Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais...

13
Journées de restitution Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department E XPLORATION DES POTENTIALITÉS DES SOURCES LASER SUPERCONTINUUM POUR L IMAGERIE MULTIPHOTONIQUE Claire Lefort , Rod O’Connor, Véronique Blanquet, Fabienne Baraige, Philippe Lévêque, Vincent Couderc, Philippe Leproux Université de Limoges – CNRS XLIM Research Institute UMR 7252 – INRA Unité de Génétique Moléculaire Animale UMR 1061 – Projet ARKENCIEL

Transcript of Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais...

Page 1: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department

EXPLORATION DES POTENTIALITÉS DES

SOURCES LASER SUPERCONTINUUM POUR

L’IMAGERIE MULTIPHOTONIQUE

Claire Lefort, Rod O’Connor, Véronique Blanquet, Fabienne Baraige,Philippe Lévêque, Vincent Couderc, Philippe Leproux

Université de Limoges

– CNRS XLIM Research Institute UMR 7252 –– INRA Unité de Génétique Moléculaire Animale UMR 1061 –

Projet ARKENCIEL

Page 2: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 2

Consortium : l’interdisciplinarité

Physiciens Informaticien Biologistes Neuroscientifique

Claire Lefort

(coordinateur)

Philippe Lévêque

Vincent Couderc

Philippe Leproux Véronique Blanquet

Fabienne Baraige

Rod O’Connor

Page 3: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 3

Multiphoton microscopy in life sciences

Quantitative analysis of

dynamics intracellular

processes

Membrane potentials

measurements

Calcic flow for neural activities

Following of tumor

evolution

Peterdi 2009, Stosiek 2003, Jung 2004

Following of cancerous

biomarkers

Spectral Analysis of

keratin of human

epidermis

Pena 2005, Kirkpatrick 2007, Cheng 2012

Collagen structure

visualization

Page 4: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 4

Multiphoton multicolor microscopy: the interest of a wideband excitation

Exogenous labelling

We want to see Labelling 2P Absorption Emission

Blood vessels Texas Red 790 nm 610 nm

Tumor cells mVenus 950 nm 530 nm

Cell nucleus DAPI 740 nm 460 nm

Calcic flow Fura-2 700 nm 500 nm

Immune cells Alexa 568 850 nm 600 nm

Endogenous fluorophores

We want to see 2P Absorption Emission

Elastin 730 nm 610 nm

Retinol 720 nm 530 nm

NADH 700 nm 460 nm

A wideband laser excitation for:

Excite a large panel of exogenous or endogenous fluorophores

Image several fluorophores simultaneously even with very

distant TPA spectra

Adapt the excitation to the TPA spectra

Zone couverte par

la source standard

(10 nm de largeur)

Page 5: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 5

Wideband excitation for multiphoton imaging: literature

Typically: spectral broadening of femtosecond pulses in a photonic crystal fiber

(PCF) associated with a step of pulse shaping for temporal compressing

Dong Li 2009

(Applied Physics Letters)

Interesting solution answering the

questions, BUT:

Complex technically (not turn-key solution)

Expensive

Unstable in the time

Page 6: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 6

Multiphoton process with a nanosecond SC source: 1st experimental test

Page 7: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 7

Two proteins imaged:- Myosin (muscular contractions)

- Actin (structure)

Alternation of myosin and actin

Detected signals:- SHG for myosin

- 2PF for actin (labelling: Alexa fluor® 546)

Multiphoton process with a nanosecond SC source: 1st experimental test

Page 8: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 8

Scale bar : 10 µm

SC

Ti:Sa

Actine

Alexa 546 Myosine

SHGSuperimposition

Comparison on the image quality obtained

between nanosecond SC and Ti: Sa sources

Multiphoton process with a nanosecond SC source: 1st experimental test

Page 9: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 9

Scale bar : 10 µm

SC

Ti:Sa

Actine

Alexa 546

Myosine

SHGSuper-

position

Quantification of the signal contrasts

Same contrast for SHG

Better contrast in 2PF with Ti: Sa

Multiphoton process with a nanosecond SC source: 1st experimental test

Page 10: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 10

Why a nanosecond supercontinuum source allows multiphoton processesBooth et al.1998 : Imagerie 2P CW

Bewerdorf et al.1997 : Imagerie 2P ps 200 MHz

Denk et al. 2006 : Principes physiques de la MPM

𝛹 ∝

Multiphoton

emission flow

Laser peak

power Laser average power

Laser repetition rate

Laser pulse duration

Cste ∝ fluorophore,

objective…

𝜂 𝑃

Laser peak

power

Cste ∝ fluorophore,

objective…

𝜂 𝑃

Ti:Sa SC

f 80 MHz 250 kHz

τ 150 fs 1 ns

𝑷 10 mW 2.2 mW

For a constant Ψ

Page 11: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 11

Multicolor multiphoton microscopy

In vivo multiphoton imaging with a SC source

Tumor cells U87 labelled with eGFP

Blood vessels labelled with Texas Red

eGFP

SC

Texas Red

Page 12: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department 12

Conclusion sur les résultats

Two-photon fluorescence and second harmonic generation

Similar between a nanosecond supercontinuum source and classical Ti: Sapphire laser

Good contrast in second harmonic generation

Progress to do for increasing the two-photon fluorescence contrast adjusting better the

excitation spectrum to the two-photon absorption one

Démonstration de principe réussie

mais utilisation d’un système commercial non adapté pour

l’objectif du projet ARKENCIEL

Achat d’un microscope 2P tout ouvert

Page 13: Défi Imag’In 2015 Projet ARKENCIEL EXPLORATION DES ......Démonstration de principe réussie mais utilisation d’un système commercial non adapté pour l’objectif du projet

Journées de restitution – Défi Imag’In 2015 – Projet ARKENCIEL

XLIM Research institute 24 février 2016 UGMA Photonics department

EXPLORATION DES POTENTIALITÉS DES

SOURCES LASER SUPERCONTINUUM POUR

L’IMAGERIE MULTIPHOTONIQUE

Claire Lefort, Rod O’Connor, Véronique Blanquet, Fabienne Baraige,Philippe Lévêque, Vincent Couderc, Philippe Leproux

Université de Limoges

– CNRS XLIM Research Institute UMR 7252 –– INRA Unité de Génétique Moléculaire Animale UMR 1061 –

Projet ARKENCIEL