23/02/2012

UNIVERSITE DAVIGNON ET DES PAYS DE VAUCLUSEProgramme des Enseignements Licence Sciences de la Vie et de la Terre parcours Biologie gnrale Responsable de la formation: Fabien MONNET Secrtariat : Lise MENET

Objectifs de la formation

Acqurir des connaissances scientifiques pluridisciplinaires qui intgrent, diffrentes chelles (molculaire, cellulaire, organisme, population) le monde vgtal, animal et microbien au travers de la biologie molculaire, la physiologie, la biotechnologie, la biochimie et lcologie. Se placer au carrefour de plusieurs domaines dexpertises professionnelles afin de rpondre la demande croissante dadaptabilit du march de lemploi ou intgrer un master au niveau national. La formation du parcours Biologie Gnrale permet dintgrer des Masters professionnels et recherches dans diffrents domaines dactivit comme lenseignement, la gestion de diffrents cosystmes aquatiques ou terrestres, la sant (pharmacologie, cancrologie), la biotechnologie et la biochimie. Le Master proposs lUniversit dAvignon intituls de la Gestion de la Qualit des Productions Vgtales et Science du mouvement humain peuvent tre intgr aprs avoir ralis le parcours Biologie gnrale. Les tudiants peuvent aussi postuler plusieurs coles dingnieurs. orientation possible lissue de la formation. Le niveau de technicien suprieur reconnu par la russite ce diplme BAC+3 est mis en valeur par la matrise de connaissances pluridisciplinaires qui ouvrent un large champ dactivits et qui permet plusieurs tudiants de trouver un emploi. Le parcours Biologie Gnrale permet dintgrer des secteurs dactivits associs la gestion de lenvironnement, les productions agroalimentaires et biotechnologiques ainsi que les domaines de lenseignement.

Poursuite dtudes

Dbouchs professionnels Le parcours Biologie Gnrale couvre plusieurs domaines dactivits qui offrent une large

Contenu des enseignements

Units denseignement de S5 Physiologie des systmes de communications Rgulation des cycles cellulaires Biochimie mtabolique approfondie Biologie molculaire Physiologie vgtale Nutrition et mtabolisme 2 Units denseignement au choix : Ecophysiologie animale Ecophysiologie vgtale Hydrobiologie Eco-toxicologie Anglais 1 Unit denseignement douverture au choix Units denseignement de S6 Unit de dcouverte professionnelle Physiologie vgtale Croissance et dveloppement Micro-organisme et biotechnologie Biologie animale Physiologie animale 2 Units denseignement au choix : Biotechnologie vgtale Ingnierie des protines Pharmacologie et pathologie des grandes fonctions Anglais 1 Unit denseignement douverture au choix

Volume horaire 30 h 30 h 30 h 60 h 60 h 30 h 30 h 30 h 30 h 30 h 18 h Volume horaire 30 h 60 h 60 h 40 h 40 h 30 h 30 h 30 h 30 h 18h

Crdits 3 3 3 6 6 3 3 3 3 3 3 Crdits 3 6 6 3 3 3 3 3 3 3

Coeff. 3 3 3 6 6 3 3 3 3 3 3 Coeff. 3 6 6 3 3 3 3 3 3 3

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Semestre 5 Physiologie des systmes de communications CM : 19h TD : 3h TP : 8h Notion de Milieu Intrieur chez les organismes multicellulaires et ncessits de la mise en place de systmes de communications et de signalisations pour que ces organismes puissent fonctionner par rapport des changements internes et externes. Etude des systmes nerveux, endocrinien et immunitaire. TP : Activits nerveuse (nerf de la patte de crabe) et neuromusculaire (anneau daorte de rat). Rgulations du cycle cellulaire eucaryote CM : 18h TD : 4h TP : 8h Mcanismes impliqus dans le contrle de la prolifration, de la diffrenciation et de la mort cellulaire. Les cellules souches animales et vgtales (fonctionnement et rles). Le cycle cellulaire et son contrle. La diffrenciation et la mort cellulaire programme (apoptose). Implications dans le maintien de lhomostasie cellulaire. TP : Cytologie des cellules souches, de la phase mitotique, de la cytocinse et de lendoreduplication. Diffrenciation cellulaire et apoptose. Biochimie mtabolique approfondie CM : 19h30 TD : 7h30 Organisation et rgulations des principales voies mtaboliques glucidique et lipidique : les principales voies mtaboliques seront replaces dans un contexte cellulaire. Laccent sera particulirement mis sur les interrelations entre ces voies mtaboliques et leur rgulation. Diffrents facteurs de rgulation seront abords : la quantit de substrat et/ou de cofacteur, le contrle allostrique, les modifications covalentes (phosphorylation, actylation..), le taux denzyme, la compartimentation cellulaire et la spcialisation dorgane. Analyse par des exercices des diffrents modes de rgulation et dintgration du mtabolisme dans la cellule et lorganisme. Biologie molculaire CM : 24h TD : 18h TP : 16h Le gnie gntique et ses applications : production de protines recombinantes, transgense (animale et vgtale) et thrapie gnique. Introduction aux clonages thrapeutiques et reproductifs. TP : amplification et clonage d'un gne chez E.coli. Physiologie vgtale (Nutrition et mtabolisme) CM : 23h TD : 15h TP : 16h Alimentation hydrique des vgtaux. Notion de potentiel hydrique (en phase liquide et gazeuse, lchelle de la cellule et de la plante), absorption de leau (localisation et mcanismes). Leau dans la plante : tat hydrique, turgescence et croissance cellulaire, lasticit paritale, variations de lhydratation. Le transport de leau : modle tension-cohsion, continuum sol-plante-atmosphre. La transpiration : phnomne dvaporation, transpiration vgtale et fonctionnement stomatique. Nutrition minrale et azote : classification et rpartition des lments minraux essentiels. Rle des lments minraux (macro et microlments) dans le mtabolisme Photosynthse : absorption de lnergie lumineuse et ractions photochimiques, fixation photosynthtique du carbone, mtabolisme C3, C4 et CAM. TP : Mouvement deau entre les cellules et le milieu - Dtermination des potentiels hydriques et osmotiques. Caractrisation des pigments photosynthtiques - Effets de la snescence. Mise en vidence de la raction de Hill. Effet de la lumire sur lalimentation azote : activit de la Nitrate Rductase. Ecophysiologie animale CM : 18h TD : 12h Communication chez les animaux (tude des signaux visuels, olfactifs, lectriques, magntiques, tactiles et sonores ainsi que des organes permettant dmettre ou de recevoir ces messages). Adaptation des animaux aux milieux extrmes, tats de vie ralentie, associations favorables ou dfavorables camouflage, mimtisme. Ecophysiologie vgtale CM : 11h TP : 8h Adaptations des vgtaux aux contraintes abiotiques du milieu : Mcanismes cytohistologiques, morphologiques et physiologiques. TP : sortie sur le terrain. TD : 8h

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Ecotoxicologie CM : 20h TD-TP : 10h Limpact des polluants sur les systmes naturels (protection de lenvironnement et de ltre humain) sera abord par ltude du mode dexposition, des cibles biologiques et des niveaux deffets (relation concentrationrponse, notions deffets aigus-chroniques, ltaux-subltaux). Des exemples sur les notions de danger et de risque cotoxicologique dans la protection de lenvironnement et en assainissement industriel seront donns. TP : sortie sur le terrain. Hydrobiologie CM : 13h TD : 8h TP : 9h Caractristiques physico-chimiques des eaux courantes et dormantes (relations biologie-chimie/physique). Les biocnoses aquatiques (plancton, benthos), leur cologie, leur volution dans leur environnement TP : Etude de diffrents cosystmes aquatiques (1 sortie de terrain dune journe). Travail en salle. Dtermination de diffrentes faunes aquatiques et leurs relations avec les facteurs du milieu. Anglais CM-TD : 30h Travail de la comprhension de l'oral et de l'crit, de la production crite et orale partir de l'tude de textes scientifiques et supports audio-visuels en rapport avec les matires enseignes au cours du semestre et les sujets scientifiques dactualit. Travail de l'interaction orale en anglais conversationnel et scientifique. Mthodologie du texte scientifique. Semestre 6 Unit de dcouverte professionnelle 30h Ce module a pour objectif de permettre aux tudiants dorienter leur cursus universitaire selon leur choix professionnel. Deux possibilits sont offertes : (1) Raliser un stage en laboratoire ou en entreprise. Suite une recherche personnelle, ltudiant propose un enseignant rfrent un sujet de stage associ un organisme. Ce stage devra tre dune dure de 4 6 semaines. (2) Afin de sensibiliser les tudiants l'approche scientifique et au monde de la recherche, les tudiants choisiront un sujet dtude aborder travers plusieurs disciplines. Le projet dvelopp sous la responsabilit dun tuteur sera mis en uvre au cours dun stage pratique de 5 7 jours durant lequel les salles de TP de chaque discipline seront ouvertes en libre service aux tudiants. Dans la mesure du possible, lensemble du matriel (appareil et consommable) ncessaire aux expriences imagines par les tudiants sera mis leur disposition. Lvaluation sera base sur la rdaction dun mmoire, dun petit article scientifique ou dun poster prsentant le stage, ltude ralise et les rsultats obtenus. Une prsentation orale sera ralise devant un jury et lensemble de la promotion de licence. Physiologie vgtale (Croissance et dveloppement) CM : 29h TD : 9h TP : 16h Aspects physiologiques de la formation des fruits et des graines des Angiospermes (les aspects morphologiques sont traits dans lUO2-4415). Le phytochrome et autres photorcepteurs du dveloppement. Les hormones de croissance : structure, mtabolisme, effets physiologiques et transduction du signal hormonal. Germination, post-germination et dormances des graines des angiospermes. La floraison : induction florale (photopriodisme ; vernalisation et signaux de floraison), vocation florale, morphogense florale et son contrle gntique. Les mouvements des vgtaux : les nasties, les mouvements de circulation, les tropismes (phototropisme et gravitropisme). TP : Dosage biologique et chimique de lauxine. Biodgradation in vitro de lauxine et dosage de lactivit auxine-oxydasique. Effets de diffrentes phytohormones sur llongation du coloptile des gramines. Etude de laction du GA3 sur la synthse de l amylase dans les cellules de la couche aleurones. Biologie animale CM : 26h TD : 14h Etude des grandes fonctions chez les invertbrs: respiration, excrtion et circulation, tude des relations entre le milieu intrieur et le milieu extrieur. Panorama du rgne animal et Nutrition des invertbrs par une tude de cas. Physiologie animale Etude des systmes physiologiques cardio-vasculaire, urornal et digestif. CM : 24h TD : 4h TP : 12h

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TP : Apprentissage des techniques chirurgicales chez le rat, valuation du volume sanguin chez le rat, tude de la diurse osmotique et de la filtration glomrulaire chez le rat, tude des effets de substances pharmacologique sur la pression artrielle de rat. Micro-organisme et biotechnologie CM : 27h TD : 27h Mtabolisme et physiologie des micro-organismes. Exemples d'utilisation en biotechnologie. Biotechnologie vgtale CM : 12h TD : 1h30 TP : 13h30 Culture in vitro (micropropagation, organogense in vitro). Cration de variabilit gntique (vitrovariation, mutagense in vitro, sauvetage dembryon, fusion somatique, transgense) TP : Prparation de diffrents milieux de culture. Mise en culture dexplants sur les diffrents milieux. Dsinfection et introduction dexplants in vitro + observation des cultures (rhizogense, caulogense, callogense) et des dsinfections. Prparation des protoplastes. Isolement des protoplastes, comptage, viabilit, permation + observation des cultures (rhizogense, caulogense, callogense). Ingnierie des protines CM : 13h30 TD : 13h30 Structure des protines. Techniques dextraction et purification des protines. Mutagnse dirige et alatoire. Utilisation des outils bioinformatiques pour l'analyse des proprits physico-chimiques, structurales et fonctionnelles des protines et pour la production in silico de protines recombinantes natives et mutes. Anglais CM-TD : 30h Travail de la comprhension de l'oral et de l'crit, de la production crite et orale partir de l'tude de textes scientifiques et supports audio-visuels en rapport avec les matires enseignes au cours du semestre et les sujets scientifiques dactualit. Travail de l'interaction orale en anglais conversationnel et scientifique. Mthodologie du texte scientifique. Pharmacologie et pathologie des grandes fonctions CM : h TD : h TP :