...

    1> 0; ~'"-';l - c/~~ - o,5'f. o ... e~ 0 ... oS" - c.... ~t-

    -~ O)i.4 10... 05 _ 0 (,~ _ c;'":!>:t. °hC6~. 0-, 1,~.1

    -4 ~)\.C1l c o't> _ooç _ 1.:1... 6C:f. - Q/ 1.~ \Ï 5-';.; .) ,,1

    ~- o c~ e;, c~ _ 0 ... ~-).. Ct G~ - ~.J~S -=>... :1..'=1-) ... -',

    1

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    ) j '"

  • AXE2III "

    .' OA

    649'"

    ----------------------h----......--.....:~---------------AXE 1

    'AN

    .' 2A

    .21 A

    ., A

    DIVERSITE DES FREOUENCES ALLELIOUES _ PLAN DES FACTEURS' ET 2

    • MALINKES

    • SENOUFOS

    6 LOOIS

  • par contre, les Loblsemblent se dIstInguer par leur position qui rap-

    pelle leur richesse en R3 et R6 ; toutefoIs leur faible effectIf lImIte

    la portée de cette analyse.

    c.2 - plan des axes 1 et 3 (graph 1que 16 page 'VI).

    Les échantll Ions lob! se distinguent très nettement par leur

    position en dessous de l'axe 1 ceux des Sénoufo se répartissent en

    majorIté au dessus de cet axe, mals quelques uns d'entre eux se retrou-

    vent avec les Lobls, ce quI Indique une grande varIabIlité des fréquen-

    ces al/éllques au nIveau des champq Sénoufo. Les MalInkés se sIgnaient

    plus nettement IcI encore par leur position à la périphérie du nuage

    de poInts; de plus Ils sont très distincts l'un de l'autre; les fré-

    quences R3, R5 et R6, les plus élevées sont rencontrées séparément dans

    les échantl lions MalInké j cela est sans doute le résultat de la sélec-

    tion des semences qui favorIserait ces al [èles.

    c.3 - plan des axes 2 et 3 (graphique 17 page~~ ).

    Cette représentation est semblable à la précédente: les

    lobl sont tous sItués en dessous de l'axe 2 ; les Sénoufo se retrou-

    vant un peu partout p mals en majorité au-dessus de cet axe.

    En conclusIon, l'analyse des composantes principales nous

    a révélé l'Importance de l'axe troIs dans la dIstinctIon entre mils

    MalInké, Sénoufo et Lobl ; cela Indique le rôle dIscriminatoire des

    allèles R3 et R5 qui sont fortement corrélés à cet axe.

    2.2.2. VARIABILITE AU NIVEAU DES ZYMOGRAMMES

    Les six allèles répertoriés peuvent s'assocIer de plusieurs

    manières qui se manIfestent, électrophorétlquement et théoriquement par

    21 zymogrammes différents schématiquement représentés figure 'lf3'- page1 11

    Le tableau des fréquences des zymogrammes (fIg. 18 page ,~

    à ~\..) appelle les remarques suivantes:

    - aucun échantll Ion ne possède sImultanément tous les 21

    zymogrammes théoriques; le nombre varIe de 7 à 17.

    - aucun zymogramme n'est présent à la fols dans tous les

    38 écAà~tlhlons.

  • ( .., l' .

    . ... --- --._.-------_.__.. -~.~ ._~- ..._- - ..

    [JSA

    AXE3

    24/11) 23 A 2

    o

    NCO

    1\)([1

    2' A30'1 0U

    bOA ~r

    2~AN

    'AN 'â ACi' A

    1\'1

    014'1

    46'1li.48 A

    l' A , 3'10 0, BA

    0

    Ô''''

    ~3A

    7U'lo

    27'1o

    1\40"

    A.t'A li.li.SDA 5 'A

    i'i.52'1 017'1

    -2".---------------------- 0 --t-----.. 344

    n'A

    l=',c, 16:UIYEIISITE l>ES FIIEOUENCE~ AU[lIUUr.s - l'LAN DES FACTEuns , ET 3U MI\IIN'U'.:>

    o SI.I'II)UIOS... LODI!> , .

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  • " /1~/ll•

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    .° 111

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    "/1

    JI,. 6 .' 'Afi.47/1'4 /1 834/1

    57/1 AXE7

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    • M 1\1lNl(ES

    • SENOUFOSlit. 1 _ ... _

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    41- Ac;C

    4ttf\a-1

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    SoA

    S"A..A

    ~J.,tt\

  • Lorsqu'on considère les groupes ethniques on note que

    - les échantillons Mallnkésont tous, les zymogrammes

    R6R6 et R2R6 ; Il Y a absence totale de R4R4

    les mils Lob 1 sont caractérIsés par la présence simul-

    tanée des zymogrammes R2Rz, R2R3 et R2R4- les échantll Ions lobl prêsentent le plus grand nombre de

    zymogrammes : en moyenne 13,6 pour les lob 1 ; 12,3 pour les Sénoufo j

    12 pour les Malinké.

    Toutes ces variations peuvent être liées à cel les des

    fréquences alléllques, ou dOes à un échantillonnage d'IndivIdus Insuf-

    fisant.

    3. APPORT DU VIOLACEUM

    Dans la collectIon, certaIns faux épis manIfestaient des carac-

    tères de la sous-espèce sauvage Pennisetum vioLaceum. En ce qui concer-

    ne les estérases, on ne note aucun apport allél Ique par Violaceum ; ce

    résultat est conforme à celuI de DUBAYlE M.C. dont les travaux (1973)

    ont montré que la populatJon sauvage sénégalaIse S.L. 68 de P. vioLaceum

    contJent les même allèles que les formes cultivées.

    }}

  • IV - DISCUSSION - CONCLUSION

    L'analyse électrophorétlque des estérases des grains de mil de

    C5te d'Ivoire a conduIt aux prIncipaux résultats suivants

    - Les six allèles mis en évidence, sont présents da s presque

    tous les échantillons mals leurs fréquences sont très fluctuantes

    d'un champ à l'autre.

    - les fréquences R1 et RZ ne peuvent servIr de critère de discri-

    minatIon valable pour laquelle 11 faut recourir aux allèles R3, R4, R5ri~

    - les échantIllons MalInké se sItuent à la périphérIe du nuage de

    poInts quelque soit le système d'axes utIlisé pour sa représentatIon

    graphrque.

    - Le groupe de Mils Sénoufo se sIgnale par une grande variabIlIté

    des fréquences al léllques ce résultat peut être mIs en parai lèle avec

    le poly.~orphisme décrit par les prospecteurs au nIveau des caractéristi-

    ques du faux-épis; l'Incite à se poser la question suivante: exlste-

    t-TI une corrélation signifIcative entre caractéristiques du faux épis

    et le comportement électrophorétlque et la fréquence des Isozymes d'eB-

    térase ? mals certains facteurs limItent la portée de l'analyse et

    rendent difficile l'Jnterprétatlon des données:

    - le bJals d'échantillonnage: Il se sJtue à trois nIveaux

    tout d'abord, les échantillons récoltés ne sont pas représentatifs de

    tous les mils de Côte d'Ivoire j comme le montre la carte des prélève-

    ments, ceux-cl n'ont pas été étendus plus au sud de la zone prospectée;

    de ce fait les rssultats ne sont pas extrapolables à toute la région

    qui s'adonne à la culture du mil. EnsuIte; le nombre d'échantIllons ré-

    coltés par ethnie est très Inégal et trop faible pour autoriser une In-

    terprétation statistique convenable. Enfin, on peut se p0ger la question

    de savoIr si les faux épIs récoltés ct la trentaine de graines analysées

    représentent bien le champ.

  • - le manqu~ d'uniformité des techniques culturales: les

    pratiques culturales ne sont pas Identiques chez les Sénoufo ; ainsi

    les prospecteurs notent que certains paysans sélectionnent leurs se-

    mences ; d'autres, pratiquent le démarlage ; mals Il est dommage que

    l'on ait pas spécifié les champs dans lesquels ces opératIons ont lieu.

    Malgré ces restrIctIons, le crItère présence-absence d'un

    allèle donné nous permet de faire un rapprochement entre nos résultats

    et ceux de TCHAlA (communication personnelle) sur mils du Mail,

    Sénégal, Cameroun, Togo, NIger et Centrafrique: dans ces pays, les

    échantII Ions analysés renferment presque tous les allèles R1 à R6 ;

    Ils ne diffèrent des nôtres que par un seul allèle (R7 au Cameroun et

    au Niger; Re au Togo; Rg au Sénégal). Au Mal f, zone de grande cultu-re de mil et au nord de la Côte d'Ivoire, on rencontre les mêmes allèles

    (R1 à R6) ; à la suite de cette comparaison, Il semble dlfflcl le de

    trouver un plus grand nombre d'allèles en Côte d'Ivoire, que dans les

    grands centres de culture du mil

  • B 1 B LlO G R A PHI E

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