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Bilan 2011 de l’inventaire participatif de l’herpétofaune sur le département du Doubs Réalisation : LPO Franche-Comté Septembre 2011

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Bilan 2011 de l’inventaire participatif de

l’herpétofaune sur le département du Doubs

Réalisation : LPO Franche-Comté

Septembre 2011

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Projet financé par : Conseil général du Doubs 7, avenue de la Gare d’Eau, 25031 BESANCON Cedex Maître d’œuvre et maître d’ouvrage : LPO Franche-Comté Maison de l’Environnement de Franche-Comté 7 rue Voirin 25000 BESANCON : 03.81.50.43.10 @ : [email protected]

Rédaction & Terrain : Nathalie Dewynter Relecture : Jean-Philippe Paul & Christophe Morin Remerciements: cf ci-dessous Photo de couverture : Vipère aspic, © Nathalie Dewynter ; Grenouille rieuse, © Claude Garnier.

Référence du document : DEWYNTER N. (2011). Bilan 2011 de l’inventaire participatif de l’herpétofaune sur le département du Doubs, Conseil Général du Doubs, LPO Franche-Comté: 13 p.

Bilan 2011 de l’inventaire participatif de

l’herpétofaune sur le département du Doubs

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Remerciements La LPO Franche-Comté adresse ses plus vifs remerciements à l’ensemble des observateurs du Doubs qui, en participant à l’inventaire de l’herpétofaune, nous permettent d’améliorer la connaissance sur les espèces et leur répartition. Les cartes et graphiques ont été réalisés grâce aux observations (herpétofaune et mammifères pour comparaison) fournies par : Accard G, Ait El Mekki Julien, Alex Emmanuel, Anonyme , Armand Michel, Arnoux Christophe, Aubertel Pierre-Marie, Aubry Gabriel, Auffret A, Augello Alexandra, Augello Alexandra, Aznar Mélanie, Bailly Loïc, Bannwarth Cyrielle, Becel Clémence, Bejean Mickaël, Bernard Cécile, Bertrand E, Beschet Laurent, Besson Sylvain, Bettinelli Chantal, Bettinelli Jean-Claude, Bettinelli Luc, Bettinelli Gaël, Bettinelli Roland, Beucler Julie, Binetruy B, Bolard Audrey, Bouillard Michaël, Bouille Hélène, Boujon JP, Bouvot D, Briot M, Brugel Éric, Buttin A, Caillet Lucie, Canella Victoria, Capelier J, Cardinaux F, Carpano Michel, Cattenoz Bruno, Cellier Thomas, Chamouton A, Champ S, Chapelain A, Chapus D, Chaput E, Chevaldonnet François, Chevrot Jean-Claude, Chiffaut Alain, Cholet Jérémie, Chopard Christian, Clément Sabrina, Clerc Patricia, Cochet Virginie, Claude P, Clément Claudine, Coeurdassier Michael, Colette Collette, Collin Pascal, Command C, Cosson Emmanuel, Cotte Bertrand, Cottet Michel, Courvoisier Sophie, Cretin Emmanuel, Crimmers Christophe, Cucherousset Ombeline, D'agostino Roberto, David Jean, Debal, Dechambre D, Dehondt François, Delafollye Laurent, Deliry Cyrille, Delon Samuel, Demoly Nicolas, Derry Nick, Dervaux Antoine, Desvignes Danielle, Dewynter Nathalie, Domalain P, DR Bourgogne Franche-Comté ONCFS, Dubail Didier, Dubarry Guillaume, Dumont J, Duquet, Durant T, Durlet Pierre, Eloy L, Fagot Jean-baptiste, Faivre Michel, Faucon François, Fernez Thierry, Ferrez Yorick, Ferrois Claude, Feuvrier Benoit, Fleur Mathias, François J, Franzoni Adeline, Froidevaux Jérémy, Fuentes Carolina, Galichet Éric, Gallecier Michèle, Galliou Serge, Gardet Jérôme, Garnier Claude, Generet Vincent, Gagliardi S, Gervais Stéphane, Giraudoux Patrick, Giroud Marc, Gremillard-hubert François & Catherine, Grossiord Franck, Gruson Tristan, Guillet Willy, Guinchard Davy, Gundelwein Flora, Guyonneau J, Guyot Anne-Cécile, Haehnel Catherine, Hagimont Aurélien, Halliez Guillaume, Henriet René, Hercent Eric, Hermitte Nicolas, Hugueny Pierre, Hugues S, Ielsch Serge, Jacques Christophe, Jacquin Sébastien, Jacquot Manon, Jeannot Noël, Jobard C, Josseron Jean-Pierre, Jussyk Frédéric, Keller J, Kéry Marc, Klein Madeleine, Kong A Siou Aurore, Lachat B, Lambert Jean-Luc, Lambert Jean-Claude, Lambert Bastien, Lamy Sébastien, Langella Gabriel, Langlade Julien, Langlois Dominique, Lasserre L, Lavrut Didier, Le Bas B, Le Jean Flavie, Le Tallec Quentin, Leclerc David, Lecornu Didier, Leducq Isabelle, Lefèvre Edith, Lefèvre Gilles, Lefèvre Marie, Legay Philippe, Lejeune Alain, Lignier Georges, Locatelli Guillaume, Lonchampt Frédéric, L’homme JF, Louiton François, Maas Samuel, Maccaud Alexandre, Magnin-feysot Thomas, Maillot Frédéric, Maire David et Jean Baptiste, Malécot Dominique, Mangeat Marc, Mangin Caroline, Mangin Dominique, Marconot Bernard, Marguet Guy, Martel (RNR - Mancy) Céline, Massin Yves, Mauvais Christophe, Mazuez Céline, Mazuy Magalie, Mazzarino S, Mersch Fabien, Meslans Ingrid, Meslin Sébastien, Michelat Dominique, Michelat Jeannette, Michelat Jean-Marie, Moingeon Jean-Marc, Moncorgé Sylvain, Montadert Marc, Moreau Claire, Morel J, Morin Christophe, Morlet Louis, Mourot Bénédicte, Movia Alexandre, Muneaux C, Nicot Jacqueline, Noel Ludovic, Nussbaum Pascal, Ortar F, Oumanetz Nadia, Paillard S, Parachout Marie, Paris Mélanie, Parratte Cyrille, Passerault Maxime, Paul JM, Paul Jean-Philippe, Paulin L, Paur Joëlle, Pelay P, Peltier Christian, Pereira Dias Samuel, Pernot Julien, Perrault Caroline, Petetin Bernard, Petit Thierry, Petitcolin Corinne, Petitjean Guillaume, Pinston Hugues, Pion Estelle, Piotte Pierre, Piotte Christine, Ployer Fabienne, Poirson Claire, Praud Francine, Prudent Anne-sophie, Quinnez Bruno, Ravenot Frédéric, Ravey J, Renaud Éric, Riblet Vanessa, Riou Ghislain, Robbe Denise, Robert J-Y, Robin A, Rolland Cécile, Rolland Simon, Romand Jean-Louis, Roué Sébastien Y., Roussel Régis, Roux C, Roveretto Philippe, Saliner Catherine, Sauget Vincent, Sauret Michel, Schmitt F, Schneider Thomas, Senechal Vincent, Solviche Alain, Solviche Marine, Spinnler Florent, Staub Daniel, Tardy Vincent, Temperman Françoise, Thevenet Annie, Thiery G, Tissot Bruno, Tourneret Alain, Tournier Nicole, Troux Pascal, Vacheret Xavier, Vadam Emilien, Vanotti, Vaucher Jérémy, Vauthier Raphaël, Vieille JF, Vitte D, Vuillemenot M, Vuillet Guillaume, Wachtarczy D, Watel S, Wegnez P, Weidmann Jean-christophe, Wolff Guillaume, Wolff Patrick, Zimerli Nicolas.

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Table des matières

1 INTRODUCTION ............................................................................................................................... 3

2 METHODOLOGIE .............................................................................................................................. 3

2.1 Animation d’un réseau d’observateurs : ................................................................................. 3

2.2 Inventaire professionnel ......................................................................................................... 5

3 RESULTATS ....................................................................................................................................... 5

3.1 Evolution du nombre d’observateurs ...................................................................................... 5

3.2 Evolution des connaissances ................................................................................................... 7

3.2.1 Nombre d’espèces par maille .......................................................................................... 7

3.2.2 Nombre d’observations par maille .................................................................................. 9

3.2.3 Données relevées par la technique des abris thermiques ............................................ 11

3.2.4 Evolution de la connaissance sur la distribution spatiale des espèces ......................... 11

4 CONCLUSION ET PERSPECTIVES .................................................................................................... 13

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1 INTRODUCTION La publication des connaissances sur la répartition des amphibiens et reptiles du Doubs datent d’il y a une dizaine d’années. En 2000, une première synthèse régionale était éditée par le GNFC sous forme d'un atlas de répartition conçu et rédigé par Hugues PINSTON, Emmanuelle CRANEY, Didier PEPIN, Marc MONTADERT et Marc DUQUET (PINSTON et al., 2000). Depuis, sauf pour certaines espèces patrimoniales (Rainette verte, lézard vert…), aucune démarche active de prospection n’a été effectuée afin de mettre à jour cette répartition. Malgré une forte remontée d’informations via Obsnatu la Base, la connaissance des espèces, de leur répartition et de leur dynamique reste encore parcellaire. Pourtant, les amphibiens et les reptiles présentent un fort intérêt écologique et patrimonial. La plupart des espèces sont protégées au niveau national et beaucoup sont menacées à l’échelle nationale ou régionale. Aussi, la Ligue pour la Protection des Oiseaux (LPO) et le Conseil Général du Doubs, ont décidé de lancer en 2011 une démarche d’inventaire ciblé sur l’herpétofaune du Doubs.

L’enquête est établie sur 5 mois de l’année 2011, sur la période comprise entre le 1er mars et le 31 juillet.

Le présent document traite des moyens mis en œuvre par la LPO Franche-Comté pour mener à bien ce projet d’amélioration des connaissances sur l’herpétofaune du département ainsi que des résultats de cette mobilisation.

2 METHODOLOGIE

2.1 Animation d’un réseau d’observateurs : L’inventaire a été lancé début mars, avec appel à tous les naturalistes qui parcourent la Franche-Comté. La participation d’observateurs volontaires est essentielle pour améliorer la connaissance sur la répartition des amphibiens et reptiles. Pour pouvoir les mobiliser, plusieurs animations en salle et sur le terrain ont été proposées :

- Une présentation du projet d’inventaire de l’herpétofaune du département en préambule de

la réunion du groupe local de Besançon ;

- Une soirée de formation à la reconnaissance de l’herpétofaune du département du Doubs

qui a réuni 22 personnes ;

- Une participation nocturne au relevé des amphibiens sur le dispositif de sauvetage installé

sur la commune de Sornay (70) qui a permis de sensibiliser 5 participants ;

- Une soirée de prospection amphibiens à laquelle 5 personnes ont participé.

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Figure 1. Extrait du diaporama présenté lors de la soirée de formation à la reconnaissance de l’herpétofaune

du Doubs.

En parallèle, afin de permettre au grand public de découvrir l’herpétologie et de lui offrir la possibilité de s’initier à la reconnaissance des différentes espèces, plusieurs documents d’informations sur l’herpétologie locale ont été mis en ligne sur le site internet de la LPO Franche-Comté (http://franche-comte.lpo.fr). De même, les cartes de répartition des espèces par maille ont été associées pour une meilleure visibilité de la répartition connue de ces deux taxons depuis 2000 sur le département. En révélant les secteurs déficitaires, ces cartes de répartition provisoires invitent les observateurs à orienter leurs prospections. Enfin, plusieurs outils de communication ont été utilisés pour informer et relancer les observateurs potentiels tout au long de la saison : messages sur obsnatu-fc, liste de discussion et d’échanges naturalistes en Franche-Comté (http://fr.groups.yahoo.com/group/obsnatu-fc/), publication dans la newsletter de la LPO régionale, présentation de plusieurs espèces cibles en brève atlas…

Figure 2. Sortie dispositif de sauvetage des amphibiens, commune de Sornay (70), mars 2011

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2.2 Inventaire professionnel La démarche de recherche systématique appliquée par le réseau de bénévoles permet un relevé aléatoire des données de terrain. Ces observations de naturalistes bénévoles ont été complétées par un travail de prospection professionnelle : une chargée d’étude ainsi qu’une stagiaire présente pendant 6 semaines à la LPO Franche-Comté ont orienté leurs recherches sur des mailles (découpage cartographique de 10x10 km) sélectionnées parmi les moins bien couvertes. En tout, 5 mailles (encadrées de vert, figure 5) ont été choisies selon plusieurs critères :

- D’une part, le nombre d’espèces connues associé à la présence d’anciennes données d’espèces patrimoniales telles que le crapaud calamite et la rainette verte dans une visée d’actualisation. Une liste a été établie, fixant à 25 le nombre d’espèces présentes sur le département du Doubs ; le groupe des grenouilles vertes qui compte trois espèces ayant été regroupé en un seul taxon du fait de la difficulté d’identification de ces espèces. En raison de l’existence d’espèces remarquables, par leur statut ou leurs exigences, le nombre de 12 espèces a été fixé comme objectif à atteindre sur les mailles du Doubs. Le croisement du critère « moins de 12 espèces recensées » avec le nombre d’espèces cibles anciennement relevées (avant 2000) a permis de réaliser une hiérarchisation des mailles permettant ainsi la sélection des secteurs à prospecter en priorité.

- D’autre part, deux mailles situées en partie sur le premier et le deuxième plateau ont été prospectées pour tenter de préciser les limites de répartition de la couleuvre d’Esculape et de la couleuvre verte et jaune. Ces deux espèces thermophiles limitées par le facteur altitudinal en région sont potentiellement sujettes à une extension de leur aire de distribution au delà des limites actuelles en raison du changement climatique (Araùjo et al., 2006). Il paraissait donc pertinent de réaliser une étude conduite aux marges de la distribution de ces deux couleuvres, là où le facteur limitant s’exprime avec le plus de force et où les populations sont les plus aptes à mettre en évidence des évolutions graduelles.

Pour pallier à la difficulté de détection de ces deux espèces, et plus largement de toute espèce de reptile, la technique dite « des plaques refuges » ou « abris artificiels » a été employée. La pose d’abris thermique, grands objets plats de nature diverse (tôle ondulée, tapis de carrière…), a concerné quatre sites sélectionnés en fonction de leur altitude et des potentialités d’accueil pour les espèces ciblées.

3 RESULTATS

3.1 Evolution du nombre d’observateurs

En 2011, plus de 150 personnes ont participé en transmettant leurs observations d’amphibiens et reptiles sur le site internet de la LPO Franche-Comté. Parmi ces observateurs, 90 personnes ont transmis des données localisées sur le département du Doubs ce qui représente près de deux tiers de l’ensemble des observateurs régionaux pour ces taxons.

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L’évolution depuis 2000 du nombre d’observateurs transmettant des données localisées sur le département est présentée en figure 3. La baisse du nombre d’observateurs ayant fourni des données en 2009 s’explique probablement en partie par une conséquence collatérale de l’ouverture d’Obsnatu la Base, au départ exclusivement ornithologique. En effet, les observateurs ont utilisé ce nouvel outil avec engouement pour saisir instantanément leurs données d’oiseaux, laissant momentanément les données herpétologiques « dans le carnet » en attendant l’ouverture de l’outil aux autres taxons. Or cette ouverture n’est survenue qu’un an après et il semble que certains observateurs n’ont pas encore fait de saisie a posteriori. Un appel à ces données « hors circuit » pourra être envisagé. A partir du premier semestre 2010, période de mise en ligne du module herpétologie sur Obsnatu la Base, on observe une nette progression. Figure 3. Evolution du nombre d’observateurs transmettant des données herpétologiques à la LPO Franche-

Comté depuis 2000

Depuis le début de l’année 2011, le nombre d’observateurs de l’herpétofaune enregistre une augmentation significative s’élevant à plus de 60 % (comparaison sur 6 mois 1/2, de janvier à mi-juillet).

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3.2 Evolution des connaissances

3.2.1 Nombre d’espèces par maille Il s’agit ici d’une description de l’ensemble des espèces qui ont été contactées et répertoriées pendant la période de l’inventaire sur le territoire du département du Doubs. L’objectif de l’inventaire qualitatif est d’obtenir la meilleure visibilité possible du nombre d’espèces observables sur les mailles étudiées. La figure 5 permet d’avoir un aperçu de l’effort de prospection fourni pendant la période d’inventaire ; la carte du nombre d’espèces d’amphibiens et reptiles par maille, connu avant l’inventaire, est présentée pour comparaison. Les observateurs ayant participé à l’inventaire ont apporté plus de 1130 données supplémentaires concernant 27 espèces recensées. Les données concernant les espèces non identifiées ne sont pas intégrées à cette synthèse (Pélophylax sp.), de même que les espèces allochtones (données de tortue de Floride). Sur les 5 mailles choisies pour la prospection professionnelle, 60 nouvelles données ont été relevées ; l’augmentation du nombre d’espèces sur ces mailles allant de 2 à 7 espèces. Sur les 77 mailles qui découpent le département du Doubs, 72 ont déjà été prospectées. Toutes les mailles non renseignées sont limitrophes de la Suisse (avec plus de 75% de la surface de la maille en Suisse). Les mailles sur lesquelles l’objectif minimum fixé (12 espèces) a été atteint sont représentées en rouge. L’effort de prospection de la saison de recensement 2011 a permis d’atteindre cet objectif sur deux mailles supplémentaires ce qui amène le nombre de mailles bien prospectées à 25. Pour la saison prochaine, l’effort devra porter sur les 52 mailles à compléter, 15 mailles étant à moins de 4 espèces de l’objectif fixé et 19 à moins de 7 espèces. Au niveau départemental, le nombre moyen d’espèces par maille est passé de 7,14 (± 4,95) à 8,17 (± 5,07) espèces entre février et juillet 2011. La figure 4 ci-dessous, présente la distribution par maille avant et après la saison de prospection 2011. Elle montre bien un glissement (représenté en vert foncé) du nombre de mailles peu prospectées vers des mailles moyennement (6 à 11) et bien prospectées (supérieur à 12).

Figure 4. Distribution du nombre d’espèces par maille de janvier 2010 à février 2011 (à gauche) et jusqu’à mi juillet 2011 (à droite)

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Figure 5. Richesse spécifique par maille intégrant les données transmises depuis 2000 jusqu’à février 2011 (à gauche) et jusqu’à juillet 2011 (à droite)

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3.2.2 Nombre d’observations par maille Le premier semestre 2011 présente une nette progression du nombre de données sur l’herpétofaune puisqu’il enregistre une augmentation de 235% par rapport au premier semestre de 2010 (figure 6). Cette augmentation résulte d’une forte mobilisation des observateurs, signe d’un intérêt croissant pour l’herpétologie en 2011. La récente mise en ligne du formulaire herpétologie sur obsnatu la Base ne doit bien évidemment pas être négligée en tant que facteur explicatif de cette progression. Toutefois, avec une ouverture de la saisie en ligne effectuée à la même date (premiers semestres 2010 et 2011), l’augmentation des données d’herpétofaune est dix fois supérieure à celle des données de mammifères en 2011 (progression de 23%). Cet indicateur semble être fiable pour évaluer positivement l’animation et les prospections herpétologiques en 2011. Figure 6. Evolution du nombre d’observations d’amphibiens et de reptiles entre les premiers semestres 2010 et 2011 sur le département du Doubs (à gauche). Evolution du nombre d’observations herpétologiques et mammalogiques sur le Doubs entre les premiers semestres 2010 et 2011 (à droite).

La carte présentant la répartition du nombre d’observations par maille révèle une pression d’observation plus importante à l’Ouest du département (figure 7). L’augmentation du nombre de données sur les mailles dans le secteur de Besançon et de ses alentours étant bien plus notable que dans le reste du département, cette tendance semble s’être maintenue au printemps 2011. La pression d’observation élevée sur ces mailles résulte très certainement de la proximité de l’agglomération bisontine, secteur de domiciliation de nombreux observateurs de la LPO Franche-Comté. Ce phénomène est possiblement accentué par une plus forte diversité spécifique en plaine, dans les vallées alluviales et les zones collinéennes que sur les plateaux. L’attraction spontanée des observateurs pour les zones à priori plus riches est un biais connu en région pour l’ornithologie. Les retours d’observations des herpétologistes et naturalistes bénévoles via Obsnatu la Base doivent se poursuivre sur l’ensemble du département. L’effort de prospection bénévole nécessite d’être accentué dans les secteurs déficitaires en données, à savoir les premier et second plateaux, et complété par des prospections dans un cadre professionnel.

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Figure 7. Carte de répartition du nombre d’observations par maille avant et après la saison de prospection 2011

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3.2.3 Données relevées par la technique des abris thermiques L’efficacité de la pose d’abris thermiques étant proportionnelle à leur temps d’installation, l’application tardive de cette méthode d’inventaire n’a pas permis de révéler la présence de la couleuvre d’Esculape, ni celle de la couleuvre verte et jaune. Il faut toutefois signaler l’observation sous plaques de plusieurs individus d’orvet fragile, espèce très discrète habituellement difficilement observable. Cette observation nouvelle sur le secteur prospecté, au regard des observations remontées depuis plus de 10 ans, confirme la répartition proposée dans l’Atlas commenté des Amphibiens et Reptiles de Franche-Comté publié en 2000.

3.2.4 Evolution de la connaissance sur la distribution spatiale des espèces

Cette partie présente une comparaison de l’aire de présence connue pour quatre espèces autochtones d’amphibiens et reptiles du département avant et après la saison de prospection 2011. Elle permet d’avoir un aperçu de l’amélioration des connaissances à l’échelle espèce et des secteurs déficitaires et d’orienter les prospections pour les prochaines saisons. Les cartes de répartition qui suivent fonctionnent sur le mode présence/absence de données, et ne prennent pas en compte le nombre de données recueillies sur chaque espèce. La présence avérée d’une espèce sur une maille est représentée par un carré rouge.

Globalement, ces cartes montrent bien une évolution de la connaissance de la répartition départementale du triton alpestre, de la grenouille rousse, de l’orvet fragile et de la couleuvre à collier avec respectivement 5, 4, 7 et 2 mailles supplémentaires où l’espèce est présente après la saison de prospection (encadrées en noir) Triton alpestre

Après la saison de prospection 2011 Avant la saison de prospection 2011

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Grenouille rousse Orvet fragile

Avant la saison de prospection 2011

Après la saison de prospection 2011

Avant la saison de prospection 2011 Après la saison de prospection 2011

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Couleuvre à collier

4 CONCLUSION ET PERSPECTIVES Pour cette première saison d’animation d’un réseau d’observateurs de l’herpétofaune, le bilan est satisfaisant. Avec près de 235% d’augmentation par rapport au premier semestre 2010 (contre 23% pour les mammifères) ce sont plus de 1130 données supplémentaires qui viennent s’ajouter aux observations des années précédentes grâce à l’implication de 90 naturalistes bénévoles. La totalité des mailles non limitrophes sont dorénavant renseignées mais seules 33% des 77 mailles ont atteint l’objectif des 12 espèces, 44% sont près de l’atteindre et 23% méritent un effort important de prospection. L’effort de prospection doit donc se poursuivre sur la totalité des mailles, car il n’y a pas de données inutiles et superflues notamment dans l’optique éventuelle d’affiner à court terme l’échelle de précisions (5x5 km, communal) nécessaire à une meilleure conservation appliquée. Afin d’aboutir à une cartographie plus nuancée, il est nécessaire d’augmenter la pression de prospection sur les mailles déficitaires en données. Pour cela, la mobilisation et l’animation de naturalistes bénévoles nécessite d’être renforcée pour la prochaine session de prospection. En 2011, bien que l’animation d’observateurs n’ait débuté que courant mars, soit après le début de la migration des amphibiens, les résultats obtenus sont très satisfaisants. Néanmoins, pour aboutir à une meilleure remontée d’informations, notamment sur les espèces précoces (grenouilles agiles, sortie d’hivernage de vipères…), l’animation du réseau d’observateurs doit pouvoir se faire de façon continue, sur la totalité de la saison de reproduction ainsi qu’en amont. La proposition d’un programme de formation naturaliste « Recensement de l’herpétofaune du Doubs » composé de conférences sur l’herpétologie et de plusieurs animations lors de sorties terrain permettrait d’augmenter en quantité et en qualité la contribution bénévole à la connaissance des amphibiens et reptiles du département. Par ailleurs, afin d’obtenir une base scientifique solide, outil indispensable d’aide à la décision, les prospections professionnelles sur les espèces cibles et les secteurs où la pression d’observation reste faible doivent être renforcées.

Avant la saison de prospection 2011

Après la saison de prospection 2011