案例分析

概述

医学领域及使用大数据方面的领先企业

Caris Life Sciences 迅速部署高性能计算解决方案，实现个性化患者护理

生命科学

在 向 个 性 化 癌 症 治 疗 转 型 的 过 程

中，Caris Life Sciences需要更高效

地处理、分析、管理和存储实验室

每天生成的、以太字节计的数据。

该公司通过NeXtScale System服务

器 部 署 了 一 个 高 性 能 计 算 解 决 方

案。该解决方案可帮助Caris Life

Sciences提高利用大量不断变化的

复杂分子数据的能力，为患者快速

寻找更合理的治疗方案。

Caris Life Sciences是一家一流生物科技公司，它致力于通过品质和创新来实现精准

医疗。该公司会通过生物标志物/药物之间的关联来分析来自患者肿瘤的分子数据，

以提供在临床上可操作的信息，帮助医师对癌症患者进行个性化治疗。到目前为

止，已提取了超过65,000名患者的数据，并且有来自63个国家/地区的7,000名肿瘤

学家订购了该产品。Caris总部位于德克萨斯州欧文市，其服务遍及美国、欧洲、澳

大利亚和世界其它地区。

随着Caris为患者执行的分子图谱技术取得进展，该公司对于管理高性能分析和快速

增长的数据存储的需求也呈现爆炸式增长。为应对这些挑战，Caris需要一个可扩展

的大规模并行计算环境以及一个PB级存储解决方案，以处理数量庞大的复杂数据。

Caris Life Sciences副主席George Poste博士指出：“我们是一家走在分子诊断前列的

公司，但这也要求我们成为医疗信息服务的先驱，因为我们的产品是用于做出治疗

决策的信息。”

“ 时间对我们来说至关 重 要。我 们 正 与致 命 疾 病 作 斗 争，我们没有时间可供浪费。”—David Spetzler博士，

研发副总裁

Caris Life Sciences

英特尔 ，让数据中心更强大

联想服务器采用英特尔 至强 处理器

案例分析

解决方案组件

硬件

装有英特尔® 至强® E5处理器系列

的NeXtScale System nx360 M4

软件

IBM通用并行文件系统（GPFS）

IBM Platform HPC

业务合作伙伴

Re-Store

生命科学

研发副总裁David Spetzler博士补充说：“我们测试了癌症的许多不同的特性，并将

这些信息集成到一个复杂的生物信息管道中，在那方面，我们是所谓‘大数据’的先

驱和生成者。对于单个患者样本，我们每天就生成数太字节的数据。因此，人们谈

论的大数据对我们而言并不大。我们生成的数据极其庞大。”

为处理那些数据——通常涉及存储以太字节计的患者数据，Caris需要还能够处理来

自其它业务部门的不同工作负载的计算和存储环境。它需要帮助确保遵守各种法规

指南，包括临床实验室改进法案（CLIA）以及美国病理学会（CAP）、国际标准化

组织（ISO）及美国食品和药物管理局（FDA）制定的标准。该公司需要一个可从多

个地点访问的解决方案，它应该能够与其它计算和存储生物信息操作相集成，加强

合作，并为企业发展提供支持。

重要的是，Caris还需要一个能够快速实施的解决方案。由于采用了“技术中立”方

法，通过一系列不同方式来生成最佳患者数据，很快，该公司现有的环境就无法满

足当前需求。Caris已经实施了一些新的尖端测序设备，并通过那些设备生成和存储

数据。这时，Caris与业务合作伙伴Re-Store展开了合作。

两家公司共同开发了进行分子分析和数据存储所需的可扩展、数据感知安全基础架

构。在初次合作不到两个月后，即完成了该解决方案的安装。Spetzler博士表示：

“Re-Store团队与我们的IT部门携手合作，非常快速地构建了该系统。这是一种非常

有效的合作关系。时间对我们来说至关重要。我们正与致命疾病作斗争，我们没有

时间可供浪费。”

Caris下一代测序（NGS）流程由各种超级计算技术提供全面支持，这包括装有两个

英特尔® 至强® E5处理器系列的NeXtScale System服务器（提供处理能力）、IBM 通

用并行文件系统（GPFS）软件和IBM Platform HPC（用于进行管理）。由于具有强

大的可扩展性，每台刀片服务器可安装含40个内核的处理器（初始实施），并可过

渡到320个处理器，以便快速分析数据。

最终生成了一个可不间断进行配置和重新配置的计算存储系统。Spetzler博士表

示：“NeXtScale System吸引我们的一个主要架构特性，在于它具有完全集成的信息

存储系统。再结合底层内核的处理速度，您将获得一个非常稳健的系统，能够对我

们每天生成的庞大数据集执行大规模多线程分析。”

通过快速实施来满足迫切需求

适应现在和未来需求的超级计算能力

英特尔 ，让数据中心更强大

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案例分析

©

对Caris而言，强大的分析能力有助于更快地做出判断，帮助他们研究可能诱发癌症

的基因改变，并确定有助于肿瘤学家改进治疗手段的治疗策略。对患者而言，分析

能力意味着可以更快获得更准确的测试结果，以帮助更有效的治疗疾病。Poste博士

说：“将来的医师将依赖于分析和临床决策支持系统。我们发现，对于某些疾病，计

算机能够比大多数医师更准确地做出诊断。因此，在今后5、10或15年，数据将逐

步转化为越来越强健的预测性数据集。”

Spetzler博士总结说：“Caris Life Sciences之所以投资开发这款计算系统，是因为我

们希望在将来，不仅那些接受优秀肿瘤学家治疗的患者能够享受个性化医疗，并且

它将成为整个医疗保健的一个有机组成部分。”

有关联想数据中心系统解决方案的详细信息，请联系您的联想销售代表或联想业务

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有关Re-Store产品、解决方案和服务的详细信息，请访问：www.re-store.net

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“Caris Life Sciences之所以投资购买这款计算系统，是因为我们希望将个性化医疗作为整个医疗保健的一个有机组成部分。”—David Spetzler博士，

研发副总裁

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