Communication Scientifique M2 MIV - Recherche documentaire...

Recherche documentaireInterfaces de gestion de bibliographie

Communication Scientifique – M2 MIVRecherche documentaire et bibliographique

M. Bailly-Bechet, d’après un document de S. Charles

Université Claude Bernard Lyon 1Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive

Bât. Mendel Mezzanine

Document disponible à :http://pbil.univ-lyon1.fr/members/mbailly

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http://pbil.univ-lyon1.fr/members/mbailly

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Table des matières

Recherche documentaire

Interfaces de gestion de bibliographie


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Que cherche-t-on ?

I Première question à se poserI Aide à fixer le cadre de la rechercheI Notions essentielles :

I Profondeur des informationsI Quantité d’informationsI Nature de l’informationI Temporalité de l’informationI Public envisagéI Langue à employer


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Où chercher ?

La réponse actuelle est : “le plus souvent, sur Internet”. Bienentendu, il existe des exceptions. . . Les autres sourcesd’information standard sont les bibliothèques, les archives, lesmusées – dont le premier rôle était de conserver des objets.Mais Internet est devenu tellement vaste que la recherche peutdevenir un cauchemar.


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Comment chercher ? Avec un moteur de recherche !

Le plus souvent, vous allez employer un moteur de recherche.Google est le plus utilisé, mais il en existe d’autres, avec certainesspécificités (discrétion, indexage des sites différent).

I Bien définir ses mots-clefs (les penser “hors-contexte”)I Attention au nombre et à l’ordre des mots-clefsI Attention à la méthode d’indexation par le site (“Google

bomb”, méthodes publicitaires. . . )


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Comment chercher ? Sur un site collaboratif ou un forum !

L’exemple le plus connu est Wikipédia.

Attention de bien vérifier l’information sur ce type de site,notamment les forums. En ce qui concerne l’informatique etnotamment la programmation, les forums Internet sont la meilleuresource d’informations, même pour des travaux sur des donnéessensibles.

Dans les deux cas précédents, il faut faire attention à latemporalité de l’information (les actualités sont exponentiellementsur-représentées) et aux problèmes de censure (locale sur les sitescollaboratifs, parfois nationale ou organisationnelle selon le cadrede la recherche).


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Comment chercher ? Sur une base de données dédiée !

Il en existe de nombreuses, dépendant des domaines. En particulier,en ce qui concerne les articles scientifiques, on trouve :

Pubmed Médecine et biologieMathSciNet MathématiquesScienceDirect GénéralisteArXiV Physique majoritairementHAL Généraliste, françaisGoogle Scholar Généraliste

Ces bases de données vont donner accès aux résumés des articles,ainsi qu’aux références nécéssaires pour les trouver dans unebibliothèque ou sur le site du journal. Elles ne donnent accès auxPDF, en général, que pour les “utilisateurs autorisés”.


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Comment accéder à un article scientifique ?

I Bases de données avec reconnaissance IP : en se connectantdepuis une BU, ou le campus, en fonction.

I BD avec reconnaissance par compte (Athens) : en ayant uncompte (payant. . . )

En pratique, n’oubliez pas que c’est l’IP de la machine depuislaquelle vous avez lancé Internet qui compte, pas celle de lamachine sur laquelle vous travaillez. . .Les BU sont souvent un bon point d’accès pour les journauxscientifiques :http://portaildoc.univ-lyon1.fr/


http://portaildoc.univ-lyon1.fr/

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Le modèle économique des revues scientifiques

Les revues font souvent payer des abonnements aux organismesscientifiques. Chaque organisme paie pour que ses employés aientaccès aux informations bilbiographiques : université, CNRS,INRIA. . . Il faut donc trouver, pour une entité de recherche, parquelle voie avoir accès à ce qui vous intéresse !


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Trucs et astuces

I Une publication inaccessible sur le site du journal (problèmed’abonnement) peut être accessible sur :

I un site de pré-publications comme ArxiVI le site web de l’auteurI JSTOR (veilles publications, accès gratuit mais limité)I Pubmed CentralI Beaucoup d’auteurs seront prêt à vous envoyer leurs

publications par email sur demande polieI Si vraiment la publication est inaccessible et semble très

intéressante, vérifier si les autres publications de l’auteur à desdates proches ne reprennent pas les résultats.


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Trucs et astuces (2)

I En fonction de leur laboratoire d’appartenance, vos collèguesont peut-être accès à des articles auxquels vous n’avez pasaccès. Notamment, les laboratoires CNRS disposent d’accèsprivilégiés à la base "Bibliovie".

I S’il vous semble que rien ne correspond à ce que vouscherchez, vérifiez votre liste de mots-clefs, et essayez detrouver les bons dans un article assez proche.


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Organiser sa recherche d’articles scientifiques

Le plus important est de se faire une idée des auteurs etlaboratoires qui travaillent sur le sujet, ainsi que de leursapproches. Cela peut prendre du temps !

I Commencer par faire une liste des mots-clefs d’intérêt ;I si vous en avez une idée, intégrer également à cette liste les

autreurs et les laboratoires travaillant sur le sujet.

Un point à ne pas oublier est de bien définir au départ les limitesde ce qui vous intéresse – vous pourrez toujours trouver des chosesnouvelles au cours de votre recherche, mais il vous faut définir àl’avance ce qui est essentiel.


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Dans les bases de données scientifiques

I À partir des mots-clefs, trouver un ou plusieurs articles derevue sur le sujet. Identifier les auteurs.

I Dans ces revues, et surtout dans leur bibliographie, trouver lesarticles et les auteurs parlant spécifiquement des pointsintéressants.

I Lancer une nouvelle recherche pour obtenir ces articlesintéressants.

I Bien noter la temporalité des articles trouvés, pour éviter deseffets "actualité" ou "vieille bibliographie".


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Recherche auteur- ou équipe-centrée

Les auteurs d’article de revue sont souvent de bonnes pistes pourlancer cette recherche.

I Une fois une équipe ou un auteur identifié comme travaillantspécifiquement sur le sujet, on peut chercher directement sespublications sur la base de données.

I Il est souvent possible d’accéder au moins à la liste despublications d’un auteur en cherchant sur sa page webprofessionnelle, ou sur le site de son laboratoire.

I Quand un sujet est abordé par plusieurs équipes de manièreindépendante, ou dans des domaines connexes, il arrive queles articles ne se citent jamais entre eux : se méfier si onobtient un seul "fil bilbiographique" sur un sujet.


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Interfaces de gestion de bibliographie


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Pourquoi utiliser un gestionnaire de bibliographie ?

I Pour organiser et retrouver vos articles,I pour annoter les articles (savoir pourquoi et quand vous les

avez cité, ce qu’ils contiennent. . . ),I pour minimiser le travail de bibliographie à refaire à chaque

nouvel article,I pour centraliser toutes vos recherches bilbiographiques et

trouver des liens entre elles.


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Principales fonctionnalités d’un gestionnaire debibliographie

I Lister tous vos articles,I effectuer des recherches par auteur ou mot-clef,I grouper et annoter des articles,I éviter tout travail de copie inutile,I faire automatiquement des citations formatées dans vos

documents.


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JabRefhttp://sourceforge.net/projects/jabref/

I S’installe sur tout OS,I spécifiquement pour LATEX,I recherche directe dans des bases externes,I gratuit.

Tutorial :http://stephlefevre.free.fr/logiciels/JabRef.php


http://sourceforge.net/projects/jabref/

http://stephlefevre.free.fr/logiciels/JabRef.php

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Mendeleyhttp://www.mendeley.com/

I S’installe sur tous les OS après enregistrement,I fonctionne avec LATEX, Word et LibreOffice,I élément de base : le fichier PDF,I fonctionnalités de réseau collaboratif avec les autres

utilisateurs,I gratuit.

Des tutorials :http://www.francoismagnan.info/node/8,http://fr.slideshare.net/amarois/

mendeley-dcouvrir-un-outil-de-partage-de-rfrences-bibliographiques.


http://www.mendeley.com/

http://www.francoismagnan.info/node/8

http://fr.slideshare.net/amarois/mendeley-dcouvrir-un-outil-de-partage-de-rfrences-bibliographiques

http://fr.slideshare.net/amarois/mendeley-dcouvrir-un-outil-de-partage-de-rfrences-bibliographiques

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Zoterohttp://www.zotero.org

I Plugin à installer sur Firefox,I permet le téléchargement de références directement depuis

Internet,I nécessite un plugin pour effectuer des citations directes sous

Word et OpenOffice,I gratuit.

Des tutorials pour Zotero :http://fr.slideshare.net/rthibert/zotero-tutoriel enfrançais,http://www.zotero.org/support/screencast_tutorialsplus complet en anglais.


http://www.zotero.org

http://fr.slideshare.net/rthibert/zotero-tutoriel

http://www.zotero.org/support/screencast_tutorials

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Bibdeskhttp://bibdesk.sourceforge.net/

I Spécialement pour MacOS et LATEX,I gratuit.

Tutorial :http://www.scribd.com/doc/19256352/BibDesk-Tutorial


http://bibdesk.sourceforge.net/

http://www.scribd.com/doc/19256352/BibDesk-Tutorial

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Endnotehttp://endnote.com/

I Fonctionne avec Windows ou MacOS,I téléchargement direct des références,I de nombreux outils de formatage des citations pour Word et

LibreOffice,I payant.


http://endnote.com/

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Comment choisir ?

I Identifier vos besoins.I Aller sur http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_

of_reference_management_software.


http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management_software

http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management_software

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