ANTIBIORÉSISTANCE ET PISCICULTURE

Baron Sandrine1, Le Bouquin Sophie2, Tocqueville Aurélien3, Jouy Eric1, Levadoux Marine4, Gaumé Matthieu3, Larvor Emeline1,3, Sanders Pascal5, David Julie6, Chauvin Claire6, Kempf Isabelle1

ANSES, Ploufragan - 1Unité Mycoplasmologie Bactériologie ; 2 Unité Épidémiologie et bien-être en aviculture et cuniculture; 6Unité Épidémiologie et bien-être porcin 3 ITAVI, Service Technique Aquaculture 4 CIPA, Paris 5 ANSES, Fougères - Laboratoire

600 PISCICULTURES ≈ 37 000 T/an

3 grandes régions productrices Aquitaine Bretagne

Nord/Picardie

Une production majoritaire

Truite arc-en-ciel

ANTIBIOTIQUE & PISCICULTURE UN ARSENAL THÉRAPEUTIQUE RESTREINT

• 5 molécules avec AMM : – Oxytétracycline, – Florfénicol, – Association triméthoprime/sulfamide, – Fluméquine, Acide oxolinique

Recours à la cascade

ANTIBIOTIQUE & PISCICULTURE UNE FILIÈRE PARTICULIÈRE

Elevage en lien direct avec l’environnement Dépendant de la qualité de l’eau en amont Contrainte de débit

Dissémination de l’antibiorésistance en milieu aquatique plus rapide

qu’en milieu terrestre

Peu de données disponibles au niveau national sur la présence de bactéries résistantes

Bactéries résistantes absentes Des paramètres de qualité des eaux, Pas de plan de surveillance systématique.

ANTIBIORÉSISTANCE ET PISCICULTURE : PROJETS EN COURS ET FUTURS

Suivi des pratiques et usage des antibiotiques ANPI (2013-2015)

Dissémination de l’antibiorésistance en milieu aquatique AQUARES (2013-2015)

Présence de bactéries résistantes dans la flore commensale & pathogène du poisson (2015-2017) Effort & Flor-Co Antibio-Fish

ANPI : ETUDE QUANTITATIVE ET QUALITATIVE DE L’UTILISATION DES ANTIBIOTIQUES EN PISCICULTURE

Service Technique Aquaculture

FINANCEMENT

PARTENAIRES GDS

Axe 4 : Conforter le dispositif de suivi de la consommation des antibiotiques et de l’antibiorésistance

Mesure 35 : Mettre en place des enquêtes régulières sur des échantillons représentatifs de vétérinaires et d’éleveurs et étendre les enquêtes de pharmaco-épidémiologie à toutes les filières

ETAT DES LIEUX DES USAGES EN PISCICULTURE

• Travaux sur l’usage dans les autres filières (porcine, avicole, cunicole, vitellière…) • En pisciculture : quelques données au niveau national, des estimations par l’ANMV

• Données ANMV (suivi des ventes) • Recensement en salmoniculture 1997 & 2007

SUIVI DES VENTES DE MEDICAMENTS (ANMV)

Répartition des ventes 2012 entre les différentes espèces en tonnage de matière active et en quantité de matière active par kilogramme animal

Répartition des ventes 2012 entre les différentes espèces en tonnage de poids vif traité (ACDkg) et en indicateur du niveau d’exposition ALEA et en quantité de matière active par kilogramme animal

RECENSEMENT 2007 VS 1997 EN SALMONICULTURE

• Une filière peu exposée • Une filière peu consommatrice d’ATB critiques pour la

santé humaine : – C3G & C4G : non utilisées – Fluoroquinolones & macrolides : peu utilisés

Mais peu de données disponibles et pas d’éléments sur la variabilité et les facteurs associés

étude ponctuelle réalisée en élevage

ETAT DES LIEUX DES USAGES EN PISCICULTURE

• Estimer les quantités utilisées • Par famille, molécule • Par voie d’administration • Variabilité des quantités entre élevages

• Analyse des usages • Motifs d’utilisation • Facteurs associés

Analyse de la variabilité des usages en relation avec les pratiques d’élevage et le niveau sanitaire

OBJECTIFS ANPI

SCHÉMA D’ÉTUDE

• Population cible : salmoniculture continentale (75% des piscicultures)

• Un échantillon représentatif d’élevages

13

• 100 élevages tirés au sort dans la base de données nationale • effectif proportionnel au nb d’élevages/région

•Production > 2T/an

LA PROCÉDURE D’ENQUÊTE

Tirage au sort des élevages

Prise de contact ( courrier d’info + téléphone)

Enquête en élevage : questionnaire complété par

interrogation de l’éleveur, consultation de documents et

relevés d’informations (inspiré d’Aquares)

Recueil d’éléments complémentaires auprès des structures (si

accord de l’éleveur et des structures) année 2013

Un traitement anonyme des données

14

AQUARES : Etude pilote sur la présence de bactéries résistantes en amont et en aval des piscicultures

dans l’hydro-écorégion Normandie/Bretagne

Service Technique Aquaculture

Axe 4 : Conforter le dispositif de suivi de la consommation des antibiotiques et de l’antibiorésistance

Mesure 37 : Examiner l’impact de l’utilisation des antibiotiques dans l’environnement des élevages

FINANCEMENT

PARTENAIRES GDS

OBJECTIFS 1. Obtenir une sélection pertinente

d’indicateurs de la dissémination de l’antibiorésistance,

2. Définir une méthodologie analytique et d’échantillonnage,

3. Mettre au point des outils épidémio (questionnaire en élevage, modalités de collecte des données d’usage… )

ANPI

BOITE À OUTILS

CHOIX DE 20 PISCICULTURES de TRUITES ARC EN CIEL

Volontariat

Localisation : Bretagne et Normandie

Type de production,

Position sur le bassin-versant,

Présence d’autres activités en amont (Station d’Epuration, Elevages terrestres…)

17

ECHANTILLONNAGE

2 visites par élevage

hiver : février/mars & Eté : juin/juillet 2014

Questionnaires + Prélèvements

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EAU / SEDIMENT BIOFILM EAU/SEDIMENT

AMONT PISCICULTURE AVAL

RECUEIL DE DONNEES / ANALYSES

Questionnaires épidémiologiques (Anpi)

Paramètres de terrain :

pH, Température, Salinité, Débit, Oxygène dissous

Caractérisation du Bassin Versant

Analyses microbiologiques % de bactéries résistantes Détection et origine de la contamination fécale Détection/quantification des gènes de résistances Caractérisation de la sensibilité aux ATB des isolats collectés

CHOIX DES « ESPECES » BACTERIENNES & DES ATB

Aeromonas Enterococcus B H E. coli Cyclines Tétracycline Tétracycline Tétracycline

Macrolides Erythromycine Quinolones

Acide

Oxolinique

Acide Oxolinique

Phénicolés

Florfénicol Florfénicol

Β-lactamines

Céfotaxime Amoxicilline Céfotaxime

Aminosides Gentamicine

Glycopeptides Vancomycine

Triméthoprime Sulfamides

Triméthoprime Sulfaméthoxazole

(SXT)

SXT

Ensemencement de milieux sans ATB et avec ATB

Conservation d’isolats bactériens Constitution d’un souchier

GSP : Aeromonas spp ECB E. coli

Slanetz Enterococcus spp

TSA Bact. Hétérotrophes

DETERMINATION DU % de BACTERIES RESISTANTES

Gènes de résistance : Détection Quantification Contamination fécale : présence/absence origine : humaine, élevage terrestre (porc…)

METHODES MOLECULAIRES

svt-biologie-premiere.bacdefrancais.net

ETAT D’AVANCEMENT Les deux campagnes de prélèvements sont achevées (collecte des paramètres de terrain)

Questionnaires épidémiologiques complétés

Constitution d’une collection d’isolats Aeromonas (1500 isolats) Enterococcus (1200 isolats) E. coli (250 isolats)

Ratio R/S en amont/aval pour l’ensemble des

piscicultures échantillonnées

Caractérisation des isolats en cours

MERCI DE VOTRE ATTENTION

Remerciements aux Eleveurs qui ont accepté de participer à ces études

Vétérinaires aquacoles & ssssssss GDS aquacoles