Epidémiologie du choléra en Sierra Léone et Guinée · 2018-03-12 · Préparation & réponse...

Epidémiologie du choléra en Sierra Léone et Guinée

Contexte

Préparation & réponse choléra Sierra Léone et Guinée – Dakar Dec. 2012 - ACF 2

Contexte géographique

Littoral vs Inland

Climat

Population

Capitale littorale

Voie de communications

Plateau guinéen

Activités commerciales

2 ou 4 ?


0

5000

10000

15000

20000

25000

30000

35000x

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30000

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30000

35000

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5000

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05000

100001500020000250003000035000

x

1970

1972

1974

1976

1978

1980

1982

1984

1986

1988

1990

1992

1994

1996

1998

2000

2002

2004

2006

2008

2010

2012

x


Synthèse

Nombre de cas Nombre de décès Nombre de cas Nombre de décès

1970 Oui Guinée 2000 60 293 731971 0 0 211 131977 Juillet Guinée 0 0 12 01978 Juillet 13251 59 0 01986 Janvier Oui Kabak/Kakossa 9222 78 8957 6691987 Sierra Leone 0 0 557 301994 Juin Oui Sierra Leone Kambia 31415 671 9709 6261995 Oui 6506 565 10285 4471996 287 17 0 01998 Juillet Oui Forecariah 881 53 2096 571999 Septembre Oui Kambia/Forecariah 599 28 863 52000 519 32 0 02001 392 22 0 02002 61 11 0 02003 6 1 0 02004 S 30 Oui Guinée Forecariah 1516 117 1747 472005 Oui Kambia/Forecariah 3821 107 6 02006 Aout Oui Guinée 3242 219 2699 1242007 S 4 Oui Sierra Leone Kambia 8546 311 2219 842008 S 16 Oui Guinée Guinée forestière 513 32 62 12009 42 0 0 02012 S 1 Oui Sierra Leone Kambia 7227 128 22495 293Total 90046 2511 62211 2469

75488 2369 61431 2426Sous-total épidémie transfrontalières

Année

Guinée Sierra Leone

Relais de diffusionPays de

déclanchementDebut (semaine)

Epidémie transfrontalière


Historique

Diffusion littorale

Saisonnalité

Amplitude

Inter-connexion

1970

1978

1986

1994

2004-07

x

0

5000

10000

15000

20000

25000

30000

35000

x

xx

0

5000

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15000

20000

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30000

35000

x

x19

7019

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7419

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8019

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9019

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9619

9820

0020

0220

0420

0620

0820

1020

12

x

2012


2003-2012

0

250

500

750

x

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250

500

750

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250

500

750

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250

500

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2002

w40

2003

w1

2003

w13

2003

w26

2003

w40

2004

w1

2004

w14

2004

w27

2004

w40

2005

w1

2005

w13

2005

w26

2005

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2006

w1

2006

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2007

w1

2007

w13

2007

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2007

w40

2008

w1

2008

w14

2008

w27

2008

w40

2009

w1

2009

w13

2009

w26

2009

w40

2010

w1

2010

w13

2010

w26

2010

w40

2011

w1

2011

w13

2011

w26

2011

w40

2012

w1

2012

w14

2012

w27

2012

w40

2013

w1

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750

500

250

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750

500

250

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750

500

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750

500

250

1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40 1 13 26 40

2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012

Wee

kly

num

ber o

f cho

lera

cas

e

Week / Year

Conakry

Maritime Guinea

Others Prefectures

Guinea

Metastabilité littorale


Semaine 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 522003 Conakry ← →

Coyah ← →Dubréka ↔Kindia ← →

SeptembreJuin MarsJanvier

2004 Boffa ← →

Kindia ← →Lélouma ← →Dalaba ← →Télémélé ← →Coyah ← →Dubréka ← →Conakry x ← →Forécariah x ← →

2005 Conakry ← → … ?Dubréka ← →Forécariah ← → ← →Coyah ← →Kindia ← →Pita ← →Boffa ← → … ?Boké ← → … ?

Semaine 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 522006 Conakry ← →

Coyah ← →Kindia ← →Dubréka ← →Forécariah ← →

Boké x x

Janvier Mars Juin Septembre

2007 Forécariah ← →Dubréka ← →Conakry x ← →Coyah ← →Boffa ← →Boké ← →Fria ← Kindia ← →Télémélé xDalaba ← →Dabola ← →

2008 Boké ← →Boffa ← →Gaoual x

Conakry (Dixinn) x


Saisonnalité

Lien écologique

n’ est pas causalité.

Cependant utile pour la préparation

Facteurs macro vs micro

0

50

100

150

200

250

300

350

400

450

500

0

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300

400

500

600

700

800

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…

0

…

0

…

0

…

0

…

Somme de précipitation Somme de cas

2003 2004 2005 2006 2007Precipitation Cas


2012: Courbe épidémique Guinée vs Sierra Leone

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500

1000

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52

Guinée Sierra LéoneSemaines

N cas


2012: Courbe épidémique Conakry vs Freetown

0

500

1000

1500

2000

2500

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52

Conakry FreetownSemaines

N cas


Sem 1-4

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45


Sem 5-21

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45


Sem 22-28

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45


Sem 29-34

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45


Sem 35-40

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45


Sem 40-45

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45


2012 : Exemple de démarrage

Prefecture Date Hisoitre du premier cas

Forecariah 02/02/2012Un jeune homme de 15 ans provenant du village de Bailó (Sierra Léone) était arrivé a Khounyi le 2 février pour rendre visite a son père qui travaillait a…. Il est resté a khouni chez la famille de son onlce. Ce soir là, il a commencé avec diahrree et vomissement intense et le lendemain a été envoyé de retour à Bairo, où il est décédé

Boffa 23/02/2012 Jeune pêcheur de 15 ans, retourné à Boffa dans une embarcation qui venait des activités de pêche de khounyi

Bokké 22/04/2012Jeune pêcheur de 25 ans, retourné à Boké dans une embarcation qui venait venait des activités de pêche de khounyi. Est décédé.

Conakry 29/05/2012 Jeune de 25 ans, commercant de vetement était parti au marché de Kabak ou il a contracté le choléra

Kindia 24/07/2012Une femme ménagère de Colanté qui est aller à Conakry pour rendre visite a une personne de sa famille malade de choléra. Elle est décédé.

Fria 28/07/2012 Hommes de 29 ans, mécanitienCoyah 01/08/2012 Homme de 25 ans, boucher

Kerouané 30/08/2012 Homme cultivateur de 65 ans. Décédè. L'origine de la maladie n'a pas été identifiéKankan 0/08/2012 Chauffeur de taxi de 28 ans, venait de Conakry pour Kankan.

Mamou Ressortissant de Mamou qui réside a Conakry, était aller a Niagara (sous-préfecture de Mamou) chez sa famille pour leur aporter des aliments. A comencé les symptomes là bas. Mort en cours de route car le centre de santé n'avait pas les moyes pour la prise en charge


Pref_sanitaire Cas Déces Cas DécèsDurée

épidémique TIC / 10 000 hab

Létalité

(n) (n) (%) (%) (n. sem) Com.Conakry 4617 24 63,9 18,8 24 28,1 0,5Kankan 53 5 0,7 3,9 3 1,3 9,4Kérouané 90 6 1,2 4,7 9 3,9 6,7Mamou 123 11 1,7 8,6 15 3,5 8,9Kindia 121 4 1,7 3,1 9 2,8 3,3Coyah 668 11 9,2 8,6 17 52,2 1,6Dubréka 354 7 4,9 5,5 16 17,9 2,0Forécariah 342 29 4,7 22,7 34 11,6 8,5Boké 210 8 2,9 6,3 20 4,8 3,8Boffa 281 11 3,9 8,6 25 12,0 3,9Fria 355 10 4,9 7,8 11 28,9 2,8

7227 128 100 100 6,04 1,77

Cas Décès

(%) (%) 2,8 4,81,4 3,41,7 5,14,5 4,80,0 0,02,9 1,00,8 0,75,9 5,56,7 10,90,3 0,0

15,3 19,85,3 10,9

52,2 33,1

100 100

TIC / 10 000 hab

10,921,214,838,60,0

11,35,0

29,246,02,7

65,829,8

66,9

35,37

Durée

épidémique

(n. sem) 171316240

118

17448

4116

21

Létalité

2,23,23,81,40,00,51,11,22,10,0

1,72,7

0,8

1,30

District

BoBontheMoyambaPujehunKailahunKenemaKonoBombaliKambiaKoinaduguPort LokoTonkoliliWestern Area

Total

Cas Déces

(n) (n) 638 14312 10391 15

1020 140 0

647 3186 2

1326 161510 32

70 0 3450 58

1200 32 11745 97

22495 293


2012 : Profil épidémiologique

Guinée Sierra Léone

Démarrage littorale S5

Diffusion initiale : …mai

Boké-Boffa S7

Capitale : S22 # S30-35

• Amplification

• Facteur météorologique

• Hétérogénéité spatiale

• # S22-S29 : Préf. Voisines

Extension Guinée Bissau

Saison sèche

• Date – augmenation AWD ?

Démarrage littorale S2

Diffusion initiale : …mai

Frontière Libéria S7

Capitale : S24 # S30-35

• Amplification

• Facteur météorologique

• Hétérogénéité spatiale

Extension Libéria

Epidémiologie du choléra en Sierra Léone et Guinée · 2018-03-12 · Préparation & réponse...

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