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A reprendre: les flores avec des dessins

Pathogene opportuniste avec des dessin

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• Les maladies infectieuses sont dues à

l’introduction dans l’organisme d’un

micro-organisme vivant qui s’y développe

– des bactéries

– des virus

– des parasites

– des champignons

_ les prions (à part)

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NOTIONS ENBACTERIOLOGIE GENERALE

UE.2.10.S1Dr Christine VENOT, biologisteLaboratoire GCS de Saintonge

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1632-1723,Anthonie van Leeuwenhoeck, drapier hollandais : microscope simple

Animalcules : particules invisibles à l’œil nu

I. HISTORIQUE

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Les bactéries

1.Place des micro-organismes dans la

classification des êtres vivants

2. Bactéries : morphologie

anatomie, structure

croissance, métabolisme

Sources d’infection et modes de transmission

1. Réservoirs, flore bactérienne

2. Relations hôte-micro-organisme, pathogénicité

3. Modes de transmission

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EUCARYOTES AlguesProtozoaires

Champignons

PROCARYOTES bactériesalgues bleues

VIRUS (acellulaire, structure particulaire)

PRIONS

II. CLASSIFICATION

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Rappel : structure de la cellule eucaryote

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Cellule eucaryote

Cellule procaryote

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Caractères distinctifs procaryotes et eucaryotes

caractéristiques Procaryote Eucaryote

Taille en µmètre 0.3 – 2.5 2 – 20

Chromosome 1 seul et unique

Plusieurs

Membrane nucléaire Absence Présence

Organites RE, app.Golgi, mitochondries

Absence Présence

Division scissiparité mitose

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I. HISTORIQUEII. CLASSIFICATIONIII. MORPHOLOGIE

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Escherichia coli (bacilles)

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Spirilles : treponema pallidium

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HISTORIQUECLASSIFICATIONMORPHOLOGIE

IV. ANATOMIE BACTERIENNE

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schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne

                                                                                                                      

                                                                 Schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne typique.

En tant que procaryote (organisme

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Enveloppes : capsuleglycocalyxparoimembrane cytoplasmique

Constituants internescytoplasmeADN chromosomiqueADN plasmidique

Appendices externesflagelles (mobilité)pili (adhésion)

Spore bactérienneforme de résistance

« surlignés en vert » élements inconstants facultatifs

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Méningite à Pneumocoque

le plus superficiel

présence inconstante

CAPSULE

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CAPSULE

Constitué de polysaccharides acides

pouvoir pathogène, car elle empêche la phagocytose

Elle peut se trouver à l'état soluble dans les liquides de l'organisme (urines, LCR)

diagnostic = recherche d'antigènes solubles.

Identification / typage : épidémies.

Vaccins : Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae.

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Le glycocalyx

Ce sont des fibres polysaccharidiques ou polymères extrêmement fréquents entourant la bactérie.

Le feutrage des fibres de glycocalyx est constant dans le cas de bactéries vivant en biofilm dans les conditions naturelles.

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Rôles du glycocalix

1. attachement des bactéries - aux cellules

buccales,respiratoires......- à des supports inertes : plaque

dentaire, biofilms des cathéters,prothèses.

2. concentre les éléments nutritifs exogènes 3. protection - de la dessication,

- résistance: antiseptiques,désinfectants, antibiotiques.

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schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne

                                                                                                                      

                                                                 Schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne typique.

En tant que procaryote (organisme

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PILI (ou fibriae) et Flagelle PILI

- grosses structures protéiques, (/glycocalyx)

fibrillaires et rigides –

RÔLE DE FIXATION spécifique des bactéries sur les cellules = pouvoirs pathogènes

(E.coli et inf. urinaires).

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Flagelle : organe de locomotionAssure la mobilitéFacultatif, (eucaryotes : flagelle du spermatozoide)

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schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne

                                                                                                                      

                                                                 Schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne typique.

En tant que procaryote (organisme

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LA PAROI ++++ C’est l’enveloppe la plus interne,

rigide assurant l'intégrité de la bactérie,

responsable de la forme des cellules. protège des variations de pression

osmotique. Elle est constitué de peptidoglycanes=

polymère . La paroi de la bactérie est ainsi une unique macromolécule.

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- La paroi est plus fine chez les bactérie gram negatif,

- Il existe en plus une enveloppe lipidique (ce qui explique que l'alcool, liposoluble, passe à travers ce type de paroi).

- traversée par du Lipopolysaccharide (LPS) représentant l'antigène O des entérobactéries

enveloppe

paroi

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En résumé

Paroi des bactérie à Gram positif

peptidoglycanne en quantité très importante

Paroi des bactérie à Gram négatif

peptidoglycanne + enveloppeen quantité peu imporante

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La composition variant selon l'espèce ou le groupe bactérien, il a été possible de distinguer des affinités tinctoriales différentes par la coloration: Gram + et Gram -.

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Coloration de gram

Gram + Gram +

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Diplocoques à gram positif

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Cocci gram positif et bacilles gram négatif

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Bacille gram négatif

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Cocci gram positif

Bacille gram positif

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Rôles de la paroi bactérienne

1. Coloration de Gram = à la base de la

classification des bactéries (voir tableau)

2. Forme des bactéries

3. Antigénicité (Ag O) / vaccin

4. Toxicité (LPS)

5.Site d'action d'antibiotiques

(bêta-lactamines,glycopeptides, fosfomycine)

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schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne

                                                                                                                      

                                                                 Schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne typique.

En tant que procaryote (organisme

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La membrane plasmique C'est une membrane formée de phospholipides

rôle important dans les échanges.

Fixation des flagelles (c'est là que se génère leur mouvement tournant).

détruite par des antibiotiques et antiseptiques

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schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne

                                                                                                                      

                                                                 Schéma de la structure cellulaire d’une cellule bactérienne typique.

En tant que procaryote (organisme

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LES CONSTITUANTS DU CYTOPLASME

ADN et ribosomes sont présents dans le cytoplasme bactérien.

1 chromosome UNIQUE et plasmide (facultatif)pas de membrane nucléaire et pas d’organites (cellule procaryote)

des antibiotiques perturbent la synthèse des protéines à leur niveau (Tétracyclines)

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A côté du chromosome, support de l'hérédité, la bactérie peut contenir des éléments génétiques (ADN) de petite taille (0,5 à 5 % du chromosome bactérien), extra-chromosomiques. Ces éléments, appelés plasmides, ne sont pas indispensables à la vie de la bactérie dans les conditions habituelles de croissance. Ils se répliquent indépendamment et en général plus rapidement que le chromosome bactérien. On les détecte lorsque les gènes qu'ils transportent confèrent à la bactérie de nouvelles propriétés

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ADN CHROMOSOMIQUE ADN PLASMIDIQUE

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Les plasmides sont des molécules d'ADN circulaires et

cytoplasmiques, de petite taille (5 à 4000 fois plus petit que le

chromosome), se réplicant d'une manière autonome non

indispensables au métabolisme normal de cellule-hôte.

transmission d'une cellule bactérienne à une autre possible +++.

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Propriétés biologiques portées par les plasmides

résistance aux antibiotiques (bêta-lactamines, aminosides, phénicols, cyclines, macrolides)

résistance aux antiseptiques mercuriels, aux métaux lourds (antimoine, argent, bismuth...) ;Les plasmides permettent ainsi aux bactéries de s'adapter à un environnement hostile.

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Propriétés biologiques portées par les plasmides

La virulence=pouvoir pathogène des bactéries peut aussi être à médiation plasmique :

• colibacilles entéropathogènes (diarrhées des voyageurs),

• staphylocoques dans l'impétigo (exfoliatine).

synthèse de bactériocines qui inhibent la croissance d'autres bactéries

(ex. : colicines létales pour les entérobactéries).

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SPORES

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SPORES

Certaines bactéries,(genre Clostridium et Bacillus), ont la propriété de se différencier en formes de survie appelées spores. Elles se présentent sous une forme végétative métaboliquement active et potentiellement pathogène ou métaboliquement inactive et non pathogène (forme sporulée).

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Sporulation/germination

La transformation de la forme végétative en spore est la sporulation :. Conditions : déclenchée par des modifications de l'environnement tel épuisement en matières nutritives.

Forme végétative

pathogène

Spore résistante

Non pathogène

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. Etapes : déshydratation progressive du cytoplasme et synthèse d'une paroi sporale épaisse et imperméable, donc hautement résistante (chaleur).

La spore intra-bactérienne est libérée dans le milieu extérieur et y survit des années.

Dans des conditions favorables (nutritives, thermiques et chimiques), elle redonne une cellule végétative = germination.

Spores = forme de résistancetempérature, temps, UV, ATS, ATB)

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HISTORIQUECLASSIFICATIONMORPHOLOGIE

ANATOMIE BACTERIENNECROISSANCE BACTERIENNE

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CROISSANCE BACTERIENNE

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DIVISION BACTERIENNE

La bactérie se multiplie par fission binaire (scissiparité): la bactérie grandit puis se divise en deux cellules filles séparées par un septum de division formé par la paroi cellulaire. Durant la division, l'ADN se duplique ainsi que les autres constituants. Divers systèmes enzymatiques de synthèse et de dégradation participent à la division cellulaire.

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HISTORIQUECLASSIFICATIONMORPHOLOGIE

ANATOMIE BACTERIENNECROISSANCE BACTERIENNE

METABOLISME

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Effet de l'oxygène sur la croissance :

1.b aerobie stricte 2. microaerophile

3. aéro-anaérobies facultatives 4.anaérobie strictes

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1. Les bactéries aérobies strictes ne se développent qu'en présence d‘O2 (air).

Leur source principale d'énergie est la respiration.

(Pseudomonas, Acinetobacter, Neisseria).

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2. Les bactéries microaérophiles se développent mieux ou exclusivement lorsque la pression partielle d'oxygène est inférieure à celle de l'air

(Campylobacter, Mycobacteries).

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3.Les bactéries aéro-anaérobies facultatives se développent avec ou sans air (oxygène).

C'est le cas de la majorité des bactéries rencontrées en pathologie médicale entérobactéries (Escherichia, Salmonella), streptocoques, les staphylocoques

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4. Les bactéries anaérobies strictes ne se développent qu'en absence totale ou presque d'oxygène qui est le plus souvent toxique. Ces bactéries doivent se cultiver sous atmosphère réductrice.

La totalité de l'énergie est produite par fermentation.

air

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Etuve avec culture de bactéries anaérobies stricts en jarre

                                                                                                          

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HISTORIQUECLASSIFICATIONMORPHOLOGIE

ANATOMIE BACTERIENNECROISSANCE BACTERIENNE

METABOLISMELES FLORES BACTERIENNES

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La flore microbienne normale de l'organisme

Notion de Flore bactérienne commensale

Flore cutanée

Flore de l’arbre respiratoire supérieure

Flore génitale

Flore digestive

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La flore bactérienne commensale  De nombreuses bactéries sont normalement présentes

sur la peau et les muqueuses des sujets sains. Elles constituent les flores commensales résidentes.

Rôles : maintien de la santé. Ex : la flore intestinale synthétise de la vitamine K, aide à l'absorption des aliments, prévient par son équilibre la prolifération de bactéries commensales potentiellement dangereuses (Clostridium difficile) et gêne la colonisation par des bactéries pathogènes.

Les bactéries commensales peuvent être réparties en 4 flores principales cutanée, respiratoire, génitale et digestive.

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La flore cutanée

est variable en qualité et en quantité (102 à 106/cm2) selon la topographie.

La flore résidente est formée de germes Gram + potentiellement peu pathogènes

Staphylocoques à coagulase négative Corynébactéries

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La flore cutanée

La flore transitoire est plus polymorphe,peut comporter des germes potentiellement pathogènes, provenant du tube digestif ou du rhinopharynx :

Entérobactéries Staphylocoque doré.

Les mains portent souvent une flore transitoire abondante (rôle dans la transmission croisée).

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La flore de l'arbre respiratoire supérieur

très variable et abondante au niveau du rhinopharynx (108/ml de sécrétion pharyngée).

Elle contient de nombreux opportunistes majeurs :

Staphylocoque doré (fosses nasales en particulier) Streptocoques (groupables ou non, dont

S.pneumoniae) Haemophilus Neisseria (parfois Neisseria meningitidis/ portage

transitoire) Branhamella catarrhalis Anaérobies, corynébactéries, lactobacilles.

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La flore de l'arbre respiratoire supérieur

Au niveau de la trachée,

la flore est minime et activement combattue par le mucus, les cils, les macrophages, etc…

L'arbre respiratoire inférieur est stérile.

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La flore vaginale rôle de protection, essentiel chez la femme.

Les lactobacilles acidophiles ou bacilles de Döderlein, par leur sécrétion d'acide lactique entretiennent un pH bas qui limite la flore commensale.

Streptocoque ( B essentiellement) Corynébactéries Bifidobacterium.

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Après la ménopause,

- diminution voir disparition des bacilles de Döderlein

- anaérobies et entérobactéries sont plus abondantes

Déséquilibre de la flore :• Vaginites à levures• Vaginose post antibiotiques

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La flore digestive

est la plus abondante et la plus importante.

varie en fonction des différents étages du tube digestif.

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Bouche : germes présents dans le rhinopharynx

- Nombre : 108 à 109 germes par ml de salive.

- abondance des streptocoques non

groupables, et des anaérobies.

- éventuellement entérobactéries

- Rôles : plaque dentaire , endocardites.

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L'estomac : flore très pauvre due à l’acidité.

L'intestin grêle possède aussi une flore pauvre en raison du péristaltisme et de l'abondance des sécrétions (bile, suc gastrique). Les germes présents sont essentiellement des streptocoques, staphylocoques et lactobacilles.

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La flore colique

- extrêmement variée et abondante.

1011-1012 bactéries/gr

- prédominance des anaérobies stricts(99,9 %),

surtout Bacteroïdes ( 1011 par gramme de selle),

Bifidobactérium, Clostridium.

- Entérobactéries (E.coli, 108/gr, Proteus,

Klebsielle...), Entérocoques et Staphylocoques.

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- Notion d’écosystème stable qui limite :- l'implantation d'espèces pathogènes telles que

Salmonelle, Shigelle ou Campylobacter - le développement de bactéries commensales

potentiellement dangereuses (porteurs sains). - Synthèse de Vitamine K et vitamine B

Si Flore déséquilibrée par antibiothérapie,

* Diarrhée à C difficile. Colite

pseudomembraneuse

* risque hémorragique

Lésion dûe cancer colique, septicémie à streptocoque

bovis avec risque d’endocardite

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HISTORIQUECLASSIFICATIONMORPHOLOGIE

ANATOMIE BACTERIENNECROISSANCE BACTERIENNE

FLORE BACTERIENNEPATHOGENICITE

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Le pouvoir pathogène (ou pathogénicité) d'une bactérie est donc sa capacité à provoquer des troubles chez un hôte.

Il dépend de :

son pouvoir invasif

capacité à se répandre dans les tissus

et à y établir un/des foyers infectieux,

son pouvoir toxicogène

capacité à produire des toxines)

de la capacité de défense de l’hôte

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Bactéries pathogènes Bactéries opportunistes

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1 - Les bactéries pathogènes

- bactéries responsables d'une maladie même chez le sujet " sain " (ex typhoïde, choléra, tuberculose, méningite...).

- Le pouvoir pathogène conditionne le type de maladie et va dépendre de l'espèce bactérienne responsable de l'infection.

le choléra dont l'agent est Vibrio cholerae est une maladie complètement différente de la méningite à méningocoque. Cette notion de pouvoir pathogène est à distinguer de celle de virulence.

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Ces bactéries pathogènes peuvent (pneumocoque, Haemophilus, méningocoque..) ou non (Mycobacterium tuberculosis, Salmonella, Shigella, Vibrio cholerae..) appartenir à la flore humaine commensale.

Ex :le méningocoque (méningite cérébrospinale), portage sain dans le nasopharynx la maladie ne touche qu‘1 porteur sain sur 10 000.Il existe des bactéries qui appartiennent à la flore commensale de l'homme bien que "pathogènes.

il existe une susceptibilité individuelle :l'âge (jeunes enfants)

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2 - Les bactéries opportunistes

 - ne donnent habituellement pas de maladie chez les sujets sains. peuvent devenir pathogènes chez les sujets aux défenses immunitaires altérées.

- bactéries commensales qui vivent à la surface de la peau et des muqueusesChez le sujet normal, elles ne donnent pas d'infections.

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- patients réceptifs : « risque d’infection »

immunodépression

Aplasiques (absence de polynucléaires),

SIDA,

prématurés

Corticothérapie, antibiothérapie,

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- Le type de maladie (= le pouvoir pathogène)

* colonisation de la porte d'entrée avec inflammation non spécifique à ce niveau (pneumonie, infection urinaire, infection sur cathéter,.. ), éventuellement suivie

* d'une généralisation, septicémie avec des localisations secondaires possibles (endocardite, abcès profond, ostéites, méningites...)

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Dans les hôpitaux, les infections causées par des bactéries opportunistes sont souvent

des infections nosocomiales.

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